32,464 research outputs found
Estimation of interdomain flexibility of N-terminus of factor H using residual dipolar couplings
No full textCharacterization of segmental flexibility is needed to understand the biological mechanisms of the very large category of functionally diverse proteins, exemplified by the regulators of complement activation, that consist of numerous compact modules or domains linked by short, potentially flexible, sequences of amino acid residues. The use of NMR-derived residual dipolar couplings (RDCs), in magnetically aligned media, to evaluate interdomain motion is established but only for two-domain proteins. We focused on the three N-terminal domains (called CCPs or SCRs) of the important complement regulator, human factor H (i.e., FH1-3). These domains cooperate to facilitate cleavage of the key complement activation-specific protein fragment, C3b, forming iC3b that no longer participates in the complement cascade. We refined a three-dimensional solution structure of recombinant FH1-3 based on nuclear Overhauser effects and RDCs. We then employed a rudimentary series of RDC data sets, collected in media containing magnetically aligned bicelles (disklike particles formed from phospholipids) under three different conditions, to estimate interdomain motions. This circumvents a requirement of previous approaches for technically difficult collection of five independent RDC data sets. More than 80% of conformers of this predominantly extended three-domain molecule exhibit flexions of <40°. Such segmental flexibility (together with the local dynamics of the hypervariable loop within domain 3) could facilitate recognition of C3b via initial anchoring and eventual reorganization of modules to the conformation captured in the previously solved crystal structure of a C3b:FH1-4 complex.</p
Rh(III)-Catalyzed Direct Access to 2,3-Substituted β-N-Glycosyl Indoles Through C-H Activation/annulation Coupling of β-N-Aryl Glycosides with Substituted Internal Alkynes
No full textAn efficient and selective C-H activation/annulation of readily available β-N-aryl glycosides with various
alkynes has been established. Using [Cp*RhCl2]2 as a catalyst and AgSbF6 in DCE, this protocol proved to be general to
prepare a variety of 2,3-substituted N-glycosyl indoles in good yields with exclusive β-selectivity
Fully Turbulent Mean Velocity Profile for Purely Viscous non-Newtonian Fluids
No full textThe characteristic near wall behavior of turbulent flow of purely-viscous non-Newtonian fluids is discussed for both power-law (P.-L.) and Herschel-Bulkley (H.-B.) rheological models. A proper scaling is presented for H.-B. fluids to establish an analogy with power-law fluids with same flow index. To provide reference data for turbulent flow of non-Newtonian fluids, DNS simulations of power-law fluids are conducted in a rectangular channel for a large range of power-law indices ( = 0.5, 0.69, 0.75, 0.9, 1, 1.2). The DNS data show that the mean velocity profile in the viscous and logarithmic layers follow expressions of the form and respectively, where shows a logarithmic dependency on the flow index.Comparison with some experimental data shows the above formulation to be valid for Reynolds numbers (based on shear velocity) as high as 1000
Rh(III)-Catalyzed Direct Access to 2,3-Substituted β-N-Glycosyl Indoles Through C-H Activation/annulation Coupling of β-N-Aryl Glycosides with Substituted Internal Alkynes
No full textAn efficient and selective C-H activation/annulation of readily available β-N-aryl glycosides with various
alkynes has been established. Using [Cp*RhCl2]2 as a catalyst and AgSbF6 in DCE, this protocol proved to be general to
prepare a variety of 2,3-substituted N-glycosyl indoles in good yields with exclusive β-selectivity
Bionanokomposit : Peluang Polimer Alami sebagai Material Baru Semikonduktor
No full textBionanokomposit adalah material generasi baru dari nanokomposit yang muncul di bidang ilmu pengetahuan material dan teknologi nano. Bionanokomposit adalah gabungan dari matrik polimer alami dari bahan pengisi organik lanorganik yang berukuran nano. Saat ini USAha pegembangan nanokomposit berbahan polimer alami difokuskan pada peningkatan sifat-sifat mekanik dan panas dan sifat fungsionalnya.Polimer alami sebagai sumber yang dapat diperbaharui seperti protein, polisakarida dan lemak. Material ini memiliki potensi yang besar untuk digunakan sebagai material semikonduktor.Dengan melihat kebutuhan akan material semikonduktor yang terus meningkat dan bahan baku polimer alami (pati) di Indonesia yang berlimpah, merupakan peluang yang cukup menjanjikan untuk pengembangan bionanokomposit sebagai material semikonduktor di Indonesia. Artikel ini akan membahas tentang bionanokomposit yang berbahan dasar polimer alami, proses pembuatan, karakteristik dan peluang penggunaan polimer alami sebagai bahan pembuatan bionanokomposit
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
No full textWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Penjernihan air limbah sintetis menggunakan koagulan alami
No full textAir merupakan kebutuhan pokok bagi manusia. Kualitas air saat ini menurun dikarenakan ulah manusia yang membuang limbah ke sungai atau ke sumber air tanpa dilakukan pengolahan terlebih dahulu. Untuk itu diperlukan cara agar dapat mengolah air limbah menjadi air bersih yaitu dengan cara koagulasi. Pada penelitian ini dipergunakan koagulan dari bahan alami dengan menggunakan protein sebagai bahan aktifnya, yang digunakan adalah biji kelor, kacang tolo, dan biji melinjo. Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari pengaruh konsentrasi larutan pengekstrak terhadap kadar protein yang terdapat dalam biji kelor, kacang tolo dan biji melinjo. Selain itu dipelajari juga pengaruh penambahan volume larutan ekstrak dengan kadar protein tertinggi (sebagai koagulan alami) dari biji kelor, kacang tolo dan biji melinjo terhadap presentase penurunan kekeruhan dari air limbah sintetis. Proses penjerihan air menggunakan koagulan alami terdiri dua tahap yaitu: (1) ekstraksi protein dari biji-bijian menggunakan pengekstrak NaCl dengan konsentrasi: 0,2 N; 0,3 N; 0,4 N; 0,5 N; 0,6 N; 0,8 N dan 1 N. (2) ekstrak protein dengan kadar protein tertinggi ditambahkan ke dalam air limbah sintetis kemudian diukur kekeruhannya. Hasil pengukuran kekeruhan ini kemudian dihitung presentase penurunannya terhadap kekeruhan air limbah sintetis mula-mula sebelum ditambahkan koagulan alami. Pengukuran kekeruhan menggunakan alat Turbidimeter. Sedangkan kadar protein diukur menggunakan alat Kjeldahl. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa kadar protein tertinggi dari setiap biji-bijian diperoleh dengan menggunakan larutan pengekstrak NaCl pada konsentrasi yang berbeda-beda. Pada biji kelor diperoleh kadar protein tertinggi sebesar 2,51% dengan menggunakan larutan pengekstrak NaCl berkonsentrasi NaCl 0,4 N. Sedangkan untuk kacang tolo dan biji melinjo kadar protein tertinggi berturut-turut sebesar 1,37% dan 0,55%, dengan menggunakan larutan pengekstrak NaCl yang berkonsentrasi berturut-turut sebesar 0,4 N dan 0,2 N. Penurunan kekeruhan air limbah sintetis dengan penambahan ekstrak protein sebanyak 0,5 mL dari biji kelor, yaitu 92,63% diikuti dengan kacang tolo, yaitu 91,02% dan biji melinjo, yaitu 90,85%
Contribution of Information and Communication Technology (ICT) in Country’S H-Index
No full textThe aim of this study is to examine the effect of Information and Communication Technology (ICT) development on country’s scientific ranking as measured by H-index. Moreover, this study applies ICT development sub-indices including ICT Use, ICT Access and ICT skill to find the distinct effect of these sub-indices on country’s H-index. To this purpose, required data for the panel of 14 Middle East countries over the period 1995 to 2009 is collected. Findings of the current study show that ICT development increases the H-index of the sample countries. The results also indicate that ICT Use and ICT Skill sub-indices positively contribute to higher H-index but the effect of ICT access on country’s H-index is not clear
A 2 h periodic variation in the low-mass X-ray binary Ser X-1
No full textSpectroscopy of the low-mass X-ray binary Ser X-1 using the Gran Telescopio Canarias have revealed a ?2 h periodic variability that is present in the three strongest emission lines. We tentatively interpret this variability as due to orbital motion, making it the first indication of the orbital period of Ser X-1. Together with the fact that the emission lines are remarkably narrow, but still resolved, we show that a main-sequence K dwarf together with a canonical 1.4 M? neutron star gives a good description of the system. In this scenario, the most likely place for the emission lines to arise is the accretion disc, instead of a localized region in the binary (such as the irradiated surface or the stream-impact point), and their narrowness is due instead to the low inclination (?10°) of Ser X-1
KARAKTERISTIK PENGOMPOSAN LIMBAH ORGANIK KOTORAN AYAM FASE THERMOFILIK PADA LINGKUNGAN ALAMI MENGGUNAKAN INDORE PIT METHODE
No full textPenelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik pengomposan limbah organik kotoran
ayam pada lingkungan terbuka alami menggunakan indore pit methode
Pengomposan limbah organik kotoran ayam secara alami dilakukan dalam lubang dengan
ukuran panjangxlebar dan dalam 2 mx2mx1m. Bahan kompos selain kotoran ayam adalah jerami padi
yang dipotong-potong untuk menambah rasio C/N. Selama pengomposan dilakukan pengkuran
temperatur pada zona luar (0-20 cm, ), zona dalam (50 cm dari permukaan, ) dan zona bawah (80 cm,
dari permukaan).
Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan data pengukuran temperatur
pengomposan limbah kotoran ayam pada lingkungan alami mempunyai fase degradasi kira-kira 2
minggu pada zona atas, 3 minggu pada zona luar dan 4 minggu pada zona dalam. Pada tahap yang
didominasi oleh proses degradasi ini ditandai oleh peningkatan temperatur yang menuju ke fase
termofilik (>55°C). Pada pengomposan secara alami ini juga lama fase termofiliknya lebih panjang (4
minggu). Pola temperatur ini didukung oleh hasil analisis kimia bahan yang sedang dikomposkan yang
pada minggu ke 6 nisbah C/N nya sudah sangat rendah yaitu 9,75 untuk pengomposan sistem alami.
Berdasarkan total mikrobanya maka pada awal pengomposan lingkungan alami mengandung mikroba
sebanyak (323 x 107 CFU/mg). Pada minggu ke 6 jumlah mikroba pada lingkungan 68x107 CFU/mg
Kata-kata kunci: Karakteristik, pengomposan--limbah organik-kotoran ayam-fase thermofilik-indore pit methode-
lingkungan alam
- …
