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Utilisations des écailles chez les poissons migrateurs amphihalins: Scalimétrie, poissons migrateurs
No full textInternational audienc
A proposito di Xanthorhoe sardisjuncta in Corsica: descrizione di una nuova sottospecie (Lepidoptera Geometridae Larentiinae Xanthorhoini)
No full textInternational audienceXanthorhoe sardisjuncta Hausmann, 2011 — die tyrrhenische vikariante von Xanthorhoe fluctuata (Linnæus, 1758), die vor kurzem auf Korsika entdeckt wurde — erweist sich als die einzige der beiden arten, die auf dieser Insel vorkommt. Diese korsischen Populationen zeigen „intermediäre“ Merkmale zwischen X. fluctuata und den typischen sardischen Populationen von X. sardisjuncta. Ihr Habitus erinnert eher an X. fluctuata auf dem Festland als an die sardischen sardisjuncta, allerdings gibt es kleine unterschiede, wohingegen sie genetisch eindeutig mit sardisjuncta verwandt sind. Obwohl sie die gleiche BIN aufweisen, bilden die korsischen Populationen von sardisjuncta und die von Sardinien zwei verschiedene untergruppen, da ihre jeweiligen Barcodes eine abweichung von durchschnittlich 0,3% aufweisen. Wir stützen uns auf diese beiden Komponenten (unterschiedlicher Habitus und Barcode), um die korsischen Populationen als X. sardisjuncta pseudofluctuata n. ssp. zu unterscheiden.Xanthorhoe sardisjuncta Hausmann, 2011 — the Tyrrhenian vicariant of Xanthorhoe fluctuata (Linnæus, 1758), recently discovered in Corsica — turns out to be the only one of these two species presenton the island. These Corsican populations show ‘‘intermediate’’ characteristics between X. fluctuata and the typical Sardinian populations of X. sardisjuncta. Their habitus is more reminiscent of mainland fluctuata than of Sardinian sardisjuncta, albeit slightly different, while they are clearly genetically related to sardisjuncta. Although they share the same BIN, the Corsican populations of sardisjuncta and those of Sardinia form two distinct subsets, their respective DNA barcodes showing a divergence of 0.3% on average. On the basis of these different elements, we describe the Corsican populations as X. sardisjuncta pseudofluctuata n. ssp.Xanthorhoe sardisjuncta Hausmann, 2011 — l’espèce tyrrhénienne vicariante de Xanthorhoe fluctuata (Linnæus, 1758), récemment découverte en Corse — se révèle être la seule de ces deux espèces qui est présente sur cette île. Ces populations corses montrent des caractéristiques « intermédiaires » entre X. fluctuata et les populations sardes typiques de X. sardisjuncta. Leur habitus évoque davantage celui des fluctuata du continent que celui des sardisjuncta de Sardaigne, quoique légèrement différent, tandis qu’elles sont clairement apparentées génétiquement à sardisjuncta. Bien qu’elles partagent le même BIN, les populations corses de sardisjuncta et celles de Sardaigne forment deux sous-ensembles distincts, leurs codes-barres ADN respectifs montrant une divergence de 0,3 % en moyenne.Nous nous fondons sur ces différents éléments pour décrire les populations corses sous le nom de X. sardisjuncta pseudofluctuata n. ssp.Xanthorhoe sardisjuncta Hausmann, 2011 — vicariante tirrenica di Xanthorhoe fluctuata (Linnæus, 1758), recentemente scoperta in Corsica — risulta essere l’unica di queste due specie presente sull’isola. Le popolazioni corse mostrano caratteristiche “intermedie” tra X. fluctuata e le tipiche popolazioni sarde di X. sardisjuncta; il loro habitus ricorda più quello di X. fluctuata continentale che quello diX. sardisjuncta sarda, anche se è leggermente diverso, mentre dal punto di vista genetico esse sono chiaramente correlate a X. sardisjuncta. Pur condividendo lo stesso BIN, le popolazioni di sardisjuncta corse e sarde formano due sottoinsiemi distinti, i cui rispettivi codici a barre mostrano una divergenza media dello 0,3%. Sulla base di questi diversi elementi, descriviamo le popolazioni corse come X. sardisjuncta pseudofluctuata n. ssp
Éléments de cadrage sur la restauration écologique et la restauration des écosystèmes.: Références historiques, rappels de définitions et de principes d’action. Critères d’évaluation et de suivi des projets. Exemples d’utilisation.
No full textThe European Union's Nature Restoration Law came into force on August 18, 2024, creating a common legal framework for large-scale ecological restoration, while building on existing European legislation. To support the implementation of this regulation, this document proposes to provide some guidance on the topic of ecological restoration. It has been designed as a summary of key points, concepts, and bibliographic references to support discussions on restoration practices. This document provides a framework for reflection to support the implementation of restoration projects. It proposes a number of criteria, recommendations, and tools to maximize the chances of success for ecological restoration projects, which must be designed first and foremost as territorial projects, taking into account regulatory objectives as well as the specific challenges of each territory. The last part invites reflection on restoration practices relating to different types of environments and raises a number of specific points to be considered when implementing restoration in these environments.Le règlement de l'Union européenne relatif à la restauration de la nature est entré en vigueur le 18 août 2024 et crée un cadre juridique commun pour la restauration écologique à grande échelle, tout en s'appuyant sur la législation européenne existante. Afin d’accompagner la mise en œuvre de ce règlement, ce document propose d’apporter quelques éléments de cadrage autour de la thématique de la restauration écologique. Il a été conçu comme une synthèse des repères, concepts et références bibliographiques clés permettant d’accompagner les réflexions autour des pratiques de restauration. Ce document constitue un cadre de réflexion, pour appuyer la réalisation de projets de restauration. Il propose un certain nombre de critères, préconisations et outils permettant de maximiser les chances de réussite des projets de restauration écologique, projets qui doivent être conçus avant tout comme des projets de territoire, prenant en compte les objectifs réglementaires, mais également les enjeux spécifiques de chaque territoire. La dernière partie invite à réfléchir aux pratiques de restauration relatives à différents types de milieux et soulève un certain nombre de points de vigilance spécifiques à prendre en compte lors de la mise en œuvre de restauration sur ces milieux
Mise à jour des estimations démographiques et des effectifs de la population de loups en France lors de l'hiver 2024/25
No full textLa population de loups (Canis lupus) en France fait l'objet d'un suivi annuel réalisé par le Réseau Loup-Lynx, piloté par l'Office Français de la Biodiversité. Ce rapport actualise les paramètres démographiques et les estimations d'effectifs à la suite de la campagne de terrain de l'hiver 2024/25. Comme déjà appliqué depuis l'hiver 2023/24, la collecte des données s'appuie sur un plan d'échantillonnage définissant, pour des mailles de 10*10km, des objectifs de récolte d'indices biologiques afin d'homogénéiser la prospection dans les zones de présence historiques. Le génotypage de l'ADN issu des indices biologiques collectés sur tout le territoire français (fèces, poils, urines, sang et dépouilles des loups morts) permet d'obtenir l'identité génétique des individus. Cette identité constitue la donnée de base pour l'estimation des paramètres démographiques et des effectifs. Comme les années précédentes, les méthodes de capture-recapture ont été utilisées pour prendre en compte la détection partielle et hétérogène des individus de la population. Les estimations d'effectifs montrent que le nombre de loups en France lors de l'hiver 2024/25 se situe vraisemblablement entre 989 et 1187 individus. Ces deux valeurs correspondent aux bornes basse et haute de l'intervalle de confiance à 95%. Bien que l'effectif moyen montre une légère hausse -passant de 1013 lors de l'hiver 2023/24 à 1082 lors de l'hiver 2024/25 -il n'est pas possible de conclure à une augmentation des effectifs entre ces deux années puisque les intervalles de confiance (IC) associés se chevauchent (2023/24 : 920-1125 ; 2024/25 : 989-1187). Les conclusions sur la tendance démographique de la population doivent se faire sur des séries pluriannuelles pour identifier les trajectoires démographiques des populations, particulièrement au vu du degré d'incertitude associé à ces estimations. La connaissance des paramètres démographiques éclaire aussi ces tendances. La mise à jour des estimations de survie annuelle confirme la dynamique observée précédemment : le taux de survie passe de 71 % (IC à 95 % : 67-76 %) sur la période 2014-2018 à 66 % (IC 95 % : 59-73 %) sur la période 2019-2025. Cette dernière période correspond au changement de régime de prélèvement dérogatoire qui est passé d'environ 10% de la population sur la période 2014-18 à 19% en 2019-25. Avec de tels niveaux de survie, une stabilisation de la population est attendue, ce que semble refléter les estimations d'effectifs des quatre dernières années
État des lieux et dynamiques des cyanobactéries benthiques dans les plans d’eau de France métropolitaine
No full textMasterThis study provides a national overview of benthic cyanobacteria in water bodies in mainland France, based on data collected under the WFD (Water Framework Directive). The analysis focused on spatial distribution, species richness, abundance, and the presence of potentially toxic taxa, as well as their temporal evolution and the main associated environmental factors. The analyses show that benthic cyanobacteria are widely distributed, present in more than 70% of the water bodies studied, with high spatial variability. Several potentially toxic genera have been identified and are among the most common and abundant (notably Phormidium and Oscillatoria). Species richness is dominated by Oscillatoriales and Nostocales. Analysis of environmental factors suggests that shoreline development, summer temperatures, and certain physicochemical parameters influence the distribution of taxa. However, the links remain complex and highly dependent on anthropogenic pressures and climate change, making it difficult to predict outbreaks. By highlighting the diversity and distribution of benthic cyanobacteria in France, this work provides an essential basis for better understanding their ecology and assessing the risks associated with their development.Cette étude dresse un état des lieux national des cyanobactéries benthiques dans les plans d’eau de France métropolitaine, à partir des données collectées dans le cadre de la DCE (Directive Cadre sur l’Eau). L’analyse a porté sur la distribution spatiale, la richesse spécifique, l’abondance et la présence de taxons potentiellement toxiques, ainsi que sur leur évolution temporelle et les principaux facteurs environnementaux associés. Les analyses montrent que les cyanobactéries benthiques sont largementdistribuées, présentes dans plus de 70 % des plans d’eau étudiés, avec une forte variabilité spatiale. Plusieurs genres potentiellement toxiques ont été identifiés et comptent parmi les plus fréquents et abondants (notamment Phormidium et Oscillatoria). La richesse spécifique est dominée par les Oscillatoriales et les Nostocales. L’analyse des facteurs environnementaux suggère que l’aménagement des rives, les températures estivales et certains paramètres physico-chimiques influencent la distribution des taxons. Toutefois, les liens restent complexes et fortement dépendants des pressions anthropiques et du changement climatique, rendant difficile la prédiction des proliférations. En mettant en lumière la diversité et la distribution des cyanobactéries benthiques en France, ce travail constitue une base essentielle pourmieux comprendre leur écologie et évaluer les risques associés à leur développement
Un observatoire dédié au suivi de la biodiversité
No full textNational audienceLa biodiversité poursuit-elle son érosion en France ? Les écosystèmes forestiers sont-ils particulièrement concernés ? Quelles sont les principales pressions, menaces et réponses apportées aujourd'hui ? L'Observatoire national de la biodiversité fournit les éléments clés pour comprendre et objectiver ces grandes questions sociétales.L'Observatoire national de la biodiversité est un dispositif mettant à disposition des informations précises et documentées sur la biodiversité en France. Divers indicateurs et synthèses sont publiés régulièrement sur le portail naturefrance. Un groupe de travail "biodiversité et forêt" développe des indicateurs spécifiques aux milieux forestiers
The ongoing spread of the Asian date mussel (Arcuatula senhousia) within the French Atlantic coast: colonisation dynamics and associated drivers in a historically invaded ecosystem (Arcachon Bay)
No full textInternational audienceArcuatula senhousia is a non-indigenous species first observed in Arcachon Bay in 2002. At that time, the species’ distribution was restricted to the northern part of this coastal lagoon. During the following 7–8 years, the species also started to colonise its south-eastern parts. Then, two surveys conducted in 2018 and 2021 showed that the species was observed over most of the investigated tidal flats within the lagoon. Between those two periods, there was a threefold increase in both frequencies of occurrence and average densities. The highest average densities and frequencies were observed in areas colonised in 2002. It suggests that this area is either the main area of introduction/settlement for the species or the area where it could find the most suitable ecological conditions. However, the use of Species Distribution Modelling showed that, considering habitat features, most of the intertidal flats in Arcachon Bay were a highly suitable habitat for A. senhousia . Further colonisation of the lagoon during the coming years appears very likely. The study of its habitat in this area suggested that the presence of meadows favoured the settlement of A. senhousia individuals. Furthermore, lower bottom current velocity and the erosion potential it induces seemed to be the principal environmental factors driving the distribution pattern of this species within the bay. However, other factors that could regulate the spread of A. senhousia must be considered. Understanding the dynamics of A. senhousia colonisation and identifying its drivers aimed to characterise possible areas to be colonised by this species. This is a crucial point in determining how to manage its distribution and assess the risk of spreading within other ecosystems
Processus biologiques par lesquels les couverts régulent les adventices ?
No full textNational audienc
Unravelling the effects of heterogeneity in space use on estimates of connectivity and population size: Insights from spatial capture-recapture modelling
No full textPeer reviewed and recommended by PCI Ecology, https://doi.org/10.24072/pci.ecology.100688International audienceSpatial Capture-Recapture (SCR) models using least-cost path distance offer an unified framework to estimate landscape connectivity and population size from individual detection data, while accounting for individual and spatial heterogeneity in space use. In our case study on the Pyrenean brown bear population, two “outliers” individuals were detected more often over very large spatial extent compared to other individuals. The integration of such individuals made SCR modelling challenging, especially since it remains unclear how unmodelled heterogeneity in space use may bias connectivity and population size estimates. To address this gap, we used simulations reflecting the Pyrenean brown bear population, with two groups of individuals differing in their space use due to individual characteristics but also in their spatial responses to landscape structure. We compared six SCR model formulations that varied in whether individual and spatial heterogeneity in space use were (1) ignored, (2) explicitly modelled, or (3) handled by removing outliers. We then applied the same models to the empirical bear dataset. By combining simulations and sensitivity analyses, we highlight the challenges of choosing the appropriate modelling approach when multiple sources of heterogeneity in space use occur simultaneously. Our results show that the treatment of heterogeneity in space use should match the research objective: removing outliers supports accurate population size estimation, while explicitly modelling heterogeneity is essential for reliable connectivityassessment. Overall, we provide a practical framework for identifying and addressing heterogeneity in SCR applications, to guide practitioners in deciding when additional model complexity is warranted
Criblage de suspects de médicaments vétérinaires et biocides dans les produits résiduaires organiques
No full textInternational audienceThe objective of the Rismeau program was to study the transfer of pharmaceutical substances and biocides into infiltrated water, soils, and earthworms following the spreading of sludge and manure. It was therefore essential to first identify the molecules present in these matrices. However, given the multitude of potential organic micropollutants and their variability across ecosystems, identifying key molecules to analyze represents a significant challenge. The use of suspect screening through mass spectrometry increases the likelihood of selecting relevant compounds to investigate. This article presents an innovative screening strategy combining two extraction methods and two analytical techniques based on liquid chromatography coupled with mass spectrometry (LC-MS). For each sample, two complementary extraction methods were implemented: a QuEChERS-based method suitable for semi-polar to non-polar compounds, and a second method assisted by ultrasound, specific to polar compounds and those in a positively ionized form. Regarding LC-MS techniques, LC-MS/MS, known for its sensitivity, and LC-QToF-MS, offering greater exhaustiveness, were employed to conduct the screening. This methodology first enabled the detection of 150 suspect substances. A confirmation phase was subsequently carried out by spiking the extracts with analytical standards and analyzing them using LC-MS/MS, which allowed for the confirmation of 19 molecules. Finally, 24 compounds, including molecules and their transformation products, were selected for targeted monitoring during the spreading of sludge and manure. The study also highlights the limitations of suspect screening, particularly in the context of analyzing complex matrices such as sludge and manure. It underscores the critical importance of confirming suspect molecules using appropriate analytical standards to ensure reliable results.L'objectif du programme RISMEAU était d'étudier le transfert des substances pharmaceutiques et des biocides dans les eaux infiltrées, les sols et les vers de terre après l'épandage de produits résiduaires organiques (PRO). Il était donc essentiel de déterminer au préalable les molécules présentes dans ces PRO. Cependant, face à la multitude de micropolluants organiques potentiels et à leur variabilité selon les écosystèmes, l'identification des molécules clés à analyser est un défi. L'utilisation de criblages de suspects par spectrométrie de masse permet d'augmenter la probabilité de sélectionner des composés pertinents à rechercher. Cetarticle présente une stratégie de criblage innovante, combinant deux méthodes d'extraction et deux techniques d'analyse par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS). Pour chaque échantillon, deux méthodes d'extraction complémentaires ont été mises en oeuvre : une de type QuEChERS adaptée aux composés semi-polaires à apolaires, et une deuxième assistée par des ultra-sons, spécifique aux composés polaires et sous forme ionisée positive. En ce qui concerne les techniques LC-MS, la LC-MS/MS, reconnue pour sa sensibilité, et la LC-QToF-MS, offrant une plus grande exhaustivité, ont été mobilisées pour réaliser le screening.Cette méthodologie a permis, dans un premier temps, de détecter 150 substances suspectes. Une phase de confirmation a ensuite été effectuée en dopant les extraits avec des standards analytiques et en les analysant par LC-MS/MS, ce qui a permis d'en confirmer 19. Enfin, 24 composés, incluant des molécules et leurs produits de transformation, ont été sélectionnés pour un suivi spécifique lors de l'épandage des PRO. L'étude met également en évidence les limites du criblage de suspects, notamment dans le cadre de l'analyse de matrices complexes comme les boues et les lisiers. Elle souligne l'importance cruciale de confirmer les molécules suspectées à l'aide de standards analytiques appropriés pour garantir la fiabilité des résultats.</div