3036 research outputs found
Sort by
Comparison of Clinically Approved Molecules on SARS-CoV-2 Drug Target proteins: A Molecular Docking Study
The new type of coronavirus, SARS-CoV-2 has affected more than 22.6 million people worldwide. Since the first day the virus was spotted in Wuhan, China, numerous drug design studies have been conducted all over the globe. Most of these studies target the receptor-binding domain of spike protein of SARS-CoV-2, which is known to bind to the human ACE2 receptor and SARS-CoV-2 main protease, vital for the virus' replication. However, there might be a third target, human furin protease, which cleaves the virus' S1-S2 domains playing an active role in its entry into the host cell. In this study, we docked five clinically used drug molecules, favipiravir, hydroxychloroquine, remdesivir, lopinavir, and ritonavir onto three target proteins, the receptor-binding domain of SARS-CoV-2 spike protein, SARS-CoV-2 main protease, and human furin protease. Results of molecular docking simulations revealed that human furin protease might be targeted by COVID-19. Remdesivir, a nucleic acid derivative, strongly bound to the active site of this protease, suggesting that this molecule can be used as a template for designing novel furin protease inhibitors to fight against the disease. Protein-drug interactions revealed in this study at the molecular level, can pave the way for better drug design for each specific target
Hybrid Algorithms Based On Combining Reinforcement Learning And Metaheuristic Methods To Solve Global Optimization Problems
This paper introduces three hybrid algorithms that help in solving global optimization problems using reinforcement learning along with metaheuristic methods. Using the algorithms presented, the search agents try to find a global optimum avoiding the local optima trap. Compared to the classical metaheuristic approaches, the proposed algorithms display higher success in finding new areas as well as exhibiting a more balanced performance while in the exploration and exploitation phases. The algorithms employ reinforcement agents to select an environment based on predefined actions and tasks. A reward and penalty system is used by the agents to discover the environment, done dynamically without following a predetermined model or method. The study makes use of Q-Learning method in all three metaheuristic algorithms, so-called RLI-GWO, RLEx-GWO, and RLWOA algorithms, so as to check and control exploration and exploitation with Q-Table. The Q-Table values guide the search agents of the metaheuristic algorithms to select between the exploration and exploitation phases. A control mechanism is used to get the reward and penalty values for each action. The algorithms presented in this paper are simulated over 30 benchmark functions from CEC 2014, 2015 and the results obtained are compared with well-known metaheuristic and hybrid algorithms (GWO, RLGWO, I-GWO, Ex-GWO, and WOA). The proposed methods have also been applied to the inverse kinematics of the robot arms problem. The results of the used algorithms demonstrate that RLWOA provides better solutions for relevant problems. (C) 2021 Elsevier B.V. All rights reserved
Being an Ethical or Unethical Consumer in Response to Social Exclusion: The Role of Control, Belongingness and Self-Esteem
Social exclusion threatens control, belongingness and self-esteem, and such threats may produce distinct behavioural intentions. This study hypothesized that thwarted control would increase the intention towards unethical consumer behaviour. Additionally, it hypothesized that inhibiting belongingness and self-esteem would decrease the intention to engage in unethical consumer behaviour for reconnection. To test the hypotheses, we conducted two online experiments, with 117 (63 females and 54 males) and 188 (91 females and 97 males) participants in the 18-64 age range, using the Cyberball game to manipulate social exclusion. The result of the first study indicated that social exclusion diminished the level of control and increased participants' willingness to engage in unethical consumer behaviour. The result of the second study indicated that social exclusion decreased levels of belongingness and self-esteem and this decreased belongingness reduced the intention to engage in unethical consumer behaviour for reconnection. These results show that sense of control and belongingness are two psychological mechanisms through which social exclusion influences unethical behavioural intentions. To our knowledge, this is the first empirical study to analyze the role of control, belongingness, and self-esteem as the mechanism explaining why excluded individuals are more likely to engage in unethical consumer behaviour but less likely to do it for affiliation. Accordingly, the paper presents some important theoretical and practical implications in the consumer behaviour context
Bilinear Multipliers of Small Lebesgue Spaces
Let G be a compact abelian metric group with Haar measure lambda and (G) over cap its dual with Haar measure mu. Assume that 1 = 0. Let L-(pi' ,L-theta (G), (i = 1, 2, 3) be small Lebesgue spaces. A bounded sequence m(xi, eta) defined on G (over cap) x G (over cap) is said to be a bilinear multiplier on G of type [(p'(1); (p'(2); (p'(3)]. if the bilinear operator B-m associated with the symbol m
B-m (f, g) (x) = Sigma(delta is an element of G)Sigma(t is an element of G) (f) over cap (s) (g) over cap (t) m(s, t) (s + t, x)
defines a bounded bilinear operator from L-(p'1,L- theta (G) x L-(p2',L-theta (G) into L-(p3',L-theta (G). We denote by BM theta [(p(1)' ; (p(2)' ; (p(3)'] the space of all bilinear multipliers of type [(p(1)'; (p(2)'; (p(3)'](theta). In this paper, we discuss some basic properties of the space BM. [(p(1)'; (p(2)'; (p(3)'] and give examples of bilinear multipliers
Proposing a Checklist for Aesthetic Control and Management in a City Under Neo-Liberal Influences: Istanbul Case
Purpose The increased flexibility in urban planning practice under neoliberal policies had impacts on urban aesthetics, such as causing cities to lose their unique character and identity, especially in developing countries. However, importance of the control and management of aesthetics has not been adequately addressed in the current planning legislations in the literature. Conventional legislation devices (such as zoning ordinances, building codes, etc.) provide little effect on aesthetic control for the flexible planning era. The aim of the study is to examine how a supplementary legal tool (a checklist) can be developed to provide urban aesthetics control and management for a city under neo-liberal influences by taking into consideration the relationship between urban environmental aesthetics and related legal regulations. Design/methodology/approach The research focusses on the Istanbul case. In this study, the aesthetic parameters with factor analysis using urban design parameters that affecting urban aesthetics are determined, how inclusion into the planning laws and regulations of these aesthetic parameters are examined and a checklist for aesthetics control and management are proposed. Findings The findings reveal that although there are different and fragmented legal sources that directly or indirectly deal with the aesthetic control and management for urban design and there is a lack of a supplementary legal tool as control management. Originality/value Checklists in the aesthetic control area can be a practical legal tool, which can establish a routine by giving proper attention to aesthetic quality and its related parameters of planning for all developing countries under the influence of neoliberal policies
Uluslararası Bir Sorun Alanı Olarak Kıbrıs’a İlişkin Tarihsel ve Teorik Öğeler Üzerinden ‘Demokratik Barış Teorisi’nin Eleştirisi
Bu makalenin amacı Türkiye-Yunanistan arasındaki Kıbrıs meselesi üzerinden Demokratik Barış Teorisi’nin (DBT) sorgulanmasıdır. Bu sorgulama dört aşamada yapılmıştır. Öncelikle DBT’nin düşünsel arka planı ele alınmış, ardından teori kavramsal ve kuramsal açıdan kısaca tanıtılmıştır. Üçüncü aşamada teorinin başlıca teorisyenlerinden biri olan Michael Doyle’un her iki ülkeyi liberal-demokratik ya da tersi ilan ettiği dönemler yine teorinin bir ülkeyi liberal-demokratik olarak tanımlamak için başvurduğu kurumlar üzerinden değerlendirilmiş; her iki ülkenin bu dönemlerdeki durumları analiz edilmiştir. Sonuç bölümünde ise her iki ülkenin savaşma ya da savaşmama kararları ile sahip oldukları rejimin türü arasındaki bağıntı sorgulanmıştır. Bu çalışmada temel olarak; Michael Doyle’un Türkiye’yi 1971-1974 ve Yunanistan’ı 1967-1975 dönemlerinde anti-liberal rejimlere sahip iki ülke olarak tanımlayıp 1974 yılında savaşmalarını bu duruma bağlamasının tek başına yeterli gerçekçi bir yaklaşım olmadığı sonucuna varılmış, her iki ülkenin savaş kararı almalarında sadece rejim türlerinin değil; Soğuk Savaş dönemi dinamiklerinin ve iki ülkenin uluslararası çıkarlarının da etkili olduğu kanaatine ulaşılmıştır
Model-Independent Determination of the Spin of the Omega(-) and Its Polarization Alignment in psi(3686) -> Omega(-)(Omega)over-bar(+)
We present an analysis of the process psi(3686) -> Omega(-)(Omega) over bar (+)(Omega(-). K-Lambda, (Omega) over bar (+) K+ (Lambda) over bar,(Omega) over bar (+) Lambda -> p pi(-), (Lambda) over bar -> p (p) over bar pthorn) based on a dataset of 448 x 10(6) psi(o3686) decays collected with the BESIII detector at the BEPCII electron-positron collider. The helicity amplitudes for the process psi(368)-> O-O thorn and the decay parameters of the subsequent decay O-. K-. oO thorn. Kthorn. THORN are measured for the first time by a fit to the angular distribution of the complete decay chain, and the spin of the O- is determined to be 3=2 for the first time since its discovery more than 50 years ago
Computational Analysis of Functional Monomers Used in Molecular Imprinting for Promising Covid-19 Detection
Today, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has recently caused a severe outbreak worldwide. There are still several challenges in COVID-19 diagnoses, such as limited reagents, equipment, and long turnaround times. In this research, we propose to design molecularly imprinted polymers as a novel approach for the rapid and accurate detection of SARS-CoV-2. For this purpose, we investigated molecular interactions between the target spike protein, receptor-binding domain of the virus, and the common functional monomers used in molecular imprinting by a plethora of computational analyses; sequence analysis, molecular docking, and molecular dynamics (MD) simulations. Our results demonstrated that AMPS and IA monomers gave promising results on the SARS-CoV-2 specific TEIYQAGST sequence for further analysis. Therefore, we propose an epitope approach-based synthesis route for specific recognition of SARS-CoV-2 by using AMPS and IA as functional monomers and the peptide fragment of the TEIYQAGST sequence as a template molecule
A different vision into the coronavirus outbreak: could pigs and its products be the vectors?
Koronavirüs küresel salgını bir zoonoz olarak tüm şiddetiyle devam ederken virüsün insan türüne geçmesine yol açan hayvan (ara konak) kesin olarak belirlenememiştir. Teknolojinin çok ileri düzeyde olduğu çağımızda güvenilirliği düşük bir PCR testi ile hastalığın tanısı konmaya çalışılmaktadır. Bir salgının tanı, tedavi ve kontrolünde izlenecek temel ilkeler yıllarca önce açıkça ortaya konmuştur. Bu prensipler temelinde salgının etyolojisinde farklı bir suş, birlikte bulunan farklı bir ajan patojen veya farklı bir bulaşma yolunun rolü göz önünde bulundurulmalıdır. Zoonotik enfeksiyonlarda mikrobiyal ajanı taşıyan hayvana maruziyet dışında hayvanlara yapılan aşılar ve aşı yapılan hayvanlara maruziyet durumları değerlendirilmelidir. Geçen yıllarda Çin’de ve birçok ülkede yaşanan çok sayıda domuz salgını nedeni ile ilgili hastalıklar için Çin’de yoğun biçimde aşı geliştirme çalışmaları devam etmektedir. İnsana yakın genetik yapısıyla ve yoğun sürü nüfusu ile domuzların bu salgında vektör olabilecekleri göz önüne alınmalıdır
Rail transport in Turkey in 100th anniversary of the Republic
Dünya’da tüketilen toplam enerji miktarının yaklaşık %27’si ulaştırma sektörü tarafından tüketilmektedir. Dünya’da havaya salınan toplam CO2 miktarının %23’ünü ulaştırma sektörü oluşturmaktadır. Enerji tüketiminde kaynakları fazlasıyla tüketen ve atmosfer kirliliği konusunda diğer sektörlerden geri kalmayan ulaştırma sektörünün sürdürülebilirlik kavramı içerisinde değerlendirilmesi gerekmektedir. Gelişen teknoloji ile birlikte kaynak kullanımı ve çevre kirliliği konusunda yeni arayışlar gündeme gelmiş, yeni ulaştırma politikaları belirlenmiştir. Ulaştırma sektörü içerisinde halen kullanılmakta olan taşıma türlerinden demiryolu taşımacılığının yukarıda belirtilen ulaştırma sektörünün kullandığı toplam enerji içindeki payının az oluşu ve çevre kirliliği konusunda diğer türlere göre daha az kirletici olması dolayısıyla gelecekte çok daha yaygın bir şekilde kullanılacağı ve geliştirilen ulaştırma politikaları içerisinde önemli bir yer tutacağı bir gerçektir. 1825 yılında İngiltere’nin iki kasabası arasında başlayan ve daha sonra tüm Dünya’ya hızla yayılan demiryolu taşımacılığı sanayi devrimini ivmelendiren ana unsurlardan birisi olmuştur. Dünya tarihi içinde diğer taşıma türlerine göre yeni olmasına rağmen insanoğlunun hayatına çok büyük yenilikler getirmiş, modernleşmesini ve medeniyetin ana unsurlarından birisi haline gelmiştir. Çalışmada demiryolunun diğer taşıma türlerine göre bize sağladığı avantajlar, demiryolunun Dünya’daki tarihsel gelişimi ile şu andaki mevcut durumu ortaya konmuştur. Son bölümde Türkiye’nin Osmanlı Dönemi’nden itibaren günümüze kadar demiryolu taşımacılığı konusunda gösterdiği gelişme çabaları incelenmiştir. Bu çabalar içerisinde sadece demiryolu altyapısını inşa edilmesinin yeterli olmayacağı, altyapı inşası ile birlikte kullanılan makine, teçhizat tüm unsurların günümüz teknolojisi içerisinde donatılması ve ayrıca bunları üretebilecek teknolojiye sahip olunması gerektiği vurgulanmıştır