1,721,996 research outputs found
WGS Analysis of Staphylococcus warneri Outbreak in a Neonatal Intensive Care Unit
Get PDFXiang Zhang,1,* Yu Zhou,2,3,* Lu Fu,4,* Lu Zhou,5 Xiangjun Cheng,6 Wei Zhang,2,3 Zhongming Tan5 1Department of Infection Management, The First Affiliated Hospital with Nanjing Medical University, Jiangsu Province Hospital, Nanjing, Jiangsu Province, People’s Republic of China; 2Department of Preventive Veterinary Medicine, College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu Province, People’s Republic of China; 3Sanya Institute of Nanjing Agricultural University, Sanya, Hainan Province, People’s Republic of China; 4Department of Nosocomial Infection Management, Affiliated Maternity and Child Health Care Hospital of Nantong University, Nantong, Jiangsu Province, People’s Republic of China; 5NHC Key Laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention, Nanjing, Jiangsu Province, People’s Republic of China; 6Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Jiangsu Province Hospital, Nanjing, Jiangsu Province, People’s Republic of China*These authors contributed equally to this workCorrespondence: Zhongming Tan, NHC Key Laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention, No. 172 Jiangsu Road, Gulou District, Nanjing, Jiangsu Province, 210009, People’s Republic of China, Tel +862583759339, Email [email protected] Wei Zhang, Department of Preventive Veterinary Medicine, College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University, No. 1 Tongwei Road, Nanjing, Jiangsu Province, 210095, People’s Republic of China, Tel +862584396517, Email [email protected]: Staphylococcus warneri is an opportunistic pathogen responsible for hospital-acquired infections (HAIs). The aim of this study was to describe an outbreak caused by S. warneri infection in a neonatal intensive care unit (NICU) and provide investigation, prevention and control strategies for this outbreak.Methods: We conducted an epidemiological investigation of the NICU S. warneri outbreak, involving seven neonates, staff, and environmental screening, to identify the source of infection. WGS analyses were performed on S. warneri isolates, including species identification, core genome single-nucleotide polymorphism (cgSNP) analysis, pan-genome analysis, and genetic characterization assessment of the prevalence of specific antibiotic resistance and virulence genes.Results: Eight S. warneri strains were isolated from this outbreak, with seven from neonates and one from environment. Six clinical cases within three days in 2021 were linked to one strain isolated from environmental samples; isolates varied by 0– 69 SNPs and were confirmed to be from an outbreak through WGS. Multiple infection prevention measures were implemented, including comprehensive environmental disinfection and stringent protocols, and all affected neonates were transferred to the isolation wards. Following these interventions, no further cases of S. warneri infections were observed. Furthermore, pan-genome analysis results suggested that in human S. warneri may exhibit host specificity.Conclusion: The investigation has revealed that the outbreak was linked to the milk preparation workbench by the WGS. It is recommended that there be a stronger focus on environmental disinfection management in order to raise awareness, improve identification, and prevention of healthcare-associated infections that are associated with the hospital environment.Keywords: Staphylococcus warneri, neonatal intensive care unit, whole-genome sequencing, pan-genom
Staphylococcus warneri: brief literature review / Staphylococcus warneri: breve revisão da literatura
Get PDFCoagulase-negative Staphylococcus warneri is an opportunistic pathogen that is capable of causing several infections, especially in patients with indwelling medical devices. Antimicrobial resistance is a global challenge for the treatment of infections caused by staphylococci. The most important virulence factor of CoNS is the biofilm-producing ability. This brief literature review discusses aspects of the antimicrobial resistance and virulence factors of the Staphylococcus warneri. Literature about the Staphylococcus warneri listed in PubMed between 2011 and 2021 was reviewed. Staphylococcus warneri is a part of the normal flora of the skin, especially the nares, head, legs, and arms. The importance of S. warneri as a modern-day pathogen is growing, as it has established itself as a successful nosocomial pathogen. S. warneri isolates from these infections are generally resistant to beta-lactam antimicrobial agents. The virulence of S. warneri have been suggested to be multifactorial, including adhesins, enzymes, extracellular toxins, capsule, iron uptake systems, virulence regulators and to adhere to produce biofilm, invade and destroy epithelial cells. The pathogenetic mechanisms of infections their mechanisms of bacterial persistence and evasion of the host’s immune system have not yet been clearly elucidated. Only with deeper studies, which will allow a more comprehensive understanding of its physiological characteristics, will it be possible to design effective strategies against S. warneri
Susceptibility of staphylococcus warneri clinical isolate to antibiotics and its modifying by methylethylpiridinol
Get PDFВідомо, що Staphylococcus warneri (S. warneri) присутній у мікрофлорі шкіри та слизових оболонок людини. Описано, що S. warneri є новим потенційним патогеном, здатним викликати серйозні інфекції у зв'язку з наявністю імплантатів або в пацієнтів з імунодефіцитом. В окремих випадках, наприклад у відділеннях інтенсивної терапії новонароджених, де S. warneri виділений як основний збудник, він може характеризуватись резистентністю до широкого кола антибіотиків
Susceptibility of staphylococcus warneri clinical isolate to antibiotics and its modifying by methylethylpiridinol
No full textВідомо, що Staphylococcus warneri (S. warneri) присутній у мікрофлорі шкіри та слизових оболонок людини. Описано, що S. warneri є новим потенційним патогеном, здатним викликати серйозні інфекції у зв'язку з наявністю імплантатів або в пацієнтів з імунодефіцитом. В окремих випадках, наприклад у відділеннях інтенсивної терапії новонароджених, де S. warneri виділений як основний збудник, він може характеризуватись резистентністю до широкого кола антибіотиків
Pseudagolius warneri Gordon & Skelley 2007
No full text120 Pseudagolius warneri Gordon & Skelley, 2007Published as part of Minor, Pablo, 2017, New state records and updated checklist of Aphodiini and Eupariini (Coleoptera: Scarabaeidae: Aphodiinae) from Mexico, pp. 493-514 in Zootaxa 4244 (4) on page 508, DOI: 10.11646/zootaxa.4244.4.3, http://zenodo.org/record/43724
Уточнение сборки генома бактерий Staphylococcus warneri 22-1
No full textБиологический факультетБактерии Staphylococcus warneri являются представителями нормальной микробиоты человека. Ранее было выявлено, что данные микроорганизмы обладают высокой устойчивостью к присутствию органических растворителей в среде, что позволяет рассматривать их как потенциальных продуцентов биотоплива. В данной работе нами было осуществлено уточнение сборки генома бактерий Staphylococcus warneri 22-1. В частности, было осуществлено картирование межгенных спейсеров кластеров генов рРНК, а также определено положение сдвоенного кластера генов рРНК и установлено количество копий профага в геноме данного микроорганизма
AVALIAÇÃO DAS ESPÉCIES ENTEROCOCCUS FECALLIS, STAPHYLOCOCCUS WARNERI E STAPHYLOCOCCUS AUREUS
No full textObjetivo: identificar e quantificar os níveis de três possíveis novos patógenos (Enterococcus faecallis, Staphylococcus warneri e Staphylococcus aureus) em indivíduos periodontalmente saudáveis e com periodontite crônica avançada, com o propósito de estabelecer melhor o papel dessas espécies bacterianas. Materiais e Métodos: foram avaliados 30 indivíduos com periodontite crônica e 10 periodontalmente saudáveis que procuraram atendimento odontológico na Universidade Guarulhos. Os parâmetros clínicos de índice de placa, sangramento gengival, sangramento à sondagem, supuração, PS e NCI foram medidos em 6 sítios por dente, e nove amostras de biofilme subgengival foram coletadas por indivíduo e analisadas pela técnica de checkerboard DNA-DNA hybridization para níveis de E. faecallis, S. warneri e S. aureus. Resultados: os níveis médios de E. faecallis e S. warneri estavam mais altos no grupo de periodontite crônica do que no de saúde periodontal (
Уточнение сборки генома бактерий Staphylococcus warneri 22-1
No full textБиологический факультетБактерии Staphylococcus warneri являются представителями нормальной микробиоты человека. Ранее было выявлено, что данные микроорганизмы обладают высокой устойчивостью к присутствию органических растворителей в среде, что позволяет рассматривать их как потенциальных продуцентов биотоплива. В данной работе нами было осуществлено уточнение сборки генома бактерий Staphylococcus warneri 22-1. В частности, было осуществлено картирование межгенных спейсеров кластеров генов рРНК, а также определено положение сдвоенного кластера генов рРНК и установлено количество копий профага в геноме данного микроорганизма
Чутливість клінічного штаму staphylococcus warneri до антибіотиків та її модифікація емоксипіном
No full textBackground. S. warneri is a common commensal organism, but it can cause serious infections. One of the ways to increase a susceptibility of this microorganism to antibiotics is their combining with adjuvant remedies.
Objectives are to study the susceptibility of S. warneri clinical isolate to antibiotics and its modification by emoxypine - 2-ethyl-6-methyl-3-hydroxypyridine hydrochloride. Methods. Samples of purulent wound exudation were obtained from a patient with infective complications after the bone fracture and osteosynthesis by metal plates. Susceptibility of S. warneri clinical isolate to antibiotics and their combinations with emoxypine (1000 μg/disk) was studied by a standard disc diffusion technic. In the case of microbial resistance, the susceptibility of investigated isolate to such antibiotic was determined in a serial broth dilutions method without or with emoxypine and evaluated according to the minimum inhibitory concentration (MIC).
Results. In the disk diffusion method, S. warneri isolate was susceptible to all tested antibiotics, except chloramphenicol. The growth inhibition zones also were formed around disks containing emoxypine, but the susceptibility of S. warneri to this agent was low. Applying of emoxypine on the disks with antibiotics resulted in the increase of S. warneri growth inhibition in all cases, except the use of amikacin, gentamicin, and fusidic acid. The most pronounced changes were observed for a composition chloramphenicol / emoxypine. Using chloramphenicol alone in the liquid medium, MIC was over a cut-off point. Addition of emoxypine (209 μg/ml) decreased MIC of the antibiotic and restored the susceptibility S. warneri to chloramphenicol. Conclusions. The susceptibility of S. warneri clinical isolate to antibiotics can be increased by combining with emoxypine which, among other, overcomes the resistance of studied microorganism to chloramphenicol.Вступ. S. warneri - звичайний коменсальний організм, але він може спричинити серйозні інфекції. Одним із способів підвищення чутливості цього мікроорганізму до антибіотиків є їх поєднання з ад'ювантними засобами. Мета. Метою роботи є вивчення чутливості клінічного ізоляту S. warneri до антибіотиків та її модифікації етилметилгідроксипіридину гідрохлоридом (емоксипіном). Методи. Зразки гнійного раневого ексудату були одержані від хворої з з інфекційними ускладненнями після перелому кістки і операції остеосинтезу металевими пластинами. Чутливість клінічного ізоляту S. warneri до антибіотиків та їх комбінацій з емоксипіном (1000 мкг/диск) вивчали диск-дифузійним методом. У разі резистентності мікроорганізму чутливість досліджуваного штаму до такого антибіотика визначали методом серійних розведень без або з емоксипіном та оцінювали відповідно до мінімальної пригнічуючої концентрації (MПК).Результати. У диск-дифузійному методі ізолят S. warneri був чутливим до всіх випробуваних антибіотиків, крім хлорамфеніколу. Зони пригнічення росту також утворювались навколо дисків, що містять емоксипін, але чутливість S. warneri до цього засобу була низькою. Нанесення емоксипіну на диски з антибіотиками призвело до посилення пригнічення росту S. warneri у всіх випадках, за винятком застосування амікацину, гентаміцину та фузидової кислоти. Найбільш виражені зміни спостерігалися для комбінації хлорамфенікол / емоксипін. При використанні самого хлорамфенікол у рідкому середовищі, мінімальна пригнічуюча концентрація була вище точки відсічення. Додавання емоксипіну (209 мкг/мл) зменшило мінімальну пригнічуючу концентрацію антибіотика та відновило чутливість S. warneri до хлорамфеніколу. Висновки. Чутливість клінічного ізоляту S.warneri до антибіотиків можна збільшити, поєднуючи їх з емоксипіном, який, крім іншого, здатний подолати резистентність досліджуваного мікроорганізму до хлорамфеніколу
Vermicompost humic acid stimulatesin vitro growth ofCattleya warneri (Orchidaceae) seedlings
No full textAbstractCattleya warneri var. concolor(Orchidaceae) is an endangered epiphyte plant with ornamental economic potential. In this research, we have studied in vitro growth of C. warneri's seedlings at different doses of humic acids isolated from vermicompost. The evaluation on growth promoted by AH was performed using variables number of leaves and roots, fresh and dry weight of leaves and roots and estimates of the H+-ATPase enzyme activity. The results indicated that the humic material obtained was able to increase the growth of the studied plant and promoting stimuli associated with the said enzyme activity. It is thus established, an efficient biostimulant aimed at producing Cattleya warneri var. concolor seedlings.</p
- …
