159 research outputs found
Surface-charge effects on the electro-orientation of insulating boron-nitride nanotubes in aqueous suspension
No full textThe alignment of hexagonal boron-nitride nanotubes (BNNTs) in aqueous KCl solutions under spatially uniform electric fields was examined experimentally, using direct optical visualization to probe the orientation dynamics of individual BNNTs for different electric-field frequencies. Different from most previously studied nanowires and nanotubes, BNNTs are wide-bandgap materials which are essentially insulating at room temperature. We analyze the electro-orientation of BNNTs in the general context of polarizable cylindrical particles in liquid suspensions, whose behavior can fall into different regimes, including alignment due to Maxwell-Wagner induced dipoles at high frequencies, and alignment due to fluid motion of the electrical double layer around the particles at lower frequencies. For BNNTs, the variation of the crossover frequencies in the electro-orientation spectra was studied in electrolytes of different conductivity. The effect of BNNT surface charge on electro-orientation was further studied by changing the pH of the aqueous solution. We find that the electric-field alignment of the BNNTs in the low-frequency regime is associated with the charging and motion of the electrical double layer around the particle. However, as BNNTs are non-conducting particles, the reasons for the formation of the electrical double layer are likely to be different than that of conducting particles. We discuss two possible mechanisms for the double-layer formation and alignment of 1D dielectric particles, and make comparison to those for the more commonly studied conducting particles.Peer reviewe
Biodegradable Piezoelectric Micro‐ and Nanomaterials for Regenerative Medicine, Targeted Therapy, and Microrobotics
Get PDFPiezoelectric micro‐ and nanomaterials can generate local electrical signals when subjected to mechanical stress, a phenomenon that can be exploited to trigger beneficial effects at the cell and tissue level. In recent years, research on biodegradable piezoelectric material has gained momentum, as these materials can degrade after fulfilling their function. Thus, they promise to considerably impact regenerative medicine, targeted therapy, and microrobotics, with better chances to match regulatory requirements with respect to their nondegradable counterparts. This review offers a comprehensive overview of recent advancements in biodegradable piezoelectric micro‐ and nanomaterials, focusing on their piezoelectric mechanisms, material types, and methods to enhance their properties. Current characterization techniques, emphasizing both piezoelectricity and biodegradability at the micro/nano scale, are also discussed. Furthermore, it is discussed how to use these materials in intelligent platforms for regenerative medicine and responsive drug delivery systems. The application of piezoelectric micro‐ and nanomaterials in microrobotics is also examined, particularly their potential for minimally invasive procedures. Finally, challenges and future directions are highlighted, underscoring the importance of biodegradable piezoelectric materials as versatile platforms for advancing biomedical technologies
KARACABEY MERİNOSU KUZULARINDA MELANOKORTİN-4 RESEPTÖR (MC4R) GEN POLİMORFİZMİNİN BÜYÜME ÖZELLİKLERİNE ETKİSİ VE SELEKSİYONDA KULLANIM OLANAKLARININ ARAŞTIRILMASI
Get PDFKARACABEY MERİNOSU KUZULARINDA MELANOKORTİN-4
RESEPTÖR (MC4R) GEN POLİMORFİZMİNİN BÜYÜME
ÖZELLİKLERİNE ETKİSİ VE SELEKSİYONDA KULLANIM
OLANAKLARININ ARAŞTIRILMASI
Semih SEVİM
Doktora Tezi, Zootekni Anabilim Dalı
Tez Danışmanı: Prof.Dr. Orhan KARACA
2020, 85 Sayfa
Karacabey Merinosu kuzularında yapılan bu çalışmada, Melanokortin-4 Reseptör
(Mc4R) geni bakımından polimorfizmin tanımlanması ve kuzuların büyüme
özellikleri bakımından genotipler arası farklılıkların ortaya konması amaçlanmıştır.
Bu çalışma Koyunculuk Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü bünyesindeki koyunculuk
şubesinde bulunan 300 baş Karacabey Merinosu kuzuda yürütülmüştür. Kuzuların
büyüme özelliklerinin genotiplere göre değişimini saptamak üzere doğum ağırlığı,
45., 90. ve 180. gün canlı ağırlıkları, 0-90.gün, 90-180.gün ve 0-180 gün ortalama
günlük canlı ağırlık artışları, 90 ve 180. gün vücut ölçümleri ve ultrason ölçümleri
yapılmıştır. Mc4R geni, dizi bilgileri temin edildikten sonra tasarlanan primer
çiftleri vasıtasıyla Mc4R1 ve Mc4R2 bölgelerine ayrılmış ve sırasıyla 825 ve 590
bç uzunluğundaki bu bölgeler sorunsuz olarak dizilenmiştir. DNA dizilimi
çıkartılan bu bölgelerden Mc4R1 bölgesi içerisinde 9.T>C, 12.G>C, 93.G>A ve
381.G>A SNP’leri; Mc4R2 bölgesi içerisinde ise 681.G>C ve 1016.G>A SNP’leri
tespit edilmiştir. 9.T>C SNP’inin 90. gün vücut ölçümlerinden sağrı genişliği
(pC SNP’inin 90. gün canlı ağırlığı ve 0-90.gün ortalama günlük canlı
ağırlık artışı (pA SNP’inin 90. gün vücut ölçümlerinden sağrı
genişiliği (pA SNP’inin 90. gün ultrason ölçümlerinden yağ kalınlığı
(pC SNP’sinin 90. gün vücut ölçümlerinden cidago yüksekliği ile
but çevresi (p<0.05), 90. gün ultrason ölçümlerinden yağ kalınlığı (p<0.01),
1016.G>A SNP’inin 180. gün canlı ağırlığı (p<0.05), sütten kesim öncesi ortalama
günlük canlı ağırlık artışı (p<0.05), sütten kesim sonrası günlük canlı ağırlık artışı
(p<0.01), 0-180.gün ortalama günlük canlı ağırlık artışı (p<0.05), 90. gün ultrason
ölçümlerinden deri kalınlığı (p<0.05), 180. gün ultrason ölçümlerinden kas derinliği
viii
(p<0.05) ile ilişkili olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak Mc4R geninin koyunlarda
büyüme özellikleri için moleküler markör olarak kullanılabileceği düşünülmektedirİÇİNDEKİLER
KABUL VE ONAY SAYFASI.............................................................................. iii
BİLİMSEL ETİK BİLDİRİM SAYFASI ................................................................v
ÖZET..................................................................................................................... vii
ABSTRACT............................................................................................................ix
ÖNSÖZ ...................................................................................................................xi
KISALTMALAR VE SİMGELER DİZİNİ........................................................ xvii
ŞEKİLLER DİZİNİ...............................................................................................xix
ÇİZELGELER DİZİNİ .........................................................................................xxi
1. GİRİŞ ...................................................................................................................1
2. KAYNAK ÖZETLERİ ........................................................................................6
2.1. Karacabey Merinosu Irkı...................................................................................6
2.2. Koyun Yetiştiriciliğinde MLD (Musculus Longissimus Dorsi) Kasına ait
Ölçümlerin Önemi............................................................................................7
2.3. DNA Temelli Markörler....................................................................................8
2.3.1. Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPDs)...........................................8
2.3.2. Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (AFLPs) .......................................9
2.3.3. Tek Zincirli Konformasyon Polmorfizmi (SSCP) .........................................9
2.3.4. Sınırlandırılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLPs) ...............................10
2.3.5. Mikrosatelitler..............................................................................................10
2.3.6. Tek Nükleotid Polimorfizmi (SNP) .............................................................10
2.4. DNA Dizi Analizi Yöntemleri ........................................................................11
2.4.1. Maxam Gilbert Yöntemi ..............................................................................12
2.4.2. Sanger Yöntemi............................................................................................12
2.5. Mc4R Geninin Yapısı ve İşlevi.......................................................................13
2.6. Koyunlarda MLD kası üzerine yapılan çalışmalar..........................................14
xiv
2.7. Çiftlik Hayvanlarında Mc4R Gen Polimorfizmi ile İlgili Yapılmış
Çalışmalar ................................................................................................... 16
2.7.1. Koyunlarda yapılan Çalışmalar................................................................... 16
2.7.2. Farklı Türlerde yapılan çalışmalar............................................................... 17
3. MATERYAL VE YÖNTEM ............................................................................ 20
3.1. Materyal.......................................................................................................... 20
3.2. Yöntem........................................................................................................... 20
3.2.1. Hayvanlara Ait Verim Özelliklerinin Belirlenmesi..................................... 20
3.2.2. Kan Örneklerinin Alınması ve Saklanması ................................................. 23
3.2.3. Kan Örneklerinden DNA İzolasyonu .......................................................... 23
3.2.4. DNA’nın Saflık ve Miktar Ölçümü............................................................. 24
3.2.5. Mc4R Geninin PCR ile Yükseltgenmesi..................................................... 24
3.2.6. Dizi Analizi ................................................................................................. 26
3.2.6.1. PCR ürünlerinin saflaştırılması ................................................................ 26
3.2.6.2. Döngüsel dizileme protokolü (Cycle Sequencing)................................... 26
3.2.7. İstatistik Analiz............................................................................................ 27
4. BULGULAR VE TARTIŞMA.......................................................................... 29
4.1. Genomik DNA İzolasyon Sonuçları............................................................... 29
4.2. Mc4R Gen Bölgesinin PCR ile Çoğaltılması ................................................. 29
4.3. DNA Dizi Analizi Sonuçları .......................................................................... 29
4.4. Dizi Analizi ile Genotipleme Sonuçları ......................................................... 33
4.5. Canlı Ağırlık, Vücut ve Ultrason ölçümleri ................................................... 37
4.5.1. Canlı Ağırlık, Vücut ve Ultrason Ölçümlerine Ait Tanımlayıcı İstatistikler
..................................................................................................................... 37
4.6. Mc4R Gen Polimorfizmi ile Büyüme ve Verim Özellikleri Arasındaki
İlişkiler ........................................................................................................ 39
4.6.1. Canlı Ağırlık Kayıtları ile Genotipler Arası İlişkiler................................... 39
xv
4.6.2. 90. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri ile Genotipler Arası İlişkiler....47
4.6.3. 180. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri ile Genotipler Arası İlişkiler..51
4.7. Haplotip Blokları ile Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler...........................54
4.7.1. Diplotipler ile Canlı Ağırlıklar Arasındaki İlişki .........................................57
4.7.2. Diplotipler ile 90. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri Arasındaki İlişki
.....................................................................................................................62
4.7.3. Diplotipler ile 180. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri Arasındaki
İlişki .............................................................................................................65
5. SONUÇ ..............................................................................................................68
KAYNAKLAR ......................................................................................................71
ÖZGEÇMİŞ ...........................................................................................................8
Author lexicography and a theoretical evaluation on author dictionaries prepared in Turkey
No full textBatı literatüründe "author lexicography" ve "writer lexicography" ve Rus sözlükçülük geleneğinde "pisatel'skaya leksikografiya" ve "avtorskaya leksikografiya" adlandırmalarıyla karşılanan yazar sözlükleri hem dünyada hem de Türkiye'de birçok örneği olan genel sözlük tipolojisinde bir alt tür olarak yer alan sözlük türüdür. Genel sözlük tanımlarından ve uygulamalarından farklı olarak "yazar sözlükleri"yle ilgili birbirinden farklı özellikte uygulama örneklerinin yaygınlaşması bu uygulama alanıyla ilgili teorik çalışmalara da bir ihtiyaç olduğu gerçeğini ortaya koymuştur. İşte bu ihtiyacı karşılamak amacıyla yazar sözlüklerinin tarihi, amaçları, yöntemleri, makro ve mikro yapısı, tipolojisi gibi konular üzerine Türkiye dışında birçok çalışma yapılmış, teoriler, yöntemler belirlenmeye çalışılmıştır. Türkiye'de de birçok yazar sözlüğü örneği bulunmakla birlikte hem adlandırmayla ilgili birtakım karışıklıkların hem de uygulamada birtakım sorunların olduğu görülmektedir. Türkiye'deki yazar sözlüğü uygulamalarıyla ilgili bu belirsizliğe sebep olarak da yazar sözlüğünü oluşturan bileşenlerin belli bir parametreye sahip olmaması görülmektedir. Bu tez çalışmasında öncelikle Türkiye dışındaki yazar sözlüğüyle ilgili teorik çalışmalar incelenmiş, ardından hem Batı'daki yazar sözlüğü örnekleri hem de Türkiye'deki uygulamalar incelenerek yazar sözlüklerinin mega, makro ve mikro yapıları oluşturulmaya çalışılmıştır.
Author dictionaries, which called "author lexicography" and "writer lexicography" in Western literature and "pisatel'skaya lexicographyya" and "avtorskaya lexicography" in the Russian lexicography tradition, are a type of dictionary that is included as a subgenre in general dictionary typology, which has many examples both in the world and in Turkey. Unlike general dictionary definitions and applications, the spread of application examples with distinctive characteristics related to "author dictionaries" has revealed the fact that there is a need for theoretical studies related to this field of application. To meet this need, many studies have been carried out outside Turkey on topics such as the history, purposes, methods, macro and microstructure, typology of author dictionaries, and theories and methods have been tried to be determined. Although there are many examples of authors' dictionaries in Turkey, it is seen that there are some confusions about naming and some problems in practice. The reason for this uncertainty about the author dictionary practices in Turkey is that the components that make up the author dictionary do not have a certain parameter. In this thesis study, firstly, theoretical studies related to the author dictionary outside Turkey were examined, then both the examples of author dictionaries in the West and the practices in Turkey were examined to create mega, macro and microstructures of author dictionaries
To what extent may the unfavorable viewpoints of critics on E. A. Poe's use of horror and social satire in his stories be refuted by examples from and analysis of the author's eight short stories?
Get PDFWith numerous short stories and poems, Edgar Allan Poe is considered to be the piquant and
astounding milestone of the American Literature. Yet, his style and achievements have always
been interpreted antagonistically by large numbers of critics. This study analyzes the features
unique to Edgar Allan Poe in his short stories “Murders In The Rue Morgue”, “The Fall of
The House of Usher”, “A Tale of Jerusalem”, “The Pit and The Pendulum”, “The System of
Doctor Tarr and Professor Fether”, “A Cask Of Amonillado”, “The Masque of Red Death”
and “The Man That Was Used Up” while refuting to chosen examples of negative reviews
about Edgar Allan Poe.
Due to the fact that Edgar Allan Poe is well-known for his usage horror, satire, humor and
fiction in his short stories, these qualities have been criticized mostly by many writers and
philosophers as well. In this sense, the scope of the study will be sharpened on how these
techniques are used in his short stories to make them nonpareil and what was Edgar Allan
Poe’s authorial intention while utilizing these attributes in his works. At this point the analysis
of the characters, themes and plot will be prioritized compared to the language and style that
Edgar Allan Poe uses in his texts.
Since the criticism against Poe focus on the usefulness of such features in his short stories and
how they intimidate the reader from the text, the study proves that the gap between Poe and
the reader is a simple issue of reciprocal misunderstanding which is proven to be artificial and
bogus with examples and facts from his short stories
Investigation of polymorphism in some native cattles for lactoferri̇n gene providing resistance to masti̇ti̇s
Get PDFBu çalışma, Aydın ilinde yetiştirilen yerli sığırlarda Laktoferrin gen polimorfizminin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. DNA, farklı lokasyonlarda yer alan 6 sürüde bulunan 100 bireyden alınan kan örneklerinden elde edilmiştir.Genotiplerin belirlenmesi için PCR-RFLP metodu kullanılmıştır. Sığır Laktoferrin genine ait 1050 bç'lik bölge PCR ile çoğaltılmış ve ardından HinfI restriksiyon enzimi ile kesime tabi tutulmuştur. HinfI enzim kesimi sonucu 635, 480, 180, 120 bç'lik bantlardan oluşan bir karışım elde edilmiştir. Bu çalışmada, daha önce literatürde bahsedilmemiş farklı bant uzunluklarına sahip olan (480, 180 ve 120 bç) ve "C" olarak adlandırılan bir allel tanımlanmıştır. Çalışmada, gen frekansları A ve C allelleri için sırası ile 0.435 ve 0.565, genotip frekansları ise AA, AC ve CC genotipleri için sırası ile 0.17, 0.53 ve 0.30 olarak belirlenmiştir. Konuyla ilgili yapılan çalışmalarda yaygın olarak gözlemlenen B alleli bu çalışmada gözlenmemiştir. Daha somut bilgilerin ortaya konabilmesi amacıyla bu gen bölgesinin DNA dizi analizinin yapılması faydalı olacaktır. Bu çalışmadan elde edilen bulgular literatüre önemli katkı sağlayacak düzeydedir.
This study was carried out to determine Laktoferrin gene polymorphism in Native cattle raised in Aydın province. DNA was extracted from 100 individual blood samples collected from cattle raised in 6 flocks at different locations. The PCR-RFLP methods were used to determine genotypes. A 1050 bp DNA fragment within bovine Laktoferrin gene was amplified with PCR and then digested with restriction endonuclease enzyme HinfI. The HinfI digestion produced a mixture containing of 635, 480, 180 and 120 bp. In this study we have detected a new allele as ''C'' with different fragments (480, 180 and 120 bp) which has not been observed in literature yet. In present study, A and C allele frequencies were identified with 0.435 and 0.565; AA, AC and CC genotype frequencies were identified with 0.17, 0.53 and 0.30, respectively. The B allele of Laktoferrin gene has not been observed. In order to reveal more concrete information, sequencing for the Laktoferrin gene may be useful. Results obtained from this study will provide a significant contribution to the literature
Babelnet ile zenginleştirilen twıtter doküman uzayında duygu analizi için işbirlikçi model kurulması
No full textDesigning preservation. Integrating the architectural project to UNESCO tools to tackle territorial fragility: the Tivoli case as a pilot experience
No full textThe research investigates the potential contribution of a design-based approach to the current institutional UNESCO safeguard tools concerning the relation core/territory, challenging the conservative role of buffer zones that lead to stalemate situations in terms of territorial development, especially in the Italian context. Through the analysis of case studies, a methodological approach is developed that focuses on the one hand on the use of design tools for the assessment of heritage-related territories (cognitive framework), and on the other hand on the use of design actions in the management strategies for valorisation (interpretation framework). These tools are tested on the relevant experimental case of Tivoli, seat of two major World Heritage sites, as a pilot experience of integration of design tools in safeguard and management strategies for the solution of territorial fragility in complex heritage-related contexts
Measuring localized viscoelasticity of the vitreous body using intraocular microprobes.
Get PDFVitrectomy is a standard ophthalmic procedure to remove the vitreous body from the eye. The biomechanics of the vitreous affects its duration (by changing the removal rate) and the mechanical forces transmitted via the vitreous on the surrounding tissues during the procedure. Biomechanical characterization of the vitreous is essential for optimizing the design and control of instruments that operate within the vitreous for improved precision, safety, and efficacy. The measurements are carried out using a magnetic microprobe inserted into the vitreous, a method known as magnetic microrheology. The location of the probe is tracked by a microscope/camera while magnetic forces are exerted wirelessly by applied magnetic fields. In this work, in vitro artificial vitreous, ex vivo human vitreous and ex vivo porcine vitreous were characterized. In addition, in vivo rabbit measurements were performed using a suturelessly injected probe. Measurements indicate that viscoelasticity parameters of the ex vivo human vitreous are an order of magnitude different from those of the ex vivo porcine vitreous. The in vivo intra-operative measurements show typical viscoelastic behavior of the vitreous with a lower compliance than the ex vivo measurements. The results of the magnetic microrheology measurements were validated with those obtained by a standard atomic force microscopy (AFM) method and in vitro artificial vitreous. This method allows minimally-invasive characterization of localized mechanical properties of the vitreous in vitro, ex vivo, and in vivo. A better understanding of the characteristics of the vitreous can lead to improvements in treatments concerning vitreal manipulation such as vitrectomy
- …
