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    Effets d'une alimentation riche en lipides sur l'inflexibilité métabolique: mécanismes de la réponse systémique et mitochondriale chez Drosophila melanogaster

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    La mitochondrie est l’organelle centrale au métabolisme de tous les organismes eucaryotes. Elle est capable de produire de l’énergie sous forme d’APT à partir de différentes sources de nutriments et est strictement régulée par un système élaboré d’effecteurs et de facteurs de transcription qui permettent de changer entre les types de nutriments dépendamment de leur disponibilité, un processus nommé flexibilité métabolique. Cependant, lors de surplus calorique chronique, telle que lors d’un traitement à une alimentation riche en lipides (HFD), l’organisme peut développer des dysfonctions mitochondriales causées par un surplus de nutriments, ce qui mène à la faillite du système de régulation, une condition nommée inflexibilité métabolique. Récemment, la mouche à fruit Drosophila melanogaster a émergé comme modèle pour l’étude du stress métabolique du fait des similarités que possèdent ces organismes au niveau des systèmes de régulation et la présence d’organes homologues aux humains. Cependant, peu d’études ont évalué l’effet de la HFD au niveau de la mitochondrie chez Drosophila et donc les mécanismes mis en place lors du développement de l’inflexibilité métabolique demeurent à peine élucidés. Lors de cette étude, nous avons cherché à dévoiler les mécanismes de la réponse systémique et mitochondriale chez Drosophila melanogaster lors du développement de l’inflexibilité métabolique induit par un traitement à une alimentation riche en lipides. Dans ce projet, la réponse systémique fut caractérisée par RMN pour évaluer les changements par rapport aux voies métaboliques, par GC-FID pour évaluer les effets sur le profil lipidique, ainsi que par des essais de longévité et de capacités locomotrices pour évaluer les effets physiologiques d’une alimentation riche en lipides, tandis que la réponse mitochondriale fut caractérisée par respirométrie sur des fibres musculaires perméabilisées et sur des isolations mitochondriales en combinaison avec la production de H₂O₂. En résumé, les résultats obtenus élucident plusieurs mécanismes de la réponse au traitement de la HFD à différents niveaux d’organisation chez Drosophila melanogaster, décrivant les caractéristiques clés du développement de l’inflexibilité métabolique. De ce fait, notre étude peut servir de base pour permettre l’identification de cibles plausibles pour le développement de produits pharmaceutiques afin de réduire les dommages causées par les dysfonctions mitochondriales ou encore de prévenir le développement de ceux-ci.thesis: M. Sc. (biochimie), Université de Moncton, 202

    Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis

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    The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed

    Relation entre phénotype et génotype mitochondrial : mesure du métabolisme mitochondrial en fonction de la température chez deux haplotypes de Drosophila simulans

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    Les mitochondries sont des organites possédant leur propre matériel génétique (ADN mitochondrial ou ADNmt), qui code pour des peptides interagissant avec ceux codés par l'ADN nucléaire pour former les complexes du système de transport des électrons (ETS) ainsi que l'ATP synthase. Ces complexes sont présumés évoluer partiellement pour ajuster la phosphorylation oxydative (OXPHOS), essentielle pour la production d'énergie de la cellule, en fonction des conditions environnementales rencontrées par l'organisme. Il a été suggéré que la sélection sur l'ADNmt peut mener à des haplotypes adaptés à différents environnements. Dans cette thèse, Drosophila simulans a été choisie pour examiner le potentiel adaptatif des divergences de l'ADN mitochondrial. Cette espèce ectotherme et eurytherme présente trois haplogroupes (511, 5/11 et 5/111) subdivisés et géographiquement distincts avec approximativement 3% de divergences inter-haplogroupes mais n'ayant aucune subdivision nucléaire observée au niveau des loci codés par l'ADN nucléaire. Le principal objectif de ce travail était d'examiner le rôle de l'ADN mitochondrial sur l'établissement de caractères phénotypiques tel que le métabolisme mitochondrial des haplotypes 5/11 et 5/111 de Drosophila simulans et de déterminer le potentiel adaptatif des divergences du génome mitochondrial sur les propiétés fonctionnelles des mitochondries en fonction des variations de température. Le premier objectif était d'identifier les différences au niveau des performances mitochondriales et de la thermosensibilité associées à la divergence des mitotypes 5/11 et 5/111 de Drosophila simulans, et spécifiquement en évaluant l'activité des différentes enzymes de l'ETS à quatre températures différentes en utilisant une approche in vitro (isolations mitochondriales). Nous avons montré que les différentes enzymes de l'ETS ont différentes thermosensibilités, ce qui peut mener à une distribution différente du contrôle de la respiration par les composantes de l'ETS et par les déshydrogénases en amont de l'ETS à différentes températures. Par exemple, nous avons détecté un excès apparent au niveau du complexe IV d'environ 604% et 613% pour 5/11 et 5/111 respectivement mais seulement à basse température (12°C), ce qui nous a amené à penser que cela était dû à un disfonctionnement des déshydrogénases à basse température. De plus le coefficient de contrôle métabolique mesuré pour le même complexe augmentait en fonction de la température passant de 0.09 à 12°C et atteignant jusqu'à 0.66 à 28°C. Cependant, les mesures sur la respiration mitochondriale (efficacité de l'OXPHOS, taux de respiration) n'ont pas démontrées de différences consistantes entre les haplotypes mitochondriaux. Nous n'avons donc pas pu conclure sur le potentiel adaptatif des divergences du génome mitochondrial à partir de ces résultats. Le second volet de cette thèse reprenait les mêmes objectifs que le premier. Cependant, pour ce chapitre, une nouvelle méthode (approche in situ) a été développée sur des fibres musculaires perméabilisées en utilisant un protocole en respirométrie à haute résolution afin de remplir ces objectifs et afin de comparer les résultats obtenus avec ceux déjà décrits dans le chapitre 1. Nous avons montré, et ce pour la première fois, que l'approche in situ est très appropriée pour évaluer les performances mitochondriales chez des invertébrés et serait même plus pertinente que l'approche in vitro. De plus hautes capacités catalytiques des complexes de rETS ont été détectées à 24°C pour le mitotype s111, essentiellement lorsqu'il y avait un flux d'électron élevé dans rETS (3712 et 2688 pmol 0 2.s·1.mg"1 de protéines pour sil 1 et silii respectivement). Cette capacité catalytique plus élevée pour sili peut donner un avantage à ce mitotype en terme d'intensité du métabolisme aérobie, d'endurance, ou des deux si l'intensité de l'exercice qui peut être effectué au niveau aérobique est dictée par la capacité aérobique du tissu. De plus, les résultats obtenus sur la thermosensibilité ont montré que même si la température affecte les capacités catalytiques des différentes enzymes de l'ETS, les mitotypes sM et silii ont une grande tolérance aux variations de température. Le troisième volet de cette thèse se concentrait sur l'évaluation du potentiel adaptatif des divergences de l'ADNmt aux quatre températures déjà testées dans les chapitres précédents en utilisant des introgressions. Ces introgressions consistent au transfert de l'ADNmt d'un mitotype dans l'environnement nucléaire d'une population possédant un autre mitotype (permettant un bris des interactions entre ADN nucléaire et ADNmt).Les performances mitochondriales des haplotypes ainsi créés (s/ll-introgressé et s/lli-contrôle) ont ensuite été mesurée avec l'approche in situ. Si le caractère métabolique propre aux mitochondries de la population Sili observé dans l'étude précédente était conféré par la spécificité de son haplotype mitochondrial, ce caractère métabolique devrait également être observé dans une population introgressée possédant ce même haplotype mitochondrial, mais un génome nucléaire étranger. Nos résultats ont montré que les capacités catalytiques des différentes enzymes de rETS dans les organismes introgressés (s/ll-introgressé) étaient quasiment similaires à celles détectées dans le mitotype s111, du moins à 24°C. De plus, les différences entre sili et Silii détectées à 24°C dans le second volet se retrouvent aussi entre s/ll-introgressé et s/lli -contrôle, dénotant que les propriétés fonctionnelles des mitochondries sont principalement conférées par l'ADN mitochondrial. Cependant, l'impact de la température divergeait entre s/11-introgressé et s/lli-contrôle, principalement au niveau de l'excès apparent de COX à 12°C (excès d'environ 193% pour srlil -contrôle, mais pas d'excès pour s/ll-introgressé) et au niveau des coefficients de température (Q lO) mesurés entre 12 et 18°C. Il est donc possible que les interactions entre ADN nucléaire et ADN mitochondrial soient nécessaires pour permettre aux organismes de faire face aux variations de température. C'est, selon nos connaissances, l'une des premières démonstrations claires du potentiel adaptatif de différents ADNmt sur les propriétés fonctionnelles des mitochondries

    Variations on the Author

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    “Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship

    Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis

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    We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis

    Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts

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    We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more sophisticated methods

    Author Index

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    koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist

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    We have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
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