160,459 research outputs found
optGpSampler: An Improved Tool for Uniformly Sampling the Solution-Space of Genome-Scale Metabolic Networks.
No full textContains fulltext :
126236.pdf (Publisher’s version ) (Open Access
Prof. Th. W. Adorno and the author Hans Erich Nossack.
No full textProf. Th. W. Adorno and the author Hans Erich Nossack at a reception of Insel Verlag, Buchmesse Frankfurt 1966LB
Estimating metabolic fluxes using a maximum network flexibility paradigm
No full textMotivation: Genome-scale metabolic networks can be modeled in a constraint-based fashion. Reaction stoichiometry combined with flux capacity constraints determine the space of allowable reaction rates. This space is often large and a central challenge in metabolic modeling is finding the biologically most relevant flux distributions. A widely used method is flux balance analysis (FBA), which optimizes a biologically relevant objective such as growth or ATP production. Although FBA has proven to be highly useful for predicting growth and byproduct secretion, it cannot predict the intracellular fluxes under all environmental conditions. Therefore, alternative strategies have been developed to select flux distributions that are in agreement with experimental "omics" data, or by incorporating experimental flux measurements. The latter, unfortunately can only be applied to a limited set of reactions and is currently not feasible at the genome-scale. On the other hand, it has been observed that micro-organisms favor a suboptimal growth rate, possibly in exchange for a more "flexible" metabolic network. Instead of dedicating the internal network state to an optimal growth rate in one condition, a suboptimal growth rate is used, that allows for an easier switch to other nutrient sources. A small decrease in growth rate is exchanged for a relatively large gain in metabolic capability to adapt to changing environmental conditions. Results: Here, we propose Maximum Metabolic Flexibility (MMF) a computational method that utilizes this observation to find the most probable intracellular flux distributions. By mapping measured flux data from central metabolism to the genome-scale models of Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae we show that i) indeed, most of the measured fluxes agree with a high adaptability of the network, ii) this result can be used to further reduce the space of feasible solutions iii) this reduced space improves the quantitative predictions made by FBA and contains a significantly larger fraction of the measured fluxes compared to the flux space that was reduced by a uniform sampling approach and iv) MMF can be used to select reactions in the network that contribute most to the steady-state flux space. Constraining the selected reactions improves the quantitative predictions of FBA considerably more than adding an equal amount of flux constraints, selected using a more naïve approach. Our method can be applied to any cell type without requiring prior information
Nowe spojrzenie na planowanie architektury mieszkaniowej w afryce subsaharyjskiej
No full textThe author shares his reflections on state of art in housing and urban planning, deficiencies, expectations and possibilities in the Sahel region of Africa. He notices, that the housing problem in Africa is one of the challenges, which should be solved in order to recover life dignity of African people and secure their rights to traditional family life in acceptable conditions. The paper describes the studies on the typical dispersed urban structures and the need to foster this type of settlement structure and proposals of introduction of new on light steel frame housing system in the area of Sahel, combining the traditional way of building houses with modern technology. The particularly analysed case, is the housing problem in the Republic of Chad. The author presents the basic discussion on this topic and his architectural proposals. Unfortunately, the gap between the needs and the financial feasibility of housing construction in this area, makes this project already at the starting point extremely difficult to be realized without external subventions.Problem mieszkaniowy w Afryce jest jednym z wyzwań, które należy rozwiązać, aby Afrykanie mogli odzyskać godność życiową i zabezpieczyć swoje prawa do tradycyjnego życia rodzinnego w akceptowalnych warunkach. W artykule opisano badania nad typowymi rozproszonymi strukturami miejskimi i potrzebą wspierania tego typu struktur osadniczych oraz propozycji wprowadzenia nowego systemu konstrukcji domów, opartym na lekkim szkielecie stalowym, łączącym tradycyjny sposób budowania domów z nowoczesną technologią. Przypadkiem szczególnie analizowanym jest problem mieszkaniowy w Republice Czadu. Autor przedstawia podstawową dyskusję na ten temat i swoje propozycje architektoniczne. Niestety luka między potrzebami mieszkaniowymi w Czadzie a finansową wykonalnością budownictwa mieszkaniowego w tym obszarze sprawia, że projekt ten, już w punkcie wyjścia, jest niezwykle trudny do realizacji bez uzyskania zewnętrznych dotacji
Synthetic dosage lethality in the human metabolic network is highly predictive of tumor growth and cancer patient survival
No full textContains fulltext :
149260.pdf (Publisher’s version ) (Open Access)Synthetic dosage lethality (SDL) denotes a genetic interaction between two genes whereby the underexpression of gene A combined with the overexpression of gene B is lethal. SDLs offer a promising way to kill cancer cells by inhibiting the activity of SDL partners of activated oncogenes in tumors, which are often difficult to target directly. As experimental genome-wide SDL screens are still scarce, here we introduce a network-level computational modeling framework that quantitatively predicts human SDLs in metabolism. For each enzyme pair (A, B) we systematically knock out the flux through A combined with a stepwise flux increase through B and search for pairs that reduce cellular growth more than when either enzyme is perturbed individually. The predictive signal of the emerging network of 12,000 SDLs is demonstrated in five different ways. (i) It can be successfully used to predict gene essentiality in shRNA cancer cell line screens. Moving to clinical tumors, we show that (ii) SDLs are significantly underrepresented in tumors. Furthermore, breast cancer tumors with SDLs active (iii) have smaller sizes and (iv) result in increased patient survival, indicating that activation of SDLs increases cancer vulnerability. Finally, (v) patient survival improves when multiple SDLs are present, pointing to a cumulative effect. This study lays the basis for quantitative identification of cancer SDLs in a model-based mechanistic manner. The approach presented can be used to identify SDLs in species and cell types in which "omics" data necessary for data-driven identification are missing
Seeing the world anew : the radical vision of Martin Waldseemüller's 1507 & 1516 world maps /
No full text9781929154470 (ISBN). 192915447X (ISBN). First edition 2012. Accompanied by 2 foldeds map in front and back pockets: 1507 map -- 1516 map.; Includes bibliographical references: pages 98-107.; Maps from pockets also available online http://nla.gov.au/nla.map-vn6254227; Original version of the 1507 map: Universalis cosmographiae secundum Ptholomaei traditionem et Americi Vespucii alioru que lustrationes. [St. Dié, France? : s.n., 1507]; Original version of the 1516 map: Carta marina, navigatoria Portugallen, navigationes atque tocius cogniti orbis terre marisque formam naturamq[u]e situs et terminos nostris temporibus recognitos et ab antiquorum traditione differentes eciam quor[um] vetusti non meminerunt auctores hec generaliter indicat / consumatum est in oppido S. Deodati compositione et digestione Martini Waldseemuller Ilacomili. [St. Dié, France? : s.n., 1516]. Prologue: In a Renaissance Vision, a Glimpse of the Modern / John W. Hessler -- "An island surrounded on all sides by sea" : The World Map, 1507 / John W. Hessler -- "Land of Cuba, part of Asia" : The Carta marina, 1516 / Chet Van Duzer -- Epilogue: A Renaissance That Resonates Still / John W. Hessler -- Notes -- Afterword / Ralph E. Ehrenberg -- About the authors -- Acknowledgments -- The Maps: The 1507 World Map, 12 sheets, with commentary -- Composite: front pocket -- The 1516 Carta marina, 13 sheets, with commentary -- Composite: back pocket
Klimat społeczny w szkole inkluzyjnej
No full textAuthor presented in this paper theoretical approach to the building of social climate in an inclusive school. The publication indicatessome tendencies and directions of changes to improve the functioning of these institutions and to implement the idea of inclusive education.Autorka przedstawiła w artykule teoretyczne ujęcie zagadnienia związanego z budowaniem klimatu społecznego w szkole inkluzyjnej. W publikacji ukazano pewne dążenia i kierunki zmian, jakich należy dokonywać w masowych szkołach, aby poprawić jakość funkcjonowania tych placówek, tak by kierowały się one ideą edukacji włączającej
Ewolucja programowa FDP w polityce wschodniej w latach 1949-1969 w świetle nowych zasobów Archiwum Niemieckiego Liberalizmu
No full textZasadniczym celem artykułu jest analiza działalności programowej FDP w polityce wschodniej Republiki Federalnej Niemiec w latach 1949-1969. Autor wykorzystał nowe zasoby Archiwum Niemieckiego Liberalizmu w Gummersbach, co umożliwiło przedstawienie nowej oceny wpływu FDP na politykę wschodnią Republiki Federalnej Niemiec.The main goal of the article is to analyze the FDP's program activities in the eastern policy of the Federal Republic of Germany in the years 1949-1969. Of great importance here is the fact that the author used in this work new archives from the Archives of German Liberalism in Gummersbach. This enabled him to present a new assessment of the FDP's impact on the eastern policy of the Federal Republic of Germany
Zasady szacowania gruntów w postępowaniach scaleniowych w Polsce
No full textThe subject of the study was the principles of land estimation used for the purpose of consolidation
proceedings, as they are applied in Poland.
The work examines the legal conditions relating to the estimation of land for the purposes of
consolidation. Documents prepared in the years 2005–2017 concerning land estimation (resolutions
of the consolidation participants, and protocols from the value estimates) have been
collected for 41 consolidated sites, located in 28 districts of 11 voivodships (regions). A survey
was conducted among the surveyors-designers of the consolidation proceedings, consisting of
19 questions. In the current year, the co-author of the present article was present at meetings of
consolidation proceedings’ participants, convened in order to determine the rules for estimating
land value on two sites located in different regions, and the material she collected during those
meetings was used in the article.
The collected data were subjected to an analysis, which showed that within Poland there is no
homogeneity in the method of estimating land value for the purpose of consolidation proceedings,
and that the method used to determine the value of land, taking into account the 1-hectare
estimated rate, and the price of 1dt of rye grain, according to the provisions of the agricultural
tax, is incompatible with the principles for the valuation of agricultural real estate, as specified in
the law on real estate management.Przedmiotem badań były zasady szacowania gruntów stosowane w postępowaniach scaleniowych w Polsce.
W ramach pracy przeanalizowano uwarunkowania prawne odnoszące się do szacunku gruntów na potrzeby scaleń. Zebrano dokumentację sporządzoną w latach 2005-2017 dotyczącą szacunku gruntów (uchwały uczestników scalenia i protokoły z przeprowadzonego szacunku) dla 41 obiektów scaleniowych, położonych na terenie 28 powiatów z 11 województw. Przeprowadzono ankietę wśród geodetów-projektantów scaleń, składającą się
z 19 pytań. Współautorka artykułu w bieżącym roku była obecna na spotkaniach uczestników scalenia, zwołanych w celu ustalenia zasad szacowania gruntów na dwóch obiektach, zlokalizowanych w różnych województwach i zebrane materiały dotyczące tych spotkań wykorzystane zostały w artykule.
Zgromadzone dane poddano analizie, która wykazała, że w Polsce nie ma jednolitości
w sposobie szacowania gruntów na potrzeby postępowań scaleniowych oraz że stosowany sposób określania wartości gruntów z uwzględnieniem stawek szacunkowych 1 ha oraz ceny 1dt żyta wg przepisów o podatku rolnym jest niezgodny z zasadami wyceny nieruchomości rolnych określonymi w ustawie o gospodarce nieruchomościami
Ograniczenia wolności słowa w Internecie
No full textThe development of Internet services lead to many changes in forms of expression of our opinions and ideas. The author shall discuss whether the term “freedom of speech” is still suitable for modern times, regarding the conversations in the social media. As we all know, the freedom of speech and the freedom of expression were never absolute and certain limitations of them are completely legal and necessary. However, as the author will try to prove, there are some serious concerns about executing such limitations online as well as effectively proving if someone’s rights have been violated due to excess of freedom of expression. The possible ideas of fighting the hate speech and other acts of trespassing the right to free expression shall also be presented.Rozwój usług Internetowych spowodował wiele zmian w sposobach wyrażania naszych opinii i pomysłów. Autor przeprowadzi rozważania odnośnie tego czy określenie “wolność słowa” jest wciąż adekwatne do współczesnych czasów, odnosząc się do rozmów w przestrzeni mediów społecznościowych. Powszechnie wiadomo, że wolność słowa i wolność wypowiedzi nigdy nie były absolutne i pewne ich ograniczenia są całkowicie legalne oraz konieczne. Jednakże, jak autor spróbuje wykazać, istnieją poważne wątpliwości odnośnie wykonalności takich ograniczeń w sieci, a także efektywnego dowodzenia, że cudze prawa zostały naruszone w związku z przekroczeniem granic wolności wypowiedzi. Propozycje możliwych rozwiązań w walce z mową nienawiści i innymi przejawami przekraczania prawa do wolności wypowiedzi także zostaną zaprezentowane
- …
