1,722,774 research outputs found
mariyam-khan/Causal_genes_GWAS_loci_CAD: Prediction of causal genes at GWAS loci with pleiotropic gene regulatory effects using correlated instrumental variable sets.
No full text<h2>v1.0.0 - Initial Release</h2>
<p>This release marks the initial milestone for the research project titled "Prediction of causal genes at GWAS loci with pleiotropic gene regulatory effects using correlated instrumental variable sets."</p>
<h3>Highlights:</h3>
<ul>
<li>Initial code for causal analysis as well as a step-by-step guide to using the functions.</li>
</ul>
<h3>Future Updates:</h3>
<p>More details and enhancements will be provided in subsequent releases. Stay tuned for additional information and updates on the per-print version of the paper.</p>
<p>For inquiries or feedback, don't hesitate to open an issue on GitHub or reach out to the project maintainers on GitHub.</p>
a case study on the maldives
Full text linkThesis(Master) --KDI School:Master of Public Policy,2008Outstandingmasterpublishedby Mariyam Zaahiya
Supporting Data for "Prediction of Causal Genes at GWAS Loci with Pleiotropic Gene Regulatory Effects Using Correlated Instrumental Variable Sets".
No full textThis repository contains datasets associated with the manuscript titled "Prediction of Causal Genes at GWAS Loci with Pleiotropic Gene Regulatory Effects Using Correlated Instrumental Variable Sets." These datasets serve the purpose of supporting the development and validation of a Multivariable Mendelian Randomization (MVMR) method, a statistical technique using sets of genetic instruments (SNPs) to estimate the direct causal effects of multiple exposures (genes) on Coronary Artery Disease (CAD).
The datasets aim to validate the Multivariable Mendelian Randomization (MVMR) method by utilizing summary statistics from Genome-Wide Association Studies (GWAS) on CAD and expression Quantitative Trait Loci (eQTL) analyses for gene expression data. The primary goal is to understand the genetic basis of CAD through pleiotropic gene regulatory effects. All files in this dataset have been generated from the following GWAS summary statistics and gene expression studies.
GWAS Summary Data (ebi-a-GCST003116):
- Trait: Coronary Artery Disease (CAD)
- Association Analysis: Instruments (SNPs) to Outcome (CAD)
- Year: 2015
- Population: European
- Source: TwoSampleMR Package
A GWAS (Genome-Wide Association Study) summary data file for a trait like Coronary Artery Disease (CAD) typically contains information about genetic variants across the entire genome and their associations with the trait of interest. Common components found in a GWAS summary data file include a SNP ID, which is a unique identifier for each genetic variant, often represented by a Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ID. Additionally, the file contains the chromosome and position (genomic location of the variant on a specific chromosome), alleles associated with each variant, effect size (Beta or Odds Ratio), standard error of the effect size, p-value, minor allele frequency (MAF), and sample size.
eQTL Analysis Summary Data:
- Source: STARNET/GTEx
- Association Analysis: Instruments (SNPs) to Exposures (Genes)
- Validation Data: GTEx
- Population: European-American subjects
- Validation Data Download Link: [GTEx Portal](https://gtexportal.org/home/datasets)
Nature and Scope:
The eQTL Analysis Summary Data also contains information in the same format as the GWAS data file, focusing on the expression levels of genes across different tissues (atherosclerotic aortic root (Aor), blood, atherosclerotic-lesion-free internal mammary artery (Mam), subcutaneous fat (Sf), visceral abdominal fat (Vaf), skeletal muscle (Sklm), and liver (Liv)). Each entry includes the association between a genetic variant (SNP) and a gene identified using a Gene ID (e.g., Ensembl ID), with the effect size representing the magnitude and direction of the association.
The dataset encompasses various files, including .csv files providing information on SNPs, gene expression, and outcome effects, and presenting the results of causal analyses. The dataset's primary focus lies in understanding the genetic basis of CAD through pleiotropic gene regulatory effects.
Detailed files overview in 0_ReadMe.tx
LAPORAN PENGABDIAN KEPADA MASYARAKAT MONITORING DAN EVALUASI PENERAPAN LAPORAN KEUANGAN NIRLABA PADA YAYASAN PANTI ASUHAN AISYAHTONG MARIYAM DI SURABAYA
Full text linkYayasan merupakan sebuah organisasi yang banyak mendapatkan sumbangan dari para
donatur dan digunakan untuk seluruh kegiatan operasional Yayasan tersebut. Mitra dalam
kegiatan pengabdian kepada masyarakat adalah Yayasan Panti Asuhan Aisyahtong Mariyam
yang merupakan lembaga nirlaba dimana memiliki tanggung jawab dalam mengelola keuangan
yang bersumber dari para donatur. Tanggung jawab tersebut dapat disajikan dalam penyusunan
laporan keuangan sesuai standar, yaitu PSAK Nirlaba, PSAK No. 45. Selama ini mitra kurang
efektif dalam menyusun laporan keuangan, oleh karena itu diperlukan suatu Sosialisasi
Laporan Keuangan Bagi Bentuk Usaha Nirlaba serta Penerapannya pada Yayasan Panti
Asuhan Aisyahtong Mariyam di Surabaya. Metode pelaksanaan monitoring dan evaluasi ini
menggunakan metode daring.
Dari hasil monitoring dan evaluasi diperoleh data kemajuan dari pihak Panti Asuhan
Aisyahtong Mariyam Surabaya. Pihak panti telah melaksanakan penyusunan laporan keuangan
sesuai dengan peraturan yang telah ditetapkan Pemerintah. Dengan kegiatan monitoring dan
evaluasi dalam kegiatan PKM ini diharapkan dapat memberikan dampak yang positif dalam
penyajian laporan keuangan nirlaba sehingga bisa digunakan sebagai pengambilan keputusa
Hubungan Self-Management Dengan Kualitas Hidup Pasien Pasca Stroke Di RSUD Encik Mariyam Tahun 2020
Full text linkTujuan penelitian ini untuk mengetahui apakah ada hubungan self -management dengan kualitas hidup pasien pasca stroke di RSUD Encik Mariyam Tahun 2020. Metode penelitian deskriptif analitik dengan pendekatan cross sectional, sampel dilakukan dengan tekhik purposive sampling dan menggunakan rumus Slovin. Jumlah sampel 38 responden. Hasil penelitian dianalisa dengan uji Spearman rho.Dengan hasil persentase respon tertinggi pada usia 56-65 tahun (47,37%), perempuan (63,16%),menikah (97,37%),pendidikan SMP (47,73%) dan tinggal bersama suami,isteri dan anak (42,11%).Dengan self-management yang baik (13,15%),self-management sedang (39,47%) dan self-management kurang (47,36%).Dengan kualits hidup yang baik (21,05%),kualitas hidup sedang (31,57%) dan kualitas hidup kurang (47,36%).Kesimpulan diketahui derajat kemaknaan α=0,00,diperoleh hasil p=0,000 dimana (p≤0,05),dengan kekuatan (r=0,967) yaitu sangat kuat dan arah hubungan positif artinya ada Hubungan Self-Management dengan Kualitas Hidup Pasien Pasca Stroke di RSUD Encik Mariyam. Diharapkan untuk lebih meningkatkan pengetahuan dan kinerja yang lebih baik guna memberikan bimbingan pelayanan kesehatan bagi pasien,khususnya pasien pasca stroke agar dapat mendukung pencapaian self-management yang baik untuk menunjang kualitas hidup pasien pasca stroke.Pasien stroke pada dasarnya masih mempunyai kemampuan untuk sembuh sesudah mengalami serangan stroke. Setengah dari pasien pasca stroke akan merasakan gejala sisa serangan stroke yang sangat beragam, yakni gangguan gerak atau pun motorik, gangguan penglihatan, gangguan bicara, perubahan emosi, serta gejala lain sesuai lokasi otak yang mengalami penyumbatan (Misbach, 2014). Tujuan penelitian ini untuk mengetahui apakah ada hubungan self -management dengan kualitas hidup pasien pasca stroke di RSUD Encik Mariyam Tahun 2020. Metode penelitian deskriptif analitik dengan pendekatan cross sectional, sampel dilakukan dengan tekhik purposive sampling dan menggunakan rumus Slovin. Jumlah sampel 38 responden. Hasil penelitian dianalisa dengan uji Spearman rho.Dengan hasil persentase respon tertinggi pada usia 56-65 tahun (47,37%), perempuan (63,16%),menikah (97,37%),pendidikan SMP (47,73%) dan tinggal bersama suami,isteri dan anak (42,11%).Dengan self-management yang baik (13,15%),self-management sedang (39,47%) dan self-management kurang (47,36%).Dengan kualits hidup yang baik (21,05%),kualitas hidup sedang (31,57%) dan kualitas hidup kurang (47,36%).Kesimpulan diketahui derajat kemaknaan α=0,00,diperoleh hasil p=0,000 dimana (p≤0,05),dengan kekuatan (r=0,967) yaitu sangat kuat dan arah hubungan positif artinya ada Hubungan Self-Management dengan Kualitas Hidup Pasien Pasca Stroke di RSUD Encik Mariyam. Diharapkan untuk lebih meningkatkan pengetahuan dan kinerja yang lebih baik guna memberikan bimbingan pelayanan kesehatan bagi pasien,khususnya pasien pasca stroke agar dapat mendukung pencapaian self-management yang baik untuk menunjang kualitas hidup pasien pasca stroke
KONSEP CARA PRODUKSI PANGAN YANG BAIK (CPPB) PADA PEMBUATAN SATE BANDENG DI UKM "HJ. MARIYAM" (SERANG-BANTEN)
Full text linkKONSEP CARA PRODUKSI PANGAN YANG BAIK (CPPB) PADA PEMBUATAN SATE BANDENG DI UKM “HJ. MARIYAM “ (SERANG - BANTEN) Putri Apriliani P 1 H3113075 Esti Widowati, S.Si., M.P 2 dan R.Baskara Katri Anandito, S.TP., M.P. 2 ABSTRAK Sate bandeng adalah produk olahan berbahan dasar ikan bandeng yang berasal dari daerah Serang, Propinsi Banten. Proses pembuatan sate bandeng dengan melumatkan daging ikan kemudian menambahkan bumbu-bumbu atau bahan tambahan pangan, lumatan daging dimasukkan kembali kedalam tubuh ikan dan dilakukan pembakaran. Praktek Quality Control di UKM “Hj. Mariyam bertujuan untuk mengetahui proses pembuatan sate bandeng, mengevaluasi dan menyusun konsep CPPB pada bahan baku, proses produksi, hingga produk akhir. Data diperoleh melalui wawancara, observasi, pengambilan sampel, pengujian, dan studi pustaka.Untuk mengetahui karakteristik mutu sate bandeng dari UKM Hj.Mariyam dilakukan beberapa pengujian antara lain kadar air, kadar abu, kadar protein total, kadar lemak dan Salmonella. Proses pembuatan sate bandeng di UKM Hj.Mariyam yaitu ikan bandeng dilakukan penyiangan dan pencucian, kemudian pengambilan daging, dilakukan pencampuran antara bahan tambahan dengan daging ikan, memasukan campuran adonan kedalam kulit ikan, pembakaran I, pelapisan dengan adonan, dan pembakaran II. Karakteristik sate bandeng yang diuji meliputi kadar air sebesar 46,59%, kadar abu 2,15%, protein total 7,85%, dan Salmonella Negatif. Penyusunan konsep CPPB dibutuhkan untuk menjamin mutu dan keamanan pada produk sate bandeng di UKM Hj. Mariyam, sehingga dapat diterima oleh masyarakat secara luas dan memenuhi syarat SNI 7757:201
MENINGKATKAN PERKEMBANGAN KOGNITIF ANAK MELALUI KEGIATAN MENGELOMPOKKAN WARNA DENGAN MEDIA BALOK KELOMPOK A DI TK MARIYAM KEDUNGDORO SURABAYA
Full text linkPenelitian ini di latar belakangi oleh kurang berkembangnya media pembelajaran anak dalam mengelompokkan benda berdasarkan warna, dalam kegiatan mengelompokkan warna selama ini menggunakan media gambar dipapan tulis dengan kapur dan benda nyata yang hanya dipegang guru tanpa anak memegang sendiri media tersebut. Seperti halnya yang terjadi di TK Mariyam Surabaya, dimana anak kelompok A kurang memahami konsep warna karena media pembelajaran yang digunakan tidak berkembang. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui apakah kegiatan mengelompokkan warna dengan media balok dapat meningkatkan perkembangan kognitif anak kelompok A di TK Mariyam Surabaya. Metode penelitian yang digunakan adalah penelitian tindakan kelas dengan menggunakan dua siklus dan setiap siklus terdiri dari perencanaan, pelaksanaan, observasi, dan refleksi. Alat pengumpulan data dengan teknik observasi dan dokumentasi. Sedangkan analisis data yang digunakan adalah teknik persentase. Hasil penelitian mendapatkan hasil meningkatnya perkembangan kognitif anak melalui kegiatan mengelompokkan warna dengan media balok, anak mendapatkan nilai rata-rata tertinggi pada siklus II yaitu 93,75% dengan kriteria Berkembang Sangat Baik. Dan nilai rata-rata terendah pada siklus II yaitu 68,75 % dengan kriteria Berkembang Sesuai Harapan. Kesimpulan penelitian ini menunjukkan bahwa permainan mengelompokkan warna dengan media balok dapat meningkatkan perkembangan kognitif anak kelompok A di TK Mariyam Surabaya. Disarankan untuk menggunakan media pembelajaran yang lebih bervariasi agar pemahaman anak terhadap warna lebih optimal
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
LAPORAN PENGABDIAN KEPADA MASYARAKAT SOSIALISASI LAPORAN KEUANGAN BAGI BENTUK USAHA NIRLABA SERTA PENERAPANNYA PADA YAYASAN PANTI ASUHAN AISYAHTONG MARIYAM DI SURABAYA
Full text linkYayasan merupakan sebuah organisasi yang banyak mendapatkan sumbangan dari para
donatur dan digunakan untuk seluruh kegiatan operasional instansi. Mitra dalam kegiatan
pengabdian kepada masyarakat adalah Yayasan Panti Asuhan Aisyahtong Mariyam yang
merupakan lembaga nirlaba dimana memiliki tanggung jawab dalam mengelola keuangan yang
bersumber dari para donatur. Tanggung jawab tersebut dapat disajikan dalam penyusunan
laporan keuangan sesuai standar, yaitu SAK Nirlaba. Selama ini mitra kurang efektif dalam
menyusun laporan keuangan, oleh karena itu diperlukan suatu “Sosialisasi Laporan Keuangan
Bagi Bentuk Usaha Nirlaba serta Penerapannya pada Yayasan Panti Asuhan Aisyahtong
Mariyam di Surabaya”. Metode pelaksanaan PKM menggunakan dua metode, yaitu metode
tatap muka dan daring. Survey dan pelatihan awal dilakukan dengan bertatap muka, yang
dilanjutkan dengan pelatihan dengan metode daring. Dengan adanya pelatihan dalam kegiatan
PKM ini diharapkan dapat memberikan dampak yang positif dalam penyajian laporan
keuangan sehingga bisa digunakan sebagai pengambilan keputusa
- …
