1,720,964 research outputs found
Identifikasi Isolat Klinik Methicillin-resistant Staphylococcus aureus dan Extended-Spectrum Beta-Lactamase Menggunakan Teknik Polimerase Chain Reaction
Full text linkBakteri patogen yang resisten terhadap banyak obat seperti Staphylococcus aureus yang kebal terhadap Methicillin (Methicillin-resistant Staphylococcus aureus/MRSA) telah menjadi agen penyebab infeksi baik di lingkungan pelayanan kesehatan maupun di masyarakat. Extended-Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) yang berasal dari mutasi β-laktamase juga menjadi masalah utama dalam infeksi terkait pelayanan kesehatan. Tujuan: Menentukan proporsi bakteri penghasil MRSA dan ESBL dari isolat klinis di Rumah Sakit Dr. M. Djamil Padang menggunakan teknik Polimerase Chain Reaction (PCR). Metode: Penelitian ini merupakan studi prospektif dengan mengumpulkan isolat Staphylococcus aureus dan Enterobacteriaceae dari Juli hingga September 2017. Penelitian dilakukan di Fakultas Kedokteran Universitas Andalas untuk mengkonfirmasi bakteri penghasil MRSA dan ESBL. Hasil: Sebanyak 15 dari 27 isolat Staphylococcus aureus (56%) merupakan MRSA dan 21 dari 41 isolat Enterobacteriaceae (51%) adalah penghasil ESBL. Klebsiella sp. paling banyak ditemukan di antara isolat Enterobacteriaceae (59%). Lima puluh persen Klebsiella sp menghasilkan ESBL. Simpulan: Studi ini menunjukkan bahwa setengah isolat klinis dari RSUP Dr. M. Djamil merupakan MRSA dan penghasil ESBL. Deteksi dini MRSA dan Enterobacteriaceae penghasil ESBL perlu dilakukan, untuk mencegah dan mengurangi transmisi bakteri MDR di lingkungan rumah sakit.
Kata kunci: Enterobacteriaceae, Klebsiella sp, MDR, Staphylococcus aureu
Analisis Karakteristik Molekular Virus SARS-CoV-2 di Sumatera Barat, Dihubungkan dengan Virulensi, Tingkat Infektivitas dan Implikasi Klinisnya
Full text linkSevere Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) rentan terhadap mutasi sehingga menghasilkan berbagai varian yang meningkatkan morbiditas dan mortalitas. Data karakteristik genomik SARS-CoV-2 di Sumatera Barat belum tersedia sehingga penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakteristik molekuler SARS-CoV-2 Sumatera Barat dan implikasinya terhadap virulensi, tingkat infektivitas, serta klinis penyakit. Penelitian ini merupakan penelitian nested di Pusat Diagnostik dan Riset Penyakit Infeksi (PDRPI) Fakultas Kedokteran Universitas Andalas. Sampel RNA memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi sebanyak 352 dari 745 sampel yang lolos skrining awal. Whole Genome Sequencing menggunakan protokol sekuensing Illumina MiSeq. Data sekuensing diolah dengan menggunakan perangkat lunak CLC Genomics Workbench® 21 version 21.0.3 untuk analisis bioinformatika. Hasil penelitian menunjukkan bahwa varian awal yang beredar di Sumatera Barat (Clade 19A, 20A, dan 20B), tergolong garis keturunan virus asal (ancestral), kemudian diikuti varian Delta dan Omicron. Jumlah mutasi asam amino, cenderung meningkat seiring dengan munculnya varian baru. Mutasi D950N mempercepat infektifitas sedangkan G142D merupakan faktor pencegah. Terdapat hubungan signifikan antara varian virus dengan virulensi, infektivitas dan klinis penyakit, dimana varian Delta 3,118 lebih berisiko memiliki luaran meninggal daripada ancestral. Varian Omicron 2,354 lebih berisiko memiliki gejala yang lebih ringan. Kesimpulannya evolusi SARS-CoV-2 dimulai dari varian awal ancestral ke varian Delta dan Omicron, dengan peningkatan mutasi dan hubungan yang signifikan antara jenis varian dengan virulensi serta gejala klinis yang ditimbulkannya. Surveilans berkelanjutan dan pemantauan genomik perlu dilakukan untuk deteksi cepat dan karakterisasi varian virus baru, dalam upaya mitigasi penyebaran virus dan strategi manajemen pandemi yang efektif.
Kata Kunci: Whole Genome Sequencing, filogenetik, surveilans genomi
HUBUNGAN FAKTOR RISIKO DENGAN KEJADIAN INFEKSI MDR Acinetobacter baumannii PADA PASIEN RAWAT INAP DI RSUP DR. M. DJAMIL PADANG PERIODE JULI - DESEMBER 2018
Full text linkRELATIONSHIP BETWEEN RISK FACTORS AND THE ISSUE OF MDR
Acinetobacter baumannii INFECTION IN PATIENT
AT RSUP DR. M. DJAMIL PADANG ON
JULY - DECEMBER 2018 PERIOD
By
Della Sylviani
ABSTRACT
Infection-related to Healthcare-Associated Infections (HAIs) previously known as nosocomial infections become problem that often faced by patients and health workers. Acinetobacter baumannii (A.baumannii) is one of the bacteria that frequently found in HAIs. The objective of this study is to determine the relationship between risk factors and the issue of A. Baumannii infection in hospitalized patients at RSUP Dr. M. Djamil Padang on July - December 2018.
This research is a descriptive-analytic study using total sampling method. The number of samples is 79 patients who have the culture results of A.baumannii. The data of characteristics and risk factors were collected from medical records. Data analysis have done by the chi-square test.
The results showed 83.5% of patients used urinary catheters, 77.2% of patients were hospitalized for a short period (<15 days), and 11.4% of patients had a history of open surgery. The relationship between the use of a urinary catheter with A.baumannii Multidrug-resistant (MDR) infection, duration of treatment with MDR A.baumannii infection, and history of open surgery with MDR A.baumannii infection were statistically valid (p <0.05).
There was a significant relationship between urinary catheter use, hospital stay, and a history of open surgery with the incidence of A.baumannii MDR infection. Infection control by isolating patients with A.baumannii MDR infection can reduce the spread of bacterial infections.
.Keywords : HAIs, Acinetobacter baumannii, urinary catheter, duration of hospital stay, open surgery
HUBUNGAN FAKTOR RISIKO DENGAN KEJADIAN INFEKSI MDR
Acinetobacter baumannii PADA PASIEN RAWAT INAP
DI RSUP DR. M. DJAMIL PADANG PERIODE
JULI - DESEMBER 2018
Oleh
Della Sylviani
ABSTRAK
Infeksi terkait pelayanan kesehatan Healthcare Associated Infections (HAIs) atau yang dahulunya disebut infeksi nosokomial merupakan sebuah permasalahan yang sering dihadapi oleh pasien dan tenaga kesehatan. Salah satu bakteri yang sering ditemukan pada HAIs adalah Acinetobacter baumannii (A.baumannii). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan faktor risiko dengan kejadian infeksi A. baumannii pada pasien rawat inap di RSUP Dr. M. Djamil Padang Periode Juli – Desember 2018.
Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif analitik dengan metode pengambilan sampel total sampling. Jumlah sampel sebanyak 79 pasien yang memiliki hasil kultur A.baumannii. Pengambilan data dari rekam medik berupa karakteristik dan faktor risiko. Analisis data dilakukan dengan uji chi-square.
Hasil penelitian menunjukan 83,5% pasien menggunakan kateter urin, 77,2% pasien di rawat di rumah sakit dalam jangka waktu yang singkat (<15 hari), dan 11,4% pasien memiliki riwayat operasi terbuka. Hubungan antara penggunaan kateter urin dengan infeksi Multi drug resistant (MDR) A.baumannii, lama rawatan dengan infeksi MDR A.baumannii, dan riwayat operasi terbuka dengan infeksi MDR A.baumannii bermakana secara statistik (p<0,05).
Terdapat hubungan yang bermakna antara penggunaan kateter urin, lama rawatan di rumah sakit, dan riwayat operasi terbuka dengan kejadian infeksi MDR A.baumannii. Pengendalian infeksi dengan cara melakukan isolasi terhadap pasien yang mengalami infeksi MDR A.baumannii dapat mengurangi penyebaran infeksi bakteri.
Kata kunci : HAIs, Acinetobacter baumannii, kateter urin, lama rawatan di rumah sakit, riwayat operasi terbuk
Gambaran Polimorfisme Gen SLC22A1 rs683369 pada Pasien Diabetes Melitus Tipe 2 yang Mendapatkan Terapi Metformin
Full text linkMekanisme kerja metformin dipengaruhi oleh Organic Cation Transporter 1 (OCT1) yang dikode oleh gen SLC22A1. Variasi atau polimorfisme pada gen SLC22A1 mempengaruhi uptake metformin ke hati sehingga berhubungan dengan efek metformin dalam menurunkan glukosa darah. Rs683369 merupakan salah satu polimorfisme dari gen SLC22A1. Tujuan: Melihat gambaran polimorfisme gen SLC22A1 rs683369 pada pasien diabetes melitus tipe 2 yang mendapatkan terapi metfomin. Metode: Penelitian ini merupakan studi deskriptif dengan teknik consequtive sampling. Sampel berasal dari 44 pasien DM tipe 2 yang mendapatkan terapi tunggal metformin yang diambil darahnya melalui pembuluh vena untuk dilakukan pemeriksaan genotip dengan cara isolasi DNA, PCR dan sekuensing. Hasil: Didapatkan pasien DM tipe 2 yang mendapatkan terapi tunggal metformin sebagian besar adalah perempuan 63,6%, dan rerata umur 55,77±7,77 tahun. Pemerikaan genotip didapatkan hasil wild type (GG) 4,5%, mutan heterozigot (GC) 22,%, dan mutan homozigot (CC) 72,7%. Simpulan: Ditemukan polimorfisme gen SLC22A1 rs683369 pada pasien DM tipe 2 yang mendapatkan terapi metformin. Perlu penelitian lebih lanjut mengenai variasi lain pada gen SLC22A1 dan efeknya terhadap gula darah pasien
Pengaruh Ekstrak Daun Sirsak (Annona muricata lin) Terhadap Viabilitas Cell Line Kanker Payudara T47D Secara In Vitro
Full text linkKanker payudara merupakan kanker terbanyak di Indonesia dengan angka mortalitas yang tinggi. Kandungan acetogenin, alkaloid, tannin, dan flavonoid pada daun sirsak dipercaya dapat menghambat pertumbuhan sel kanker. Tujuan: Mengetahui pengaruh ekstrak daun sirsak terhadap viabilitas cell line kanker payudara T47D secara in vitro. Metode: Ini merupakan penelitian eksperimental dengan metode MTT menggunakan cell line T47D yang dibagi menjadi 8 kelompok perlakuan konsentrasi ekstrak daun sirsak dan tiga variasi masa inkubasi serta pengulangan sebanyak empat kali. Pemeriksaan dibaca menggunakan xMark microplate reader dan selanjutnya ditentukan konsentrasi ekstrak yang dapat menghambat 50% viabilitas sel. Hasil: Ada penurunan viabilitas sel seiring dengan peningkatan konsentrasi yang diberikan pada ketiga masa inkubasi. Konsentrasi ekstrak yang dapat menghambat 50% viabilitas sel pada masa inkubasi 24 jam 569,8μg/ml, 48 jam 431,6 μg/ml, dan 72 jam 94,26 μg/ml. Simpulan: Ekstrak daun sirsak berpengaruh terhadap viabilitas cell line kanker payudara T47D dan dapat menghambat 50% viabilitas sel pada konsentrasi 94,26 μg/ml pada masa inkubasi 72 jam yang berpotensi sebagai antikanker
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Pregnancy confirmed COVID-19 in hospital Dr. M. Djamil Padang periode 2020-2021
Full text linkIntroduction: Coronavirus disease 2019 (COVID-19) caused a highly acute respiratory infection and high mortality. Symptoms of COVID-19 would be more severe if it affects people at high risk, one of which is pregnant women. This study aims to determine the characteristics of pregnant women with confirmed COVID-19 at RUSP Dr. M. Djamil Padang Objective: to find out the profile of the maternal charactheristic confirmed COVID-19 in hospital Dr. M. Djamil Padang Periode 2020-2021. Methods: This type of research is descriptive with a total sampling technique using secondary data, namely patient medical records. The sample of this study were all pregnant women who were confirmed to have COVID-19 at RSUP Dr. M. Djamil Padang for the 2020-2021 period with a total sample of 186 patient medical records. Univariate data analysis is presented in the form of frequency distribution and data processing using the Computerized SPSS version of the IBM version 26.0. Results: The highest age group was 20-35 years old (78%), the most addresses were Padang City (43,5). %), the most gravida status was multigravida (71,5%), the most parity status was multipara (38,2%), the most gestational age was third trimester (81,7%), the most clinical symptoms are asymptomatic (44,1 %), and the most comorbid status was without comorbid (82,3%). Conclusion: The most pregnant women have confirmed COVID-19 at RSUP Dr. M. Djamil Padang in 2020-2021 with characteristics of age 20-35 years, address in Padang City, status of multigravida and multiparous pregnancy, third trimester gestational age, asymptomatic and no comorbidities
- …
