67 research outputs found

    Impact des Antibiotiques sur le microbiote digestif et l’émergence de bactéries multirésistantes

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    The development of new generation sequencing methods has allowed us to deepen our knowledge on the role of the gut microbiota in human health and on the impact of its disruption, in particular by the use of antibiotic molecules. The impact of different antibiotic classes and molecules within the same class is only partially known. Antibiotics with high biliary elimination are known to be involved in dysbiosis phenomena. This impact would be correlated to the presence of residual antibiotics in the colonic lumen. To better understand this issue, we developed a technique for the determination of residual beta-lactam levels in faeces by UHPLC-ESI-MS method. We then compared in a prospective pilot study the impact of ceftriaxone and cefotaxime on the cultivable digestive microbiota of patients hospitalized in the internal medicine department of the Saint-Joseph hospital and treated with one of these two molecules. Finally, we evaluated the role of the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae on the occurrence of infectious episodes in patients hospitalized in intensive care and detected as rectal carriers. This work allowed us to demonstrate a profound but comparable impact of ceftriaxone and cefotaxime on the digestive microbiota. This similarity of impact despite a lower biliary elimination of cefotaxime can probably be explained by the use of a higher dosage and by its metabolization into a molecule presenting an antibiotic activity. Furthermore, the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae seems to play a major role in the occurrence of infectious episodes related to these bacteria. The relative fecal abundance of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae was higher in patients with recent antibiotic pressure and in patients colonized with a non-Escherichia coli species. These results deserve to be confirmed by larger prospective multicenter studies.Le développement des méthodes de séquençage de nouvelle génération a permis d’approfondir les connaissances sur le rôle du microbiote digestif en santé humaine et sur l’impact de sa perturbation notamment par la prise de molécules antibiotiques. L’impact des différentes classes antibiotiques et des molécules au sein d’une même classe n’est que partiellement connu. Les antibiotiques présentant une importante élimination biliaire sont réputés comme étant en cause dans les phénomènes de dysbiose. Cet impact serait corrélé à la présence d’antibiotiques résiduels dans la lumière colique. Pour mieux appréhender cette question, nous avons mis au point une technique de dosage des taux résiduels de bêta-lactamines dans les fécès par méthode UHPLC-ESI-MS. Nous avons ensuite comparé lors d’une étude pilote prospective l’impact de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif cultivable de patients hospitalisés dans le service de médecine interne de l’hôpital Saint-Joseph et relevant d’un traitement par l’une de ces deux molécules. Enfin nous avons évalué le rôle de l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE sur la survenue d’épisodes infectieux chez les patients hospitalisé en réanimation et dépistés comme porteurs au niveau rectal. Ces travaux nous ont permis de mettre en évidence un impact profond mais comparable de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif. Cette similarité d’impact malgré une élimination biliaire moindre du cefotaxime peut probablement être expliqué par l’utilisation de posologie plus élevée et par sa métabolisation en une molécule présentant une activité antibiotique. Par ailleurs, l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE semble jouer un rôle prépondérant dans la survenue d’épisodes infectieux liés à ces bactéries. L’abondance fécale relative en entérobactéries productrice de bêta-lactamase à spectre étendu était plus importante chez les patients ayant été récemment soumis à une pression antibiotique et les patients colonisés par une espèce non Escherichia coli. Ces résultats méritent d’être confortés par des études multicentriques prospectives de plus grande envergure

    Impact des Antibiotiques sur le microbiote digestif et l’émergence de bactéries multirésistantes

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    The development of new generation sequencing methods has allowed us to deepen our knowledge on the role of the gut microbiota in human health and on the impact of its disruption, in particular by the use of antibiotic molecules. The impact of different antibiotic classes and molecules within the same class is only partially known. Antibiotics with high biliary elimination are known to be involved in dysbiosis phenomena. This impact would be correlated to the presence of residual antibiotics in the colonic lumen. To better understand this issue, we developed a technique for the determination of residual beta-lactam levels in faeces by UHPLC-ESI-MS method. We then compared in a prospective pilot study the impact of ceftriaxone and cefotaxime on the cultivable digestive microbiota of patients hospitalized in the internal medicine department of the Saint-Joseph hospital and treated with one of these two molecules. Finally, we evaluated the role of the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae on the occurrence of infectious episodes in patients hospitalized in intensive care and detected as rectal carriers. This work allowed us to demonstrate a profound but comparable impact of ceftriaxone and cefotaxime on the digestive microbiota. This similarity of impact despite a lower biliary elimination of cefotaxime can probably be explained by the use of a higher dosage and by its metabolization into a molecule presenting an antibiotic activity. Furthermore, the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae seems to play a major role in the occurrence of infectious episodes related to these bacteria. The relative fecal abundance of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae was higher in patients with recent antibiotic pressure and in patients colonized with a non-Escherichia coli species. These results deserve to be confirmed by larger prospective multicenter studies.Le développement des méthodes de séquençage de nouvelle génération a permis d’approfondir les connaissances sur le rôle du microbiote digestif en santé humaine et sur l’impact de sa perturbation notamment par la prise de molécules antibiotiques. L’impact des différentes classes antibiotiques et des molécules au sein d’une même classe n’est que partiellement connu. Les antibiotiques présentant une importante élimination biliaire sont réputés comme étant en cause dans les phénomènes de dysbiose. Cet impact serait corrélé à la présence d’antibiotiques résiduels dans la lumière colique. Pour mieux appréhender cette question, nous avons mis au point une technique de dosage des taux résiduels de bêta-lactamines dans les fécès par méthode UHPLC-ESI-MS. Nous avons ensuite comparé lors d’une étude pilote prospective l’impact de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif cultivable de patients hospitalisés dans le service de médecine interne de l’hôpital Saint-Joseph et relevant d’un traitement par l’une de ces deux molécules. Enfin nous avons évalué le rôle de l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE sur la survenue d’épisodes infectieux chez les patients hospitalisé en réanimation et dépistés comme porteurs au niveau rectal. Ces travaux nous ont permis de mettre en évidence un impact profond mais comparable de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif. Cette similarité d’impact malgré une élimination biliaire moindre du cefotaxime peut probablement être expliqué par l’utilisation de posologie plus élevée et par sa métabolisation en une molécule présentant une activité antibiotique. Par ailleurs, l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE semble jouer un rôle prépondérant dans la survenue d’épisodes infectieux liés à ces bactéries. L’abondance fécale relative en entérobactéries productrice de bêta-lactamase à spectre étendu était plus importante chez les patients ayant été récemment soumis à une pression antibiotique et les patients colonisés par une espèce non Escherichia coli. Ces résultats méritent d’être confortés par des études multicentriques prospectives de plus grande envergure

    Impact des Antibiotiques sur le microbiote digestif et l’émergence de bactéries multirésistantes

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    The development of new generation sequencing methods has allowed us to deepen our knowledge on the role of the gut microbiota in human health and on the impact of its disruption, in particular by the use of antibiotic molecules. The impact of different antibiotic classes and molecules within the same class is only partially known. Antibiotics with high biliary elimination are known to be involved in dysbiosis phenomena. This impact would be correlated to the presence of residual antibiotics in the colonic lumen. To better understand this issue, we developed a technique for the determination of residual beta-lactam levels in faeces by UHPLC-ESI-MS method. We then compared in a prospective pilot study the impact of ceftriaxone and cefotaxime on the cultivable digestive microbiota of patients hospitalized in the internal medicine department of the Saint-Joseph hospital and treated with one of these two molecules. Finally, we evaluated the role of the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae on the occurrence of infectious episodes in patients hospitalized in intensive care and detected as rectal carriers. This work allowed us to demonstrate a profound but comparable impact of ceftriaxone and cefotaxime on the digestive microbiota. This similarity of impact despite a lower biliary elimination of cefotaxime can probably be explained by the use of a higher dosage and by its metabolization into a molecule presenting an antibiotic activity. Furthermore, the relative faecal abundance of ESBL-producing Enterobacteriaceae seems to play a major role in the occurrence of infectious episodes related to these bacteria. The relative fecal abundance of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae was higher in patients with recent antibiotic pressure and in patients colonized with a non-Escherichia coli species. These results deserve to be confirmed by larger prospective multicenter studies.Le développement des méthodes de séquençage de nouvelle génération a permis d’approfondir les connaissances sur le rôle du microbiote digestif en santé humaine et sur l’impact de sa perturbation notamment par la prise de molécules antibiotiques. L’impact des différentes classes antibiotiques et des molécules au sein d’une même classe n’est que partiellement connu. Les antibiotiques présentant une importante élimination biliaire sont réputés comme étant en cause dans les phénomènes de dysbiose. Cet impact serait corrélé à la présence d’antibiotiques résiduels dans la lumière colique. Pour mieux appréhender cette question, nous avons mis au point une technique de dosage des taux résiduels de bêta-lactamines dans les fécès par méthode UHPLC-ESI-MS. Nous avons ensuite comparé lors d’une étude pilote prospective l’impact de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif cultivable de patients hospitalisés dans le service de médecine interne de l’hôpital Saint-Joseph et relevant d’un traitement par l’une de ces deux molécules. Enfin nous avons évalué le rôle de l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE sur la survenue d’épisodes infectieux chez les patients hospitalisé en réanimation et dépistés comme porteurs au niveau rectal. Ces travaux nous ont permis de mettre en évidence un impact profond mais comparable de la ceftriaxone et du cefotaxime sur le microbiote digestif. Cette similarité d’impact malgré une élimination biliaire moindre du cefotaxime peut probablement être expliqué par l’utilisation de posologie plus élevée et par sa métabolisation en une molécule présentant une activité antibiotique. Par ailleurs, l’abondance fécale relative en entérobactéries productrices de BLSE semble jouer un rôle prépondérant dans la survenue d’épisodes infectieux liés à ces bactéries. L’abondance fécale relative en entérobactéries productrice de bêta-lactamase à spectre étendu était plus importante chez les patients ayant été récemment soumis à une pression antibiotique et les patients colonisés par une espèce non Escherichia coli. Ces résultats méritent d’être confortés par des études multicentriques prospectives de plus grande envergure

    Infections urinaires en ville : description de la population et épidémiologie actuelle des résistances bactériennes

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    Objectif : Réaliser une analyse épidémiologique des infections urinaires (IU) communautaires et analyser les taux de résistance bactérienne aux antibiotiques.Méthode : Étude de cohorte prospective multicentrique réalisée au sein d’une plateforme de laboratoires d’Ile de France concernant les patients majeurs ayant fait réaliser un ECBU positif au cours de la période de recrutement. Résultats : 1223 patients ont été inclus dont 995 femmes. Les principales indications à la réalisation de l’ECBU étaient la présence d'une symptomatologie urinaire (79,7%) et le contrôle après antibiothérapie (11,9%). 90,7% des ECBU étaient positifs à bacille Gram négatif, 70% à Escherichia coli. La prévalence des entérobactéries sécrétrices de bêta-lactamase à spectre étendu (EBLSE) était de 4,2%. Les taux de résistance d’Escherichia coli et des EBLSE étaient respectivement de 50% et 100% aux pénicillines, 20% et 80% aux fluoroquinolones et inférieur à 5% et 10% à la nitrofurantoïne et la fosfomycine. Les facteurs associés aux infections urinaires à EBLSE étaient l’âge élevé, la notion d’infections urinaires à répétition (OR =3,7), l’immunodépression (OR = 9,2), l’hospitalisation récente (OR = 4) et l’antibiothérapie récente (OR = 13,4).Conclusion : Les IU communautaires concernent quatre fois plus de femmes que d’hommes. La plupart des ECBU de ville sont réalisés devant la présence de symptômes urinaires. 90% sont positifs à BGN, 70% à Escherichia coli. La prévalence des EBLSE est de 4,2%. L’âge élevé, l’immunodépression, les infections urinaires à répétition, l’hospitalisation récente et l’antibiothérapie récents sont les principaux facteurs de risque d’IU communautaire à EBLSE

    Anomalies hématologiques rencontrées en soins primaires et réseau de soins ville-hôpital en hématologie

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    Introduction: the development of new therapies in hematology moves the management of these patients to ambulatory medicine. General practitioners (GPs) find themselves increasingly exposed to the management of complications of these diseases and their treatments. Objectives: the main objective of this study is to determine the nature and frequency of hematological abnormalities encountered in primary care medicine. Secondary objectives are to identify tools in order to improve the coordination of care with hematology and to determine the expectations of GPs in terms of training in this area. Materials and methods: a prospective study in France with an online form from 13 June to 31 July 2016. Statistical analysis was made by using Excel® and BioStatGV®. Results: 576 responses from 35 departments were analyzed. The main hematologic abnormalities encountered in primary care medicine are, in decreasing order: anemia, hyperleucocytosis, lymphadenopathy, leukopenia, monoclonal gammapathy and thrombocytopenia. The main expectations are a shorter appointment settling time; a reference contact with a direct line for counseling and a more explicit procedure in the report in case of complications. 95% of GPs are favorable for the development of training in hematology in particular on the Internet. Conclusion: GPs are increasingly involved in the care of hematology patients. Good coordination between these actors is essential to ensure quality care.Introduction : le développement de nouveaux traitements en hématologie déplace la prise en charge de ces patients vers la médecine ambulatoire. Les médecins généralistes (MG) se retrouvent de plus en plus exposés à la prise en charge des complications de ces pathologies et de leurs traitements. Objectifs : l’objectif principal de cette étude est de déterminer la nature et la fréquence des anomalies hématologiques rencontrées en soins primaires. Les objectifs secondaires sont d’identifier des outils pour l’amélioration de la coordination des soins avec les services d’hématologie et de déterminer les attentes des MG en terme de formation dans ce domaine. Matériel et méthodes : étude prospective en France métropolitaine par questionnaire en ligne du 13 juin au 31 juillet 2016. Analyse statistique par Excel® et BioStatGV®. Résultats : 576 réponses de 35 départements ont été analysées. Les principales anomalies hématologiques rencontrées en soins primaires sont, par ordre décroissant : les anémies, les hyperleucocytoses, les adénopathies, les leucopénies, les gammapathies monoclonales et les thrombopénies. Les principales attentes sont des délais de rendez-vous plus courts, un interlocuteur référent joignable sur une ligne direct pour les avis et une marche à suivre plus explicite dans les comptes rendus en cas de complication. 95% des MG sont favorables au développement de formations en hématologie en particulier par internet. Conclusion : les MG sont de plus en plus impliqués dans la prise en charge des patients d’hématologie. Une bonne coordination entre ces acteurs est indispensable pour assurer des soins de qualité

    L’antibiothérapie est-elle différée selon les recommandations dans les infections urinaires de l'adulte en ambulatoire ? Étude prospective auprès des médecins généralistes

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    Resistance to antibiotics is a major public health issue. Urinary tract infections (UTI) represent 15% of all antibiotic prescriptions in ambulatory care. We carried out a prospective study with questionnaires including adult patients who present symptoms of UTI between June and October 2017. The main purpose was to assess whether guidelines are followed by general practionners, especially when considering postponing antibiotic therapy. 154 questionnaires were completed and results analysed. 35% of deferrable antibiotic therapies were, in fact, deferred. Fear of pyelonephritis as possible complication and patient demands were the biggest hindrance. 66% of empiric antibiotic therapies in UTI with risk of complication were suitable. Our study shows a significant difference between practices of family physicians and guidelines concerning management of UTI, mostly when antibiotic therapy could be postponed. The pertinence of such a recommendation has yet to be questioned in outpatient care.L’antibiorésistance est un problème de santé publique majeur. Les infections urinaires (IU) représentent 15% des prescriptions antibiotiques en ville. Nous avons mené une étude prospective par questionnaires incluant les patients adultes consultant en soins primaires dans un contexte d’IU entre juin et octobre 2017. L’objectif principal était de connaître l’adéquation entre les pratiques en cabinet de médecine générale et les recommandations notamment concernant le report de l’antibiothérapie. 154 questionnaires anonymes ont été évaluables dans leur totalité. 35% des antibiothérapies décalables l’ont été. Les principaux freins déclarés étaient la peur de complication en pyélonéphrite et la pression du patient. 66% des antibiothérapies probabilistes dans les infections urinaires à risque de complication étaient conformes aux recommandations. Notre étude tend à montrer un écart significatif entre les pratiques et les recommandations dans l’antibiothérapie probabiliste des IU surtout concernant les situations où la temporisation de l’antibiothérapie est préconisée. Les résultats interrogent la pertinence de cette recommandation en médecine de ville

    Recent advances in the understanding and management of mucormycosis [version 1; referees: 2 approved]

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    Mucormycoses were difficult-to-manage infections owing to limited diagnostic tools and therapeutic options. We review here advances in pathology understanding, diagnostic tools including computed tomography, and serum polymerase chain reaction and therapeutic options

    Infectious Complications of Targeted Therapies for Solid Cancers or Leukemias/Lymphomas

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    Background: Infections are well known complications of some targeted drugs used to treat solid organ cancer and hematological malignancies. Furthermore, Individual patient risk factors are associated with underlying pathologies, concomitant immunosuppressive treatment, prior treatment and use of anti-infective prophylaxis. Immune-related adverse events (irAEs) are frequent among patients treated with new targeted drugs. Objectives: In this narrative review, we present the current state of knowledge concerning the infectious complications occurring in patients treated with immune checkpoint inhibitors (ICIs), Bruton’s tyrosine kinase (BTK) inhibitors, phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) inhibitors, antiapoptotic protein BCL-2 inhibitors, Janus kinase inhibitors or CAR-T cell infusion. Sources: We searched for studies treating infectious complications of ICIs, BTK inhibitors, PI3K inhibitors, antiapoptotic protein BCL-2 inhibitors and CAR-T cell therapy. We included randomized, observational studies and case reports. Content: Immune-related adverse events (irAEs) are frequent among patients treated with new targeted drugs. Treatment of irAEs with corticosteroids and other immunosuppressive agents can lead to opportunistic infections. Bruton’s tyrosine kinase (BTK) inhibitors are associated with higher rate of infections, including invasive fungal infections. Implications: Infections, particularly fungal ones, are common in patients treated with BTK inhibitors even though most of the complications occurring among patients treated by ICIs or CART-cells infusion are associated with the treatment of side effects related to the use of these new treatments. The diagnosis of these infectious complications can be difficult and may require extensive investigations

    Empiric Treatment in HAP/VAP: “Don’t You Want to Take a Leap of Faith?”

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    Ventilator-associated pneumonia is a frequent cause of ICU-acquired infections. These infections are associated with high morbidity and mortality. The increase in antibiotic resistance, particularly among Gram-negative bacilli, makes the choice of empiric antibiotic therapy complex for physicians. Multidrug-resistant organisms (MDROs) related infections are associated with a high risk of initial therapeutic inadequacy. It is, therefore, necessary to quickly identify the bacterial species involved and their susceptibility to antibiotics. New diagnostic tools have recently been commercialized to assist in the management of these infections. Moreover, the recent enrichment of the therapeutic arsenal effective on Gram-negative bacilli raises the question of their place in the therapeutic management of these infections. Most national and international guidelines recommend limiting their use to microbiologically documented infections. However, many clinical situations and, in particular, the knowledge of digestive or respiratory carriage by MDROs should lead to the discussion of the use of these new molecules, especially the new combinations with beta-lactamase inhibitors in empirical therapy. In this review, we present the current epidemiological data, particularly in terms of MDRO, as well as the clinical and microbiological elements that may be taken into account in the discussion of empirical antibiotic therapy for patients managed for ventilator-associated pneumonia
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