68 research outputs found

    Estimation of interdomain flexibility of N-terminus of factor H using residual dipolar couplings

    No full text
    Characterization of segmental flexibility is needed to understand the biological mechanisms of the very large category of functionally diverse proteins, exemplified by the regulators of complement activation, that consist of numerous compact modules or domains linked by short, potentially flexible, sequences of amino acid residues. The use of NMR-derived residual dipolar couplings (RDCs), in magnetically aligned media, to evaluate interdomain motion is established but only for two-domain proteins. We focused on the three N-terminal domains (called CCPs or SCRs) of the important complement regulator, human factor H (i.e., FH1-3). These domains cooperate to facilitate cleavage of the key complement activation-specific protein fragment, C3b, forming iC3b that no longer participates in the complement cascade. We refined a three-dimensional solution structure of recombinant FH1-3 based on nuclear Overhauser effects and RDCs. We then employed a rudimentary series of RDC data sets, collected in media containing magnetically aligned bicelles (disklike particles formed from phospholipids) under three different conditions, to estimate interdomain motions. This circumvents a requirement of previous approaches for technically difficult collection of five independent RDC data sets. More than 80% of conformers of this predominantly extended three-domain molecule exhibit flexions of &lt;40°. Such segmental flexibility (together with the local dynamics of the hypervariable loop within domain 3) could facilitate recognition of C3b via initial anchoring and eventual reorganization of modules to the conformation captured in the previously solved crystal structure of a C3b:FH1-4 complex.</p

    Penolakan Pemberian Status Justice Collaborator Dalam Perkara Tindak Pidana Korupsi (Tinjauan Yuridis Putusan Nomor 50/Pid.Sus-Tpk/2020/Pn.Jkt.Pst)

    No full text
    Tindak pidana korupsi merupakan tindak pidana yang dapat dilakukan secara terorganisasi. Penyelesaian tindak pidana terorganisasi ini cenderung sulit. Hal yang mendasari sulitnya penyelesaian tindak pidana tersebut dikarenakan tindak pidana terorganisasi dilakukan oleh banyak orang. Salah satu upaya untuk menyelesaikan tindak pidana terorganisasi adalah dengan dihadirkannya seorang Justice Collaborator. Pelaku tindak pidana tidak semuanya dikategorikan sebagai Justice Collaborator, ada identifikasi seseorang dapat dikatakan sebagai Justice Collaborator. Putusan Nomor 50/Pid.Sus-Tpk/2020/PN.Jkt.Pst memuat mengenai pertimbangan hakim mengenai penolakan pemberian status Justice Collaborator. Penelitian ini merupakan penelitian kualitatif dengan metode pendekatan perundang-undangan dan metode pendekatan kasus. Data yang digunakan adalah data sekunder. Data tersebut kemudian diolah dengan reduksi data, display data serta kategorisasi data, lalu kemudian disajikan dengan teks naratif dan dianalisa dengan menggunakan metode yuridis normatif bersifat kualitatif. Penelitian ini dilakukan berdasarkan Putusan Nomor 50/Pid.Sus-Tpk/2020/PN.Jkt.Pst yang memperoleh data sebagai berikut: majelis hakim sudah tepat dalam memutuskan penolakan permohonan status Justice Collaborator yang diajukan oleh Terdakwa Joko Soegiarto Tjandra. Alasan penolakan permohonan tersebut adalah Terdakwa Joko Soegiarto Tjandra tidak memenuhi syarat sebagaimana seseorang dapat diidentifikasikan menjadi Justice Collaborator. Syarat seseorang dapat dikatakan sebagai Justice Collaborator belum ada peraturan perundang-undangan yang pasti mengenai Justice Collaborator maka, syarat mengenai identifikasi seseorang dapat dikatakan sebagai Justice Collaborator terdapat di dalam SEMA Nomor 04 Tahun 2011

    Uji Hemaglutinasi Assay pada Hemolimf Spodoptera exigua yang diberi Perlakuan Botani Pestisida

    No full text
    Abstract. The larval stage of the armyworm (Spodoptera exigua), has a high and polyphagous feeding activity so that these insects have the potential to be pests in agriculture. The use of botanical pesticides in this case Mirabilis jalapa, is expected to control agricultural pests so that research on the immune system of S. exigua larvae is carried out by observing lectins that play a role in analyzing foreign molecules that enter the insect's body. The results were obtained, the higher the M. jalapa concentration, at the concentration of M. jalapa 0.4% and 0.8%, the lower the hemolymf agglutination titers. This is thought to decrease the binding capacity of lectins to foreign molecules. So that M. jalapa has the potential to be used as an environmentally friendly botanical pesticide.Keywords: agricultural pests, botanical pesticides, lectin agglutination

    Pengaruh Ekstrak Mirabilis jalapa terhadap Jumlah Hemosit Larva Spodoptera exigua

    No full text
    ABSTRAKEkstrak tanaman Mirabilis jalapa diketahui berperan sebagai biopestisida alami. Larva Spodoptera exigua merupakan salah satu hama dalam bidang pertanian jika jumlahnya berlebih di alam.  Konsentrasi subletal tanaman M. jalapa 0.4% dan 0.8% yang diberikan pada pakan larva S. exigua, akan mempengaruhi sistem imun larva berupa penurunan  jumlah total konsentrasi hemosit sebesar  1.66 ± 0.47  dan 1.01 ± 0.07 (sel/mL x 106). Kata kunci: Mirabilis jalapa, Spodoptera exigua, hemosit, system imun ABSTRACTExtracts of Mirabilis jalapa plant, known to act as a natural biopesticide Spodoptera exigua larvae is one of the pests in agriculture if the amount is excessive in nature. M. jalapa plant sublethal concentrations of 0,4 % and 0,8 % were given to the larvae of a decrease in the total number of hemocytes concentration of 1.66 ± 0.47 and 1.01 ± 0.07 (cell/mL x 106). Keywords: Mirabilis jalapa, Spodoptera exigua, hemocytes, immune syste

    Alokasi Energi, Fekunditas, dan Sintasan Larva Cacing Nipah Simpatrik (Polychaeta: Nereididae)

    No full text
    Two species of semelparity Nypa palm worms can only reproduce once during their lifetime lives sympatrically. This reproductive is a unique strategy for allocating energy and fecundity to maximize fertility and larval survival. Information about energy allocation and fecundity of semelparity Nypa palm worms is not yet available. This study aimed to obtain data on the strategy of two species of sympatric Nypa palm worms related to total energy allocation, fecundity, and larval survival. Energy allocation determining by the proportion between reproductive energy and somatic energy. Fecundity was calculated based on the total number of oocytes obtained from the same individual samples used for energy measurement. Larvae survival was counting the trochophore and 3-setigers larvae resulting from fertilization. Energy allocation, fecundity, and survival were analyzed descriptively. The results showed that both sympatric species allocated energy for reproduction. The fecundity of Namalycastis rhodochorde was higher than that of Namalycastis abiuma, but had lower larval survival than N. abiuma. Fecundity in N. rhodochorde is a strategy to compensate for the low survival rate. Meanwhile, N. abiuma had lower fecundity but had high larval survival. Fecundity and larval survival between the two sympatric Nypa palm worm species differed, but both allocated the same energy. Different larval survival yet similar energy allocation is their strategy to survive in the same environmental conditions.    Dua spesies cacing nipah semelparitas yang hanya dapat melakukan reproduksi sekali selama hidupnya ditemukan hidup secara simpatrik. Kemampuan adaptasi ini mengindikasikan adanya strategi yang khas dalam mengalokasikan energi dan fekunditasnya sehingga dapat memaksimalkan fertilitas dan sintasan larva, namun informasi tersebut masih belum tersedia. Tujuan penelitian ini untuk mendapatkan data strategi dua spesies cacing nipah simpatrik terkait dengan alokasi energi total, fekunditas, dan sintasan larva. Alokasi energi dideterminasi dengan menghitung proporsi antara energi reproduksi  dan energi somatis. Fekunditas dihitung berdasarkan jumlah total oosit yang didapatkan dari sampel individu yang sama dengan yang digunakan untuk pengukuran energi. Penghitungan sintasan dilakukan dengan menghitung jumlah larva trokofor dan larva 3-setiger hasil fertilisasi. Data alokasi energi, fekunditas, dan sintasan dianalisis secara deskriptif. Hasil penelitian menunjukkan kedua spesies simpatrik mengalokasi energi untuk reproduksi. Fekunditas Namalycastis rhodochorde lebih tinggi dibandingkan Namalycastis abiuma, namun memiliki sintasan larva yang lebih rendah dari N. abiuma. Fekunditas pada N. rhodochorde merupakan startegi untuk mengimbangi rendahnya sintasan. Sementara itu, N. abiuma memiliki fekunditas yang lebih rendah namun memiliki sintasan larva yang tinggi. Fekunditas dan sintasan larva antara kedua spesies cacing nipah simpatrik ditemukan berbeda namun keduanya mengalokasi energi yang sama. Perbedaan fekunditas dan sintasan serta persamaan alokasi energi merupakan strategi spesies simpatrik untuk dapat bertahan hidup pada kondisi lingkungan yang sama.
    corecore