380 research outputs found
Encyclopedia of Quality of Life and Well-being Research
No full textField Editor and Editorial Board Member.
Entries under Filomena Maggino's responsibilities:
- Conceptual design of indicators (author: F. Maggino),
- Indicator Development and Construction (author: F. Maggino),
- Data Representation (authors: F. Maggino & M. Trapani),
- Guttman Scale (author: F. Maggino),
- Indicator development and construction (author: F. Maggino),
- Multidimensional Analysis (authors: F. Maggino & M. Fattore),
- Multivariate Statistical Analysis (authors: F. Maggino & M. Fattore),
- Partially Ordered Set (author: M. Fattore),
- Questionnaire Design (author: W. Saris),
- Semantic Differential (author: F. Maggino),
- Subjective Indicators (author: A. Michalos),
- Subjective Weighting (author: K. Land),
- Systems of Indicators (author: H-H. Noll),
- Weighting Schemes (author: K. Land).
The Encyclopedia:
- represents the first comprehensive reference work on scientific and other scholarly research on the quality of life
- covers the subject of quality-of-life from a multi disciplinary perspective
- includes the behavioral and social sciences as well as health and healthcare
Encyclopedia's Keywords: Happiness - Health - Patient-reported outcomes research - Positive Psychology - Psychology - QOL - Quality of Life Research - Social Indicators - Sociology - Spirituality - Wealth - Welfare - Wellbeing
Encyclopedia's related subjects: Economics - Medicine - Psychology - Well-Bein
Erratum: Lack of immunity against rubella among Italian young adults. [BMC Infect Dis., 17, (2017) (199)] Doi: 10.1186/s12879-017-2295-y
No full textAfter publication of this article [1], the authors noted that the given names and family names of all authors had been inverted, and are therefore incorrect in the original article. In the original article, the author names appear as the following: Gallone Maria Serena, Gallone Maria Filomena, Larocca Angela Maria Vittoria, Germinario Cinzia and Tafuri Silvio. However, this is incorrect, and the author names should appear as per the below: Maria Serena Gallone, Maria Filomena Gallone, Angela Maria Vittoria Larocca, Cinzia Germinario, Silvio Tafuri. The author names have been corrected in the author list and the citation for this Erratum
[Poesia] Poema de Filomena Malva
No full textA poem by Filomena Malva About the author: Born in Luanda, on December 6, 1952. At the age of six months, she moved to Sá da Bandeira, now Lubango, where she completed her primary and secondary studies, beginning her studies at the Faculty of Letters of University of Luanda. At the Faculty of Letters of the University of Coimbra, she completed her degree in History, as well as his postgraduate degree in "Portuguese expansion in the Atlantic world". She pursued her professional activity as a History teacher. Regarding scientific publications, In 1996, the unpublished work O retábulo-mor da capela de Nossa Senhora da Paz da Constantina. In 2015, she published the lyric poetry work entitled Aspirar a polpa do absoluto, with the review of Carmen Lucia Tindó Secco, whose edition is sold out. She participated in the blog MyAngola / MinhaAngola with poetic words and comments and, yet in the scope of the blog, was invited to write a foreword to the poetic works Mentes perversas e outras conversas, by Ana Paula Lavado, and Silêncios de outono, by Graça Arrimar, respectively in Porto and in Coimbra.Un poema de Filomena Malva Sobre la autora: Nacida en Luanda el 6 de diciembre de 1952. Con 6 meses de edad, se trasladó a Sá da Bandeira, actual Lubango, donde completó sus estudios de primaria y secundaria, a partir de la educación superior en la Facultad de Artes, Universidad de Luanda. En la Facultad de Artes de la Universidad de Coimbra concluyó un grado en Historia, así como estudios de postgrado en “La expansión portuguesa en el mundo atlántico”. Ejerció su carrera profesional como maestra de Historia. No lo que se refiere a las publicaciones científicas, se publicó, en 1996, la obra inédita O retábulo-mor da capela de Nossa Senhora da Paz Constantina. Em 2015 publicó el trabajo de la lírica titulada Aspirar à Polpa de Tudo -- con la opinión de Carmen Lucia Tindó Secco --, cuya edición está agotada. Participado en el proyecto MyAngola/MinhaAngola blog con palabras poéticas y comentarios y, en virtud de que, fue invitada a presentar la obra poética Mentes perversas e outras conversações de Ana Paula Lavado, y Silêncios de outono, de Graça Arrimar, respectivamente en Porto y Coimbra.Poema de Filomena Malva. Sobre a autora: Nasceu em Luanda, a 6 de dezembro de 1952. Com 6 meses de idade, foi viver para Sá da Bandeira, atual Lubango, onde concluiu os seus estudos primários e liceais, iniciando o ensino superior na Faculdade de Letras da Universidade de Luanda. Na Faculdade de Letras da Universidade de Coimbra concluiu a licenciatura em História, assim como a pós-graduação em “A expansão portuguesa no mundo atlântico”.Exerceu a sua atividade profissional enquanto docente de História.No que concerne a publicações científicas, foi publicada, em 1996, a obra inédita O retábulo-mor da capela de Nossa Senhora da Paz da Constantina. Em 2015 publicou a obra de poesia lírica intitulada Aspirar a polpa do absoluto, com parecer de Carmen Lucia Tindó Secco, cuja edição está esgotada. Participou, no blogue do projeto MyAngola/MinhaAngola, com palavras poéticas e comentários e, no âmbito do mesmo, foi convidada para apresentar as obras poéticas Mentes perversas e outras conversas, de Ana Paula Lavado, e Silêncios de outono, de Graça Arrimar, respectivamente no Porto e em Coimbra
The paratextual framework of «La Filomena»: editorial model and literary model
No full textEl análisis de dedicatorias de La Filomena(1621) sugiere que fueron compuestas en base a una poética paratextual cuya función era mostrar una imagen ideal del autor Lope de Vega.The analysis of dedications in La Filomena(1621) suggests that they were composed on the basis of a paratextual poetic whose function was to show an ideal image of the author Lope de Vega
Patrick Modiano (2014) Filomena Firmeza. São Paulo: Cosac & Naify
No full textAnalysis of one of the children\u27s literary issues where the author Patrick Modiana addresses the issue of lying. A story of a dance teacher (Filomena Firmeza), narrated in the first person, where her childhood in New York is recounted and consequently her present is talked about with a visit to her parents. The author addresses family ties in his work which makes the book interesting for anyone to read and was considered by many as one of his best books.Análise de uma das questões literárias infanto-juvenil onde o autor Patrick Modiana aborda a questão da mentira. História de uma professora de dança (Filomena Firmeza), narrada na primeira pessoa, onde se relata a sua infância em Nova York e consequentemente se fala do seu presente com a visita aos seus pais. O autor aborda os laços familiares na sua obra o que torna o livro interessante para qualquer um ler, considerado por muitos como um dos seus melhores livros
Certi pomeriggi non passano mai:Some Afternoons Never Seem to End
No full textCerti pomeriggi non passano mai by Mario Fortunato is a short and engaging theatre monologue that analyzes the tension created by waiting for a beloved who is late for an appointment. The wait stretches for hours and creates controversial emotions and anxiety ironically described by the author, with hilarious moments that go from drama to comedy to the surreal, in a sort of ‘one man’ Waiting for Godot. The text was freely adapted and performed in Italian, with some parts in German and English. Theatralia is an international collective of performers and artists who explore texts through physical theatre, live art & music, inventive digital art, and audience participation that was founded by Filomena Campus in 2003. Since 2006 Theatralia’s productions have been sponsored by the Arts Council England. Their much acclaimed production Misterioso. A Journey into the Silence of Thelonious Monk, written by Stefano Benni, was presented at London Riverside Studios and at the Edinburgh Festival.
Filomena Campus is a theatre director and a Jazz musician. Productions include Not in My Name inspired by The Living Theatre and U238 by Marco Paolini. Filomena has also worked as university lecturer in London. For more details see: www.filomenacampus.com Mario Fortunato is an author, literary critic, and the former Director of the Italian Cultural Institute in London. His publications include: Luoghi naturali, L’arte di perdere peso, I giorni innocenti della Guerra, Allegra Street, Il viaggio a Paros, and L’Italia degli altri. He regularly writes for the Italian news magazine L’Espresso
Chromosomes and fertility in Sus scrofa and Bos taurus: an analysis of progenitors and embryos
No full textThis original research was developed to achieve the Master’s Degree in Biotechnology for Health SciencesEfficient breeding of livestock species, such as pig and cattle, has become a priority due to the rising global food demand fuelled by the human population increase. The number of people on the planet is expected to rise from 7.8 billion (currently) to 9.7 billion in 2050. To optimize breeding efficiency and produce individuals with high genetic merit and so capable to produce more using fewer resources, new technologies have been developed. These include in vitro production (IVP) of embryos and preimplantation genetic testing (PGT). Producing livestock embryos by IVP using sperm and oocytes from elite parents can dramatically increase the breeder’s ability to select the most promising animals. This can lead to rapid improvement of the target livestock population. One drawback of IVP however is that they suffer from a high incidence of chromosomal abnormalities such as aneuploidy. This can lead to clinical syndromes, infertility, and miscarriages, but can be detected through preimplantation genetic testing for aneuploidy (PGT-A). In this dissertation, three different PGT-A algorithms: Karyomapping, BAF/LRR and Gabriel-Griffin plots, were applied on two cattle embryo DNA marker databases to investigate aneuploidy presence, class, parental and mechanistic origin, overall and as related to embryo sex and quality. In pigs, for the first time in this species, a novel IVP protocol was optimised and applied on selected donors to produce embryos, which could be screened by the same three PGT-A algorithms mentioned above. In the first cattle dataset, embryos were produced from different oocyte retrieval protocols (stimulation or coasting) or in-vivo and were dissected in their two tissues: inner cell mass (ICM) and trophectoderm (TE). PGT-A analysis found a higher aneuploidy incidence in embryos from oocyte retrieval protocols. It was also found that TE biopsies are a useful tool to perform PGT-A, due to their high concordance (in terms of chromosome constitution) with the ICM. In the second cattle dataset, embryos from a commercial breeding programme were analysed in a retrospective study. Following PGT-A and the elective use of euploid embryos, pregnancy and live birth rates could be improved while reducing the number of embryo transfer performed. In cattle, the majority of aneuploidies detected were monosomies, followed by trisomies of meiosis I origin; both types were more common in the oocyte. Triploid and hypotriploid cases were also discovered. Male embryos were more common and had a higher incidence of aneuploidy when compared to female embryos. In pigs, the IVP protocol designed resulted in high cleavage and blastocyst rates with excellent quality embryos, from which TE and ICM biopsies were collected. For the few first samples for which a full DNA analysis was available at the time of writing, BAF/LLR graphs were constructed, and two samples were identified as euploid. The results presented suggest that the application PGT-A could have a significant impact on embryo IVP and therefore on the future of breeding programmes and global food production. Moreover, they provide an original insight into the mechanics of aneuploidy origin and distribution in livestock embryos, the knowledge of which can guide future IVP optimisation strategies.A criação eficiente de espécies de gado, como suíno e bovino, tornou-se uma prioridade devido à crescente necessidade de produção de alimentos. Para 2050, é estimado um aumento até 9,7 bilhões na população humana. Para otimizar a produção destas espécies com alto mérito genético e em maior quantidade com menos recursos, novas tecnologias têm sido desenvolvidas, como a produção in vitro (IVP) de embriões e o teste genético pré-implantação (PGT). A produção de embriões por IVP, usando espermatozoides e oócitos previamente selecionados, pode melhorar drasticamente a capacidade do criador de selecionar os animais mais promissores, levando a uma rápida melhoria da população. No entanto, embriões produzidos por IVP tendem a ter uma incidência alta de anomalias cromossómicas, como aneuploidias, levando a síndromes clínicas, infertilidade e abortos. Estas aneuploidias podem ser detetadas por meio de testes genéticos pré-implantação para aneuploidia (PGT-A). Nesta dissertação, três algoritmos PGT-A diferentes – Karyomapping, gráficos BAF/LRR e Gabriel-Griffin – foram aplicados em duas bases de dados de marcadores de DNA em embriões bovinos para investigar a presença de aneuploidia, classe, origem parental e mecanismo. Pela primeira vez em porcos, um novo protocolo de IVP foi otimizado e aplicado em indivíduos previamente selecionados para obter embriões, para rastrear a sua origem e, posteriormente, analisar pelos algoritmos PGT-A supramencionados. Na primeira base de dados de bovinos, foram produzidos embriões através de diferentes protocolos de obtenção de oócitos (estimulação ou "coasting") ou in vivo, sendo submetidos à dissecação de duas linhas celulares: massa celular interna (ICM) e trofoectoderme (TE). A análise através de PGT-A demonstrou uma maior incidência de aneuploidia em embriões com origem em protocolos de obtenção de oócitos. Verificou-se também que as biópsias da TE são uma ferramenta útil para realizar PGT-A, devido à sua alta concordância com a ICM. Já na segunda, embriões de um programa comercial de criação de gado foram analisados num estudo retrospetivo. Após PGT-A e o uso seletivo de embriões euploides, as taxas de gestação e natalidade podem ser melhoradas, reduzindo o número de transferências de embriões. Em bovinos, a maioria das aneuploidias detetadas foram monossomias, seguidas por trissomias com origem na meiose., as quais tiveram mais incidência no oócito. Também foram encontrados casos de triploidia e hipotriploidia. Foram diagnosticados com maior frequência embriões do sexo masculino com maior incidência de aneuploidia quando comparados com embriões do sexo feminino. Em porcos, o protocolo de IVP desenhado resultou em altas taxas de divisão e blastocisto com embriões de excelente qualidade, das quais foram colhidas biópsias da TE e ICM. Para as primeiras amostras, com análises completas de DNA disponíveis aquando a escrita desta dissertação, foram construídos gráficos BAF/LLR e identificadas duas amostras como euploides. Os resultados apresentados sugerem que a aplicação de PGT-A poderá ter um impacto significativo na IVP de embriões e, consequentemente, no futuro dos programas de reprodução e na produção global de gado. Ademais, fornecem uma visão original sobre o mecanismo da origem e distribuição de aneuploidias em embriões de gado, cujo conhecimento poderá orientar futuras estratégias de otimização de IVP
Definição do perfil transcricional da sequência de DNA satélite major de Rattus norvegicus num modelo celular tumoral
No full textDissertação de Mestrado em Genética Molecular Comparativa e TecnológicaAs sequências de DNA satélite são sequências repetidas em tandem, presentes em regiões heterocromáticas do genoma como os centrómeros ou os telómeros. Devido à sua localização em regiões de elevada condensação da cromatina, eram tidas como sequências não transcritas, e foram, como tal, consideradas dispensáveis no contexto genómico e celular, sendo adereçadas como “junk” genómico. Contudo, diversas evidências da sua expressão foram recentemente relatadas, tendo-lhes sido atribuídas funcionalidades no contexto celular, algumas das quais associadas com o desenvolvimento e/ou progressão de cancro.
A sequência de DNA satélite em foco neste trabalho é a sequência sat I de Rattus norvegicus, e é até ao momento a única sequência deste tipo identificada na referida espécie.
Os nossos grandes objetivos foram a avaliação do perfil transcricional, dos mecanismos de regulação e da função da sequência DNA satélite “major” centromérica sat I num modelo celular tumoral de Rattus norvegicus.
No presente trabalho, foi feita a análise comparativa da sequência de DNA satélite I de Rattus norvegicus na linha tumoral (CLS-ACI-1) desta espécie e numa linha normal (RNO).
Com este trabalho foi conseguida a determinação do perfil transcricional de sat I no modelo em estudo. Verificou-se a ocorrência de expressão da sequência satélite sat I de R. norvegicus em ambos os genomas analisados, embora apresentem níveis diferentes de expressão. A expressão desta sequência parece ser regulada através de alterações epigenéticas, nomeadamente a metilação do DNA. Contudo, este mecanismo epigenético aparenta ser um facilitador, mas não o mecanismo de maior importância na regulação da expressão desta sequência especificamente. Como tal, são de apontar as modificações histónicas também como um possível regulador das mesmas. Os transcritos observados in situ apresentam sinal em “cluster”, com natureza madura e co-localização com a região centromérica. A expressão de sat I não aparenta dependência de ciclo e aponta-se uma possível função na manutenção da heterocromatina. Na análise comparativa do nível de expressão na linha normal e tumoral, foi verificada a diminuição desta em cancro, explicada pelo aumento da percentagem de metilação da sequência de DNA satélite I. A expressão diferencial relatada leva-nos a supor uma possível função de supressor tumoral para sat I (como TERRA, sequência repetitiva telomérica, cuja expressão aparenta estar reduzida em cancro devido a suposta função reguladora negativa da telomerase) e/ou possível dependência do tipo de tecido para a sua transcrição. Pelo ensaio de stresse de “choque térmico”, verifica-se a não dependência do fator HSF 1 para a expressão de sat I, mas sim um mecanismo independente deste fator como a alteração epigenética. Desta forma, este trabalho levou-nos à conclusão que as sequências de DNA satélite apresentam uma regulação altamente controlada e complexa, em que sua compreensão inclui o conhecimento aprofundado e amplo de diversos mecanismos e vias de regulação transcricional.Satellite DNAs are tandemly repeated sequences that are present in heterochromatic genome regions like the centromeres and telomeres. Resulting from their association with high condensed chromatin regions they were thought as non-transcribed and dispensable sequences in the genomic and cellular context. They were initially called genomic junk, however since that time much evidence has demonstrated their active transcription. To these transcripts were attributed some cellular functionalities, such us the development of cancer.
The satellite DNA sequence in focus on this work is the sequence sat I of Rattus norvegicus and it is so far the only sequence of this type identified in this species.
Our main goals were to determine the transcriptional profile, regulation mechanism and function of the centromeric major satellite DNA sequence sat I in a cancer cell line model of Rattus norvegicus, having as counterpart the normal genome.
In the present work it was made the comparative analysis of the satellite DNA sequence sat I in the normal cell line RNO and tumor cell line CLS-ACI-1 of rat. With this work it was defined the transcriptional profile of sat I in the tumor cell model CLS-ACI-1. We verified the occurrence of expression of sat I in both genomes analyzed, although displaying differences in the expression levels exhibited. The expression of this sequence seems to be regulated by DNA methylation. This epigenetic mechanism appears to be the facilitator, but not the main epigenetic alteration behind the regulation of sat I. Therefore we can hypothesize the histonic modification as one possible regulator of this sequence. The transcripts observed in situ were identified as clusters, mature transcripts, with co-localization with the centromeric region. Sat I expression does not appear to be cycle dependent and we indicate a possible function for this sequence in the maintenance of heterochromatin. On the comparative expression analysis between normal and tumor cell line, it was verified a decrease of transcripts in cancer. This variation is explained by the increase of the methylation status in sat I. The differential expression leads to a possible tumor suppression function for sat I (as TERRA, a telomeric repeat-containing RNA whose expression appears decreased in cancer due to its supposed negative regulation of telomerase) and possible tissue dependent transcription for this satellite sequence. For the heat shock assay, it was verified the non-transcription dependence of HSF1, but a mechanism independent of this factor such as epigenomic mechanisms regulating sat I expression.As such, this work leads us to the conclusion that satellite expression presents a tight and complex regulation. The understanding of satellite DNA expression passes through a profound and ample knowledge of several mechanisms and pathways of transcriptional regulation
Determinação dos padrões de transcrição da sequência FA-SAT em células proliferativas: modelo celular carnivora
No full textDissertação de Mestrado em Genética Molecular Comparativa e TecnológicaA inatividade transcricional e o elevado nível de condensação foram consideradas as mais emblemáticas características da heterocromatina constitutiva durante várias décadas. Contudo, na última década sucessivas evidências têm reportado que estas sequências de DNA repetitivo são transcritas, originando RNAs não codificantes (ncRNAs) com funções na organização e regulação dos genomas. A transcrição de sequências de satDNA centroméricas (CT) e pericentroméricas (PCT) nos genomas eucariotas é atualmente incontestável, contudo muitas questões permanecem por esclarecer: Como é a transcrição das sequências de satDNA efetivamente regulada? Sequências de satDNA teloméricas são também transcritas, à semelhança dos satélites CT e PCT? Quais as funções exatas dos transcritos satélite? Será essa função partilhada por todos os eucariotas? Ou apresentarão funções específicas e distintas de espécie para espécie?
O trabalho desenvolvido nesta dissertação de mestrado teve como objetivo contribuir para o avanço do conhecimento nesta área. Pretendeu-se assim analisar o perfil de transcrição e os mecanismos de regulação da sequência de satDNA major do gato doméstico, FA-SAT, em dois genomas distintos. Apesar de inicialmente isolada a partir do genoma de Felis catus (Carnivora, Felidae), esta sequência é também partilhada com elevada similaridade pelo genoma da geneta (Genetta genetta: Carnivora, Viverridae). O estudo paralelo nestas duas espécies constitui uma estratégia inovadora para analisar uma mesma sequência de satDNA localizada em dois contextos cromossómicos distintos: telomérico no gato e (peri)centromérico na geneta.
A análise da transcrição FA-SAT foi realizada por Real time RT-qPCR e RNA-FISH e permitiu definir o perfil transcricional da sequência FA-SAT nas duas espécies em estudo, tendo revelado pela primeira vez atividade transcricional de uma sequência de satDNA telomérica. A análise da localização celular dos transcritos FA-SAT em Felis catus e Genetta genetta revelou a presença de ncRNAs no nucléolo e dispersos no núcleo. A análise dos transcritos nascentes evidenciou que a transcrição da sequência ocorre aparentemente em mais do que um local na célula, sugerindo a existência de mais do que um tipo de transcritos FA-SAT.
A determinação dos perfis de transcrição da sequência FA-SAT evidenciou que esta ocorre de forma dependente do ciclo celular, sugerindo uma associação entre a expressão FA-SAT e a progressão no ciclo, nas duas espécies. A acumulação de ncRNAs FA-SAT em estados de quiescência/senescência foi também detetada, sugerindo o envolvimento desta sequência na regulação de acontecimentos do ciclo celular e da saída de ciclo.
Neste trabalho foram ainda analisados os mecanismos de regulação da expressão FA-SAT através da utilização do agente de desmetilação global do genoma 5’-azacitidina. A modelação da expressão da sequência sugeriu a existência de uma complexa via de regulação, envolvendo aparentemente vários mecanismos reguladores sinergéticos, diferentes nos dois genomas em análise.
Finalmente, a deteção de alterações nos níveis de expressão FA-SAT em condições de stress específicas revelou resultados importantes acerca dos processos em que estes ncRNAs podem estar envolvidos.
A integração de todos os resultados obtidos ao longo deste trabalho permitiu evidenciar a importância que a localização cromossómica pode ter no comportamento transcricional de uma sequência de satDNA e na função dos transcritos resultantes.The transcriptional inactivity and high level of condensation were once, and during several decades, considered the most emblematic features of constitutive heterochromatin. However, in the last decade increasing evidences suggest that these repetitive DNA sequences are transcribed and that the resulting non-coding RNAs (ncRNAs) seem to play important roles in the organization and regulation of genomes. Transcription of centromeric (CT) and pericentromeric (PCT) satDNA sequences in the genomes of many eukaryotes is currently undeniable, however many questions remain unsolved: How is the transcription of satDNA effectively regulated? Are telomeric satDNA sequences also transcribed, as CT and PCT satDNAs? What are the exact functions of these satellite transcripts? Are those functions shared by all eukaryotes? Or is the function distinct between taxa?
The work developed in this master dissertation had the aim of contributing to the progress of knowledge in this area. We intended to analyze the transcription profile and the regulation mechanisms of the major satDNA sequence of the domestic cat, FA-SAT sequence, in two distinct genomes. Although originally isolated from the genome of Felis catus (Carnivora, Felidae), this sequence is also shared with high similarity by the genet genome (Genetta genetta: Carnivora, Viverridae). The study of these two species represents a good strategy for analyzing the same satDNA, naturally localized in two different chromosome locations: telomeric in cat and (peri)centromeric in genet.
Transcription analysis of FA-SAT was performed by real-time RT-qPCR and RNA-FISH and allowed to define the transcriptional profile of FA-SAT in both genomes. This analysis revealed for the first time the transcriptional activity of a telomeric satellite DNA sequence. The analysis of the cellular location of FA-SAT transcripts in Felis catus and Genetta genetta revealed the presence of ncRNAs in the nucleolus and in the nucleus. The analysis of nascent transcripts showed that the transcription itself seems to occur in more than one location in the cell, suggesting more than one type of FA-SAT ncRNAs. The definition of the FA-SAT transcription profiles revealed that it is cell-cycle dependent, suggesting a correlation between the expression of FA-SAT and the cell-cycle progression in both species analyzed. The accumulation of FA-SAT ncRNAs in quiescence/senescence states was also detected, suggesting a role for this sequence in the regulation of cell cycle events and in cell cycle exit.
Also the mechanisms regulating the expression of FA-SAT were analysed in this work by using the global genome demethylating agent 5'-azacytidine. The modelation of this satDNA transcription suggests the existence of a complex pathway involving several regulatory mechanisms, apparently different in the two genomes under analysis.
Finally, the detection of changes in FA-SAT expression levels under specific stress conditions revealed important insights about the processes in which these ncRNAs may be involved.
The results obtained in this master dissertation have highlighted the importance that the chromosomal location may have in the transcriptional behaviour of a satDNA sequence and in the function or functions of the resulting transcripts
Molecular microevolution in cat mammary tumor lines: genomic and cytogenomic cell models
No full textTese de Doutoramento em Genética Molecular Comparativa e TecnológicaOs tumores de mama espontâneos em gata têm-se revelado ao longo do tempo como excelentes modelos para o estudo e compreensão de como se inicia e desenvolve o processo tumoral, bem como para melhorar as ferramentas de diagnóstico ou mesmo para o desenvolvimento e aumento da eficiência de terapias bem-sucedidas para o Homem. As semelhanças entre os tumores mamários da gata e da mulher vão desde os genes e pathways envolvidos na tumorigénese, até às características histológicas, entre outras. No entanto, a investigação oncológica apenas com recurso a animais é praticamente inviável e levanta uma série de questões importantes, nomeadamente éticas. Nesse cenário, surgem os modelos celulares: linhas celulares derivadas de tecidos ou células tumorais que são um recurso extremamente valioso como modelos in vitro para a investigação oncológica. A grande vantagem dos modelos celulares depende da sua disponibilidade e facilidade na manipulação, mas depende grandemente da sua adequada caracterização. O presente trabalho teve dois objetivos principais, o estabelecimento de várias linhas celulares de tumores mamários de gata, sendo que uma delas, a linha celular FkMTp cresceu sem interrupção durante aproximadamente dois anos e a sua caracterização detalhada aos níveis da análise fenotípica, citogenómica e genética. Em conjunto, este trabalho teve como grande finalidade a de criar uma ferramenta única e distinta, bem como um recurso para a investigação fundamental e aplicada do cancro. Para atingir estes objetivos, foi realizada uma abordagem diferente na metodologia durante o estabelecimento da linha celular, o que permitiu a criação de um "banco" preservado de diferentes “momentos” do tumor in vitro ao longo do tempo. Este "banco" estende-se desde a cultura primária até a passagem 154, e inclui: linhas celulares criogenicamente preservadas, preparações cromossómicas fixadas, DNA genómico, RNA e células (para isolamento de proteínas), preservados a cada seis passagens da linha celular (durante todo o processo de estabelecimento). De seguida e de forma a validar este modelo celular, foram caracterizadas, a diferentes níveis, até 18 passagens da linha celular FkMTp, desde a análise morfológica das células, até à análise das alterações dinâmicas na estrutura do citoesqueleto, das suas capacidades de crescimento sem ancoragem, de cicatrização, invasão e migração, até o nível citogenético, onde as alterações não clonais, transitórias e cromossómicas clonais (incluindo breakpoints) foram identificadas, permitindo revelar o padrão de evolução cariotípico, bem como os perfis de expressão de genes importantes implicados no início e na progressão tumoral. Os resultados obtidos durante este trabalho são demonstrativos de que a linha celular FkMTP é um excelente modelo para o estudo dos tumores mamários da mulher e especialmente, o subtipo triplo negativo e um modelo ideal para compreender as várias vias envolvidas na tumorigénese, desde os primeiros eventos até a progressão do tumor.Spontaneous cat mammary tumors have been emerging over the time as excellent models to study and understand how tumorigenesis begins and evolve, as well as to improve the diagnostic tools or even for the development and enhancement of successful therapies for the human counterpart. The similarities between cat and human mammary tumors goes from the genes and pathways involved in cancer initiation and progression until the histological features, among others. However, animal based-research alone is almost unfeasible and raise a number of important and ethical issues. In this scenario, cellular models arise: the cell lines derived from tumor tissues or cells are an extremely valuable resource as in vitro models to cancer research. The great advantage of cellular models relies in their readily availability and easiness of manipulation, but depends on their suitable characterization. The present work had two major goals, the establishment of several cat mammary cancer cell lines, one of them, the FkMTp cell line that grew without interruption for almost two years, and its detailed characterization at the phenotypic, cytogenomic and gene analysis levels. Together, this work aimed to create a unique and distinct tool, as well as a resource for the cancer fundamental and applied research. To accomplish those goals, a distinctive approach in the methodology was used during the cell line establishment, which allowed the generation of a preserved “bank” of different “moments” of tumor progression along the time. These “bank” extends from the primary culture until passage 160, and it includes cryogenically preserved cell lines, fixed chromosome preparations, genomic DNA, RNA and cells (for protein isolation), preserved every six passages of the cancer cell line (during all the establishment process). Following and to validate this cell model for cancer research, up to 18 passages of the FkMTp cell line were characterized at different levels, from the cells’ morphology, to the analysis of the dynamic changes on the cytoskeleton structure, their abilities to grow without anchorage, to wound-healing, to perform invasion and migration, until the cytogenetic level, where the non-clonal, the transitional and the clonal chromosome alterations (including the breakpoints disclosure) were identified, allowing to uncover the pattern of karyotypic evolution and expression profiles of important genes implicated in tumor initiation and progression. The results obtained during this work prove that the cell line FkMTP is an excellent cellular model to study human breast cancer, and especially, the triple negative subtype and an optimal model to understand the several pathways involved in tumorigenesis, from the early events towards tumor progression.Fundação para a
Ciência e Tecnologia, “Programa Operacional Potencial
Humano – POPH”, co-financiado pelo Fundo Social Europeu
(POPH/FSE) e por fundos nacionais (POPH-QREN
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