Biruni University Institutional Repository
Not a member yet
2908 research outputs found
Sort by
Synthesis of benzimidazole-1,2,4-triazole derivatives as potential antifungal agents targeting 14 alpha-demethylase
Abstract
Invasive fungal infections (IFIs) are increasing as major infectious diseases around the world, and the limited efficacy of existing medications has resulted in substantial morbidity and death in patients due to the lack of effective antifungal agents and serious drug resistance. In this study, a series of benzimidazole-1,2,4-triazole derivatives (6a-6l) were synthesized and characterized by 1H NMR, 13C NMR, and HR-MS spectral analysis. All the target compounds were screened for their in vitro antifungal activity against four fungal strains, namely, C. albicans, C. glabrata, C. krusei, and C. parapsilopsis. The synthesized compounds exhibited significant antifungal potential, especially against C. glabrata. Three compounds (6b, 6i, and 6j) showed higher antifungal activity with their MIC values (0.97 mu g/mL) compared with voriconazole and fluconazole. Molecular docking provided a possible binding mode of compounds 6b, 6i, and 6j in the 14 alpha-demethylase active site. Our studies suggested that the benzimidazole-1,2,4-triazole derivatives can be used as a new fungicidal lead targeting 14 alpha-demethylase for further structural optimization. In addition, their effects on the L929 cell line were also investigated to evaluate the cytotoxic effects of the compounds. SEM analyses were performed to examine the effects of compounds 6a, 6i, and 6j on C. glabrata cells under in vivo experimental conditions
Dose-dependant preventive effect of a herbal compound on crystal formation in rat model
Abstract
Introduction: To analyze the dose-dependent preventive effect of a plant-based herbal product on the new crystal formation in a rat model.
Materials and methods: A total of 42 rats were divided into 7 groups and zinc discs were placed into the bladder of rats to provide a nidus for the development of new crystal formation: Group 1: control, Group 2: 0.75 percent ethylene glycol (EG); Group 3: 0.75 percent EG plus 0.051 ml of the compound; Group 4: 0.75 percent EG plus 0.179 ml of the compound; Group 5: 0.75 percent EG plus 0.217 ml of the compound; Group 6: 0.75 percent EG plus 0.255 ml of the compound; Group 7 0.75 percent EG plus 0.332 of the compound). The analysis and comparison focused on the disc weights, changes in urinary oxalate and calcium levels, urinary pH, and the histopathologic evaluation of the inflammatory changes in the bladder after 14 days.
Results: According to the evaluation of discs placed in the bladders of the animals, animals receiving the herbal compound on a dose-dependent basis showed a limited increase in the disc weights values after 14 days, despite a considerable increase in animals receiving EG alone (p = 0.001). Further evaluation of the increase in disc weights on a dose-dependent basis in different subgroups (from Groups 3 to 7) demonstrated that the limitation of crystal deposition began to be more prominent as the dose of herbal compound increased. This effect was more evident particularly in comparisons between group 7 and others, according to LSD multiple comparison tests (p = 0.001). As anticipated, there has been no discernible change in the weight of the discs in the control group. Although urinary calcium levels in animals of Groups 2, 6, and 7 were significantly higher than the other groups, we were not able to demonstrate a close correlation between urinary oxalate levels and the increasing dose levels. Even though mean urine pH levels were statistically considerably higher in Group 3, there was no statistically significant correlation between the oxalate and calcium levels between all groups, and no association was seen with the administration of herbal agents. The transitional epithelium between the three groups of animals' bladder samples did not exhibit any appreciable difference according to pathological analysis.
Conclusions: In this animal model, the treatment of the compound was successful in lowering the amount of crystal deposition surrounding the zinc discs, most noticeably at a dosage of 0.332 ml, three times per day
Clinical and genetic spectrum from a prototype of ciliopathy: Joubert syndrome
Objective: Joubert syndrome is a neurodevelopmental disorder with a distinctive hindbrain malformation called molar tooth sign, causing motor and cognitive impairments. More than 40 genes have been associated with Joubert syndrome. We aim to describe a group of Joubert syndrome patients clinically and genetically emphasizing organ involvement. Methods: We retrospectively collected clinical information and molecular diagnosis data of 22 patients with Joubert syndrome from multiple facilities. Clinical exome or whole-exome sequencing were performed to identify causal variations in genes. Results: The most common variants were in the CPLANE1, CEP290, and TMEM67 genes, and other causative genes were AHI1, ARMC9, CEP41, CSPP1, HYLS1, KATNIP, KIAA0586, KIF7, RPGRIP1L, including some previously unreported variants in these genes. Multi-systemic organ involvement was observed in nine (40%) patients, with the eye being the most common, including Leber’s congenital amaurosis, ptosis, and optic nerve coloboma. Portal hypertension and esophageal varices as liver and polycystic kidney disease and nephronophthisis as kidney involvement was encountered in our patients. The HYLS1 gene, which commonly causes hydrolethalus syndrome 1, was also associated with Joubert syndrome in one of our patients. A mild phenotype with hypophyseal hormone deficiencies without the classical molar tooth sign was observed with compound heterozygous and likely pathogenic variants not reported before in the KATNIP gene. Conclusion: Some rare variants that display prominent genetic heterogeneity with variable severity are first reported in our patients. In our study of 22 Joubert syndrome patients, CPLANE1 is the most affected gene, and Joubert syndrome as a ciliopathy is possible without a classical molar tooth sign, like in the KATNIP geneaffected patients
Öğrenmeyi Kolaylaştırmada ve Başarıyı Arttırmada Öz Düzenleme Nedir?
Öz Düzenleme, zihinsel yeteneklerin görevle ilgili becerilere dönüştürüldüğü öz-yönlendirme sürecini ifade eder. Öğrencilerin düşüncelerini yönetmek ve düzenlemek ve bunları öğrenme için kullanılan becerilere dönüştürmek için öz düzenleme sürecini geliştirmeleri çok önemlidir. Öz düzenleme, bir amaca yönelik ilerlemeyi sürekli olarak izleme, sonuçları kontrol etme ve başarısız çabaları yeniden yönlendirme aşamalarından oluşur. Öncelikle öz düzenleme yapabilmek için kendi düşünce süreçlerinin farkına varılması gerekir.
Sevgili öğrenciler, öğrenmeyi, öğretimin bir sonucu olarak başınıza gelen örtülü bir olay olarak görmek yerine proaktif bir şekilde kendiniz için yaptığınız bir aktivite olarak görmeniz gerekir.
Öz-düzenlemeye dayalı öğrenme doğuştan gelen bir yetenek değil, öğrencilerin öğrenme sürecinde kendilerini yönlendirmelerine yardımcı olmak için geliştirilebilen bir beceri setidir. Bu beceri setini geliştirerek, kendiniz için net hedefler belirleyebilir ve hedef ve stratejilere dayalı olarak ilerlemenizi izleyebilirsiniz. Böylece daha etkili bir şekilde öğrenebilir, sizin için önemli olan sosyal aktivitelere, spora, sanatsal etkinliklere vakit ayırabilirsiniz. Ergoterapi alanına göre, rollerimiz, yaşımız ve kültürümüzle bağlantılı yaşam aktivitelerine dengeli katılım, zaman yönetimi ve öz düzenleme süreçlerinin kullanılması yaşam memnuniyetini arttırmanın anahtarlarıdır. Öz-düzenleme için gerçekleştirmeniz gereken düşünce süreçleri şunlardır;
1. Planlama – Belirli bir ödev, sınav veya değerlendirme formatı için ne zaman ve nerede çalışılacağını düşünün veya alt hedefler belirleyin.
2. İzleme – Çalışma sırasında belirli konumların veya stratejilerin ne kadar etkili olduğunu, engeller ortaya çıktığında ne yapacağınızı düşünün.
3. Değerlendirme – Kendi bilgini ve düşünce sürecini anlamaya çalış. Bir görevde ilerlerken hata yapıldığında tespit et. Kendine ‘Ben nasıl daha iyi öğrenebilirdim?’ sorusunu sor. Tekrarlara mı ihtiyacım var? Görsel bilgi mi? İşitsel bilgi mi öğrenmemi kolaylaştırıyor?
4. Hatayı düzeltme – Bir hata tespit edildiğinde geri dön ve hataları düzelt. Zihinsel yeteneklerini görevle ilgili becerilere dönüştürebilirsiniz. Unutma hatayı düzeltebilmenin ödülü başarıya ulaşmak anlamına gelir.
5-Kendini ödüllendirme- bir pekiştireç seçin ve kabul edilebilir bir performans kriterine ulaştığınızda kendinizi ödüllendirin. (Planladığım çalışmamı veya ödevlerimi bitirdikten sonra eğlenceli bir aktivite yapabilirim gibi) .
Dijital teknolojilerin, yeni öğrenme alternatifleri sunması ve öz-düzenleme becerilerinin kazanılmasına faydaları da dikkate alındığında, bu süreci geliştirerek üniversite yaşamınızı daha aktif ve daha başarılı kılmak elinizde olacaktır
Optical solitons in magneto-optic waveguides having Kudryashov’s law of nonlinear refractive ındex by trial equation approach
Abstract
The paper addresses optical solitons in magneto-optic waveguides that are studied using Kudryashov’s law of nonlinear refractive index in the presence of chromatic dispersion and Hamiltonian-type perturbation terms. The trial solution approach yielded a variety of soliton solutions, which are listed in this paper
Do Hounsfeld Units have any signifcance in predicting intra and postoperative outcomes in retrograde intrarenal surgery using Holmium and Thulium fber laser? Results from the FLEXible ureteroscopy outcomes registry (FLEXOR)
Abstract
Purpose: To evaluate outcomes of flexible ureteroscopy for renal stones by comparing hard versus soft stones based on their attenuation on computed tomography (Hounsfield Units-HU).
Methods: Patients were divided into two groups according to the type of laser employed [Holmium:YAG (HL) or Thulium fiber laser (TFL)]. Residual fragments (RF) were defined as > 2 mm. Multivariable logistic regression analysis was performed to evaluate factors associated with RF and RF needing further intervention.
Results: 4208 patients from 20 centers were included. In whole series, age, recurrent stones, stone size, lower pole stones (LPS), and multiple stones were predictors of RF at multivariable analysis and LPS and stone size with RF requiring further treatment. HU and TFL were associated with lesser RF and RF requiring an additional treatment. In HU < 1000 stones, recurrent stones, stone size, and LPS were predictors of RF at multivariable analysis, whereas TFL was less likely associated with RF. Recurrent stones, stone size, and multiple stones were predictors of RF requiring further treatment, while LPS and TFL were associated with lesser RF requiring further treatment. In HU ≥ 1000 stones, age, stone size, multiple stones, and LPS were predictors of RF at multivariable analysis, while TFL was less likely associated with RF. Stone size and LPS were predictors of RF requiring further treatment, whereas TFL was associated with RF requiring further treatment.
Conclusion: Stone size, LPS, and use of HL are predictors of RF after RIRS for intrarenal stones regardless of stone density. HU should be considered an important parameter in predicting SFR
Evaluation of Morphologic and Morphometric Characteristics of the Mental Foramen and Anterior Loop in a Turkish Subpopulation Using Cone Beam Computed Tomography
ABSTRACT
Objective: Before a surgical intervention in the mandibular interforaminal area, it is important to have a full
understanding of the anatomy of the mandibular anterior segment. The evaluation of anatomical structures,
variations and pathologies is performed with radiological imaging methods. Today, cone beam computed
tomography (CBCT) is an imaging method which offers all the features necessary for this. In addition to its
importance in surgical applications, it is also valuable in terms of anatomical studies thanks to the reliability of its
measurements and the fact that it allows for a three-dimensional evaluation. The mental foramen and anterior loop
are some of the most significant anatomical structures in the lower jaw. The aim of this study was to determine
the characteristics of mental foramen according to age and gender in a Turkish population and to evaluate anterior
loop length and the frequency of anterior loop. Methods: In this retrospective study, CBCT images from 148
patients (89 females and 59 males) were examined. Images of the mental foramen and interforaminal area of
patients who were over 18 years of age were included in the study, while images with mandibular pathology and
without occlusal closure to at least premolar teeth were excluded. Linear measurements of the mental foramen
were repeated three weeks later by the same observer. Descriptive statistics (mean, standard deviation) and the
Kolmogorov-Smirnov, Kruskal-Wallis, Mann-Whitney U, ANOVA tests and the t-test were used to evaluate the
data. Results: The morphological and morphometric features of the mental foramen, which is a characteristic
structure in mandibular bone, were determined. No statistically significant difference was found between the age
groups in the morphometric characteristics of the mental foramen, but a statistically significant difference was
found according to gender. The most frequently detected oval shape and P3, and P4 positions were similar to the
other studies conducted in Turkish populations. The prevalence of anterior loop was 58%. Conclusion: Detailed
preliminary analysis focusing on anesthesia and surgical interventions is important in order to avoid possible
complications
Investigation of the relationship between emotional burden, psychological resilience and depression levels in individuals with a sibling with special needs
Özel gereksinimli bireylerin yaşadığı zorlu süreçler aile dinamiklerini etkileyebilmektedir. Aileler bu süreçte özel gereksinimli bireye daha fazla odaklanırken ailede var olan diğer kardeşlerin ihmal edilebildiği bilinmektedir. Bu durum kardeşlerin bir takım duygusal tepkilerine sebep olmaktır. Araştırma da özel gereksinimli kardeşe sahip olan bireylerde algılanan duygusal yük ve psikolojik sağlamlık ile depresyon arasındaki ilişkinin ortaya konulması ve bazı değişkenlere göre (yaş farkı, cinsiyet, eğitim düzeyi ve yetersizlik türü) etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Araştırmanın çalışma grubunu, özel gereksinimli kardeşe sahip olan, Adana ili Seyhan ilçesinde yaşayan, okuma yazma bilen, yaşları 12-40 arasında değişen ve herhangi bir özel gereksinimi olmayan 265'i kadın 158'i erkek olmak üzere toplamda 423 kişi oluşturmaktadır. Araştırmada, veri toplama aracı olarak demografik bilgi formu, Özel Gereksinimli Kardeşe Sahip Bireylerde Duygusal Yük Ölçeği (Özdemir ve İnanç, 2024), Kısa Psikolojik Sağlamlık Ölçeği (Doğan, 2015) ve Birinci Basamak İçin Beck Depresyon Tarama Ölçeği (Aktürk vd., 2005) kullanılmıştır. Araştırmada Regresyon analizi,-testi, ANOVA testi kullanılmıştır. Verilerinin analiz edilmesinde SPSS 24.0 istatistik programı kullanılmıştır. Sonuç olarak araştırmaya katılan bireylerin Özel Gereksinimli Kardeşe Sahip Bireylerde Duygusal Yük Ölçeği ile cinsiyet değişkenleri arasında anlamlı bir fark olduğu, eğitim durumu depresyon düzeyleri değişkeninden etkilendiği, duygusal yük ve depresyon düzeyleri gereksinim türü değişkeni üzerinde anlamlı bir fark olduğu bulgusuna ulaşılmıştır. Özel gereksinimli kardeşe sahip bireylerin duygusal yük düzeyleri, psikolojik sağlamlıklarını düşük negatif düzeyde, duygusal yük düzeyleri ile depresyon düzeyleri orta pozitif düzeyde etkilemektedir. Araştırma sonuçları ışığında özel gereksinimli çocuklara ve onların ailelerine yönelik hazırlanan aile eğitim programlarında özellikle kardeşlere yönelik çalışmalara daha fazla yer verilmesi önerilmektedir.The challenging processes experienced by individuals with special needs can affect family dynamics. While families focus more on the individual with special needs in this process, it is known that other siblings in the family may be neglected. This situation causes some emotional reactions of siblings. In this study, it was aimed to reveal the relationship between perceived emotional burden and psychological resilience and depression in individuals with siblings with special needs and to determine the effect of some variables (age difference, gender, education level and type of disability). The study group of the research consisted of a total of 423 people, 265 of whom were female and 158 of whom were male, who had siblings with special needs, lived in Seyhan district of Adana province, were literate, aged between 12-40 years and did not have any special needs. Purposive sampling method was used in the study. In the study, demographic information form, Emotional Burden Scale in Individuals with Siblings with Special Needs (Özdemir & İnanç, 2024), Brief Psychological Resilience Scale (Doğan, 2015) and Beck Depression Screening Scale for Primary Care (Aktürk et al., 2005) were used as data collection tools. Regression analysis, test and ANOVA test were used in the study. SPSS 24.0 statistical program was used to analyze the data. As a result, it was found that there was a significant difference between the Emotional Burden Scale in Individuals with Siblings with Special Needs and gender variables, education status was affected by the depression levels variable, and emotional burden and depression levels were significantly different on the type of need variable. Emotional burden levels of individuals with siblings with special needs affect their psychological resilience at a low negative level, and emotional burden levels and depression levels at a medium positive level. In the light of the results of the study, it is recommended to include more studies especially for siblings in family education programs prepared for children with special needs and their families
The relation between burnout and psycholigical resilience that nurses experienced during covid-19 pandemics
ÖZET Bu araştırma, hemşirelerin COVID-19 pandemi sürecinde tükenmişlik ve psikolojik dayanıklılık düzeyleri arasındaki ilişki ve etkileyen faktörlerin incelenmesi ve psikolojik dayanıklılığın arttırılmasına yönelik hedeflerin belirlenmesi amacıyla bir üniversite hastanesinde Ağustos – Kasım 2021 tarihleri arasında gerçekleştirildi. Araştırmanın evrenini bir üniversite hastanesinde çalışan 700 hemşire oluşturmaktadır. Örneklem sayısı belirlenerek araştırma 185 hemşirenin katılması ile tamamlandı. Veriler ‘‘Hemşire Bilgi Formu’’, ‘‘Maslach Tükenmişlik Ölçeği’’ ve ‘‘Yetişkinler İçin Psikolojik Dayanıklılık Ölçeği’’ kullanılarak on-line anket yöntemiyle elde edildi. Hemşirelerin çoğunun 20-27 yaş aralığında (%50,81), mesleki kıdeminin 1-5 yıl (%35,68), yarıdan fazlasının bekar (%54,05) ve üniversite mezunu olduğu (%55,68), çoğunun dahili serviste çalıştığı (%34,05), pandemi sürecinde hastanedeki ekipman, personel vb durumları yetersiz bulduğu (%42,16), büyük çoğunluğun COVID-19 tanısı almış hastalara bakım verdiği (%82,70) bulundu. Yaş ve mesleki kıdem arttıkça tükenmişliğin azaldığı, psikolojik dayanıklılığın arttığı; yoğun bakımlarda çalışan hemşirelerin duyarsızlaşma alt boyut puanının yüksek olduğu; mesleği isteyerek seçen hemşirelerin duygusal tükenme puanının daha düşük; yapısal stil, gelecek algısı, aile uyumu, kendilik algısı, sosyal kaynaklar ve psikolojik dayanıklılık toplam puanlarının daha yüksek olduğu tespit edildi (p0,05) görüldü. Sonuç olarak Maslach Tükenmişlik Ölçeği ve Yetişkinler İçin Psikolojik Dayanıklılık Ölçeği puanları arasında negatif yönde ilişki olduğu saptandı. Psikolojik dayanıklılık arttıkça tükenmişliğin azaldığı görüldüABSTRACT This research was conducted in a university hospital between August and November 2021 in order to examine the relationship between burnout and psychological resilience levels of nurses during the COVID-19 pandemic and to examine the factors affecting it and to determine targets for increasing psychological resilience. The population of the study consists of 700 nurses working in a university hospital. The number of samples was determined and the research was completed with the participation of 185 nurses. The data were obtained by on-line survey method using ‘‘Nurse Information Form’’, ‘‘Maslach Burnout Inventory’’ and ‘‘Psychological Resilience Scale for Adults’’. It was found that most of the nurses were in the 20-27 age range (50.81%), their professional seniority was 1-5 years (35.68%), more than half of them were single (54.05%) and university graduates (55.68%), most of them worked in the internal service (34.05%), they found the equipment, staff, etc. in the hospital inadequate during the pandemic (42.16%), and the vast majority cared for patients diagnosed with COVID-19 (82.70%). As age and professional seniority increase, burnout decreases, psychological resilience increases; that the desensitization sub-dimension score of nurses working in intensive care units is high; nurses who willingly choose the profession have a lower emotional exhaustion score; structural style, future perception, family harmony, self-perception, social resources and psychological resilience were found to be higher in total scores (p0.05). As a result, there was a negative relationship between Maslach Burnout Inventory and Psychological Resilience Scale for Adults scores. As psychological resilience increased, burnout decreased
Hassasiyet giderici ağız çalkalama sularının diş renklenmesi ve pürüzlülüğüne etkisi
Amaç: Bu çalışmanın amacı, farklı içeriklere sahip hassasiyet giderici ağız çalkalama sularının diş
minesinde renklenme ve yüzey pürüzlülüğü üzerine olan etkilerini in vitro olarak değerlendirmektir.
Yöntem: Periodontal endikasyonla çekilen 48 adet çürük ve restorasyonu bulunmayan alt daimi kesici
diş çalışmaya dahil edildi. Dişler rastgele ve eşit sayıda (n= 12) olacak şekilde 4 gruba ayrıldı: Listerine
Hassasiyet için Geliştirilmiş Koruma (Grup 1), Sensodyne Cool Mint (Grup 2), Sensodyne Promine
(Grup 3), Klorhex (Grup 4). Çekim sonrası diş yüzeyleri temizlenerek polisaj yapıldı. Daha sonra dişler
24 saat oda sıcaklığında damıtılmış suda saklandı. Renk ve yüzey pürüzlülüğü ölçümleri yapıldıktan
sonra dişler 37°C'de 24 saat ilgili ağız çalkalama suyunda bekletildi. Ağız çalkalama suyuna
maruziyetin sonunda diş yüzeyindeki renk tayini ve pürüzlülük tekrarlandı. Renk ölçümü gri zemin
üzerinde spektrofotometre cihazı, yüzey pürüzlülüğü ise yüzey profilometresi kullanılarak kaydedildi.
Tüm ölçümler tek bir araştırmacı tarafından her dişin bukkal orta üçlüsünde aynı noktadan üç ölçüm
olacak şekilde yapıldı ve ortalamaları alındı. Renk değişimi (∆E), CIE L*a*b* sistemi ile belirlendi.
Veriler istatistiksel olarak değerlendirildi. p<0.05 anlamlı kabul edildi. Bulgular: Tüm ağız çalkalama
suları renk değişikliğinde artışa neden oldu. En fazla renk değişiminin grup 2’de olduğu, en az renk
değişiminin ise grup 3’te olduğu gözlendi. Gruplar arasında hem başlangıçta hem de ağız çalkalama
sularına maruziyet sonrası yüzey pürüzlülüğü değerleri bakımından istatistiksel olarak anlamlı fark
bulunmadı (p>0.05). Hem renk değişimi hem yüzey pürüzlülüğü değişimi bakımından gruplar
arasındaki fark anlamlı değildi (p>0.05). Başlangıç yüzey pürüzlülüğü ile ∆E pozitif korele bulundu
(r= 0.297; p<0.05). Sonuç: Farklı içeriğe sahip hassasiyet giderici ağız çalkalama suları diş minesinde
renklenme ve yüzey pürüzlülüğü üzerinde etkilere sahip olabilir. Konu ile ilgili olarak daha geniş
kapsamlı klinik çalışmaların yapılması, uzun dönem etkilerinin daha iyi anlaşılmasına yardımcı
olabilir