Journal of Biota
Not a member yet
606 research outputs found
Sort by
Construction of Soil Metagenomic Library to Obtain Recombinant Clones with an Indigenous Lipase Activity
Get PDFPenelitian ini bertujuan untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah dari sekitar lokasi industri pengolahan minyak kelapa di Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah, dalam upaya mendapatkan klon rekombinan dengan aktivitas lipase indigenuos. Penelitian dilakukan di Laboratorium Genetika, Fakultas Biologi, Universitas Jenderal Soedirman mulai bulan Mei hingga Desember 2006. Secara umum tahapan penelitian terdiri atas ekstraksi dan pemurnian DNA tanah, isolasi pUC19, pemotongan DNA tanah, pemotongan dan defosforilasi pUC19, ligasi fragmen-fragmen DNA tanah ke dalam pUC19 untuk menghasilkan molekul DNA rekombinan, dan transformasi sel inang E. coli JM109 menggunakan molekul DNA rekombinan yang diperoleh untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah. Pemotongan DNA tanah menghasilkan fragmen-fragmen yang sebagian besar berukuran lebih kurang 5 kb sehingga gen lipase dimungkinkan untuk dibawa di dalamnya. Transformasi sel inang E. coli JM109 memperlihatkan efisiensi 1.7 x 105 cfu/μg plasmid. Di antara koloni-koloni yang diperoleh, terdapat 102 koloni berwarna putih, yang menunjukkan keberadaan molekul DNA rekombinan. Koloni putih ini dapat digunakan sebagai materi untuk skrining klon rekombinan dengan aktivitas lipase
Optimasi Produksi Poli-β-Hidroksibutirat (PHB) oleh Bacillus sp. PSA10
Get PDFA new strain characterized as Bacillus sp. PSA10 was found to produce poly-β-hydroxybutyrate (PHB) at concentration of 52.28% (g PHB/g dry cell weight) in shaken flask culture, using sago starch as a carbon source. This research is aimed to determine the optimum culture condition of PHB production Bacillus sp. PSA10 at laboratory scale. Optimization of PHB production was conducted in this research, in terms of inoculum concentration, concentration of the major components in minimal medium, environmental condition and incubation time. The result showed that optimum conditions for the production of PHB by Bacillus sp. PSA10 were achieved at minimal medium (Ramsay medium) with 5% (v/v) inoculum concentration, 2% (w/v) sago starch, 1.0 g/l (NH4)2SO4, 6.7 g/l Na2HPO4.7H2O, and 0 g/l KCl. The optimum environmental conditions were achieved with initial pH 7, temperature 37oC, agitation speed at 150 rotary per minute (rpm) and the best of incubation time was 48 hour. Under this optimum condition, the maximum PHB production by Bacillus sp. PSA10 increased from 52.28% to 71.35% (g PHB/g dry cell weight) at 48 hour cultivation. Therefore, Bacillus sp. PSA10 is potential to apply for PHB production from sago starch at industrial scale
Aktivitas Makan Monyet Ekor Panjang (Macaca fascicularis) di Bumi Perkemahan Pramuka, Cibubur, Jakarta
Get PDFLong-tailed macaque (Macaca fascicularis) is one of the non human primates which is widely distributed. Long-tailed macaques live in a group consisted of multimales and multifemales. The group size was determined by predator, food resources, and foraging efficiency. Bumi Perkemahan Pramuka Cibubur is a habitat for long-tailed macaques. This place is a camp area and tourism site, which is predominated by akasia (Acacia auriculiformis). This research is aimed to study feeding activity of long-tailed macaque in Bumi Perkemahan Pramuka, Cibubur, Jakarta. Methods used in this research were habituation, census, ad libitum sampling, focal animal sampling, and scan sampling. The identification of food items was carried out by means of direct observation, interview, specimen collection, and identification of plant species. Feeding activities of long-tailed macaques constituted 9.01% of the total daily activities. Food consumed consists of natural and non natural food. Natural food items were leaf buds of awi tali (Gigantochloa apus) 34.76%, jukut pait (Axonopus compressus) 22.61%, and fig (Ficus benjamina) 7.15%, respectively. Furthermore, non natural food items were food leftovers of visitors 29.00% and peanuts 15.52%, respectively. In general, natural food (74.02%) was consumed more frequent than those of non natural food (25.98%)
Karakterisasi Kromosom Sel Heterohibrida Dengan Teknik Karyotiping
Get PDFThe aim of the research was to characterize the chromosomal structure of the heterohybride cells by karyotyping technique. Heterohybride cells were made by fusion of Bali cattle lymphocyte cells with mouse myelomma in selective medium which contains hypoxanthin, aminopterin and thymidine. Those cells which showed growth then were identified, selected and isolated for characterizing its chromosomal structure by karyotyping technique. The result showed that all of the chromosomal structure of the heterohybride cells were diploidy. The average of diploidy chromosome of heterohybride cells were 97 diploid Bali cattle lymphocyte cells and myelomma of mouse. The conclusion of the research is the heterohybride cells do not contain abnormal chromosome and are most potent to develop as candidate of Jembrana diseases vaccine
Alteration of Ecdysteroid Titre by Thyroxine and Juvenile Hormone Analogue (Methoprene) in Bombyx mori (Lepidoptera: Bombycidae)
Get PDFPenelitian ini dilakukan untuk mengetahui pengaruh hormon tiroksin dan analog hormon juvenil (metopren) terhadap pola titer hormon ekdisteroid hemolimf selama instar lima Bombyx mori. Instar dua B. mori diberi pakan daun murbei yang telah diberi tiroksin dengan konsentrasi 1500 ppm. Larva kemudian dibiarkan ganti kulit sampai instar tiga dan empat tanpa perlakuan. Tujuh puluh dua jam setelah ganti kulit pada instar lima, larva disuntik sebanyak 10 μl metopren dengan konsentrasi 15 atau 25 ppm. Titer ekdisteroid hemolimf dideteksi dengan Kromatografi Cair Kinerja Tinggi. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa perlakuan dengan tiroksin ataupun kombinasi tiroksin-metopren menyebabkan terjadinya perubahan pola titer ekdisteroid dibandingkan dengan kontrol. Ekdisteroid terdeteksi dua hari lebih awal pada perlakuan tiroksin dan titer ekdisteroid pada puncak tertinggi lebih tinggi jika dibandingkan dengan kontrol. Kombinasi tiroksin-metopren tampaknya menyebabkan penekanan terhadap titer ekdisteroid. Hal ini terlihat dengan terjadinya penurunan titer ekdisteroid segera setelah penyuntikan dengan metopren sebelum mencapai titer puncak tertinggi
Periode Pemijahan Spons Aaptos aaptos (Porifera: Demospongia) di Perairan Pulau Pari, Kepulauan Seribu, DKI Jakarta
Get PDFThe purpose of this research was to study spawning period of sponge Aaptos aaptosat Pari Island, Thousand Islands, DKI Jakarta. The result showed that spawningtime occurred at 17.00-18.00, and within that time the sponge closed their osculumto throw out the zygote leaving the body faster. The duration of spawning rangefrom 4 minutes to 41 minutes. Based on the lunar periode, spawning for spongeAaptos aaptos started from early new moon till few days after full moon. Spawningmostly took place during spring tides. Based on the PCA analysis, it was found thatwater temperature and pressure had strong correlation with spawning time
Keanekaragaman Jenis Lumut (Musci) di Lereng Gunung Wani, Suaka Margasatwa Buton Utara, Sulawesi Tenggara
Get PDFDiversity study on mosses at the slope of Wani mountain, North Buton Wild Life Reserve, South-east Sulawesi was conducted. There are 26 species belong to 14 genera and 8 families are recorded. Two genera i.e. Thuidium and Himanthocladium dominated in this area. Sixth species are recorded as “new record” to Sulawesi i.e. Barbella pendula,Calyptotheciumcaudatum, Himantocladium plumula, Pinatella ambigua, Taxithelium alare, and Thuidium investe
Kajian Laboratorium Tentang Pengaruh Hujan Asam Buatan terhadap Armadillidium vulgare (Armadillidiidae, Isopoda)
Get PDFKajian laboratorium ini dilakukan untuk mengetahui mekanisme pengaruh negatif hujan asam terhadap makrofauna tanah. Armadillidium vulgare yang merupakan salah satu makrofauna tanah pemakan seresah (saprofag) penting di Tokyo yang digunakan dalam penelitian ini. Pengaruh makanan, pengaruh langsung dan pengaruh medium yang direndam dengan cairan asam digunakan untuk mengetahui mekanisme ini. (1). Pengaruh makanan dilakukan dengan cara merendam seresah daun aoki (Aucuba japonica) dalam air atau air yang diberi cairan H2SO4 dengan pH 6,4, dan 2. Seresah ini diberikan pada A. vulgare sebagai makanan (2) Efek langsung dilakukan dengan cara meneteskan 1 ml air atau air yang diberi cairan H2SO4 langsung ke tubuh hewan setiap dua minggu. (3) Pengaruh medium dilakukan dengan merendam medium dalam air maupun air yang diberi cairan H2SO4. Pertumbuhan dan persen hidup A. vulgare dicatat. Pertumbuhan dan persen hidup A. vulgare yang diberi makan seresah yang rendam dalam larutan asam sangat rendah. Penetesan cairan asam pada tubuh A. vulgare secara langsung tidak berpengaruh negatif terhadap pertumbuhan dan persen hidup A. vulgare. Pertumbuhan A. vulgare tidak dipengaruhi oleh medium yang direndam dalam cairan asam, tetapi persen hidupnya sedikit berkurang. Pengaruh cairan asam secara tidak langsung melalui makanan lebih penting daripada pengaruh langsung. Hal ini disebabkan tubuh A. vulgare dilindungi kutikula yang tebal. Untuk taksa yang memiliki tubuh yang lunak pengaruh langsung mungkin juga penting
Keanekaragaman Burung di Sungai Mamberamo, Papua (Short Communication)
No full textTheMamberamo-Rouffaer-IdenburghRiverwatershed, one of the wetland sites inWest Papuais the largest tropical marshlands in northern Papua, covers 7,711,602 hectares and includes in the North Papuan Lowlands Endemic Bird Area (EBA). The Irian Jaya Biodiversity Conservation Priority-Setting Workshop (Conservation International, 1999) highlighted that theMamberamoBasinis an area with high priority for conservation. It is also acknowledged little biological information has been collected therefore it is urgent to carry out biological and ecological study in this particular sites
Pengaruh Media Terkondisi Sel Punca Mesensimal (MT-SPM) terhadap Histopatologi Pankreas Tikus Model DM Tipe 2
Get PDFDiabetes mellitus tipe 2 merupakan jenis diabetes yang paling banyak terjadi. Berbagai macam terapi telah digunakan untuk menangani DM (Diabetes Mellitus) tipe 2, namun masih terdapat keterbatasan. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui pengaruh MT-SPM terhadap histopatologi pankreas dan jumlah sel normal Langerhans pada tikus model diabetes melitus tipe 2. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental murni dengan desain Posttest Control Group. Sebanyak 27 ekor tikus Sprague Dawley jantan dibagi menjadi 3 kelompok: kontrol normal (K(-)) yaitu 9 tikus sehat, kontrol diabetes (K(+)) yaitu 9 tikus yang diinduksi DM tipe 2 dengan 60 mg/kg BB STZ (i.p) dan 120 mg/kg BB NA (i.p), dan kelompok perlakuan (P) yaitu 9 tikus yang diinduksi DM tipe 2 dan diberi perlakuan dengan 0,1 ml/200 g BB (i.p) setiap 3 hari selama 10 kali. Pada hari ke-30 setelah perlakuan, tikus dikorbankan dan diambil jaringan pankreasnya untuk diuji histopatologi dengan pewarnaan Hematoksilin-Eosin. Hasil tersebut dianalisis dengan program Image J. Hasil penelitian menunjukkan terjadi perbaikan pada profil histopatologi pankreas dan terdapat peningkatan jumlah sel normal di islet Langerhans pada kelompok perlakuan yang diberi MT-SPM dibandingkan kelompok kontrol positif