Majalah Ilmiah Biologi BIOSFERA: A Scientific Journal
Not a member yet
275 research outputs found
Sort by
Pertumbuhan Rumput Gajah Kerdil (Pennisetum purpureum ‘Mott’) di Lahan Terbuka Bekas Penambangan Batu Kapur Kawasan Karst Gombong Jawa Tengah
Get PDFThe negative impact of limestone mining on a karst area around Gombong is the destruction of ecosystem. Ecosystem’s destruction will decrease the variety, productivity, quality and continuity of indigenous livestock forages. The aim of this research is to know the growth rate of Dwarf Elephant grass (Pennisetum purpureum 'Mott') in the post mining limestone with various methods of planting. The method used in this research is an experimental method in an open field that was used for limestone mining by using Completed Random Design. The treatment consists of 4 kinds of planting methods with 4 repetitions, while the research treatment used in this experiment is the RG (the field with Dwarf Elephant Grass); RGL (the field with Dwarf Elephant Grass + peanut legume); RGK (the field with Dwarf Elephant Grass + goat’s compost 1,5 kg/m2) and RGKL (the field with Dwarf Elephant Grass + peanut legume + goat’s compost 1,5 kg/m2). The parameter used for the research is the growth rate which includes the plant’s height, the length of the leaves, and also the width of Dwarf Elephant Grass’s leaves (Pennisetum purpureum ‘Mott’) until the 8th week.The result of this research shows that the use of goat’s compost 1,5 kg/m2 and planting of peanut can give significant results to the growth of Dwarf Elephant Grass in open field that was used for limestone mining
RAPD Profile Of Winged-Bean [Psophocarpus tetragonolobus (L.)DC] Mutated Using Ethyl-Methane Sulphonate
Get PDFGenetic diversity of winged-bean [Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC] can be produced by induced mutation with EMS (ethyl-methane sulphonate). To identify the genetic diversity after EMS application on winged-bean, molecular analysis using RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) technique was carried out. This study aims to identify RAPD profile of winged-bean after EMS application. Winged-bean seeds of both long and short pod types were soaked in wet paper towels for 6 hours followed by soaking in EMS of 0.3% and 0.5% for 4 hours. Winged-bean seeds of both pod types without EMS served as control. Ten of the 30 primers operon technologies USA and 2 primers bangalore genei showed sufficiently clear bands (OPA 1, OPA 3, OPA 10, OPA 15, OPA 19, OPB 1, OPB 6, OPB 7, ES10C27, and ES10C28). All the ten primers produced polymorphic fragments with a total number of 320 and size ranging from 100 bp to 2,000 bp. As many as 66 loci were observed. The polymorphism values obtained ranged from 16.67% to 46.97%. This low polymorphism values indicate that EMS concentrations applied have not resulted in sufficiently high genetic variation. At the same time, the genetic distance observed were only 0.11 to 0.41
Indeks Gonadosomatik dan Struktur Histologis Gonad Ikan Uceng (Nemacheilus fasciatus, Valenciennes in Cuvier and Valenciennes, 1846)
Get PDFUceng fish is wild native fish of Indonesia that live in fresh water river. It is very common that people consume the fish for it high protein contain. High demand of fish availability cause the fish exploitation increasing rapidly in nature. The high intensity of fish exploitation, soon will induce declining population of the fish and leading to extinction. Uceng fish cultivation is one alternative to solve the tread. The purpose of this research is to examine the Gonadosomatic Index (GSI) and gonad histological structure of male and female uceng fish (Nemacheilus fasciatus) on the period of immature and mature. Fish were dissected , weighed and the gonads were measured for gonadosomatic index. Moreover, gonad were fixed in NBF 5% for histological preparation by paraffin method and which than were stained by Hematoxylin-Eosin. The result were analyzed for both qualitatively and quantitatively. Qualitative analysis was conducted for gonad histological structure of male and female fish, while quantitative analysis was for Gonadosomatic Index (GSI) of fish respectively. The result showed that there were differences on the gonadosomatic index of males and females fish, the histological structure of ovarian follicle and the composition of the spermatogenic cells of immature gonads and mature gonads of the fish respectively. It was conclude that there are differences on Gonadosomatic Index and gonad histological structure on immature and mature of male and female of Uceng fish (N. fasciatus)
Keberhasilan Ginogenesis Ikan Tawes (Barbonymus gonionotus Blkr.) pada Dua Dosis Iradiasi UV (λ 254 nm) dengan Kejut Panas 40 C
Get PDFLaporan ini memverifikasi keberhasilan protokol tiga tahap ginogenesis tawes melalui inaktivasi genom jantan dengan iradiasi ultra violet (UV), fertilisasinya, dilanjutkan diploidisasi zigot dengan kejut panas (400 C) selama 60 detik. Eksperimen Rancangan Acak Lengkap, tujuh perlakuan yaitu, kontrol positif (fertilisasi normal); kontrol negatif1 telur difertilisasi dengan milt encer yang di UV 1983,348 J/m2; kontrol negatif2 dosis iradiasinya 3966,96 J/m2; ginogenesis1 kontrol negatif1 lalu dikejut panas pada 10 menit pasca fertilisasi; ginogenesis2 ginogenesis1 beda waktu kejut pada 15 menit pasca fertilisasi; ginogenesis3 kontrol negatif2 lalu dikejut pada 10 menit pasca fertilisasi; dan ginogenesis4 ginogenesis3 beda waktu kejut pada 15 menit pasca fertilisasi. Materi gamet segar diperoleh dari induk yang diinduksi GnRH analog dan domperindon dosis 1,5 ml/kg bobot induk intramuskuler, 6-10 jam sebelumnya. Milt segar diencerkan 100 x dalam larutan Ringer. Data dianalisis dengan uji Anova, menggunakan program SPSS. Hasil penelitian menunjukkan bahwa data fertilitas, data penetasan dan data kelangsungan hidup yang terbukti homogen (p>0,05), menunjukkan bahwa ketujuh perlakuan secara statistik fertilitas, penetasan, dan kelangsungan hidupnya tidak nyata (p>0,05) antar pelakuan. Data persentase morfologi larva abnormal tawes menunjukkan bahwa perlakuan yang dicobakan memberikan pengaruh yang sangat nyata (P<0,01). Secara keseluruhan dapat disimpulan bahwa, keempat perlakuan mitoginogenesis yang diujikan efektif menghasilkan larva mitoginogenesis ikan tawes walaupun efektifitasnya masih tergolong rendah. Efektivitas perlakuan dibuktikan dari signifikansi data morfologi larva abnormal dariklompok kontrol negatif membuktikan efektivitas dosis inaktivasi genetis jantan dan morfologi larva normal hasil perlakuan ginogenesis membuktikan efektivitas diploidisasi kejut panas tidak berbeda dari morfologi kontrol positif
Faktor-Faktor Ekologis yang Berpengaruh terhadap Struktur Populasi Kumbang Badak (Oryctes rhinoceros L. )
Get PDFKumbang badak (Oryctes rhinoceros L.) dapat hidup dengan optimal dengan dukungan dari faktor ekologis yang cocok. Faktor ekologis meliputi habitat limbah material organik di vegetasi tersebut, musuh alami, musim, dan faktor cuaca (suhu, curah hujan dan kelembaban) diteliti pengaruhnya terhadap struktur populasi kumbang badak pada Oktober-Desember 2015. Penelitian ini merupakan penelitian survei dengan pengambilan sampel dilakukan sebanyak empat kali, dua kali pada musim kemarau dan dua kali pada musim penghujan. Data dianalisis dengan analisis ANOVA dan untuk mengetahui faktor ekologis yang paling berpengaruh dilakukan uji lanjut dengan Duncan. Berdasarkan ANOVA, ada perbedaan antar habitat F=0,012 untuk perbandingan antara jerami dan serasah daun, 0,002 antara jerami dan tanpa limbah, 0,000 antara serasah daun dan tanpa limbah, serta 0,001 untuk batang pohon dan tanpa limbah (P<0,05). Untuk stadium pupa dan imago hasil analisis ANOVA menunjukkan hasil tidak berbeda nyata. Faktor musim memberikan hasil bahwa terjadi peningkatan di ketiga stadium yang ditemukan dengan jumlah yang berbeda. Stadium larva mengalami peningkatan sebanyak 381 larva, stadium pupa sebanyak 25 pupa, dan peningkatan sebanyak 166 ekor kumbang badak stadium imago. Setelah dilakukan uji statistik dengan uji t, jumlah populasi kumbang badak pada musim kemarau dan penghujan berbeda nyata dengan nilai uji t =0,000 untuk stadium larva, sedangkan pada pupa, t = 0,038 (P<0,05). Setelah dilakukan uji lanjut diperoleh hasil habitat limbah material organik merupakan faktor ekologi yang paling berpengaruh. Habitat limbah material organik yang paling berpengaruh adalah batang pohon, disusul dengan habitat serasah dan jerami
Ekspresi Relatif mRNA BRLF1 Epstein-Barr Virus dari Biopsi Jaringan Tumor dalam Blok Parafin sebagai Petanda Biologi Patogenesis Karsinoma Nasofaring
Get PDFKarsinoma nasofaring (KNF) merupakan tumor ganas pada sel epitel nasofaring dan merupakan penyakit multifaktor yang bersifat endemik. Tipe KNF tidak berdiferensiasi (KNF WHO-3) telah terbukti konsisten dengan infeksi EBV. Gen litik BRLF1 berperan sebagai mediator transisi dari fase laten menjadi litik. Pengukuran aktivitas mRNA EBV di lokasi tumor primer perlu dilakukan karena lebih mencerminkan patogenesis KNF yang sesungguhnya dari pada diagnosis serologi dan pengukuran DNA EBV di sirkulasi darah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui nilai ekspresi relatif mRNA BRLF1 Epstein-Barr Virus pada beberapa tingkat stadium tumor penderita KNF sebagai petanda biologi potensial dalam patogenesis KNF. Metode penelitian yang digunakan adalah metode deskriptif yang berbentuk studi seran lintang. Sampel penelitian ini adalah biopsi jaringan tumor dalam blok parafin penderita KNF sebanyak 24 sampel. Sampel tersebut telah didiagnosis pasti sebagai KNF WHO-3 dari hasil pemeriksaan Patologi Anatomi pada Poli Patologi Anatomi, RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo, Purwokerto serta memenuhi kriteria inklusi sampel. Analisis statistik dilakukan untuk membandingkan ekspresi relatif mRNA BRLF1 stadium yang berbeda. Nilai ekspresi relatif mRNA BRLF1 EBV pada 24 sampel KNF berkisar 99,04415959-1097,496026. Hasil analisis statistik menunjukkan nilai ekspresi relatif mRNA BRLF1 EBV pada stadium awal (n = 5; 544,72420 + 142,614733) lebih tinggi 1,8 kali dibandingkan dengan stadium lanjut (n = 17; 395,68612 + 293,172201), namun peningkatan ekspresi relatif mRNA BRLF1 EBV tidak bermakna secara statistik karena didapatkan nilai p=0,130 (p>0,05). Oleh karena itu, ekspresi relatif mRNA BRLF1 EBV dari biopsi jaringan tumor dalam blok parafin tidak berpotensi sebagai petanda biologi molekul patogenesis KNF, khususnya progresivitas tumor pada stadium lanjut KNF
Uji Antagonis Jamur Tempe (Rhizopus Sp) terhadap Bakteri Patogen Enterik
Get PDFIndonesian tempeh is a food product made from soybeans fermented by Rhizopus oligosporus. The role of R.oligosporus as the primary fungi in soybean is very important, that changing the composition of the substrate soybeans into food that is more nutritious and contains many enzymes and bioactive compounds, including antibacterial compounds. This study was aimed at testing the antibacterial activity of Rhizopus sp fungus isolated from commercial tempeh against several enteric pathogen bacteria Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella typhimurium ATCC 14028 and Shigella flexneri ATCC 12022. The tests were conducted by the antagonism test agar diffusion method, by putting pieces of SDA that has grown Rhizopus sp on agar Muller Hinton which test bacteria was inoculated. The incubation period was 24 hours at 37 ° C. The results showed that Rhizopus sp has antagonistic to the bacteria, which produce inhibitory zone of 28 mm against the E.coli ATCC 25922, 26 mm against S.typhimurium ATCC 14028 and 39.5 mm against Shigella flexneri ATCC 12022. Based on these results it can be concluded that the Rhizopus sp isolated from tempeh is antagonistic against enteric pathogenic bacteria. The results of this study reinforce the benefits of tempeh as a functional food
Analisis Fenetik Kultivar Krisan (Chrysanthemum morifolium Ramat.)
Get PDFChrysanth (Chrysanthemum morifolium Ramat.) atau dikenal sebagai Seruni merupakan tanaman herba hias. Chrysanth merupakan salah satu komoditas tanaman hias utama yang memiliki keragaman kultivar, seperti dapat dilihat dari bentuk dan variasi warna bunganya. Penelitian ini bertujuan untuk menyelidiki keragaman dan hubungan kesamaan kultivar chrysanth. Metode penelitian yang digunakan purposive sampling. Data dari chrysanth kultivar morfologi dan anatomi daun karakter dianalisis berdasarkan hubungan kemiripan dengan UPGMA (Unweighted Pasangan Metode Group dengan Arithmetic mean) metode menggunakan 5.05 software MEGA. Berdasarkan penelitian, delapan kultivar chrysanth diperoleh, yaitu C. morifolium 'Cut Nyak Dien', C. morifolium 'Dewi Ratih', C. morifolium 'Dwina Kencana', C. morifolium 'Dwina Pelangi', C. morifolium 'Elora ', C. morifolium' Pasopati ', C. morifolium' Puspita Nusantara ', dan C. morifolium' Swarna Kencana '. Kesamaan terdekat adalah antara C. morifolium 'Dwina Kencana' dan C. morifolium 'Dwina Pelangi' kultivar, dengan indeks ketidaksamaan terkecil 0,152, sedangkan kesamaan paling jauh adalah antara C. morifolium 'Elora' dan C. morifolium 'Swarna Kencana 'kultivar, dengan indeks ketidaksamaan terbesar 2,256
Perkembangan Awal Protocorm Anggrek Phalaenopsis amabilis secara In Vitro setelah Penambahan Zat Pengatur Tumbuh α-Naphtaleneacetic Acid dan Thidiazuron
Get PDFPhalaenopsis amabilis (L.) Blume merupakan salah satu anggrek alam dengan nilai komersial yang tinggi. Keberadaannya di alam semakin sukar dijumpai akibat eksploitasi berlebihan dan kerusakan hutan. Selain itu budidaya anggrek ini cukup sulit dilakukan karena biji bersifat mikroskopis dan tidak memiliki endosperm, sehingga perlu dilakukan kultur in vitro. Dalam budidaya secara in vitro diperlukan medium pendukung pertumbuhan anggrek secara optimal misalnya dengan penambahan Zat Pengatur Tumbuh (ZPT) dari golongan auksin dan sitokinin. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan ZPT tersebut terhadap perkembangan protokorm (pertumbuhan embrio anggrek) P. amabilis secara in vitro dari aspek morfologi dan anatomi. Penelitian dilakukan di Laboratorium Bioteknologi dan Laboratorium Struktur Perkembangan Tumbuhan. Digunakan protokorm anggrek P. amabilis berumur 2 bulan. Protokorm disubkultur pada medium NP dengan kombinasi ZPT NAA dan TDZ pada berbagai konsentrasi dan diinkubasi pada ruangan dengan kelembaban tinggi, suhu 250C. Kemudian diamati protokorm anggrek selama 2 minggu yang mencakup persentase pertumbuhan, persentase protokorm yang membentuk tunas dan absorbing hair. Pembuatan preparat anatomi dilakukan dengan mengambil protokorm setiap minggunya, disimpan dalam larutan alkohol 70% dan dibuat preparat anatomi menggunakan metode Parafin dengan pewarnaan safranin. Hasil penelitian menunjukkan pada penambahan NAA dan TDZ pertumbuhan protokorm mencapai 100%. Persentase protokorm yang membentuk tunas berturut turut (0:0, 0.2:0, 0:0.5, 0.2:0.5, 0:1, dan 0.2:1) ppm adalah 24%, 22%, 32%, 40%, 40% dan 38% sedangkan untuk pengamatan protokorm yang membentuk absorbing hair sebesar 10%, 18%, 14%, 24%, 16%, dan 0%. Untuk diameter sel berukuran 39.2±0.47µm, 44.4±0.97µm, 39.08±0.5µm, 38.83±0.2µm,39.5±0.39µm dan 39.75±0.28µm. Sehingga dapat disimpulkan medium yang paling optimal dalam pertumbuhan anggrek P. amabilis secara in vitro adalah medium NP dengan kombinasi NAA dan TDZ (0.2 : 0.5) ppm.Kata kunci : Anatomi, Kultur In Vitro, Morfologi, Phalaenopsis amabili
Ekstraksi Na-Alginat dari Rumput Laut Padina sp. Menggunakan Konsentrasi Kalium Hidroksida yang Berbeda
Get PDFThe objective of this study was to obtain the best sodium alginate extract from Padina sp. with different potassium hydroxide concentration. Padina sp. was collected in coastal Senggarang, Tanjungpinang, Riau Islands Province. The raw material of Padina sp. was extraction by potassium hydroxide with different concentration (0.6%, 0.8%, 1%). We analyzed content of moisture, ash, yield, viscosity and pH. The best results obtained in the treatment with a solution of KOH concentration 0,8% with content of moisture 10,87%, ash 31,24%, yield 17,82%, viscosity 275,50 cP and pH 8,21.