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AVALIAÇÃO DA LITERACIA E PRÁTICAS DE SAÚDE ORAL INFANTIL DOS PAIS E CUIDADORES DE CRIANÇAS ENTRE OS 3-10 ANOS
No full textTrabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina Dentária apresentado à Faculdade de MedicinaIntrodução: Na infância os pais desempenham um papel importante representando um modelo de comportamento para os filhos, sendo com os pais que se estabelecem os primeiros hábitos de higiene oral. A literacia em saúde oral define-se como a capacidade demonstrada para obter, processar e compreender informação básica relacionada, bem como os recursos necessários para tomar decisões apropriadas neste âmbito. Os pais com níveis mais baixos de literacia em saúde oral enfrentam inúmeros desafios que podem dificultar a implementação de comportamentos preventivos adequados em saúde oral nos seus filhos. Este estudo teve como objetivo avaliar o nível de literacia, conhecimentos e práticas em saúde oral de pais/cuidadores relativamente à saúde oral dos seus filhos (entre os 3 e 10 anos) e indagar possíveis relações com características sociodemográficas.Materiais e Métodos: Este estudo observacional transversal visou a aplicação de um questionário a pais/tutores de crianças com idades compreendidas entre os 3-10 anos, com cumprimento dos requisitos éticos exigidos. Foram utilizados métodos de amostragem de conveniência e de bola de neve. O questionário semiestruturado, de caráter anónimo, foi distribuído em papel e online (fevereiro -abril de 2024), em 2 escolas, nas aulas de clínica de Odontopediatria da Faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra e em consulta privada. Os dados obtidos foram analisados com recurso ao IBM SPSS versão 29.0, teste qui-quadrado para avaliar associações entre as características sociodemográficas dos pais e os seus conhecimentos, literacia e práticas em saúde oral infantil. Os testes foram considerados significativos para p inferior a 0.05.Resultados: Foram incluídos na análise final 590 questionários, 75.9% destes preenchidos em papel. A grande maioria dos inquiridos respondeu corretamente a 13 das 15 questões, revelando um bom nível de conhecimentos. Apesar disso, é de salientar que os pais e cuidadores demonstraram conhecimentos insuficientes relativamente a aspetos fundamentais no que concerne às necessidades e práticas de higiene oral dos seus filhos. Verificou-se associação entre o nível de escolaridade dos pais e cuidadores e as suas respostas sobre a saúde oral na maioria das questões. Conclusão: A maioria dos pais demonstrou um nível adequado de conhecimentos e práticas de saúde oral; contudo, foram observadas algumas lacunas nos conhecimentos essenciais, sublinhando a necessidade de intervenções de promoção e educação para a saúde oral. Os resultados destacaram uma associação significativa entre o nível de escolaridade dos pais e os conhecimentos e literacia em saúde oral, tornando-os um importante alvo das intervenções e medidas preventivas da patologia dentária na criança.Introduction: Parents and caregivers play a pivotal role in shaping oral health behaviors, serving as role models, and establishing habits that influence their children's oral health outcomes. Oral Health Literacy (OHL) is defined as the capacity to obtain, process, and understand basic oral and craniofacial health information and resources needed to make appropriate health decisions. Parents with lower levels of OHL face numerous challenges that may hinder the implementation of adequate oral health preventive behaviors. This study aimed to assess the level of oral health literacy, knowledge, and practices of parents and caregivers regarding the oral health of their children (aged 3-10 years), and to investigate the relationship between parents’ sociodemographic characteristics and their level of oral health literacy and knowledge.Materials and Methods: This cross-sectional observational study involved parents and caregivers of children aged 3 to 10 years. All required ethical requirements have been met. This study employed convenience and snowball sampling methods. An anonymous semi-structured questionnaire was distributed online and in print from February to April 2024, in 2 schools, Pediatric Dentistry clinic of Faculty of Medicine, University of Coimbra (Portugal) and in private consultation. Statistical analysis was performed with IBM SPSS version 29.0, using the chi-square to assess associations between parents' sociodemographic characteristics and their oral health knowledge, literacy and practices. The tests were considered significant for a p-value less than 0.05.Results: In total 590 questionnaires were included in the final analysis, 75.9% of them were filled in paper. Most of the respondents answered correctly to 13 out of 15 questions regarding OHK, thus revealing a good level of oral health knowledge. Despite this, it is noteworthy that parents and caregivers exhibited insufficient knowledge regarding critical aspects of their children’s oral hygiene needs and practices. Parents' and caregivers’ education level was associated with their answers on OHK in most of the questions. Conclusion: The majority of parents showed good understanding of oral health knowledge and practices, but there are still some misconceptions that require educational interventions. The findings highlighted a significant association between parent’s education level and oral health knowledge and literacy. Tailored preventive programs are recommended to enhance children’s oral health outcomes
Aplicação de fibrina rica em plaquetas e plasma rico em plaquetas em endodontia: uma scoping review
No full textTrabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina Dentária apresentado à Faculdade de MedicinaRationaleConventional endodontic treatment has several disadvantages, which lead to the introduction of regenerative endodontic procedures aiming to maintain tooth vitality. Platelet concentrates possess relevant biological properties, and their application has been explored in various endodontic procedures.ObjectivesIdentify the applications of platelet-rich plasma (PRP) and platelet-rich fibrin (PRF) in endodontics. To identify and map the types of studies being published, the protocols for obtaining PRF/PRP, the most productive authors in this topic, and the journals where most articles were published.Source of evidenceA bibliographic search was conducted in Medline (via PubMed), Embase, Cochrane Library, and Web of Science databases, using a combination of MeSH terms and keywords.Eligibility CriteriaAll study types were included. Language filters for Portuguese, Spanish, French, and unspecified languages were applied. No restrictions on publication dates were applied.Participants and interventionsPopulation: patients and experimental models of endodontic treatment; Concept: use of PRF and PRP; Context: endodontic treatmentMethodsDuplicates were removed. The articles were screened first by title and abstract and later by full text, independently by two authors. From the included articles the following information was extracted: first author and year, clinical procedure, platelet concentrate used and type of study.Also, a sampling methodology was adopted, and the five most recent articles for each procedure were used for additional information extraction, including sample size and characteristics, pulp and periapical diagnosis, study protocol, platelet substrate and protocol for its obtention, treatment outcome, and follow-up.LimitationsOnly the Choukroun’s original PRF, leukocyte-PRF and PRP were included, so the other platelet concentrates were not considered. Only information on the first author was extracted.ResultsFrom the bibliographic search, 1303 articles were identified. After removing duplicates and applying the inclusion and exclusion criteria, 384 articles were included.Of the included studies, 225 reported the use of PRF, 78 of PRP, and 81 reported both. Eighty-seven clinical case reports, 26 clinical case series, 5 cohort studies, 3 case-control studies, 58 randomized controlled trials, 23 in vitro studies, 53 narrative reviews, 40 systematic reviews, 3 scoping reviews, 1 umbrella review, 34 animal studies, and 52 randomized controlled trial protocols were included.As for the type of endodontic procedure, 172 studies referred to the regeneration of immature teeth, 74 to apical surgery, 51 to pulpotomy and pulp protection, 37 to the regeneration of mature teeth, 37 to the evaluation of biological effects, 19 to apexification, 16 to endo-perio lesions, 12 to reimplantation, 10 to perforations, 5 to resorptions, 2 to auto transplantations, 2 regarding mechanical properties, and 2 to root fractures.The journal with the most publications was the Journal of Endodontics with 51 publications, and the author with the most first authorships was Dexton Anthony Johns with 4 publications.ConclusionsPRF is the platelet concentrate most reported. Immature teeth revascularization is the endodontic procedure most described. There is significant heterogeneity in the protocols used for obtaining PRF and PRP and in their clinical application.Review registrationThis review was registered in the Open Science Framework platform. The protocol is available at: https://doi.org/10.17605/OSF.IO/6UY49.Referencial teóricoOs tratamentos endodônticos convencionais apresentam várias desvantagens, o que levou à introdução de procedimentos endodônticos regenerativos visando manter a vitalidade do dente. Os concentrados plaquetários possuem propriedades biológicas relevantes e a sua aplicação tem sido explorada em vários procedimentos endodônticos.ObjetivosIdentificar as aplicações do plasma rico em plaquetas (PRP) e da fibrina rica em plaquetas (PRF) na endodontia. Identificar e mapear os tipos de estudo publicados, os protocolos de obtenção do PRF/PRP, os autores mais ativos neste tópico e os principais jornais onde artigos foram publicados.Fontes de evidênciaA pesquisa bibliográfica foi realizada nas bases de dados Medline (via PubMed), Embase, Cochrane Library e Web of Science (todas as bases de dados), utilizando uma combinação de termos MeSH e palavras-chaveCritérios de elegibilidadeTodos os tipos de estudos foram incluídos. Na pesquisa bibliográfica foram aplicados filtros de língua para português, espanhol, francês e idioma inespecífico. Nenhuma restrição para as datas das publicações foi aplicada.Participantes e intervençõesPopulação: doentes e modelos experimentais de tratamento endodôntico; Conceito: utilização de PRF e PRP; Contexto: tratamento endodôntico.MétodosOs duplicados foram removidos. Os artigos foram escrutinados primeiro pelo título e resumo e depois pelo texto completo, de forma independente por dois autores. Dos artigos incluídos, foram extraídas as seguintes informações: primeiro autor e ano, procedimento clínico, concentrado plaquetário utilizado e tipo de estudo.Além disso, foi adotada uma metodologia de amostragem, e foram utilizados os cinco artigos mais recentes para cada procedimento, para extração adicional de informações, incluindo o tamanho e características da amostra, diagnóstico pulpar e periapical, protocolo do estudo, substrato plaquetário e protocolo de obtenção, outcomes do tratamento e período de acompanhamento. LimitaçõesApenas foram incluídos o PRP, PRF original de Choukroun e PRF rico em leucócitos, excluindo os restantes substratos plaquetários. Apenas informação do primeiro autor foi extraída.Resultados Da pesquisa bibliográfica resultaram 1303 artigos. Após remoção dos duplicados e aplicação dos critérios de inclusão e exclusão 384 artigos foram incluídos. Dos estudos incluídos, 225 relataram o uso de PRF, 78 de PRP e 81 relataram ambos. Foram incluídos 87 relatos de casos clínicos, 26 séries de casos clínicos, 5 estudos de coorte, 3 estudos caso-controle, 58 ensaios controlados randomizados, 23 estudos in vitro, 53 revisões narrativas, 40 revisões sistemáticas, 3 revisões scoping, 1 revisão umbrella, 34 estudos com animais e 52 protocolos de ensaios controlados randomizados.A revista com mais publicações foi o Journal of Endodontics com 51 publicações e o autor com mais publicações como 1º autor foi Dexton Anthony Johns, com 4 publicações.ConclusõesO PRF tem sido o concentrado plaquetário mais frequentemente relatado nos procedimentos endodônticos. A revascularização de dentes imaturos é o procedimento mais descrito. Há uma significativa heterogeneidade nos protocolos utilizados na obtenção de PRF e PRP e na sua aplicação clínica.Registo da revisãoEsta revisão foi registada na Open Science Framework. O protocolo está disponível em: https://doi.org/10.17605/OSF.IO/6UY4
Long-term Clinical and Histological Evaluation of the Use of Autologous Dentin as a Bone Substitute - Case Series
No full textTrabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina Dentária apresentado à Faculdade de MedicinaIntroduction: Surgical extraction of lower third molars is a procedure commonly performed in Dentistry. Associated with this, bone dimensional changes occur in the post-extraction socket and there may be periodontal compromise of the adjacent second molar. Alveolar preservation, using alternative biomaterials to the gold standard, such as autologous dentin, is used to mitigate these changes. Materials and methods: In a previous clinical study, participants underwent surgical extraction of a lower third molar and were divided into two groups: regeneration with autologous dentin graft in the socket (study group) and conventional regeneration (control group). In this series of cases, clinical and radiographic evaluations were carried out 24 months postoperatively, in addition to laboratory processing of bone samples obtained for histological analysis.Results: The values of probing depth and bone parameters evaluated are lower in patients in which an autologous dentin graft was used. Histological analysis demonstrated the presence of bone trabeculae, connective tissue and blood vessels in all patients. Discussion: Alveolar preservation is essential to minimize resorption of the alveolar ridge after tooth extraction and favors bone regeneration on the distal face of the adjacent second molar, and autologous dentin has demonstrated osteoconductive and osteoinductive properties. The present study, similar to that published in the literature, demonstrates that the use of dentin graft significantly reduces periodontal probing depth and bone loss compared to conventional extractions, promoting more effective bone integration and improved postoperative healing.Conclusion: Autologous dentin demonstrates properties that make it a promising alveolar preservation material.Introdução: A extração cirúrgica de terceiros molares inferiores é um procedimento comummente efetuado em Medicina Dentária, associado a esta ocorrem alterações dimensionais ósseas do alvéolo pós-extracional e pode existir um comprometimento periodontal do segundo molar adjacente. A preservação alveolar, utilizando biomateriais alternativos ao gold standard, como a dentina autóloga, é utilizada para atenuar estas alterações. Materiais e métodos: Num estudo clínico prévio, os participantes foram submetidos à extração cirúrgica de um terceiro molar inferior e divididos em dois grupos: regeneração com enxerto de dentina autóloga no alvéolo (grupo de estudo) e regeneração convencional (grupo de controlo). Nesta série de casos, foram efetuadas avaliações clínicas e radiográficas, aos 24 meses pós-operatórios, além do processamento laboratorial das amostras ósseas obtidas para análise histológica.Resultados: Os valores de profundidade de sondagem e dos parâmetros ósseos avaliados são menores nos pacientes em que foi utilizado enxerto de dentina autóloga. A análise histológica demonstrou a presença de trabeculado ósseo, tecido conjuntivo e vasos sanguíneos, em todos os pacientes. Discussão: A preservação alveolar é essencial para minimizar a reabsorção do rebordo alveolar após a extração dentária e favorece a regeneração óssea na face distal do segundo molar adjacente, sendo que a dentina autóloga tem demonstrado propriedades osteocondutora e osteoindutora. O presente estudo, à semelhança do publicado na literatura, demonstra que o uso de enxerto de dentina reduz significativamente a profundidade de sondagem periodontal e a perda óssea em comparação com extrações convencionais, promovendo uma integração óssea mais eficaz e uma cicatrização pós-operatória melhorada.Conclusão: A dentina autóloga demonstra propriedades que a torna um material de preservação alveolar promissor
Avaliação de Métodos de Integração de Dados para Análise de Dados Multi-Ómicos
No full textDissertação de Mestrado em Biologia Computacional apresentada à Faculdade de Ciências e TecnologiaThe development of high-throughput biological technologies accompanied with reducing costs has allowed the simultaneous study of different omics, such as genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolics, for the same set of samples. Combining information on different molecular layers may contribute to better understand biological processes and disease mechanisms. International projects like The Cancer Genome Atlas (TCGA, https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga) and International Cancer Genome Consortium (ICGC, https://dcc.icgc.org/) have generated a large amount of multi-omics cancer data. The integrative analysis of such data may contribute to identify cancer subtypes, essential for personalised treatments and to discover potential new biomarkers related to diagnosis and prognosis. Integrative analysis of multi-omics data may contribute to the identification of cancer subtypes and reveal potential biomarkers related to diagnosis and prognosis. However, the potential of multi-omics data can only be fully unlocked with suitable data analysis methods. Numerous unsupervised data integration methods have been developed and compared using mainly continuous data. Here several unsupervised integration methods were compared using binary and continuous omics data from chronic lymphocytic leukemia (CLL). The consistency of results obtained with different methods was evaluated by comparing clusters and the features that distinguished those clusters. All methods clustered patients in two groups although with a different partitioning and based on diverse relevant features. These results suggested that performing multi-omics data integration analysis with only one method may not provide a complete view of the molecular profile.O desenvolvimento de tecnologias biológicas de alto desempenho acompanhado da redução de custos tem permitido o estudo simultâneo de diferentes “ómicas”, tais como genómica, transcriptómica, proteómica e metabolómica, para o mesmo conjunto de amostras. A combinação de informações sobre diferentes níveis moleculares pode contribuir para uma melhor compreensão dos processos biológicos e dos mecanismos das doenças. Projectos Internacionais tais como “The Cancer Genome Atlas” (TCGA, https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga) e “International Cancer Genome Consortium” (ICGC, https://dcc.icgc.org/) geraram uma grande quantidade de dados de “ómicas” de vários tipos de cancro. A análise integrada de dados “multi-ómicos” pode contribuir para a identificação de subtipos de cancro e revelar potenciais biomarcadores de diagnóstico e prognóstico. No entanto, o potencial dos dados “multi-ómicos” só pode ser totalmente aproveitado com métodos de análise de dados adequados. Vários métodos de integração de dados não supervisionados foram desenvolvidos e comparados usando principalmente dados contínuos. Neste trabalho, vários métodos de integração não supervisionados foram comparados usando dados “ómicos” binários e contínuos de leucemia linfocítica crónica (LLC). A consistência dos resultados obtidos com diferentes métodos foi avaliada comparando os grupos e as variáveis que os distinguem. Todos os métodos agruparam os pacientes em dois grupos, embora com uma partição diferente e baseados em variáveis diversas. Estes resultados sugerem que a realização de análises de integração de dados “multi-ómicos” com apenas um método pode não revelar uma visão completa do perfil molecular
Definição e Implementação do Software do Serviço para Procedimentos de Controlo de Naves Espaciais
No full textDissertação de Mestrado em Engenharia Informática apresentada à Faculdade de Ciências e TecnologiaThroughout history, mankind has always been fascinated by space. The thought of exploring this vast unknown has led to remarkable scientific advancements.In recent years, technological advancements have transformed this dream into reality, making it possible to explore and understand this final frontier like never before.Critical Software has been engaged in multiple space-related projects since its foundation, being responsible for the production and validation of Flight Software (FSW). The European Cooperation for Space Standardization (ECSS) organization, supported by European Space Agency (ESA), has defined standards aiming to improve the reliability and safety of European missions. Currently, Critical Software is actively developing the Karvel platform, a spacecraft on-board control software platform consisting of diverse modules that adhere to these standards. These modules provide various functionalities to the spacecraft and are designed modularly, offering flexibility for adaptation, addition, or removal in order to meet the mission-specific requirements.One of these modules is the Packet Utilization Standard (PUS), which is responsible for hosting several services, such as the PUS Service 18 - On-board Control Procedure (OBCP), which will be the main topic of this document. This service serves as a remote interface for the OBCP Engine, another module within the FSW, enabling the management and monitoring of OBCPs from the ground. OBCPs are sets of custom instructions that can be created, transmitted, and executed on the spacecraft during the mission, enhancing the operational flexibility and adaptability of the FSW. The instructions are designed based on the mission-specific objectives.This internship is divided into two semesters. In the initial semester, the primary focus was the analysis of norms, guidelines, and documents describing the PUS Service 18 requirements. Following this analysis, a subset of requirements was chosen for implementation due to time constraints. Lastly, the On-board Control Procedure Service flowcharts were designed to describe the service behavior.In the second semester, the focus shifted to developing the PUS Service 18 - On-board Control Procedure. Concurrently, significant attention was devoted to the development of the OBCP Engine, which became integral to the development of the PUS Service. As each PUS Service functionality was implemented, unit tests were systematically created to ensure their reliability and functionality. Upon concluding the development phase, rigorous validation tests were conducted to validate the service requirements.Ao longo da história, a humanidade sempre foi fascinada pelo espaço. A ideia de explorar este vasto desconhecido levou a vários avanços científicos significativos. Nos últimos anos, os avanços tecnológicos transformaram esse sonho em realidade, tornando possível explorar e compreender esta última fronteira como nunca antes.A Critical Software tem estado envolvida em múltiplos projetos relacionados com o espaço desde a sua fundação, sendo responsável pela produção e validação de FSW. A organização ECSS, apoiada pela ESA, definiu normas que visam melhorar a fiabilidade e segurança das missões europeias. Atualmente, a Critical Software está a desenvolver a plataforma Karvel, uma plataforma de software de controlo a bordo de naves espaciais composta por diversos módulos que aderem a estas normas. Estes módulos fornecem várias funcionalidades à nave espacial e estão pensados de forma modular, oferecendo flexibilidade para adaptação, inclusão ou exclusão, de modo a cumprir os requisitos específicos da missão.Um destes módulos é o PUS, composto por vários serviços, como o PUS Service 18 - On-board Control Procedure, que será o principal foco deste documento. Este serviço serve como uma interface remota para o Motor de OBCPs, outro módulo dentro do FSW, que permite a gestão e monitorização dos OBCPs a partir do solo. Os OBCPs são conjuntos de instruções personalizadas que podem ser criadas, transmitidas e executadas na nave espacial durante a missão, aumentando a flexibilidade e adaptabilidade do FSW. As instruções são desenhadas com base nos objetivos específicos da missão.Este estágio está dividido em dois semestres. No semestre inicial, o foco principal foi a análise de normas, diretrizes e documentos que descrevem os requisitos do PUS Service 18. Após esta análise, um subconjunto de requisitos foi escolhido para implementação devido a restrições de tempo. Por fim, os fluxogramas do PUS Service 18 foram desenhados para descrever o comportamento do serviço.No segundo semestre, o foco mudou para o desenvolvimento do PUS Service 18 - On-board Control Procedure. Simultaneamente, uma atenção significativa foi dedicada ao desenvolvimento do Motor de OBCPs, que se tornou integral ao desenvolvimento do PUS Service. À medida que cada funcionalidade do PUS Service era implementada, testes unitários foram sistematicamente criados para garantir a sua fiabilidade e funcionalidade. Após a conclusão da fase de desenvolvimento, testes de validação foram conduzidos para validar os requisitos do serviço
Relatórios de estágio e monografia intitulada "Plant-mammal communication: the potential role of plant-derived vesicles on skin conditions and disease"
No full textRelatório de Estágio do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas apresentado à Faculdade de FarmáciaThe following document encloses two reports structured as SWOT (Strengths, Weaknesses, Opportunities and Threats) analyses and a monograph titled "Plant-mammal communication: the potential role of plant-derived vesicles on skin conditions and disease". One of the reports addresses an internship experience at a community pharmacy (Farmácia Moço) and the other one reports the internship experience at a pharmaceutical industry (Bluepharma Indústria Farmacêutica S. A.). The monograph presents the potential of plant-derived vesicles to treat skin diseases, while also exploring vesicle isolation, technological aspects such as vesicle loading, storage and safety. In this context, plants may give rise to different types of vesicles, ranging from extracellular vesicles obtained from apoplastic fluid to vesicles that may be generated during plant material processing. These lipid bilayer-bound structures contain diverse cargo, including metabolites, proteins, lipids and nucleic acids. Considering their peculiar attributes, it is possible to apply plant-derived vesicles directly on skin conditions or explore their useful properties in this context. Overall, in vitro and in vivo assays verify that these structures – whether used alone, loaded with exogenous therapeutic agents or in combination with other therapeutic strategies – present favorable features for treating skin cancer, cutaneous wounds and other skin pathologies involving oxidative stress, inflammation and/or immune dysfunction. However, despite encouraging therapeutic and safety results, various limitations are identified, including optimization needs, due to the fairly recent research on this type of structures which, given their significant potential in cutaneous biomedical applications, is expected to be further explored in the near future.O presente documento integra dois relatórios de estágio estruturados como análises SWOT (Strengths, Weaknessess, Opportunities e Threats) e uma monografia intitulada "Plant-mammal communication: the potential role of plant-derived vesicles on skin conditions and disease". Um dos relatórios expõe a experiência de estágio numa farmácia comunitária (Farmácia Moço) e o outro descreve a experiência de estágio numa indústria farmacêutica (Bluepharma Indústria Farmacêutica S. A.). A monografia apresenta o potencial de vesículas derivadas de plantas no tratamento de doenças da pele, explorando ainda aspetos relacionados com o seu isolamento, tecnologia farmacêutica, nomeadamente a encapsulação de compostos nas vesículas, armazenamento e segurança. Neste contexto, as plantas podem gerar diferentes tipos de vesículas, desde as vesículas extracelulares obtidas a partir de fluído apoplástico, até às vesículas decorrentes do método de processamento do material vegetal. Estas estruturas, delimitadas por uma bicamada lipídica, possuem um conteúdo de matéria variável, incluindo metabolitos, proteínas, lípidos e ácidos nucleicos. Atendendo às suas características peculiares, é possível a aplicação direta das vesículas derivadas de plantas em doenças da pele ou que explorem propriedades úteis para estas condições. De uma forma geral, ensaios in vitro e in vivo evidenciam que estas estruturas – quer por si só, quer carregadas com agentes terapêuticos exógenos ou usadas em combinação com outras estratégias terapêuticas – possuem atributos favoráveis ao tratamento de cancro da pele, feridas cutâneas e outras patologias da pele que envolvam stress oxidativo, inflamação e/ou disfunção do sistema imunológico. Contudo, apesar dos resultados encorajadores ao nível da terapêutica e da segurança, são ainda identificadas várias limitações, incluindo as destacadas necessidades de otimização, resultantes da exploração sensivelmente recente deste tipo de estruturas, que, dado o seu manifesto potencial em aplicações biomédicas cutâneas, se espera vir a ser mais aprofundada num futuro próximo
Relatórios de Estágio e Monografia intitulada "Gatilhos de enxaqueca: verdade ou mito"
No full textRelatório de Estágio do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas apresentado à Faculdade de FarmáciaThis document includes an analysis of the internships carried out in Pharmaceutical Industry and Community Pharmacy based on the SWOT methodology (Strengths, Weaknesses, Opportunities, Threats), as well as the monograph "Migraine triggers: Truth or myth". Migraine is the most prevalent neurological cause of disability globally and is a leading contributor to years lived with disability, particularly among young people. The intricate interplay of genetic, physiological, and environmental factors underlying migraine requires a comprehensive understanding of its pathophysiology to develop targeted treatments and effective management strategies. The current therapeutic approaches are primarily focused on the prevention of acute attacks and the reduction of the risk of future episodes. In addition, ongoing research is aimed at identifying more precise therapeutic targets.A crucial element of migraine management is the dentification and comprehension of specific triggers, including certain foods, weather changes, alcohol consumption and hormonal fluctuations. These triggers, although commonly recognized by patients, are not formally included in diagnostic criteria, raising the question of whether they are causative or merely correlated with migraine onset. This paper provides an in-depth analysis of migraine triggers, examining their validity and distinguishing between correlation and causation. Additionally, it reviews the pathophysiology of migraine, current therapeutic options, and emerging treatments. The goal is to offer a comprehensive understanding of migraine and contribute valuable insights to the ongoing discussion in the field.O presente documento integra uma análise dos estágios realizados na Farmácia do Bairro e na Bluepharma com base na metodologia SWOT(Strengths, Weaknesses, Opportunities, Threats), bem como a monografia "Migraine triggers: Truth or myth". A enxaqueca é a principal causa neurológica de incapacidade a nível global e uma das principais responsáveis pelos anos vividos com incapacidade, especialmente entre jovens. A complexa interação entre fatores genéticos, fisiológicos e ambientais inerente a esta patologia exige uma compreensão aprofundada da sua fisiopatologia para o desenvolvimento de tratamentos específicos e estratégias eficazes de gestão da doença. As atuais abordagens terapêuticas concentram-se principalmente na prevenção dos ataques e na diminuição da probabilidade de ocorrência de episódios futuros. Assim, a investigação atual tem como objetivo identificar alvos terapêuticos mais precisos. Um aspeto crucial na gestão da enxaqueca é a identificação e compreensão de gatilhos específicos, incluindo certos alimentos, mudanças climáticas, consumo de álcool e flutuações hormonais. Apesar destes gatilhos serem frequentemente reconhecidos pelos pacientes, não estão incluídos nos critérios de diagnóstico, o que levanta incerteza sobre a relação dos mesmos com o início da enxaqueca. Este artigo oferece uma análise aprofundada sobre os gatilhos da enxaqueca, examinando a sua veracidade e distinguindo-os entre correlação e causalidade. Adicionalmente, revê a fisiopatologia da enxaqueca, as opções terapêuticas atuais e os tratamentos emergentes. O objetivo é proporcionar uma compreensão abrangente desta patologia e contribuir com informação útil para a discussão contínua no campo
Terapia Génica Para A Doença De Machado-Joseph: Um Roteiro Regulamentar
No full textDissertação de Mestrado em Biotecnologia Farmacêutica apresentada à Faculdade de FarmáciaMachado-Joseph disease (MJD), also known as spinocerebellar ataxia type 3 (SCA3), is an autosomal dominant neurodegenerative disease and is the most common form of spinocerebellar ataxia in the world. This disease is mainly characterized by cerebellar and brainstem dysfunction and progressive motor disability, including a gradual loss of coordination and balance, progressive muscle weakness, visual impairment, and difficulty speaking and swallowing. There is currently no cure for MJD, but research over the last years has substantially increased the knowledge on the molecular mechanisms underlying MJD, which may become attractive targets for the development of new drugs. Furthermore, new approaches involving Advanced Therapy Medicinal Products (ATMP), particularly based on gene therapy, have been showing very promising results, suggesting that ATMPs may be a reality for MJD treatment in the future.As for all medicinal products, to make an ATMP widely marketed in the European Union (EU), an application for a marketing authorization (MA) is mandatory. According with EU legislation, in the case of ATMPs this authorization has to be requested to the European Medicines Agency (EMA) and is granted by the European Commission (EC). This authorization consists of a formal request to the EMA, in a particular dossier format, that must contain the pharmaceutical development data, as well as the results of preclinical studies and clinical trials to demonstrate the quality, safety, and efficacy of the drug. Given the importance of clinical trials for the granting of a MA, whenever a clinical trial is intended to be conducted, a clinical trial application (CTA) must first be submitted, in which all information regarding the investigational ATMP (ATIMP) and the planned trial must be provided. This information must be contained and organized in the investigational medicinal product dossier (IMPD), which forms the basis of the dossier later submitted in the MA application.With all this in mind, this work has taken the first step in constructing an IMPD model for a future gene therapy-based ATMP to treat MJD. The data used to build this dossier refers to a drug designated rAAV9-miR-ATXN3, whose therapeutic action consists of the allele-specific silencing of mutant ATXN-3 gene (the gene that causes MJD), using an artificial miRNA and delivered by a recombinant AAV9 viral vector. With the information currently available on this drug, the pharmaceutical development data covered some of the main regulatory requirements, such as demonstration of biological activity, the development of the manufacturing process, the control of materials and in-process controls, the characterization of the structure and impurities and the respective analytical procedures used. The non-clinical studies were conducted on two different animal models of the disease and demonstrated the efficacy of this treatment in reducing the levels of the mutant protein, silencing its expression and mediating a phenotypic alleviation of MJD-related symptoms.Despite the promising results presented in this IMPD model, further studies are still needed in order to meet all the regulatory requirements for this drug to be approved for widespread marketing in the EU. Nevertheless, the very first step has been taken in building a robust IMPD model, which could be used in the future for other possible gene therapy-based ATIMPs to treat MJD, thereby accelerating the application and approval process for a MA for this disease.A doença de Machado-Joseph (MJD) é uma doença neurodegenerativa autossómica dominante e é a forma mais comum de ataxia espinocerebelosa no mundo. Esta doença é caracterizada principalmente pela disfunção do cerebelo e do tronco cerebral e pela incapacidade motora progressiva, incluindo uma perda gradual da coordenação e do equilíbrio, fraqueza muscular progressiva, deficiência visual e dificuldade em falar e engolir. Atualmente, não existe cura para a MJD, mas a investigação científica ao longo dos últimos anos aumentou substancialmente o conhecimento sobre mecanismos moleculares subjacentes à MJD que podem vir a ser alvos atrativos para o desenvolvimento de novos medicamentos. Para além disso, novas abordagens envolvendo medicamentos de terapia avançada (ATMP), em particular baseados em terapia génica, têm apresentado resultados muito promissores, sugerindo que os ATMP podem vir a ser uma realidade para o tratamento da MJD no futuro.Para que qualquer ATMP possa ser amplamente comercializado na União Europeia (UE), é obrigatório a realização de um pedido de autorização de introdução no mercado (AIM). De acordo com a legislação da EU, esta autorização tem de ser solicitada à Agência Europeia de Medicamentos (EMA) sendo concedida pela Comissão Europeia (CE). Esta autorização consiste num pedido formal à EMA, num formato específico de dossier que contém os dados do desenvolvimento farmacêutico, bem como os resultados de estudos pré-clínicos e ensaios clínicos, de forma a demonstrar a qualidade, segurança e eficácia do medicamento. Dada a importância dos ensaios clínicos para a concessão de uma AIM, sempre que se pretende realizar um ensaio clínico, é necessário apresentar previamente um pedido de ensaio clínico (CTA), no qual deve ser fornecida toda a informação relativa ao medicamento de terapia avançada experimental (ATIMP) e ao ensaio planeado. Esta informação deve estar contida e organizada no Dossier do Medicamento Experimental (IMPD), que constitui a base do dossier posteriormente apresentado no pedido de AIM.Considerando tudo isto, neste trabalho foi dado o primeiro passo na construção do modelo de um IMPD para um futuro ATMP baseado em terapia génica para tratar a MJD. Os dados utilizados para a construção deste dossier referem-se a um fármaco denominado rAAV9-miR-ATXN3, cuja ação terapêutica consiste no silenciamento específico do alelo mutante do gene ATXN-3 (o gene causador da MJD), utilizando um miRNA artificial e sendo entregue através de um vetor viral AAV9 recombinante. Com a informação atualmente disponível sobre este fármaco, os dados do desenvolvimento farmacêutico contemplaram alguns dos principais requisitos regulamentares, como por exemplo demonstração da atividade biológica, desenvolvimento do processo de fabrico, o controlo dos materiais e controlos em processos, a caraterização da estrutura e das impurezas e os respetivos procedimentos analíticos usados. Os estudos não clínicos foram efetuados em dois modelos animais da doença distintos, tendo sido demonstrada a eficácia do tratamento na redução dos níveis da proteína mutante, silenciando a sua expressão e mediando um alívio fenotípico dos sintomas relacionados com a MJD.Apesar dos resultados promissores apresentados neste modelo do IMPD, são ainda necessários mais estudos e ensaios de forma a responder a todas as exigências regulamentares, para que este medicamento seja aprovado para comercialização generalizada na UE. Ainda assim, foi dado o primeiro passo na construção do modelo de um IMPD, que poderá ser utilizado no futuro para outros eventuais ATIMPs baseados em terapia génica para tratar a MJD, de forma a acelerar o pedido e a aprovação de uma AIM para esta doença
Prefrontal Serotonin Input in Cognitive Flexibility and its Ability to Revert Impairments in Stress-related Disorders
No full textDissertação de Mestrado em Engenharia Biomédica apresentada à Faculdade de Ciências e TecnologiaMajor depressive disorder is a debilitating mental illness with social, emotional and cognitive consequences which negatively affect around 17% of the western societies’ wellbeing. Its etiopathogenesis is strongly associated to the exposure to stressful events and the consequent increase of circulating cortisol. This greatly effects the serotonergic system, including its projections from the dorsal raphe to subregions of the medial prefrontal cortex (mPFC), specifically the orbitofrontal cortex (OFC) and the prelimbic cortex (PrL) subregions, responsible for cognitive flexibility – the ability to change our cognitive patterns to changes in context. Recently, the serotonergic projections to the OFC were found to be relevant for the intradimensional rule reversal (RR) and the activity in the PrL relevant for the extradimensional rule shift (RS). Notably, the activation of the PrL 5-HT1A receptor is hypothesized to play an important role in RS. As cognitive inflexibility is manifested because of stress and it is typically observed in depressive patients, the hypothesis is that the activation of the PrL and OFC 5-HT1A receptor ameliorates cognitive inflexibility in the context of stress and depression. Thus, the aim in this work is to understand the extent to which this cognitive domain is affected in a mice model of depression – the unpredictable chronic mild stress protocol (uCMS) – through the implementation of behavioral test, the attentional set shifting test (ASST), to assess cognitive flexibility. Moreover, the efficacy of a biased postsynaptic 5-HT1A receptor agonist, NLX-101, to rescue stress-induced deficits in cognitive flexibility will be tested. The ASST was successfully optimized and implemented. However, when performing the test with uCMS exposed mice, ASST data did not reveal stress-induced cognitive inflexibility. Instead, uCMS exposed mice presented increased flexibility in the RS domain, when compared to control. Furthermore, similar results were found with uCMS exposed and NLX-101 treated mice. Additionally, analysis of serotonergic innervation of the PrL and OFC revealed no differences among the experimental groups. These results subverted the expectation of decreased cognitive flexibility and reduced innervation in stressed mice, since previous works have found negative differences, albeit with different stressors. This made the search for a positive impact of postsynaptic 5-HT1A receptor activation through NLX-101 possibly impracticable with this stress protocol. In light of these results, subsequent studies should alter the animal model of depression, as the uCMS protocol may have worked as a potential adaptative stimulant instead of conferring debilitation.Perturbação Depressiva Major é uma doença do foro psiquiátrico debilitante, com consequências sociais, emocionais e cognitivas, afetando negativamente o bem-estar de cerca de 17% das sociedades ocidentais. A sua etiopatogenia é veemente associada à exposição a eventos stressantes e, consequentemente, ao aumento dos níveis circulantes de cortisol. Isto interfere significativamente no sistema serotinérgico, incluindo as projeções do núcleo rafe dorsal para sub-regiões do medial prefrontal cortex (mPFC), e mais especificamente o orbitofrontal cortex (OFC) e prelimbic cortex (PrL), sub-regiões responsáveis pela flexibilidade cognitiva – a capacidade de alterar padrões cognitivos pré-concebidos perante uma mudança de contexto. Recentemente, descobriu-se que as projeções serotinérgicas para o OFC eram importantes para a intradimensional rule reversal (RR), e que a atividade no PrL era relevante para a extradimensional rule shift (RS). Notoriamente, levanta-se a hipótese que a ativação do recetor PrL 5-HT1A pode ter um papel importante no RS. Como a inflexibilidade cognitiva é manifestada como repercussão do stress, e é tipicamente observada em doentes depressivos, surge a hipótese de que a ativação do PrL e do respetivo recetor 5-HT1A incremente a inflexibilidade cognitiva no contexto de stress e depressão. Assim, o objetivo deste trabalho é perceber até que ponto este domínio cognitivo é afetado em modelos de depressão de murganhos – o unpredictable chronic mild stress protocol (uCMS) – através da implementação de um teste comportamental, o attentional set shifting test (ASST), para avaliar a flexibilidade cognitiva. Adicionalmente, é testada a eficácia de um agonista enviesado do recetor pós-sináptico 5-HT1A, o NLX-101, com o intuito de recuperar défices na flexibilidade cognitiva induzidos pelo stress. O ASST foi otimizado e implementado com sucesso. No entanto, ao realizar o teste com murganhos expostos ao uCMS, os resultados do ASST não revelaram inflexibilidade cognitiva induzida pelo stress. Pelo contrário, murganhos expostos ao uCMS apresentaram maior flexibilidade no domínio RS, em comparação com o controlo. Além disso, os resultados foram semelhantes nos murganhos expostos ao uCMS e tratados com NLX-101. Adicionalmente, a análise da inervação serotinérgica do PrL e do OFC não revelou diferenças entre os grupos experimentais. Estes resultados contrariam a expectativa de decremento da flexibilidade cognitiva e da inervação em murganhos stressados, identificado em trabalhos anteriores, embora tenham sido usados stressores diferentes. Isto tornou a pesquisa de um impacto positivo pela ativação do recetor pós-sináptico 5-HT1A através do NLX-101 possivelmente impraticável com este protocolo de stress. À vista destes resultados, estudos subsequentes devem alterar o modelo animal de depressão, dado que o protocolo uCMS pode ter funcionado como um estímulo adaptativo em vez de debilitante.Outro - Financiamento recebido pelo Prémio Maria de Sousa, atribuído pela Fundação Bial, juntamente com a Ordem dos Médicos
Explorando Autoencoders Semi-Supervisionados: Uma Abordagem para Classificar Distúrbios Psicóticos através de Dados Proteómicos não Balenceados
No full textDissertação de Mestrado em Engenharia Biomédica apresentada à Faculdade de Ciências e TecnologiaDeep Learning (DL) apresenta um potencial significativo para transformar os cuidados de saúde, através da oferta de um suporte mais aprofundado aos clínicos e melhorando a qualidade do atendimento aos pacientes. No entanto, o desenvolvimento de modelos eficazes de deep learning é desafiante e depende da qualidade, quantidade e formato dos dados. O diagnóstico de perturbações psicóticas pode levar anos, principalmente devido à dependência de entrevistas estruturadas e de avaliações a longo prazo.Esta dissertação analisa um conjunto de dados desbalanceados fornecido pelo Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (CHUC), composto por 78 amostras representando sete perturbações psicóticas distintas, juntamente com um grupo de controlo. O conjunto de dados contém 2302 proteínas quantificadas obtidas através da análise por espectrometria de massa de células mononucleares do sangue periférico, oferecendo uma abordagem mais acessível e económica em comparação com métodos alternativos. Adicionalmente, o conjunto de dados inclui dois conjuntos de rótulos: um do diagnóstico inicial, realizado aquando do primeiro episódio psicótico, e outro obtido após um seguimento de dois anos. A combinação de um elevado número de proteínas quantificadas, do tamanho reduzido da amostra de pacientes, a possível mudança de diagnóstico e a escassa literatura existente apresentam desafios significativos para a análise de dados e desenvolvimento de modelos.Uma abordagem orientada pelos dados determinou a direção desta dissertação, dado que o conjunto de dados era inexplorado, exigindo uma série de tentativas de classificação. Inicialmente, foi realizada uma análise exploratória de dados utilizando técnicas de machine learning (ML), como random forest (RF), support vector machine (SVM) não linear, k-nearest neighbors (KNN) e AdaBoost (AB), utilizadas para classificar perturbações psicóticas em relação aos pacientes de controlo. No entanto, esta abordagem não produziu resultados satisfatórios, levando a uma tentativa com um método não supervisionado. Esta segunda abordagem tinha como objetivo descobrir clusters, independentes dos rótulos atribuídos pelos médicos no diagnóstico após o seguimento de dois anos, utilizando principal component analysis (PCA) e um autoencoder para redução dimensional, seguido de clustering com k-means. Este método também não apresentou resultados promissores, mas o potencial do autoencoder foi explorado mais profundamente.A terceira e principal abordagem implementada foi um autoencoder semi-supervisionado, baseado no modelo desenvolvido por Naranjo-Alcazar et al. Este modelo apresenta um autoencoder modificado combinado com um multilayer perceptron (MLP) para classificar esquizofrenia entre outras perturbações psicóticas, excluindo os controlos saudáveis. A visualização do espaço latente utilizando t-distributed stochastic neighbor embedding (t-SNE) mostrou uma boa separação visual das amostras, mas o desempenho do modelo obteve uma área sob a curva (AUC) de 58% e uma F1-score de 61,1%, indicando baixo sucesso na distinção entre esquizofrenia e outras perturbações psicóticas.Trabalhos futuros devem concentrar-se na aplicação de métodos de explicabilidade para aumentar a confiança dos clínicos, destacando os fatores que influenciam os resultados. Além disso, o software desenvolvido permanecerá disponível para os laboratórios usarem em futuros desenvolvimentos, tendo sido levemente explorada uma opção de low-code para facilitar o uso mais amplo pela comunidade científica.Deep learning (DL) has significant potential to transform healthcare by offering deeper support to clinicians and improving patient care. However, developing effective deep learning models is challenging and largely depends on data quality, quantity, and format. Diagnosing psychotic disorders can take years, primarily due to reliance on structured interviews and long-term assessments.This dissertation analyzes an imbalanced dataset from Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (CHUC), consisting of 78 samples representing seven distinct psychotic disorders, alongside a control group. The dataset contains 2302 protein quantities derived from mass spectrometry (MS) analysis of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), offering a more accessible and cost-effective approach compared to alternative methods. Additionally, the dataset includes two sets of labels: one from the initial diagnosis at the first psychotic episode and another from a 2-year follow-up. The combination of high-dimensional protein features, limited sample size, potential diagnostic shifts, and sparse literature presents significant challenges for both data analysis and model development.A data-driven approach shaped the direction of this dissertation, as the dataset was unexplored, requiring a series of classification attempts. Initially, an exploratory data analysis using machine learning techniques, such as random forest (RF), non-linear support vector machine (SVM), k-nearest neighbours (KNN), and AdaBoost (AB), was applied to classify psychotic disorders from control patients. However, this approach yielded unsatisfactory results, prompting a shift toward an unsupervised method. This second approach aimed to discover latent clusters independent of the physician-assigned labels from the 2-year follow-up diagnosis, using principal component analysis (PCA) and an autoencoder for dimensionality reduction, followed by k-means clustering. This, too, did not show promising results, but the potential of the autoencoder was explored further.The third and main approach implemented was a semi-supervised autoencoder, based on the model developed by Naranjo-Alcazar et al. This model featured a modified autoencoder combined with a multilayer perceptron to classify schizophrenia among other psychotic disorders, excluding healthy controls. Visualization of the latent space using t-distributed stochastic neighbour embedding showed good visual separation of the samples, but the model's performance yielded an area under the curve of 58% and an F1-score of 61.1%, indicating low success in distinguishing schizophrenia from other psychotic disorders.Future work should focus on applying explainability methods to enhance clinician trust by highlighting the factors influencing the results. Additionally, the software developed will remain available for the laboratories to use in future development, with a low-code option slightly explored to facilitate broader use by the scientific community.Outro - This work was financed by the European Regional Development Fund (ERDF) through the COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation and Portuguese national funds via FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., OE FCT/MCTES (PIDDAC) under projects: POCI-01-0145-FEDER-029311, POCI-01-0145-FEDER-007440 (strategic project UID/NEU/04539/2019), POCI-01-0145-FEDER-016428 (ref.: SAICTPAC/0010/2015), and POCI-01-0145-FEDER-016795 (ref.: PTDC/NEU-SCC/7051/2014); POCI-01-0145-FEDER-029311 (ref.: PTDC/BTM-TEC/29311/2017); POCI-01-0145-FEDER-30943 (ref.: PTDC/MEC-PSQ/30943/2017); PTDC/MED-NEU/27946/2017; and by The National Mass Spectrometry Network (RNEM) under the contract POCI-01-0145-FEDER-402-022125 (ref.: ROTEIRO/0028/2013