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Biosurfactants produced by yeasts: fermentation, screening, recovery, purification, characterization, and applications
No full textThe demand for biosurfactants (BS) produced by yeast for use in industrial processes and products is increasing. Therefore, there has been an increase in the number of publications related to characterization of surfactant compounds produced by yeasts generally recognized as safe (GRAS), which has enabled their application in several industries, including the pharmaceutical and food industries. However, some of these studies use techniques that are not accurate or are no longer essential because of advancements in new technologies. Given the industrial importance of yeasts and their potential to produce BS, this study reviews the production of BS by this microorganism and the most recent industrial applications of BS. It also critically reviews a wide range of techniques used in screening of BS-producing strains, as well as those used in recovery, purification, and characterization of these surfactant compounds produced by yeasts. This review introduces diverse methodologies that are indispensable for the study of BS produced by yeast in an effort to advance BS design, synthesis, and application and introduces new perspectives in the research of these compounds to overcome the obstacles present in this field
Phenotyping of upland rice lines in the second crop
No full textArquivo retido, a pedido da autora, até março de 2024.Rice is the third most produced grain in the world and is considered basic food in the diet of more than half of the world's people. Above the current 11 million tons, rice output is predicted to reach 14 million tons in 2030. Technology investments and production diversification, which increase the production system's sustainability, are among the most significant needs for meeting this aim. And one of the strategies to be used is the insertion of the culture in the second crop. Thus, the objective was to evaluate the phenotypic behavior and responsiveness of rice lines subjected to different sowing times in the second crop. Eight elite lines from the uplands Rice Genetic Improvement Program of the Federal University of Lavras (UFLA) - Melhor Arroz, in partnership with Embrapa Arroz e Feijão and Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig) were evaluated. The genotypes were evaluated in four (4) planting seasons, with a 7-day interval, on: January 28, 2022, February 4, 11 and 18, 2022. Each season consisted of 8 genotypes with three repetitions, totaling 24 plots in a randomized block design (DBC). The results indicated that the genotypes CMG ERF 81-2 and CNAx20665-B-6 Trat 81 EO were the earliest, while the genotypes P85-15-CNAx18874-B-5-6 Trat. 17 of Preliminary and NAx20663-B-14 Trat. 78 EO, the later ones. The highest plant height was recorded in
genotype CMG ERF 81-2 in all seasons. The genotypes 1 P 95-8 CNAx18360-B-3-B-B, CNAx20658-B-12 Trat. 73 EO and CMG ERF 81-2 showed higher grain weight in all seasons. Sowing performed in the first season, on January 28 was considered the most suitable date for rice cultivation, considering the average phenotypic performance of the genotypes. Therefore, the plants with early sowing have a better performance compared to those with late sowing.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)O arroz é considerado um alimento base na dieta alimentar de mais da metade da população mundial, sendo o terceiro cereal mais produzido no mundo. Em 2030, a produção de arroz deverá alcançar 14 milhões de toneladas, superando os atuais 11 milhões e, uma das maiores expectativas para suprir essa demanda é o investimento em tecnologias e diversificação da produção, tornando o sistema produtivo mais sustentável. E uma das estratégias a ser utilizada é a inserção da cultura em segunda safra. Foram avaliadas oito linhagens elites provenientes do Programa de Melhoramento Genético de Arroz de terras Altas da Universidade Federal de Lavras (UFLA) – Melhor Arroz, em parceria com a Embrapa Arroz e Feijão e Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig). Os genótipos foram avaliados em quatro (4) épocas de semeadura, com um intervalo de 7 dias, nos dias de: 28 de janeiro de 2022, 4, 11 e 18 de fevereiro de 2022. Cada época foi constituída por 8 genótipos com três repetições, totalizando 24 parcelas em delineamento de blocos casualizados (DBC). Os resultados indicaram que os genótipos CMG ERF 81-2 e CNAx20665-B-6 Trat 81 EO foram os mais precoces, enquanto os genótipos P85-15-CNAx18874-B-5-6 Trat. 17 do Preliminar e NAx20663-B-14 Trat. 78 EO, os mais tardios. A maior altura de plantas foi registrada no genótipo CMG ERF 81-2 em todas as épocas. Os genótipos 1 P 95-8 CNAx18360-B-3-B-B, CNAx20658-B-12 Trat. 73 EO e CMG ERF 81-2 apresentaram maior peso de grãos em todas épocas. A semeadura realizada na primeira época, no dia 28 de janeiro foi considerada a data mais adequada para o cultivo de arroz, considerando o desempenho fenotípico médio dos genótipos. Portanto, as plantas com semeadura precoce possuem um melhor desempenho em
comparação com as de semeadura tardia
Produtividade da água no cultivo de Melissa Officinalis L. irrigada com água tratada magneticamente
Get PDFThe water consumption, leaf dry mass (LDM), essential oil yield (Y), essential oil production (Prod), and water productivity as a function of the LDM and the essential oil production of lemon balm were evaluated. The treatments included 25%, 75%, 100%, and 125% crop evapotranspiration (ETc) replacement by irrigation with untreated water (CW) and magnetically treated water (MTW). Through analysis of variance (F-test), means tests (Scott-Knott), and regression analysis, it was observed significant differences among the water replacement level but not between the water treatment. The contribution of magnetically treated water was not clear from the results obtained. The water productivities as a function of leaf dry mass and essential oil production shows the 75% of ETc quite promising for achieving satisfactory leaf production and efficient oil production relative to the amount of water applied.Avaliou-se o consumo de água, a massa seca de folhas, rendimento de óleo essencial, produção de óleo essencial, e a produtividade da água em relação a massa seca de folhas e em relação a produção de óleo essencial da melissa produzida em vaso em ambiente protegido. Utilizando-se como tratamento a variação na reposição da água evapotranspirada nas proporções de 25%, 75%, 100% e 125% da evapotranspiração da cultura (Etc), aplicada por gotejamento com água sem tratamento (AC) e tratada magneticamente (ATM). Através da análise da variância (Teste F), teste de médias (Scott-Knott) e regressão, observou-se que os tratamentos que receberam 25% da ETc tanto para ATM quanto para AC, apresentaram diferenças significativas, com valores inferiores, em relação aos demais para massa seca de folhas e produção de óleo essencial, e superior, para rendimento do óleo essencial e produtividade da água em relação a produção de óleo essencial. Não foi observado efeito significativo da magnetização da água, e levando em consideração os parâmetros avaliados, o tratamento de 75% da ETc foi o que apresentou melhores resultados, concluindo que as variáveis produtividade da água em relação a produção de massa seca de folhas e em relação a produção de óleo essencial foram influenciadas em função do tipo de água utilizada
Módulo Regularização Ambiental SICAR - vinculação e/ou adição de embargos à proposta de regularização ambiental
Get PDFBR 51 2022 001593 5AD02-Função Adm (Planejamento governamental: estratégico, operacional, técnica de planej., organização administr., organização funcional, organograma, estrutura organizacional, controle administr. - análise de desempenho, avaliação de desempenho);AG02-Ciênc Agrl (agrologia, agronomia, agrostologia, edafologia, pomologia); AG03- Adm Agricl (imóvel rural: fazenda - granja empresa rural); AG11-Ciênc Flor Ciências Florestais (dasonomia, economia florestal, política florestal, produção vegetal, silvicultura; arboricultura-florestamento, reflorestamento, terra marginal); DI03 -Disc Dr. Outras Disciplinas do Direito (disciplinar, previdenciário, ecológico, urbanístico, econômico, financeiro, tributário: cálculo do tributo, evasão tributária, infração tributária, etc; direito processual civil, direito penal, direito processual penal, direito internacional público; direitos do homem ou humanos, litígio internacional; direito privado, direito civil, bens: propriedade pública, privada, patrimônio, semoventes, imóveis, públicos, direito de família, direito das coisas: direito autoral, enfiteuse ou aforamento, laudemio, registro imobiliário; direito sucessório: herança, sucessão, inventário, direito das obrigações: acordo, convênio, contrato, loca ção, arrendamento, fiança, direito agrário; direito do trabalho, direito comercial, direito industrial, direito marítimo, direito aeronáutico, direito internacional privado. GC06-Topografia (topometria, planimetria, altimetria, acidente topográfico, sensoramento remoto ou monitoreamento remoto); GC08-Mapeamento (fotogramia, mapa, carta, fotocarta, mosaico, etc); HD02-Hidrograf (bacia hidrográfica, representativa, área de inundação, curso de água, bacia lacustre, etc); IF02-Documentação (análise da informação, processamento de informação armazenamento, recuperação, disseminação, interc âmbio, bibliofilia, bibliologia, bibliometria); IF07-Ciênc Info (sistema de informação, rede de informação, teoria da informação, fluxo de informação); MA01-Meio Amb (artificial, natural, política do meio ambiente); MA04-Qualid Amb (qualidade da vida, da água, do ar, monitoramento ambiental, engenharia ambiental, de defesa civil)
Social management methodological instruments
No full textArquivo retido, a pedido da autora, até março de 2024.Methodologies such as the Emancipating Participatory Rapid Diagnosis (DRPE), the Altadir Popular Planning Method (MAPP), and the Objective-Oriented Project Planning Method (ZOPP) are references that have a democratic and participatory nature, being relevant to the achievement of the proposed objectives. by Social Management, in its articulation between society, market, and State. However, some methods still need practical validation, through implementation in different contexts and social settings, and others still need to be associated with the potential for the field. Thus, due to the need for a more precise methodological outline for Social Management practices that prioritize participatory methodologies as an alternative, the following research problem was outlined: How can participatory methodological instruments contribute to the epistemological and paradigmatic consolidation of Social Management? The answer to this problem goes towards defining analysis criteria that allow the identification of participatory methods and techniques that theoretically strengthen the Social Management paradigm. This construction will be guided by the analysis criteria of Habermasian deliberative citizenship, the theoretical categories of Social Management, and the characteristics of the public spheres that emerge from the world of life and are capable of influencing the system, that is, State and market. Therefore, the general objective of this work is to identify and analyze the methodological instruments that contribute to the epistemological and paradigmatic construct of Social Management. The specific goals are: a) to identify participatory methods and techniques that present a potential contribution to the epistemological and paradigmatic consolidation of Social Management based on the criteria of deliberative citizenship (discussion process, pluralism, inclusion, participatory equality, autonomy, common good and social control) and other evaluation criteria derived from studies on social management in the Habermasian perspective; b) describe the possible contributions of the previously evaluated methods and techniques for the epistemological and paradigmatic consolidation of Social Management. In methodological terms, the present work consists of a theoretical and qualitative dissertation, with a descriptive character. A systematic review of articles, dissertations, and theses was carried out to search for participatory methods and techniques that approached the criteria predefined. The answer to the research question involved the integrative analysis of the participatory method and its techniques based on the criteria of deliberative citizenship and the theoretical categories of Social Management. It was found that it is necessary to recognize whether the method incorporates communicative action in its processes and whether its sequencing provides for the inclusion of the community in an educational process that continues beyond the moments promoted by the interdisciplinary team. Based on the methodological reference proposed by the integration between the DRPE and MAPP methods, it will be possible to analyze whether a participatory method or technique truly has a driving character of contribution to Social Management, even beyond the Habermasian perspective.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Metodologias como o Diagnóstico Rápido Participativo Emancipador (DRPE), o Método Altadir de Planificação Popular (MAPP) e o Método de Planejamento de Projeto Orientado pelos Objetivos (ZOPP) são referências que apresentam natureza democrática e participativa, sendo relevantes para a consecução dos objetivos propostos pela Gestão Social, na sua articulação entre sociedade, mercado e Estado. No entanto, há métodos que ainda necessitam de validações práticas, por meio da realização em diferentes contextos e configurações sociais, e outras ainda precisam ser associadas como potencialidades para o campo. Dessa forma, mediante a necessidade de um delineamento metodológico mais preciso para as práticas de Gestão Social e que priorizem as metodologias participativas como alternativa, delineou-se o seguinte problema de pesquisa: Como os instrumentos metodológicos participativos podem contribuir para a consolidação epistemológica e paradigmática da Gestão Social? A resposta para esse problema caminha para a definição de critérios de análise que permitam a identificação de métodos e técnicas participativos que fortalecem teoricamente o paradigma da Gestão Social. Essa construção será orientada pelos critérios de análise da cidadania deliberativa habermasiana e pelas categorias teóricas da Gestão Social, bem como pelas características das esferas públicas que emergem do mundo da vida e são capazes de influenciar o sistema, ou seja, Estado e mercado. Logo, o objetivo geral deste trabalho é identificar e analisar os instrumentos metodológicos que contribuem para o construto epistemológico e paradigmático da Gestão Social. Como objetivos específicos têm-se: a) identificar os métodos e técnicas participativos que apresentam potencial contribuição para a consolidação epistemológica e paradigmática da Gestão Social com base nos critérios de cidadania deliberativa (processo de discussão, pluralismo, inclusão, igualdade participativa, autonomia, bem comum e controle social) e em outros critérios de avaliação derivados dos estudos sobre gestão social na perspectiva habermasiana; b) descrever as possíveis contribuições dos métodos e técnicas avaliados anteriormente para a consolidação epistemológica e paradigmática da Gestão Social. Em termos metodológicos, o presente trabalho consiste em uma dissertação teórica e de natureza qualitativa, de caráter descritivo. Realizou-se uma revisão sistemática, em artigos, dissertações e teses para a busca de métodos e técnicas participativos que se aproximavam dos critérios pré-definidos. A resposta para a questão de pesquisa envolveu a análise integrativa do método participativo e suas técnicas a partir dos critérios da cidadania deliberativa e das categorias teóricas da Gestão Social. Constatou-se que é preciso reconhecer se o método incorpora a ação comunicativa em seus processos e se seu sequenciamento prevê a inclusão da comunidade em um processo educativo que têm continuidade além dos momentos promovidos pela equipe interdisciplinar. Com base na referência metodológica proposta pela integração entre os métodos DRPE e MAPP será possível analisar se um método ou técnica participativa possui, verdadeiramente, caráter propulsor de contribuição para a Gestão Social, inclusive para além da perspectiva habermasiana
Espécies de Calonectria associadas a plantações de Eucalyptus no nordeste do Brasil
No full textArquivo retido, a pedido da autora, até março de 2024.In recent decades, commercial Eucalyptus plantations have expanded toward the warm and humid regions of northern and northeastern Brazil, where Calonectria leaf blight (CLB) has become the primary fungal leaf disease of this crop. CLB can be caused by different Calonectria species, and previous studies have indicated that Calonectria might have high species diversity in Brazil. Therefore, this study aimed: 1) to characterize the species of Calonectria associated with Eucalyptus plantations in the Pará and Maranhão states, trough morphological and phylogenetic analyses and to confirm their pathogenicity to Eucalyptus, (2) to determine the genotypic diversity within each Calonectria species, (3) to understand the mating strategy of each Calonectria species and, (4) to determine the species diversity of Calonectria and its distribution in different Eucalyptus plantations. During disease surveys conducted between 2020 and 2021 in commercial plantations of Eucalyptus in northeastern Brazil, diseased leaves from Eucalyptus trees and soil samples were collected, and 206 Calonectria isolates were obtained. A total of eight species of Calonectria were find in association with Eucalyptus plantations, of which two were new to science, C. paragominensis sp. nov. and C. imperata sp. nov. Also, was the first report of C. quinqueramosa and C. amazonica causing leaf blight on E. urophylla trees in northeastern Brazil. The complete species collection was C. imperata with 48.7% of all the isolates, followed by C. amazonica (24.9%), C. ovata (9.1%), C. brasiliensis (6.1%), C. variabilis (4.1%), C. quinqueramosa (3.6%), C. paragominensis (2%), and C. maranhensis (1.5%). The pathogenicity of C. paragominensis, C. imperata and C. quinqueramosa to Eucalyptus was confirmed by fulfilling the Koch’s postulates. Concerning to genetic diversity, C. imperata presented the highest genetic diversity, with 17 genotypes in 96 isolates, followed by C. brasiliensis with 10 genotypes in 12 isolates. Regarding the mating system, MAT1-1-1 and MAT1-2-1 genes amplification showed that C. maranhensis is putative heterothallic, and that the asexual cycle is the main reproductive mode of C. amazonica. The most prevalent species were C. amazonica and C. imperata, found in seven and six plantations, respectively. Our understanding of the species, genetic diversity, distribution, mating strategy, and morphological characteristics of Calonectria in ten commercial Eucalyptus plantations in northeastern Brazil has increased as a result of this study. This knowledge could be used to create an effective management strategy for CLB in Eucalyptus plantations and the breeding of resistant Eucalyptus clones.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Desenvolvimento (CNPq)Nas últimas décadas, as plantações comerciais de Eucalyptus expandiram-se para regiões quentes e úmidas do norte e nordeste do Brasil, nas quais a mancha foliar por Calonectria (CLB) tornou-se a principal doença fúngica foliar dessa cultura. A CLB pode ser causada por diferentes espécies de Calonectria, e estudos prévios indicaram que Calonectria pode ter uma alta diversidade de espécies no Brasil. Portanto, este estudo teve como objetivos: 1) caracterizar as espécies de Calonectria associadas às plantações de Eucalyptus nos estados do Pará e Maranhão, através de análises morfológicas e filogenéticas e confirmar sua patogenicidade ao Eucalyptus, (2) determinar a diversidade genotípica dentro de cada espécie de Calonectria , (3) entender a estratégia reprodutiva de cada espécie de Calonectria e, (4) determinar a diversidade de espécies de Calonectria e sua distribuição em diferentes plantações de Eucalyptus. Durante levantamentos de doenças de campo realizados entre 2020 e 2021 em plantações comerciais de Eucalyptus no nordeste do Brasil, foram coletadas folhas doentes de Eucalyptus e amostras de solo, dos quais foram obtidos 206 isolados de Calonectria. Um total de oito espécies de Calonectria foram encontradas em associação com plantações de Eucalyptus, das quais duas são novas para a ciência, C. paragominensis sp. nov. e C. imperata sp. nov. Além disso, foi o primeiro relato de C. quinqueramosa e C. amazonica causando mancha foliar em árvores de Eucalyptus urophylla no nordeste do Brasil. A coleção completa de espécies foi C. imperata com 48,7% de todos os isolados, seguida por C. amazonica (24,9%), C. ovata (9,1%), C. brasiliensis (6,1%), C. variabilis (4,1%), C. quinqueramosa (3,6%), C. paragominensis (2%) e C. maranhensis (1,5%). A patogenicidade de C. paragominensis, C. imperata e C. quinqueramosa ao Eucalyptus foi confirmada pelo cumprimento dos postulados de Koch. Com relação à diversidade genética, C. imperata apresentou a maior diversidade genética, com 17 genótipos em 96 isolados, seguido por C. brasiliensis com 10 genótipos em 12 isolados. Em relação ao sistema de acasalamento, a amplificação dos genes MAT1-1-1 e MAT1-2-1 mostrou que C. maranhensis é possivelmente heterotálica, e que o ciclo assexual é o principal modo reprodutivo de C. amazonica. As espécies mais prevalentes foram C. amazonica e C. imperata, encontradas em sete e seis plantios, respectivamente. Com esse estudo foi possível compreender melhor as espécies, diversidade genética, distribuição, estratégia de acasalamento e características morfológicas de Calonectria em dez plantações comerciais de Eucalyptus no nordeste do Brasil aumentou como resultado deste estudo. Esse conhecimento pode ser usado para criar uma estratégia de manejo eficaz para CLB em plantações de Eucalyptus e na obtenção de clones de Eucalyptus resistentes
Convolutional neural networks applied to identify cracks in images of eucalyptus logs in the field
No full textWood is a product widely used by human. Most of its stock comes from artificial forest stands promoting various industries such as civil construction and furniture. Although part of the stands presents good performances in terms of production, the sector still deals with material losses due to the projection of cracks in the wood. Efforts to minimize this problem mainly focus on obtaining trees with a genetic constitution that is less prone to cracking. Advances in genetic improvement for this character are reported, above all, for the evaluation methods. Traditional computer vision approaches are an excellent alternative for evaluating cracks. However, its inability to implement it in the field is the main bottleneck of the technique. Based on deep learning, field phenotyping approaches using computer vision show promise for field evaluation tasks. Thus, this work aimed to evaluate the ability of convolutional neural networks to identify cracks in logs from images collected in the field. For this purpose, images were used in the field and a controlled environment. The first group of images underwent class annotation processes (background, log, and crack) to generate masks. In contrast, masks previously made by other works were used for the second group. Synthetic images were generated from the controlled environment images, simulating the field environment from the segmentation and merging of the log-in field photos. In addition, several wood textures were combined to generalize the model. The set of images obtained, both synthetic and field, underwent database expansion processes so that the architectures have enough images for good training. In the end, 2,554 images were obtained, which were divided into sets of exclusive training and validation data in the proportion of 80% and 20% respectively. Three architectures of convolutional neural networks were evaluated, namely U-Net, FPN, and Linkinet. The models generated from the architectures were evaluated, and the best one was selected based on the best averages for insertion over union (IoU). The class estimates of the model chosen were visually compared with the expected masks from a set of 20 images. Finally, the actual and estimated area of the crack was calculated and compared using the chi-square test, coefficient of determination (R2), root mean squared error (RMSE), and the mean percentage absolute error (MAPE). With this work, it is observed that the U-Net model is configured as the best option among the architectures evaluated here for the phenotyping of cracks in logs in the field. The statistical equity of the estimates of the crack area concerning the real area and the speed in obtaining the results encourage its use in crack evaluation tasks in forest improvement programs, even though the model presents difficulties in dealing with small cracks. Future studies may focus on strategies to improve the detection of small cracks.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)A madeira é um produto amplamente utilizado pelo homem. Parte de seu estoque advém de povoamentos florestais artificiais que fomentam setores como o da construção civil e movelaria. Embora parte dos povoamentos apresentem bons desempenhos quanto à produção, o setor ainda lida com perdas de material devido à projeção de rachaduras na madeira. Os esforços para minimizar tal problema concentram-se na obtenção de árvores com constituição genética com menor propensão para rachaduras. Avanços no âmbito de melhoramento genético para tal caráter são relatados para os métodos de avaliação. Abordagens tradicionais de visão computacional se apresentam como uma alternativa para a avaliação de rachaduras. Entretanto, a sua incapacidade de implementação em campo configura-se como o principal gargalo da técnica. Abordagens de fenotipagem em campo usando visão computacional, pautadas em aprendizado profundo, demonstram ser promissoras para tarefas de avaliação em campo. Assim, objetivou-se com esse trabalho avaliar a capacidade das redes neurais convolucionais na identificação de rachaduras em toras a partir de imagens coletadas a campo. Foram usadas imagens em ambiente de campo e em ambiente controlado. O primeiro grupo de imagens passou por processos de anotação das classes (background, tora e rachadura) para a geração de máscaras, enquanto o segundo grupo utilizou-se as máscaras anteriormente feitas por outros trabalhos. A partir das imagens de ambiente controlado foram geradas imagens sintéticas simulando o ambiente de campo, a partir da segmentação e mesclagem da tora em fotos de campo. Além disso, para a generalização do modelo, foram realizadas mesclagem de diversas texturas de madeiras. O conjunto de imagens obtidas, sintéticas e de campo, passaram por processos de ampliação do banco de dados para que as arquiteturas tenham imagens o suficiente para um bom treinamento. Ao final, foram obtidas 2.554 imagens as quais foram divididas em conjunto de dados exclusivos de treino e de validação, na proporção de 80% e 20%, respectivamente. Foram avaliadas três arquiteturas de redes neurais convolucionais, sendo elas a U-Net, FPN e Linkinet. Os modelos gerados a partir das arquiteturas foram avaliados e a seleção do melhor se deu em função das melhores médias para a inserção sobre união (IoU). As estimativas das classes do modelo selecionado foram comparadas visualmente com as máscaras esperadas a partir de um conjunto de 20 imagens. Por fim, foram calculadas a área real e estimada da rachadura as quais foram comparadas via teste qui quadrado, coeficiente de determinação (R2), Raiz do erro quadrático médio (RMSE) e o Erro absoluto médio percentual (MAPE). Com esse trabalho, observa-se que o modelo U-Net se configura como a melhor opção dentre as arquiteturas aqui avaliadas para a fenotipagem de rachaduras de toras em campo. A equidade estatística das estimativas da área das rachaduras em relação à área real aliados com a rapidez em se obter os resultados estimulam o seu emprego em tarefas de avaliação de rachaduras em programas de melhoramento florestal, ainda que o modelo apresente dificuldade ao lidar com pequenas rachaduras. Estudos futuros podem focar em estratégias que visem a melhoria de detecção das pequenas rachaduras
Prospecting chitinase coding transcripts in leaf-cutting ant Atta sexdens RNA-Seq data
No full textThe leaf-cutting ant Atta sexdens is widely distributed in Brazil and is considered an important insect pest of several crops due to its intense foraging activity on fresh plant material. The intense defoliation performed by ants takes place to grow the symbiotic fungus (Leucoagaricus gongylophorus) on which ants feed. Although much is known about the ants bioecology, there are still few studies to validate the gene function of protein families that play important roles in the development of leaf-cutting ants, since little molecular data is currently available for these species. This work aimed to obtain the leaf-cutting ant A. sexdens transcriptome by RNA sequencing of five biological samples (whole larva, larval gut, whole foraging ant, head, and gut of foraging ant), aiming to identify sequences encoding chitinases – enzymes involved in the degradation route of chitin, a vital polysaccharide for building extracellular matrices and for accomplishing other functions in insects. After sequencing, de novo assembly of the transcripts was performed using the Trinity tool. The prediction of Open Reading Frames occurred from similarity data and identification of protein domains, with identification of 45,253 protein-coding sequences. Of this total, 36,639 sequences had at least one domain deposited in the Pfam database, and it was possible to annotate 24,392 sequences containing direct orthologs in databases available in eggNOG. In general, the transcripts present in larger quantities in A. sexdens transcriptome fell into the category signal transduction mechanisms. From the phylogenetic analysis, twenty-three sequences encoding chitinases were identified, divided into eleven groups of chitinases commonly found in insects, of which fifteen presented all the expected domains. Therefore, with the in silico identification of potencial candidates for chitinases in the A. sexdens transcriptome it will be possible to expand molecular and physiological knowledge about the species and contribute to further studies aimed at elucidating the role of these enzymes in the development of leaf-cutting ants.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)A formiga cortadeira Atta sexdens apresenta ampla distribuição no Brasil e é considerada um importante inseto-praga de diversas culturas agrícolas devido à sua intensa atividade de forrageio de material vegetal fresco. A intensa desfolhação dessas formigas ocorre em virtude da necessidade de fornecerem alimentos para cultivo do fungo (Leucoagaricus gongylophorus) com o qual vivem em simbiose e do qual também se alimentam. Embora muito se saiba sobre a bioecologia destes insetos, ainda são poucos os estudos de validação da função gênica de famílias proteicas que desempenham funções importantes no desenvolvimento das formigas cortadeiras, uma vez que são quase inexistentes os dados moleculares disponíveis para estas espécies. O objetivo deste trabalho consistiu em obter o transcritoma da formiga cortadeira A. sexdens proveniente do sequenciamento de RNA de cinco amostras biológicas (larva inteira, intestino de larva, formiga forrageadora inteira, cabeça e intestino de formiga forrageadora), visando identificar transcritos codificadores de quitinases, que são enzimas envolvidas na rota de degradação da quitina - um importante polissacarídeo componente de matrizes extracelulares e que desempenha diversas funções nos insetos. A partir dos dados brutos do sequenciamento das amostras foi conduzida análise de qualidade e, posteriormente, as leituras processadas foram utilizadas na montagem de novo do transcritoma por meio da ferramenta Trinity. A predição de ORFs (do inglês - Open Reading Frames) ocorreu a partir de dados de similaridade e identificação de domínios proteicos, com identificação de 45.253 sequências candidatas a transcritos codificadores. Deste total, 36.639 sequências apresentaram ao menos um domínio depositado no banco de dados Pfam, sendo que foi possível anotar 24.392 sequências contendo ortólogos diretos nos bancos de dados disponíveis no eggNOG. De maneira geral, os transcritos presentes em maior quantidade no transcritoma de A. sexdens se enquadraram na categoria de mecanismos de transdução de sinais. Após a análise filogenética foram identificados 23 transcritos codificadores de quitinases, divididos em 11 grupos de quitinases comumente encontradas em insetos. De modo geral, quinze das quitinases identificadas em A. sexdens apresentaram todos os domínios esperados. Portanto, com a identificação in silico de potenciais candidatas a quitinases no transcritoma de A. sexdens será possível ampliar o conhecimento molecular e fisiológico acerca da espécie e contribuir com estudos posteriores que visem elucidar o papel destas enzimas no desenvolvimento da formiga cortadeira Atta sexdens
Características de propriedades leiteiras com diferentes níveis de eficiência técnica
Get PDFDairy farming is essential for Brazilian agriculture and, especially, for the Minas Gerais State. The understanding of technical efficiency and its impacts on the economic performance of dairy farms contributes to the development of the milk production chain. In the context of organizations, the Firm Theory helps in understanding how production factors affect the economic performance of these organizations, which are little studied in dairy farming. The objective of this study was to identify the main characteristics that differentiate dairy farms in the state of Minas Gerais, Brazil. For this purpose, dairy farms with different levels of efficiency (high, medium and low) were compared using data envelopment analysis (DEA), descriptive statistics and mean difference tests, analyzing socioeconomic, cost and economic performance variables. To increase the technical efficiency of dairy farms, it is important to reduce the total operating cost (TOC) and effective operating cost (EOC) by optimizing their components. However, spending on feeding (concentrated) and electricity should be increased so that the analyzed dairy farms become more efficient. In addition, the increase in the technification of dairy farms must happen, but always with caution, so that depreciation costs do not rise disproportionately. This research contributes to the advancement of scientific knowledge by applying the assumptions of the Firm Theory to dairy farming, an incipient topic in the literature. For rural producers, this research can be especially useful when presenting efficiency indicators and parameters for dairy farms, such as food costs, which must be more than 60% of the EOC.A pecuária leiteira é essencial para a agropecuária brasileira e, principalmente, para o estado de Minas Gerais. A eficiência técnica e seus impactos no desempenho econômico das propriedades leiteiras contribuem para o desenvolvimento da cadeia produtiva do leite. A Teoria da Firma auxilia no entendimento de como os fatores de produção afetam o desempenho econômico dessas organizações, pouco estudada na pecuária leiteira. O objetivo deste estudo foi identificar as principais características que diferenciam as propriedades leiteiras do Estado de Minas Gerais, Brasil. Para tanto, propriedades leiteiras com diferentes níveis de eficiência (alta, média e baixa) foram comparadas por meio de Análise Envoltória de Dados (DEA), estatística descritiva e testes de diferença de médias, sendo analisadas variáveis socioeconômicas, de custos e de desempenho econômico. Para aumentar a eficiência técnica de propriedades leiteiras, é importante reduzir o custo operacional total (COT) e o custo operacional efetivo (COE) otimizando seus componentes. No entanto, os gastos com alimentação (concentrada) e energia elétrica devem ser aumentados para que as propriedades leiteiras analisadas se tornem mais eficientes. Além disso, o aumento da tecnificação de propriedades leiteiras deve acontecer, mas sempre com cautela, para que os custos com depreciação não se elevem desproporcionalmente. Esta pesquisa contribui para o avanço do conhecimento científico ao aplicar os pressupostos da Teoria da Firma à pecuária leiteira, tema incipiente na literatura. Para produtores rurais, esta pesquisa pode ser especialmente útil ao apresentar indicadores e parâmetros de eficiência de propriedades leiteiras, caso dos custos com alimentação, que devem ser mais de 60% do COE
Cryopreservation of axillary buds and biochemical analysis of Passiflora gibertii
No full textThe Passiflora genus encompasses over 600 plant species worldwide, with high commercial
potential for fruit production, ornamentation, and medicinal purposes. The diversity and
intrinsic characteristics of Passiflora, such as seed dormancy and cross-fertilization, may
require specific storage conditions and special care to maintain viability and genetic integrity
over time, posing challenges in germplasm fields, a traditional conservation method.
Cryopreservation is described as an increasingly established practice, offering an alternative
for species conservation with advantages like space efficiency, low maintenance, and
pathogen-free preservation. This study aimed to promote and assess the cryopreservation of
axillary buds as explants from Passiflora gibertii plants in Murashige and Skoog (MS) standard
culture medium supplemented with 6-benzylaminopurine (BAP) and sucrose. The
cryopreservation technique employed was droplet vitrification. Beforehand, the explants
underwent pre-treatment in a culture medium with a high sucrose concentration for 24 hours.
Subsequently, they were subjected to Loading Solution (LS) for 30 minutes for dehydration.
Aluminum strips were prepared at 0°C, and Vitrification Solution (VSL) drops were applied. The
treatments were immersed in liquid nitrogen (LN) inside cryotubes for an hour. The re-
warming process used Recovery Solution (RS) for 30 minutes. In the subsequent stage,
explants were rehydrated in post-treatment medium with a high sucrose concentration for 24
hours. After this period, segments were transferred to a regeneration medium (MS + BAP) to
assess survival rates. The treatment with the highest survival rate was 66.7%, achieved with a
45-minute exposure to VSL. Explant sections were made for qualitative anatomical evaluation.
Surviving buds from the best treatment and dead buds were preserved, embedded, and
analyzed under a microscope for comparison. Cells with ruptured membranes and cellular
content leakage were prominently observed in dead buds, indicating that even with droplet
vitrification, crystallization occurs in a significant portion of the explants. Biochemical analyses,
covering various parameters such as sugars, antioxidant enzymes, and lipid peroxidation, were
performed on cryopreserved explants compared to non-cryopreserved controls, both during
cryopreservation and rooting, investigating physiology, antioxidants, and osmoregulation. In
the cryopreservation process, exposure to the solution induced stress in the buds, reflected by
a significant increase in malondialdehyde (MDA). High levels of MDA, combined with a
reduction in protective antioxidants, indicated cell death. However, the application of VSL
allowed survival and stimulated regeneration, evidenced by increased soluble sugars and
hydrogen peroxide. Rooting differed between species, with Passiflora gibertii facing
difficulties, while Passiflora alata demonstrated greater efficiency, supported by biochemical
distinctions between rooted and non-rooted explants.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)O gênero Passiflora compreende mais de 600 espécies de plantas espalhadas pelo mundo,
apresentando alto potencial comercial para a produção de frutos, ornamentação e fins
medicinais. A diversidade de espécies do gênero e características intrínsecas a estas, como
dormência de sementes e fecundação cruzada, podem exigir condições específicas de
armazenamento e cuidados especiais para manter sua viabilidade e integridade genética ao
longo do tempo apresentando dificuldades em sua manutenção nos campos de germoplasma,
que é uma maneira tradicional de conservação. A criopreservação é descrita como uma prática
cada vez mais consolidada, sendo uma alternativa para a conservação das espécies e
apresentando vantagens como a capacidade de manter o material conservado em pouco
espaço, baixa necessidade de manutenção e livre de patógenos. Assim, o presente trabalho
teve como objetivo promover e avaliar a criopreservação de gemas axilares como explantes de
plantas da espécie Passiflora gibertii em meio de cultura do tipo Murashige e Skoog (MS)
padrão acrescido de 6-benzilaminopurina (BAP) e sacarose. A técnica criopreservadora
empregada foi a droplet vitrification. Antes disso, os explantes passaram por um pré-
tratamento em meio de cultura contendo alta concentração de sacarose por 24 horas. Em
seguida, foram submetidos à solução LS (Loading Solution) por 30 minutos para desidratação.
As tiras de alumínio foram preparadas a uma temperatura de 0°C e sobre elas foram aplicadas
gotas da solução de vitrificação VSL (Vitrification Solution L). Os tratamentos foram imersos em
nitrogênio líquido (NL) dentro de criotubos por uma hora. O processo de reaquecimento foi
realizado utilizando a solução RS (Recovery Solution) por um período de 30 minutos. Na etapa
subsequente, os explantes foram reidratados em meio de pós-tratamento contendo alta
concentração de sacarose, durante 24 horas. Após esse período, os segmentos foram
transferidos para um meio de regeneração (MS + BAP) para avaliar a taxa de sobrevivência. O
tratamento que apresentou a maior taxa de sobrevivência foi de 66,7% e ocorreu com uma
exposição de 45 minutos à solução VSL. Cortes dos explantes foram feitos para a avaliação
anatômica qualitativa, gemas sobreviventes do melhor tratamento e gemas mortas foram
conservadas, emblocadas e analisadas em microscópio para comparação. Células rompidas
com extravasamento de conteúdo celular foram observadas com bastante expressão em
gemas mortas, indicando que mesmo utilizando a técnica de droplet vitrification, a
cristalização ocorre em grande parte dos explantes. As análises bioquímicas, abrangendo
diversos parâmetros como açúcares, enzimas antioxidantes e peroxidação lipídica, foram
realizadas em explantes criopreservados em comparação ao controle não criopreservado e
durante o enraizamento, investigando fisiologia, antioxidantes e osmorregulação. No processo
de criopreservação, a exposição à solução gerou estresse nas gemas, refletido pelo aumento
de MDA. Altos níveis de MDA, combinados com a redução de antioxidantes protetores,
indicaram à morte celular, enquanto a aplicação de VSL permitiu a sobrevivência e estimulou a
regeneração, evidenciada pelo aumento de açúcares solúveis e peróxido de hidrogênio. O
enraizamento diferiu entre as espécies, com Passiflora gibertii apresentando dificuldades,
enquanto Passiflora alata demonstrou maior eficiência, com distinções nos marcadores
bioquímicos entre explantes enraizados e não enraizados