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The morphology of reduplication in japanese ideophones
No full textCette recherche vise à explorer les idéophones, qui relèvent du symbolisme sonore et constituent une part significative de l’inventaire lexical du japonais. Alors qu’il a été considéré que les idéophones possèdent peu de morphologie (Childs, 1995), je montre que les idéophones japonais sont morphosyntaxiquement complexes, et je propose strictement une analyse selon une approche du type Item-and-Arrangement de la morphologie. Le but ultime de cette étude est d’identifier les propriétés morphosyntaxiques de la réduplication des idéophones du japonais standard. Pour y parvenir, la recherche vise également à identifier les composants morphologiques, à proposer leurs fonctions morphosyntaxiques et sémantiques, ainsi qu’à comparer les structures internes des idéophones avec celles des quasi-idéophones. En limitant les objets d’analyse aux bases bimoraïques, l’étude s’appuie à la fois sur des jugements grammaticaux de locuteurs natifs et sur une revue de la littérature.
L’analyse est fomulé dans le cadre de la Morphologie Distribuée (Halle & Marantz, 1993, 1994), en particulier sur l’hypothèse de Category-neutral root (Chomsky, 1970; Marantz,1997). Je propose que les idéophones japonais sont composés de multiples morphèmes, dont un morphème réduplicatif et des morphèmes tonals, organisés de manière concaténative. Le morphème réduplicatif, RED, est une tête aspectuelle imperfective avec une sémantique d’extention : il projette un sens duratif en s’attachant directement à la racine idéophonique, et un sens itérative lorsqu’il s’attache à la base adverbiale. Quant aux têtes catégorielles, outre les suffixes idéophoniques (-Q, -N, -ri) qui projettent la catégorie adverbiale, les morphèmes tonals HL et LH projettent les catégories adverbiale et adjectivale, respectivement. Je propose également que la structure des idéophones adjectivaux est distincte de celle des quasi-idéophones, malgré leur ressemblance formelle en surface: tandis que les idéophones sont dérivés des bases catégorielles neutres, les quasi-idéophones sont dérivés de noms, catégorisés par une tête fonctionnelle [n.-ø]. Ainsi, bien que la ressemblance tonale entre ces deux types d’idéophones découle d’une même réalisation phonologique de la tête adjectivale, leurs composants internes et le rôle sémantique du redupliquant diffèrent.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : idéophones, redoublement, japonais, morphologie, syntaxe, morphologie concaténative, morphèmes tonal
Dynamique de l'aléa torrentiel au long de la rivière Chaudière : analyse historique et modélisation
Get PDFDans le bassin-versant de la rivière Chaudière, les inondations sont partie intégrante de la réalité territoriale. En effet, de nombreuses études ont été réalisées dans les dernières années concernant les inondations en eau libre et par embâcle. Néanmoins, on observe que les inondations torrentielles, ou crues torrentielles, bien qu’omniprésentes dans la région, sont très peu documentées à ce jour. Le présent mémoire s’intéresse à la dynamique spatio-temporelle de ces évènements et aux facteurs aggravants présents sur le territoire qui tendent à amplifier le phénomène. Par une double approche qualitative et quantitative, qui combine une recension historique, la caractérisation des sous-bassins-versants et la modélisation des facteurs de vulnérabilité environnementale, nous avons dressé un premier portrait de l’aléa torrentiel à l’échelle du bassin-versant de la rivière Chaudière. Ainsi, nous avons pu répertorier 53 évènements à caractère torrentiel pour la période de 1900 à aujourd’hui. La collecte des informations liées aux crues torrentielles, soit les facteurs météorologiques, anthropiques et géomorphologiques ont permis d’établir des constats généraux quant à l’occurrence de celles-ci. L’occurrence des évènements à caractère torrentiel semble premièrement liée aux passages d’évènements météorologiques extrêmes. Les facteurs aggravants consistent en un aménagement du territoire qui accroît le ruissellement (augmentation des surfaces minéralisées et diminution des forêts, prairies et milieux humides) et une disposition géomorphologique des tributaires (forte pente et compacité) qui provoque une amplification du ruissellement lors de fortes précipitations. L’analyse multicritère repose sur l’addition d’indices amplifiant le ruissellement lors de fortes précipitations (pente, occupation du sol et potentiel de ruissellement). La comparaison entre les sous-bassins-versants présentant les valeurs les plus élevées et ceux ayant connu le plus d'événements d'inondation selon la recension historique a démontré la pertinence de cette méthode pour identifier, de manière préliminaire, les sous-bassins-versants potentiellement vulnérables à l’aléa torrentiel. Cette étude se veut donc un premier jalon dans l’acquisition de connaissances sur la dynamique torrentielle dans le bassin-versant de la rivière Chaudière.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : inondation, torrents, crues torrentielles, pluies torrentielles, aléas torrentiels, bassin-versant de la rivière Chaudière, facteurs aggravants, conditions hydrométéorologique
Les installations olympiques de Montréal : histoire d'un espace politisé
Get PDFCette recherche a pour objectif de mettre en lumière le processus politique ayant façonné le développement des installations du Parc olympique de Montréal entre 1976 et 2022. Plus largement, elle cherche à analyser la politique québécoise à travers cet enjeu majeur. Pendant presque cinq décennies, l’évolution de ces infrastructures a été minutieusement scrutée, révélant les diverses visions des acteurs impliqués. L’hypothèse avancée est que la politisation, amorcée lors de la phase préolympique des Jeux d’été de 1976, s’est intensifiée par la suite. Les installations olympiques ont ainsi été au centre d’un débat politique fortement médiatisé après les Jeux. Ce mémoire examine divers sujets choisis en fonction de l’intérêt des parties prenantes. Les enjeux tels que le sport amateur, les considérations démocratiques de la RIO, la question du logement à Montréal, le virage controversé vers la rentabilité et la vocation récréotouristique du Parc ont tous joué un rôle central dans son développement. Afin d’analyser le discours médiatique, ainsi que les opinions citoyennes et celles des organismes communautaires et publics concernant le développement des installations olympiques, une grande quantité d’archives de journaux et de caricatures a été examinée. Les sources ont été recoupées avec des documents officiels, tels que des rapports annuels de la RIO, les Rapports du Comité-conseil Marsan, de la Commission d’enquête Malouf et du Comité-conseil Bissonnette. Cette méthode offre une vue d’ensemble et représentative des différents points de vue qui ont façonné le champ politique. L’objectif principal est de dresser un tableau exhaustif des débats marquant l’évolution du Parc, en mettant en lumière les moments saillants. Cette recherche a permis de dégager plusieurs conclusions significatives. Premièrement, les principes démocratiques de la RIO ont souvent été remis en question. Deuxièmement, l’analyse du processus politique a révélé que la coopération entre les différents niveaux de gouvernement a été inconstante, bien qu’évolutive. Troisièmement, les citoyens et les organismes communautaires ont parfois été marginalisés dans le processus politique, jouant un rôle tantôt discret, tantôt bruyant selon les décisions les concernant. Finalement, en 1977, le premier comité d’experts, le Comité-conseil Marsan, a proposé des idées avant-gardistes qui ont été partiellement reprises en 2012.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Montréal, installations olympiques, l’après-Jeux, histoire politique, médiatisatio
To crip or not to crip - Les théories critiques du handicap pour (dé)construire l'identité diabétique
Get PDFÀ partir d’une perspective crip et intersectionnelle, et en adoptant une méthodologie basée sur une approche autoethnographique en dialogue avec des entretiens semi-structurés, ce mémoire propose de transposer le concept de « capacitisme » à l’analyse de l’identité diabétique. Je souhaite apporter un nouvel éclairage aux débats dans le domaine des études critiques du handicap (critical disability studies) qui, trop souvent, tend à évacuer la question des maladies chroniques – en posant la question suivante : comment les diabétiques conçoivent-iels leur rapport au handicap et à l’identité diabétique? Je réponds à cette question à travers six chapitres qui intègrent théorie et expérience et suppose que cripper l’identité diabétique a le potentiel d’initier une première réflexion critique et intersectionnelle du diabète dans un contexte francophone.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : théories crip, handicap, diabète, capacitisme, intersectionnalit
Rapport au travail et rapport au religieux : le cas de personnes musulmanes entrepreneures au Québec
Get PDFLe travail et les convictions d’ordre moral sont des éléments structurants de l’individu et de la vie en collectivité. Le travail permet notamment la quête de subsistance ou de richesse, les convictions d’ordre moral permettent aussi d’évaluer ses actions en termes de bien ou de mal. Cette thèse est construite autour de l’articulation entre le rapport au religieux et le rapport au travail, en ayant pour but de comprendre les tensions réelles ou supposées entre ces deux rapports, précisément chez des individus musulmans au Québec. Pour mieux répondre à cet objectif de recherche sociologique inscrite dans une approche qualitative, le terrain est constitué de vingt-neuf personnes. Ce terrain est composé d’hommes et de femmes, de différentes tranches d’âge, de plusieurs origines ethniques et culturelles, qui exercent dans divers secteurs d’activités, et se déclarant toutes et tous d’appartenance à la religion musulmane au sens cultuel du terme. Afin d’observer un rapport au travail inscrit dans une plus grande autonomie décisionnelle, ces personnes exerçaient leurs activités professionnelles sous le statut d’entrepreneuriat. La principale question de recherche consiste à examiner comment sont articulés le rapport au religieux et le rapport au travail des personnes musulmanes entrepreneures au Québec? Pour atteindre l’objectif de la recherche et répondre à cette question et les questions spécifiques qui en découlent, la revue de littérature sur laquelle s’est adossé ce travail a été élargie, sur les plans disciplinaires et culturels, afin de faire dialoguer des travaux et des perspectives d’origines arabo-musulmane et occidentale. Ainsi, la conception du travail, de la place de la religion, du rapport à l’argent et du rapport aux autres, tels que présentés par des figures de la discipline sociologique d’Occident, comme Max Weber, et du monde arabo-musulman, comme Ibn Khaldun, ont permis d’examiner les perceptions des logiques et des différentes formes de rationalités (occidentale et/ou de pensée islamique) mises en oeuvre par les personnes interrogées. Il s’agit, dans un premier temps, de comprendre les dimensions religieuses exprimées, leurs manifestations pratiques et leurs influences potentielles ou avérées sur le rapport au travail, et à l’inverse, de comprendre les choix professionnels au travail sur le plan entrepreneurial et l’évolution dans l’univers des affaires et les possibles influences sur le rapport au religieux. Ce qui, dans un deuxième temps, a conduit à documenter et analyser les différents arrangements et stratégies individuels d’accommodements entre ces deux rapports. C’est la conjugaison de ces deux dynamiques qui a guidé l’enquête de terrain, notamment les phases d’observation des milieux de vie et de travail et les vingt-neuf entrevues semi-dirigées qui l’ont jalonnée. Il en ressort que les rationalités en jeu des personnes participantes sont des rationalités qui s’inscrivent dans un modèle économique capitaliste de la société québécoise et avec la considération de leur appartenance à la religion musulmane auto-déclarée. Autrement dit, les personnes participantes sont dans une démarche de quête du profit sur le plan économique et dans une évaluation axiologique de cette démarche sur le plan religieux. Ces rationalités ont mené les entrepreneurs musulmans à adopter différentes stratégies, à structurer plusieurs arrangements et à poser diverses actions dans la manière de gérer au quotidien leur rapport au religieux et leur rapport au travail. Ainsi, ces entrepreneurs musulmans prennent des décisions qui concilient leur conception du travail et leur conception de la religion musulmane. Leurs actions sont induites par des considérations religieuses et économiques, induites par des motivations professionnelles et personnelles, induites par des conceptions des causes et de leurs effets potentiels, induites par des rapports à l’argent et par des rapports aux autres. Ces actions s’articulent, en définitive, autour de la prière durant le temps de travail, des financements des activités professionnelles avec la considération de l’interdiction religieuse des emprunts avec intérêts, du développement de relations d’affaires en fonction du rapport au religieux, de la quête de rentabilité sous certaines exigences religieuses, et d’une mise en lien de la trajectoire professionnelle et de la trajectoire religieuse. La pluralité des rapports au religieux et des rapports au travail des personnes entrepreneures musulmanes est effective dans l’échantillon de cette recherche. L’analyse des données a permis de faire émerger les théories des participantes et participants à la recherche et a permis de cerner cinq types-théoriques de comportements des personnes entrepreneures musulmanes établies au Québec. Ainsi, l’articulation de leur rapport au travail et leur rapport au religieux peut s’inscrire dans : une primauté du rapport au travail sur le rapport au religieux ; une dissociation entre ces deux rapports ; une mise en lien entre les deux rapports ; ou encore par une veille au respect de leur rapport au religieux, même si cela peut avoir une incidence sur leur rentabilité au sens capitaliste du terme ; et finalement une recherche de ce qu’elles ont nommé la Baraka.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Travail ; Islam ; Entrepreneuriat ; Musulman ; Religio
Les représentations de l'hystérie dans quatre films de fiction français et québécois du XXIe siècle : regards féminins sur des femmes psychiatrisées
Get PDFCe mémoire de recherche s’intéresse aux représentations des femmes « hystériques » dans quatre films de fiction français et québécois du XXIe siècle : Ma vie en cinémascope (2004) de Denise Filiatrault, Augustine (2012) d’Alice Winocour, Nelly (2016) d’Anne Émond et Le Bal des folles (2021) de Mélanie Laurent. Historiquement utilisé en psychiatrie pour désigner un ensemble de symptômes et de comportements ne pouvant être expliqués par des causes médicales évidentes, le terme « hystérie » a longtemps été attribué au sexe féminin. L'imaginaire collectif de cette pathologie, devenue obsolète dans la pratique médicale moderne, continue toutefois d'influencer les pratiques artistiques contemporaines, notamment au 7ème art. Sa mise en images a contribué à véhiculer une vision péjorative des femmes psychiatrisées, les enfermant dans un statut de « pauvres folles ». Située au croisement des études cinématographiques et des études féministes, la présente recherche examine la manière dont quatre réalisatrices, de par leur regard féminin, favorisent la reconstruction du sujet « hystérique ». En adoptant une approche intersectionnelle, elle propose une nouvelle forme de regard cinématographique : le hysterical gaze. Cette proposition conceptuelle part de l’idée selon laquelle le diagnostic de l’hystérie, historiquement lié aux femmes, imbrique à la fois les stéréotypes de genre et ceux associés à la folie. En dénaturalisant ces stéréotypes, le hysterical gaze vise à déployer une lecture contre-hégémonique des protagonistes « hystériques ». Les personnages d’Alys Robi, Louise Augustine Gleizes, Nelly Arcan et Eugénie Cléry font l’objet de nos analyses.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : cinéma, féminisme, gaze, hystérie, réalisatrices, représentations, sanisme, sexism
Caractéristiques distinctives de la supervision dans le contexte des thérapies du fonctionnement traumatique : une analyse thématique du point de vue des supervisés et superviseurs
Get PDFLes demandes d’aide psychothérapeutique à la suite d’un traumatisme sont de plus en plus fréquentes étant donné l’état de désorganisation du fonctionnement qu’il engendre. Dans une perspective psychanalytique, on utilise le terme de « fonctionnement traumatique » pour parler de ce genre d'organisation mentale marquée par le traumatisme. De nombreux psychothérapeutes entreprennent d’en faire une spécialité. Toutefois, les thérapies du fonctionnement traumatique (TFT) sont reconnues pour poser des défis substantiels et placer le psychothérapeute à risque d’effets néfastes potentiels, dont le traumatisme vicariant (TV). Pour faire face à ces importantes difficultés et aux risques qui en découlent, il est habituellement préconisé de s’engager dans un processus de supervision. Il demeure néanmoins incertain si la supervision doit prendre une forme particulière pour réellement aider le psychothérapeute exerçant dans ce type de clinique. Très peu d'études ont porté sur les spécificités de la supervision psychodynamique des thérapies du fonctionnement traumatique (STFT). Ce faisant, cette thèse vise à identifier et à décrire les spécificités de la supervision psychodynamique des thérapies du fonctionnement traumatique (objectif #1) ainsi qu’à obtenir le point de vue de psychothérapeutes novices pour tenter de déterminer les éléments qu’ils jugent aidant de ce type de supervision (objectif #2). Parallèlement, la thèse a pour objectif d’explorer la manière dont les participants conçoivent que la STFT puisse prévenir – ou minimalement amoindrir – les effets négatifs des thérapies du fonctionnement traumatique sur le psychothérapeute supervisé (objectif #3). Afin de répondre aux objectifs de recherche, une méthodologie qualitative fut choisie étant donné l’importance qu’elle accorde à la subjectivité du participant. Deux séries d’entretiens semi-structurés furent effectuées. Dans un premier temps avec des superviseurs (6) possédant une vaste expérience en STFT (M = 25,8 7,2 années). Une deuxième ronde d'entrevue fut ensuite réalisée auprès de supervisés novices (7) possédant en moyenne 3,5 années d’expérience (É.-T. = 2,2 années) et travaillant majoritairement auprès de personnes présentant un fonctionnement traumatique. Les deux articles qui composent cette thèse sont divisés entre les participants superviseurs et les participants supervisés respectivement. Ils permettent de présenter les résultats obtenus à la suite des analyses thématiques des entretiens. Le premier met l’accent sur l'identification des éléments distinctifs de la STFT selon l’avis des participants superviseurs très expérimentés. Les résultats indiquent que les défis de la supervision découlent directement des caractéristiques du fonctionnement traumatique, notamment leur rapport interpersonnel teinté de destructivité et les récits horrifiants auxquels sont soumis les psychothérapeutes. Les résultats mettent également à l’avant-plan l’attention particulière que les participants superviseurs accordent à l’état affectif de leur supervisé. Cette attention s’exprime par un soutien marqué à l’élaboration du contre-transfert négatif, à maintenir la distinction entre la thérapie personnelle et la supervision ainsi qu’en favorisant le développement d’une posture propre à recevoir le trauma de la personne. Le deuxième article se penche sur la perception des participants supervisés novices quant à ce qui leur apparait être aidant dans leur expérience de la STFT. L’étude suggère l’existence d’un principe organisateur de l’expérience des participants soit l’intensité de la relation transférentielle auquel doit répondre la supervision. Les résultats soulignent l’importance d’un climat de confiance, de l’élaboration du contre-transfert ainsi que le rôle de la supervision dans la prévention des effets néfastes des thérapies des traumatismes. L’étude met aussi en lumière les limites de la supervision et les moyens disponibles aux psychothérapeutes pour appuyer la supervision. La discussion générale et la conclusion de cette thèse résument les éléments centraux de nos résultats desquels découlent des recommandations pour l’amélioration de la pratique de la STFT pour les superviseurs, les supervisés et les milieux universitaires. Finalement, nous témoignons des apports et des limites du projet, en plus de proposer des pistes pour des recherches futures.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Supervision psychodynamique, Thérapies du fonctionnement traumatique, Superviseurs, Supervisés novices, Trouble de stress post-traumatiqu
Mapping the antibody combining site of tumor-associated carbohydrate antigen
Get PDFLes antigènes associés aux tumeurs (TACAs) constituent un groupe fascinant de néo-antigènes, décorant exclusivement les surfaces de diverses cellules cancéreuses. Cette caractéristique distinctive ne fait pas seulement la distinction entre les cellules cancéreuses et saines, mais souligne également leur potentiel en tant que cibles clés pour des traitements innovants du cancer, promettant d'ouvrir une ère transformative en immunothérapie anticancéreuse. Au sein du répertoire diversifié des TACAs, les antigènes Thomsen-Friedenreich (TF) et Tn émergent comme des marqueurs pancarcinomes prééminents, largement répandus dans divers cancers, dont le cancer du sein. L'ubiquité des antigènes TF et Tn est sous-tendue par des altérations complexes dans les schémas de glycosylation des glycoprotéines de mucine au sein des cellules malignes. Plus précisément, l'antigène TF, caractérisé par le disaccharide Galβ1-3GalNAc-α-OR, et l'antigène Tn, portant le monosaccharide GalNAc-α-OR, sont des marques de glycosylation aberrante, conférant une signature moléculaire distincte aux cellules cancéreuses, facilitant ainsi leur identification et leur ciblage. Malgré leur présence omniprésente dans le paysage cancéreux, les propriétés intrinsèques des TACAs peuvent ne pas provoquer de manière autonome une réponse immunitaire robuste contre les malignités. L'interaction entre les TACAs et le système immunitaire implique des mécanismes sophistiqués d'évasion immunitaire orchestrés par les cellules cancéreuses, nécessitant une compréhension nuancée de l'immunologie tumorale pour le développement d'interventions immunothérapeutiques efficaces. Exploiter l'immunogénicité des TACAs présente une opportunité alléchante pour affiner les stratégies d'immunothérapie du cancer, avec le potentiel d’exploiter pleinement le potentiel thérapeutique du système immunitaire contre le cancer du sein et d'autres malignités. Étant donné l'importance des TACAs comme cibles thérapeutiques, la conception et la synthèse standard des antigènes Tn et TF sont essentielles pour développer des composés plus efficaces et spécifiques en immunothérapie. En outre, et en dehors de l'importance des modifications anomériques des TACAs, la modification de positions non anomériques sur les TACAs est cruciale pour une approche multifacette pour la recherche et la thérapie du cancer. Ces modifications jouent des rôles pivots en immunothérapie, améliorant la reconnaissance immunitaire des cellules cancéreuses et améliorant l'efficacité de stratégies telles que les vaccins anticancéreux et la thérapie cellulaire adoptive. Dans cette thèse, nous présentons une étude approfondie de la conception et la synthèse d'un vaccin semi-synthétique basé sur Tn avec la N-acétylgalactosamine fonctionnalisée au point focal. Nous avons utilisé la région anomérique du sucre comme épitope potentiel et sa conversion en un glycoside d'allyle pour générer des dérivés allongés par espaceur. La synthèse et la caractérisation de ces composés ont été confirmées à l'aide de diverses techniques analytiques, notamment la RMN du proton, la RMN du carbone, COSY, HSQC et la spectrométrie de masse, avant de passer aux étapes suivantes. Pour résoudre le problème de tolérance immunitaire associé à l'antigène Tn, nous avons fixé l'albumine sérique bovine (BSA) au composé conjugué nouvellement formé dans des conditions contrôlées. Cela a nécessité une réaction d'addition thiol-ène sous photocatalyse UV (254 nm) en utilisant du 2,2-diméthoxy-2-phénylacétophénone (DMPA). Avant cela, la pureté de la BSA a été vérifiée avec soin par électrophorèse sur gel SDS, garantissant son intégrité pour des expérimentations ultérieures. La concentration moyenne de BSA par composé conjugué a été évaluée à l’aide du test de Bradford, tandis que le nombre de Tn par BSA dans chaque conjugué a été déterminé via la méthode de Dubois. De plus, cette étude avait pour objectif d'explorer la capacité de liaison du conjugué Tn-BSA à des anticorps anti-Tn spécifiques et à valider le processus de conjugaison à l'aide d'un dosage immunoenzymatique (ELISA). Diverses lectines, dont l'agglutinine d’arachide (PNA) d'Arachis hypogaea et l'agglutinine de Vicia villosa (VVA), ont été utilisées comme modèles pour les interactions avec les anticorps. Deux méthodes distinctes, colorimétrique et fluorimétrique, ont été utilisées, et leurs résultats ont été analysés et discutés. Par ailleurs, la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse par ionisation électrospray (LC-MS) a été utilisée pour identifier les fragments peptidiques de la BSA où l'antigène Tn a été greffé et modifié. De plus, un dosage de résonance plasmonique de surface (SPR) a été réalisé pour étudier l'affinité de liaison de l'antigène TF envers la PNA, fournissant une analyse supplémentaire. Nous avons également synthétisé des dérivés d'antigènes Tn halogénés et proposé une bibliothèque de dérivés Tn où les groupes hydroxyles libres aux positions 3, 4 et 6 ont été remplacés par divers groupes fonctionnels. Cette initiative visait à élucider les interactions complexes entre les analogs proposés et diverses lectines telles que VVA, SBA et Jacalin, servant de modèle pour les interactions anticorps. Ensuite, parmi les approches connues pour cartographier finement les interactions antigène-anticorps, la modélisation computationnelle a été choisie pour restreindre la bibliothèque et identifier les analogs les plus puissants en termes de présentation d'une forte affinité envers les lectines mentionnées. Pour optimiser la structure de l'antigène Tn en complexe avec les anticorps pertinents, des substitutions ont été introduites aux positions 3, 4 et 6 de Tn. En utilisant le package de modélisation moléculaire SYBYL-X 1.1, des structures de composés basés sur Tn ont été générées et ensuite affinées dans Discovery Studio 4.1 en utilisant le champ de force CHARMm. Des études de docking ont été menées avec des lectines (VVA, SBA et Jacalin) en utilisant des structures cristallines obtenues à partir de la base de données RCSB. Le site actif de la lectine a été modélisé dans une sphère de 15 Å autour de l'antigène Tn, permettant aux atomes du ligand et des chaînes latérales environnantes de se déplacer librement. Les sites actifs des lectines ont été identifiés et les analogs de Tn ont été ancrés dans ces sites en utilisant le programme GOLD, avec les paramètres par défaut. Les résultats ont été sauvegardés. Le docking a été effectué trois fois. Pour évaluer la fiabilité des résultats de docking et étudier les modifications des analogues de Tn en complexe avec les lectines au fil du temps dans un milieu aqueux, une simulation de dynamique moléculaire (MD) a été réalisée. Le package de simulations GROMACS 5.1.2 GROMOS96 53a6 a été utilisé pour simuler le système protéine-ligand. Le site Web Pharmit (http://pharmit.csb.pitt.edu/) a été utilisé pour construire le modèle pharmacophore en utilisant la structure cristalline de lectines en complexe avec l'antigène Tn (http://www.pdb.org). Les codes pdb de 1N47 pour VVA (Vicia villosa agglutinin), 4D69 pour SBA (Soybean Agglutinin) et 1UH0 pour la lectine de Jacalin ont été utilisés. Les modèles pharmacophores ont défini les caractéristiques d'interaction essentielles pour l'activité biologique de ces composés. Ensuite, dans une étude comparative, les modèles pharmacophores acquis ont été utilisés pour cribler la base de données Zinc afin de déterminer si l'un des composés récupérés de la criblage virtuel atteignait la valeur Goldscore du composé obtenu à partir de la méthode de docking, le criblage virtuel, le pharmacophore et la dynamique moléculaire ont été décrits ici. Le facteur d'enrichissement et le re-docking ont permis de valider les méthodes computationnelles.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Antigènes associés aux tumeurs (TACAs), antigènes Thomsen-Friedenreich (TF), antigène Tn, immunothérapie anticancéreuse, schémas de glycosylation, antigènes TF et Tn, albumine sérique bovine (BSA), tolérance immunitaire, dosage immunoenzymatique (ELISA), lectines, agglutinine d'arachide (PNA), agglutinine de Vicia villosa (VVA), méthodes colorimétrique et fluorimétrique, chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse par ionisation électrospray (LC-MS), résonance plasmonique de surface (SPR), dérivés halogénés de l'antigène Tn, modélisation computationnelle, études de docking, modélisation moléculaire SYBYL-X 1.1, Discovery Studio 4.1, programme GOLD, simulations de dynamique moléculaire (MD), GROMACS 5.1.2, site Web Pharmit, modélisation pharmacophore, base de données Zinc, valeur Goldscore, facteur d'enrichissement, re-dockin
Effet de la nanoparticule d'oxyde d'aluminium sur la toxicité du chrome hexavalent en contact avec le bioindicateur Lemna minor
Get PDFLes avancées technologiques ont entraîné le développement de nanoparticules d’oxyde, dont leurs applications se retrouvent dans différents secteurs, comme, la pharmacie, l’agriculture et l’environnement. Certaines nanoparticules d’oxyde présentes dans l’environnement sont capables d’adsorber les polluants hautement toxiques. Mais peu d’études s’intéressent à l’impact de ces nanoparticules lorsqu’elles interagissent avec les différents polluants présents dans l’environnement, tel que le chrome hexavalent (Cr(VI)), un polluant extrêmement toxique, considéré par l’environnement Canada et la santé Canada, causant des problèmes majeurs dans l’environnement. Dans cette étude, nous nous sommes intéressés à la nanoparticule d’oxyde d’aluminium (nano Al2O3), utilisée pour adsorber le Cr(VI) dans le traitement des eaux. La plante Lemna minor a été utilisée comme bioindicateur, pour évaluer la physiologie de la plante, qui était en interaction avec le mélange de la nano Al2O3 (10 mg/L et 100 mg/L) et du Cr(VI) (5 mg/L et 10 mg/L). Les résultats indiquent que la nano Al2O3 n’a pas d’impact sur la toxicité du Cr(VI), en fonction du poids frais de la plante, du nombre de frondes et de la longueur des racines. Toutefois, la nano Al2O3 a considérablement réduit (p<0,01) la toxicité du Cr(VI), mesurée par l’inhibition du taux de croissance, par rapport au Cr(VI) seul à 10 mg/L. Bien que la toxicité ait diminué, le Cr(VI) est resté toxique. Une réduction (de manière non significative) de la Chl a a été observée dans le test contenant le Cr(V) à 10 mg/L en présence de la nano Al2O3 à 100 mg/L. La nano Al2O3 n’a pas impacté la toxicité du Cr(VI) en fonction de l’efficacité de la photosynthèse. Les stratégies de traitements de l’eau qui utilisent la nano Al2O3 adsorbant le Cr(VI), ne changent pas les propriétés toxiques du Cr(VI). Ce travail permet d’évaluer les risques pour la santé et pourrait contribuer à développer des stratégies visant à réduire ces risques.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Cr(VI), nano Al2O3, Lemna minor, pigments photosynthétiques, efficacité de la photosynthèse
Les forêts de varech et les changements climatiques
Get PDFLes forêts de varech sont des forêts de macroalgues que l’on retrouve sur toutes les côtes des continents. Ce sont des écosystèmes importants où vivent un grand nombre d’espèces animales et végétales. La structure sous-étagée et la fonction du milieu varient selon la région où le varech pousse. Plusieurs secteurs économiques dépendent aussi du varech, tels que la pêche commerciale et récréative. Les changements climatiques modifient les paramètres de survie des forêts de varech, avec une hausse des températures de l’eau apportant des changements dans les courants, l’acidification de l’eau, les déséquilibres dans la chaîne alimentaire, etc. Les activités anthropiques, quant à elles, comme la surpêche, l’aménagement côtier, la gestion des eaux usées vont aussi affecter les forêts de varech. Enfin, des mesures de protection, telles que les aires marines protégées, ainsi que des méthodes d’aménagement et de gestion, comme l’Ecosystem-Based Management, permettent de conserver les forêts de varech ainsi que de restaurer ces écosystèmes importants. Notre essai présente l’histoire des varechs et explique de quelle façon la communauté scientifique observe les modifications importantes de ces milieux.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Varech, Changement climatique, Aménagement, Oursins, Déforestation, Biodiversité, réchauffement des océans