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Impact of combined atmospheric and marine heatwaves on the filtration activity of the invasive Asian date mussel, Arcuatula senhousia.
No full textInternational audienceThe Asian date mussel, Arcuatula senhousia, originated from East Asia, is a highly invasive species that severely affects ecosystem functioning and biodiversity in various ecosystems in America and Europe. In recent decades, heatwave events have increased in severity and frequency, causing additional stress for intertidal organisms living in one of the most thermally challenging habitats. Therefore, understanding the impact of stressful environmental conditions on species' behavioural responses is essential for predicting the effects of biological invasions in the context of climate change. This study aimed to evaluate the response of A. senhousia filtration activity under two levels of realistic combined marine and atmospheric short-term heatwaves (strong and extreme), performed during spring and summer conditions. Although numerous intertidal organisms have been shown to suffer greatly from heatwaves, the results indicate that A. senhousia is able to withstand short-term heatwaves. The results showed that, for all intensities and seasons, heatwaves had no significant effect on the clearance rate. Although there was no distinct general trend regarding the influence of heatwaves on the behaviour of valve opening in spring, strong heatwave conditions significantly increased the valve gaping activity (e.g., increasing valve opening and time of active filtration) during the summer experiment without significant difference on the clearance rate. This highlights the importance of considering the season when attempting to understand and predict the impacts of heatwaves. Therefore, this species exhibits a high filtration rate as well as tolerance to heatwaves. However, future investigations should investigate if this resistance have an impact on the species growth and survival at a longer term. In the context of climate change, this species may have advantage over native ones, and its abundances may significantly rise, leading to important ecological consequences in terms of communities structures and habitat modifications
Annotating opportunistic camera-trap images with conditions of recording, for the disease surveillance of Eurasian lynx (Lynx lynx)
No full textInternational audienceThe French population of the Eurasian lynx (Lynx lynx) is small and fragmented. Any emerging disease would endanger it even further, so disease surveillance is crucial. Currently, it relies on lynx carcass surveillance. In parallel, the Eurasian lynx population is being monitored since 1997 by a large network of observers in different regions and this trove of camera-trap images could allow for the opportunistic detection of clinical signs. Camera traps have been used for a very long time in ecology and, more recently, in epidemiology to study e.g. sarcoptic mange. However, depending on image quality, the level of detail visible in the animal's body varies. This work examines how the quality of the images relates to the ability to detect cutaneous changes and abnormal body conditions. Different factors affect image quality and the detection of changes. These include intrinsic camera parameters like the type and settings of the camera trap, extrinsic factors like the external lighting conditions or the position of the animal in relation to the camera. In our data set, clearly visible cutaneous changes were associated with a different set of factors than visible abnormal body conditions. The camera-trap conditionscurrently used for ecological monitoring of the lynx are very diverse and may allow for the general surveillance of abnormal health signs. However, for monitoring specific health signs, the camera settings as well as the shooting context should be optimized to ensure the best possible sensitivity and specificity of the detection
Étude expérimentale de la dynamique sédimentaire soumise à des hydrogrammes : application à la remobilisation d’une recharge visant à la restauration de frayères
No full textHydroelectric dams disrupt river continuity by limiting the availability of sediments essential for maintaining aquatic habitats, particularly those used by salmonids for spawning. To compensate for this deficit, targeted sediment inputs are implemented to restore these habitats; however, such interventions remain vulnerable to flow variations caused by dam management in response to floods and extreme events. Predicting sediment remobilization under these conditions is complex, as it does not follow classical sediment transport laws and is strongly influenced by hydrograph unsteadiness, making the assessment of sediment supply durability challenging. To better understand these mechanisms, an experimental model was developed to reproduce in the laboratory the hydrodynamic and sedimentary conditions of a river reach downstream of the Hautefage dam (Corrèze, France). The setup, designed according to hydraulic similarity principles based on the Froude and Shields numbers, allows the simulation of flood hydrographs and the analysis of sediment mobilization. The experimental approach incorporates measurement tools such as Particle Image Velocimetry (PIV) and optical sediment tracking, enabling a detailed characterization of how hydrograph unsteadiness affects shear stress development, early sediment mobilization, and the evolution of sediment bar stability and displacement. The results show that the rising phases of floods intensify shear stress and sediment transport, with shear velocities exceeding those observed under steady flows. These phenomena are influenced by the rising time and the difference between flood peak and baseflow, which generate shear stress peaks and affect sediment stability. In contrast, total sediment displacement is primarily controlled by the duration during which sediments are exposed to shear stresses above their mobilization threshold, reflecting the behavior of long-duration hydrographs. Thus, flood slope plays a central role in triggering and regulating sediment transport intensity during flood peaks, while total flood duration governs overall erosion and sediment displacement. This study provides novel insights into the dynamics of sediment inputs in dam-regulated flood contexts. It delivers an initial experimental dataset, useful for identifying the hydrograph parameters responsible for various sediment transport processes and erosion regimes, which should be expanded to better quantify these effects. Furthermore, the study supports the development of predictive numerical models and emphasizes the importance of incorporating hydrograph unsteadiness when designing and managing spawning ground restoration interventions, thereby enhancing their long-term durability.Les barrages hydroélectriques perturbent la continuité des cours d’eau en limitant la disponibilité des sédiments nécessaires au maintien des habitats aquatiques, en particulier ceux utilisés par les salmonidés pour leur reproduction. Pour pallier ce déficit, des apports sédimentaires ciblés sont réalisés afin de restaurer ces habitats. Ces interventions restent toutefois vulnérables aux variations de débit induites par les crues et les événements extrêmes liés aux déversements des barrages. La prédiction de la remobilisation des sédiments dans ce contexte est complexe, car elle dépend de l’instationnarité des hydrogrammes, ce qui rend difficile l’évaluation de la durabilité des apports. Pour mieux comprendre ces mécanismes, un modèle expérimental a été conçu afin de reproduire en laboratoire les conditions hydrodynamiques et sédimentaires d’un tronçon situé en aval du barrage de Hautefage (Corrèze). Ce dispositif, établi selon les principes de similitude hydraulique usuels de Froude et de Shields, permet de simuler des hydrogrammes de crue et d’analyser la mise en mouvement des sédiments. L’approche intègre des outils de mesure tels que la vélocimétrie par images de particules (PIV) et le suivi optique des sédiments, permettant de caractériser l’influence des paramètres des hydrogrammes sur la variation du cisaillement, la mise en mouvement précoce des sédiments, ainsi que l’évolution de la stabilité et du déplacement d’un tas sédimentaire. Les résultats montrent que les phases de montée en crue entraînent une intensification du cisaillement et du transport solide, avec des vitesses de cisaillement supérieures à celles observées lors d’écoulements stationnaires. Ces phénomènes dépendent du temps de montée et de la différence entre le débit de crue et le débit de base, favorisant ainsi les pics de cisaillement et influençant la stabilité des sédiments. En revanche, le déplacement total des sédiments est principalement déterminé par la durée pendant laquelle ils subissent des contraintes de cisaillement supérieures à leur seuil de mobilisation, ce qui est représentatif des hydrogrammes de longue durée. Ainsi, le rôle de la pente de crue apparaît central pour le déclenchement et l’intensité du transport pendant le pic de crue, tandis que la durée totale de la crue influence l’érosion et le déplacement global des sédiments. Cette étude apporte des éléments nouveaux sur la dynamique des apports sédimentaires dans des contextes de crues régulés par les barrages. Elle fournit une première base de données expérimentales, utile pour identifier les paramètres des hydrogrammes responsables des différents processus de déplacement et des régimes d’érosion, et devra être enrichie pour mieux quantifier l’évolution de ces modifications en fonction de ces paramètres. Enfin, cette étude peut servir au développement de modèles numériques prédictifs et souligne l’importance d’intégrer les effets instationnaires des hydrogrammes afin d’améliorer la conception et la gestion des opérations de restauration de frayères, renforçant ainsi la durabilité de ces interventions
Phos-Fer Valo (2022-2025) Rapport: Rapport du projet Phos-Fer Valo mené de 2022 à 2025, portant sur l’optimisation du fonctionnement de réacteurs garnis de Fer dans le cadre du traitement des pollutions phosphorée, azotée et microbienne dans les eaux usées des stations de faible capacité et valorisation du phosphore immobilisé.
No full textCe document correspond au rapport du projet Phos-Fer Valo mené de 2022 à 2025, portant sur l’optimisation du fonctionnement de Réacteurs garnis de Fer dans le cadre du Traitement des pollutions phosphorée, azotée et microbienne dans les eaux usées des stations de faible capacité et valorisation du Phosphore immobilisé. Il présente des résultats des travaux réalisés en laboratoire et sur un démonstrateur déployé sur une station de traitement des eaux usées pendant 2 ans. Ce projet, porté par le laboratoire E2LIM de l’université de Limoges, a été réalisé en partenariat avec le Centre Technique de l’Eau (CTE-LIM) et Limoges Métropole, avec le soutien de l’Office Français de la Biodiversité, de la Région Nouvelle-Aquitaine et de l’Agence de l’Eau Loire-Bretagne. Dans le cadre de la valorisation des matériaux, des partenariats avec ARDHORR CRITT Horticole et le laboratoire IRCER de l’université de Limoges ont été mis en place
Selection of intra‐forest meadows by red deer increases with winter temperature
No full textInternational audienceSurvival and reproduction drive animals to occupy specific habitats within their home range. Red deer shows a particular preference for forest gaps, whereas the elevated browsing pressure can limit tree regeneration. Nevertheless, intra-forest meadows can attract red deer within forests by providing accessible grass, particularly as warmer winter temperatures, driven by climate change, result in earlier vegetation onset and lower snow cover. Using GPS monitoring of red deer in two populations from France and Belgium, we analysed how their selection of intra-forest meadows varies according to season, seasonal mean temperature and time of day (night-time and daytime). We show that red deer preferentially selects intra-forest meadows at night, irrespective of the season, although the strength of this selection is reduced in winter. However, the strength of night-time selection of meadows increases with winter mean temperature. We proposed that this pattern is explained by seasonal variations of vegetation availability (minimal in winter), which is positively linked to winter temperature. These results suggested that meadows act as critical foraging areas for red deer across all seasons in a climate change context with warmer winters. We also hypothesised that intra-forest meadows modify the spatial distribution of browsing pressure within neighbouring forest areas, a key issue for forest managers
Projet PUMAT -Pour Un Maraîchage Attractif en Martinique et en Guadeloupe : bilan et perspectives
No full textAccompagner l’évolution des systèmes agricoles vers une moindre dépendance aux produits phytopharmaceutiques en se concentrant sur les méthodes préventives et sur les évaluations élargies des pratiques de protection des cultures et en les appréciant à travers leur durabilité. Dans ce numéro, nous abordons la conception d’outils et de stratégies de prévention, le développement de méthodes de lutte non chimique contre différents ravageurs et pathogènes, ainsi que l’évaluation, la définition d’indicateurs, la diffusion et la structuration de pratiques, depuis l’échelle de la parcelle jusqu’à celle des territoires et des filières. Ces projets ont été financés dans le cadre des appels à projets Ecophyto Recherche & Innovation lancés en 2019 : - Les approches globales pour limiter l’utilisation des produits phytopharmaceutiques - Durabilité des systèmes de productions agricoles alternatifs évitant ou limitant l’utilisation des produits phytopharmaceutiques"National audienceThe ECOPHYTO PUMAT project identified several levers that promote the adoption of agroecological practices at productive scales (farm size, diversification, training), commercial scales (certification), and collective scales (producer organizations). Labour, up to 90% of total costs—and pricing are central factors. Consumers are willing to pay a premium for pesticide-free products but do not attach importance to the marketing channel. The project’s systemic approach demonstrates that preventive innovationconstitutes a collective investment, which requires trust and transparency, and that the tension between alliances and competitiveness questions the coherence of transition pathways.Le projet ECOPHYTO PUMAT a identifié plusieurs leviers favorisant l'usage de pratiques agroécologiques aux échelles productives (surface, diversification culturale, formation), commerciales (certification) et collectives (groupements de producteurs). Le travail, représentant jusqu'à 90 % des coûts, et les prix, sont centraux. Les consommateurs sont prêts à payer plus pour du sans pesticides mais sans attacher d'importance au mode de commercialisation. La démarche systémique du projet montre que l'innovation préventive est un investissement collectif, qui exige confiance et transparence, et que la tension entre collaboration et compétitivité interroge la cohérence des transitions
First record of the genus Uroxys Westwood, 1842 in Martinique (Lesser Antilles), with descriptions of two new species from cloud forests (Coleoptera: Scarabaeidae: Scarabaeinae)
No full textInternational audienceTwo new species of Uroxys Westwood, 1842 are described from Martinique: Uroxys martinicensis Huchet, sp. nov., and Uroxys aphanes Huchet, sp. nov. These species represent the first documented presence of Uroxys in Martinique. Both new species are flightless due to their brachypterous condition (reduced metathoracic wings), a condition that highlights the role of the cloud forests of the Lesser Antilles as centers of endemism and attests to the long-term isolation of some insular lineages of Scarabaeinae. These new taxa are compared with the three other Uroxys species currently known from the Lesser Antilles, namely U. vincentiae Arrow, 1903, U. productus Arrow, 1933, and U. trinitatis Arrow, 1933, and diagnostic characters are provided. An identification key to the Uroxys species from the Lesser Antilles is provided, along with two distribution maps: one detailing the Martinican records of the new taxa, and another summarizing the distribution of the genus across the archipelago.Deux nouvelles espèces du genre Uroxys Westwood, 1842 sont décrites de Martinique : Uroxys martinicensis Huchet, sp. nov., et Uroxys aphanes Huchet, sp. nov. Ces espèces représentent la première mention documentée du genre Uroxys pour la Martinique. Toutes deux présentent une brachyptérie marquée, caractérisée par des ailes métathoraciques extrêmement réduites et vestigiales, condition qui met en évidence le rôle des forêts de nuages des Petites Antilles comme centres d’endémisme et témoigne de l’isolement évolutif de certains Scarabaeinae insulaires. Ces nouveaux taxons sont comparés aux trois autres espèces actuellement connues des Petites Antilles, à savoir U. vincentiae Arrow, 1903, U. productus Arrow, 1933 et U. trinitatis Arrow, 1933, et leurs caractères diagnostiques sont présentés. Une clé d’identification des espèces du genre Uroxys des Petites Antilles est fournie, accompagnée de deux cartes de distribution : l’une détaillant les localités martiniquaises des nouveaux taxons, et l’autre illustrant la répartition des espèces du genre dans l’ensemble de l’archipel
Rapport d’analyses génomiques des populations de vanneaux huppés hivernant en France
No full textCe rapport présente les résultats détaillés de l’action 1 du projet Ecocontribution 1274 VanConnect, réalisé entre 2024 et 2025, portant sur l'étude génomique de populations hivernantes de Vanneau huppé (Vanellus vanellus) en France. L'enjeu principal est de mieux comprendre la provenance et la structure des populations de Vanneaux huppés hivernant en France. Pour répondre à ces questions, les analyses ont porté sur 438 vanneaux échantillonnés sur le territoire français, à l’aide de 40 746 marqueurs de simple polymorphisme (SNPs). L'analyse s’appuie sur la technique 3D-GBS (Genotyping-By-Sequencing, de Ronne et al. 2023) utilisant deux combinaisons de trois enzymes de restriction : NsiI-MspI et PstI-MspI. Les lectures brutes ont été alignées sur le génome de référence du Vanneau huppé publié par la FNC : bVanVan3.1.fa (ENA accession number PRJEB89817).Les différentes statistiques (Fis, ADMIXTURE, ACP, identité par état (IBS) et identité par descendance (IBD)) convergent vers un même constat : l’absence de structuration génétique marquée entre les individus et une diversité génétique forte. Ces résultats suggèrent que les vanneaux huppés collectés en France proviennent d’une même population bien mélangée et peu structurée. Les fichiers .bam individuel et le fichier VCF avant filtres sont disponibles sur l’ENA au numéro d'accession PRJEB88728
Early life stages of Aquitanian pike Esox aquitanicus (Teleostei, Esocidae): first description of morphological development and trials of rearing
No full textInternational audienceAquitanian pike, Esox aquitanicus, is a new esocid species described in 2014 and endemic to Southwestern France. The four main goals of the present study were to (i) obtain the first morphological data on the early life stages, (ii) test the effects of temperature on their survival and development, (iii) compare the results with the Northern pike, and (iv) produce a few individuals to exhibit them at the Aquarium of Limoges. Eggs are yellowish, demersal, and sticky. The mean diameter was 2.73 ± 0.08 mm (n = 174). The larval size at hatching was 9.09 ± 0.24 mm (n = 14). The morphological development of 15 larvae was followed during 11 weeks as well as the snout growth in relation to eye size. It appeared that already after three weeks, slight differences between the two species were apparent, and after nine weeks, this snout/eye ratio was twice greater for Northern pike than Aquitanian pike. At the end of the yolk-feeding period, which lasted from 12 days at 18 °C to 36 days at 6 °C, the overall survival rate was over 85% and larvae were of similar size, except at 6 °C. After three months, the best results in term of survival were obtained at 12 °C (60%) and for growth at 15 °C (34.11 mm), followed at 12 °C (27.85 mm). Based on these results, we were able to rear Aquitanian pike for more than 2 years in the Aquarium of Limoges in order to promote the conservation of the species to the public
Do sex, age or ecological needs shape an endangered Brown Bear population diet? New insights from faecal metabarcoding
No full textInternational audienceConservation strategies usually focus on megafauna and keystone species to protect habitats. In temperate ecosystems, brown bear appears as one of the potential megafauna keystone species thanks to its omnivorous diet. However, most of the trophic interactions' studies used coproscopic analyses that generally miss highly digested items and rarely investigated the effect of sex, age and individual. In addition, the diet was frequently investigated according to climatic seasons, while Bear Ecological Periods -BEP -(e.g. mating, hyperphagia) really drive individual movement and foraging. In this study, we collected brown bear faeces of different age class and sex across BEP from a critically endangered population. We used metabarcoding and four markers specific to plants, fungi, arthropods and vertebrates to investigate the brown bear diet in the Pyrénées mountains. The diet was mainly composed of plants but also of arthropods, vertebrates and fungi. Pyrenean brown bear consumed significantly fewer arthropods during hyperphagia than other BEP, and exhibited preferences for different plant life forms during mating (diversified herbs), pre-hyperphagia (fleshy-fruits) and hyperphagia (dryfruits). Females consumed plants more often than males, which in turn consumed more wild vertebrates. We highlighted the most diverse level of mycophagy (21 genera) of an omnivore Ursid thanks to metabarcoding. We showed the high variability of this brown bear population diet among BEP and sexes, but not among age-classes. This detailed diet study provides new insights for brown bear conservation, and invites similar approaches on other animals