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Le pôle « recherche et développement » MIAME : la science en appui à la gestion des poissons migrateurs amphihalins
Plusieurs décennies de recherche ont éclairé les politiques publiques de gestion des migrateurs amphihalins. Cette collaboration de longue date initiée par l’Office français de la biodiversité (OFB) et INRAE entre science et action publique a abouti en 2013 à la création d’un pôle recherche et développement. Consacré à l’étude des migrateurs amphihalins dans leur environnement, le pôle prendra la dénomination de « MIAME » en 2019. Il recueille les besoins des acteurs publics et coordonne les travaux scientifiques qui y répondent. Ce dossier revient sur les acquis et productions majeures de cette collaboration
Increasing crop diversity reduces pesticides across diverse production situations
International audiencePesticides have caused significant losses of biodiversity and pose a threat to human health. Crop diversification is proposed as a major solution to achieve the needed pesticide reduction in agriculture, by moderating the pressure of weeds, insect pests, and fungal diseases. According to the pest triangle framework, the impact of a pest outbreak depends on the interactions between crop, pest, and the environment. Diversifying crop sequences in a cropping system could impact the interactions between the three factors and recalibrate the need for pesticides to control pests and avoid yield losses. A previous study found that pesticide use, measured by the Treatment Frequency Index at the cropping system level, is affected both by crop species and crop diversity (assessed in this study through the number of crops), with crop species having a greater impact. However, to our knowledge, no study has quantified the role of the farming environment in the effect of crop diversity on regulating pest pressure, and limiting the need for pesticides. In this study, we used the classification and regression trees method to identify six clusters of production situations with contrasting levels of pesticide use, taking into account the nature of crop species grown. Our results show that production situations, the crop species, and crop diversity, jointly shaped pesticide reliance at the cropping system level. Specifically, production situations explained 5.6% of the variance in total pesticide use. Crop diversification by adding one extra crop reduced total Treatment Frequency Index by 0.10, after filtering out the influences of production situation, and this effect was significant across all pesticide groups, namely herbicides, fungicides, and insecticides. Our findings provide evidence that increasing crop diversity consistently reduces pesticide reliance across diverse production conditions. These insights highlight the potential of crop diversification as an effective and scalable strategy for sustainable pest management
Etude de l’exposition potentielle de la faune sauvage à enjeux aux produits biocides circulant à La Réunion
Ce rapport constitue une première synthèse sur l’usage et les effets potentiels des produits biocides sur la faune terrestre sauvage à enjeux à La Réunion. Il met en lumière une diversité de situations, des pratiques contrastées et des risques écotoxiques encore largement sous-évalués
Cyanobacterial bloom dynamics in lake Léon: a multi-seasonal modeling approach
International audienceCyanobacterial blooms are known to cause significant ecological and public health concerns by altering the physico-chemical conditions of aquatic environments and releasing harmful toxins. This issue has recently been observed in lake Léon (Landes, France), where the proliferation of cyanobacteria has become a major issue. Various chemical (e.g., nutrient concentrations), physical (e.g., water level), and meteorological factors are known to favor the development of cyanobacterial blooms. The aim of this study is to test the relative importance of these factors on the development of cyanobacteria biovolume in the lake Léon. To this end, the relevant variables have been compiled from 2008 onwards and incorporated into a series of linear models. These models were constructed both across the entire study period and at a seasonal scale to identify the specific conditions that contribute to the biovolume variability over time. Physico-chemical factors-particularly nutrient levels such as phosphorus-show strong correlations with cyanobacterial biovolumes. Meteorological conditions also play a key role, although the timing and intensity of their effects vary by parameter and season. Among these, temperature emerges as the most influential variable. Additionally, water level is significantly associated with biovolume during the summer months. Seasonal persistence was also observed, with biovolumes depending on those of the preceding seasons. Consequently, the occurrence of blooms appears to result from the interplay of these multiple factors. These findings align with existing literature and offer new insights into cyanobacterial proliferation in the specific context of lake Léon. Nevertheless, expanding the dataset-both in terms of duration and resolution-would improve model reliability and support the development of predictive tools for managing future public health risks
Comité d'experts sur la gestion adaptative - Avis concernant la chasse de la tourterelle des bois
Dung beetles, but not rodents, contribute to brown bear feces removal, disaggregation, and secondary seed dispersal
article de 14 p.Data (Pauly et al., 2025) are available from Data INRAE: https://doi.org/10.57745/KFWPNI.International audienceSeed dispersal by endozoochory is essential to plant dynamics, but once released in the feces, the seeds face a hostile environment that is not always favorable to germination. Indeed, feces may contain inhibitors, have high seed density, and be densely structured. However, feces visitors such as vertebrates and invertebrates may play an essential role in secondary seed dispersal (SSD) and can alleviate the chemical and physical constraints of the feces. Yet, their relative roles in the dispersal of small-and medium-sized seeds are not well documented. In this study, we designed a field experiment in the French Pyrénées mountains to disentangle the relative role of vertebrate and invertebrate on feces removal, disaggregation, and secondary dispersal of small-and medium-sized seeds. We thus used 30 brown bear (Ursus arctos) fresh feces and separated each of them into three sub-samples submitted to different treatments allowing total access of any visitor, access restricted to invertebrates, and no visitor access, respectively. We inserted eight raspberry (Rubus idaeus) and five blueberry (Vaccinium myrtillus) marked seeds in each sub-sample to assess SSD. In parallel, we used camera and pitfall traps to document the presence of vertebrate and invertebrate visitors, respectively. After ten days, we weighed the fecal matter remaining, counted the remaining seeds, and assessed the feces disaggregation based on visual examination and objective criteria. We observed a significant effect of invertebrates on feces removal, disaggregation, and secondary dispersal of both seed species. Vertebrates did not visit the feces. Dung beetles caught in pitfall traps appear as the main secondary seed dispersers and disaggregation agents in this area. We also pinpointed that diet composition and structure of brown bear feces affect dung beetle attraction and activities. Our study in a temperate mountainous area identifies dung beetles as key agents in the disaggregation of large feces and secondary dispersal of small-and medium-sized seeds, with no evidence of rodents. Diet composition and the fecal matter trapping the seeds affect seed fate by modulating dung beetle activity. By releasing variable fecal contents, omnivorous primary seed vectors have an even more complex effect on seed fate than expected.La dispersion des graines par endozoochorie est essentielle à la dynamique des plantes, mais une fois dans les fèces, elles sont confrontées à un environnement hostile à la germination. En effet, les fèces peuvent contenir des inhibiteurs, une forte densité de graines et être densément structurées. Cependant, les visiteurs des fèces (vertébrés et invertébrés) peuvent jouer un rôle essentiel dans la dispersion secondaire des graines (DSG) et limiter les contraintes des fèces. Dans cette étude, nous avons conçu une expérience dans les Pyrénées pour démêler le rôle relatif des vertébrés et des invertébrés sur la désagrégation des fèces de l'ours brun ( Ursus arctos ) et la dispersion secondaire de graines de petite et moyenne taille. Nous avons utilisé 30 fèces fraîches d'ours brun pyrénéens et séparé chacune d'entre elles en trois sous‐échantillons permettant soit un accès total à tout visiteur, un accès limité aux invertébrés ou aucun accès. Nous avons inséré huit graines de framboise ( Rubus idaeus ) et cinq graines de myrtille ( Vaccinium myrtillus ) marquees dans chaque sous‐échantillon pour évaluer la DSG. Parallèlement, nous avons utilisé des pièges photos et des pièges à fosse pour capturer respectivement la presence de vertébrés et invertébrés. Après dix jours, nous avons pesé la fèces, compté les graines et évalué la désagrégation des fèces. Nous avons observé un effet significatif des invertébrés sur l'élimination et la désagrégation des fèces et la DSG des deux plantes. Les vertébrés n'ont pas visité les fèces. Les bousiers, capturés dans les pièges à fosse, semblent être le principal agent de désagrégation et de DSG. Nous avons également mis en évidence que la composition du régime alimentaire des fèces de l'ours brun affecte l'attraction des bousiers et leurs activités. Notre étude dans une zone montagneuse tempérée identifie les bousiers, mais pas les rongeurs, comme des agents clés dans la désagrégation et la dispersion secondaire des graines de petite et moyenne taille. La composition des fèces qui contiennent les graines influencent le devenir des graines en modulant l'activité des bousiers. En libérant des fèces de composition variable, les omnivores vecteurs primaires de graines ont un effet encore plus complexe que prévu sur le devenir des graines
Signatures morpho-sédimentaires des rivières en tresses alpines appliquées à la restauration physique
Rapport bibliographique de thèse réalisé dans le cadre du projet SMS_TRESSES entre l'INRAE et l'OFB. Ce rapport propose dans un premier temps une synthèse du cadre théorique du fonctionnement et de l'hétérogénéité morphologiques et sédimentologique des rivières en tresses. Puis, dans un second temps, il présente le cas spécifique du tressage du Drac amont et de son tronçon restauré
Etude collective : vers un référentiel d’indicateurs de la qualité des sols
National audienc
Rapport d'étude du projet NectonYN
Responsables de l’étude : Marine Delesalle & Pierre Thiriet. Cheffe de l’équipe en charge du programme : Anne Souquière.L’UAR PatriNat travaille au développement de méthodes de suivis complémentaires afin d’évaluer l’état écologique des communautés de poissons côtiers pour la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM). Ces travaux s’inscrivent dans le cadre de mise en œuvre de la surveillance DCSMM mais ont plus globalement l’objectif de répondre aux besoins des différentes politiques publiques (DCSMM, DHFF, DCE), des gestionnaires d’AMPs et autres espaces maritimes (cantonnements, ZPF, EMR), mais également aux besoins de connaissances et de recherches.Considérant le contexte actuel d’extension des énergies marines renouvelables (EMR) et les lacunes de connaissances sur les effets potentiels des EMR sur l’ichtyofaune et les mammifères marins, l’observation des effets des parcs éoliens sur les poissons est un besoin qui a été plus récemment inclus dans le cahier des charges de la surveillance de la biodiversité. Le projet NectonYN visait à développer et tester la méthode de suivi par vidéo stéréoscopique appâtée (BRUV) et évaluer sa complémentarité avec d’autres méthodes de suivi (ADNe et pêches expérimentales). Celle-ci a été testé dans le cadre de la réalisation de l’état initial peuplements de poissons bentho-pélagiques et récifaux ainsi que des cétacés dans le secteur des parcs éoliens de Saint Nazaire et Yeu-Noirmoutier. Les tests menés ont permis de valider la configuration technique des BRUV et d’optimiser l’analyse des vidéos, en réduisant le temps de visionnage à 30–40 minutes par séquence, tout en conservant une bonne capacité de détection des espèces. Bien que cette méthode soit efficace en milieu benthique, son application en milieu pélagique s’est révélée moins pertinente, en raison d’une faible densité d’espèces observées. L’analyse comparative des méthodes a mis en évidence que l’ADNe permettait de détecter une plus grande diversité taxonomique, notamment les espèces de petite taille (gobies, blennies), tandis que la pêche au filet ciblait des individus de taille supérieure à 20 cm et plus homogènes. Les BRUV permettent d’échantillonner les mêmes métriques que les filets mais avec une sélectivité moindre et présente par ailleurs de nombreux avantages (e.g. non destructif, meilleure précision spatiale, observation du comportement des espèces,…).Les données mobilisées pour réaliser l’état initial suggèrent une similarité écologique entre les communautés de poissons observées dans les différentes zones. Cette tendance est précisée par les données ADNe grâce au calcul d’indices de diversité. Une espèce de delphinidé a également été détectée, sans pouvoir être identifiée précisément.Les méthodes employées fournissent des métriques utiles pour répondre aux exigences des politiques publiques et aux suivis réglementaires liés à l’implantation des éoliennes. Mutualiser ces suivis permettrait d’optimiser les efforts et de renforcer la compréhension des impacts sur la biodiversité marine