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Le projet BEE, une démarche de protection agroécologique de la vigne pour intégrer le biocontrôle
No full textCe numéro fait suite au carrefour de l'innovation agronomique dédié au résultats des projets DEPHY EXPE 2 - Des systèmes utilisant les pesticides en ultime recours : résultats et enseignements de 6 ans d’expérimentations le 13 mars 2025 co-organisé par Inrae, Agreenium, la cellule d'Animation Nationale du réseau DEPHY Ecophyto et le lycée agricole du Valentin. Sont présenté les résultats des projets DEPHY EXPE 2 arrivant à leur terme en décembre 2024 pour diffuser les connaissances des principaux enseignements de ces essais « systèmes » qui ont éprouvé pendant 6 ans des combinaisons de leviers alternatifs à la lutte chimique pour maîtriser les bioagresseurs des cultures : diversification de l’agroécosystème, méthodes de contrôle biologique, choix de matériel végétal, stratégie d’évitement, prophylaxie… Les modalités de mises en œuvre des alternatives testées, leurs conditions de réussite et de diffusion et leurs impacts sur les performances techniques, économiques et environnementales de systèmes ont été discutées.National audienceThe project has five experimental sites in France: (16), (33), (37), (68), and (30). Results observed between 2018 and 2023 show an 83% reduction in the non-biocontrol TFI (Treatment Frequency Index) without increasing the number of treatments. The use of biocontrol-list product has drastically increased, while the use of copper-based fungicides has been limited to an average of 1.65 kg/ha of copper metal per hectare. The protection against powdery mildew (100 % biocontrol) and black rot was satisfactory. However, protection against downy mildew of grape bunch posed a higher risk compared to standard practices, particularly for protection in high disease pressure vintage. The dissemination of results began in 2022 in Cognac with the establishment of the LUMA participatory network: "Limiting the Use of Phytopharmaceutical ProductsAccording to Agroecology Principles."Biocontrôle et Equilibre de l'Ecosystème vigne » développe une démarche viti-écologique afin de faciliter l'intégration des produits de biocontrôle. Le projet dispose de 5 sites expérimentaux dans les départements 16, 33, 37, 68 et 30. Les résultats 2018 -2023 montrent : une réduction de l'Indice de Fréquence de Traitement phytosanitaire (IFT) hors-biocontrôle de 83 % sans augmenter le nombre de passages ; une forte augmentation du recours au biocontrôle ; une très réduite utilisation de fongicides ( à 1,65 kg/ha/an de cuivre métal). La protection contre l'oïdium (100 % biocontrôle) et le black-rot a donné satisfaction. La protection contre le mildiou des grappes présente une prise de risque plus élevée par rapport à la référence en particulier sur les millésimes à forte pression. La diffusion des résultats a débuté en 2022 à Cognac via le réseau participatif LUMA : « Limiter l'utilisation des produits phytopharmaceutiques selon les principes de l'Agroécologie »
The ecological role of hydromorphology, assessed through the new LHYMO index, in sustaining lake macroinvertebrate biodiversity and function
No full textHunting and fishing harvest data collection: a horizon scanning exercise from the French context
No full textInternational audienceLegal and societal moves increasingly lead leisure hunting and fishing practitioners to record their harvest. The total number of individuals harvested per population per year is the minimum required information to feed into demographic models and allow science‐based management. Some few schemes record more detailed data, hence allowing better‐informed decisions to be made. France has an extended list of legally harvested species and a wide variety of exploitation modes, which leads to a large number of harvest data collection schemes. This country is therefore taken as a case study to review the variety of situations and the pros and cons of each protocol. This review outlines a set of best practices that can guide future harvest data collection schemes both nationally and internationally, distinguishing basic information that is needed for minimum management from additional data that allow for more detailed knowledge. It highlights the trade‐off between using simple tools and clear protocols to encourage user participation, and the need for more detailed data to support advanced modeling techniques used for modern population and harvest management
Ecological and management drivers of pest regulation via multitrophic pathways in tropical insular agroecosystems
No full textInternational audienceHighlights: • In La Réunion agroecosystems, field vegetation diversity boosts arthropod diversity. • Crop pests and damage decrease with increasing natural enemy diversity. • Pest regulation service benefits from field non-crop vegetation diversity. • Management and landscape factors also affect trophic cascades. • Vegetation diversity effects can outweigh management and landscape factors.Abstract: Natural pest regulation services provided by arthropod natural enemies are a cornerstone of ecological intensification. While vegetation diversification is known to support natural enemy communities, its relative contribution and interactions with other drivers for pest regulation services remains unclear, especially in dynamic and diversified smallholder agroecosystems under the tropics. In this study, we investigate how crop and non-crop field vegetation diversity, farming practices, climatic and landscape parameters jointly shape arthropod community structure and their services in the aerial and ground strata in tropical market gardening systems on La Réunion Island. We surveyed 22 open-field market gardening systems during two seasons. Using a multitrophic, piecewise structural equation modeling approach, we assessed direct and indirect cascading effects of local and landscape factors on arthropod diversity and pest regulation services. Results show that in aerial communities, non-crop vegetation richness generated a positive bottom-up trophic cascade. It enhanced herbivore diversity which, in turn, increased natural enemy richness, ultimately reducing pest abundance and crop damage, particularly during the dry season. In contrast, insecticide use suppressed natural enemy richness and reduced the effectiveness of pest regulation. Ground-dwelling communities were more strongly influenced by landscape fragmentation, semi-natural habitat cover, and temperature, with less evidence for structured trophic cascades. Overall, beneficial cascading effects of vegetation on pest regulation services in above-ground communities may outweigh the impacts of other management and landscape drivers. These findings underscore the potential of promoting vegetation diversity and reducing pesticide use as key strategies for enhancing natural pest regulation in tropical smallholder agroecosystems
A narrative review of the impact of anthropogenic light and noise on owls
No full textInternational audienceToday, owls are exposed to increasingly brightly lit nights and noisy environments because of human activities. To understand the impacts of artificial light at night (ALAN) and anthropogenic noise we performed an evidence synthesis. We searched four literature databases and Google Scholar and we collected 39 relevant articles (1945-2024) providing 125 cases (64 on light pollution and 61 on noise pollution), targeting 25 species (c. 10% of owl species). We found harmful effects of both sensory pollutants on several outcomes. First, ALAN tends to reduce acoustic communication and to be associated with a lower occurrence of owl species, although it is difficult to confirm whether ALAN leads to silent or absent owls. Moreover, ALAN disturbs owl-prey interactions. Although light probably improves owl vision, the light-avoidance behaviour of small mammals could result in poorer hunting success of owls feeding on mammals. Conversely, ALAN enhances food provisioning and even breeding of owls feeding on insects that are attracted by light, to the detriment of these prey populations. Second, human-induced noise clearly tends to reduce owl vocalization, yet that vocalization may be essential to communication between individuals. The ability of owls to detect prey (hunting success) is also reduced under noise exposure (even at low amplitude), probably as the result of masking and distraction. Studies also demonstrate that anthropogenic noise can cause physiological and behavioural stress and disturbance to owls. Such adverse effects may contribute to declines in reproduction and occurrence of owls observed in noisy areas. As a result, we recommend reduction of both sensory stressors as much as possible, for owls and for ecosystem stability, for example by maintaining and restoring quiet and dark areas. We also recommend more consideration of owls in sensory ecology research to fill knowledge gaps.De nos jours, les rapaces nocturnes sont exposés à des nuits de plus en plus lumineuses et à un environnement de plus en plus bruyant en raison des activités humaines. Pour comprendre l'impact potentiel de la lumière artificielle nocturne et du bruit anthropique, nous avons réalisé une revue de littérature. Nous avons interrogé 4 bases de données bibliographiques et Google scholar et nous avons collecté 39 articles pertinents (1945–2024) fournissant respectivement 125 cas (64 sur la pollution lumineuse et 61 sur la pollution sonore), ciblant en tout 25 espèces (~10% des Strigiformes ). Nous avons trouvé plusieurs effets néfastes des pollutions lumineuse et sonore. Tout d'abord, la lumière artificielle tend à diminuer la communication acoustique et est associée à une occurrence plus faible, bien qu'il soit difficile de confirmer si les chouettes sont plus silencieuses ou absentes. Il est indéniable que l'éclairage nocturne perturbe les interactions entre les rapaces nocturnes et leurs proies, ce qui peut expliquer en partie cette situation pour les espèces qui se nourrissent de rongeurs, selon les effets documentés de la luminosité de la lune: alors que la lumière améliore la vision des chouettes/hiboux, le comportement d'évitement de la lumière des petits mammifères pourrait entraîner un moins bon succès de chasse. Inversement, l'éclairage artificiel améliore l'approvisionnement en nourriture et même la reproduction des chouettes insectivores, probablement au détriment des populations de proies attirées par la lumière. Deuxièmement, les sons artificiels tendent clairement à diminuer la vocalisation des chouettes, pourtant essentielle à la communication (par exemple entre partenaires). La capacité des Strigiformes à détecter leurs proies (succès de chasse) est également réduite en cas d'exposition au bruit (même à faible amplitude), sûrement par un effet de masquage et de distraction. Les données démontrent également que le bruit anthropique provoque du stress et des perturbations, tant au niveau physiologique que comportemental. Ces effets négatifs peuvent être responsables de la tendance à la baisse de la reproduction et de l'occurrence des rapaces nocturnes qui est également observée dans les zones bruyantes. Par conséquent, nous recommandons de réduire autant que possible les deux facteurs de stress sensoriel—pour les chouettes/hiboux et pour la stabilité des écosystèmes—par exemple en maintenant et en rétablissant des zones calmes et sombres. Nous demandons également que les Strigiformes soient davantage pris en compte dans la recherche en écologie sensorielle afin de combler les lacunes en matière de connaissances
A 178 bp diagnostic D-loop fragment (OvisCR) to discriminate domestic sheep (Ovis aries) and European mouflon (Ovis musimon) in diet metabarcoding studies
No full textInternational audienceAccurate species identification is essential in metabarcoding diet studies, notably to distinguish domestic from wild species, as they have markedly different ecological and socio-economic implications. This is particularly true for the genus Ovis , where domestic sheep ( Ovis aries ) and European mouflon ( O. musimon ) often co-exist, but are indistinguishable with common mitochondrial markers due to insufficient variation. Misidentification of these taxa can skew carnivore predation assessments, notably for species like the grey wolf ( Canis lupus ), impacting wildlife conservation and management efforts. Here, we developed a diagnostic D-loop fragment that effectively differentiates O. aries and O. musimon haplotypes in diet metabarcoding studies. Using reference samples from 46 European mouflons and 46 domestic sheep collected in the French Alps, we identified a 178 bp fragment (OvisCR) containing 43 SNPs, distinguishing four mouflon haplotypes and 35 sheep haplotypes. No haplotypes were shared between the two species, though one O. musimon haplotype was closely related to two O. aries haplotypes. The performance of the OvisCR fragment was tested using 115 wolf scat samples. We sequenced a general metabarcoding marker (a 60–140 bp amplicon of the 12S region) alongside the new amplicon on the Ion Torrent platform to assess the ability of the latter to refine Ovis identification. Following sequencing, two bioinformatic pipelines (DADA2 and OBITools) were employed to compare their effectiveness in resolving Ovis operational taxonomic units (OTUs) or amplicon sequence variants (ASVs). The two pipelines demonstrated similar accuracy, with the OvisCR fragment achieving Ovis species-level assignment for more than 81% of scats with Ovis reads detected, regardless of the pipeline used. This new marker provides a robust and practical tool for metabarcoding applications, improving ecological inference in carnivore trophic studies and supporting biodiversity conservation management strategies. While effective in the French context, its broader geographic applicability requires prior validation using region-specific reference datasets that encompass the diversity of domestic sheep, European mouflon and other Ovis species
DATASAPROX: standardised dataset from protocolled sampling of saproxylic beetles in continental France and Corsica
No full textInternational audienceAs part of the DATASAPROX project, we created an occurrence dataset of the saproxylic beetles from continental France and Corsica focused on protocolled data from flight interception traps. For this, we solicited the main national data producers and collected their raw data as well as the associated trapping metadata (e.g. type of trap). Once retrieved, all data went through selection and reformatting steps, including the removal of duplicates between datasets and the standardisation of taxonomic information according to the TAXREF v.18 format. We considered data from specific aerial interception traps: crossed window (©Polytrap, ©Pimul, ©Crosstrap, ©Portrap), multi-funnel (Lindgren) and window (single glass) traps. We aggregated a dataset constituting 675,525 records from 21 data producers and providers, including 485 identified projects. This dataset includes a total of 71 families, 153 subfamilies, 738 genera and 2039 species of saproxylic beetles. Data points encompass all 96 counties from continental France and Corsica for a total of 8969 geographic points and 66,202 samples. This new standardised dataset on saproxylic beetles offers new opportunities for ecological studies and conservation applications
Premier catalogue des Salticidae (Arachnidae, Araneae) de Guyane et description d'une nouvelle espèce
No full textNational audienceA work of bibliographic synthesis and identification of collected material made possible to complete the knowledge concerning one of the best studied spider families of the neotropical region from a systematic point of view, namely the Salticidae Blackwall, 1841. This catalog lists the presence of 122 species as well as 68 morphospecies, belonging to 36 genera, making a total of 190 potential species. After argument based on the observation of type species or individuals, exchanges with data producers or even verification of data in the bibliography, the following species, 19 in number, are deleted from the list of Salticidae of French Guyana: Amycus ectipus (Simon, 1900), Amycus pertyi Simon, 1900, Anasaitis canosa (Walckenaer, 1837), Chira simoni (Galiano, 1961), Chirothecia crassipes (Taczanowski, 1878), Colonus germaini (Simon, 1900), Corythalia tropica (Mello-Leitão, 1939), Hypaeus miles Simon, 1900, Lyssomanes amazonicus G. W. Peckham, E. G. Peckham & Wheeler, 1889, Lyssomanes elegans (Cambridge, 1900), Lyssomanes parallelus (Peckham & Wheeler, 1889), Matinta fasciata (Mello-Leitão, 1940), Noegus bidens (Simon, 1900), Noegus petrusewiczi Caporiacco, 1947, Psecas bubo (Taczanowski, 1871), Sarinda atrata (Taczanowski, 1871), Scopocira melanops (Taczanowski, 1871), Rudra wagae (Taczanowski, 1871) and Viciria chabanaudi Fage, 1923. The mention of a species in Vedel et al. (2013), not recognized by the World Spider Catalog (2023), is also deleted: Salticus fulvatus (Fabricius, 1896). The following new synonymy is established: Amycus flavolineatus C. L. Koch, 1846 is a junior synonym of Colonus sylvanus (Hentz, 1846), n. syn. Amycus amrishi Makhan, 2006 and Neonella heliophanina (Taczanowski, 1871) are considered as nomina dubia. Pseudopartona ornata Caporiacco, 1954, type species of the genus Pseudopartona Caporiacco, 1954, belongs to the genus Sassacus Sassacus G. W. Peckham & E. G. Peckham, 1895, which results in Pseudopartona being synonymised with Sassacus, and the following new combination Sassacus ornatus (Caporiacco, 1954) n. comb. Finally, 25 species are newly cited, including one newly described species: Eustiromastix agatheae Courtial & Picard n. sp. (male).Un travail de synthèse bibliographique et d'identification de matériel collecté a permis de compléter la connaissance concernant l'une des familles d'araignées les mieux étudiées de la région néotropicale du point de vue de la systématique, à savoir les Salticidae Blackwall, 1841. Le présent catalogue liste la présence de 122 espèces, ainsi que de 68 morpho-espèces, appartenant à 36 genres, soit au total 190 espèces potentielles. Après argumentation basée sur l'observation de certains types ou individus, d'échanges avec les producteurs de données ou encore la vérification des données dans la bibliographie, les espèces suivantes, au nombre de 19, sont supprimées de la liste des Salticidae de Guyane: Amycus ectipus (Simon, 1900), Amycus pertyi Simon, 1900, Anasaitis canosa (Walckenaer, 1837), Chira simoni (Galiano, 1961), Chirothecia crassipes (Taczanowski, 1878), Colonus germaini (Simon, 1900), Corythalia tropica (Mello-Leitão, 1939), Hypaeus milesSimon, 1900, Lyssomanes amazonicus G. W. Peckham, E. G. Peckham & Wheeler, 1889, Lyssomanes elegans (Cambridge, 1900), Lyssomanes parallelus (Peckham & Wheeler, 1889), Matinta fasciata (Mello-Leitão, 1940), Noegus bidens (Simon, 1900), Noegus petrusewiczi Caporiacco, 1947, Psecas bubo (Taczanowski, 1871), Sarinda atrata (Taczanowski, 1871), Scopocira melanops (Taczanowski, 1871), Rudra wagae (Taczanowski, 1871) et Viciria chabanaudi Fage, 1923. La mention d'une espèce dans Vedel et al. (2013), non reconnue par le World Spider Catalog (2023), est elle aussi supprimée: Salticus fulvatus (Fabricius, 1896). La nouvelle synonymie suivante est établie: Amycus flavolineatus C. L. Koch, 1846 est synonyme junior de Colonus sylvanus (Hentz, 1846), n. syn. Amycus amrishi Makhan, 2006 et Neonella heliophanina (Taczanowski, 1871) sont considérés nomina dubia. Pseudopartona ornata Caporiacco, 1954, espèce type du genre Pseudopartona Caporiacco, 1954 appartient au genre Sassacus G. W. Peckham & E. G. Peckham, 1895, ce qui entraîne la mise en synonymie de Pseudopartona avec Sassacus, et la combinaison nouvelle suivante Sassacus ornatus (Caporiacco, 1954) n. comb. Enfin, 25 espèces sont nouvellement citées parmi lesquelles une espèce nouvellement décrite: Eustiromastix agatheae Courtial & Picard n. sp. (mâle)
Rapport de mission - Polynésie française - Mai 2024
No full textEn mai 2024, une délégation de PELAGIS et PatriNat, deux unités d’appui et de recherche (UAR), a été organisé surle territoire polynésien afin de rencontrer les acteurs locaux, de restituer les travaux réalisés pour plusieurs programmes (REMMOA 2011, Listes rouges 2015) et de coconstruire les suites à donner.PatriNat s’est engagée dans l’accompagnement des acteurs des territoires d’Outre-mer pour une meilleure prise encompte de la biodiversité, notamment avec le renforcement de ses programmes socles sur la connaissance, ledéploiement de projets spécifiques et des appuis aux expertises locales.La mission visait à avoir une meilleure connaissance des attentes des acteurs du territoire polynésien et à établir un état des lieux des projets actuels de connaissance sur place. Durant cette mission, l’équipe a bénéficié de l’appui de la délégation de l’OFB en Polynésie française pour rencontrer les parties prenantes sur le suivi et la conservation de la biodiversité. Cette mission a également été facilitée par le délégué CNRS (et directeur du CRIOBE).Les échanges avec les acteurs locaux impliqués sur la connaissance et la préservation de la biodiversité se sontorganisés autour de deux thématiques principales :• Cette mission avait aussi pour but de restituer des éléments sur la campagne 2011 du programme REMMOA (REcensement des Mammifères marins et autre Mégafaune pélagique par Observation Aérienne) en Polynésie Française. Les échanges ont permis de recueillir des avis et des besoins pour préparer collectivement une nouvelle campagne de ce programme sur le territoire polynésien. • A la suite des résultats Liste rouge produits pour le territoire en 2015 sur la flore endémique et les oiseaux, la question de la mise à jour de ces évaluations doit être envisagée avec les acteurs polynésiens. La structuration et le partage des données sur les espèces et les habitats constituent un socle indispensable pour ce type d’étude et pour une contribution pertinente à la réglementation ou à la construction de zones clefs de biodiversité.Une série de rencontres institutionnelles et techniques a eu lieu, auprès du Haut-Commissariat, de la Vice-Présidence et de la Ministre en charge de la culture et de l’environnement, avec le directeur de la DIREN (Direction de l’environnement) ou encore la Déléguée à la Recherche du Pays. Du côté société civile, plusieurs associations et naturalistes se sont rendus disponibles. Un moment fort d’échange collectif a été accueilli par la CODIM (Communauté de communes) à Nuku Hiva, au sujet du dossier de classement UNESCO d’une série des sites de l’archipel des Marquises
On the implementation of maximum entropy sampling with unequal probabilities and without replacement
No full textSampling with maximum entropy offers robustness to statistical inference based on randomization theory. However, there were no comprehensive, practical guides explaining how to implement maximum entropy sampling for finite populations with unequal probabilities and without replacement. This article serves as both a toolkit and a reference guide for researchers and engineers, filling a gap in the literature. It links key formal results with ready-to-use algorithms that can be implemented in any procedural programming language. Maximum entropy sampling is straightforward when the sample size is allowed to vary. This is achieved via the Poisson sampling design, in which the sample size is a random variable distributed according to a Poisson binomial distribution. In contrast, the conditional Poisson sampling design, which is obtained by conditioning Poisson sampling on a fixed sample size, has long posed a significant challenge to statisticians.A compendium of formal results for Poisson sampling, the Poisson binomial distribution, and conditional Poisson sampling is presented.The computation of inclusion probabilities up to the second order is detailed for the conditional Poisson sampling, and the corresponding algorithms are provided.Ready-to-use algorithms are provided for implementing Poisson sampling and the Poisson binomial distribution. For conditional Poisson sampling, the rejective, draw-by-draw, sequential, and exchange sampling algorithms are detailed