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Highly Pathogenic Clade 2.3.4.4b H5N1 Influenza Virus in Seabirds in France, 2022–2023
No full textInternational audienceIn 2022, a very high number of wild bird deaths associated with the detection of highly pathogenic (HP) H5 avian influenza virus (AIV) lineage Gs/GD/96, clade 2.3.4.4b viruses were unusually observed in Europe between May and September, whereas prior to 2022 most of these HP H5 AIVs detected in wild birds in Europe were almost all detected between October and March and few between April and September. In France, wild birds affected by this virus during this unusual period were mainly seabirds, including larids and sulids. Although the abnormal mortalities in larids and sulids were reported simultaneously, sequencing of the complete genomes of the viruses identified in these seabirds showed that sulids are mainly infected with genotype EA-2020-C, whereas larids are mainly infected with genotype EA-2022-BB. The identification of these two genotypes, therefore, confirmed that there was no direct link between the abnormal mortality observed in sulids and the abnormal mortality observed in larids. These two seabird mortality events can also be distinguished by the evolutionary pattern of the number of detections. Indeed, sulid mortality associated with the EA-2020-C genotype was observed in France only between July and September, corresponding to a single epidemic wave, whereas larid mortality associated with the EA-2022-BB genotype began in France and Europe in May 2022 and then this genotype continued to spread among larids in France in the form of several successive epidemic waves until at least September 2023.</div
Programme archéologique molénais, rapport n°21. Quatrième campagne de fouille programmée sur le site multipériodes de Porz ar Puns, île de Béniguet (Le Conquet, Finistère)
No full textBien que repéré dès 1950, le site de Porz ar Puñs est un temps oublié puis redécouvert lors des tempêtes hivernales de 2013-2014 qui mettent au jour un important niveau coquillier conservé sous la dune. Dès 2021, plusieurs niveaux d’occupation ont pu être observés, se rapportant à la fin du Néolithique (2570-2140 cal BC), à l’âge du Bronze ancien (2290-1890 cal BC), au Moyen Âge (VIIe-IXe s. et Xe-XVIe s.) et à l’époque contemporaine (XIXe-XXe s.). Au terme de quatre années de fouilles, la dynamique de mise en place des dunes sur le site de Porz ar Puñs se précise grâce notamment aux datations OSL sur les couches sableuses. La stratigraphie du site et de ses occupations est désormais comprise dans sa globalité. Les datations 14C donnent une succession logique des couches observées en stratigraphie et sont en accord avec le mobilier contenu, même si à l’intérieur des couches, quelques inversions peuvent être observées. En 2024, l’érosion active du front de dune a mis au jour un crâne humain dans un secteur déjà identifié comme un probable cimetière du haut Moyen Âge. Une opération limitée (2 m²) a permis de mettre en évidence qu’il s’agissait des ultimes restes d’un individu en place mais aussi de fouiller partiellement un second individu in situ. Ces deux individus se trouvent au milieu d’une série de fosses profondes qui pourraient correspondre à autant de fosses sépulcrales. Le réexamen des découvertes anthropologiques depuis 1950 permet d’estimer leur nombre à un minimum de 36 individus, parmi lesquels 21 immatures et 15 adultes (dont 3 femmes, 1 homme). La fouille des couches du Bronze ancien (US X0, X1 et X2) a été achevée, à l’exception de deux carrés de fouilles, où chaque vestige est coté en 3D afin d’étudier plus en détail la constitution de l’US X1. Ces couches livrent une céramique qui comprend des vases bien cuits à parois fines parfois à engobe rouge, ainsi que des vases à cordons lisse sub-oraux, caractéristiques des productions régionales du début du Bronze ancien. À l’instar des US X0 et X1, des sillons de labours ont été identifiés au sommet de l’US X3, datée de la fin du Néolithique. Bien que peu marqués, l’étude micromorphologique montre que les horizons supérieurs (US X3a et le haut de l’US X3b) ont été travaillés. La fouille des niveaux de la fin du Néolithique (US X3) a été entamée sur cinq carrés. Plusieurs éléments de la culture matérielle semble se rattacher au Campaniforme (tessons décorés, pendeloque en os, ébauche et pointe de flèche) mais aussi au Néolithique final (style Conguel). Les différentes études présentées ici (typo-technologie et pétrographie des céramiques, industries lithiques, malacologie, biométrie, aDNA sédimentaire, ichtyologie, anthracologie, carpologie) permettent d’ores et déjà de brosser à grands traits les modes de vie des différentes communautés insulaires qui se sont succédé sur l’île de Béniguet
Petit guide des punaises de la Guadeloupe
No full textInternational audienceThis introductory guide presents 69 taxa (genera and species) of true bugs (Heteroptera) found in Guadeloupe. Each species has been selected for its frequency, its biological originality or, in some cases, its morphological characteristics that make it easy to recognise during nature walks or field surveys.This work is aimed at naturalists and those who are interested in knowing more about the biological heritage of Guadeloupe. Its aim is to provide an introduction to the little-known world of true bugs in the Lesser Antilles.Ce petit guide présente 69 taxons (genres et espèces) de punaises (hétéroptères) présents en Guadeloupe. Chaque espèce a été sélectionnée pour sa fréquence, son originalité biologique ou, dans quelques cas, ses caractéristiques morphologiques permettant de la reconnaître facilement lors de balades ou de prospections sur le terrain.Ce travail est particulièrement destiné aux naturalistes et aux personnes curieuses ou en charge de l’étude du patrimoine biologique de la Guadeloupe. Il a pour simple ambition de constituer une introduction au monde méconnu des punaises des Petites Antilles
Shared population trends but no annual synchrony in duck species across Europe and North America
No full textThe version of record of this article, first published in European Journal of Wildlife Research, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1007/s10344-025-01895-7International audienceAbstract Few studies have explored population dynamics of species sharing life-history traits and common environmental drivers but living in widely separated regions or continents. Large-scale climate cycles can impact habitats and populations over broad geographic areas and may act as global forces shaping animal population dynamics. We tested for synchronous population dynamics of eight ecologically equivalent duck species in Western Europe (WEU) and central North America (NA) from 1976 to 2019. We investigated the extent to which the Atlantic Multi-Decadal Oscillation (AMO) may have induced shared climatic conditions on the breeding areas of these populations and whether the index was correlated with duck population dynamics. Evidence of annual and long-term population synchrony was assessed by estimating correlation in annual growth rates and population abundances, respectively. Shared (increasing) long-term trends in WEU and NA were found in four species-pairs, but no species-pair had synchronous population growth on an annual basis. Three species-pairs sharing trends were positively correlated with the AMO index which increased during the study period. Positive cycling of the AMO was correlated with increased temperature and precipitation in breeding areas of both continents, which may have produced favorable conditions (earlier springs, more ponds) for some duck populations. Differences in the local effects of weather on environmental conditions and other continent-specific extrinsic factors may mask annual synchrony in the response of continental populations to climate. Potential links between the AMO trends and extrinsic factors such as shared changes in anthropogenic drivers (e.g., climate and land use change) should be addressed in future studies
SalmoGlob – Un nouveau modèle pour l’évaluation des stocks de saumon atlantique à l’échelle de l’Atlantique Nord
No full textInternational audienceÉvaluer l'état des populations de poissons sauvages est essentiel pour guider une gestion efficace dans un contexte de fortes pressions sur la ressource. Dans le cadre du projet SalmoGlob, les chercheurs ont développé un modèle innovant pour évaluer les stocks de saumon atlantique dans l’Atlantique Nord. Ce modèle intègre des données depuis 1971, permettant d’analyser la dynamique des populations à différentes échelles et stades de vie. Adopté par le Conseil international pour l’exploration de la Mer en 2024, il améliore significativement la qualité des évaluations scientifiques et des scénarios de gestion face aux changements globaux
Caractérisation de l’état écologique des habitats marins à partir de la détection des accumulations de poissons et de la cartographie des biocénoses benthiques avec un sondeur multifaisceaux
No full textLe projet FISHHAB, réalisé par la société SEAVIEWS, vise à caractériser l'état écologique des habitats marins à partir de la détection des accumulations de poissons et de la cartographie des biocénoses benthiques le tout réalisé avec un sondeur multifaisceaux.Objectifs du projet :• Développer une méthode pour évaluer l'état écologique des habitats marins en Méditerranée.• Utiliser un sondeur multifaisceaux pour détecter les accumulations de poissons et cartographier les biocénoses benthiques.• Créer un indice de qualité écosystémique intégrant les ressources halieutiques et les biocénoses marines.Méthodologie :• Acquisition de données acoustiques avec le sondeur multifaisceaux R2Sonic 2022.• Traitement des données pour générer des cartes bathymétriques et de réflectivité.• Classification automatique des fonds marins et détection des poissons.• Détection des poissons dans la colonne d’eau avec les données acoustiques• Calcul d’un indice de qualité écosystémique (IQE) synthétisant les données fond (Habitats) et les données colonne d’eau (poisson).Résultats :• Cartographie des habitats marins et des accumulations de poissons dans plusieurs zones d'étude (Baie de La Ciotat, Baie de Calvi, Centuri, Tombolo de Giens, Côte palavasienne, parc Marin de la Côte Bleue).• Analyse des densités et répartitions des poissons par unité de surface et de volume.• Création d'un indice écosystémique basé sur la biodiversité des espèces, la biodiversité des habitats et le réseau trophique.• Test de l’IQE sur la zone du parc Marin de la côte bleueConclusions :• La méthode développée permet une évaluation précise de l'état écologique des habitats marins.• Les résultats montrent des zones de pressions anthropiques et des accumulations de poissons en fonction des types de fonds marins.• Des améliorations sont nécessaires pour identifier certaines espèces et affiner l'indice écosystémique.Pour plus de détails, vous pouvez consulter le rapport complet ou visiter notre site web : https://www.cartosub.fr/fish/index.htm
Eoldist , a Web Application for Estimating Cautionary Detection Distance of Birds by Automatic Detection Systems to Reduce Collisions With Wind Turbines
No full textInternational audienceThe installation of automatic detection systems (ADSs) on operating wind energy facilities is a mitigation measure to reduce bird collisions. The effectiveness of an ADS depends on a combination of parameters, including the detection distance of the bird, its flight speed, and the time to complete the chosen action (e.g., turbine shutdown). We created a web application, Eoldist , to calculate cautionary detection distances required by an ADS, using bird flight speed and turbine shutdown time as input parameters. We compiled a database of the flight speeds of 168 Western Palearctic birds from a review of scientific literature supplemented by an analysis of unpublished GPS‐tracking datasets. To estimate turbine shutdown time, we conducted 137 field trials of experimental shutdown at seven wind farms and found that the duration to reach residual rotor speeds of 3 or 2 rotations per minute (rpm) was respectively 32.2 or 38.8 s on average. Based on this data, Eoldist allows the user to select a species from the database, wind turbine characteristics, and a residual rotor speed (3 or 2 rpm); it then calculates the time to reach the selected threshold and provides a distribution curve for the cautionary detection distance needed to prevent collision. This article includes examples of cautionary detection distances required for several species to demonstrate the sensitivity of key input parameters. Eoldist is freely available and should help the wind energy industry, ADS suppliers, and environmental agencies to define requirements for ADS bird detection that are compatible with the biology of the target species
Relevance of the synergy of surveillance and populational networks in understanding the Usutu virus outbreak within common blackbirds (Turdus merula) in Metropolitan France, 2018
No full textInternational audienceUsutu virus (USUV) was first isolated in Africa in 1959 and has since spread to and through Europe with a typical enzootic mosquito-bird cycle. In France, it was first detected in birds in 2015, but during summer 2018 the spread of USUV was particularly significant throughout the country, killing mainly common blackbirds (Turdus merula) and to a lesser extent great grey owls (Strix nebulosa), among other captive and non-captive wild bird species. Previous studies of USUV in France have focused on reconstructing pathways of introduction, but not on structural aspects of virus spread within the country. Data (RT-PCR of geolocated dead birds) on this 2018 outbreak were collected through both an event-based wildlife network named SAGIR and the health surveillance of the French-speaking Association of Zoo Veterinarians (AFVPZ). In addition, common blackbird populations could be monitored through another network (REZOP). Statistical analysis (spatial, temporal, spatiotemporal and environmental determinants) of the SAGIR and AFVPZ network data helped to highlight the early appearance of separate large clusters of USUV cases in mid-July 2018, the subsequent diffusion into smaller and secondary clusters at the end of August 2018, and a meanwhile enlargement of the first clusters with an increase in the number of cases. High human density (top 10.5% densest areas in France) and wetland concentration (top 19.3% most likely wetland areas) were significant factors in USUV case locations. Using generalised additive mixed models on REZOP data, we also highlighted the decline in common blackbird population trends in areas with medium and even more with high USUV pressure (areas defined based on SAGIR-AFVPZ data) following the 2018 outbreak (respectively -7.4% [-11.4; -3.9] 95% and -15.7% [-16.2; -9.1] 95% ). A large area (radius ∼150 km) in the centre and centre-west of France, and smaller areas in the south-east, north and north-east of France (each with a radius ∼ 50 km) were particularly affected. We conclude on the importance to work with synergistic networks to assess infection spread in wild bird species, as well as the negative impact of an emerging arbovirus. The responsiveness of such a network system could be improved by automating alerts
Potential impacts of floating photovoltaics on carbon fluxes across aquatic-terrestrial boundaries
No full textInternational audienceFloating photovoltaic (FPV) systems are a rapidly expanding renewable energy technology, yet their potential ecological impacts, particularly cross-ecosystem effects, remain poorly understood. This review synthesises current knowledge on organic matter (OM) dynamics and carbon (C) fluxes in lake ecosystems, examining how FPV installations may influence lake C cycling, insect emergence, and greenhouse gas (GHG) emissions. FPV can alter OM availability, shifting the balance between autochthonous and allochthonous inputs. In the short term, installation may increase OM deposition due to the rapid decline of primary producers and riparian vegetation removal. Long-term effects remain uncertain but could drive metabolic regime shifts toward autotrophy or heterotrophy, depending on initial lake conditions. These changes, combined with reduced oxygen and temperature, could significantly alter aquatic food webs, modify GHG fluxes, and alter C dynamics. Increased OM sedimentation could enhance GHG production, while reduced and delayed insect emergence may weaken C transfer to terrestrial ecosystems. Declines in emergent insect biomass could impact terrestrial predators, such as bats and birds, triggering cascading ecological effects. Overall, FPV may reshape carbon fluxes across aquatic–terrestrial boundaries, with impacts varying by FPV coverage and lake-specific factors. There is an urgent need for ecosystem-scale studies and long-term data to assess FPV-induced changes in C fluxes and mitigate its potential impacts on biodiversity and the global C cycle
Que fait l’État lorsque l’eau vient à manquer ?
No full textChapitre 6International audienceCe chapitre décrit la manière dont les services de l’État gèrent les situations de pénurie conjoncturelle. Il décrit les fondements hydrologiques des seuils de pénurie et rend compte des enjeux de conception, mise en œuvre et contrôle des mesures de restriction