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Inbreeding Depression Across Multiple Life‐History Traits in a Long‐Lived Mammal
No full textInternational audienceABSTRACT Inbreeding depression is widely recognised as a near‐universal phenomenon of high conservation concern, particularly as wild populations continue to decline. However, most research to date has focused on early life stages, leaving later‐life effects comparatively understudied, especially for wild populations of long‐lived species. The Pyrenean brown bear ( Ursus arctos ), characterised by a small population, high levels of inbreeding and conflicts with human activities, embodies the conservation challenges faced by many large mammals. We analysed 27 years of monitoring data to quantify inbreeding depression across multiple life stages on survival, reproduction and dispersal. Our results reveal strong inbreeding depression effects, particularly in early life stages, including a reduction in litter size and in natal dispersal distance. In adults, more inbred mothers exhibit lower cub survival. The cumulative effect of inbreeding, as measured by lifetime breeding success, also shows a negative impact. These findings highlight the necessity of assessing inbreeding depression across the entire life cycle to accurately evaluate its threat to population dynamics and viability. Such comprehensive assessments will become increasingly essential for wild plant and animal populations constrained by habitat destruction, human–wildlife conflict and harvesting pressures
Le métabarcodage des diatomées : un outil pour optimiser l’évaluation de la qualité des milieux aquatiques
No full textInternational audiencePour évaluer l’état écologique des rivières et des lacs, la directive-cadre sur l’eau (DCE) prévoit l’utilisation d’indicateurs biologiques (ou bio-indicateurs), tels que les diatomées, des microalgues utilisées depuislongtemps comme témoins de la qualité des eaux. Pour répondre à l’enjeu de densification de la surveillance environnementale, des études sont menées pour permettre d’inventorier les diatomées par séquençage à haut débit de leur ADN. Point sur les avancées de cette solution en devenir
Corpus de synthèses bibliographiques : Le drone appliqué à la conservation des espèces et à l’inventaire des oiseaux marins
No full textSeabirds are fascinating not only for their adaptation to the marine environment and their diversity but also for the symbolism associated with them. In many cultures, seabirds represent freedom and travel. In our modern societies, they are also considered indicators of the health of the ecosystems they inhabit.In addition to infectious diseases, colonies are subject to anthropogenic pressures—such as disturbance, pollution, and degradation of breeding sites—which can impact their development and long-term survival. As part of monitoring efforts, various protocols are implemented and adapted based on the species and the nesting context. In recent years, protocols based on drone usage have been increasingly employed by various stakeholders.While this method is promising, there is now a clear need for a standardized framework that stakeholders can rely on to conduct efficient (both economically and temporally), high-quality, and ethical monitoring. It is within this context that the TRIDA project was launched. This project was born from a collaboration between non-profit organizations (GIS Oiseaux Marins, GON - Groupement Ornithologique et Naturaliste du Nord Pas-de-Calais) and private or institutional partners, including the LISIC (a research laboratory specializing in computer science and signal/image processing) and the French Biodiversity Agency (OFB).Les oiseaux marins ou oiseaux de mer fascinent tant par leur adaptation au milieu marin, leur diversité mais aussi par la symbolique qui leur est associée. Dans de nombreuses cultures, les oiseaux de mer sont les symboles de liberté et du voyage. Dans nos sociétés, ils peuvent être également considérés comme le reflet de la santé des écosystèmes qu’ils fréquentent. Outre les maladies infectieuses, les colonies sont également soumises à des pressions anthropiques (dérangement, pollution, dégradation des sites de reproduction) pouvant avoir des effets sur leur développement et leur persistance. Dans le cadre de cette surveillance, différents protocoles sont mis en place et adaptés selon les espèces et le contexte de nidification. Ces dernières années, des protocoles basés sur l’utilisation de drone ont été de plus en plus employés par différents acteurs. Si cette méthode est intéressante, nous ressentons aujourd’hui le besoin de mettre à disposition un socle sur lesquels ces acteurs pourraient s’appuyer, afin de réaliser des suivis efficaces (économiquement et temporellement), qualitatifs et éthiques. C’est dans ce contexte que le projet TRIDA a pris son essor. Ce projet est né de la collaboration entre des structures associatives (Groupement d’Intérêt Scientifique Oiseaux Marins, Groupement Ornithologique et Naturaliste du Nord Pas-de-Calais) et privées (Laboratoire de recherche spécialisé en informatique et dans le traitement du signal et de l’image (LISIC), et de l’Office Français de la Biodiversité
Un nouveau Leptoctenopsis de la Martinique (Lepidoptera Geometridae Desmobathrinae)
No full textInternational audienceThe analysis of DNA barcodes from two specimens of Leptoctenopsis from the French Antilles recently revealed, against all expectations, the existence in Martinique of a previously unknown species; this species is named, described and illustrated in this article. Thus, L. tatochorda, described from Dominica at the beginning of the last century, flies in Guadeloupe but has been replaced, in Martinique, by the new species L. deknuydti. A distribution map is provided for each of the two species.L’analyse des codes-barres ADN de deux spécimens de Leptoctenopsis des Antilles françaises ont récemment permis de mettre en évidence, contre toute attente, l’existence en Martinique d’une espèce jusque-là inconnue ; celle-ci est nommée, décrite et figurée dans le présent article. Ainsi, L. tatochorda, décrit de la Dominique au début du siècle dernier, vole en Guadeloupe mais est remplacé, en Martinique, par la nouvelle espèce L. deknuydti. Une carte de répartition est fournie pour chacune des deux espèces
Calibrating an occupancy metric to monitor elusive territorial species at large scale: application to the grey wolf population in France
No full textInternational audienceMonitoring species in time and space is vital to identify changes in their status and to help define management measures to improve their conservation. Abundance is often used to monitor species at the population level. However, this metric is costly and requires intensive fieldwork, reaching limits in the context of elusive territorial species distributed over large areas. As a cost‐effective alternative, we developed a spatial metric to monitor such species using the grey wolf in France as a case study. We built a dynamic occupancy model for the wolf population in France and calibrated some parameters to turn site occupancy probabilities into occupied versus unoccupied sites. Then, we evaluated the performance of the model under different monitoring‐focus scenarios to catch, both at the national and local scales, trends in wolf demography in order to monitor the population and inform its status for the current and previous years. We calibrated the spatial metric to achieve the best trade‐off between avoiding false positives and false negatives. To do so, we aimed to match known occurrences of wolf permanent presence areas (packs and non‐packs) identified from naïve detection, as well as population sizes estimated from capture–recapture analysis. The best scenario performed efficiently to predict wolf presence and absence, as well as new permanent presence area occurrences. However, it detected less the disappearance of such areas, which are usually quickly recolonized when located in the core area of the species distribution. The spatial metric results were presented through three elements: annual maps of the predicted wolf presence, annual estimates of the total area occupied by the wolves at the national scale and evaluation of the changes in occupancy at a local scale from year to year. Practical implication . This spatial metric could be efficient to monitor species trends at a large scale while being more cost‐effective in data collection compared to capture–recapture analysis at such a large scale. While accounting for imperfect detection with presence–absence data, the different elements of the spatial metric also provide dynamic maps over the years, allowing for management processes at both national and local scales.Le suivi spatiotemporel des espèces est essentiel pour identifier des changements dans leur statut et définir des mesures de gestion visant à améliorer leur conservation. L'abondance est souvent utilisée pour le suivi des populations. Cependant, cette mesure est coûteuse et nécessite un travail de terrain intensif, atteignant des limites dans le contexte d'espèces territoriales faiblement détectables réparties sur de vastes zones. Nous avons développé une métrique spatiale, comme alternative plus efficiente, pour le suivi de ces espèces et présentons le loup gris en France comme cas d'étude. Nous avons construit un modèle d'occupation dynamique pour la population de loups en France et calibré certains paramètres pour transformer les probabilités d'occupation en sites occupés ou inoccupés. Ensuite, nous avons évalué la performance du modèle selon différents scénarios de suivi pour saisir, à la fois à l'échelle nationale et locale, les tendances de la population de loups et d'informer son statut pour l'année en cours et les années précédentes. Nous avons calibré la métrique spatiale afin d'obtenir le meilleur compromis entre les faux positifs et les faux négatifs. Pour ce faire, nous avons cherché la correspondance avec les zones de présence permanente des loups (meutes et non meutes) identifiées à partir d'une détection naïve, ainsi qu'avec les estimations de taille de population obtenues par modèles de capture‐recapture. Le meilleur scénario a permis de prédire efficacement la présence et l'absence des individus, ainsi que l'apparition de nouvelles zones de présence permanente. Cependant, il a moins bien détecté la disparition de ces zones, qui sont généralement recolonisées rapidement lorsqu'elles sont situées dans la zone cœur de la distribution de l'espèce. Les résultats de la métrique spatiale ont été présentés à travers trois éléments: des cartes annuelles de la présence prédite des loups, des estimations annuelles de la zone totale occupée par les loups à l'échelle nationale, et l'évaluation des changements dans l'occupation à l'échelle locale d'une année sur l'autre. Implication pratique . Cette métrique spatiale pourrait être efficace pour suivre les tendances de l'espèce à grande échelle tout en étant plus efficiente en ce qui concerne la collecte de données comparé aux modèles de capture‐recapture à une telle échelle. Tout en tenant compte de la détection imparfaite avec les données de présence‐absence, les différents éléments de la métrique spatiale fournissent également des cartes dynamiques au fil des ans, permettant d'informer le processus de gestion à la fois à l'échelle nationale et à l'échelle locale
Healthy forests safeguard traditional wild meat food systems in Amazonia
No full textInternational audienceAmazonia is the largest and the most species-rich tropical forest region on Earth , where hundreds of Indigenous cultures and thousands of animal species have interacted over millennia. Although Amazonia offers a unique context to appraise the value of wildlife as a source of food to millions of rural inhabitants, the diversity, geographic extent, volumes and nutritional value of harvested wild meat are unknown. Here, leveraging a dataset comprising 447,438 animals hunted across 625 rural localities, we estimate an annual extraction of 0.57 Mt of undressed animal biomass across Amazonia, equivalent to 0.34 Mt of edible wild meat. Just 20 out of 174 taxa account for 72% of all animals hunted and 84% of the overall biomass extracted. We show that this amount of wild meat can meet nearly half of protein and iron dietary requirements for rural peoples, along with a substantial portion of their needs for B vitamins (18–126%) and zinc (23%). However, wild meat productivity is likely to have decreased by 67% in nearly 500,000 km² of highly deforested areas of Amazonia. Furthermore, the availability of wild meat per capita decreases significantly in areas with higher human population, greater proximity to cities, and more extensive deforestation. These findings highlight the urgent need to preserve the forest to safeguard biodiversity and traditional wild meat food systems, which will be essential for ensuring Amazonian peoples’ well-being and achieving several of the United Nations Sustainable Development Goals
Projet Sainte-Foy-Tarentaise - Rapport d’étape 2025
No full textBilan des actions réalisées par Patrinat dans le cadre du projet Sainte-Foy-Tarentaise, entre 2021 et 2025
Drivers of variation in yellow crazy ant ( Anoplolepis gracilipes ) abundance and impacts on native fauna in an atoll ecosystem
No full textInternational audienceAbstract The yellow crazy ant ( Anoplolepis gracilipes ; YCA) is a widespread invader of islands across the Pacific and Indian oceans. This species can negatively affect native fauna and, at high abundances, ecosystem functions. Here we investigated the activity patterns, habitat preferences, and impacts of YCA on a Polynesian atoll (Teti'aroa). We found that YCA activity decreases with increasing substrate temperature, and that YCA favored substrates rich in coarse woody debris and Pisonia grandis trees. By comparing 46 sites varying in YCA abundance (including on non‐invaded islets) we found that ground nesting seabird (brown noddy, Anous stolidus ) presence and abundance decreased with increasing YCA abundance. Terrestrial hermit crab abundance also varied relative to YCA abundance; YCA abundance was negatively correlated with the presence of Coenobita perlatus and positively correlated with the presence of Coenobita rugosus (apparently due to a shared habitat preference for woody debris) and Coenobita brevimanus (potentially due to a shared preference for Pisonia forest). These impacts occurred despite the relatively low abundance of YCA during our surveys. In addition to identifying some drivers of variation in YCA abundance, this study provides an example of how YCA can impact the fauna of atoll islets with ground nesting seabirds. YCA control or eradication measures may be required in order to restore healthy seabird and terrestrial crab populations in this context
Patrimoine Géologique de Guyane française : des sites remarquables au service du territoire
No full textInternational audience« Bien commun de l'Homme et de la Terre », le patrimoine géologique constitue une interface privilégiée entre les géosciences et le grand public. Composé de sites, d'objets et d'histoires remarquables, que ce soit pour des aspects scientifiques, géomorphologiques ou encore culturels, une bonne connaissance de ce « géopatrimoine » est un véritable atout pour un territoire.Créée depuis peu, la Commission Régionale du Patrimoine Géologique de Guyane (CRPG) œuvre à inventorier les sites géologiques remarquables situés en Guyane française. Cette commission tâche également de contribuer à la large diffusion des connaissances ainsi rassemblées. Cela permet d'apporter un éclairage sur une histoire géologique encore trop méconnue et de donner accès à un matériel local pouvant aussi bien servir dans des perspectives d'enseignements que d'aménagements du territoire.Ce poster s'inscrit dans cette démarche de diffusion en se proposant de porter à connaissance les travaux récents de la CRPG de Guyane. L'objectif, outre d'ouvrir une fenêtre sur la géologie guyanaise au travers de quelques sites documentés, est de mettre en exergue comment l'inventaire du patrimoine géologique entrepris donne l'opportunité à toute une population de s'approprier son espace et de mieux appréhender la richesse géologique de son territoire
Impact of hunting modality on social contacts in wild boar populations across Europe
No full textInternational audienceAbstract Variation in animal social interactions emerges from individual responses to social and physical environments and plays a key role in shaping pathogen transmission, gene flow and information transfer. Although hunting can induce changes in contact patterns through disruption of the social environment, the non‐consumptive effects of hunting have not received much attention compared to demographic effects of harvest. We examined the effects of hunting activities on contact rates in wild boar, a species particularly exposed to social disruptions owing to its high sociality and intense management. Using GPS‐telemetry data from 21 populations across Europe (435 unique dyads), we analysed how hunting activities impact social contacts within and between wild boar groups while accounting for confounders potentially shaping contact heterogeneity (e.g. habitat productivity, population density, predation, seasonality, individuals' sex and spatial proximity). We found that drive hunts, but not individual hunts, lowered contact rates within wild boar groups. Contact rates tended to be negatively related to drive hunts' frequency. We did not observe the effect of hunting mode on contact rates between members of different groups, which was mainly shaped by a positive relationship with spatial proximity. Contact probability among females from different groups was lower compared to male–male or mixed‐sex dyads. Synthesis and applications . Our study showcases how hunting disturbance influences social contact rates in a group‐living wild mammal. Along with other biotic and abiotic drivers, hunting modality plays a significant role in shaping intra‐group, but not inter‐group, contacts. Reduced group cohesion induced by drive hunts could negatively impact survival, foraging efficiency, and resource utilization. Hunting management could mitigate those negative impacts by spatially spreading driven areas throughout the season and targeting different groups each time. Our results suggest that hunting disturbances should not enhance disease spread through increased inter‐group contacts. Yet, hunting‐induced escape movements could still pose a risk of transmission into new areas. Inter‐group connectedness appeared to be maintained predominantly by males which could be targeted if disease transmission was a major management objective. Spatial proximity between individuals can be a reliable index of the amount of direct contacts within wild boar populations