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Mapping and Conservation of Cold-Water Corals in the Lacaze-Duthiers Canyon for Transboundary Management
No full textWOS:001505283000001International audienceCold-water coral habitats (Madrepora oculata and Desmophyllum pertusum) were mapped in the Lacaze-Duthiers Canyon, within the “Parc naturel marin du golfe du Lion” (northwestern Mediterranean), to support the creation of a strongly protected area for these vulnerable marine ecosystems (VME). The analyses are based on ROV data, high-resolution digital terrain models (5–10 m), hydrodynamic model simulations (currents, temperature, salinity from SYMPHONIE), and fishing pressure data derived from Vessel Monitoring System (VMS) and Automatic Identification System (AIS) fishing data. Habitat models indicate coral habitats are mainly on the western canyon flank (250 to 600 m depth). Desmophyllum pertusum predominantly colonizes gentle slopes at cliff bases, while M. oculata is found on steeper slopes, and the eastern flank. Some western flank areas support both species. Direct impacts from fishing activities, including lost longlines and nets entangled with corals, were observed. In addition, bottom trawling at the continental shelf edge induces sediment resuspension, potentially smothering the underlying coral ecosystems in the canyon. This study recommends enhancing fishing activity monitoring by increasing VMS positioning transmission frequency across European countries and facilitating the combination of VMS and AIS data to derive higher-resolution fishing effort and footprint assessments. Protection should prioritize canyon flanks and the surrounding continental shelf, not just the canyon itself, to mitigate fishing pressure. Tailored management measures are needed for sensitive habitats. Creating a strongly protected area will require crossborder cooperation (France, Spain) to ensure the effective conservation of these fragile ecosystems
What is the evidence for the impacts of airborne anthropogenic noise on wildlife? A systematic map update
No full textInternational audienceBackground. Noise from human activities is a major concern for wildlife, with numerous studies demonstrating significant impacts. In 2020, Sordello and collaborators systematically mapped the literature on the impacts of anthropogenic noise on wildlife up to 2018. Since then, research on this topic has continued to grow steadily. To reflect these developments, we present an updated systematic map encompassing studies published through 2023, exclusively focused on airborne noise.Methods. The method follows the a priori protocol published by Sordello and collaborators in 2019. The present work includes literature searches by Sordello et al. (2020) and a complementary search update performed on 2020–2023. Literature from Sordello et al. (2020) was re-screened to align with the updated scope, now restricted to airborne noise. For the update, both peer-reviewed and grey literature were retrieved from Scopus, the Web of Science Core Collection, and Google Scholar. Titles, abstracts, and full texts were screened by eligibility criteria, and included articles were coded. We included all wild terrestrial or semi-aquatic taxonomic groups, and anthropogenic noise from various sources (e.g., transport, urban, recreational) was considered, along with all relevant outcomes (e.g., behaviour, reproduction, physiology).Review findings. Sordello et al. (2020) provided 1,794 articles, of which 466 were retained after re-screening the full texts. The search update yielded 13,698 citations, resulting in 397 relevant articles. A total of 863 articles were included in the map (665 primary research studies, 196 reviews and meta-analyses, 2 modelling papers). Most studies have been conducted in the USA. Birds are the most studied taxonomic group (64%), followed by mammals (22%); transportation is the most studied source of noise (43%), followed by urban noise (24%); behaviour (27%) and vocal communication (25%) are the most studied outcomes.Conclusion. The map represents an updated state of the art on the impact of airborne anthropogenic noise on wildlife and can serve as a starting point for further syntheses of evidence. Three clusters of knowledge were What is the evidence for the impact
Effets de la structure forestière sur l’endoparasitisme chez le chevreuil Capreolus capreolus
No full textInternational audienceParasitic infection by endoparasites is heterogeneous within a population. Such heterogeneity in parasitic status among individuals depends in particular on differences in their susceptibility to infection and in the habitats and resources used by the individuals. While several studies have aimed to identify individual factors and, mostly at large spatial scales, environmental factors that influence endoparasitism in wild populations, we aim in this study to investigate the influence of habitat quality (vegetation type, resource availability) on parasite burden within a population of roe deer living in a heterogeneous forest. We collected 1,469 fecal samples to measure the parasite burden on 952 roe deer captured between 1996 and 2020 in Chizé (France), a study site stratified into two contrasting sectors in terms of vegetation structure and resource quality. We quantified the effect of the sector on parasitism after considering the possible influences of age, sex, body mass and Julian date. The prevalence of parasitism was higher in individuals living in the poorer sector, but the intensity of the parasite burden was not influenced by the sector. These results suggest that within a host population, parasite infection risk would not be the same everywhere, probably due to differences in resource availability, vegetation species and density of host, showing the need to study parasitism at fine scales.L’infection parasitaire par les endoparasites est hétérogène au sein d’une population. Cette hétérogénéité du statut parasitaire entre individus dépend notamment des différences de sensibilité à l’infection et des habitats et ressources utilisés par les individus. Alors que plusieurs études ont cherché à identifier les facteurs individuels et, principalement à grande échelle spatiale, les facteurs environnementaux influençant l’endoparasitisme dans les populations sauvages, nous souhaitons, dans cette étude, étudier l’influence de la qualité de l’habitat (type de végétation, disponibilité des ressources) sur la charge parasitaire au sein d’une population de chevreuils vivant dans une forêt hétérogène. Nous avons collecté 1 469 échantillons fécaux afin de mesurer la charge parasitaire sur 952 chevreuils capturés entre 1996 et 2020 à Chizé (France), un site d’étude stratifié en deux secteurs contrastés en termes de structure de la végétation et de qualité des ressources. Nous avons quantifié l’effet du secteur sur le parasitisme après avoir pris en compte les influences possibles de l’âge, du sexe, de la masse corporelle et de la date julienne. La prévalence du parasitisme était plus élevée chez les individus vivant dans le secteur le plus pauvre, mais l’intensité de la charge parasitaire n’était pas influencée par le secteur. Ces résultats suggèrent qu’au sein d’une population hôte, le risque d’infection parasitaire ne serait pas le même partout, probablement en raison de différences de disponibilité des ressources, d’espèces végétales et de densité d’hôtes, ce qui souligne la nécessité d’étudier le parasitisme à des échelles fines
EU Grassland Butterfly Indicator 1990-2023 Technical report
No full textExecutive Summary Butterflies have been systematically monitored in Europe for several decades using standard protocols that are now adopted in over 30 countries. Butterflies are ideal biological indicators: they are well-documented, measurable, sensitive to environmental change, occur in a wide range of habitat types, represent many other insects, and are popular with the public because of their beauty. Records from over 6,000 standardised butterfly transects are gathered into a central database as part of the European Butterfly Monitoring Scheme (eBMS) run by Butterfly Conservation Europe (BCE) and the UK Centre for Ecology and Hydrology (UKCEH). The database provides trends on individual species which can be combined to give trends for different habitats. In this report, trends for 17 species have been used to generate an updated Grassland Butterfly Index (GBI) for 1991-2023, using data from all 27 EU countries. The GBI is specifically mentioned in the EU Nature Restoration Regulation (NRR) in article 11 on the Restoration of Agricultural ecosystems as one of the possible indicators that should be measured until the satisfactory levels as set in accordance with Article 14(5) are reached. In practice, for those Member States choosing the GBI as an Indicator, under NNR Article 11, this means that 2025 will be the first year for this indicator. The EU Grassland Butterfly Index shows a decline of just over 50% since 1991. In North-western Europe, the decline is primarily attributed to habitat loss resulting from the intensification of agricultural grasslands and nitrogen deposition in nature reserves. In Northern (Scandinavia, Finland and the Baltic states), Eastern and Southern Europe, the abandonment of grasslands is also a strong driver as shrubs and secondary forest encroachment result in less habitat for grassland butterflies. The decline observed over the last 33 years probably reveals only part of the historical decline in grassland butterflies, as many populations were extirpated from the landscape before 1990 The GBI is the Indicator on the EU Dashboard Target 5, for evaluating progress with improving agroecosystems for biodiversity. It is also part of the EU Sustainable Indicator set, for evaluating the implementation of the Global Biodiversity Strategy. This technical report provides an important message from scientists to policy makers - that butterflies are still declining at an alarming rate across the EU and that urgent action is required to protect and restore habitats to reverse this trend, not only for butterflies but also for other wild insect pollinators and their ecosystem services. The completion and appropriate management of the Natura 2000 network across Europe is a crucial step in helping grassland butterflies. Restoration and creation of landscapes with mosaics of habitats, both within and outside Natura 2000 areas, are essential to protect grassland butterflies in the EU. We are grateful to all the many thousands of volunteer butterfly recorders who contribute their records to this important database, to the many BMS schemes, co-ordinators and funders who support the work, and to the EU for funding the EBMS through the EMBRACE project
From traditional taxonomy to the inclusion of web applications to improve diatom-based ecosystem's health assessment
No full textInternational audienc
Geographical disparities in nitrate trends: Mapping transfer times in French aquifers
No full textInternational audienceThe Water Framework Directive (WFD, EC/2000) and its daughter directive (EC/2006) aim to limit the nitrates from agricultural sources that pollute ground and surface waters, reverse the upward concentration trends, and prevent further contamination. Several programmes of measures have been implemented for this purpose but their effectiveness varies across geographical sectors, not only because of the effective reduction of contamination sources but also because of the variability of environmental responses. Evaluating the effectiveness of programmes of measures can therefore be challenging, particularly regarding groundwater quality
Note d'appui scientifique et technique relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis
No full textAnses. (2025). Note d’AST relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis (saisine 2024-SA-0146). Maisons-Alfort : Anses, 19 p.L’Anses a été saisie le 19 juillet 2024 par la Direction générale de l’alimentation (DGAL), la Direction de l’eau et de la biodiversité (DEB) et la Direction générale de la prévention des risques (DGPR) pour la réalisation de l’appui scientifique et technique concernant une réponse préliminaire à la deuxième étape de la saisine 2024-SA-0146 relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose chez le Bouquetin des Alpes (Capra ibex) dans les massifs du Bargy et des Aravis.La France est reconnue officiellement indemne de brucellose bovine depuis 2005, et de brucellose ovine et caprine depuis 2014 sur le territoire hexagonal, à l’exception du département des Pyrénées-Atlantiques (64) reconnu officiellement indemne en mars 2021. En 2012, un foyer bovin de brucellose à Brucella melitensis a été détecté en Haute-Savoie sur le massif du Bargy et a conduit à la découverte d’un réservoir de Brucella melitensis dans lapopulation de bouquetins de ce massif.Depuis 2012, sur le massif du Bargy, des campagnes de gestion par capture et euthanasie des bouquetins séropositifs, ainsi que des tirs, se sont succédé tous les ans. En 2013, des captures de bouquetins avec tests sérologiques ont également été conduites sur les massifs des Aravis et de Sous-Dîne, voisins du Bargy.La surveillance des espèces de ruminants sensibles chassables, i.e. le Chamois (Rupicapra rupicapra), le Cerf élaphe (Cervus elaphus) et le Chevreuil (Capreolus capreolus), est également mise en place depuis 2012 avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur la partie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à travers le réseau SAGIR [1] est renforcée [2].Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis de faire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses 2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovins domestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovin laitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses 2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pour évaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population de bouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avis l’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion à l’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situation dans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur le massif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne (femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022 afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et les mesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis de l’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles données recueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicité le 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence a été rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pour l’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les captures pouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus « fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de la brucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la lumière des premiers résultats des nouveaux travaux de modélisation qui ont redémarré cette année.Il s’agira notamment :- d’établir des recommandations chiffrées et qualitatives (secteurs et populations à cibler prioritairement, etc.) en termes de captures et de tirs dans chacun des deux massifs, pour le printemps 2025,- d’évaluer l’intérêt des recaptures, et d’établir le cas échéant des recommandations chiffrées, pour les massifs du Bargy et des Aravis, - d’envisager la nécessité d’élargir la zone de surveillance et de lutte à d’autres massifs,- d’identifier le cas échéant d’autres mesures de lutte non mises en œuvre jusqu’alors,- de fournir des recommandations pratiques de biosécurité, applicables dans les contraintes topographiques alpines, pour protéger dès la montée en estive de 2025 les élevages de ruminants de l’infection à B. melitensis (par exemple effarouchement des bouquetins avant la mise en alpage des ruminants domestiques, etc.). Ces recommandations pourront s’appuyer sur le rapport d’expertise relatif à l’occupation spatiale des bouquetins produit par l’OFB et VetAgroSup à la demande de la DGAL en juin 2023, et sur une sollicitation de l’Inrae. »• Étape 3 : « d’établir des recommandations en termes d’effort de lutte annuel à mettre en œuvre pour atteindre une prévalence faible, favorable à l’extinction de l’infection, à l’horizon 2030. Ce travail pourra éventuellement s’appuyer sur les retours d’expériences d’extinction de la brucellose dans des populations d’animaux sauvages dans d’autres pays ».Appui scientifique et technique de l’AnsesDemande n° « 2024-SA-0146 »Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129page 2 / 19chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur lapartie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale deschasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à traversle réseau SAGIR1 est renforcée2.Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis defaire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovinsdomestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovinlaitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pourévaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population debouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avisl’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion àl’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situationdans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur lemassif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne(femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et lesmesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis del’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles donnéesrecueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs duBargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicitéle 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans lespopulations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence aété rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pourl’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les capturespouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus« fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de labrucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la[1] SAGIR : réseau de surveillance des maladies infectieuses des oiseaux et des mammifères sauvages terrestres.Il existe depuis 1955 et repose sur un partenariat entre les fédérations des chasseurs et l’Office français de labiodiversité.[2] Dépistage systématique de la brucellose sur les différents cadavres collectés dans le cadre du dispositif SAGIRclassique sur les départements de Savoie et Haute-Savoie et renfort de collecte avec dépistage systématique descadavres de cerfs, chevreuils, chamois, mouflons et bouquetins dans les massifs du Bargy, des Aravis et de Sous-Dine.[3] La séroprévalence est la proportion d’animaux présentant des anticorps contre l’agent de la brucellose.(Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129
On evaluating the efficiency of the delta-lognormal mean estimator and predictor
No full textA variable taking positive values from a lognormal distribution and null values with a given probability is distributed according to the so-called delta-lognormal distribution. Two situations arise depending on whether the data are regarded as a random sample from an infinite population (superpopulation) or from a finite population, itself considered as a random sample from a superpopulation. In the case of an infinite population, estimating the mean can be accomplished using a uniformly minimum-variance unbiased estimator (UMVUE). Likewise, the prediction of the mean in the case of a finite population may be based on the UMVUE. In both cases, one expects a gain in precision when taking into account the shape of the distribution by relying on the UMVUE rather than on the sample mean, which is a nonparametric estimator (or predictor).1. For the infinite population case, the relative efficiency results presented in this article are more complete and more accurate than those published so far.2. The article fills a gap regarding the question of relative efficiency in the case of a finite population.3. Calculations were performed using the exact expression for the variance of the UMVUE of the mean, expressed in terms of the confluent hypergeometric limit function
