Portal of Scientific Journals of UEU
Not a member yet
1968 research outputs found
Sort by
Heterogeneotasunaren analisi azkar eta automatizatua krio-mikroskopia elektronikoan
No full textUnderstanding structural heterogeneity is a key challenge in Cryo-Electron Microscopy (Cryo-EM). We propose a novel method that leverages the natural similarity between neighboring projection directions to perform a localized Principal Component Analysis (PCA) in directional subsets of the data. These local analyses are then globally synchronized using Orthogonal Group Synchronization, a novel field in applied mathematics. Our approach is designed to pose very few execution parametes, reducing the need for extensive user tuning. The parameters involved have clear physical and statistical interpretations, enhancing their usability and transparency. In addition, it is also computationally efficient, achieving significantly faster execution times compared to conventional heterogeneity analysis methods. We validate our approach on both simulated and experimental datasets exhibiting compositional and conformational heterogeneity, demonstrating its effectiveness in capturing structural variability.Krio-Mikroskopia Elektronikoan (CryoEM) laginaren egitura heterogeneotasuna erronka nagusia da. Honetarako, ondoko norabideetatik proiektatutako irudien arteko antzerakotasunaren abantaila hartzen duen metodo bat proposatzen dugu. Honetarako, Osagai Nagusien Analisia (PCA) burutzen da datuen norabide-azpimultzoekin. Analisi lokal hauek modu globalean sinkronizatzen dira Talde Ortogonalen Sinkronizazioaren bidez, matematika aplikatuen arloko eremu berri bat. Heterogeneotasun analisi ikuspegi honek parametro gutxi behar ditu exekutatzeko, eskuzko doipenak murriztuz eta erabilgarritasuna indartuz. Honez gain, parametroek zentzu fisiko-estadistikoa dute, hauen ulergarritasuna eta gardentasuna bermatuz. Beste alde batetatik, algoritmoa konputazionalki oso eraginkorra da, ohiko heterogeneotasun-analisi metodoekin alderatuta exekuzio-denbora nabarmen azkarragoak lortuz. Metodoa balioztatzeko, heterogeneotasun konposizionala eta konformazionala erakusten duten datu-simulazio eta esperimentaletan probatzen dugu, egitura-aldakortasuna argitzeko duen eraginkortasuna erakutsiz
EAEko Derrigorrezko Bigarren Hezkuntzako curriculumaren aukerak eta hutsuneak diseinu konpetentzien garapenean STEM hezkuntzaren testuinguruan
No full textThis study explores the possibilities presented by the secondary education curriculum in the Basque Autonomous Community for developing design competences in the context of STEM education, based on the framework defined by Rusmann and Ejsing-Dunn (2022). Design competences refer to the skills, knowledge, and abilities necessary to identify and address complex problems through design processes. The findings indicate that the curriculum defined by Decree 77/2023 offers several opportunities, such as in empathy, modeling, and process management. However, gaps have also been identified, particularly in problem definition and ideation strategies. In order to continue this line of research, it is proposed to measure the design competences of Basque Autonomous Community students to compere with the findings of this study.Ikerlan honetan, Euskal Autonomia Erkidegoko (EAE) Derrigorrezko Bigarren Hezkuntzako curriculumak, STEM hezkuntzaren testuinguruan, Rusmann eta Ejsing-Duun autoreen (2022) markoan definitutako diseinu konpetentziak garatzeko eskaintzen dituen aukerak aztertu dira. Diseinu konpetentziak, diseinu-prozesuen bidez, arazo konplexuak identifikatu eta horiei aurre egiteko behar diren gaitasunak, ezagutzak eta trebetasunak dira. 77/2023 Dekretuak zehaztutako Curriculumak hainbat aukera eskaintzen dituela ondorioztatu da, hala nola, enpatia, modelaketa eta prozesuen kudeaketari dagokienez. Hala ere, hutsuneak ere identifikatu dira, batez ere, arazoen definizioan eta ideaziorako estrategietan. Etorkizunera begira, EAEko ikasleen diseinu konpetentziak neurtzea, eta azterlan honekin alderatzea proposatzen da, ikerlerro honekin jarraitzeko
Molekulen propietateen iragarpena sare neuronalen bitartez datu-urritasun egoeretan
No full textWe present a Recurrent Neural Network (RNN) that predicts molecular properties only based on the molecular structure. The SMILES representations of the molecular structures are fed into the algorithm as an input. In general, Artificial Neural Networks work well when they have plenty of input data available, but they perform poorly under data scarcity scenarios. In this work, we specially focus on giving a solution to the problem of data scarcity and we have analyzed different approaches to tackle it. Our hypothesis is that training the model with similar data will improve the results. The analyzed similarities are of distinct nature. On the one hand, we have considered string similarities of the SMILES encodings. On the other hand, we have computed the similarities of the feature vectors.Molekulen egitura kimikotik abiatuta haien propietateak iragartzen dituen sare neuronal errepikari (RNN) bat aurkezten da lan honetan. Egitura kimikoak SMILES errepresentazio molekularrarekin kodifikatzen dira sareko sarrera datu bezala erabiltzeko. Oro har, sare neuronal artifizialek emaitza onak ematen dituzte datu askorekin entrenatzen direnean, baina arazoak izaten dituzte datu-urritasun egoeretan. Beraz, lan hau datu-urritasun egoeretan zentratua dago eta horri aurre egiteko hainbat bide aztertzen ditu. Gure hipotesiaren arabera, algoritmoa antzekoak diren datuekin entrenatuz gero, emaitzak hobetu egingo lirateke. Horrela, datuen arteko mota ezberdinetako antzekotasunak aztertu dira; hala nola, SMILES-en arteko antzekotasunei, bai eta ezaugarri bektoreen arteko antzekotasunei erreparatu zaie
RFID teknologiaren eraginkortasuna ugaztun erdiurtarren jarraipenerako
No full textDuring this century, using RFID technology to study the ecology of river vertebrates, mainly fish, has become increasingly important. This new technology has proven effective in studying their spatial ecology and habitat selection. In our case, we used two types of antennas that we made ourselves to detect the Pyrenean desman: barrier antennas and latrine antennas. Although this method has been tested on other animals, its effectiveness has not been determined for research on semi-aquatic mammals, nor how it varies over a year. Here, we have added RFID technology to the previously tested artificial latrine methodology. The results showed that the barrier antennas have a very high detection rate when they cover the entire width of the watercourse. The number of detections is not determined by the variability of the flow of the stream, and we have shown that it can be detected throughout the year. Finally, combining these two detection methods has enabled us to obtain the necessary information, such as the proportion of false negatives. This method opens new possibilities for increasing knowledge about this endangered species, which is very difficult to detect.Mende honetan, RFID teknologiaren erabilera, irrati uhinen bitartez distantzian den objektu baten identikazioa eta jarraipena ahalbidetzen duen sistema, ohikoa bilakatu da erreketako ornodunen ekologia aztertzeko, batez ere arrainetan. Teknologia berri honek bere eraginkortasuna frogatu du haien ekologia espaziala eta habitataren hautespenak aztertzeko. Gure kasuan, bi antena mota erabili ditugu guk eraikitakoak, ur-satorra detektatzeko: hesi-antenak eta kakatoki-antenak. Hemen aurretik testatutako kakatoki artifizialen metolodologiari, RFID teknologia batu diogu, kakatokien erabilerari buruzko informazioa sakontzeko. Hesi-antenek detekzio maila oso altua dute baldin eta errekaren zabalera osoa estaltzen badute. Edozein dela emaria, ur-satorrak urte osoan zehar detektatzen ahal ditugu. Azkenik, bi detekzio metodologi horien bateratzeak, kakatoki-antenek eta kakatoki artifizialak, markatze jarrerari buruzko beharrezko informazioak eskuratzea bermatu digu, adibidez, negatibo faltsuen proportzioa azaleratuz. RFID teknologiaren erabilerak, berez detektatzen oso zaila den espezie mehatxatu honi buruzko ezagutzak areagotzeko aukera berriak sortzen ditu
IR(A)UTEN: Altsasuko Santa Ageda festaren brodatuak aztertzen
No full textIn this article we will examine the materiality of Santa Águeda celebration of Altsasu (Navarre), focusing on the clothing and embroidery. It´s a celebration that´s undergone a lot of changes, and it was originally a women´s celebration. One of their occupations was coaxing, embroidery, etc… holding meetings for this purpose. The celebration gradually changed and the male presence incresed. The meetings went to workshops and then to few individuals. Embroidery reflects the social, cultural and individual evolution of the celebration.Artikulu honetan, Altsasuko (Nafarroa) Santa Ageda festaren materialitatea aztertuko da, batez ere, jantzietan eta brodatuetan arreta jarriz. Hainbat aldaketa jasan dituen festa da, eta jatorrian emakumezkoek ospatzen zuten festa zen. Bertan, haien zereginetako bat ardazketa, brodatzea eta abar ziren, horretarako bilkurak eginez. Festa gradualki aldatzen joan eta gizonezkoen presentzia handiagoa egin zen. Bilkurak tailerretara pasa ziren eta geroago banako bakar batzuetara. Brodatuen bidez, festaren bilakaera soziala, kulturala eta indibiduala islatzen zaigu
Modalitate anitzeko ereduen eta hizkuntza ereduen zentzumen espazialaren azterketa
No full textUnderstanding spatial commonsense, our knowledge about physical space and relationships, is a fundamental aspect of human cognition. This investigation evaluates and compares various current models to determine their understanding of spatial commonsense reasoning. Three types of models are taken into account in this work: text-only models, multimodal models with text inputs, and text-to-image models generating visual representations from text. Spatial commonsense is something very simple to understand for humans, but it has been a tough task for language models in the past. Our research shows that current models have improved significantly at these kinds of tasks. Ultimately, this work contributes to the advancing development of AI systems in reasoning about spatial relationships, which is an essential step toward human-level understanding of the world.Zentzumen espaziala, espazio eta harreman fisikoari buruzko gure ezagutza, giza kognizioren funtsezko ezaugarria da. Ikerketa honek gaur egungo hainbat eredu ebaluatu eta alderatzen ditu, zentzumen espazialari dagokionez. Hiru eredu mota hartzen dira kontuan: testu hutseko ereduak, sarrera bezala testua erabiltzen duten modalitate anitzeko ereduak, eta testutik abiatuta irudiak sortzen dituzten ereduak. Zentzumen espaziala gizakiontzat ulertzeko oso erraza den alderdi bat bada ere, hizkuntza ereduentzat zeregin zaila da. Ikerketa honen emaitza gisa, aurkitu dugu egungo ereduek nabarmen hobetu dutela horrelako zereginetan BERT edo RoBERTa bezalako eredu ez hain berriekin alderatuta. Azken finean, ikerketa honekin espazio-harremanei buruzko arrazoiketan adimen artifizialeko sistemen garapena azpimarratzen dugu, mundua giza mailan ulertzeko funtsezko urratsa dena
NEDD4 eta UBE3Aren arteko elkarrekintzaren azterketa Angelman sindromearen testuinguruan
No full textAngelman syndrome (AS) is a complex and severe neurodevelopmental disorder that results from the loss of UBE3A E3 ubiquitin-protein ligase function in the brain. Knowing the identity and ubiquitination patterns of UBE3A substrates is necessary for a better understanding of AS and the search for new therapeutic strategies. With the expectation that the results obtained in the validation of the potential substrate EAAT2 can be explained by investigating the relationship between NEDD4 and UBE3A, and these results may contribute to a better understanding of AS, the aim of this work is to validate NEDD4 as an interactor and substrate of UBE3A in human HEK293T cells. Although it has not been possible to explain the interaction between NEDD4 and UBE3A, there are sufficient results to continue the study.Angelman sindromea (AS) neurogarapen nahasmendu konplexu eta larria da, garunean UBE3A E3 ubikitina-proteina ligasaren funtzioaren galeraren ondorioz sortzen dena. UBE3Aren substratuen identitate eta ubikitinazio patroiak ezagutzea beharrezkoa da AS hobeto ulertu eta estrategia terapeutiko berriak bilatze aldera. EAAT2 substratu potentzialaren balioztatzean lorturiko emaitzak NEDD4 eta UBE3Aren arteko erlazioa ikertuz azal daitezkeelakoan, eta honek AS hobeto ulertzen lagun dezakeelakoan, ikerketa lan honen helburua NEDD4 UBE3Aren interaktore eta substratu gisa HEK293T giza zeluletan balioztatzea da. NEDD4 eta UBE3Aren arteko elkarrekintza azaltzea lortu ez den arren, lortutako emaitzek ikerketarekin jarraitzeko beharra erakusten dut
SNNorlax: Pultsu bidezko Neurona-sareak azeleratzeko hardware plataforma
No full textSpiking Neural Networks (SNN) are a type of Artificial Neural Network (ANN) that closely mimic the way biological neural networks work. Unlike traditional ANN, SNNs encode information as discrete spikes leading to improved performance and a high degree of energy efficiency ratio. However, most of the current hardware platforms do not take advantage of the event driven nature of SNN and have poor scalability when handling larger size and more complex networks. To solve this problems, this paper proposes a new hardware acceleration platform (SNNorlax), a highly configurable FPGA co-processor that supports any configurable network size and synaptic connections.(NSA) mota bat dira. NSA tradizionalek ez bezala, PNS-ek informazioa pultsu diskretuetan oinarrituta prozesatzen dute, errendimendu altuagoa eta eraginkortasun energetiko nabarmenagoa lortuz. Hala ere, gaur egungo hardware plataforma gehienek ez dute aprobetxatzen PNS-en gertaera bidezko izaera eta horrek sare handiak eta konplexuak prozesatzea oztopatu dezake. Arazo horiei aurre egiteko, artikulu honetan Ate-matrize programagarrietan (FPGA) oinarritutako hardware azelerazio plataforma berria (SNNorlax) aurkezten da, sarearen tamaina eta sinapsi konexioak konfiguratzeko maila altua duena
Lurzoru erabileraren eta ibilgu aktiboaren arteko harremana eta bilakaera azken mende erdian Ebro arroan
No full textThe EbroHydromorph project aims to study the morphological changes in the middle Ebro River over the last few decades, with particular focus on sediment transport. In the first phase, historical changes in land use within the basin are being analyzed to understand their impact on the hydrogeomorphological conditions of the river courses. Land use-land cover from the mid-20th century has been digitized, and this cartography has been compared with the 2014 land use-land cover maps. Preliminary results show a significant reduction in active channel surfaces, whereas forest, grassland and artificial areas have increased.EbroHydromorph proiektuak Ebro ibaiaren erdiko tartean azken hamarkadetan izandako aldaketa morfologikoak aztertzea du helburu, bereziki sedimentuen garraioan jarrita arreta. Lehen fasean, arroko lurzoruaren erabileren aldaketa historikoak aztertuko dira, ibaietako baldintza hidrogeomorfologikoetan izandako eragina ulertzeko. Ebro goi eta erdi arroaren XX. mendearen erdialdeko lurzoru erabilerak eta estaldurak digitalizatu egin dira, eta kartografia hori 2014ko lurzoru estaldura eta erabilerarekin alderatu da. Aurreneko emaitzek adierazten dute ibilgu aktiboaren azalerak beherakada nabarmena izan duela, baso, belardi eta urbanizatutako eremuek gora egin duten bitartean
Hizkuntzetarako neurona espezifikoak LLMetan?
No full textLarge Language Models (LLM) are revolutionary artificial intelligence neural networks with billions of parameters. This study investigates language-specific neurons in LLMs, focusing on their adaptation to Basque. Using the Language Activation Probability Entropy (LAPE) metric, we identify neurons in Llama-3.1-8B and its Basque-adapted variant (Llama-eus-8B) that are specialized for Basque, French, Spanish, and English. Experiments reveal that language-specific neurons predominantly cluster in final layers, with Basque showing the highest count. Perplexity analysis indicates that deactivating these neurons disproportionately affects their target languages when these are not predominant in the model, validating their specificity. These findings highlight the interplay between language adaptation and neuron distribution, offering insights for optimizing LLMs for low-resource languages.Hizkuntza Eredu Handiak (LLM) adimen artifiziala irauli duten milaka milioi parametroko neurona-sareak dira. Ikerketa honetan LLMen hizkuntza jakinetarako neurona espezifikoak aztertzen dira, euskaran fokua ezarriz. Hizkuntza Aktibaziorako Probabilitate Entropia (LAPE) metrika erabiliz, Llama-3.1-8B ereduko eta euskarara egokitutako aldaerako (Llama-eus-8B) euskara, frantses, gaztelera eta ingeles hizkuntzetan espezializatutako neuronak identifikatzen ditugu. Esperimentuetan ikusten da neurona espezifikoak ereduaren kanpoaldeko geruzetan pilatzen direla gehienbat, eta euskarak dituela neurona espezifiko gehien. Perplexity-a erabiliz egindako analisiak erakusten du neurona horiek desaktibatzeak eragin berezia duela helburuko hizkuntzan ereduko hizkuntza nagusia ez den kasuetan, neuronen espezifikotasuna baieztatuz. Aurkikuntza horiek horrelako ereduak beste hizkuntzetara egokitzearen eta neurona espezializatuen arteko erlazioa erakusten dute, eta LLMak baliabide urriko hizkuntzetara era optimoan egokitzeko bideei buruzko informazioa ematen dute