Redape – Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa
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Bioteste para medição da toxicidade do farelo de mamona (Ricinus communis) utilizando o inseto Callosobruchus maculatus.
No full textEstes dados foram coletados em um estudo para desenvolvimento de um bioteste para medição da toxicidade causada pela ricina no farelo de mamona (Ricinus communis) utilizando o inseto Callosobruchus maculatus (Coleoptera). As amostras de farelo de mamona foram coletadas em três diferentes fases do processo de extração de óleo em uma indústria. Antes da coleta destes dados, o bioteste foi otimizado por vários ensaios buscando a otimização dos protocolos de multiplicação do inseto, de preparação do extrato, da impregnação das sementes e daescolha das variáveis a serem coletadas. O conjunto de dados contém apenas a contagem de insetos adultos emergidos após a incubação em sementes impregnadas com extratos de farelo de mamona. A quantidade de insetos emergidos escolhida como a variável mais relevante e fácil de medir.This dataset was collected in a study to develop a biotest to measure the toxicity caused by ricin in castor meal (Ricinus communis) using the beetle Callosobruchus maculatus (Coleoptera). The castor meal samples were collected at three different stages of the oil extraction process in an industry. Before collecting these data, the biotest was optimized by several tests seeking to optimize the insect multiplication protocols, extract preparation, seed impregnation, and the choice of variables to be collected. The data set contains only the count of adult insects emerged after incubation in seeds impregnated with castor bean meal extracts. The count of emerged insects was chosen as the most relevant and easy-to-measure variable
Circuito genético funcional para a ativação da expressão da endonuclease I-Ceul para o desenvolvimento de sistemas biológicos livres de DNA cromossomal (SimCells).
No full textDados experimentais relacionados ao desenvolvimento e funcionalidade do Plasmídeo pSD_ICeul_i9iBP, contendo o gene I-Ceul, responsável pela produção de uma endonuclease capaz de degradar totalmente o genoma da célula hospedeira controlada pela Integrase 9. O objetivo final é o desenvolvimento de células livres de DNA cromossomal denominadas SimCells (do inglês, simple cells), como alternativa para o desenvolvimento de células sintéticas funcionais não replicáveis
Potencial de aporte nutricional da palma forrageira para o leite bovino: caracterização do sistema de produção e da dieta animal de diferentes propriedades que se utilizam da palma, e o correspondente valor nutracêutico do leite (perfil de ácidos graxos e teor de compostos fenólicos totais)
No full textBase de dados final gerada no âmbito do projeto "Potencial nutracêutico do leite de vacas consumindo diferentes dietas contendo palma forrageira em condições comerciais", sob o código SEG (Sistema Embrapa de Gestão) nº 10.23.00.032.00.00, entre 02/2023 e 08/2025.
Contempla os registros obtidos junto a 75 propriedades leiteiras do semiárido brasileiro, localizadas em 4 estados da região Nordeste (PE, BA, SE e AL), onde 70 utilizam palma forrageira na dieta animal e 5 não utilizam (grupo "controle"), sendo composta por 2 sub-bases dispostas em planilhas diferentes:
1. Dados observacionais, coletados via enquete com os produtores: Caracterização do sistema de produção, da dieta animal e do manejo da palma forrageira (61 variáveis);
2. Dados laboratoriais: Perfil de ácidos graxos do leite, obtidos via cromatografia gasosa, e expressos em g/100g de ácidos graxos totais; e teor de compostos fenólicos totais (TPC), via método de Folin–Ciocalteu, e expresso em mg equivalente de ácido gálico por L de amostra; totalizando 74 variáveis.
As sub-bases estão disponibilizadas na forma do par de arquivos (banco de dados + dicionário de variáveis), nas versões em português e inglês.
A variável para unificação das sub-bases está nomeada, respectivamente, como id_am e sample_id, nos arq.s 1 e 2.
E o questionário empregado na enquete consta também anexado (arq. PDF), para facilitar a compreensão das variáveis.
Final dataset generated within the project "Nutraceutical potential of milk from cows fed different diets containing forage cactus under commercial conditions", under the SEG (Embrapa Project's Management System) code No. 10.23.00.032.00.00, carried out between 02/2023 and 08/2025.
It comprises records obtained from 75 dairy farms in the Brazilian semiarid region, located in four states of the Northeast (PE, BA, SE, and AL), of which 70 use forage cactus in animal diets and 5 do not (the “control” group). The dataset is composed of two sub-bases presented in separate spreadsheets:
1. Observational data, collected through a producer questionnaire: Characterization of the production system, animal diet, and forage cactus management (61 variables);
2. Laboratory data: Milk fatty acid profile, obtained via gas chromatography and expressed in g/100 g of total fatty acids; and total phenolic content (TPC), via the Folin–Ciocalteu method and expressed in mg gallic acid equivalents per L of sample; totaling 74 variables.
The sub-datasets are provided as a pair of files (database and variable dictionary), available in both Portuguese and English versions.
The variable used to integrate the sub-datasets is designated as id_sample in the first file and sample_id in the second file.
The questionnaire used in the survey is also included as an attachment (PDF file) to support the interpretation and proper understanding of the variables
Changes in the morphology of castor seeds after selection for fast germination
No full textThis dataset was measured in castor seeds that were produced by plants that were subjected to three cycles of selection of fast germination. Data was taken on seed weight, length, width, and height, seed coat weight, and caruncle weight. Calculations were made to obtain the values of relative weight for seed, seed coat, and caruncle, seed area, volume, and density, and seed coat density. Additional experimental details and the analysis of the data can be accessed in the published article.Este conjunto de dados foi medido em sementes de mamona que tinham sido produzidas por plantas que foram submetidas a três ciclos de seleção para rápida germinação. Foram registrados dados de peso, comprimento, largura e altura das sementes e o peso da carúncula. Foram calculados os valores de peso relativo da semente, da casca da semente e da carúncula, área, volume e densidade da semente, e densidade da casca da semente. Detalhes experimentais e a análise desses dados podem ser acessados no artigo que foi publicado
Diagnóstico agroambiental dos municípios com os distritos agrotecnológicos do projeto Semear Digital.
No full textOs dados aqui apresentados remetem ao diagnóstico agroambiental dos municípios com os Distritos Agrotecnológicos (DAT) do projeto Semear Digital. Fornecem uma base sólida para o planejamento de ações e políticas públicas que promovam o desenvolvimento sustentável. Assim, foi dividido nos seguintes tópicos: 1) distribuição espacial dos municípios com os DAT, localização no território nacional e sua distribuição nos biomas e estados brasileiros; 2) caracterização edafoclimática, com informações sobre hipsometria, declividade, e pedologia; 3) estrutura fundiária, análise do padrão espacial das propriedades rurais; 4) produção agropecuária, análise do número dos rebanhos (bovinos, suínos e galináceos) entre 1985 e 2023; 5) uso e cobertura da terra em 2022, espacialização e descrição das principais classes de uso do solo; 6) dinâmica da mudança do uso e cobertura da terra entre 1985 e 2022; 7) expansão e retração de áreas de agropecuária; 8) dinâmica das pastagens degradadas; e 9) potencialidade agrícola de áreas de pastagens degradadas.The agroenvironmental diagnosis presented here for the municipalities hosting the Agrotechnological Districts (DATs) under the Semear Digital project delivers a solid basis for formulating public policies and actions directed toward sustainable development. The study is structured around several key analytical components. It commences with a geographical contextualization, mapping the municipalities' locations within the national territory, biomes, and states. This is followed by an edaphoclimatic characterization, supplying critical data on hypsometry, slope, and soils. The analysis then examines the land structure, focusing on the spatial configuration of rural properties. The diagnosis further investigates agricultural and livestock production trends from 1985 to 2023. A detailed account of land use and cover for 2022 is provided, alongside an analysis of the transitions observed between 1985 and 2022. The final sections detail the expansion and contraction of agricultural frontiers, the dynamics of degraded pastures, and a forward-looking assessment of their agricultural potential. In summary, this report provides a holistic and detailed perspective to inform strategic decision-making
Mapa genético de Megathyrsus maximus (Jacq.), com informação de dosagem alélica e fase de ligação.
No full textMapa genético de Megathyrsus maximus (Jacq.), com informação de dosagem alélica e fase de ligação. Este corresponde ao mapa de ligação mais denso e informativo para a espécie, até o momento, com 7095 marcadores, abrangendo 1746.18 cM do genoma. Foi gerado a partir de uma população biparental de 224 indivíduos, os quais foram sequenciados por meio do protocolo de Genotipagem por sequenciamento (GBS). Os dados brutos de sequenciamento foram analisados para encontrar variantes e estimar as dosagens alélicas para ambos os pais e todos os indivíduos da população. Cinco genomas de referência de espécies relacionadas foram utilizados durante o processo de mapeamento, devido à ausência de um genoma de referência para M. maximus. O software GATK v.4.1.6.0 foi utilizado para encontrar as variantes e estimar os genótipos. O software MAPpoly v0.2.3 foi utilizado para a construção do mapa.Genetic map of Megathyrsus maximus (Jacq.), with allele dosage and phase information. This corresponds to the densest and most informative linkage map for the species to date, with 7095 markers covering 1746.18 cM of the genome. It was generated from a biparental population of 224 individuals, which were sequenced using the Genotyping by Sequencing (GBS) protocol. The raw sequencing data were analyzed to find variants and estimate allele dosages for both parents and all individuals in the population. Five reference genomes of related species were used during the mapping process due to the absence of a reference genome for M. maximus. The software GATK v.4.1.6.0 was used to identify variants and estimate genotypes. The software MAPpoly v0.2.3 was used for map construction
Doses of gibberellin influencing the germination of castor seed
No full textThis data was collected in an experiment for measuring the effect of the hormone gibberellin on the germination of castor seed cultivar Mia (Kaiima Seeds). The test was made in plastic boxes, incubated at 30 °C for nine days, exposing the seeds to 11 doses of gibberellin varying from zero to 133 mg/L. Addtional experimental details and the analysis of the data can be found in the published article.Este conjunto de dados foi coletado em um experimento com objetivo de medir o efeito do hormônio giberelina sobre a germinação de sementes de mamona da variedade Mia (Kaiima Seeds). O teste foi feito em caixas de plástico, encubadas a 30 °C por nove dias, expondo as sementes a 11 doses de giberelina variando de zero a 133 mg/L. Mais detalhes experimentais e a análise dos dados podem ser acessados no artigo que foi publicado
Experimento referente a épocas de semeadura de cultivares de trigo no município de Coxilha, RS.
No full textDados experimentais, fenologia, fenometria, Coxilha, RS, 2019, Épocas de semeadura (25/06/2019, 25/07/2019 e 23/08/2019), Cultivares (Toruk, BRS Reponte, BRS Belajoia e BRS Tarumã), dados de solo (físicos e químicos), de clima e práticas de manejo
Dados de galinhas da linha pura GGp da Embrapa Suínos e Aves.
No full textConjunto de dados com informações de pedigree e produção de galinhas da linha pura GGp (Duplo propósito-Caipira) da Embrapa Suínos e Aves para estudos de genética quantitativa para análises que necessitam de dados de aves para trabalhos de complementação de formação profissional/acadêmica.Data set with pedigree information and production of chickens from the pure GGp (Double purpose-Free Range) line from Embrapa Swine and Poultry for quantitative genetic studies for studies that require bird data for work to complement professional/academic training
Fenótipos de bovinos de corte para avaliação genética e inserção de critérios de seleção nos rebanhos.
No full textPara melhoria e integração da base genética do rebanho Nelore, nos segmentos comerciais e melhoradores, buscou-se enriquecer os bancos de dados com novos fenótipos e mais atualizações, promovendo avaliações genéticas com melhor qualidade e possibilitando a inserção de novos critérios de seleção nos rebanhos. Os fenótipos envolvem pesos, medidas de perímetro escrotal, notas de conformação frigorífica e dados de ultrassom.In order to improve and integrate the Nelore cattle genetic base, we sought enrich the database with new phenotypes and updated data, both from commercial and breeding sectors, promoting genetic evaluations with enhanced quality and allowing the insertion of new selection criteria in herds. The phenotypes include weights, scrotal circumference measures, visual scores for conformation and ultrasound data