aboclo - Repositório Institucional UFRB (Univ. Federal do Recôncavo da Bahia)
Not a member yet
1398 research outputs found
Sort by
Vida universitária e saúde mental: um estudo junto a estudantes da UFRB
No full textO ingresso na universidade está relacionado a significativas mudanças na vida dos estudantes. Todavia, alguns estudos têm associado tal etapa a prejuízos ao bem-estar e à saúde mental. Nesse âmbito, este livro apresenta os principais resultados de uma pesquisa que teve por objetivo analisar as relações entre vida universitária e saúde mental entre estudantes de graduação
Método Box e Jenkins na estimativa de preços de celulose de fibra curta brasileira
Get PDFForest planning is increasingly essential to support the development of the sector, which makes it fundamental to know the behavior of forest product prices over the years, in order to predict future values and to help forest base. In view of the above, this work aimed to evaluate the Box and Jenkins (1976) methodology, used to forecast the price of Brazilian hardwood pulp. He considered the price of the period from January 2007 to April 2014 for the adjustment of the model and the period from June 2014 to May 2015 for validation of the forecast. The selection of the most appropriate model was based on the lowest values observed in the Akaike (AIC) and Schwarz (SCH) criteria, significance of the coefficients, the upper R2 adjusted, the parsimony principle and the residue behavior. The results indicated that the appropriate model to predict the price of Brazilian hardwood pulp was ARIMA (1, 1, 2).O planejamento florestal mostra-se cada vez mais essencial para subsidiar o desenvolvimento do setor, o que torna fundamental o conhecimento do comportamento dos preços dos produtos florestais ao longo dos anos, com intuito de prever valores futuros e auxiliar a tomada de decisões das empresas de base florestal. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo avaliar a metodologia Box e Jenkins (1976), empregada para a realizar a previsão do preço de celulose de fibra curta brasileira. Considerou o preço do período de janeiro de 2007 a abril de 2014 para o ajuste do modelo e o período de junho de 2014 a maio de 2015 para validação da previsão. A seleção do modelo mais adequado baseou-se aos menores valores observados nos critérios de Akaike (AIC) e Schwarz (SCH), significância dos coeficientes, ao valor superior R2 ajustado, no princípio de parcimônia e no comportamento dos resíduos. Os resultados alcançados indicou que o modelo apropriado para prever o preço de celulose de fibra curta brasileira, foi um ARIMA (1, 1, 2)
Juventude e agricultura familiar no Recôncavo da Bahia
No full textNeste livro o autor propõe romper a invisibilidade social, acadêmica e política que estão submetidos os jovens agricultores familiares. Ao descrever a situação juvenil na agricultura familiar em suas dimensões objetivas e subjetivas - presentes nas condições matérias, nos processos de socialização, nas representações sociais e nos projetos juvenis – põem em evidência tanto essa categoria social quanto as relações entre essa situação e os impasses na sucessão geracional da agricultura familiar. No caso do Recôncavo predominam os projetos profissionais não agrícolas, principalmente entre as mulheres e jovens adolescentes. Na perspectiva desses, a ausência de autonomia material para os jovens na agricultura agrava a crise sucessória no Recôncavo. Este livro é um convite ao estudo da Sociologia Rural na Bahia e à mobilização social dos jovens agricultores familiares por reconhecimento e autonomia
A importância do diálogo sobre sexualidade e gênero entre pais e filhos: a experiência do CRAS de São Félix
Get PDFThe present work sought to demonstrate the relevance of family dialogue, between mothers and fathers with regard to sexuality and gender. Considering that adolescence is a phase of major changes in the lives of individuals and that, therefore, they need support from parents or guardians, through dialogue and exchange, especially on issues related to the construction of sexuality and affection, this research was carried out in order to analyze how families work with sexuality and gender issues with adolescents. We had as a locus of research the CRAS of São Félix, from the Salva Vidas neighborhood, in the municipality of São Félix - BA. The interviews were conducted with the families and adolescents belonging to groups assisted by the referred CRAS, totaling X adolescents interviewed and X family members participating in the study. As a result, it was possible to notice that many parents have been striving to maintain a close relationship with their children, as they understand the need for this action. However, there is still a need for reflection and awakening awareness so that families
realize the importance of dialogue, reducing the distance between parents and children, bringing security to the home and reducing STDs, early pregnancy, as well as demystifying prejudices against LGBTI.O presente trabalho buscou demonstrar a relevância do diálogo familiar, entre mães e pais no que diz respeito à sexualidade e gênero. Considerando que a adolescência é uma fase de grandes mudanças na vida dos indivíduos e que, portanto, necessitam de um suporte dos pais ou responsáveis, através do diálogo e da troca, em especial sobre questões relativas à construção da sexualidade e do afeto, esta pesquisa foi realizada com o intuito de analisar de que forma as famílias trabalham as questões da sexualidade e de gênero com os e as adolescentes. Tivemos como lócus de pesquisa o CRAS de São Félix, do bairro Salva Vidas, no município de São Félix - BA. As entrevistas foram realizadas com as famílias e adolescentes integrantes de grupos assistidos pelo referido CRAS, totalizando X adolescentes entrevistados e X familiares participantes do estudo. Como resultado, foi possível notar que muitos pais tem se esforçado para manter um relacionamento de proximidade com os filhos, pois compreendem a necessidade dessa ação. Entretanto, ainda é preciso um trabalho de reflexão e despertar da consciência de forma, que as famílias percebam a relevância do diálogo, diminuindo
a distância entre pais e filhos, trazendo segurança ao lar e reduzindo DSTs, gravidez precoce, bem como desmistificando os preconceitos contra LGBTI
Permanência e saída do jovem no campo: uma abordagem dos jovens rurais da Matinha, Ituberá-Ba.
Get PDFIn the last decade of the twentieth century the theme of youth became more debated in Brazil, centered above all on social sciences, pointing to different concepts, based on a period that goes from childhood to adulthood. Subsequently, the subject is debated by the academy, in general, but also by NGOs, social movements, and public policies, focusing especially on urban youth. In this context, the discussion on rural youth, of extreme importance for rural development and the rural man, was second to none. However, more recently, such an approach has already been a topic of debate in the most diverse areas of society, among them, in academia and in public policies. Based on this assumption, the objective of this work was
to know the reality lived by the youngsters of Matinha community located in the municipality of Ituberá in the state of Bahia. Specifically, it also aimed to point out the aspects that contribute to the choice of young people to stay in rural areas; to outline the problems faced in the rural environment for those who started to arouse interest in migrating to the urban center; identify if there are public policies with the purpose of benefiting them and encouraging them in their local stay. Methodologically, a field survey was carried out. The information was collected through semi-structured interviews divided into two blocks of questions. The main results indicated that the main reasons attributed by the young people to stay in the rural
environment are the fact of the family valorization, the desire to continue the work of the parents, especially the boys, and the non-abandonment of the family. On the other hand, motives were also presented by the young people responsible for the desire to leave the field, to den them, the lack of access to formal education; to technologies; the health; to pubic transport; to a fixed income; to land for cultivation; and public policy. All of these problems
were pointed out by the young people interviewed in the community of Matinha, some managed to survive and remain in the midst of these problems, but others pointed as the only solution the destination to cities in search of better life. In view of these results, it was concluded that there is a need for greater investments in the field, with a differentiated approach for the youth living there, with opportunities to guarantee better living and working conditions.Na última década do século XX o tema juventude passou a ser mais debatido no Brasil, centralizado, sobretudo, nas Ciências Sociais, apontando conceitos diferentes, tomando como base um período que vai da infância até a passagem para vida adulta. Posteriormente, o assunto passa a ser debatida pela academia, de modo geral, mas também por ONGS, movimentos sociais, e, políticas públicas, tomando como foco, sobretudo, a juventude urbana. Nesse contexto, ficou em segundo plano, a discussão sobre a juventude rural, de extrema
importância para o desenvolvimento rural e o homem do campo. No entanto, mais recentemente, tal abordagem já tem sido tema de debate nas mais diversas áreas da sociedade, dentre ela, na academia e nas políticas públicas. Partindo deste pressuposto, o objetivo desse trabalho foi conhecer a realidade vivenciada pelos jovens da comunidade da Matinha localizada no município de Ituberá no estado da Bahia. Especificamente objetivou ainda, apontar os aspectos que contribuem para a escolha dos jovens em permanecer no meio rural; esboçar os problemas enfrentados no âmbito rural àqueles que passaram a despertar o interesse em migrar para o centro urbano; identificar se existem políticas públicas com a finalidade de beneficiá-los e incentivá-los na sua permanência local. Metodologicamente, foi realizada uma pesquisa de campo. As informações foram coletadas através de entrevistas semiestruturadas dividas em dois blocos de questões. Os principais resultados apontaram que os principais motivos atribuídos pelos jovens a permanecerem no meio rural é o fato da valorização familiar, o desejo em dar continuidade ao trabalho dos pais, sobretudo pelos rapazes, e, o não abandono da família. Por outro lado, motivos também foram apresentados pelos jovens responsáveis pelo desejo de saída do campo, dente eles, a falta de acesso à educação formal; às tecnologias; à saúde; ao transporte púbico; a uma renda fixa; às terras para o cultivo; e, às políticas públicas. Todos esses problemas foram apontados pelos jovens
entrevistados residentes na comunidade da Matinha, alguns conseguem sobreviver e se manterem em meio a esses problemas, mas, outros apontaram como única solução o destino às cidades em busca da melhoria de vida. Diante destes resultados, concluiu-se da necessidade
de maiores investimentos no campo, com um olhar diferenciado para a juventude que lá residem, com oportunidades que lhes garantam melhores condições de vida e de trabalho
Ensinar História no Século XXI: dilemas e perspectivas
Get PDFEste livro reúne textos produzidos por diferentes pesquisadores que dialogam sobre Ensino de História, Educação Básica e Licenciatura, expressando variadas visões sobre alguns de seus principais desafios e perspectivas na contemporaneidade. O foco principal das reflexões é a Educação Básica, entendida como espaço privilegiado de produção e renovação do conhecimento histórico e educacional
Avaliação do ensino de sistemática filogenética em escolas de ensino médio da rede pública do município de Cruz das Almas, Bahia
Get PDFThe Phylogenetic Systematics is a classification system of living beings that uses as its reference their evolutionary history, proposed by Willi Henning in 1965. This classification system constitutes the most important approach in Biology studies, once the parental relationship among the taxonomical groups is presented using an evolutionary context. However, in the context of High School Biology classes, several authors mention the fragmented approach in Biology teachings, specially about Biodiversity, focusing on the curricular content and its memorization. Based on this scenario presented, the necessity of an evaluation about how the subject has been approached by teachers and in the high school textbooks of public schools in Cruz das Almas, Bahia, has emerged. To achieve this goal, a questionnaire was applied to eight Biology teachers who work in public schools in the city, and for 35 students of these four high schools. A qualitative analysis of the contents related to the Phylogenetic Systematics of textbooks adopted by these four investigated schools, that have been approved by the PNLDEM, was carried out, with the goal of evaluating the issue approach, in these textbooks, with comprise the main support for teachers work. It was possible to note that all teachers have studied Phylogenetic Systematics in their initial education, nevertheless, they do not adopt this approach in Biology teaching, specially due to failures in these formation, having doubts in concepts and process, that brought up feelings of insecurity on teaching these issues. Historically, the textbook has been pointed as villain, since it discusses this theme superficially. Therefore, what has been observed in last years, as it was showed in the material studied here, this scenario has been modified, with presentation of Phylogenetic Systematics properly, giving support to evolutionary processes. Despite of that, although these textbooks constitutes the main support to the interviewed teachers, the insecurity about the issue, arising from their initial education, do not encourage them to address the theme as the basis for Biodiversity knowledge. The students were able to identify the restrictive approach of these concepts, especially in Biological classification, therefore, they showed interested in having more knowledge about evolving parts inherent to Phylogenetic Systematics. Based on the present study, it was verified the necessity of teachers comprehend the importance of their actualization about the approach’s methodologies for these issues, leaving apart the inadequate teaching’s methods, based on linearity, isolated and supported on the content, without contextualization of the subject. It was evidenced the urgency of Biology teachers on high schools continuing education, elaborating their knowledge about the subject and allowing them to adopt the Phylogenetic Systematics approaches securely on their teaching practices.A Sistemática Filogenética é um sistema de classificação dos seres vivos que usa como referência a sua história evolutiva, proposto por Willi Henning em 1965. Este sistema de classificação, no estudo da Biologia é imprescindível, uma vez que, as relações de parentesco tornam a visão mais acessível ao aluno, que pode compreender assim como as características presentes em cada grupos inserem em um processo evolutivo. Entretanto, no contexto das aulas de Biologia do Ensino Médio, muitos autores apontam para uma abordagem fragmentada do ensino de Biologia, especialmente quanto à Biodiversidade, em que se adotam estratégias conteudistas e de memorização do assunto Fundamentado no cenário apresentado, surgiu a necessidade de avaliar como o tema vem sendo abordado por professores e nos livros didáticos de ensino médio de escolas públicas da região de Cruz das Almas, Bahia. Para atingir esse objetivo foram aplicados questionários para 8 professores de Biologia que atuam em escolas públicas do município, e para 35 alunos destas 4 escolas de Ensino Médio. Uma análise qualitativa dos conteúdos referentes à Sistemática Filogenética dos livros didáticos adotados nas 4 escolas pesquisadas e aprovados pelo PNLDEM foi realizada, com o objetivo de verificar a abordagem do assunto neste que é a principal ferramenta de apoio ao professor. Foi possível notar que todos os professores tiveram formação inicial em Sistemática Filogenética, entretanto, não adotam esta abordagem no ensino da Biologia, especialmente, por terem falhas nesta formação, com dúvidas em conceitos e processos, que geraram insegurança no seu ensino. Historicamente, o livro didático tem sido apontado como vilão, por não trazer o tema de forma restrita. Entretanto, o que se observa nos últimos anos, a exemplo do material analisado aqui, este cenário tem se modificado, com a apresentação de itens específicos sobre Sistemática Filogenética, embasando o conhecimento sobre os processos evolutivos. Ainda assim, embora seja o maior apoio aos professores entrevistados, a insegurança sobre o assunto, decorrente da sua formação, não estimula que ele seja tratado como a base do conhecimento da Biodiversidade. Os estudantes conseguiram identificar a abordagem restrita dos conceitos, principalmente na classificação biológica, porém mostraram interesse em ter mais conhecimento sobre os aspectos evolutivos inerentes à Sistemática Filogenética. A partir deste estudo, verificou-se a necessidade dos professores de compreenderem a importância de sua atualização sobre as metodologias de abordagem desses conteúdos, deixando de lado o ensino inadequado, linear, isolado e conteudista, sem contextualização. Tornou-se evidente ainda a premência da formação continuada de professores de Biologia do Ensino Médio, elaborando o seu conhecimento sobre o tema e permitindo o uso desta abordagem com segurança em suas práticas docentes
Ações de cooperativas rurais: a experiência da COOPERSABOR em Monte Santo - Território do Sisal - BA
Get PDFThe Northeast region of Brazil has in rural areas its representative occupation of family farmers who live and develop their productive activities, most of the time, in small farms, with limitations that range from those imposed by the climate to those arising from the lack of effective public policies. Limitations, which have a direct impact on the production and marketing of their products, however, do not prevent them from having a stake in agricultural production in the Northeast. In this scenario, social organization through association and cooperative structures may represent alternatives capable of enabling changes in production, market and life conditions. The objective was to analyze the actions of the Cooperativa Regional de Agricultores/as Familiares e Extrativistas da Economia Popular e Solidária (COOPERSABOR) against seven production groups and their consumers in the municipality of Monte Santo, Sisal Territory. In order to reach the objectives, a bibliographic research was carried out, a priori, to understand the current ideas on the subject. Addressed, and, based on the model by Oliveira (2006), compare the actions of the cooperative in the field. Then, he visited the locus to interview seven productive groups that are part of COOPERSABOR. The main results showed that COOPERSABOR has contributed to improve several aspects in the lives of its members, both in terms of production, marketing and social organization, seeking to meet a management model that includes strategic planning devices, technological components, evaluation components and behavioral components. It was concluded that COOPERSABOR's actions reflect a change in life of farmers and their families, but other actions are still needed to further strengthen the Cooperative structure in the territory and the assistance to other groups of family farmers, also in need.A região Nordeste do Brasil tem no meio rural sua ocupação representativa de agricultores familiares que vivem e desenvolvem suas atividades produtivas, na maioria das vezes, em minifúndios, com limitações que vão desde as impostas pelo clima até as oriundas da falta de políticas públicas efetivas. Limitações, que têm reflexos diretos na produção e na comercialização de seus produtos, no entanto, não impedem que possuam participação na produção agrícola do Nordeste. Neste cenário, a organização social via estruturas de associações e cooperativas podem representar alternativas capazes de possibilitar mudanças nas condições de produção, de mercado e de vida dos mesmos. O objetivo foi analisar as ações da Cooperativa Regional de Agricultores/as Familiares e Extrativistas da Economia Popular e Solidária (COOPERSABOR) frente a sete grupos de produção e seus consumidores no município de Monte Santo, Território do Sisal. Para alcançar os objetivos foi realizada, a priori, uma pesquisa bibliográfica para compreender as atuais ideias sobre, o tema
abordado, e, com base no modelo de Oliveira (2006), comparar as ações da cooperativa em campo. Em seguida, visitou o locus para entrevistar sete grupos produtivos que fazem parte da COOPERSABOR. Os principais resultados apontaram que a COOPERSABOR tem contribuído para melhorar diversos aspectos na vida dos seus integrantes, tanto no sentido da produção, quanto comercialização e organização social, buscando atender um modelo de gestão que inclui dispositivos de planejamento estratégico, componentes tecnológicos, componentes de avaliação e componentes comportamentais. Concluiu-se que as ações da COOPERSABOR refletem em mudança de vida
dos agricultores e suas famílias, mas outras ações ainda são necessárias para fortalecer ainda mais a estrutura Cooperativa no território e o atendimento a outros grupos de agricultores familiares, também necessitados
Diversidade e evolução do nono e décimo passos da via biossintética de purinas em procariotos
Get PDFThe purine biosynthetic pathway (PBP) starts from phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) which is converted to Inosine monophosphate (IMP) in 10 enzymatic steps, in 4 of these steps the enzymes involved may vary according to the taxonomic group. In Bacteria and eukaryotes the ninth and tenth steps are performed by the PurH enzyme and in the archaeas by the PurP and PurO respectively. PurH has two domains, the AICARFT that performs the ninth step and the IMPCH that performs the tenth step, these domains have recently been found in species of the Archaea Domain as independent unfused genes. The PurP and PurO are analogous to the PurH domains and until then considered signatures of the Archaea Domain. In the first chapter of this work a study of the distribution of the genes related to the last steps of the PBP (purH, purP, purO and the genes coding for AICARFT and IMPCH named purV and purJ, respectively) was carried out on 1405 completely sequenced genomes of the Domains Archaea and Bacteria. Analyzes of comparative genomics indicated that PurH was the evolutionary solution of the Bacteria Domain to catalyze the enzymatic reactions of the last stages of PBP. Homologues of the purO, purV and purJ genes were found in bacterial genomes indicating that these genes are not exclusive to the Archaea Domain. It was also observed that there is a taxonomic pattern for the occurrence of these genes and that in some species they are in the same genomic context as other genes of the PBP. In spite of presenting the same conservation pattern of the primary structure, the PurO homologs of the Domains Archaea and Bacteria are not related and formed distinct groups in the phylogenetic tree, due to this we can infer that the PurO already existed in the common ancestor of all living beings. On the other hand the PurP seems to have arisen after the divergence of archaeas, and its isoforms were originated from events of gene duplication. The objective of the work presented in the second chapter was to understand the evolutionary history of the PurVs and PurJs and their evolutionary relations with the AICARFT and IMPCH domains of PurHs. The comparative enomics were performed with 2735 genomes, although the number of analyzed genomes was almost double, the results observed for the distribution of purH, purV, purJ, purP and purO in the prokaryotic lines were similar to those presented in the first chapter. The amino acid analysis of the active site showed that despite some variations, there are conserved amino acids between AICARFTs/PurVs and IMPCHs/PurJs, including amino acids which have been described as essential for AICARFT activity. According to the literature most of these variations are physically-chemically possible, in addition, they are equivalent between AICARFTs/PurVs and IMPCHs/PurJs. The topology of the phylogenetic tree of the PurHs shows a clear separation between Gram positive and Gram negative suggesting that the current PurHs originated from a single event of gene fusion. Phylogenetic analyzes indicated that archaeal PurHs are phylogenetically related to Gram Negative PurHs, indicating that they were acquired by horizontal transfer. This result is consistent with the hypothesis that the event of gene fusion that originated the PurH occurred in the Bacteria Domain. From the phylogeny we can infer that the PurV probably originated from the ancestral domain that originated PurH and PurJ from breaks of the PurH gene along the evolution and diversification of prokaryotic lines.
CAPÍTULO 1 = The last two steps of the purine biosynthetic pathway may be catalysed by different enzymes in prokaryotes. The genes that encode these enzymes include homologs of purH, purP, purO and those encoding the AICARFT and IMPCH domains of PurH, here named purV and purJ, respectively. In Bacteria these reactions are mainly catalysed by the domains AICARFT and IMPCH of PurH. In Archaea these reactions may be carried out by PurH and also by PurP and PurO, both considered signatures of this domain and analogous to the AICARFT and IMPCH domains of PurH, respectively. These genes were searched for in 1,405 completely sequenced prokaryotic genomes publicly available. Our analyses revealed taxonomic patterns for the distribution of these genes and anticorrelations in their occurrence. The analyses of bacterial genomes revealed the existence of genes coding for PurV, PurJ and PurO, which may no longer be considered signatures of the domain Archaea. Although genetically unrelated, the PurOs of Archaea and Bacteria show a high level of conservation in the amino acids of the active sites of the protein, allowing us to conclude that these enzymes are analogs. The gene purO was present in the common ancestor of all living beings, whereas the gene encoding PurP emerged after the divergence of Archaea and Bacteria and their isoforms originated in duplication events in the common ancestor of phyla Crenarchaeota and Euryarchaeota. The results reported here expand our understanding of the diversity and evolution of the last two steps of the purine biosynthetic pathway in prokaryotes.
CAPÍTULO 2 = The study of the purine biosynthetic pathway (PBP) has contributed significantly to the development of anticancer and , antimicrobial drugs, providing the production of compounds of commercial value from microorganisms, and also in the agricultural area, since their enzymes are directly related to factors such as growth and virulence of phytopathogens. Phosphoribosyl-pyrophosphate (PRPP) is the precursor of the purine pathway, it is converted to inosine monophosphate (IMP) through 10 enzymatic steps. The ninth and tenth steps of PBP are originally performed by PurH in Bacteria and by PurP and PurO in Archaea, respectively. In Chapter 1 we report the existence of PurO, PurV and PurJ in the Bacterial Domain, new enzymes of the PBP that are probably also related to the ninth and tenth passage of the pathway. As discussed earlier, PurV and PurJ are homologous to the AICARFT and IMPCH domains of PurH, however, it is not yet known what their origin would have been if they originated from the ancestral domains that gave rise to PurH or from the PurH gene, due to this the objective of this work was first to better understand the diversity of the genes involved with the ninth and tenth steps of the PBP in the prokaryotic genomes, to find evidence that allow us to infer that PurV and PurJ are active in the pathway and to understand the evolutionary relation between they are the PurH. A comparative genomic was performed with 2735 completely sequenced prokaryotic genomes, searching for the purH, purV, purJ, purP and purO genes. Although the number of genomes is almost double that of chapter 1 the results of comparative genomics were basically the same. An analysis of the amino acids of the active site of the AICARFTs and IMPCHs of all the recovered PurHs and PurVs and PurJs recovered was performed, with it being possible to observe that despite some variations there is conservation of amino acids from the PurV and PurJ active site including amino acids that were described as essential for the activity of the enzyme. The conservation pattern of the primary structure of AICARFTs/PurVs and IMPCH/PurJ is similar, they present basically the same conserved regions. In the PurH tree it was possible to observe a clear division between Gram positive and Gram negative. Of the 32 phyla sampled only 8 were monophyletic for PurH, while monophyly was also observed at lower rates such as family, order or class. The Archaea PurHs were dispersed and probably would have been acquired from lateral gene transfer. The topology that the PurJs tree with the PurHs IMPCH domains took, reflects that the purJs did not have a single origin and probably arose from purH breaks, since some of them clustered with the IMPCHs of the same edge. The PurV on the other hand formed distinct groups in the tree and are not related to the PurHs AICARFTs, indicating that they probably originated from the ancestral domain.A via biossintética de purinas (VBP) inicia a partir do fosforibosil pirofosfato (PRPP) que é convertido à inosina monofosfato (IMP) em 10 etapas enzimáticas, em 4 dessas etapas as enzimas envolvidas podem variar de acordo com o grupo taxonômico. Nas bactérias e eucariotos o nono e décimo passo são realizados preferencialmente pela enzima PurH e nas archaeas pela PurP e PurO respectivamente. A PurH tem dois domínios, o AICARFT que realiza o nono passo e o IMPCH que realiza o decimo passo, esses domínios recentemente foram encontrados em espécies do Domínio Archaea como genes independentes não fusionados. A PurP e PurO são análogas aos domínios da PurH e até então consideradas assinaturas do Domínio Archaea. No primeiro capítulo desse trabalho foi realizada um estudo da distribuição dos genes relacionados com os últimos passos da VBP (purH, purP, purO e os genes que codificam AICARFT e IMPCH nomeados de purV e purJ, respectivamente) em 1405 genomas completamente sequenciados dos Domínios Archaea e Bacteria. As análises de genômica comparativa indicaram que a PurH foi preferencialmente a solução evolutiva do Domínio Bacteria para catalisar as reações enzimáticas das últimas etapas da VBP. Homólogos dos genes purO, purV e purJ foram encontrados em genomas bacterianos indicando que esse genes não são exclusivos do domínio Archaea. Também foi observado que existe padrão taxonômico para ocorrência desses genes e que em algumas espécies eles estão no mesmo contexto genômico que outros genes da VBP. Apesar de apresentarem o mesmo padrão de conservação da estrutura primária, os homólogos da PurO do Domínio Archaea e Bacteria não estão relacionados e formaram grupos distintos na árvore filogenética, devido a isso podemos inferir que a PurO já existia no ancestral comum de todos os seres vivos. Por outro lado a PurP parece ter surgido após a divergência das archaeas, e suas isoformas foram originadas a partir de eventos de duplicação gênica. O objetivo do trabalho apresentado no segundo capítulo foi compreender a história evolutiva das PurVs e PurJs e suas relações evolutivas com os domínios AICARFT e IMPCH das PurHs. A genômica comparativa foi realizada com 2735 genomas, apesar do número de genomas analisados ser quase o dobro, os resultados observados para a distribuição de purH, purV, purJ, purP e purO nas linhagens procarióticas foram similares aos apresentados no primeiro capítulo. A análise dos aminoácidos do sítio ativo mostrou que apesar de algumas variações, existem aminoácidos conservados entre AICARFTs/PurVs e IMPCHs/PurJs, inclusive aminoácidos que foram descritos como essenciais para a atividade do AICARFT. De acordo com a literatura a maioria dessas variações são possíveis do ponto de vista físico-químico, além disso, elas são equivalentes entre AICARFTs/PurVs e IMPCHs/PurJs. A topologia da árvore filogenética das PurHs mostra uma clara separação entre Gram positivas e Gram Negativas sugerindo que as PurHs atuais originaram de um único evento de fusão gênica. As análises filogenéticas indicaram que as PurHs das archaeas são filogeneticamente relacionadas com as PurHs de Gram Negativas o que indica que elas foram adquiridas por transferência horizontal. Esse resultado é coerente com a hipótese de que o evento de fusão gênica que originou a PurH ocorreu no Domínio Bacteria. A partir da filogenia podemos inferir que a PurV provavelmente tenha sido originada a partir do domínio ancestral que originou a PurH e a PurJ a partir de quebras do gene da PurH ao longo da evolução e diversificação das linhagens procarióticas.
CAPÍTULO 1 = As duas últimas etapas da via biossintética das purinas podem ser catalisadas por diferentes enzimas em procariotos. Os genes que codificam essas enzimas incluem homólogos de purH, purP, purO e aqueles que codificam os domínios AICARFT e IMPCH de PurH, aqui denominados purV e purJ, respectivamente. Em bactérias, essas reações são catalisadas principalmente pelos domínios AICARFT e IMPCH de PurH. Em Archaea essas reações podem ser realizadas por PurH e também por PurP e PurO, ambas consideradas assinaturas desse domínio e análogas aos domínios AICARFT e IMPCH de PurH, respectivamente. Esses genes foram pesquisados em 1.405 genomas procarióticos completamente sequenciados e disponíveis publicamente. Nossas análises revelaram padrões taxonômicos para a distribuição desses genes e anticorrelações em sua ocorrência. As análises dos genomas bacterianos revelaram a existência de genes que codificam PurV, PurJ e PurO, que não podem mais ser considerados assinaturas do domínio Archaea. Embora geneticamente não relacionados, os PurOs de Archaea e Bacteria apresentam um alto nível de conservação nos aminoácidos dos sítios ativos da proteína, permitindo concluir que essas enzimas são análogas. O gene purO estava presente no ancestral comum de todos os seres vivos, enquanto a codificação do gene PurP surgiu após a divergência de Archaea e Bacteria e suas isoformas originadas em eventos de duplicação no ancestral comum dos filos Crenarchaeota e Euryarchaeota. Os resultados relatados aqui expandem nossa compreensão da diversidade e evolução das duas últimas etapas da via biossintética da purina em procariotos.
CAPÍTULO 2 = O estudo da via biossintética de purinas (VBP) tem contribuído de forma significativa no desenvolvimento de fármacos anticâncer, antimicrobianos, na área da biotecnologia proporcionando a produção de compostos de valor comercial a partir de microrganismos, e também na área agrícola, uma vez que suas enzimas estão diretamente relacionadas a fatores como crescimento e virulência de fitopatógenos. O fosforribosil-pirofosfato (PRPP) é o precursor da via de purinas, ele é convertido a inosina-monofosfato (IMP) através de 10 etapas enzimáticas. O nono e décimo passos da VBP é originalmente realizado pela PurH nas Bactérias e pela PurP e PurO nas Archaeas, respectivamente. No capítulo 1 relatamos a existência da PurO, PurV e PurJ no Domínio Bacteria, novas enzimas da VBP que provavelmente também estão relacionadas com o nono e décimo passo da via. Como discutido anteriormente a PurV e PurJ são homólogos aos domínios AICARFT e IMPCH da PurH entretanto ainda não se sabe qual teria sido a origem delas, se foram originados a partir dos domínios ancestrais que deram origem a PurH ou a partir de quebras do gene da PurH, devido a isso o objetivo desse trabalho foi primeiramente compreender melhor a diversidade dos genes envolvidos com o nono e décimo passos da VBP nos genomas procarióticos, buscar evidencias que nos permitam inferir que PurV e PurJ são ativas na via e entender a relação evolutiva existente entre elas e a PurH. Foi realizada uma genômica comparativa com 2735 genomas procarióticos completamente sequenciados, buscando pelos genes purH, purV, purJ, purP e purO. Apesar do número de genomas ser quase o dobro do capítulo 1 os resultados da genômica comparativa foram basicamente os mesmos. Foi realizada uma análise dos aminoácidos do sítio ativo dos AICARFTs e IMPCHs de todas as PurHs recuperadas e PurVs e PurJs recuperados, com isso foi possível observar que apesar de algumas variações existe conservação de aminoácidos do sítio ativo de PurV e PurJ inclusive de aminoácidos que foram descritos como essenciais para a atividade da enzima. O padrão de conservação da estrutura primária de AICARFTs/PurVs e IMPCH/PurJ é similar, eles apresentam basicamente as mesmas regiões conservadas. Na árvore da PurH foi possível observar uma clara divisão entre Gram positivas e Gram negativas. Dos 32 filos amostrados apenas 8 foram monofiléticos para PurH, entretando a monofilia foi observada também em taxas inferiores como família, ordem ou classe. As PurHs de Archaea ficaram dispersas e provavelmente teriam sido adquiridas a partir de transferência lateral de genes. A topologia que a árvore das PurJs com os domínios IMPCHs das PurHs assumiu, reflete que os purJs não tiveram uma única origem e provavelmente surgiram a partir de quebras de purH, uma vez que parte deles agruparam com os IMPCHs do mesmo filo. A PurV por outro lado formou grupos distintos na árvore e não estão relacionados com os AICARFTs das PurHs, indicando que provavelmente tenham sido originadas a partir do domínio ancestral
Genetic diversity and selection of cassava genotypes by morphagronomic and molecular characterization in Angola
No full textManihot (Manihot esculenta Crantz) is considered the most Brazilian of the cultures, being native to Brazil and cultivated in all tropical countries. Its exploitation is basically made by small producers in marginal areas of agriculture because of their rusticity and the ability to produce relatively well under conditions where other species would not even survive. The objective of this work was to evaluate the population structure, genetic diversity and selection of cassava genotypes of Angola by means of agronomic characteristics and molecular markers. The field experiment was conducted in the agricultural years of 2015-2016 and 2017-2018 in Malanje, Angola, with forty cassava genotypes
in the randomized block design with 4 replicates and each plot consisted of five lines of 10 plants with one spacing of 0.90 x 0.90 m. The data were submitted to analysis of individual and joint variance, when significant, the means were grouped by the Scott-Knott test. Character entropy levels, population structure, Pearson correlation coefficients, pooled analysis of quantitative, qualitative variables, Mulamba and Mock index for selection and indices were determined to determine the most informative ISSR primers such as polymorphic information content, marker index and resolution power. The morphoagronomic characterization of the evaluated genotypes indicates the existence of promising
materials that can be used in the diversification of cassava planting in Angola. The most promising cassava varieties are Tio Jojo, Ngana Yuculu and Kimbanda. The molecular characterization revealed that there is genetic diversity within each studied population. The indices used to determine the most informative primers allowed the discrimination of different primers, which could be used in future
studies of cassava populations. There was genetic structuring among the populations studied. There is genetic variability from the morphoagronomic characteristics of the varieties of cassava evaluated.A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é considerada a mais brasileira das culturas, por ser originária do Brasil e cultivada em todos países tropicais. Sua exploração, basicamente é feita por pequenos produtores, em áreas marginais de agricultura, devido a sua rusticidade e a capacidade de produzir relativamente bem em condições em que outras espécies sequer sobreviveriam. Sendo assim, objetivou-se avaliar a estrutura de populações, a diversidade genética e a seleção de genótipos de mandioca em Angola por meio de caracteres agronômicos e marcadores moleculares. O experimento de campo foi conduzido nos anos agrícolas de 2015-2016 e 2017-2018, em Malanje, Angola, com quarenta genótipos de mandioca no delineamento blocos ao acaso com 4 repetições. Cada parcela foi constituída por cinco linhas de 10 plantas em espaçamento de 0,90 x 0,90 m. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância individual e conjunta, quando significativo, e as médias foram
agrupadas pelo teste de Scott-Knott. Foram estimados níveis de entropia dos caracteres, estrutura de população, coeficientes de correlação de Pearson, análise conjunta de variáveis quantitativas, qualitativas, índice de seleção de Mulamba e Mock e índices para determinar os primers ISSR mais informativos como o conteúdo de informação polimórfica, o índice do marcador e poder de
resolução. A caracterização morfoagronômicas dos genótipos avaliados demonstrou a existência de materiais promissores que podem ser utilizados na diversificação do plantio de mandioca em Angola. As variedades de mandioca mais promissoras são Tio Jojo, Ngana Yuculu, Kimbanda, Vermute, Jaca
Vermelha, Jaca Branca. A caracterização molecular revelou que há diversidade genética dentro de cada população estudada. Os índices utilizados para determinar os primers mais informativos possibilitaram a discriminação de primers diferentes, que poderão ser utilizados em futuro estudos de populações de mandioca. Houve estruturação genética entre as populações estudadas. Existe variabilidade genética a partir das características morfoagronômicas nas variedades de mandioca avaliadas