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Funciones gaussianas en sistemas periódicos: aplicaciones en MOF y evaluación de integrales electrónicas
No full textLos materiales cristalinos pueden presentar propiedades útiles para su aplicación en situaciones diversas. Entre éstas, la captura de gases puede beneficiarse de una mayor caracterización del fenómeno de adsorción que presentan; esta caracterización puede ser brindada por medio de cálculos de estructura electrónica para sistemas periódicos. Este tipo de análisis puede requerir de muchos recursos computacionales, en parte por el procesamiento de las integrales electrónicas, cantidades fundamentales y numerosas en los cálculos involucrados. Así, el desarrollo de una herramienta moderna para la evaluación de estas integrales puede resultar de utilidad, permitiendo el uso de más plataformas de cómputo y facilitando el acceso a los procedimientos involucrados. Esta tesis presenta los resultados de un proyecto conformado por el estudio teórico de sistemas cristalinos (específicamente tipo MOF) y el desarrollo de un código para la evaluación de integrales electrónicas en este tipo de sistemas. Los cálculos sobre la adsorción de gases en MOF dieron posibles explicaciones para una serie de observaciones experimentales, que podrían luego ser tomados en cuenta en el estudio y diseño de materiales análogos. Por otro lado, el código desarrollado en este proyecto demuestra una buena reproducción de las integrales hasta ahora implementadas respecto a un código de referencia, a la vez que permite el acceso a los procedimientos para su resolución. Tanto en los cálculos realizados como en la implementación del código se hace uso de funciones gaussianas como funciones de base, demostrando de paso la valía de este tipo de funciones en cálculos de sistemas periódicos
Caracterización fisicoquímica del extracto de muicle (Justicia spicigera Schechtendal) y su adición exógena en un sistema alimentario (tortilla de maíz)
Get PDFThere is currently a growing demand for functional foods containing ingredients and additives (natural colorants), but the latter are expensive and difficult to standardize since they come from a vegetable source (fruits, vegetables, flowers, among others), as they depend on seasonality, growing conditions and extraction methods. In Mexico, there are many native plants of easy cultivation, which are used in traditional medicine since pre-Hispanic times, such as Justicia spiciguera Schechtendal, also known as muicle or muite, which also can impart violet coloration, provided by the content of anthocyanins present in the extracts of this plant. Kaempferol, astragalin, allantoin, among others, can be found within its polyphenol content. For this reason, a physicochemical characterization study was proposed in this doctoral work, for a later application in food (tortilla) based on nixtamalized corn flour. Different extraction methods were explored (ultrasound and maceration), as well as two dissolution media (water and ethanol). It was concluded that the aqueous extraction using maceration with a temperature of 55-57°C for 30 min, obtained the highest number of polyphenols and anthocyanin pigments present in the muicle leaves. Once the extraction method was standardized, the Muicle Extract (ME) was applied to the nixtamalized cornflour (NWMF). The amount of ME in NWMF was 0, 0.7, 1.7, and 2.7 g/100 g dry basis. The dough and tortilla variations were labelled as Mx and Tx respectively, where "x" corresponds to the ME content in NWMF on a dry basis. It was observed that the addition of the muicle extract to the nixtamalized white corn dough, contributed with a significant content of total polyphenols that also help to increase the antioxidant capacity of tortillas under intestinal conditions, as well as significantly reduce the total starch (TS), the digestible fractions of rapidly digested starch (RDS) and slowly digested starch (SDS), increasing the non-digestible fraction of resistant starch (RS). This study allows the formulation of foods that modulate the digestibility of starch fractions and the obtainment of corn flour tortillas that mimic the colour of blue corn tortillas by adding muicle extract, which also provides anthocyanins at a lower cost with a simple extraction process.En la actualidad existe una creciente demanda por alimentos funcionales, que contengan ingredientes y aditivos (colorantes de origen natural), pero estos últimos resultan costosos y son difíciles de estandarizar al provenir de una fuente vegetal (frutas, hortalizas, flores, entre otros), ya que dependen de la estacionalidad, condiciones de cultivo y métodos de extracción. En México existen muchas plantas nativas de fácil cultivo, que se emplean en la medicina tradicional, desde épocas prehispánicas, como Justicia spicigera Schechtendal, también conocida como muicle o muite, que además posee la capacidad de impartir coloración violácea, aportada por el contenido de antocianinas presentes en los extractos de esta planta, dentro de su contenido de polifenoles destacan el kaempferol, astragalina, alantoína, entre otros. Razón por la cual en el presente trabajo doctoral se propuso un estudio de caracterización físico-química, para una posterior aplicación en un alimento (tortilla) a base de harina de maíz nixtamalizado. En la presente investigación fueron explorados diferentes métodos de extracción (ultrasonido y maceración), así como dos medios de disolución (agua y etanol), se concluyó que la extracción acuosa empleando maceración con temperatura de 55-57 °C durante 30 min, obtuvo la mayor cantidad de polifenoles y pigmentos de antocianinas presentes en las hojas de muicle. Una vez estandarizado el método de extracción se procedió a aplicar el Extracto de Muicle (EM), en la harina de maíz nixtamalizada (NWMF). La cantidad de EM en NWMF fue de 0, 0.7, 1.7 y 2.7 g/100 g base seca. Las variaciones de masa y tortilla se etiquetaron como Mx y Tx respectivamente, donde "x" corresponde al contenido de EM en NWMF en base seca. Se observó que la adición del extracto de muicle a la masa de maíz blanco nixtamalizado, contribuyo al aporte de un contenido significativo de polifenoles totales que además ayudan a aumentar la capacidad antioxidante de las tortillas bajo condiciones intestinales, así como reducir significativamente el contenido del almidón total (ST), de las fracciones digeribles de almidón de rápida digestión (RDS) y del almidón de lenta digestión (SDS), aumentando la fracción no digerible de almidón resistente (RS). Este estudio permite formular alimentos que modulen la digestibilidad de las fracciones de almidón y obtener tortillas de harina de maíz, que imitan el color de las tortillas de maíz azul al adicionar el extracto de muicle, que también aporta antocianinas a menor costo y con un proceso de extracción simple
Efecto de la adición de carbonato de bismuto en óxido de zirconio en el proceso de producción de hidrógeno vía fotocatalítica
Get PDFThe present investigation describes the synthesis, characterization and photocatalytic evaluation of the composite materials ZrO2-Bi2O2(CO3) which were synthesized by the chemical co-precipitation method. The solids were prepared by modifying the content of Bi2O2(CO3), obtaining samples at 0.5, 1 and 2% mol, in order to determine the influence of the percentage of Bi2O2(CO3) in ZrO2 on the production of H2 via photocatalytic process. The same mechanism of synthesis, characterization and photocatalytic evaluation of the reference materials ZrO2 and Bi2O2(CO3) was carried out to compare their activity with that of the composite materials. The materials were characterized in order to study their structural, textural and optical properties. In this sense, the solids were analyzed by X-ray diffraction, diffuse reflectance UV-Vis spectroscopy, infrared spectroscopy, scanning electron microscopy, high resolution transmission electron microscopy, photoluminescence spectroscopy, N2 physisorption, and X Ray photoelectron spectroscopy. The evaluation of the photocatalytic activity of the materials was carried out in the production of H2 under UV light irradiation. The results showed that ZrO2 with the addition of Bi2O2(CO3) significantly improves the photocatalytic behavior compared to the reference materials
Dinámica del conocimiento tradicional de la flora local en la comunidad pluricultural de Santa María Jalapa del Marqués, Oaxaca
Get PDFIs very important to analyze the effects of cultural exchanges on the dynamics of traditional plant knowledge and the different ways that people perceive and use these resources. The objective of this study was to contribute to the recording of traditional ethnobotanical knowledge of the local flora in the multicultural community of Santa María Jalapa del Marqués, Oaxaca. One hundred collaborators from 10 localities belonging to 6 convergent ethnic groups (Chontales, Huaves, Mixes, Zapotecos del Istmo, Zapotecos del Sur, and Zapotecos del Valle) were interviewed, besides the mestizos. An inventory of the floristic and ethnofloristic richness was carried out. Possible similarities were determined based on the type of species known and/or used under a principal components analysis and the knowledge richness index was calculated by locality. The dynamics of traditional knowledge between residents and convergent ethnic groups were analyzed under the acculturation strategies proposed by Berry (2004). The contribution of floristic and ethnofloristic richness was compared with studies already reported for the Isthmus of Tehuantepec. Additionally, the species found to be under some risk category were recorded. A total of 230 species were registered, of which 210 are known and used corresponding to 65 botanical families, being Fabaceae, Euphorbiaceae, and Cactaceae the most representative. The most important categories of use are medicinal, construction and food. There were differences between the converging groups, most of the ethnic groups use medicinal and food plants more frequently, while the mestizos use mostly plants for construction. The use of firewood is similar between both groups. The mestizos adhere to the integration strategy, while the Zapotecs of the isthmus adjust to the separation process. Chontales and Zapotec from the south reflected coupling and acclimatization by having similar vegetation with the new location of arrival, while in Mixes, Valley Zapotecs and Huaves the adaptation process was present since the ecosystems of origin and arrival are different. Fifty percent of the flora known and used in the municipality has a name in the indigenous language. Of the taxonomically identified species, five species have not been reported in floristic studies and 95 species have not been reported in ethnofloristic studies for the Isthmus of Tehuantepec. Sixty percent of the species are registered in some risk category. Traditional knowledge about the use of plants in the municipality of Jalapa del Marqués is still valid. The dynamics of this knowledge among residents is not homogeneous, and convergence phenomena represent a complex process. Evidently, the dynamics of plant use in multicultural populations is intimately influenced by more than one aspect, and more studies are necessary in order to understand the processes of acculturation in convergent groups.Analizar los efectos de los intercambios culturales en la dinámica del conocimiento tradicional de las plantas y las diferentes formas en que las personas perciben y utilizan dichos recursos es muy importante. El objetivo de este estudio fue contribuir al registro del conocimiento tradicional etnobotánico de la flora local en la comunidad pluricultural de Santa María Jalapa del Marqués, Oaxaca. Se entrevistaron a 100 colaboradores de 10 localidades pertenecientes a 6 etnias convergentes (Chontales, Huaves, Mixes, Zapotecos del Istmo, Zapotecos del Sur y Zapotecos del Valle) además de los mestizos. Se realizó un inventario de la riqueza florística y etnoflorística. Se determinaron las posibles similitudes en función del tipo de especies que conocen y/o usan bajo un análisis de componentes principales y se calculó el índice de riqueza de conocimiento por localidad. La dinámica del conocimiento tradicional entre los residentes y las etnias convergentes se analizó bajo las estrategias de aculturación propuestas por Berry (2004). La contribución de la riqueza florística y etnoflorística se comparó con los estudios ya reportados para el Istmo de Tehuantepec. Y se registraron las especies que se encontraron en alguna categoría de riesgo. Se registró un total de 230 especies, de las cuales 210 son conocidas y utilizadas correspondientes a 65 familias botánicas, siendo Fabaceae, Euphorbiaceae y Cactaceae las más representativas. Las categorías de uso más importantes son: medicinal, construcción y alimenticio. Hubo diferencias entre los grupos convergentes, la mayoría de las etnias utilizan con mayor frecuencia plantas medicinales y alimenticias, mientras que los mestizos utilizan mayormente plantas para la construcción. El uso de leña es similar entre ambos grupos. Los mestizos se acoplan a la estrategia de integración, mientras que los zapotecos del istmo se ajustan al proceso de separación. Chontales y zapotecos del sur reflejaron acoplamiento y aclimatación al tener una vegetación similar con la nueva localidad de llegada, mientras que en mixes, zapotecos del valle y huaves se presentó el proceso de adaptación ya que los ecosistemas de origen y de llegada son distintos. El 50% de la flora conocida y utilizada en el municipio presenta nombre en lengua indígena. De las especies identificadas taxonómicamente, cinco especies no se han reportado en estudios florísticos y 95 especies no se han reportado en estudios etnoflorísticos para el Istmo de Tehuantepec. El 62.6% de las especies se encuentran registradas en alguna categoría de riesgo. Se evidencia que el conocimiento tradicional sobre el uso de plantas en el municipio de Jalapa del Marqués sigue vigente. La dinámica de este conocimiento entre los residentes no es homogénea, y los fenómenos de convergencia representa un proceso complejo. Esto demuestra que la dinámica del uso de plantas en poblaciones pluriculturales está íntimamente influenciada por más de un aspecto y son necesarios más estudios para comprender los procesos de la aculturación en grupos convergentes
Efecto de la sobreexpresión y silenciamiento génico de la triosa fosfato isomerasa de Giardia lamblia como blanco farmacológico para el diseño de antiparasitarios
Get PDFLa giardiasis es una enfermedad endoparasitaria causada por el protozoario Giardia lamblia. El sistema nacional de vigilancia epidemiológica (SINAVE) consideró la giardiasis en 2020 entre las 10 principales enfermedades parasitarias, acumulando 5 794 casos nuevos. El tratamiento para esta enfermedad no es específico y el parásito genera resistencia a fármacos, por lo que hoy en día se continúa con la búsqueda de nuevas dianas terapéuticas. La triosafosfato isomerasa (TPI) es una enzima que participa en la vía de la glucólisis; estudios anteriores han demostrado que algunos fármacos derivatizan las cisteínas presentes en la proteína recombinante TPI de G. lamblia, provocando una alteración en su estabilidad térmica y actividad catalítica. Para poder evaluar la importancia de esta proteína para G. lamblia, y encontrar nuevas estrategias farmacológicas, el objetivo de este trabajo fue evaluar los efectos de la sobreexpresión y el silenciamiento por RNA de interferencia del gen triosafosfato isomerasa en el parásito G. lamblia (GlTpi). Para la sobreexpresión se construyó el vector pTub-HisTEV-Tpi, para el silenciamiento se utilizó el vector pTubGdh_eGFP-RNAi, que da origen a síntesis de dsRNA, con tres regiones diferentes del gen GlTpi. Se cultivaron trofozoítos de G. lamblia WB clona C6 en medio TYI-S-33. Para el análisis del efecto de la sobreexpresión se construyó el vector pTub-HisTEV-Tpi, los trofozoítos se transfectaron por electroporación y se seleccionaron con puromicina como antibiótico de selección. La cepa de los trofozoítos que albergaron el plásmido se denominó T1048, los cuales mostraron un aumento de tres veces en la expresión del RNAm de GlTp, respecto a la cepa silvestre (WtWB). La proteína sobreexpresada se evaluó mediante ensayos de inmunofluorescencia, detectando la mayor parte de la proteína en la periferia de la cepa T1048. Además, la sobreexpresión de GlTpi también provocó cambios en el metabolismo, ya que en la cepa T1048 se redujo la concentración de piruvato (1.4 veces), con un aumento de la tasa de producción de etanol (3.5 veces) y un aumento en el consumo de glucosa (3.5 veces) respecto a la cepa WtWB. Se analizaron otros metabolitos que también mostraron diferencias entre las cepas, especialmente cuando se midió la fluorescencia intrínseca del triptófano y la piridoxina. Los datos obtenidos mostraron que la sobreexpresión del gen GlTpi altera el metabolismo de G. lamblia, y estas cepas generadas pueden ser utilizadas como referencia para proponer nuevas dianas y evaluar nuevos fármacos. Para el análisis del efecto del silenciamiento se utilizó el vector pTubGdh_eGFP-RNAi. Se realizó una curva de crecimiento de trofozoítos silvestres (WtWB), transfectados con el vector sin el gen (WtWB-iv) y transfectados con el vector con diferentes regiones del gen (iTpi-R1, iTpi-R2 e iTpi-R3). Se cuantificó la expresión génica por RT-qPCR y se midió la actividad enzimática por espectrofotometría, a 24, 48, 72, y 96 h de cultivo. Los resultados mostraron que el silenciamiento con la región 2 del gen GlTpi disminuyó el crecimiento de los trofozoítos hasta un 78% a las 48 h de cultivo; también disminuyó 0.75 veces la expresión relativa del gen GlTpi a las 24 h, respecto a la cepa WtWB, y disminuyó tres veces la actividad enzimática de la proteína. Estos resultados sugieren que la sobreexpresión y el silenciamiento son buenas herramientas para el análisis de blancos farmacológicos. Además, se demostró que la proteína TPI de G. lamblia es una enzima importante para la viabilidad del parásito.Giardiasis is an endoparasitic disease caused by the protozoan Giardia lamblia. In 2020 the National Epidemiological Surveillance System (SINAVE) considered giardiasis among the top 10 parasitic diseases, accumulating 5 794 new cases. Treatment for this disease is not specific and the parasite generates drug resistance, therefore, the search for new therapeutic targets is still ongoing. Triosephosphate isomerase (TPI) is an enzyme that participates in the glycolysis pathway; previous studies have shown that some drugs derivatize the cysteines present in this enzyme, causing an alteration in its thermal stability and catalytic activity. To assess the importance of this enzyme for G. lamblia, and to find new pharmacological strategies, the aim of this work was to evaluate the effects of the overexpression and the silencing, by means of interfering RNA of the G. lamblia triosephosphate isomerase gene (GlTpi). The pTub-HisTEV-Tpi vector was used for the overexpression and the pTubGdh_eGFP-RNAi vector was used for silencing. The latter gives rise to dsRNA synthesis with three different regions of the GlTpi gene. Trophozoites of G. lamblia WB clone C6 were cultured in TYI-S-33 medium. For the overexpression assessment, the vector pTub-HisTEV-Tpi was constructed, and the trophozoites were transfected by means of electroporation and selected using puromycin as a selection antibiotic. The strain of trophozoites harboring the plasmid was named as T1048, which showed a 3-folded increase in GlTpi mRNA expression relative to the wild-type strain (WtWB). The overexpressed protein was assessed by immunofluorescence assays, being most of it detected in the periphery of the strain T1048. Furthermore, GlTpi overexpression also caused changes in metabolism, as the T1048 strain reduced pyruvate concentration (x1.4) and increased both the ethanol production rate (x3.5) and the glucose consumption (x3.5) with respect to WtWB. Other metabolites were also analyzed showing differences between strains, especially when intrinsic fluorescence of tryptophan and pyridoxine was measured. The data obtained showed that overexpression of GlTpi alters the metabolism of G. lamblia, and these generated strains can be used as a reference to develop new targets and evaluate new drugs. For the silencing analysis, the pTubGdh_eGFP-RNAi vector was used. A growth curve of wild-type trophozoites (WtWB), transfected with the vector without the gene (WtWB-iv) and transfected with the vector containing different regions of the gene (iTpi-R1, iTpi-R2 and iTpi-R3) was performed. Gene expression was quantified by RT-qPCR and enzyme activity was measured spectrophotometrically at 24, 48, 72, and 96 culture hours. The results obtained indicate that silencing using region 2 of the GlTpi gene decreased the trophozoite growth by 78% at 48 culture hours. Additionally, it decreases the relative expression of the GlTpi gene by a factor of 0.75 at 24 h compared to the WtWB strain and decreases the enzymatic activity of the protein by three times. These results suggest that overexpression and silencing are good and feasible tools for drug targeting analysis. In addition to this, it was also shown that the TPI protein of G. lamblia is an important enzyme for parasite viability
Producción de biosurfactantes lipopeptídicos por Bacillus spp. en fermentación en medios sólido y líquido
Get PDFThe lipopeptide biosurfactants produced by Bacillus, have applications in different fields of industry. Lipopeptides have been mainly carried out in submerged fermentation which presents foaming associated with biosurfactant production. Besides, some increase in medium viscosity is due to the production of exopolysaccharides by some strains. Foaming and high viscosity decrease oxygen transfer, increasing the production costs and diminishing product concentration. On the other hand, solid-state fermentation does not present such problems and Reports of lipopeptide production in solid-state fermentation are scarce but satisfactory and have mostly used natural supports (non-inert material), agro-industrial residues, or complex culture media, which hinders recovery, purification, and analysis of the product. The aim of the work was to develop a bioprocess with higher LP production in solid-state fermentation with a defined medium adsorbed on an inert support such as polyurethane foam. The above facilitate the control of the bioprocess, recovery, analysis of the products, and comparison with submerged fermentation. In this way, identify and understand the relationship between secondary and primary metabolism and some limiting nutrients with the bioprocess. Part I of this work used Bacillus subtilis ATCC 6633 for the tests as improvement of the strain, selection of the most favorable solid support, and the effect of C/N on LP production. Polyurethane foam is the support that could allow the greatest lipopeptide production. The ammonium nitrate and C/N 17.1, was the most favorable condition for the bioprocess. For Part II, different strains were studied in solid and submerged fermentation, four wild and one mutant strain (unable to develop biofilm). The wild-type strains revealed a higher production of lipopeptides and biomass, glucose consumption, and a lower synthesis of primary metabolites in
solid-state fermentation than in submerged. However, the mutant strain produced a slightly higher production of primary metabolites in solid fermentation than in submerged. The analysis of the carbon balance showed that the carbon flux is directed mainly to lipopeptides in solid-state fermentation, whereas, in submerged fermentation, it is directed to the production of primary metabolites. In the present work, a bioprocess is developed in solid-state fermentation with high lipopeptide production, mainly fengycin (2.7 g/L) and iturin (1.2 g/L) using a defined medium adsorbed on inert support by the Bacillus subtilis ATCC 21332. The concentrations reached are higher than those reported in the literature by wild strains. To the best of my knowledge, this is the first report that uses polyurethane foam in solid-state fermentation for lipopeptide production, facilitating the recovery and analysis of the product, as well as glucose and biomass. Furthermore, this is the first study to present the quantitative production of fengycin by solid fermentation.Los biosurfactantes (BS) lipopeptídicos producidos por Bacillus tienen aplicaciones en diferentes áreas de la industria. Los lipopéptidos (LP) se han producido principalmente en fermentación líquida (FML), la cual presenta formación de espuma asociada con la producción de BS y un incremento en la viscosidad del medio debido a la producción de exopolisacáridos, lo que provoca una baja transferencia de oxígeno. Dichas situaciones aumentan los costos de producción y bajan la concentración del producto. Por otro lado, la fermentación sólida (FMS) no presenta dichos problemas y son escasos pero satisfactorios los reportes de producción de LP en este tipo de cultivo, los cuales, en su mayoría han utilizado soportes naturales (no inertes), residuos agrícolas o medios de cultivo complejos, que dificultan la recuperación, purificación y análisis del producto. El objetivo fue desarrollar un bioproceso con alta producción de LP en FMS utilizando un medio definido adsorbido en un soporte inerte como la espuma de poliuretano (PUF) para facilitar el control del bioproceso, recuperación, análisis de los productos y comparación con la FML. De esta forma, identificar y comprender la relación entre los metabolismos primario y secundario; y algunos nutrientes limitantes con el bioproceso, ya que poco se les ha investigado. En la parte I del trabajo se utilizó B. subtilis ATCC 6633 para las experimentaciones las cuales incluyen: mejorar la cepa por mutagénesis inducida, seleccionar el soporte inerte que más beneficia el bioproceso y evaluar el efecto C/N del medio de cultivo en la producción de los LP. Se encontró que la PUF, es el soporte que permitiría producir mayor cantidad de LP y se obtuvo que el nitrato de amonio y la relación C/N=17.1, es la condición que permitió la mayor concentración de LP. En la parte II se estudiaron diferentes cepas en FML y FMS, cuatro silvestres y una mutante (incapaz de desarrollar biopelícula). Las cepas silvestres revelaron una mayor producción de LP y biomasa, consumo de glucosa y una menor síntesis de metabolitos primarios en FMS que FML. Sin embargo, la cepa mutante presentó una producción ligeramente mayor de metabolitos primarios en FMS que FML. El análisis del balance de carbono mostró que el flujo de carbono se dirige principalmente a los LP en FMS, mientras que, en FML, se dirige a la producción de metabolitos primarios. Se desarrolló un bioproceso en FMS con alta producción de LP de fengicina (2.7 g/L) e iturina (1.2 g/L) utilizando un medio definido adsorbido en un soporte inerte por la cepa Bacillus subtilis ATCC 21332. Las concentraciones alcanzadas son mayores a las reportadas en la literatura por cepas silvestres. Este es el primer reporte que utiliza en FMS PUF en la producción de LP, facilitando la recuperación y análisis del producto como de glucosa y biomasa. Además, es el primer estudio que presenta la producción cuantitativa de fengicina por FMS
Control biológico de hongos micotoxigénicos con bacterias ácido lácticas
Get PDFThe lost food caused by the contamination with microorganisms is an important problem to solve human survival. The contamination by fungus is a topic of great interest. because the fungus biosynthesized mycotoxins associated with several diseases. In this sense to give solutions to the problem mentioned before, in this thesis, the use of lactic acid bacteria as antagonists of the growth of Aspergillus carbonarius is proposed. The work focuses on enhancing the antifungal effect of LAB modifying the formulation of the culture medium and identifying metabolites with antifungal activity. Firstly, an analysis of the fermentation products of the LAB was carried out. The strains were characterized as homofermentative, because mainly produced lactic acid, and a low concentration of propionic acid, ethanol, and LAB strain 31 (MZ809351) also produced butyric acid. On the other hand, it was found that the highest antifungal activity occurred when the cell-free supernatant was obtained between 72 and 96 h of LAB culture under anaerobic conditions. Secondly, we analyzed the effect of the concentration of the nitrogen source and some nutritional factors. LAB strains 7 from Mexico and 31 from the Ivory Coast exhibited the highest antifungal activity, moreover, it was found that both yeast extract and ammonium citrate can be eliminated from the culture medium without affecting both growth and antifungal activity. Lastly, this part shows the antifungal activity was reduced when calcium chloride was added to culture media and was not affected by the presence of sodium chloride. The last stage corresponds to the analysis of the results of adding polyols to the MRS culture medium on the production of metabolites with antifungal activity. The highest growth inhibition of A. carbonarius was obtained by cultivating L. plantarum MZ809351 (LAB 31) in the presence of xylitol and glycerol. Under these conditions, in addition to 9-octadecenoic acid, 3 diketopiperazines or cyclic dipeptides were identified, including cyclo (Leu-Leu), cyclo (Pro-Gly) and cyclo (Val-Phe), these compounds have been related to microbial antifungal activity. On the other hand, adding xylitol and glycerol to the MRS broth reduced the Ochratoxin A (OTA) content to 56.8 and 54.7%, respectively. This study shows the potential for using L. plantarum as a biocontrol agent.La pérdida de alimentos causada por la contaminación de microorganismos es una problemática importante para atender la demanda creciente de la población humana. Específicamente la contaminación por hongos es un tema de interés puesto que producen micotoxinas a las que se les atribuye diversas enfermedades. Para resolver la problemática antes mencionada se propone el uso de bacterias ácido lácticas (BAL) como antagonistas del crecimiento del hongo Aspergillus carbonarius. En el trabajo se busca potenciar el efecto antifúngico de cepas de BAL mediante la modificación de la formulación del medio de cultivo, así como identificar metabolitos con actividad antifúngica. En una primera etapa se realizó un análisis de los productos de fermentación de las BAL. Se encontró que son homofermentativas, por producir principalmente ácido láctico con bajas concentraciones de ácido propiónico, etanol y en el caso de la cepa BAL 31 también se produjo ácido butírico. Se determinó que la mayor actividad antifúngica se presentó cuando el sobrenadante libre de células fue obtenido entre las 72 y 96 h de cultivo de las BAL bajo condiciones anaerobias. En una segunda fase se evaluó la actividad antifúngica cuando se modifican la cantidad de fuente de nitrógeno y algunos factores nutricionales. Se encontró que la BAL 7 de México y la BAL 31 de Costa de Marfil son las que presentan mayor actividad antifúngica, también se encontró que tanto el extracto de levadura y citrato de amonio pueden ser eliminados del medio de cultivo sin afectar el crecimiento y la actividad antifúngica. Por último, el cloruro de calcio tiene un efecto negativo en la inhibición y el cloruro de sodio no tiene ningún efecto sobre la inhibición. La última sección corresponde al estudio del efecto de la adición de polioles al medio de cultivo MRS sobre la producción de metabolitos con actividad antifúngica. La mayor inhibición del crecimiento de A. carbonarius se obtuvo cultivando L. plantarum MZ809351 en presencia de xilitol y glicerol. En estas condiciones, además del ácido 9-octadecenoico, se identificaron 3 dicetopiperazinas o dipéptidos cíclicos, entre ellos ciclo (Leu-Leu), ciclo (Pro-Gly) y ciclo (Val-Phe), compuestos que han sido relacionados con actividad antifúngica. Por otro lado, la adición de xilitol y glicerol al caldo MRS redujo el contenido de ocratoxina A (OTA) a 56.8 y 54.7%, respectivamente. Este estudio muestra el potencial para usar L. plantarum MZ809351 como agente de biocontrol
Química orgánica II
No full textEl presente material didáctico está escrito en formato de notas de curso y su contenido está basado en el temario oficial del programa de estudios vigente de la Unidad de Enseñanza Aprendizaje ‘Química Orgánica II (2141071)’. El objetivo de este material es que los estudiantes de Química Orgánica II cuenten con notas de curso en formato digital (PDF) con información condensada, ordenada, actualizada, precisa y adicional a los contenidos que, de forma considerablemente más extensa, se puede encontrar en los libros de texto clásicos de Química Orgánica...El origen de estas notas de curso son los apuntes de la Q. Perla Islas-Jácome (coautora), tomados en la Clase de Química Orgánica II (17-P) impartidapor el Dr. Eduardo González Zamora (coautor), profesor de química orgánica adscrito al Áreade Química Inorgánica del Departamento de Química, responsable de la Academia de Química Orgánica del Departamento de Química y miembro del Cuerpo Académico PRODEP ‘Materiales Orgánicos e Inorgánicos UAMI-CA-95’, todos ellos en la UAM-Iztapalapa. El arte gráfico fue elaborado utilizando la versión 15.0.0.106 del software ChemDraw Professional by Perkin-Elmer, Cambridge, USA2015. Las imágenes tomadas de otras fuentes se encuentran citadas cuidando los créditos y los derechos de los autores correspondientes
Evaluación de la interacción de la proteína de matriz del virus sincitial respiratorio humano (VSRH) con la proteína nucleolar fibrilarina
Get PDFThe Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV) is one of the main etiological agents causing respiratory infections in infants. However, reinfections can occur throughout life. Therefore, HRSV is often a public health problem that affects various age groups. That is why generating information about the mechanisms of viral infection becomes necessary in order to be able to offer pharmacological treatments that allow patients to have a moderate infection without clinical complications. One of the virus-host interaction mechanisms studied in recent years in HRSV is the translocation of viral proteins to the nucleus. In this sense, during the first hours of HRSV infection, the matrix protein and the NS1 protein can be found in the nucleus to modulate the expression of genes that allow the virus to continue its infection cycle in a more efficient way. Although there is already a mechanism by which the matrix protein can regulate cell transcription, we decided to explore another possible mechanism by which said protein could regulate the said process. Therefore, our work focused on evaluating the subcellular distribution of the matrix protein in infected A549 cells, as well as analysis of the possible interaction of the matrix protein with the fibrillary protein, a protein highly related to cell transcription. During the first hours of HRSV infection, the matrix protein presented a perinuclear and cytoplasmic distribution, not a nuclear one, as previously reported. When performing the analysis of the colocalization of the matrix protein and fibrillarin, the colocalization did not occur. Therefore it is not present. However, we observed that the subcellular distribution of fibrillarin protein was the same in mockinfected and infected cells. Finally, when performing an in-silico analysis, our data indicate that the interaction of these two mentioned proteins is possibly not viable. Although all our data were not as expected, there are still unknowns that may allow us to explore new viral mechanisms in the future.El Virus Sincitial Respiratorio Humano (VSRH) es unos de los principales agentes etiológicos causantes de infecciones respiratorias en infantes. Sin embargo, pueden ocurrir reinfecciones a lo largo de la vida. El VSRH suele ser un problema de salud pública que afecta a diversos grupos de edad. Es por ello, que generar información acerca de los mecanismos de infección viral se vuelve necesario, para así poder ofrecer tratamientos farmacológicos que permitan que los pacientes cursen una infección moderada y sin complicaciones clínicas. Uno de los mecanismos de interacción virus y huésped que en los últimos años se ha estado estudiando en VSRH, es la translocación de proteínas virales al núcleo. En este sentido, se tiene conocimiento que durante las primeras horas de infección por VSRH la proteína de matriz y la proteína NS1 pueden encontrarse en el núcleo, para poder modular la expresión de genes que le permitan al virus continuar con su ciclo de infección de manera eficaz. Si bien, ya existe un mecanismo por el cual se ha descrito que la proteína de matriz puede regular la transcripción celular nosotros decidimos explorar otro posible mecanismo por el cual dicha proteína pudiera estar regulando dicho proceso. Por ello, nuestro trabajo se centró en evaluar la distribución subcelular de la proteína de matriz en células A549 infectadas, así como en el análisis de la posible interacción de la proteína de matriz con la proteína fibrilar, proteína altamente relacionada con la transcripción celular. Se encontró que durante las primeras horas de infección por VSRH, la proteína de matriz presentaba una distribución perinuclear y citoplasmática y no nuclear como ya se había reportado. También se encontró, al realizar el análisis de la colocalizacion de la proteína de matriz y fibrilarina, que dicha colocalizacion no se daba, por tanto no está presente. Sin embargo, observamos que la distribución subcelular de la proteína fibrilarina era la misma en células falsamente infectas e infectadas. Finalmente, al realizar un análisis in silico, nuestros datos nos indican que la interacción de estas dos proteínas mencionadas posiblemente no es viable. A pesar de que todos nuestros datos no fueron los esperados, aún existen incógnitas que en un futuro nos pueden permitir explorar nuevos mecanismos virales