Biotecnia (E-Journal)
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Confiabilidad de PCR en punto final para el diagnóstico de fiebre manchada por Rickettsia rickettsii en hisopado de piel y orina de pacientes hospitalizados en Sonora: PCR en punto final para diagnóstico de fiebre manchada por R. rickettsii
No full textRocky Mountain spotted fever (RMSF) is an infectious disease confirmed through IgM and IgG determination obtained by indirect immunofluorescence, although it has limited clinical value because it requires up to three weeks to be reliable. Polymerase Chain Reaction (PCR) is an alternative for RMSF diagnosis in whole blood, but there is less certainty regarding its ability when urine and tissue samples are used.
This study aims to estimate the reliability of PCR in skin swab and urine samples obtained from patients with suspected RMSF, comparing it with PCR results from whole blood samples. Samples from 110 suspected RMSF hospitalized patients, between September 2018 and October 2019, were analyzed. Reliability was calculated using the Kappa Coefficient (K).
Rickettsia rickettsii was detected in 21 urine samples, finding substantial agreement (K = 0.607, 95% CI (0.385, 0.844)); meanwhile, 3 skin swabs were positive, but without statistical significance (K = 0.417, 95% CI ((-0.338, 1.172).Our findings support that urine PCR is a reliable technique to confirm clinical suspicion of RMSF in hospitalized patients.La determinación de anticuerpos IgM e IgG por inmunofluorescencia indirecta es la prueba estándar para confirmar la fiebre manchada por Rickettsia rickettsii (FMRR), aunque tiene limitado valor clínico pues requiere tres semanas para ser confiable. La Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) es una opción para el diagnóstico en sangre total, pero hay menos certidumbre respecto a su capacidad al usar muestras de orina y tejido.
Nos proponemos estimar la confiabilidad de PCR en muestras de hisopado cutáneo y orina en pacientes sospechosos de FMRR, comparándole con resultados de PCR en muestras de sangre total. Se analizaron muestras de 110 pacientes sospechosos de FMRR atendidos en hospitales de Sonora, entre septiembre de 2018 y octubre de 2019. El cálculo de la confiabilidad se realizó mediante el Coeficiente de Kappa (K).
Se detectó Rickettsia rickettsii en 21 muestras de orina, encontrando una concordancia sustancial (K = 0.607, IC 95% (0.385, 0.844)); en tanto, 3 hisopados cutáneos resultaron positivos, pero sin significancia estadística (K = 0.417, IC95% ((-0.338, 1.172).
Nuestros hallazgos sustentan que la PCR en orina es una técnica confiable para confirmar la sospecha clínica de FMRR en pacientes hospitalizados
Influencia de la separación de agua residual porcina en fracciones sólida y líquida, en la producción de metano con Iodo anaerobio granular y disperso
Get PDFIn most cases, the current strategies to treat swine effluents in Mexico are not efficient, resulting in the discharge of partially treated wastewater, wasting an energy resource. This study aimed to evaluate the impact of the solid-liquid separation of swine wastewater on methane production using granular (GS) and disperse sludge (DS), under three concentrations. The COD concentration in the raw effluent (RE) was 13,640 mg/L, which corresponds up to 69 % to the solid fraction (SF) and the remaining to the liquid fraction (LF). The results indicate that the cultures with the SF produced the higher cumulative methane, increasing 1.47-, 1.31-, and 1.22-times in retaliation to the RE, at 3, 6, and 9 g VSS/L of DS. The solid-liquid separation strategy resulted in a higher methane production, evidenced by the amount of methane obtained by the SF and LF, which was 2.14- and 2.28-times higher than the obtained by the RE. The application of anaerobic processes to treat solid and liquid wastes will allow to recovery efficiently the energy from the transformation of organic matter into methane.Las estrategias actuales de tratamiento de efluentes porcinos en México son en muchos casos poco eficientes, que se traduce en la descarga de aguas tratadas parcialmente y no tratadas, así como el desaprovechamiento de un recurso energético. El objetivo de este estudio fue evaluar el impacto de la separación sólida-líquida del agua residual porcina sobre la producción de metano, utilizando lodo granular (LG) y lodo disperso (LD), bajo tres concentraciones. La concentración de DQO en el efluente crudo (EC) fue de 13,640 mg/L, con 69 % correspondiente a la fracción sólida (FS) y el resto para la fracción líquida (FL). Los resultados indican que los cultivos con la FS produjeron una mayor cantidad de metano, incrementándose 1.47, 1.31 y 1.22 veces en comparación al EC, para las concentraciones de 3, 6 y 9 g SSV/L de LD. La estrategia de separación sólida-líquida resultó en incrementos en la producción de metano, evidenciado porque la suma del metano acumulado por la FS y FL fue entre 2.14 y 2.28 veces mayor que la cantidad obtenida por el EC. La aplicación de procesos anaerobios para tratar residuos sólidos y líquidos permitirá recuperar de manera más eficiente la energía a partir de la transformación de la materia orgánica a metano
Physicochemical study of chitin and chitosan obtained from California brown shrimp (Farfantepenaeus californiensis) exoskeleton
Get PDFThis work describes the obtention of chitin and chitosan from the brown shrimp exoskeleton (Farfentepenaeus californiensis), which is collected from the Gulf of California. The chitin isolation process was carried out by a consecutive treatment that includes demineralization and deproteinization. On the other hand, the preparation of chitosan was conducted through alkaline hydrolysis, and the product was purified by using a membrane filters series to homogenize the size of the macromolecular chains. According to the methodology, the yield of chitin and chitosan was around 34 % and 20 % (dry weight), respectively. The materials were characterized by FTIR spectroscopy and thermogravimetric analysis. Also, the chitosan sample was analyzed by proximal test, viscometric-average molecular weight, and deacetylation degree. The products exhibited chemical structure and physicochemical properties comparable to biopolymers isolated from similar sources reported in the literature. Chitosan was found to have a degree of acetylation of 15.87 % (by 1H-NMR analysis) and Mv=170 kDa. The results suggest that the chitinous waste from the Sea of Cortes coast can be considered a promising source for the preparation of chitosan and used for several applications in the region.Este trabajo describe el aislamiento de quitina y optimización del proceso de desacetilación para obtener quitosana a partir del exoesqueleto de camarón café (Farfentepenaeus californiensis) recolectado del Golfo de California. La extracción se realizó a través de un proceso consecutivo de desmineralización y desproteinización. Por otro lado, la desacetilación se llevó a cabo por hidrólisis alcalina y el producto se purificó utilizando una serie de filtros de membrana para homogeneizar el tamaño de las cadenas macromoleculares. De acuerdo con la metodología seguida, se obtuvo rendimiento del 33 % y 23 % (base seca) de quitina y quitosana, respectivamente. Los materiales se caracterizaron por espectroscopía FTIR y análisis termogravimétrico. Asimismo, se evaluó el análisis proximal, peso molecular viscosimétrico y el grado de acetilación en la muestra de quitosana. Los productos obtenidos presentaron estructura química y propiedades fisicoquímicas comparables con los biopolímeros aislados por métodos similares reportados en la literatura. Se encontró que la quitosana pura tiene un grado de acetilación de 15.87 % (estimado por 1H-RMN) y . Los resultados obtenidos sugieren que los desechos quitinosos del Mar de Cortés pueden considerarse como una fuente importante para la preparación de quitosana y utilizarse para diversas aplicaciones de la regió
Leche cruda de vaca destinada a la elaboración de productos artesanales: calidad microbiológica y fisicoquímica
Get PDFRaw cow's milk is widely used as a raw material to elaborate artisanal products; however, it is necessary to analyze its quality before its transformation into the final product. The objective of this study was to evaluate the quality of raw milk from Tepatitlán de Morelos, Jalisco, used for the production of artisanal products concerning the physicochemical and microbiological limits established in Mexican standards. The factors studied in this study were the type of milking and the milk treatment. The quality analysis of the samples collected was carried out according to Mexican standards. Regarding microbiological quality, the results of somatic cells, mesophilic bacteria, and total coliform organisms showed that most samples did not comply with the limits established in Mexican regulations. In contrast, the results of the physicochemical analysis of the milk showed protein, fat, lactose, and non-fat solids content within the specifications established by regulations. The results reflect the poor microbiological quality of the milk used to elaborate artisanal products; this is the consequence of poor hygiene practices during milking, storage, and transportation.La leche cruda de vaca se utiliza como materia prima sin pasteurizar para la elaboración de productos artesanales; sin embargo, es necesario analizar su calidad antes de su transformación al producto final. El objetivo del presente estudio fue evaluar los parámetros de calidad de leche cruda de una Cooperativa de productores del municipio de Tepatitlán de Morelos, Jalisco, utilizada para elaborar productos artesanales con respecto a los límites fisicoquímicos y microbiológicos establecidos en la normatividad mexicana. Los factores de estudio del presente trabajo fueron tipo de ordeño y tratamiento que recibe la leche. El análisis de la calidad de las muestras recolectadas se efectuó acorde a metodologías oficiales. Respecto a la calidad microbiológica, los resultados de células somáticas, bacterias mesofílicas y organismos coliformes totales demostraron que la mayoría de las muestras no cumplen con los criterios establecidos. Contrariamente, los resultados del análisis fisicoquímico de la leche mostraron que el contenido de proteína, grasa, lactosa y sólidos no grasos se encuentran dentro de las especificaciones que dicta la normatividad. Los resultados reflejan la mala calidad microbiológica de la leche utilizada para la elaboración de productos artesanales; siendo esto la consecuencia de prácticas higiénicas deficientes durante la ordeña, almacenamiento y transporte
Efecto de la estacionalidad en la calidad microbiológica y fisicoquímica de leche de cabra producida en el centro de Veracruz, México
Get PDFThe effect of seasonality on the microbiological and physicochemical quality of goat milk produced at the center of the Veracruz state, Mexico, was evaluated. Milk from different goat production units (Coatepec, Perote and Tatatila) during the rainy, dry and windy seasons were evaluated. The contents of aerobic mesophiles, total coliform Eschericha coli, Staphylococcus aureus, Salmonella ssp. and Brucella sp. as well as protein, fat, lactose, non-fat solids, density and acidity. The microbiological results determined the absence of Eschericha coli, Staphylococcus aureus, Salmonella spp. and Brucella sp. in the analyzed milks. The effect of the interaction season of the year per production unit per type of milk showed that 50 % of the milk (raw and pasteurized) produced in the windy and rainy seasons presented the highest contents of aerobic mesophiles and total coliforms. The effect of the interaction unit of production by type of milk showed the highest content of non-fat solids, proteins, lactose and density due to the use of different forages such as mulberry, orange peel, Taiwan grass, alfalfa and corn stover. The highest fat contents were found in the production units of Coatepec and Tatatila.Se evaluó el efecto de la estacionalidad en la calidad microbiológica y fisicoquímica de leche de cabra producida en el centro del estado de Veracruz, México. Se evaluaron leches de diferentes unidades de producción caprina (Coatepec, Perote y Tatatila) producidas en las épocas de lluvias, secas y nortes. Se determinaron los contenidos de mesófilos aerobios, coliformes totales Eschericha coli, Staphylococcus aureus, Salmonella ssp y Brucella sp. así como proteína, grasa, lactosa, sólidos no grasos, densidad y acidez. Los resultados microbiológicos determinaron la ausencia de Eschericha coli, Staphylococcus aureus, Salmonella spp y Brucella sp. en las leches analizadas. El efecto de la interacción Época del año por Unidad de producción por Tipo de leche mostro que el 50% de las leches (crudas y pasteurizadas) producidas en las épocas de norte y lluvias presentaron los mayores contenidos de Mesófilos aerobios y Coliformes totales. El efecto de la interacción unidad de producción por tipo de leche presentaron los mayores contenidos de sólidos no grasos, proteínas, lactosa y densidad debido a uso de diferentes forrajes como morera, cascaras de naranja, pasto Taiwán, alfalfa y rastrojo de maíz. Los mayores contenidos de grasa se encontraron en las unidades de producción de Coatepec y Tatatila
Sports supplements: a health risk?
Get PDFSports supplements are a category of dietary supplements which in recent years has not only increased their quantity and availability, but also the number of new products. Athletes of all levels are interested in consuming supplements which are useful to increase gains in muscle mass thus making the consumption of these products a common practice. Unfortunately, there are some products that are actually doping substances which are offered as sports supplements, on the other hand, certain sports supplements may contain active pharmaceutical ingredients or their analogues undeclared in their ingredients, probably to effectively enhance the benefits that these products ensure exposing consumers to a significant potential health risk, especially those unfamiliar with sports nutrition products. It is important for health professionals to be aware of the possible implications for the consumption of certain products offered in the sports nutrition market when evaluating their patients for a variety of pathologies.Los suplementos deportivos son una categoría de los suplementos alimenticios que en los últimos años no solo ha incrementado en cantidad y disponibilidad, sino también en el número de nuevos productos. Deportistas de todos los niveles se interesan en el consumo de suplementos que son útiles para incrementar la ganancia de masa muscular convirtiendo así el consumo de estos productos en una práctica común. Desafortunadamente existen algunos productos que en realidad son sustancias dopantes que son ofertadas como suplementos deportivos, por otra parte ciertos suplementos deportivos pueden contener sustancias con actividad farmacológica o sus análogos no declarados en sus ingredientes probablemente para potenciar de manera efectiva los beneficios que estos productos aseguran, exponiendo a los consumidores a un riesgo potencial significativo a la salud, sobre todo a aquellos que no están familiarizados con los suplementos deportivos. Es importante que los profesionales de la salud tengan el conocimiento de las posibles implicaciones por el consumo de ciertos productos ofertados en el mercado de la nutrición deportiva al momento de evaluar a sus pacientes para una variedad de patologías
Predicción de la producción y rendimiento de frijol, con modelos de redes neuronales artificiales y datos climáticos
Get PDFThe state of Zacatecas ranks first in the production of rainfed beans in Mexico. Due to the economic and food security repercussions, it is important to predict yields, production and harvested area, as well as to know the climatological variables that have the greatest effect on bean cultivation. The objectives of the present work were 1) to develop ANN models for the prediction of the harvested area, yields and production of rainfed beans in the state of Zacatecas, using data on maximum and minimum air temperature, precipitation and evaporation during the period 1988-2019. 2) to determine the input variables that have the greatest influence on bean production and yield through sensitivity analysis. Due to the limited availability of climatic data, the Climatol library of the R statistical package was used to fill in missing data. The results show that the RNA models capture the influence of climate on bean production, with an overall efficiency of 0.89 for Rto and 0.86 for SC. The production was estimated using the outputs, Rto and SC, from RNA models and an R2 =0.80 was obtained. According to the sensitivity analysis, Evaporation of the cycle is the most important variable in predicting yield, while precipitation in August (Pp_Ago) and minimum temperature (Tmin) had a greater influence on production.
El estado de Zacatecas ocupa el primer lugar en la producción de frijol de temporal en México. Debido a las repercusiones económicas y de seguridad alimentaria, es importante la predicción de los rendimientos, producción y superficie cosechada, igualmente, conocer las variables climatológicas que mayor efecto tienen en el cultivo de frijol. Los objetivos del presente trabajo fueron 1) desarrollar modelos de redes neuronales artificiales RNA para la predicción de la superficie cosechada (SC), los rendimientos (Rto) y la producción (P) de frijol de temporal en el estado de Zacatecas, empleando datos de temperatura máxima y mínima del aire, precipitación y evaporación durante el periodo 1988-2019. 2) realizar un análisis de sensibilidad para determinar las variables de entrada que tienen mayor influencia en la producción y rendimiento de frijol. Debido a la limitada disponibilidad de datos climáticos, se usó la librería Climatol del paquete estadístico R, para el llenado de datos faltantes. Los resultados muestran que los modelos de RNA son capaces de detectar la influencia del clima en la producción de frijol. La eficiencia global en los modelos RNA fue de 0.89 para Rto y 0.86 para SC. La producción se estimó con los modelos de RNA para Rto y SC y se obtuvo un R2 =0.80. De acuerdo al análisis de sensibilidad, la evaporación del ciclo del cultivo (Eva) es la variable más importante en la predicción del rendimiento, mientras que la precipitación de agosto (Pp_Ago) y la temperatura mínima (Tmin) influyeron más en la producción
Identificación de rizobacterias aisladas de Tagetes coronopifolia y Tagetes terniflora (Cempasúchitl) y evaluación de su capacidad inhibitoria in vitro de microorganismos fitopatógenos
Get PDFTagetes is a group of plants commonly known as cempasúchil or “flower of the dead”, which are mainly recognized for their use in the food industry, ornamental horticulture, therapeutic herbalism and culture. Tagetes coronopifolia and terniflora are two species plants of this genus, which are used in crop rotation to control phytopathogenic nematodes. In the curent work, 581 strains were isolated from samples of rhizosphere soil, soil attached to the root and the interior of the root at 30, 60, 90 and 120 days of growth, in greenhouse cultures. From the total isolated rhizobacteria strains, 22 presented antagonistic activity to Fusarium sp. and 53 to Stenocarpella maydis, both. pathogenic fungi in corn, while 37 strains showed antagonism to the pathogenic bacteria Clavibacter michiganensis subsp michiganensis. According to the percentage of inhibition of the phytopathogens, 10 rhizobacteria were selected for molecular identification using a fragment of approximately 1484 bp of the 16SrDNA gene. The similarity analysis using the NCBI BLAST tool, showed that the rhizobacteria belong to the genera Bacillus and Pseudomonas, which are used as biocontrol agents.El género Tagetes, es un grupo de plantas conocidas comúnmente como cempasúchil o flor del muerto, las cuales, son reconocidas principalmente por su uso en la industria alimentaria, horticultura ornamental, terapéutico herbolario y cultural. Tagetes coronopifolia y terniflora, son dos plantas de este género, empleadas en la rotación de cultivos para el control de nemátodos fitopatógenos. En este trabajo se realizó el aislamiento de 581 cepas a partir de muestras de suelo rizosférico, suelo adherido a la raíz y el interior de la raíz a los 30, 60, 90 y 120 días de crecimiento, en cultivos de invernadero. Del total de cepas de rizobacterias aisladas, 22 presentaron actividad antagónica a Fusarium sp. y 53 a Stenocarpella maydis, ambos. hongos patógenos de maíz, mientras que 37 cepas mostraron antagonismo a la bacteria fitopatógena Clavibacter michiganensis subsp michiganensis. De acuerdo con el porcentaje de inhibición de los patógenos en estudio, se seleccionaron 10 rizobacterias para su identificaron molecular utilizando un fragmento de aproximadamente 1484 pb del gen 16SrDNA. El análisis de similitud utilizando la herramienta BLAST del NCBI, arrojó como resultado que las rizobacterias pertenecen a los géneros Bacillus y Pseudomonas, géneros utilizados como agentes de biocontrol
Trichoderma harzianum y espinosina en el control de gorgojo del trigo Sitophilus granarius (L. 1758)
Get PDFSonora, a state located in northwestern Mexico, stands out worldwide for being a producer and supplier of grains and forages, mainly wheat. The existing agroclimatic and technological conditions in the regions where wheat is grown in Sonora are favorable. There are seasons and spaces where pests become a problem and one of them is in storage. Sitophilus granarius, is a small insect which, under favorable conditions, affects up to 85% of stored wheat. Research efforts are being directed towards the development of bioproducts based on fungi or bacteria with entomopathogenic action, with potential utility as bioinsecticides. Studies related to Trichoderma harzianum and spinosyn in the control of the beetle pest of stored grains are minimal and it is in this context, the objective of this work was to evaluate the effect of Trichoderma and spinosyn in the control of Sitophilus granarius in stored wheat. For the development of the study, the grain of all the treatments was first impregnated with spinosyn; three concentrations (three treatments) of T. harzianum conidia were sprayed (T1:103, T2:106 y T3:109 conidias.mL-1), with five repetitions for each treatment. In the study they were considered controls without treatments. The exposure times of the insect to the treatments were 72, 144 and 216 h. The mortality rate was calculated. To establish the differences between treatments and controls, analysis of variance was performed. The results show that Trichoderma harzianum has a bioregulatory effect on S. granarius, which is significant when combined with spinosyn. This bioregulatory effect is emphasized when higher concentrations of 109 condia/mL are inoculated. Studies related to coinoculation and the use of spinosyn should be carried out, as well as evaluating the viability of the seed and the organoleptic properties of the grain.Sonora, un estado ubicado en el noroeste de México, se destaca a nivel mundial por ser un productor y proveedor de granos y forrajes, principalmente de trigo. Las condiciones agroclimáticas y tecnológicas existentes en las regiones donde se siembra trigo en Sonora, son favorables. Hay temporadas y espacios donde las plagas se vuelven un problema y uno de ellos es en el almacenaje. Sitophilus granarius, es un pequeño insecto el cual bajo condiciones favorable llega a afectar al trigo almacenado hasta en un 85%. Los esfuerzos investigativos están siendo orientados hacia el desarrollo de bioproductos a base de hongos o bacterias con acción entomopatógena, con utilidad potencial como bioinsecticidas. Estudios relacionados con Trichoderma harzianum y espinosina en el control del coleópteros- plaga de granos almacenados son mínimos y es en este contexto, el objetivo del presente trabajo consistió en evaluar el efecto de Trichoderma y la espinosina en el control de Sitophilus granarius en trigo almacenado. Para el desarrollo del estudio, el grano de todos los tratamientos fue impregnado primeramente con espinosina; tres concentraciones (tres tratamientos) de conidias de T. harzianum fueron asperjadas (T1:103, T2:106 y T3:109 conidias.mL-1), con cinco repeticiones cada tratamiento. En el studio fueron considerados controles sin tratamientos. Los tiempos de exposición del insecto a los tratamientos fueron de 72, 144 y 216 h. La tasa de mortalidad fue calculada. Para establecer las diferencias entre los tratamientos y los testigos, se realizaron análisis de varianza. Los resultados muestran que, Trichoderma harzianum presenta un efecto biorregulador sobre S. granarius, el cual es significativo cuando se combina con la espinosina. Este efecto bioregulador se enfatiza cuando se inoculan concentraciones superiores de 109 condias/mL. Se deben realizar estudios relacionados con la coinoculación y el uso de la espinosina, asimismo, evaluar la viabilidad de la semilla y propiedades organolépticos del grano
Propagación asexual de Bursera glabrifolia (Sapindales: Burseraceae) bajo diversas condiciones agronómicas de crecimiento
Get PDFDada la importancia que tiene Bursera glabrifolia (Kunth) Engl. en el estado de Oaxaca, para la elaboración de alebrijes, la investigación se realizó con el objetivo de evaluar el prendimiento de estacas de B. glabrifolia en función de dos fechas de plantación (5 de diciembre y 26 de marzo), cuatro sustratos (proporciones de suelo sin uso agrícola:lombricomposta: 100:0, 75:25, 50:50 y 25:75) y cinco profundidades de plantación (5, 10, 15, 20 y 25 cm). El experimento se realizó bajo un diseño experimental factorial 2×4×5 con arreglo completamente al azar. Con ello se pudo encontrar que las estacas sembradas en marzo tuvieron una respuesta favorable en comparación con las establecidas en diciembre. La plantación a 5 cm de profundidad mejoró el prendimiento de las estacas en la fecha de siembra de marzo. A su vez se pudo observar que la fecha y profundidad de propagación, es un factor importante a considerar ya que, de ello depende la supervivencia de las nuevas plantas