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D.I. Diakonov. Some Personal Notes
International audienceIn this short note I recall my friendship with Mitya Diakonov against the background of the historical and political events of that time
Développement et validation de nouveaux tests de viabilité pour la détection de Mycobacterium tuberculosis viable dans les sécrétions respiratoires de patients tuberculeux
Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis, responsible for approximately 10 million new cases and 1.25 million deaths each year, mainly in resource-limited regions such as Africa and Southeast Asia. Among these cases, nearly 3 million remain undiagnosed due to the technical limitations of conventional diagnostic methods. Microscopic examination lacks sensitivity and is operator-dependent, culture is time-consuming and requires biosafety level 3 facilities, while molecular assays, although rapid and sensitive, are costly and demand trained personnel. Beyond diagnosis, therapeutic monitoring remains insufficient: current methods cannot distinguish live from dead bacilli, hindering early detection of relapse or treatment failure. To date, culture remains the only reference method for detecting viable bacilli, but its implementation in the field is limited. The World Health Organization (WHO) therefore recommends the development of rapid, sensitive tests capable of specifically detecting viable bacilli to monitor bacterial load dynamics and adapt patient treatment accordingly.In this context, this PhD work focused on the development and evaluation of three methods for detecting viable M. tuberculosis in sputum samples: the EDMYC method, the PATHFAST TB-LAM assay, and a viability PCR (v-PCR).The EDMYC method, based on the electrochemical detection of the enzymatic activity of the mycobacterial Ag85 complex, showed a sensitivity of 89% and a specificity of 78% in a cohort of 36 patients (18 positives and 18 negatives), confirming its feasibility for viable bacilli detection. Optimization of the protocol, including an adapted liquefaction process and specific magnetic bead-based capture, represents a step toward a portable tool for rapid diagnosis. The commercial PATHFAST TB-LAM assay, which measures the lipoarabinomannan (LAM) glycolipid in sputum, demonstrated a sensitivity of 75% and a specificity of 95% in 60 patients (40 culture-positive and 20 culture-negative for tuberculosis), with results correlated with bacterial load and consistent with microscopy, PCR, and culture findings. Moreover, it showed promising potential for treatment monitoring, with a decrease in LAM concentration observed within the first two months of therapy. The v-PCR, based on the use of the DNA intercalating dye PMAxx, demonstrated satisfactory repeatability, enabling the rapid identification of viable bacilli in sputum samples.The combination of these approaches represents a relevant multi-tool strategy for both the diagnosis and therapeutic monitoring of tuberculosis. Once optimized and clinically validated, these methods could provide efficient tools to tailor patient follow-up to clinical needs and epidemiological contexts, particularly in resource-limited settings, enabling rapid detection of viable bacilli and accurate assessment of treatment response.La tuberculose est une maladie infectieuse causée par Mycobacterium tuberculosis, responsable chaque année de 10 millions de nouveaux cas et de 1,25 million de décès, principalement dans les régions à ressources limitées comme l’Afrique et l’Asie du Sud-Est. Parmi ces cas, environ 3 millions restent non diagnostiqués en raison des limites techniques des méthodes traditionnelles. L’examen microscopique manque de sensibilité et dépend de l’opérateur, la culture est longue et nécessite des infrastructures spécialisées, tandis que les tests moléculaires sont rapides mais coûteux et requièrent du personnel qualifié. Au-delà du diagnostic, le suivi thérapeutique reste insuffisant : les méthodes classiques ne permettent pas de distinguer les bacilles vivants des bacilles morts, rendant difficile la détection précoce des rechutes ou des échecs thérapeutiques. Aujourd’hui, la culture est la seule référence pour identifier les bacilles vivants, mais elle reste difficilement déployable sur le terrain. L’OMS recommande donc le développement de tests rapides et sensibles, capables de détecter spécifiquement les bacilles vivants afin de suivre l’évolution de la charge bacillaire et d’adapter le traitement des patients.Dans ce contexte, mon travail de thèse a porté sur la mise au point et l’évaluation de trois méthodes pour détecter M. tuberculosis viable dans les expectorations : la méthode EDMYC, le test PATHFAST TB-LAM, et une PCR de viabilité (v-PCR).La méthode EDMYC, basé sur la détection électrochimique de l’activité enzymatique du complexe Ag85 spécifique de la mycobactérie, a montré une sensibilité de 89 % et une spécificité de 78 % sur 36 patients (18 positifs et 18 négatifs), confirmant sa faisabilité pour détecter les bacilles viables. L’optimisation du protocole, incluant une fluidification adaptée et une capture spécifique avec des billes magnétiques, ouvre la voie à un test portatif pour le diagnostic rapide. Le test PATHFAST TB LAM commercialisé, mesurant le lipoarabinomannane, glycolipide de la paroi, dans les expectorations, a présenté une sensibilité de 75 % et une spécificité de 95 % sur l’évaluation de 60 patients (40 positifs pour la tuberculose en culture et 20 négatifs), avec des résultats corrélés à la charge bacillaire et concordants avec la microscopie, la PCR et la culture. Il a montré un potentiel prometteur pour le suivi thérapeutique, avec une diminution du LAM observée dès les deux premiers mois de traitement. La v-PCR, utilisant l’intercalant PMAxx, a démontré une répétabilité satisfaisante, permettant d’identifier rapidement les bacilles vivants dans les expectorations.La combinaison de ces approches constitue une stratégie multi-outils pertinente pour le diagnostic et le suivi thérapeutique de la tuberculose. Optimisées et validées, elles pourraient fournir des outils efficaces pour adapter le suivi aux besoins cliniques et aux contextes épidémiologiques, notamment dans les pays à ressources limitées, en permettant une détection rapide des bacilles viables et un suivi précis de la réponse au traitement
L’utilisation de jeux vidéo accessibles adaptés de contes pour proposer à la lecture des classiques aux élèves de primaire
Children read and learn how to read through several different media, which, in the educational system often translates to using printed texts within genres pertaining to children’s literature, among which we find literary tales. Among rising concerns regarding the literacy level of children, teenagers and young adults and shifting attitudes towards reading, which includes a move from traditional printed media to various forms of digital media, we are in need of new pedagogical tools to approach literary classics in education to help students regain an interest in reading and nurture their literacy skills.In France, the formal teaching of reading starts in CP (Cours Préparatoire), the equivalent of first grade. Students must learn how to properly read, enrich their vocabulary and become more autonomous throughout their years in elementary school. Yet already at this age (between 6 and 11), we find those who struggle with reading, or who may not prioritize this activity over others. Our objective within this PhD has been to use literary material found in the programs of the French Ministry of Education, focusing specifically on the study of folk and fairy tales, and adapt them into video games. As they are common and highly popular products, we can expect children to react positively to playing video games in educational contexts and enhance motivation to learn through play. From a design perspective, we have applied a user-centered approach to offer games accessible for children. The games created through this process have been tested with elementary school students to evaluate their enjoyment of such products within the confines of the classroom and validate the accessible design applied in their production. We have also examined how much of the classic stories they played in video game form they remembered after playing, to suggest whether or not video games could be used as a viable alternative and a new tool to practice reading at school and learn while playing.Les enfants lisent et apprennent à lire au travers de différents objets, ce qui dans le système éducatif se traduit généralement par l’utilisation de textes imprimés dans des genres appartenant à la littérature de jeunesse, parmi lesquelles on trouve des contes. Au cœur des inquiétudes sur la littératie des enfants, adolescent.e.s et jeunes adultes, des évolutions des comportements vis-à-vis de la lecture, et notamment d’une transition des lecteur.ice.s vers différentes formes de textes digitaux, nous avons besoin de nouveaux outils pédagogiques pour aborder des classiques de la littérature, afin de contribuer à un regain d’intérêt pour la lecture chez les élèves et à améliorer leur littératie.En France, l’apprentissage formel de la lecture commence en CP. Les élèves doivent, tout au long de leur parcours à l’école primaire, enrichir leur vocabulaire et devenir des lecteur.ice.s autonomes. Toutefois, déjà à cet âge (entre 6 et 11 ans), certain.e.s ont des diffcultés de lecture, et d’autres ne voient pas la lecture comme une priorité, au regard de toutes les autres activitiés qu’iels préfèrent faire. Notre objectif dans cette thèse a été d’utiliser des textes littéraires issus des programmes du Ministère de l’Education Nationale, en se concentrant spécifiquement sur l’étude de contes, et de les adapter en jeux vidéo. Puisque ces derniers font partie du quotidien et sont des produits extrêmement populaires, nous pouvons imaginer que les enfants réagissent positivement à leur utilisation dans des contextes éducatifs et que jouer puisse être un facteur motivant. D’un point de vue créatif, nous avons appliqué une approche centrée sur les utilisateur.ice.s pour proposer des jeux accessibles à un jeune public. Les jeux ainsi créés ont été testés avec des élèves à l’école primaire, pour évaluer leur appréciation de ceux-ci dans l’enceinte de l’école et valider le design accessible appliqué lors de leur production. Nous avons également mesuré ce que les élèves avaient pu retenir de l’histoire à laquelle iels avaient joué, pour dire si oui ou non les jeux vidéo peuvent être une alternative viable et un nouvel outil à destination des enseignant.e.s pour pratiquer la lecture à l’école et apprendre en jouant
La solidarité, geste d’hier
La solidarité, geste d'hier par Kilien STENGELSi dès le IVe siècle, Saint Martin de Tours, soldat romain qui deviendra figure de la miséricorde, partage un jour son manteau avec un pauvre, la volonté d'aider ceux qui en ont besoin est un sujet d'actualité depuis l'Antiquité jusqu'encore aujourd'hui.</div
L’administré et le citoyen, objets et acteurs de la solidarité territoriale
International audienc
Mise en évidence d‘une régulation virale dans la dynamique des populations bactériennes impliquées dans le turnover de la matière organique
National audienc
Exploiter, produire et consommer dans le Massif armoricain, du Néolithique à l’époque Moderne : inventaire des données carpologiques
International audienceLes Rencontres d'Archéobotanique sont régulièrement l'occasion de fédérer la communauté des carpologues pour engager des travaux de synthèse de données carpologiques sur des zones géographiques, des thématiques et des périodes diverses. À ce titre, le quart nord-est de la France, la région Centre-Val-de-Loire, le Massif central, la vallée du Rhône et le littoral méditerranéen comptent déjà leur synthèse régionale sur des séquences chronologiques définies. Aujourd'hui, une nouvelle dynamique de recherche s'installe dans le nord-ouest de la France et, à cette occasion, une synthèse d'envergure a été initiée concernant les données carpologiques sur le Massif Armoricain du Mésolithique à l'époque Moderne. Un premier inventaire, alimenté par les nombreuses et nombreux carpologues participant·e·s, fait déjà état de près de 175 sites étudiés, couvrant 243 phases d'occupations.Cette synthèse s’articule en trois temps avec un objectif à long terme. Le premier axe vise à faire état de la recherches carpologique dans les régions concernées et d’observer les évolutions liées au développement de l’archéologie préventive. Dans un deuxième temps, une analyse des données par périodes chronologiques permet d’observer les activités et lacunes sur le territoire. Enfin, cette présentation permettra d’ouvrir le dialogue vers un projet de recherche destiné à développer cette synthèse collective. Dans le cadre de ce travail d'envergure, la création d'une base de données commune permettrait de valoriser les données de l'Ouest de la France, particulièrement des régions Bretagne et Pays de la Loire qui ont longtemps été considérés comme défavorables aux études carpologiques. L'abondance de ces dernières permet d'appréhender tout un pan des liens qui ont pu exister entre les sociétés humaines et les végétaux dans le Massif armoricain
Pratiques managériales innovantes et bien-être au travail : un lien à questionner
International audienceOur study seeks to characterize the potential relationships between innovative managerial practices and well-being at work. Managerial practices result from a contextualization of various management devices and tools which form a system of values, organizational relationships and structures, and technical supports. The proposed model seeks to identify two factors that condition how practices tend to cohere when managerial innovations are implemented, that is, when the system components align with the how actors adopt the devices and the tools. We hypothesize that a high level of coherence in innovative managerial practices leads to the development of more effective, sustainable and positive practices in terms of well-being at work. Our methodology is based on the analysis of 42 interviews conducted in 27 organizations of various sizes and sectors, most of which have adopted new management methods. The results largely confirm the hypothesis, but they also highlight a number of conditions. The conditions pertain to the modalities of innovation implementation and the negative effects that some of them may generate. The theoretical contribution lies in the concept of “coherent practices”, posited as a necessary and prior condition for well-being at work. The validation conditions provide relevant elements to guide managers wishing to initiate new modes of management with positive and lasting effects on performance.L’objectif de cette recherche consiste à analyser le lien potentiel entre les pratiques managériales innovantes et le bien-être au travail. Les pratiques managériales correspondent à une contextualisation par les acteurs de divers dispositifs et outils de gestion formant un système de valeurs, de relations et de structures organisationnelles, et de supports techniques. Le modèle proposé vise à identifier deux facteurs qui conditionnent la cohérence des pratiques lors de la mise en place d’innovations managériales : un alignement entre des éléments du système et une appropriation par les acteurs. La recherche pose l’hypothèse qu’un niveau de cohérence élevé des pratiques managériales innovantes conduit à installer des pratiques plus efficaces, plus durables et positives sur le bien-être au travail. La méthodologie repose sur l’exploitation et l’analyse de 42 entretiens menés au sein de 27 organisations de tailles et de secteurs d’activité diversifiés, ayant adopté pour la plupart de nouveaux modes de management. Les résultats conduisent à valider en grande partie l’hypothèse posée, sous réserve d’un certain nombre de conditions. Celles-ci concernent le processus de mise en œuvre des innovations et les effets pervers que certaines d’entre elles peuvent générer. La contribution théorique tient dans le concept de « cohérence des pratiques » posé comme condition nécessaire et préalable au bien-être au travail. Les conditions de validation constituent des éléments pertinents pour guider les managers qui souhaitent initier de nouveaux modes de management à effets positifs et durables sur la performance