University of Sucre

Universidad de Sucre: Repositorio Digital
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    1509 research outputs found

    Molecular characters for the taxonomic determination of three species of Lutzomyia (Diptera: Psychodidae), potential Leishmania vectors found in the Aburrá valley, Colombia.

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    Artículo digital.To date, 143 species of Lutzomyia França are recorded in Colombia, but less than 7% is incriminated in the transmission of Leishmania spp. Alternative taxonomic characters are necessary to correctly identify the particular sand fl y fauna in each Colombian region, and the separation of morphologically similar vector and non-vector species. In order to detect useful molecular characters for the taxonomic determination of three potential vectors of Leishmania present in the Valle de Aburrá, Colombia, the present work sequenced the 3’ end of the mitochondrial cytochrome b gene in Lutzomyia hartmanni (Fairchild and Hertig), L. columbiana (Ristorcelli and Van Ty), and L. tihuiliensis Le Pont, Torrez-Espejo and Dujardin. Polymorphic sites, pairwise genetic distances (p), and entropy were determined from the multiple alignment of the nucleotide sequences. Numbers of silent and non silent substitutions were calculated from the amino acid sequences deduced from the nucleotide sequences of the gene. In the multiple alignment of the cytochrome b nucleotide sequences from Lutzomyia hartmanni, L. columbiana and L. tihuiliensis, 83 polymorphic sites were detected. A total of 18 amino acid replacements were found in the partial nucleotide sequences of the protein. Genetic distances varied from 0,137 between L. tihuiliensis and L. columbiana, to 0,215 among L. columbiana and L. hartmanni. Nucleotide and amino acid sequence polymorphisms within the cytochrome b gene and protein, respectively, constitute molecular characters potentially useful for the taxonomic determination of these sand fl y species.En Colombia están registradas 143 especies de Lutzomyia França, pero menos del 7% de éstas se encuentran incriminadas como vectores de Leishmania spp. Debido a la alta semejanza morfológica de algunas especies vectoras con otras no vectoras, se necesitan caracteres taxonómicos alternativos para identifi car correctamente los fl ebotomíneos de cada zona geográfi ca del país. Con este objetivo, en el presente trabajo se secuenció el extremo 3’ del gen mitocondrial que codifi ca para la proteína citocromo b en tres vectores potenciales de Leishmania presentes en el valle de Aburrá, Colombia, Lutzomyia hartmanni (Fairchild y Hertig), L. columbiana (Ristorcelli y Van Ty) y L. tihuiliensis Le Pont, Torrez-Espejo y Dujardin. A partir del alineamiento múltiple de nucleótidos se determinaron los sitios polimórfi cos, las distancias genéticas pareadas netas (p) y la entropía. Las secuencias de nucleótidos fueron trasladadas a aminoácidos para estimar el número de sustituciones sinónimas y no sinónimas. En el alineamiento múltiple de 321 nucleótidos del gen citocromo b de L. columbiana, L. hartmanni y L. tihuiliensis se detectaron 83 sustituciones. En la secuencia parcial de la proteína se encontraron 18 reemplazos de aminoácidos. Las distancias genéticas interespecífi cas fl uctuaron en un rango mínimo de 0,137 entre L. tihuiliensis y L. columbiana, y un máximo de 0,215 entre L. columbiana y L. hartmanni. Los polimorfi smos detectados en la secuencia de nucleótidos del gen y de aminoácidos de la proteína constituyen caracteres moleculares potencialmente útiles para la determinación taxonómica de estas especies de flebotomíneos

    Membranas de celulosa bacteriana como filtros para la remoción de turbidez en agua

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    La celulosa es el polímero natural más abundante en la tierra. Puede ser extraída de distintos organismos, a mencionar, las plantas, hongos, microorganismos y animales invertebrados. Posee excelentes propiedades físico-mecánicas y es químicamente estable. Actualmente, es extraída con mayor frecuencia de fuentes vegetales, en su mayoría árboles maderables. Para su extracción es necesaria la tala masiva de árboles poseedores de lignina, causando un impacto negativo para el ambiente y la naturaleza, por lo que en los últimos años se ha venido implementando la producción de celulosa a partir de bacterias, siendo el organismo modelo para la producción de celulosa Komagataeibacter xylinus, bacteria Gram-negativa aerobia estricta, antes Gluconacetobacter xylinus que produce celulosa a partir de la fermentación de azucares. La celulosa bacteriana cuenta con características físicas, químicas y mecánicas que la hacen superior a la celulosa extraída de fuentes vegetales, a citar, el grado de pureza y cristalinidad, resistencia a la tracción y fácil extracción, por lo que puede ser utilizada para procesos de purificación de aguas, como filtro, por su estructura microporosa que permite retener impurezas, causantes principalmente de la turbidez y poca aceptación del solvente. Para su obtención se utilizaron residuos de piña (Ananas comosus L.) a diferentes concentraciones (40%, 60% y 80%), siendo las dos últimas concentraciones, las óptimas para el crecimiento del biopolímero. La celulosa extraída se empleó como membrana filtrante y presentó una eficiencia del 99% en cuanto a la remoción de turbidez y mejoramiento de ciertas características fisicoquímicas básicas del agua.PregradoBiólogo(a)primera ediciónBiologí

    Caracterización molecular del asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre usando marcadores moleculares tipo RAMs

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    64 hojasEl asno criollo colombiano ha contribuido con el desarrollo de algunos departamentos, estos animales se caracterizan por ser rústicos, adaptados a las condiciones climáticas, por su capacidad de ser alimentados con forrajes de baja calidad nutricional, resistencia a enfermedades, a ectoparásitos, entre otras cualidades ha sido aliadas de los campesinos en las diferentes labores agropecuarias en las son requeridos. Aun así, se encuentra en riesgo de extinción al ser sustituidos algunos de sus usos. Actualmente se desconoce el inventario asnal del país. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente el asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre, usando microsatélites amplificados al azar. Para ello se utilizaron 100 individuos ubicados en las cinco subregiones del departamento, se extrajo el ADN y se amplificó por PCR siete cebadores RAMs, dos de los cuales fueron monomórficos y excluidos de los análisis. Se encontraron un total de 291 bandas, 11.96±1.45 en promedio por cebador, el valor más alto en CCA (18±2.23) y el menor en TG y GT (8.8±0.44). El cebador más polimórfico (88.09±10.91%) y con mayor He (0.376±0.021) fue CA, mientras que el menor fue GT (34.12±7.06% y 0.101±0.040 para % de loci polimórfico y He, respectivamente), aunque solo en este marcador se encontraron loci poco frecuentes. El análisis intrapoblacional mostró un promedio de 66.50±1.72 bandas de las cuales el 89.86±24.04% fueron polimórficas. La subpoblación GO presento el mayor número de bandas (63) y el menor se encontró en MO (48), sin embargo, el valor más alto % de loci polimórfico (81.16%) y He (0.335±0.022) se encontró en la subpoblación MM, siendo esta la más diversa. El promedio de diversidad genética encontrado fue de 0.351±0.021 para toda la población. El análisis de estructura poblacional mostró, un 10% de variación entre subpoblaciones, con un valor de FST de 0.17±0.01 (p<0.05). Las distancias genéticas entre subpoblaciones ubican a MO y GO como las distantes. Se concluye que los marcadores RAMs con eficientes evaluando la diversidad genética del asno, esta raza criolla tienen medios valores de diversidad genética, además, que la estructura genética encontrada puede ser resultado de las barreras geográficas naturales en las subregiones estudiadas.PregradoZootecnist

    Relación entre los Procesos de Simplificación Fonológica y la Lectura Inicial en Niños de 4 y 5 Años de Edad de Instituciones Educativas de Sincelejo, Sucre 2019

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    El objetivo de la presente investigación fue determinar la relación entre los procesos de simplificación fonológica y las habilidades de lectura inicial. En el estudio participaron 99 niños con edades comprendidas entre 4 y 5 años, de dos Instituciones Educativas de la ciudad de Sincelejo. Para ello se aplicó el Test para Evaluar Procesos de Simplificación Fonológica, Revisado (TEPROSIF-R) y el Test para la Detección Temprana de las Dificultades en el Aprendizaje de la Lectura y Escritura. Los resultados obtenidos arrojaron que el tipo de proceso más frecuente en el total de la muestra fue el relacionado con la estructura de la sílaba y la palabra (451) y en menor cuantía el de sustitución (342) y asimilación (342). Consecuente con esto, en la lectura inicial una cantidad importante de niños reflejaron dificultades severas en las habilidades de conciencia fonológica (47,5% en segmentación de sílabas y 36,3% en identificación de fonemas) y discriminación de fonemas (41,4%). A partir de los resultados encontrados, utilizando el Chi cuadrado de Pearson se obtuvo una relación teórica entre los procesos de simplificación fonológica y las habilidades de lectura inicial (p=0,000), se calculó, además, la magnitud del efecto, a través de la “V de Cramer”, obteniendo un “efecto grande” en esta relación.PregradoFonoaudiólogoprimera ediciónFonoaudiologí

    Babesia bigemina in cattle from the municipality of Los Palmitos (Sucre, Colombia)

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    Artículo digitalBovine babesiosis is a disease that usually causes losses in the livestock sector, so it is necessary to diagnose early the haemoparasite in cattle. The aim of this study was the detection, by duplex PCR, of Babesia species that are present in cattle of the municipality of Los Palmitos in the department of Sucre, Colombia.La babesiosis bovina es una enfermedad que suele causar pérdidas en el sector pecuario, por lo que es necesario el diagnóstico temprano del hemoparásito que la transmite a los bovinos. El objetivo de esta investigación fue la detección mediante la reacción en cadena de la polimerasa (pCR) dúplex de especies de Babesia que estén presentes en bovinos, en el municipio Los Palmitos, en el departamento de Sucre, Colombia

    Distribution of Spotted Fever Group Rickettsiae in Hard Ticks (Ixodida: Ixodidae) from Panamanian Urban and Rural Environments (2007-2013).

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    Articulo digital.Tick-borne rickettsiosis is an important emerging disease in Panama; to date, there have been 12 confirmed cases, including eight fatalities. To evaluate the distribution of rickettsiae in Panamanian ticks, we collected questing and on-host ticks in urban and rural towns in elevations varying between 0 and 2300 m. A total of 63 sites (13 urban and 50 rural towns) were used to develop models of spatial distributions. We found the following tick species: Rhipicephalus sanguineus s.l. (present in 54 of 63 towns and cities), Amblyomma mixtum (45/63), Dermacentor nitens (40/63), A. ovale (37/63), Rhipicephalus microplus (33/63), A. oblongoguttatum (33/63), Ixodes affinis (3/63), and Ixodes boliviensis (2/63). Rhipicephalus sanguineus s.l. was present in urban and rural towns, and other species were present only in rural towns. DNA was extracted from 408 R. sanguineus s.l., 387 A. mixtum, 103 A. ovale, and 11 A. oblongoguttatum and later tested for rickettsiae genes using PCR. Rickettsia DNA was detected in ticks from 21 of 63 localities. Rickettsia rickettsii was detected in five A. mixtum (1.29%), and Candidatus ‘‘Rickettsia amblyommii’’ was found in 138 A. mixtum (35%), 14 R. sanguineus (3.4%), and one A. ovale (0.9%). These results suggest that much of rural Panama is suitable for the expansion of tick populations and could favor the appearance of new tick-borne rickettsiosis outbreaks

    Changes in the carboxyl-terminal domain of cytochrome b as a taxonomic character in Lutzomyia (Diptera: Psychodidae).

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    Artículo de revista.Morphological characters have been traditionally used for identification of sand flies of the genus Lutzomyia; however, their utility is limited in some species. In this work, we characterized the mitochondrial DNA region coding for the carboxyl-terminal domain of cytochrome b protein in seven species of Lutzomyia: L. trinidadensis, L. panamensis, L. cayennensis cayennensis, L. dubitans, L. gomezi, L. rangeliana and L. evansi. A total of 134 polymorphic sites were detected in the gene (40.98%) and 29 sites in the protein (26.6%). The very high level of polymorphism observed in cytochrome b, included replacement of amino acids, use of alternative stop codons, and differences in the size of the protein. The utility of the studied region in the identification of Lutzomyia species is discussed.Los caracteres morfológicos se emplean para la determinación taxonómica tradicional de flebotomíneos del género Lutzomyia, sin embargo, su utilidad es limitada en algunas especies. En este trabajo se caracterizó la región del genoma mitocondrial que codifica para el extremo carboxilo terminal de la proteína citocromo b en siete especies de Lutzomyia: L. trinidadensis, L. panamensis, L. cayennensis cayennensis, L. dubitans, L. gomezi, L. rangeliana y L. evansi. Se detectaron 134 sitios polimórficos (40,9%) en el gen y 29 sitios (26,6%) en la proteína. El alto polimorfismo en citocromo b comprendió el reemplazo de aminoácidos, empleo de distintos codones de parada y diferencias en el tamaño de la proteína. Se discute la utilidad de la región estudiada en la identificación de especies de Lutzomyia

    New records of species of Lutzomyia (Diptera: Psychodidae) from the department of Cesar, Colombia.

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    Artículo digital.Studies of the insects associated with the epidemiological cycle of leishmaniasis on the Caribbean coast of Colombia have been focused on the departments of Sucre and Córdoba. The phlebotomine sand fly fauna of the rest of the Caribbean region remains little known. In the present study four species of the genus Lutzomyia are reported from the department of Cesar for the first time. Sand flies were sampled using two CDC light traps with blue color LEDs at Balneario Hurtado, a tourist area in the city of Valledupar. A total of 50 phlebotomine sand flies were collected, of which the species Lutzomyia cayennensis cayennensis (38 % of the sample) and L. trinidadensis (14 %) were already known from the departament. Specimens of L. evansi (28 %), L. venezuelensis (10 %), L. micropyga (6 %) and L. rangeliana (2 %) represent the first records of these species for Cesar, raising the number of known occurrences from the department to eight species. Noteworthy among the new records is the sandfly L. evansi, recognized vector de Leishmania spp. in the Colombian Caribbean coast.El estudio de los insectos asociados a la epidemiología de la leishmaniasis, en la costa Caribe colombiana, se ha concentrado en los departamentos de Sucre y Córdoba, por consiguiente existe un escaso conocimiento de la fauna de flebotomíneos del resto de la región. En la presente nota se presentan cuatro nuevos registros de Lutzomyia spp., para el departamento de Cesar. Los insectos fueron colectados con dos trampas de luz tipo CDC, equipadas con LED de color azul, en el Balneario Hurtado de la ciudad de Valledupar, Cesar. Se recolectaron en total 50 flebotomíneos, los cuales estuvieron representados por las especies Lutzomyia cayennensis cayennensis (38 %), L. evansi (28 %), L. trinidadensis (14 %), L. venezuelensis (10 %), L. micropyga (6 %) y L. rangeliana (2 %). Como primeros registros para el departamento sobresalen L. evansi, L. venezuelensis, L. micropyga y L. rangeliana, con lo que se eleva a ocho el número de especies reportadas hasta la fecha en el Cesar. Entre los nuevos registros se destaca el hallazgo de L. evansi, reconocido vector de Leishmania spp. en la costa Caribe de Colombia

    Sampling Design and Mosquito Trapping For Surveillance of Arboviral Activity.

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    Capítulo de libro electrónicoMosquitoes are the most important vectors for arboviral human diseases across the world. Diseases such as Dengue Fever (DF), West Nile Virus (WNV), Yellow Fever (YF), Japanese Encephalitis (JE), Venezuelan Equine Encephalitis (VEE), and St. Louis Encephalitis (SLE), among others, have a deep impact in public health. Usually mosquitoes acquire the arboviral infection when they feed on viremic animals (birds or mammals), so their infection can be detected along the year or in short periods of time (seasons). All of this depends on the frequency and seasonality of the encounters between viremic animals and vectors. With the convergence of several phenomena like the increasing traveling of human populations, globalization of economy and more recently the global warming, the introduction of nonendemic arbovirus into new areas has become the current scenario. As examples of this new social and environmental frame we can mention the outbreak of West Nile Virus in North America in the late 1990s and more recently the outbreaks of chikungunya and Zika virus in the Americas. The present chapter deals with one of the first steps in the development of research studies and diagnosis programs, the surveillance of arboviruses in their vectors, the sampling design and mosquito trapping methods. The chapter also includes some important considerations and tips to be taken into account during the mosquito fieldwork

    Divergencia del ADN mitocondrial entre poblaciones del campo y de colonia de Anopheles albimanus Wiedemann (Diptera: Culicidae).

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    Artículo digital.Studies of insect vectors may be facilitated by using laboratory colonies. However, it has been suggested that the colony insects are not representative of natural populations, sometimes yeal ding to erroneous interpretations of the intraspecific genetic variation between the individuals. In the present study the variability of the mitochondrial gene cytochrome b was evaluated among a closed laboratory colony of Anopheles albimanus that was founded 20 years ago and the field population from which it was derived. The analyses revealed the presence of five and three nucleotide haplotypes in the wild and colony populations, respectively. Wild individuals presented greater variability than those of the colony based on the number of polymorphic sites, haplotype diversity, nucleotide diversity and mean values of nucleotide differences. The mean and net numbers of nucleotide substitutions per site between populations and the significant FST value calculated (0,37179, P = 0.05) indicate that there is a considerable degree of genetic differentiation between them. The phylogenetic tree showed that the colony haplotypes appear to be derived from the wild population. These results suggest a great genetic variability in wild specimens compared with the laboratory ones as a consequence of a long time of colonization.Las colonias de laboratorio facilitan el estudio de los insectos vectores; sin embargo, se ha sugerido que tales colonias de insectos no son representativas de las poblaciones naturales, llevando en algunos casos, a interpretaciones erróneas respecto a la variación intra específica entre los individuos. En el presente estudio se evaluó la variabilidad del gen mitocondrial citocromo b entre una colonia de laboratorio de Anopheles albimanus Wiedemann fundada hace 20 años y la población del campo de la cual se derivó. Los análisis revelan la presencia de cinco y tres haplotipos en las poblaciones del campo y la colonia, respectivamente; los individuos del campo presentaron una mayor variabilidad que los de la colonia basada en el número de sitios polimórficos, la diversidad haplotípica, la diversidad nucleotídica y el valor promedio de las diferencias nucleotídicas. El promedio y el número neto de sustituciones nucleotídicas por sitio entre las poblaciones y los valores calculados para el FST (0,37179, P = 0.05) indican que existe un considerable grado de diferenciación genética entre ellas; el árbol filogenético muestra que los haplotipos de la colonia parecen derivarse de las poblaciones del campo. Estos resultados sugieren una mayor variabilidad genética existente entre los especímenes del campo en comparación con los individuos de la colonia debido en parte, al largo tiempo de colonización

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