UIBrepositori (Universitat de les Illes Balears)
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Propuesta de intervención de trabajo social de grupos con personas solicitantes de protección internacional de origen venezolano en centros de acogida temporal de cruz roja en Mallorca
No full text[spa] En los Centros de Acogida Temporal del Programa de Protección Internacional de Cruz
Roja, los usuarios se ven inmersos en una situación de ambigüedad e incertidumbre
que les genera un estrés añadido a las diferencias culturales que padecen entre el país
de origen y el de acogida. En el caso de los solicitantes de Protección Internacional de
origen venezolano se ha detectado una dificultad de adaptación a la cultura española
por falta de apoyo y de información de calidad. Se refleja esta necesidad en
investigaciones realizadas en diferentes comunidades autónomas de España. Estos
atraviesan un proceso administrativo de larga duración que conlleva sentimientos de
falta de identidad, incomodidad en el nuevo entorno, incluso conflictos con otros
ciudadanos.
Para dar respuesta a la necesidad detectada, en el presente documento se ha diseñado un
proyecto de intervención de Trabajo Social Grupal que pretende paliar esta necesidad
y facilitar la integración social de dichos usuarios en la sociedad española. Además,
pretende generar un lugar de confianza para la creación de redes de apoyo dentro del
grupo[eng] In the Temporary Reception Centers of the International Protection Program of the Red
Cross, users are immersed in a situation of ambiguity and uncertainty that generates
added stress to the cultural differences between the country of origin and the host
country. In the case of applicants for International Protection of Venezuelan origin, a
difficulty in adapting to Spanish culture has been detected due to a lack of support and
quality information. This need is reflected in research carried out in different
autonomous communities in Spain. They go through a long administrative process
that leads to feelings of lack of identity, discomfort in the new environment, and even
conflicts with other citizens.
In order to respond to the detected need, this document has designed a Group Social
Work intervention project that aims to alleviate this need and facilitate the social
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integration of these users in the Spanish society. In addition, it aims to generate a
place of trust for the creation of support networks within the grou
Estudio de la prevalencia de patología oral y su relación con la obesidad y los estilos de vida de la población escolar de Mallorca
No full text[spa] Introducción
La salud se define como un estado de completo bienestar físico, mental y social, y no solo como la ausencia de enfermedades. En este contexto, la salud oral adquiere una relevancia significativa como indicador integral de calidad de vida, ya que las enfermedades bucodentales no tratadas afectan a cerca de la mitad de la población mundial. Entre las enfermedades bucodentales más frecuentes se encuentran la caries dental y la enfermedad periodontal. Los grupos más vulnerables a las enfermedades orales incluyen a la población infantil y adolescente, que también es la más afectada por la obesidad.
Contenido de la tesis
La obesidad infantil es uno de los problemas de salud pública más preocupantes en las sociedades desarrolladas debido a su creciente prevalencia y a las consecuencias negativas que tiene para la salud, tanto a corto como a largo plazo. Esta problemática guarda una estrecha relación con los estilos de vida y los hábitos adquiridos desde temprana edad. Los estilos de vida, que incluyen, entre otros, la alimentación, la actividad física y las horas dedicadas a las pantallas, desempeñan un papel crucial en la salud integral, influyendo tanto en el desarrollo físico como en la calidad de vida de los niños y adolescentes en edad escolar.
El estudio que se presenta en esta tesis tiene como objetivo analizar la prevalencia de caries y obesidad en la población infantil y adolescente de Mallorca, así como determinar la asociación entre ambas patologías. Además, se busca indagar en los hábitos y estilos de vida que favorecen el desarrollo de estas condiciones.
Los resultados del estudio reflejan una leve disminución en la prevalencia de caries en la dentición permanente, aunque se registra un aumento en la caries de la dentición temporal y en los casos de enfermedad periodontal. Paralelamente, se destaca que la prevalencia de sobrepeso y obesidad sigue en aumento entre la población escolar, afectando en mayor medida a los niños. Aunque nuestros datos no indican una asociación directa entre obesidad y patología oral, se observa que factores como el percentil y la edad ejercen una influencia relevante en la salud bucal. Además, se encuentran diferencias según el sexo biológico en cuanto a los estilos de vida, observándose que los niños dedican más tiempo al uso de pantallas (dispositivos digitales), lo que se asocia con un índice de masa corporal más elevado.
Estos datos subrayan la necesidad de abordar de manera integral los estilos de vida desde la infancia, enfocándose en equilibrar la actividad física, reducir el tiempo frente a pantallas y fomentar hábitos alimenticios saludables, con el fin de mejorar tanto la salud general como la bucodental en esta población. Todo ello resalta la importancia de implementar estrategias de prevención centradas en la promoción de estilos de vida saludables.
La salud se define como un estado de completo bienestar físico, mental y social, y no solo como la ausencia de enfermedades. En este contexto, la salud oral adquiere una relevancia significativa como indicador integral de calidad de vida, ya que las enfermedades bucodentales no tratadas afectan a cerca de la mitad de la población mundial. Entre las enfermedades bucodentales más frecuentes se encuentran la caries dental y la enfermedad periodontal. Los grupos más vulnerables a las enfermedades orales incluyen a la población infantil y adolescente, que también es la más afectada por la obesidad.
La obesidad infantil es uno de los problemas de salud pública más preocupantes en las sociedades desarrolladas debido a su creciente prevalencia y a las consecuencias negativas que tiene para la salud, tanto a corto como a largo plazo. Esta problemática guarda una estrecha relación con los estilos de vida y los hábitos adquiridos desde temprana edad. Los estilos de vida, que incluyen, entre otros, la alimentación, la actividad física y las horas dedicadas a las pantallas, desempeñan un papel crucial en la salud integral, influyendo tanto en el desarrollo físico como en la calidad de vida de los niños y adolescentes en edad escolar.
El estudio que se presenta en esta tesis tiene como objetivo analizar la prevalencia de caries y obesidad en la población infantil y adolescente de Mallorca, así como determinar la asociación entre ambas patologías. Además, se busca indagar en los hábitos y estilos de vida que favorecen el desarrollo de estas condiciones.
Los resultados del estudio reflejan una leve disminución en la prevalencia de caries en la dentición permanente, aunque se registra un aumento en la caries de la dentición temporal y en los casos de enfermedad periodontal. Paralelamente, se destaca que la prevalencia de sobrepeso y obesidad sigue en aumento entre la población escolar, afectando en mayor medida a los niños. Aunque nuestros datos no indican una asociación directa entre obesidad y patología oral, se observa que factores como el percentil y la edad ejercen una influencia relevante en la salud bucal. Además, se encuentran diferencias según el sexo biológico en cuanto a los estilos de vida, observándose que los niños dedican más tiempo al uso de pantallas (dispositivos digitales), lo que se asocia con un índice de masa corporal más elevado.
Conclusiones
Estos datos subrayan la necesidad de abordar de manera integral los estilos de vida desde la infancia, enfocándose en equilibrar la actividad física, reducir el tiempo frente a pantallas y fomentar hábitos alimenticios saludables, con el fin de mejorar tanto la salud general como la bucodental en esta población. Todo ello resalta la importancia de implementar estrategias de prevención centradas en la promoción de estilos de vida saludables.[eng]Introduction
Health is defined as a state of complete physical, mental, and social well-being, and not merely the absence of disease. In this context, oral health takes on significant relevance as an integral indicator of quality of life, since untreated oral diseases affect nearly half of the global population. Among the most common oral diseases are dental caries and periodontal disease. The most vulnerable groups to oral diseases include the child and adolescent population, who are also the most affected by obesity.
Childhood obesity is one of the most concerning public health problems in developed societies due to its increasing prevalence and the negative consequences it has for health, both in the short and long term. This issue is closely related to lifestyle and habits acquired from an early age. Lifestyle factors, including, among others, diet, physical activity, and screen time, play a crucial role in overall health, influencing both physical development and the quality of life of children and adolescents in school age.
Research Content
The study presented in this thesis aims to analyze the prevalence of caries and obesity in the child and adolescent population of Mallorca, as well as determine the association between these two conditions. Additionally, it seeks to investigate the habits and lifestyle factors that promote the development of these conditions.
The results of the study show a slight decrease in the prevalence of caries in permanent teeth, although there is an increase in caries in temporary teeth and in cases of periodontal disease. In parallel, it is noted that the prevalence of overweight and obesity continues to rise among the school population, affecting boys to a greater extent. Although our data do not indicate a direct association between obesity and oral pathology, it is observed that factors such as percentile and age have a significant influence on oral health. Additionally, differences are found according to biological sex in terms of lifestyle, with boys tending to spend more time using screens (digital devices), which is associated with a higher body mass index.
Conclusions
These findings underline the need to address lifestyle comprehensively from early childhood, focusing on balancing physical activity, reducing screen time, and promoting healthy eating habits to improve both general and oral health in this population. This highlights the importance of implementing prevention strategies centred on the promotion of healthy lifestyles.
Introduction
Health is defined as a state of complete physical, mental, and social well-being, and not merely the absence of disease. In this context, oral health takes on significant relevance as an integral indicator of quality of life, since untreated oral diseases affect nearly half of the global population. Among the most common oral diseases are dental caries and periodontal disease. The most vulnerable groups to oral diseases include the child and adolescent population, who are also the most affected by obesity.
Childhood obesity is one of the most concerning public health problems in developed societies due to its increasing prevalence and the negative consequences it has for health, both in the short and long term. This issue is closely related to lifestyle and habits acquired from an early age. Lifestyle factors, including, among others, diet, physical activity, and screen time, play a crucial role in overall health, influencing both physical development and the quality of life of children and adolescents in school age.
Research Content
The study presented in this thesis aims to analyze the prevalence of caries and obesity in the child and adolescent population of Mallorca, as well as determine the association between these two conditions. Additionally, it seeks to investigate the habits and lifestyle factors that promote the development of these conditions.
The results of the study show a slight decrease in the prevalence of caries in permanent teeth, although there is an increase in caries in temporary teeth and in cases of periodontal disease. In parallel, it is noted that the prevalence of overweight and obesity continues to rise among the school population, affecting boys to a greater extent. Although our data do not indicate a direct association between obesity and oral pathology, it is observed that factors such as percentile and age have a significant influence on oral health. Additionally, differences are found according to biological sex in terms of lifestyle, with boys tending to spend more time using screens (digital devices), which is associated with a higher body mass index.
Conclusions
These findings underline the need to address lifestyle comprehensively from early childhood, focusing on balancing physical activity, reducing screen time, and promoting healthy eating habits to improve both general and oral health in this population. This highlights the importance of implementing prevention strategies centred on the promotion of healthy lifestyles.[cat] Introducció
La salut es defineix com un estat de complet benestar físic, mental i social, i no només com l'absència de malalties. En aquest context, la salut oral adquireix una rellevància significativa com a indicador integral de qualitat de vida, ja que les malalties bucodentals no tractades afecten prop de la meitat de la població mundial. Entre les malalties bucodentals més freqüents es troben la càries dental i la malaltia periodontal. Els grups més vulnerables a les malalties orals inclouen la població infantil i adolescent, que també són els més afectats per l'obesitat.
L'obesitat infantil és un dels problemes de salut pública més preocupants en les societats desenvolupades, a causa de la seva creixent prevalença i de les conseqüències negatives que té per a la salut, tant a curt com a llarg termini. Aquesta problemàtica manté una estreta relació amb els estils de vida i els hàbits adquirits des de ben petits. Els estils de vida, que inclouen, entre altres, l'alimentació, l'activitat física i les hores dedicades a les pantalles, exerceixen un paper crucial en la salut integral, influint tant en el desenvolupament físic com en la qualitat de vida dels infants i adolescents en edat escolar.
Contingut investigació
L'estudi que es presenta en aquesta tesi té com a objectiu analitzar la prevalença de càries i obesitat en la població infantil i adolescent de Mallorca, així com determinar l'associació entre ambdues patologies. A més, es vol investigar els hàbits i estils de vida que afavoreixen el desenvolupament d’aquestes condicions.
Els resultats de l'estudi reflecteixen una lleu disminució en la prevalença de càries en la dentició permanent, tot i que es registra un augment en la càries de la dentició temporal i en els casos de malaltia periodontal. Paral·lelament, es destaca que la prevalença de sobrepès i obesitat segueix augmentant entre la població escolar, afectant en major mesura els nens. Tot i que les nostres dades no indiquen una associació directa entre obesitat i patologia oral, s'observa que factors com el percentil i l'edat exerceixen una influència rellevant en la salut bucodental. A més, es troben diferències segons el sexe biològic pel que fa als estils de vida, observant-se que els nens dediquen més temps a l'ús de pantalles (dispositius digitals), cosa que s'associa amb un índex de massa corporal més elevat .
Conclusions
Aquests dades subratllen la necessitat d'abordar de manera integral els estils de vida des de la infància, centrant-se en equilibrar l'activitat física, reduir el temps davant de les pantalles i fomentar hàbits alimentaris saludables, amb l'objectiu de millorar tant la salut general com la bucodental d'aquesta població. Tot això ressalta la importància d'implementar estratègies de prevenció centrades en la promoció d'estils de vida saludables
Un ambiente ¿sano? consumo juvenil de drogas en la escena techno mallorquina: un análisis cualitativo desde una perspectiva de género
No full text[spa] El presente trabajo analiza el consumo juvenil de drogas ilegales desde una perspectiva de
género, en el contexto de Mallorca. Mediante entrevistas cualitativas semiestructuradas
realizadas a jóvenes de entre 20 y 28 años, se exploran las motivaciones, significados y
vivencias asociadas al consumo en estos eventos, así como la percepción del ambiente y las
dinámicas ligadas al género. Los resultados indican que la escena techno presenta formas
alternativas de socialización y expresión de la identidad, estrechamente vinculadas al uso de
sustancias, que actúan como catalizadores de una experiencia colectiva, articulada en torno a
una cierta sensación de bienestar y convivencia armónica. En cuanto a las relaciones de
género, las mujeres describen estos espacios como seguros y menos sexualizados que otros
espacios de ocio. Sin embargo, admiten que el consumo de sustancias sigue estando
fuertemente estigmatizado en su caso. Futuras investigaciones deberían indagar en las
repercusiones sociomorales de ese estigma[eng] This study analyzes the consumption of illegal drugs by young people from a gender
perspective in the context of Mallorca. Through qualitative semi-structured interviews with
young people between 20 and 28 years old, we explore the motivations, meanings and
experiences associated with consumption at these events, as well as the perception of the
environment and the dynamics linked to gender. The results indicate that the techno scene
presents alternative forms of socialization and expression of identity, closely linked to the use
of substances, which act as catalysts of a collective experience, articulated around a certain
sense of well-being and harmonious coexistence. In terms of gender relations, women
describe these spaces as safe and less sexualized than other leisure spaces. However, they
admit that substance use is still strongly stigmatized in their case. Future research should delve
deeper into the sociomoral repercussions of this stigm
Inteligencia artificial aplicada a la medicina
No full text[[spa] La inteligencia artificial (IA) y el aprendizaje automático (ML) están transformando el análisis de
imágenes médicas. Este trabajo estudia la relevancia de diferentes características radiómicas extraídas de
imágenes por resonancia magnética (MRI) y tomografía computarizada (CT) para tareas de clasificación
en oncología. Se emplean 15 datasets públicos, con algoritmos supervisados (Logistic Regression, Random
Forest, XGBoost) y métodos de selección de características (SelectKBest, Boruta, SHAP). El análisis se
centra en identificar los tipos de características (textura, intensidad, morfología) que aportan mayor valor
predictivo. Los resultados revelan que las características de textura son en general las más predictivas.
Asimismo, se observa una correlación entre el tipo de imagen (MRI vs CT) y el tipo de característica
más relevante. Sin embargo, no se identifica una asociación directa entre un tipo de característica y una
patología específica. Este trabajo sugiere que las características de textura tienen más posibilidades de
actuar como biomarcadores de malignidad en distintos contextos clínicos[eng] The application of artificial intelligence (AI) and machine learning (ML) is revolutionizing medical
image analysis. This work main focus is the study of radiomic features extracted from magnetic resonance
imaging (MRI) and computed tomography (CT) scans used for clasifying oncological data. 15 public
datasets are used with supervised machine learning algorithms (Logistic Regression, Random Forest,
XGBoost) and feature selection methods (SelectKBest, Boruta, SHAP). The analysis focuses on identifying
the types of features (texture, intensity, morphology) that provide the highest predictive value.
The results reveal that texture features are generally the most predictive. Additionally, a correlation is
observed between the image type (MRI vs. CT) and the most relevant feature type. However, no direct
association is identified between a specific feature type and a specific pathology. This study suggests that
texture characteristics are more likely to serve as a biomarkers of malignancy in different clinical contexts[cat] La intel·ligència artificial (IA) i l’aprenentatge automàtic (ML) estan transformant l’anàlisi d’imatges
mèdiques. Aquest treball estudia la rellevància de diferents característiques radiómiques extretes d’imatges
per ressonància magnètica (MRI) i tomografia computada (CT) per a tasques de classificació en oncologia.
S’empren 15 conjunts de dades públics, amb algoritmes supervisats (Regressió Logística, Random Forest,
XGBoost) i mètodes de selecció de característiques (SelectKBest, Boruta, SHAP). L’anàlisi se centra en
identificar els tipus de característiques (textura, intensitat, morfologia) que aporten un valor predictiu
més alt. Els resultats revelen que les característiques de textura són, en general, les més predictives. Així
mateix, s’observa una correlació entre el tipus d’imatge (MRI vs CT) i el tipus de característica més rellevant.
Tanmateix, no s’identifica una associació directa entre un tipus de característica i una patologia
específica. Aquest treball suggereix que les característiques de textura tenen més possibilitats d’actuar
com a biomarcadors de malignitat en diferents contextos clínics
Programació metabòlica i durada de la lactància
No full text[cat] La durada de la lactància és un factor que pot condicionar el fenotip adult dels nadons
mitjançant la programació metabòlica. Així, l’escurçament de l’alletament pot programar un
fenotip caracteritzat per alteracions i disfuncions metabòliques en el pàncrees, fetge i teixits
adiposos que poden conduir a perfils obesos i diabètics, així com també pot alterar el
comportament alimentari, tenint como a resultat un perfil hiperfàgic.
L’escurçament de la lactància és més típic en mares obeses, que solen tenir una hipernutrició
que per ella mateixa pot causar efectes de programació adversos, i a més pot potenciar la
programació per deslletament precoç. Per això, es important avaluar l’efecte combinat
d’ambdues condicions. Això s’ha abordat en un experiment on es veu com, en rates mascle,
els efectes a llarg termini en l’adultesa d’una dieta materna obesogènica -com ara l’increment
de l’índex d’adipositat, la insulinèmia i la resistència a la insulina- es magnifiquen quan, a més,
hi ha hagut un deslletament precoç. Tot això amb un fort dimorfisme sexual, ja que en femelles
el deslletament precoç combinat amb una dieta materna obesogènica té efectes a l’adultesa
oposats als que s’observen als mascles[spa] La duración de la lactancia es un factor que puede condicionar el fenotipo adulto de los
neonatos mediante la programación metabólica. Así, el acortamiento de la lactancia puede
programar un fenotipo caracterizado por alteraciones y disfunciones metabólicas en el
páncreas, hígado y tejidos adiposos que pueden conducir a perfiles obesos y diabéticos, así
como también puede alterar el comportamiento alimentario, teniendo como resultado un perfil
hiperfágico.
El acortamiento de la lactancia es más típico en madres obesas, que suelen tener una
hipernutrición que por sí misma puede causar efectos adversos de programación, y además
puede potenciar la programación por destete precoz. Por ello, es importante evaluar el efecto
combinado de ambas condiciones. Esto se ha abordado en un experimento donde se observa
cómo, en ratas macho, los efectos a largo plazo en la adultez de una dieta materna
obesogénica -como el incremento del índice de adiposidad, la insulinemia y la resistencia a la
insulina- se magnifican cuando, además, ha habido un destete precoz. Todo ello con un fuerte
dimorfismo sexual, ya que en hembras el destete precoz combinado con una dieta materna
obesogénica tiene efectos en la adultez opuestos a los que se observan en los machos[eng] The duration of lactation is a factor that can influence the adult phenotype of neonates through
metabolic programming. Thus, shortened lactation can program a phenotype characterized by
metabolic alterations and dysfunctions in the pancreas, liver, and adipose tissues, which can
lead to obese and diabetic profiles, as well as alter feeding behaviour, resulting in a
hyperphagic profile.
Shortening of lactation is more typical in obese mothers, who tend to have overnutrition, which
can cause adverse programming effects by itself and can also enhance the programming due
to early weaning. Therefore, it is essential to assess the combined impact of both conditions.
This has been addressed in an experiment that showed that, in male rats, the long-term effects
of a maternal obesogenic diet in adulthood, such as increased adiposity index, insulinemia,
and insulin resistance, are magnified when the rats are also subjected to early weaning. This
effect exhibited marked sexual dimorphism, as in female rats, early weaning combined with a
maternal obesogenic diet has opposite effects in adulthood compared to those observed in
male
Explorant el potencial de ChatGPT a l’ensenyament d’idiomes per a fins específics: experiències a l’aula d’anglès per a turisme
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Aprendre lingüística des del carrer: una experiència a través del paisatge lingüístic de Palma
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Get PDF[eng] The growing prevalence of nosocomial infections produced by MDR and particularly XDR Pseudomonas aeruginosa strains is associated with significantly increased morbidity and mortality, since it compromises the selection of effective therapies. This increasing threat results from the extraordinary capacity of P. aeruginosa for developing resistance to nearly all available antibiotics by the selection of mutations in chromosomal genes and from the growing prevalence of transferable resistance determinants, particularly those encoding carbapenemases or extended spectrum β-lactamases, frequently co-transferred with aminoglycoside-modifying enzymes determinants and linked to epidemic high-risk clones such as ST111, ST175 and ST235 disseminated in hospitals worldwide.
The combined analysis of chromosomal resistance genes and resistance determinants allow establishing the antibiotic resistance genotype which should correlate with the antibiotic resistance phenotype. Even though several initiatives have provided useful clues and tools for the prediction of the resistance phenotype from WGS genotype analysis over recent years, our current capacity to fully predict the phenotype from the genotype is still incomplete and needs to be continuously refined upon the introduction of novel agents and/or the emergence of novel resistance mechanisms or mutations.
In this doctoral thesis, a genotypic score was developed to predict P.aeruginosa SIR phenotypes for five relevant antipseudomonal agents: ceftazidime, ceftolozane/tazobactam, meropenem, ciprofloxacin and tobramycin based on WGS-data. A set of 40 chromosomal resistance genes potentially involved in mutation-driven resistance were selected to develop the genotypic score system for these five antipseudomonal agents. The presence of acquired resistance determinants and mutations within the chromosomal genes was then scored for each antipseudomonal agent, ranging their effect onto antibiotic resistance from 0 (no effect) to 1 (EUCAST clinical resistance). One hundred wild-type strains obtained from 51 different Spanish hospitals during a 2017 multicenter study were fully sequenced and analyzed in order to define a catalogue of natural polymorphisms in these 40 chromosomal resistance genes. A total of 455 different missense mutations were classified as P. aeruginosa natural polymorphisms. These mutations without a directly effect in antimicrobial resistance were removed from the resistome analysis.
The capacity of genotypic score to predict the susceptibility phenotype was tested in 204 clinical isolates from a Spanish collection and 105 clinical respiratory isolates from a European-ICUs collection. Although a margin for improvement was evidenced in this proof of concept study, an overall good correlation between the genotypic resistance score and the susceptibility profile was documented in both cohorts. The developed score system was able to predict ceftolozane/tazobactam susceptible and resistance in 100% of cases. Furthermore, the capacity to predict susceptibility to ceftazidime (97.7-100%), tobramycin (100-100%) and ciprofloxacin (95.5-100%) was very high in both cohorts. In contrast, the prediction of clinical resistance was far more variable depending on the agent. The prediction of resistance to meropenem was particularly low (46.1-93.9%), whereas the capacity to predict clinical resistance to ceftazidime (72.4-95.7%), tobramycin (87.1-100%) and ciprofloxacin (94.1-98.3%) was highest, especially in the international cohort.
Further refining of the scoring system improved including novel resistance targets and extending both the catalogue of the natural polymorphisms and the panel of resistance genes and the development of a web-based bioinformatics tool for the automatic determination of the genotypic scores should follow.[cat] La creixent prevalença d’infeccions nosocomials produïdes per soques de Pseudomonas aeruginosa multirresistents (MDR) i, particularment, extremadament resistents (XDR) s’associa amb un augment significatiu de la morbiditat i mortalitat, ja que compromet la selecció de teràpies efectives. Aquesta amenaça creixent resulta de l’extraordinària capacitat de P. aeruginosa per desenvolupar resistència a quasi tots els antibiòtics disponibles mitjançant la selecció de mutacions en gens cromosòmics, i de l’augment en la prevalença de determinants de resistència transferibles, particularment aquells que codifiquen carbapenemases o β-lactamases d’espectre estès (BLEE), freqüentment co-transferits amb determinants d’enzims modificants d’aminoglicòsids i lligats a clons epidèmics d’alt risc, com ST111, ST175 i ST235, disseminats a hospitals de tot el món.
L’anàlisi dels gens de resistència cromosòmics juntament amb els determinants de resistència permet establir el genotip de resistència a antibiòtics, que hauria de correlacionar amb el fenotip de resistència. Malgrat que diverses iniciatives han proporcionat pistes i eines útils per a la predicció del fenotip de resistència a partir de l’anàlisi del genotip mitjançant la seqüenciació del genoma complet (WGS) en els últims anys, la nostra capacitat actual per predir completament el fenotip a partir del genotip segueix essent incompleta i necessita ser refinada contínuament davant la introducció de nous agents i/o l'aparició de nous mecanismes o mutacions de resistència.
En aquesta tesis doctoral, es va desenvolupar un sistema de puntuació genotípic per predir els fenotips SIR de P. aeruginosa davant de cinc agents antipseudomònics rellevants: ceftazidima, ceftolozà/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina i tobramicina, basant-se en dades de seqüenciació del genoma complet (WGS). Es va seleccionar un conjunt de 40 gens cromosòmics de resistència, potencialment implicats en la resistència mediada per mutacions, per desenvolupar el sistema de puntuació genotípic per a aquests cinc antibiòtics. La presència de determinants de resistència adquirits i mutacions dins dels gens cromosòmics es va puntuar per a cada agent antipseudomònic, qualificant el seu efecte sobre la resistència antibiòtica de 0 (sense efecte) a 1 (resistència clínica segons EUCAST). Es van seqüenciar i analitzar completament 100 soques silvestres obtingudes de 51 hospitals espanyols diferents durant un estudi multicèntric al 2017, amb la finalitat de definir un catàleg de polimorfismes naturals en aquests 40 gens cromosòmics de resistència. Un total de 455 mutacions van ser classificades com a polimorfismes naturals de P. aeruginosa. Aquestes mutacions sense un efecte directe en la resistència antimicrobiana es van eliminar de l’anàlisi del resistoma.
La capacitat del sistema de puntuació genotípica per predir el fenotip de susceptibilitat es va provar en 204 aïllats clínics d'una col·lecció espanyola i en 105 aïllats respiratoris clínics d'una col·lecció europea d'UCIs. Malgrat que es va evidenciar un marge de millora en aquest estudi de prova de concepte, es va documentar una bona correlació global entre la puntuació de resistència genotípica i el perfil de susceptibilitat en ambdues cohorts. El sistema de puntuació desenvolupat va ser capaç de predir la susceptibilitat i la resistència a ceftolozà/tazobactam en el 100% dels casos. A més, la capacitat per predir la susceptibilitat a ceftazidima (97,7-100%), tobramicina (100-100%) i ciprofloxacina (95,5-100%) va ser molt alta en ambdues cohorts. No obstant això, la predicció de la resistència clínica va ser molt més variable segons l'agent. La predicció de resistència a meropenem va ser particularment baixa (46,1-93,9%), mentre que la capacitat per predir la resistència clínica a ceftazidima (72,4-95,7%), tobramicina (87,1-100%) i ciprofloxacina (94,1-98,3%) va ser més alta, especialment en la cohort internacional.
En un futur s'haurà de millorar el sistema de puntuació incloent nous objectius de resistència i ampliant tant el catàleg de polimorfismes naturals com el panell de gens de resistència. A més del desenvolupament d'una eina bioinformàtica per a la determinació automàtica de les puntuacions genotípiques.[spa] La creciente prevalencia de infecciones nosocomiales producidas por cepas de Pseudomonas aeruginosa multirresistentes (MDR) y, particularmente, extremadamente resistentes (XDR) se asocia con un aumento significativo de la morbilidad y mortalidad, ya que compromete la selección de terapias efectivas. Esta amenaza creciente resulta de la extraordinaria capacidad de P. aeruginosa para desarrollar resistencia a casi todos los antibióticos disponibles mediante la selección de mutaciones en genes cromosómicos, y del aumento en la prevalencia de determinantes de resistencia transferibles, particularmente aquellos que codifican carbapenemasas o β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), frecuentemente co-transferidos con determinantes de enzimas modificantes de aminoglucósidos y vinculados a clones epidémicos de alto riesgo, como ST111, ST175 y ST235, diseminados en hospitales de todo el mundo.
El análisis de los genes de resistencia cromosómicos junto con los determinantes de resistencia permite establecer el genotipo de resistencia a antibióticos, que debería correlacionar con el fenotipo de resistencia a los mismos. A pesar de que varias iniciativas han proporcionado pistas y herramientas útiles para la predicción del fenotipo de resistencia a partir del análisis del genotipo mediante secuenciación del genoma completo (WGS) en los últimos años, nuestra capacidad actual para predecir completamente el fenotipo a partir del genotipo sigue siendo incompleta y necesita ser refinada continuamente ante la introducción de nuevos agentes y/o la aparición de nuevos mecanismos o mutaciones de resistencia.
En esta tesis doctoral, se desarrolló un sistema de puntuación genotípico para predecir los fenotipos SIR de P. aeruginosa frente a cinco agentes antipseudomónicos relevantes: ceftazidima, ceftolozano/tazobactam, meropenem, ciprofloxacino y tobramicina, basándose en datos de secuenciación del genoma completo (WGS). Se seleccionó un conjunto de 40 genes cromosómicos de resistencia, potencialmente implicados en la resistencia mediada por mutaciones, para desarrollar el sistema de puntuación genotípico para estos cinco antibióticos. La presencia de determinantes de resistencia adquiridos y mutaciones dentro de los genes cromosómicos se puntuó para cada agente antipseudomónico, calificando su efecto sobre la resistencia antibiótica de 0 (sin efecto) a 1 (resistencia clínica según EUCAST). Se secuenciaron y analizaron completamente 100 cepas silvestres obtenidas de 51 hospitales españoles diferentes durante un estudio multicéntrico en 2017, con el fin de definir un catálogo de polimorfismos naturales en estos 40 genes cromosómicos de resistencia. Un total de 455 mutaciones fueron clasificadas como polimorfismos naturales de P. aeruginosa. Estas mutaciones sin un efecto directo en la resistencia antimicrobiana se eliminaron del análisis del resistoma.
La capacidad del sistema de puntuación genotípica para predecir el fenotipo de susceptibilidad se testó en 204 aislados clínicos de una colección española y en 105 aislados respiratorios clínicos de una colección europea de UCIs. Aunque se evidenció un margen de mejora en este estudio de prueba de concepto, se documentó una buena correlación global entre la puntuación de resistencia genotípica y el perfil de susceptibilidad en ambas cohortes. El sistema de puntuación desarrollado fue capaz de predecir la susceptibilidad y la resistencia a ceftolozano/tazobactam en el 100% de los casos. Además, la capacidad para predecir la susceptibilidad a ceftazidima (97,7-100%), tobramicina (100-100%) y ciprofloxacino (95,5-100%) fue muy alta en ambas cohortes. Sin embargo, la predicción de la resistencia clínica fue mucho más variable según el agente. La predicción de resistencia a meropenem fue particularmente baja (46,1-93,9%), mientras que la capacidad para predecir la resistencia clínica a ceftazidima (72,4-95,7%), tobramicina (87,1-100%) y ciprofloxacino (94,1-98,3%) fue mayor, especialmente en la cohorte internacional.
En un futuro se deberá mejorar el sistema de puntuación incluyendo nuevos objetivos de resistencia y ampliando tanto del catálogo de polimorfismos naturales como el panel de genes de resistencia. Además del desarrollo de una herramienta bioinformática para la determinación automática de las puntuaciones genotípicas