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Direct Use of Information Extraction from Scientific Text for Modeling and Simulation in the Life Sciences
Get PDFPurpose: To demonstrate how the information extracted from scientific text can be directly used in support of life science research projects. In modern digital-based research and academic libraries, librarians should be able to support data discovery and organization of digital entities in order to foster research projects effectively; thus we speculate that text mining and knowledge discovery tools could be of great assistance to librarians. Such tools simply enable librarians to overcome increasing complexity in the number as well as contents of scientific literature, especially in the emerging interdisciplinary fields of science. In this paper we present an example of how evidences extracted from scientific literature can be directly integrated into in silico disease models in support of drug discovery projects.
Design/methodology/approach: The application of text-mining as well as knowledge discovery tools are explained in the form of a knowledge-based workflow for drug target candidate identification. Moreover, we propose an in silico experimentation framework for the enhancement of efficiency and productivity in the early steps of the drug discovery workflow.
Findings: Our in silico experimentation workflow has been successfully applied to searching for hit and lead compounds in the World-wide In Silico Docking On Malaria (WISDOM) project and to finding novel inhibitor candidates.
Practical implications: Direct extraction of biological information from text will ease the task of librarians in managing digital objects and supporting research projects. We expect that textual data will play an increasingly important role in evidence-based approaches taken by biomedical and translational researchers.
Originality / value: Our proposed approach provides a practical example for the direct integration of text- and knowledge-based data into life science research projects, with the emphasis on its application by academic and research libraries in support of scientific projects
Measuring the Institution's Footprint in the Web
Get PDFPurpose: Our purpose is to provide an alternative, although complementary, system for the evaluation of the scholarly activities of academic organizations, scholars and researchers, based on web indicators, in order to speed up the change of paradigm in scholarly communication towards a new fully electronic 21st century model.
Design/methodology/approach: In order to achieve these goals, a new set of web indicators has been introduced, obtained mainly from data gathered from search engines, the new mediators of scholarly communication. We found that three large groups of indicators are feasible to obtain and relevant for evaluation purposes: activity (web publication); impact (visibility) and usage (visits and visitors).
Findings: As a proof of concept, a Ranking Web of Universities has been built with Webometrics data. There are two relevant findings: ranking results are similar to those obtained by other bibliometric-based rankings; and there is a concerning digital divide between North American and European universities, which appear in lower positions when compared with their US & Canada counterparts.
Research limitations / implications: Cybermetrics is still an emerging discipline so new developments should be expected when more empirical data become available.
Practical implications: The proposed approach suggests the publication of truly electronic journals, rather than digital versions of printed articles. Additional materials such as raw data and multimedia files should be included along with other relevant information arising from more informal activities. These repositories should be Open Access, available as part of the public Web, indexed by the main commercial search engines. We anticipate that these actions could generate larger Web-based audiences, reduce the costs of publication and access and allow third parties to take advantage of the knowledge generated, without sacrificing peer review, which should be extended (pre- & post-) & expanded (closed & open).
Originality / value: A full taxonomy of web indicators is introduced for describing and evaluating research activities, academic organizations and individual scholars and scientists. Previous attempts for building such classification were more incomplete and not taking into account feasibility and efficiency
The Future of eBooks? Will Print disappear? An End-User Perspective
Get PDFPurpose: Ebooks are a hot topic. Traditional book publishing, especially in the academic world, is changing at a rapid pace. The question on everybody's mind is what direction book publishing will take? Will print survive in the Google-generation, or is it destined to be totally replaced by eBooks? Springer publishes over 4000 book titles annually, which are converted into eBooks almost without exception. Being the market leader and innovator of a new business model in electronic books in the STM area, Springer has conducted a study on the implications of the Springer eBook collection in comparison to its print book activities. The main purpose is to find out whether eBooks are cannibalizing print books, as well as an assessment of factors that are influencing eBook usage.
Design/methodology/approach: This study is based upon interviews with both end-users and librarians. And in addition, Springer has assessed the (COUNTER compliant) usage statistics from SpringerLink.
Findings: Overall, Springer's eBook usage is already 50% of its journal usage, while the amount of content compared to journals is only 15%. Taking this success of eBook usage into account, Springer still believes strongly in the print model, and has recently launched MyCopy: heavily discounted print-on-demand books from the electronic versions.
Originality/value: The study shows that print and electronic can exist together, and will complement each other's strengths
Europäische Informationsinfrastruktur: von DRIVER, OpenAIRE, PEER, Europeana und anderen Initiativen mit Beteiligung der Universitätsbibliothek Bielefeld
No full textDas Internet bedingt einen radikalen Wandel des Informationsverhaltens in der Wissenschaft mit sich, auf den auch die infrastrukturellen Einrichtungen der Wissenschaft, etwa Bibliotheken, reagieren. Die Europäische Kommission fördert Vorhaben zum Aufbau einer wissenschaftlichen Informationsinfrastruktur in mehreren Förderprogrammen. Die Universitätsbibliothek Bielefeld beteiligt sich an einigen essentiellen Vorhaben und nimmt damit national wie international eine Vorreiterrolle ein, sei es bei der Vernetzung lokaler Wissensspeicher für Publikationen, sog. Repositorien, (Projekte DRIVER und OpenAIRE), gemeinsam mit Verlagen bei Untersuchungen der Auswirkungen dieser neuen Nutzungsformen (Projekt PEER) oder groß angelegten Projekten zur digitalen Überlieferung des Europäischen Kulturgutes (Europeana)
Neue Methoden für wissenschaftliche Online-Server: SWORD und ORE
Get PDFWären Repositorien im bibliothekarischen Umfeld lediglich abgeschottete elektronische Schubladen für wissenschaftliche Dokumente, dann wären sie ohne besonderen Mehrwert und im Prinzip entbehrlich. Eine simple Datenbank täte es dann auch. Erst ihre Einbettung in die Arbeitsabläufe wissenschaftlicher Kommunikation machen sie zu unverzichtbaren und universellen Speichern. Doch dazu bedarf es weiterer Protokolle und darauf basierender Dienste. Im Rahmen der Präsentation werden die Grundlagen zweier neuartiger - durchaus komplementärer - Entwicklungen gestreift und ihre Anwendungsbereiche beispielhaft in den EU-Projekten PEER und DRIVER skizziert. Dabei handelt es sich zum einen um SWORD (Simple Web-service Offering Repository Deposit), also um einen Dienst, der eine automatisierte Übertragung von Daten aus einer Anwendung in ein Repository ermöglicht. Zum anderen geht es um OAI-ORE (Object Reuse and Exchange). Dabei handelt es sich um ein Protokoll, welches auf der Grundlage der Web-Architektur Aggregationen elektronischer Ressourcen und deren Austausch- bzw. Übertragungsmöglichkeiten definiert
Science Fiction und die Zukunft der englischen Sprache: Neologismen, Vereinfachungen, Kreolisierungen oder lieber gleich Klingonisch?
Get PDFDas Science Fiction Genre kreiert neue Welten und entwickelt mehr oder minder plausible Entwürfe der Zukunft. Hierbei liegt der Schwerpunkt oft auf den technischen, wissenschaftlichen und sozialen Entwicklungen. Aber wie geht das Science Fiction Genre mit der zukünftigen Entwicklung der (englischen) Sprache um? Dieser Beitrag soll zeigen, wie sich Science Fiction Autoren die Zukunft der englischen Sprache sowie komplett nicht-menschliche Sprachen vorstellen und wie weit diese Visionen linguistisch plausibel sind. Hierbei ist festzuhalten, dass sich die meisten Autoren bei der Sprachfrage auf die Kreation von Neologismen beschränken, von denen einige wie "robot" und "television" Eingang in dieAlltagssprache gefunden haben. Andere Autoren versuchen, über eine stark vereinfachte Sprache (George Orwells "newspeak") oder veränderte Rechtschreibung (z.B. C.M. Kornbluth und David Mitchell) Zukünftigkeit zu suggerieren. Einige Werke bemühen sich, Kreolisierungsprozesse darzustellen wie "nadsat" in A Clockwork Orange von Anthony Burgess. Schließlich gibt es auch Versuche, komplett neue Sprachen für außerirdische Zivilisationen zu schaffen, wobei sich Autoren wie Samuel R. Delany oder Jack Vance besonders auf die Sapir-Whorf Hypothese beziehen. Das wohl bekannteste Beispiel einer konstruierten außerirdischen Sprache ist die Klingonische Sprache, geschaffen für die Fernsehserie Star Trek, welche zu den Kunstsprachen mit den weltweit größten Sprechergemeinschaften gehört
Typologische und konstruktionelle Einflüsse bei der Kodierung von Bewegungsereignissen in der Zweitsprache
Get PDFMein Aufsatz behandelt die Frage, inwieweit Sprecher mit Türkisch als Erst- und Deutsch als Zweitsprache bei der Kodierung von Bewegungsereignissen im Deutschen durch ihre L1 Türkisch beeinflusst werden. Die Ergebnisse einer vergleichenden Analyse eines Korpus elizitierter, gesprochener Sprache zeigt, dass sich nur wenige Gebrauchspräferenzen der DaZ-Sprecher feststellen lassen, die von denen einsprachiger Sprecher abweichen. Typologische Einflüsse scheinen dabei, wenn überhaupt, nur einen sehr geringen Teil der Unterschiede erklären zu können. Stattdessen scheint die Präferenz für bestimmte Konstruktionstypen einige Besonderheiten zu verursachen, wobei nicht vollständig geklärt werden kann, ob ein genuiner Transfereffekt vorliegt oder allgemeine Tendenzen, die für alle Lerner- und Zweitsprachen gelten
Ranking library materials
Get PDFPurpose: This paper discusses ranking factors suitable for library materials and shows that ranking in general is a complex process and that ranking for library materials requires a variety of techniques.
Design/methodology/approach: The relevant literature is reviewed to provide a systematic overview of suitable ranking factors. The discussion is based on an overview of ranking factors used in Web search engines.
Findings: While there are a wide variety of ranking factors applicable to library materials, today's library systems use only some of them. When designing a ranking component for the library catalogue, an individual weighting of applicable factors is necessary.
Research limitations/implications: While this article discusses different factors, no particular ranking formula is given. However, this article presents the argument that such a formula must always be individual to a certain use case.
Practical implications: The factors presented can be considered when designing a ranking component for a library's search system or when discussing such a project with an ILS vendor.
Originality/value: This paper is original in that it is the first to systematically discuss ranking of library materials based on the main factors used by Web search engines
Das mentale Lexikon und Vokabellernen in der Grundschule
Get PDFDas mentale Lexikon wird oft als Reservoir bezeichnet, in dem das Wissen über alle dem Individuum bekannten Worte der Muttersprache (L1) gespeichert ist. Es gibt verschiedene Modelle des mentalen Lexikons, die versuchen, dieses Wissen in unterschiedlicher Weise abzubilden. Die Modelle variieren insbesondere in Hinblick auf die Art des gespeicherten Wissens und die Verknüpfung der kognitiven Informationen untereinander. Darüber hinaus wird diskutiert, ob das mentale Lexikon für eine Fremdsprache (L2) ein eigenständiges System ist oder ob es ganz oder teilweise in das Lexikon der L1 integriert ist. In diesem Artikel werden Unterschiede und Gemeinsamkeiten ausgesuchter Modelle sowie deren Implikationen speziell für den Frühen Fremdsprachenunterricht aufgezeigt, auf dessen Grundlage eine Interventionsstudie an Grundschulen (in Klasse 3 und 4) durchgeführt wurde. In dieser Studie wurden die Versuchsgruppen in einer Weise unterrichtet, die auf Erkenntnissen der kognitiven Linguistik basiert und das Wissen über das mentale Lexikon im Anfangsunterricht nutzbar machen will
