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Uma metodologia eficiente para recuperação de exames médicos DICOM por similaridade de caracteristicas visuais
Get PDFDissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computaçao.À medida que se iniciou o processo de popularização de exames médicos em formato digital, surgiu à necessidade de se desenvolver técnicas capazes de facilitar o processo de tomada de decisão médica. Nesse contexto, técnicas de Recuperação de Imagens Médicas Baseada no Conteúdo - Content-Based Medical Image Retrieval (CBMIR) [MULLER, 2004a] têm sido empregadas
Montando questionários para medir a satisfação do usuário: avaliação de interface de um sistema que utiliza técnica de recuperação de imagens por conteúdo.
No full textO resumo intuitivo e atraente da interface com o usuário é essencial para o sucesso de qualquer sistema computacional. Dentro do escopo de sistemas CBIR (content-Based Image Retrieval), que são sistemas inerentemente interativos de recuperação de imagens baseadas em conteúdo, a interface do usuário ainda é um elemento constituído de pouca pesquisa e desenvolvimento. Um dos maiores obstáculos para a eficácia de design desses sistemas consiste da necessidade em prover aos usuários uma interface de alta qualidade na formulação de perguntas e exibição dos resultados. O objetivo principal deste trabalho visou analisar a interação do usuário em sistemas CBIR em relação à funcionalidade e usabilidade por meio da interação de usuários reais dentro do domínio da aplicação e propor questionário que reflita, fielmente os pontos avaliados. Para alcançar esse desafio, a interação humano-computador foi avaliada, adotando técnicas de questionamento a fim de mensurar a satisfação do usuário em relação ao uso do sistema
Como tornar sua apresentação atrativa e interessante.
Get PDFIntrodução. Apresentação é uma atividade que envolve a preparação dos slides e a apresentação do conteúdo para uma audiência. As duas etapas exigem muitas recomendações e dicas que serão apresentadas em dois artigos divididos em: 1) Preparação dos Slides e 2) Apresentação dos Slides. Preparar uma apresentação é uma atividade frequente na vida acadêmica ou profissional. Durante a graduação, os alunos são motivados a apresentar seminários e trabalhos de conclusão de curso. Alunos de pós-graduação defendem seus projetos apresentando-os a uma banca na qualificação e na conclusão do seu mestrado e/ou doutorado. Aqueles que optam pelo mercado de trabalho, frequentemente farão apresentações na empresa ou para clientes. Atualmente, existem vários recursos áudio-visuais e softwares que podem ser utilizados para preparar slides de alta qualidade. O objetivo deste artigo é apresentar um pequeno guia prático para elaborar apresentações que motivem, transmitam a idéia do trabalho de forma adequada e que sejam capazes de despertar e cativar a atenção dos ouvintes. Além disso, vamos apontar alguns usos que devem ser evitados. Antes de iniciar a elaboração da apresentação, é preciso saber claramente qual é o seu objetivo. Um passo importante que antecede a elaboração dos slides é conhecer sua audiência, as regras da sessão, o tempo da apresentação e os recursos áudio-visuais disponíveis. Esse conhecimento prévio ajuda a pensar na linguagem a ser utilizada, quantos slides devem ser elaborados e que tipo de recursos poderá ser usado na apresentação. Conhecer a audiência também ajuda a escolher a melhor forma de abordar o assunto da apresentação. Por exemplo, evite falar sobre conceitos básicos para uma platéia de especialistas, permitindo gastar mais tempo com os aspectos mais relevantes do seu trabalho. A apresentação deve ser estruturada para cativar a atenção dos expectadores para o seu problema e impressionar os especialistas com o seu trabalho. No entanto, a apresentação deve ser atrativa também para os não-especialistas e isso pode ser conseguido com slides mais intuitivos, que passem a idéia principal e a importância/aplicação do trabalho
Como se preparar para uma apresentação de sucesso: com seus slides prontos, veja como apresentá-los de maneira eficiente.
Get PDFO sucesso na apresentação de um trabalho depende mais da dedicação na preparação do conteúdo e do treino para apresentá-lo do que do talento do apresentador. É verdade que com a prática, muitas pessoas acabam se tornando exímias apresentadoras. No entanto, para se tornar um especialista na arte de apresentar trabalhos, é preciso muito mais ?transpiração? do que ?inspiração?. Apresentação é uma atividade que envolve duas etapas de trabalho: a elaboração dos slides e a exposição do conteúdo para um grupo de espectadores. A primeira etapa de confecção dos slides já foi detalhada em artigo anterior (SBC-Horizontes - Número 03, Dezembro 2009). Neste artigo, trataremos das questões envolvidas com a preparação prévia e as dicas para o dia da apresentação. Tanto na vida acadêmica quanto profissional, frequentemente nos deparamos com situações em que é necessário nos manifestarmos oralmente. Desde o relato de uma idéia em uma reunião até uma apresentação formal em um evento, terá mais sucesso aquele que conseguir transmitir melhor o conteúdo e prender a atenção dos ouvintes. Durante a graduação, por exemplo, os alunos são avaliados por meio de seminários e apresentação de trabalhos de conclusão. Alunos de pós-graduação defendem seus projetos apresentando-os a uma banca na qualificação e na conclusão do seu mestrado e doutorado. Aqueles que optam pelo mercado de trabalho, também precisam defender idéias em reuniões ou negociar projetos/contratos com clientes. Em todas essas tarefas, é importante conhecer técnicas e saber se portar adequadamente diante da audiência a fim de obter êxito com a apresentação. Nesse contexto, o objetivo deste artigo é descrever um conjunto de dicas de como se preparar para apresentar um trabalho a fim de transmitir a idéia da melhor forma, despertar e cativar a atenção dos ouvintes. Além disso, vamos indicar aspectos que devem ser evitados na hora da apresentação. Ao se preparar para apresentar um trabalho é de extrema importância conhecer sua audiência, as regras da sessão, o tempo da apresentação e os recursos disponíveis no ambiente. Esse conhecimento prévio ajuda a pensar na linguagem a ser utilizada, no tempo a ser gasto e o quão formal a apresentação deve ser. De qualquer forma, o mais importante é ter em mente que qualquer pessoa é capaz de fazer uma boa apresentação. Munido de slides criativos e com um bom treino, certamente sua apresentação tem tudo para ser um sucesso
Combinação de técnicas de interação humano-computador para avaliação de sistemas de recuperação de imagens por conteúdo.
No full textA interação humana pode contribuir efetivamente para avaliar o desempenho de sistemas de recuperação de imagens baseadas em conteúdo (Content-based Image Retrieval - CBIR), tanto em relação à eficiência e eficácia, quanto a satisfação do usuário. O crescimento, aprimoramento e a excelência da pesquisa em técnicas CBIR, avaliados pela sua performance na recuperação de informações, contradizem-se com a ausência de procedimentos específicos de avaliação por meio da percepção visual do usuário. Um dos desafios decorrentes desses sistemas consiste na necessidade em prover aos usuários uma interface de alta necessidade em prover aos usuários uma interface de alta qualidade na formulação de perguntas e exibição dos resultados. O objetivos deste trabalho foi avaliar a interação humano-computador para sistemas CBIR que atuam em modo compartilhado usando intranet, aplicando uma combinação de técnicas de avaliação, levando em consideração o usuário final e os fatores humanos que influenciam o trabalho com grandes volumes de dados e imagens. Tal avaliação foi baseada em um estudo de caso aplicado à medicina, visando tornar o diagnóstico médico e a evolução dos tratamentos cada vez mais precisos e eficientes.WebMedia 200
Tri-plots: Scalable tools for multidimensional data mining
No full textWe focus on the problem of finding patterns across two large, multidimensional datasets. For example, given feature vec-tors of healthy and of non-healthy patients, we want to an-swer the following questions: Are the two clouds of points separable? What is the smallest/laxgest pair-wise distance across the two datasets? Which of the two clouds does a new point (feature vector) come from? We propose a new tool, the tri-plot, and its generalization, the pq-plot, which help us answer the above questions. We provide a set of rules on how to interpret a tri-plot, and we apply these rules on synthetic and real datasets. We also show how to use our tool for classification, when traditional methods (nearest neighbor, classification trees) may fail
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No full textO presente trabalho traz uma revisão das técnicas de compressão de dados e a correspondente descompressão. A compressão tem por objetivo preservar as informações de modo que ocupem menos espaço em sistemas de armazenamento de massa de dados. A descompressão e caminho inverso, buscando recuperar os dados para que possam ser reconhecidos. Neste sentido algumas técnicas são discutidas mostrando como o processo e realizado e em quais métodos encontra-se perda de dados. A perda de dados e uma das características que são exploradas por alguns métodos de compressão de dados principalmente quando trabalha-se com imagens. Características físico-visuais do sistema de visão humana quando da interpretação de imagem, constitui um aspecto importante na escolha do compressor de dados de imagem. Assim, pode-se alcançar uma elevada taxa de compressão para dados de imagem. A técnica escolhida para tratar a compressão e descompressão de imagens foi a proposta pelo Joint Photographics Expert Group - JPEG, grupo formado pela união de interesses entre International Standard Organazation - ISO e CCITT com o objetivo de constituir uma norma padronizada para compressão de imagens coloridas ou tons de cinza. Assim, implementou-se um sistema de compressão de dados utilizando alguns módulos do algoritmo proposto por JPEG, sendo implementado em maquinas de uso geral, com objetivo de colocá-las a disposição do Sistema de Tomografia, desenvolvido pelo grupo de Ressonância Magnética - RM do IFSC, uma vez que em uma sessão de tomografia são geradas muitas imagens, pode-se encontrar dificuldade com a preservação das mesmasThis work presents a review of data compression and decompression techniques. Data compression is aimed at preserving the information while optimizing storage space. The decompression process recovers the original data to a state suitable for presentation or analysis. This work discusses several compression techniques with emphasis on the data loss aspect. Data loss (lossy) is explored by some compression methods to enhance the compression rate, and lossy techniques may be used in applications such as the storage and transmission of images, allowing higher compression rates. In this case, the physical characteristics of the human eye, in addition to psychological aspect are important factors in the choice of an appropiate technique. This study was aimed at selecting a suitable compression/decompression technique for an imaging Tomographic System, developed for the Tomographic Magnetic Resonance system developed at the IFSC-USP. The choice has fallen on the one proposed by the Joint Photographic Expert Group JPEG. Some standardized compression methods were implemented in a platform independent environment. The availability of a compression engine coupled to such a system is important due to the high number of images that can be generated in a tomographic session, and also due to the need of preserving many of the
Técnicas de indexação de grandes conjuntos de dados complexos com valores de atributos faltantes.
No full textDue to the increasing amount and complexity of data processed in real world applications, similarity search became a vital task to store and retrieve such data. However, missing attribute values are very frequent and metric access methods (MAMs), designed to support similarity search, do not operate on datasets when attribute values are missing. Currently, the approach to use the existing indexing techniques on datasets with missing attribute values just use an indicator to identify the missing values and employ a traditional indexing technique. Although, this approach can be applied over multidimensional indexing techniques, it is impractical for metric access methods. This dissertation presents the results of a research conducted to identify and deal with the issues related to indexing and querying datasets with missing values in metric spaces. An empirical analysis of the metric access methods when applied on incomplete datasets leads us to identify two main issues: distortion of the internal structure of the index when data are missing at random and skew of the index structure when data are not missing at random. Based on those findings, a new variant of the Slim-tree access method, called Hollow-tree, is presented. It employs new techniques that are capable to handle missing data issues when missingness is ignorable. The first technique includes a set of indexing policies that allow to index objects with missing attribute values and prevent distortions to occur in the internal structure of the indexes. The second technique targets the similarity queries to improve the query performance over incomplete datasets. This technique employs the fractal dimension of the dataset and the local density around the query object to estimate an ideal radius able to achieve an accurate query answer, considering data with missing values as a potential response. Results from experiments with a variety of real and synthetic datasets show that Hollow-tree achieves nearly 100% of precision and recall for Range queries and more than 90% for k Nearest Neighbor queries, while Slim-tree access method deteriorates with the increasing amount of missing values. The results confirm that the indexing technique helps to establish consistency in the index structure and the searching technique achieves a remarkable performance. When combined, the new techniques allow to explore properly all the available data even with high amounts of missing attribute values. As they are independent of the underlying access method, they can be adopted by a broad range of metric access methods, allowing to extend the class of MAMs.O crescimento em quantidade e complexidade dos dados processados e armazenados torna a busca por similaridade uma tarefa fundamental para tratar esses dados. No entanto, atributos faltantes ocorrem freqüentemente, inviabilizando os métodos de acesso métricos (MAMs) projetados para apoiar a busca por similaridade. Assim, técnicas de tratamento de dados faltantes precisam ser desenvolvidas. A abordagem mais comum para executar as técnicas de indexação existentes sobre conjuntos de dados com valores faltantes é usar um indicador de valores faltantes e usar as técnicas de indexação tradicionais. Embora, esta técnica seja útil para os métodos de indexação multidimensionais, é impraticável para os métodos de acesso métricos. Esta dissertação apresenta os resultados da pesquisa realizada para identificar e lidar com os problemas de indexação e recuperação de dados em espaços métricos com valores faltantes. Uma análise experimental dos MAMs aplicados a conjuntos de dados incompletos identificou dois problemas principais: distorção na estrutura interna do índice quando a falta é aleatória e busca tendenciosa na estrutura do índice quando o processo de falta não é aleatório. Uma variante do MAM Slim-tree, chamada Hollow-tree foi proposta com base nestes resultados. A Hollow-tree usa novas técnicas de indexação e de recuperação de dados com valores faltantes quando o processo de falta é aleatório. A técnica de indexação inclui um conjunto de políticas de indexação que visam a evitar distorções na estrutura interna dos índices. A técnica de recuperação de dados melhora o desempenho das consultas por similaridade sobre bases de dados incompletas. Essas técnicas utilizam o conceito de dimensão fractal do conjunto de dados e a densidade local da região de busca para estimar um raio de busca ideal para obter uma resposta mais correta, considerando os dados com valores faltantes como uma resposta potencial. As técnicas propostas foram avaliadas sobre diversos conjuntos de dados reais e sintéticos. Os resultados mostram que a Hollow-tree atinge quase 100% de precisão e revocação para consultas por abrangência e mais de 90% para k vizinhos mais próximos, enquanto a Slim-tree rapidamente deteriora com o aumento da quantidade de valores faltantes. Tais resultados indicam que a técnica de indexação proposta ajuda a estabelecer a consistência na estrutura do índice e a técnica de busca pode ser realizada com um desempenho notável. As técnicas propostas são independentes do MAM básico usado e podem ser aplicadas em uma grande variedade deles, permitindo estender a classe dos MAMs em geral para tratar dados faltantes
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No full textNeste trabalho é apresentado um algoritmo para a reconstrução tridimensional de imagens digitais, o qual foi baseado na combinação de transformada rápida de Fourier com janela de Hamming e o uso de função trilinear para interpolação. O algoritmo possibilita não somente a geração de mapas tridimensionais da distribuição espacial de spins para tomografia por ressonância magnética (MRT), como também mapas de coeficientes de atenuação para tomógrafos de raio-X ou raio-Gamma. A técnica de tons de cinza foi utilizada para a visualização das imagens, bem como foi utilizado ferramentas desenvolvidas no ICMSC, as quais possibilitam análises de fatias coronais ou sagitais das imagens reconstruídas. Resultados mostraram a grande utilidade e eficiência do algoritmo, o qual primeiramente reconstrói as imagens bidimensionalmente para em seguida ser aplicada a interpolação trilinear. Em particular,dados obtidos dos tomógrafos de ressonância magnética do IFSC-USP e do de raio-X e Gamma do CNPDIA-Embrapa, ambos de São Carlos-SP, foram utilizados para avaliação do algoritmo. Adicionalmente, uma comparação com o método de retroprojeção é também apresentado. O algoritmo foi desenvolvido em linguagem C++ e em ambientes DOS e UNIX.In this work it is presented an algorithm for three-dimensional digital image reconstruction. Such algorithm is based on the combination of both a Fast Fourier Transform method with Hamming Window and the use of a tri-linear interpolation function. The algorithm allows not only the generation of three-dimensional spatial spin distribution maps for Magnetic Resonance Tomography data but also X and y-rays linear attenuation coefficient maps for CT scanners. The gray-level technique was used for image visualization, as well as for tools developed at the ICMSC-USP. It is also possible to analyze coronal or sagital slices of reconstructed images. Results demonstrates the usefulness of the algorithm in tree-dimensional image reconstruction by doing first two-dimensional reconstruction and rather after interpolation, i.e., in particular with tomographic data obtained by using the MR scanner from the IFSCUSP and the CT scanner from the CNPDIA-Embrapa, both from São Carlos-SP. Additionaly, a comparation with the backprojection method is outlined. The algorithm was developed in C++ language, and there are two available versions: one under the DOS environment, and the other under the UNIX/Sun environmen
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