1,721,019 research outputs found
Untersuchen von verschiedenen Strategien zum Targeting von mutiertem p53 für die Krebstherapie
No full textTP53 is an essential tumor suppressor gene. It is inactivated in 50% of tumors, most frequently by missense mutations that result in the expression of a mutant p53 protein (mutp53). Mutp53 loses the ability to activate tumor-suppressive target genes and acquires pro-tumorigenic gain-of-function properties.
An emerging strategy for treatment of cancers with missense p53 mutations is pharmacological restoration of wild-type p53 activity. Initial evidence that p53 reactivation leads to tumor regression was obtained in mouse models where p53 loss was the initiating event. Many patient tumors, however, develop in the presence of wild-type p53 and inactivate it only at later stages of evolution. To bypass p53-dependent tumor suppression such tumors acquire alterations in the p53 pathway that, in principle, could render p53 reactivation inefficient. To test this, we have modeled late-stage p53 inactivation in mice. Surprisingly restoration of p53 in such late-inactivated tumors resulted in widespread apoptosis and superior survival of the animals. ARF gene alterations were identified as a cause of primary or acquired resistance that could be overcome by Mdm2 inhibitors. Together this study provided proof of concept that p53 reactivation is an effective therapy option for tumors with late-stage p53 inactivation and identified ARF as a predictive biomarker.
Among the many different missense mutations, cooperativity mutations represent a mechanistically unique class that often results in a partial loss-of-function (pLOF). As pLOF is a characteristic of many non-hotspot p53 mutations, we have tested if residual functions of two distinct p53 cooperativity mutants (p53E177R “RR” and p53R178E “EE”) may be exploited to induce cell death. Using embryonic development as a model, we have shown that Mdm2-deficiency results in constitutive stabilization of p53 cooperativity mutants and triggers massive apoptosis and embryonic lethality. This indicated that the apoptosis deficiency, characteristic for p53 pLOF mutants, can be rescued by inhibition of Mdm2. Studies of p53 cooperativity mutant mice confirmed that stabilization of mutp53 by pharmacological or constitutive Mdm2 inhibition lowers the apoptotic threshold, sensitizes tumor cells to the pro-apoptotic activity of DNA damaging drugs, and generates a survival benefit under chemotherapy. This was even seen for the DNA binding-deficient cooperativity mutant EE, pointing at a critical role of non-transcriptional apoptotic functions in the context of chemotherapy. In parallel, p53EE was found to be incapable of suppressing tumor development, highlighting a differential role of p53’s non-transcriptional apoptotic functions in tumor suppression and cancer therapy. Collectively, our investigation of two cooperativity mutants suggests that non-hot-spot p53 variants retain residual wild-type activities, that can be harnessed for cancer therapy.TP53 ist ein essentielles Tumorsuppressorgen, welches in über 50% aller Tumore inaktiv vorliegt. Häufig geschieht dies durch sogenannte Missense-Mutationen, welche zur Expression eines mutierten p53 Proteins führen. Mutp53 verliert zwar die Fähigkeit tumorsuppressive Zielgene zu aktivieren, gewinnt aber neue, pro-tumorale Eigenschaften hinzu.
Ein neu aufkommender Therapieansatz um Tumorpatienten mit einer Missense p53 Mutation zu behandeln, ist die pharmakologische Reaktivierung der p53-Wildtyp Funktion. Erste Anhaltspunkte, dass eine p53 Reaktivierung zu einer Tumorregression führen kann, wurden in Mausmodellen beobachtet, bei denen ein Verlust der p53 Funktion das auslösende Ereignis der Tumorentstehung darstellt. Im Gegensatz dazu entwickeln sich Tumore in Patienten oftmals in Gegenwart von Wildtyp p53 und dessen Inaktivierung stellt einen späten Schritt in der Tumorevolution dar. Um tumorsuppressive Funktionen von p53 in solchen Tumoren zu umgehen, ist vorstellbar, dass diese Tumore Alterationen im p53 Signalweg erwerben, die eine Ineffizienz späterer p53 Reaktivierung induzieren. Um diese Annahme zu testen, haben wir eine späte p53 Inaktivierung in Maustumoren untersucht. Überraschenderweise konnten wir zeigen, dass eine Reaktivierung von p53 in diesen spät inaktivierenden Maustumoren zum Auftreten massiver Apoptose und zu einer erhöhten Überlebensrate der Tiere führte. Alterationen des Arf Gens wurden hierbei als Ursache primärer oder akquirierter Resistenz identifiziert, welche jedoch durch Mdm2-Inhibitoren überkommen werden konnten. Zusammenfassend belegt unsere Studie ein Konzept, in dem die Reaktivierung von p53 auch in Tumoren mit einem späten Verlust der p53 Funktion eine effektive Therapie darstellt. Zudem haben wir in diesem Zusammenhang Arf als Biomarker identifizieren können.
P53 Kooperativitätsmutanten stellen eine aus mechanistischer Sicht einzigartige Klasse innerhalb des Spektrums von p53 Missense Mutationen dar und resultieren in einem teilweisen Verlust der Funktion von p53 (sogenannte pLOF Mutanten). Typischerweise handelt es sich bei vielen non-hotspot Mutanten ebenfalls um pLOF Mutationen. In unserem Projekt haben wir die Fragestellung untersucht, ob sich die residuale Funktion zweier solcher Mutanten (p53E177R “RR““ und p53R178E “EE“) nutzen lässt um Apoptose von Tumorzellen zu induzieren. Als Modell haben wir dabei die embryonale Mausentwicklung gewählt. Dabei führte eine Defizienz von Mdm2 zu einer konstitutiven Stabilisierung der p53 Kooperativitätsmutanten, was mit massiver Apoptoseinduktion und embryonaler Lethalität einherging. Das Ergebnis impliziert, dass eine für p53 pLOF typische Apoptosedefizienz durch gleichzeitige Hemmung von Mdm2 überwunden werden kann. So zeigen Studien mit Mäusen, die eine p53 Kooperativitätsmutante tragen, dass eine Stabilisierung von Mutp53, herbeigeführt durch pharmakologische oder konstitutive Hemmung von Mdm2, die Apoptoseschwelle herabsetzt. Tumorzellen werden so gegenüber DNA schädigenden Agenzien sensitiviert, was mit einem verbesserten Überleben der Tiere unter Chemotherapie einhergeht. Diese Beobachtung kann sogar für die DNA-bindungsdefiziente p53 Mutante “EE“ gemacht werden, was auf eine nicht transkriptionelle apoptotische Funktion von p53 im Zusammenhang mit Chemotherapie hinweist. Parallel haben wir gezeigt, dass diese “EE“ Mutante die Tumorentstehung per se nicht verhindern konnte. Somit scheinen nicht- transkriptionelle Eigenschaften von p53 eine differentielle Funktion bei Tumorentstehung versus Therapie zu spielen. Zusammenfassend zeigt unsere Studie an zwei kooperativitätsdefizienten p53 Mutanten, dass diese mit residualen tumorsuppressiven Funktionen ausgestattet sind, die für die Effizienz einer Chemotherapie ausgenutzt werden können
p53RR in the therapy of Eμ-Myc lymphoma
No full textTumor diseases are among the most common causes of death in humans. Our most prolific protection against tumors is provided by the p53 protein, which counteracts the development of
tumors in a variety of ways and is, therefore, called the tumor suppressor gene. A loss of normal p53 function substantially increases the risk for tumor diseases. Tumors that harbor mutations
in the p53 gene and produce a malfunctioning p53 protein usually respond worse to chemotherapy, relapse more often, and thus lead to death faster. Thirty percent of such mutations affect hotspot residues, which leads to a complete loss of transcriptional activity (loss of function, LOF). From the remaining 70% of non-hotspot mutants, over a third retain residual p53 function (partial loss of function, pLOF) and can have a beneficial impact on therapy outcome. Unfortunately, the therapeutic implications of these largely neglected mutants remain unclear.
Within this project, DNA cooperativity mutants p53E177R (p53RR) and p53R178E (p53EE) were used as models for mutations with reduced (p53RR) and almost completely abolished (p53EE) functions of p53. P53RR is unable to induce pro-apoptotic genes but nonetheless is able to perform cell cycle arrest, induce senescence, and initiate DNA repair mechanisms. Both cooperativity mutants are considered to reserve transcription-independent pro-apoptotic functions. In previous experiments, different clinical effects were observed after the therapy of lymphoma in mice involving the p53RR and p53EE mutants. Even though both showed superior survival after treatment compared to p53KO lymphoma, their therapy effectiveness was not the same. Interestingly, p53RR led quickly to a relapse in almost all tested mice and brought only slight survival advantages over p53KO mutants. In contrast, mice with p53EE lymphomas survived significantly longer after therapy, and around 30% of mice enjoyed stable remission. This superior therapeutic response of p53EE lymphomas was unexpected since p53EE is unable to regulate gene expression, while in p53RR mutants, many transcriptional
functions are preserved and were most likely activated during chemotherapy. This led to the assumption that the residual transcriptional functions of p53RR could, in this context, be
counterproductive and impair therapy efficiency.
To pursue this question, we analyzed the functional and expressional features of the different p53 genotypes under stressed and unstressed conditions. To assess the influence of the residual
canonical p53 functions of p53RR in mice, a list of genes has been selected, comprising either direct p53 targets or those closely associated with p53-mediated pathways. Utilizing the
CRISPR/Cas9 system, knockout p53RR lymphoma cell lines lacking these genes were generated and introduced in further in vivo experiments.Tumorerkrankungen gehören zu den häufigsten Todesursachen beim Menschen. Unser effektivster Schutz gegen Tumore wird durch das p53-Protein bereitgestellt, das auf vielfältige
Weise der Tumorentwicklung entgegenwirkt und daher als das Tumorsuppressorgen bezeichnet wird. Ein Verlust der normalen p53-Funktion erhöht das Risiko für Tumorerkrankungen
erheblich. Tumoren, die Mutationen im p53-Gen aufweisen und ein fehlerhaftes p53-Protein produzieren, sprechen in der Regel schlechter auf die Chemotherapie an, erleiden häufiger
Rückfälle und führen somit schneller zum Tod. Dreißig Prozent dieser Mutationen betreffen Hotspot-Residuen, was zu einem vollständigen Verlust der transkriptionellen Aktivität (Loss
of Function, LOF) führt. Von den übrigen 70% der Nicht-Hotspot-Mutanten behalten über ein Drittel eine residuale p53-Funktion (Partieller Funktionsverlust, pLOF) bei und können sich
positiv auf den Therapieerfolg auswirken. Leider bleiben die therapeutischen Auswirkungen dieser weitgehend vernachlässigten Mutanten unklar. Im Rahmen dieses Projekts wurden
DNA-Kooperativitätsmutanten p53E177R (p53RR) und p53R178E (p53EE) als Modelle für Mutationen mit reduzierter (p53RR) bzw. fast vollständig aufgehobener (p53EE) p53-Funktion
verwendet. P53RR ist nicht in der Lage, pro-apoptotische Gene zu induzieren, kann jedoch Zellzyklusarrest, Seneszenz und DNA-Reparaturmechanismen auslösen. Beide
Kooperativitätsmutanten werden angenommen, transkriptionsunabhängige pro-apoptotische Funktionen zu besitzen. In früheren Experimenten wurden unterschiedliche klinische Effekte
nach der Therapie von Lymphomen bei Mäusen unter Verwendung der p53RR- und p53EEMutanten beobachtet. Obwohl beide nach der Behandlung eine überlegene Überlebensrate im
Vergleich zu p53KO-Lymphomen zeigten, war ihre Therapieeffektivität nicht gleich. Interessanterweise führte p53RR fast bei allen getesteten Mäusen schnell zu einem Rückfall
und brachte nur geringfügige Überlebensvorteile gegenüber p53KO-Mutanten, während Mäuse mit p53EE-Lymphomen nach der Therapie signifikant länger überlebten und rund 30% der
Mäuse eine stabile Remission erlebten. Diese überlegene therapeutische Reaktion von p53EELymphomen war überraschend, da p53EE nicht in der Lage ist, die Genexpression zu
regulieren, während bei p53RR-Mutanten viele transkriptionelle Funktionen erhalten bleiben und während der Chemotherapie höchstwahrscheinlich aktiviert wurden. Dies führte zur
Annahme, dass die residuellen transkriptionellen Funktionen von p53RR in diesem Kontext kontraproduktiv sein könnten und die Therapieeffizienz beeinträchtigen könnten. Um dieser
Frage nachzugehen, analysierten wir die funktionellen und expressionalen Merkmale der verschiedenen p53-Genotypen unter belasteten und unbelasteten Bedingungen. Zur Beurteilung
des Einflusses der residuellen kanonischen p53-Funktionen von p53RR bei Mäusen wurde eine Liste von Genen ausgewählt, die entweder direkte p53-Ziele oder eng mit p53-vermittelten
Signalwegen verbunden sind. Unter Verwendung des CRISPR/Cas9-Systems wurden p53RRLymphomzelllinien erzeugt, die diese Gene ausschalten, und in weiteren In-vivo-Experimenten
eingeführt
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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