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Integrating Physiology, Phenology and Demography in Biogeographical Analysis
Biological processes underlying species responses to climate, such as physiology, phenology and demography, can add important information to the prediction of climate change effects on organisms, yet most studies do not consider those processes. On this thesis, I present and evaluate different venues of incorporating such processes on biogeographical analysis. On the first chapter, I show activity time can be a better predictor than environmental temperatures for the distribution a tropical lizard, Tropidurus torquatus. I also determine the best practices for obtaining those estimates. Tropidurus torquatus seems to be restricted in its distributions by colder temperatures and precipitation, thus climate warming could lead to potential range expansion. On the second chapter, I examine the drivers of reproductive seasonality in two tropical lizards, Tropidurus torquatus and Ameiva ameiva. Solar radiation and day length were the main factors determining the reproductive seasonality of T. torquatus, while A. ameiva was more sensitive to precipitation. Solar radiation could be driving T. torquatus breeding phenology through the parietal eye mechanism, while A. ameiva, which lacks such structure, could be more sensitive to immediate weather conditions. This might have important consequences for these T. torquatus adaptation to climate change, since the rapid shift in weather might cause a mismatch between the photoperiodic cue and optimal environmental conditions for reproduction. On the third chapter, I use the estimates of time of activity and breeding phenology o from the previous chapters to spatially extrapolate demographic rates obtained from a 12-year mark and recapture study on a T. torquatus population. Survival was correlated with time of activity and precipitation, both interacting with breeding phenology, while recruitment was correlated with temperature and precipitation, with no breeding season interaction. Population growth projections were not correlated with occurrence records, indicating that spatial predictions were unreliable. Physiology and phenology add important information to the estimation of demographic rates at local scales but proved unreliable predictors for spatial extrapolation of those rates. This could be due to environmental variation, adaptation, plasticity or species interactions. We suggest possible venues for incorporating those processes and improving similar analysis. I provide an R package, Mapinguari, with tools to generate spatial predictors based on the processes described here
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Variation in Reproductive Behavior and Sexual Signals Within and Among Populations of an Incipiently Speciating Lizard
Discrete variation in colorful sexual signals is often associated with variation in reproductive tactics or strategies. Many taxa with intrapopulation color polymorphisms also exhibit variation among populations or among closely related species in the frequency of color morphs, the number of morphs present within a population, or which particular colors are used as signals. These patterns may be important for understanding speciation because theoretical and empirical studies indicate that both color polymorphism and alternative reproductive tactics may be associated with elevated diversification rates. I studied variation in throat color, an important sexual signal, within and among populations of the mesquite lizard (Sceloporus grammicus) species complex. The S. grammicus species complex is considered a possible example of incipient speciation due to high levels of variation in chromosome number, habitat use, reproductive cycles, and life history. My first chapter confirms this variability in female life history, and the rest of my dissertation is the first research to address sexual signals in S. grammicus. I performed a broad geographic survey of throat color polymorphisms and used laboratory behavioral trials and molecular phylogenetics to investigate the meaning and evolutionary context of the polymorphisms I observed. I found that male S. grammicus within a single population exhibited either orange, yellow, and blue throat color morphs or orange, yellow, and white throat color morphs. In no case did I observe the blue male morph and the white male morph in the same population. I found that both the orange/yellow/blue and orange/yellow/white polymorphisms in males were associated with variation in male aggression level, but the meanings of particular colors were different between the two populations I studied. I also found that females performed more rejection behaviors towards allopatric males when those males were of a color morph that did not occur in the female's home population than when the allopatric male was of a color morph that did occur in the female's home population. Finally, I constructed a phylogeny of the populations I had sampled and used ancestral state reconstruction to establish that the white male morph in the S. grammicus complex has originated at least twice
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Ventajas de la viviparidad : adaptaciones fisiológicas y sociales de los lagartos más australes del mundo, liolaemus, al clima frío.
Los ambientes templados-fríos presentan restricciones térmicas que influyen en
la ecología, fisiología y el comportamiento de los ectotermos. No obstante, la relación
entre la historia de vida y el ambiente está también condicionada por factores genéticos
que evolucionaron por haber estado sometidos a condiciones ambientales diferentes en
el pasado. Actualmente han predominado dos hipótesis para explicar la evolución de la
viviparidad en reptiles, la primera propone que la viviparidad ha evolucionado en
respuesta a la ocupación de climas fríos dada la posibilidad de las hembras preñadas,
mediante la termorregulación, de mantener temperaturas mayores que la que los
embriones podrían experimentar en el nido. La segunda hipótesis, sugiere que la ventaja
de la viviparidad se basa en la posibilidad de mantener temperaturas estables durante el
desarrollo, ya que afecta positivamente la aptitud de los recién nacidos. Actualmente se
presenta una nueva hipótesis que se basa en un fenómeno de selección sexual
frecuencia-dependiente entre morfotipos de coloración y comportamiento. Estos
morfotipos limitan el intercambio de genes y promueven la especiación, ya que se
encuentran codificados por un gen de tipo Mendeliano que determina el morfotipo de
color e interviene en mecanismos de control de diversos fenómenos comportamentales,
fisiológicos y estrategias reproductivas alternativas. El polimorfismo de coloración se
ha asociado generalmente a comportamientos diferenciales, mas marcados en machos
maduros. Los machos dominantes generalmente tienen mayor velocidad y resistencia
física y cabezas y cuerpos más grandes que los machos sumisos, por lo que los
dominantes serían capaces de adquirir y defender grandes territorios y tener un mayor
éxito reproductivo.
Las lagartijas que viven en ambientes sujetos a cambios extremos presentan
características particulares que les permiten reproducirse exitosamente. Así, las
lagartijas Patagónicas están activas en un periodo restringido a la primavera y el verano
en el cual llevan a cabo la vitelogénesis, la preñez y los nacimientos, y los machos
presentan ciclos reproductivos adaptados a la corta temporada reproductiva de las
hembras. En esta tesis, se espera avanzar en el conocimiento de las adaptaciones
fisiológicas y comportamentales al clima frío relacionadas con la reproducción de las
dos especies de lagartijas más australes del mundo, las especies vivíparas y simpátricas
Liolaemus sarmientoi y Liolaemus magellanicus. Además en machos de L. sarmientoi
se analiza la existencia de morfotipos de coloración asociados con un comportamiento
diferencial, y en hembras la influencia de dos tratamientos de temperatura durante la
preñez en las fechas de puesta y también en el peso, morfometría corporal y velocidad
de carrera de los recién nacidos. Los resultados se discuten en relación a las hipótesis de
la viviparidad en reptiles.
Las hembras de las dos especies comienzan la vitelogénesis a fines de
primavera, la cual probablemente se detiene o continúa a tasas muy bajas durante la
brumación, y concluye en la primavera siguiente. La preñez comienza en la primavera y
los nacimientos se producen durante un mes a mediados del verano. Las hembras que
dan a luz temprano en la temporada de actividad pueden iniciar un nuevo ciclo
vitelogénico antes del otoño y llevar a cabo un ciclo reproductivo anual. Sin embargo,
las hembras que dan a luz tarde retrasan el comienzo de un nuevo ciclo vitelogénico
hasta la siguiente primavera, llevando a cabo un ciclo reproductivo bianual. Los machos
llevan a cabo una reproducción continua, mostrando la presencia de esperma durante
toda la temporada de actividad, aumentando las posibilidades de aparearse a comienzos
de primavera y favoreciendo los nacimientos a principios del verano. El potencial de las hembras de ajustar su frecuencia reproductiva anual-bianual, de acuerdo a las
restricciones impuestas por las condiciones ambientales, y de los machos de realizar un
ciclo reproductivo continuo confieren una ventaja adaptativa para lidiar con las
adversidades del clima frío que habitan.
En cuanto a los experimentos de laboratorio, las hembras preñadas de L.
sarmientoi, que experimentaron desde un estadio medio de desarrollo embrionario la
posibilidad de termorregular libremente, parieron antes y crías en buenas condiciones de
salud, de mayor tamaño y peso corporal y que mostraron una mayor aptitud para la
carrera que las crías de las hembras que experimentaron durante la preñez una
temperatura similar a la que experimentaría un huevo en un nido. A su vez, la
variabilidad de la distribución de las temperaturas preferidas fue mayor en las hembras
no preñadas que en las preñadas. Las hembras preñadas buscan mantener la temperatura
preferida en un rango estrecho de temperaturas, apoyando la hipótesis del clima frío
dado que las crías de hembras expuestas a temperaturas bajas no se desarrollaron
adecuadamente como para nacer con tiempo para alimentarse antes de la brumación, y a
su vez presentaron baja aptitud para la carrera. Además las hembras preñadas fueron
capaces de termorregular a temperaturas mayores que las del ambiente, alcanzando una
eficiencia térmica típica de un termorregulador moderado. Del mismo modo, la
hipótesis de la manipulación térmica materna es apoyada fuertemente, ya que las
hembras preñadas mostraron menor variabilidad en la temperatura preferida que las
hembras no preñadas y sus crías mostraron mayor aptitud que las que se desarrollaron a
temperaturas menores.
En cuanto a la hipótesis de polimorfismo de coloración y comportamiento, en
machos de Liolaemus sarmientoi se observan los morfotipos rojo puro (RR), rojo-
amarillo (RA) y amarillo puro (AA). El largo entre rodillas y el alto de la cabeza de RR
resultó mayor que el de AA y el alto de la cabeza de RA mayor que el de AA. De los
despliegues comportamentales registrados de los enfrentamientos entre machos, la
variable "Rasqueteo" fue mayor en el morfotipo AA y la variable "Lagartijeo" mayor en
RR que en RA; también el RR presentó mayor temperatura corporal al finalizar el
enfrentamiento que el AA. Por lo que el morfotipo RR presenta características de
dominante al enfrentarse a un RA o AA, el cual exhibe comportamiento de sumisión en
los enfrentamientos. Estas especies, al vivir en amplios roquedales distribuidos a lo
largo de la estepa arbustiva, presentan despliegues comportamentales mucho menores y
más sutiles a los observados en otras especies de climas templados o tropicales en los
cuales el tamaño poblacional y la lucha territorial es mucho mayor. Aunque es necesario
un mayor tamaño de muestra para concluir acerca de las diferencias entre los distintos
morfotipos de L. sarmientoi, éstos pueden influir en la posibilidad de aparearse con las
hembras y de esta forma tener un efecto directo en la descendencia, por lo que el
comportamiento y la selección sexual pueden haber influido en la evolución de la
viviparidad.
Finalmente las dos hipótesis térmicas sobre el origen de la viviparidad se pueden
confirmar en relación a estos lagartos de clima frío y además se complementan. Las
hembras preñadas pueden termorregular para mantener temperaturas mayores que las
que tendría un huevo de un ovíparo en un nido, y eligen temperaturas estables en un
rango estrecho de temperaturas que benefician el desarrollo y la adecuación biológica de
las crías. A su vez, los comportamientos y los enfrentamientos entre machos previos a la
cópula pueden limitar el intercambio de genes y haber influido a nivel hormonal en la
retención del huevo en útero y la evolución de la viviparidad.Fil: Fernández, Jimena B. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universitario Bariloche; Argentina
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
We have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
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