235,923 research outputs found
Soluble CD40 ligand can replace the normal T cell-derived CD40 ligand signal to B cells in T cell-dependent activation
We have constructed a soluble chimeric fusion protein between the mouse CD8 alpha chain and the mouse CD40 T cell ligand. This protein binds to both human and mouse B cells. By itself it induced a modest degree of B cell proliferation, but together with anti-immunoglobulin (anti-Ig) antibody it greatly stimulated B cell proliferation, as determined by both [3H]thymidine uptake and increase in cell numbers. These data are evidence that the CD40 ligand on T cells provides a signal that drives B cell proliferation. This signal is synergistic with that delivered by anti-Ig antibody
Malaria impairs T cell clustering and immune priming despite normal signal 1 from dendritic cells
Interactions between antigen-presenting dendritic cells (DCs) and T cells are essential for the induction of an immune response. However, during malaria infection, DC function is compromised and immune responses against parasite and heterologous antigens are reduced. Here, we demonstrate that malaria infection or the parasite pigment hemozoin inhibits T cell and DC interactions both in vitro and in vivo, while signal 1 intensity remains unaltered. This altered cellular behaviour is associated with the suppression of DC costimulatory activity and functional T cell responses, potentially explaining why immunity is reduced during malaria infection
Annulation du QRS-T pour la détection de l'onde P : une approche par analyse een ondelettes dyadiques
Une nouvelle méthode d'annulation battement à battement du QRS-T dans le but de faciliter la détection de l'onde P est introduite. La phase d'annulation s'appuie sur une approche de pseudo inversion d'une décomposition en ondelettes dyadiques du signal ECG, observé sur deux dérivations, pour fournir un signal résiduel ne devant contenir que le train d'ondes P. Leur détection est par la suite entreprise sur ce signal et est abordée sous forme d'un problème de classification binaire. Des comparaisons, sur signaux simulés et réels, avec d'autres approches sont présentées
Activation of the Hedgehog signaling pathway in T-lineage cells inhibits TCR repertoire selection in the thymus and peripheral T-cell activation
TCR signal strength is involved in many cell fate decisions in the T-cell lineage. Here, we show that transcriptional events induced by Hedgehog (Hh) signaling reduced TCR signal strength in mice. Activation of Hh signaling in thymocytes in vivo by expression of a transgenic transcriptional-activator form of Gli2 (Gli2DeltaN(2)) changed the outcome of TCR ligation at many stages of thymocyte development, allowing self-reactive cells to escape clonal deletion; reducing transgenic TCR-mediated positive selection; reducing the ratio of CD4/CD8 single-positive (SP) cells; and reducing cell surface CD5 expression. In contrast, in the Shh(-/-) thymus the ratio of CD4/CD8 cells and both positive and negative selection of a transgenic TCR were increased, demonstrating that Shh does indeed influence TCR repertoire selection and the transition from double-positive (DP) to SP cell in a physiological situation. In peripheral T cells, Gli2DeltaN(2) expression attenuated T-cell activation and proliferation, by a mechanism upstream of ERK phosphorylatio
Methodes adaptatives d'estimation de signaux bruites avec voie de reference
Nous considérons le problème de l'estimation continue d'un signal S(t) perturbé par un bruit additif B1(t) lorsqu'on dispose d'une voie de référencé, dépourvue de signal, recevant un bruit B2(t). Les deux bruits sont corrélés et sont supposés déduits d'un même bruit par deux filtres linéaires. Le signal est indépendant des bruits. L'estimation du signal utile est réalisée en soustrayant à la voie principale une estimée du bruit perturbateur, obtenue par filtrage de la voie de référence. Les deux méthodes d'estimation adaptatives présentées utilisent, en vue de faciliter l'estimation, le principe classique d'orthogonalisation : on applique le bruit B2(t) à un filtre en treillis pour obtenir les erreurs de prédiction rétrogradés orthogonales. L'estimation de B1(t) s'obtient alors par un filtre transverse excité par les erreurs rétrogrades données par le treillis. La première méthode présentée actualise les coefficients de réflexion du filtre en treillis et ceux du filtre transverse par une méthode de gradient. La deuxième méthode est, dans le cas du préfenêtrage des données, une solution aux moindres carrés exacts avec normalisation des différentes erreurs de prédiction et des valeurs estimées du signal. Une étude comparative des performances obtenues par simulation entre chacune de ces deux méthodes et le filtrage adaptatif LM S de Widrow est présentée et montre l'intérêt des deux méthodes précitées. On donne également les résultats de tests objectifs effectués sur des signaux de parole bruitée
Correlation between fat signal ratio on T1-weighted MRI in the lower vertebral bodies and age, comparing 1.5-T and 3-T scanners
Background
The hypothesis was that the fat-dependent T1 signal intensity in vertebral bodies increases with age due to red-yellow marrow conversion.
Purpose
To analyze the increasing fatty conversion of red bone marrow with age.
Material and Methods
A continuous sample of 524 patients (age range 2–96 years) with normal lumbar spine MRIs (T11–L5) was retrospectively selected in order to get a representative sample from our 1.5-T and 3-T MRI units (Siemens, Erlangen, Germany). Four radiologists read the images independently. Absolute T1 signal intensities were measured in the lower vertebral bodies and standardized by dividing their value by the signal of the subcutaneous fat on lumbar and sacral level.
Results
The standardized T1 signal correlated significantly with patients’ age at the 1.5-T unit, with the best correlation demonstrated by thoracic vertebra T11, followed by lumbar vertebra L1, with correlation coefficients (R) of 0.64 (95% CI 0.53–0.72, P < 0.0001) and 0.49 (95% CI 0.38–0.59, P < 0.0001), respectively. For women and men, the R values were similar in thoracic vertebra T11 at 0.62 (95% CI 0.49–0.72) and 0.64 (95% CI 0.44–0.77), respectively. The vertebral signal correlated significantly better with age in the 1.5-T compared to the 3-T unit on all vertebral levels: the best R value of the 3-T unit was only 0.20 (95% CI 0.09–0.30, P < 0.0001). Our study showed an average increase of the relative T1 signal in T11 of 10% per decade.
Conclusion
T1 fat signal ratio increases with age in the vertebral bodies, which could help estimating the age of a person. Best age correlation was found when measuring T1 signal in T11, standardized by the sacral subcutaneous fat signal and using a 1.5-T MRI
Traitement par filtrage iverse d'images obtenues par retrodiffusion d'electrons
Dans un microscope électronique à balayage, le diamètre du faisceau d'électrons au niveau de l'échantillon est plus faible que la résolution spatiale, surtout lorsqu'on ne détecte que les électrons rétrodiffusés. Ceci est dû à la distribution spatiale de l'émission et se décrit par un produit de convolution entre cette distribution spatiale G(t) et le signal attendu S(t). G (t) est une fonction de point de l'échantillon et on ne peut qu'en estimer une valeur moyenne. Dans un microanalyseur, le faisceau d'électrons est plus large que la distribution de l'émission des électrons rétrodiffusés ; c'est donc la taille du faisceau au niveau de l'échantillon qui limite la résolution. Le signal obtenu s'exprime encore par : G (t) x S (t) G (t) est la répartition électronique dans le faisceau primaire, donc une fonction d'appareil. Dans les deux cas, les images ont été traitées par filtrage inverse du signal à l'aide d'un convoluteur. Le signal est traité monodimensionnellement ligne par ligne. L'image intermédiaire est conservée sur un tube à mémoire. Explorant à 90° du balayage précédent, un nouveau traitement donne l'image finale
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Molecular Signal Processing in T Cell Signaling
T cells behave as an extremely sensitive and selective sensor of antigen molecules. Only a few molecules of cognate antigen surrounded by outnumbering non-cognate self antigens are detected by a T cell, leading to T cell activation and immune responses. This antigen discrimination occurs through a system of molecules and reactions, involving T cell receptor (TCR) and intermediate and effector signaling molecules. How the signal processing through this molecular system provides the exquisite capability of antigen sensing remains unclear. Single-molecule observations of antigen-ligated TCR and associated signaling events have revealed that a single ligated TCR stochastically induces a discrete LAT condensate – a local dense phase of a scaffold protein LAT and associated proteins – in an antigen-dependent manner, implying a crucial role of LAT condensation in antigen discrimination. Here we characterize how LAT condensation and associated molecular events process the signals originating from antigens. In the first part of the study, we ask whether the condensates are functional by characterizing the correlations between LAT condensation and downstream calcium signaling using single-molecule and live-cell imaging. We find that individual LAT condensates are functional for calcium signaling without temporal delays. We further quantitatively analyze the LAT-calcium-NFAT signaling axis and find that calcium signal is additively contributed by individual condensates, and suggestively NFAT activation binarizes it. This signal processing operates the summation and thresholding of condensate counts. Furthermore, the finding of the condensate-calcium linear relation reveals the mechanism of calcium signal dynamics in T cells, which has been questioned for decades. In the second part of the study, we address the question of how the dwell-time-dependent LAT condensation propensity emerges from upstream molecular events, which determines the TCR response to antigens with different binding lifetimes, offering antigen discrimination fidelity. A canonical conception of kinetic proofreading describes such fidelity by sequential reaction steps. We propose that a more general kinetic proofreading scheme should reflect two molecular features: the multiplicity of the signaling domain ITAM on TCR, and LAT condensation behaving as a binary output from TCR. A revised scheme features parallel reactions on single TCR which is integrated to induce the binary output, referred to as multi-threading. We theoretically characterize these schemes and find the advantage of multi-threading that robustly improves the discrimination fidelity, which also describes several experimental antigen discrimination behaviors. Together, critical aspects of the molecular signal processing for antigen sensing by T cells are characterized
Sur la possibilite d'utiliser la representation conjointe en temps et fre quence dans l'analyse des signaux modules en frequence emis en vibrosismique
Parmi les différentes Représentations en temps et fréquence des signaux d'énergie finie, la Représentation définie par J. VILLE présente des avantages pratiques de calcul. L'étude est conduite pour des signaux S(t) à valeur réelle, causaux et de durée finie. Le calcul du signal analytique Z(t) associé à S(t) est réalisé dans le domaine fréquentiel. Les signaux étudiés ont un produit durée-bande passante élevé : 50 BT150. Les exemples traitent de signaux à modulation de fréquence linéaire et hyperbolique. Ces signaux sont à modulation croissante ou décroissante correspondant aux types utilisés en vibrosismique. On étudie le cas d'un signal à modulation mixte obéissant à la condition de LEVINE. La Représentation de VILLE met alors en évidence la répartition d'énergie d'interaction entre deux signaux à lois de modulation symétriques. Il apparaît donc qu'on peut obtenir pratiquement la loi de modulation de fréquence νi(t) du signal par le moment d'ordre un de p(t,v). Une estimation pratique et rapide de vi(t) utilise les propriétés d'une section de la surface p(t,v) à date donnée. Une modulation d'amplitude du signal S(t) correctement choisie, A(t), permet d'obtenir une lecture directe et aisée de vi(t) vu la grande valeur du produit BT
t-HGSP: Hypergraph Signal Processing Using t-Product Tensor Decompositions
Graph signal processing (GSP) techniques are powerful tools that model complex relationships within large datasets, being now used in a myriad of applications in different areas including data science, communication networks, epidemiology, and sociology. Simple graphs can only model pairwise relationships among data which prevents their application in modeling networks with higher-order relationships. For this reason, some efforts have been made to generalize well-known graph signal processing techniques to more complex graphs such as hypergraphs, which allow capturing higher-order relationships among data. In this paper, we provide a new hypergraph signal processing framework (t-HGSP) based on a novel tensor-tensor product algebra that has emerged as a powerful tool for preserving the intrinsic structures of tensors. The proposed framework allows the generalization of traditional GSP techniques while keeping the dimensionality characteristic of the complex systems represented by hypergraphs. To this end, the core elements of the t-HGSP framework are introduced, including the shifting operators and the hypergraph signal. The hypergraph Fourier space is also defined, followed by the concept of bandlimited signals and sampling. In our experiments, we demonstrate the benefits of our approach in applications such as clustering and denoising.</p
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