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Metabolismo del plancton marino medido a diferentes escalas espacio-temporales y su relación con los ciclos biogeoquímicos.
The overall objective is to advance the understanding of scales and control processes that connect the structure and metabolism net (balance photosynthesis / respiration) of planktonic communities ocean biogeochemical processes. Given the difficulty for measuring metabolism at different scales. A second objective is the development of new tools to assess, monitor and predict the balance photosynthesis / respiration marine plankton. The dissertation is an observational component, including participation in two oceanographic cruises in the Atlantic (South Atlantic
Transect), and a time series of measures in the Ria de Vigo, along with a generation component and experimental validation of empirical models derived from the first phase.
The heavy workload of field sampling and analytical allowed successfully complete observational and experimental phase.El objetivo general es avanzar en la comprensión de las escalas y procesos de control que conectan la estructura y el metabolismo neto (balance fotosíntesis/respiración) de las comunidades planctónicas con los procesos biogeoquímicos del océano. Dada la dificultad para la medida del metabolismo a diferentes escalas. Un segundo objetivo es el desarrollo de nuevas herramientas para evaluar, seguir y predecir el balance fotosíntesis/respiración del plancton marino. La tesis doctoral tiene una componente observacional, incluyendo la participación en dos campañas oceanográficas en el Atlántico (Atlantic Meridional
Transect), y una serie temporal de medidas en la Ría de Vigo, además de una componente de generación y validación experimental de los modelos empíricos derivados de la primera fase.
La importante carga de trabajo de muestreo de campo y analítico han permitido completar con éxito la fase observacional y experimental.O obxectivo xeral é facer avanzar a comprensión das escalas e procesos de control que ligan a estrutura e rede de metabolismo (saldo fotosíntese / respiración) dos procesos biogeoquímicos planctónicas comunidades do océano. Dada a dificultade para medir o metabolismo en diferentes escalas. Un segundo obxectivo é o desenvolvemento de novas ferramentas para avaliar, controlar e prever o equilibrio da fotosíntese / respiración plancto mariño. A disertación é un compoñente observacional, incluíndo a participación en dous cruceiros oceanográficos no Atlántico (Atlántico Sur
Transecto), e unha serie temporal de medidas na Ría de Vigo, xunto cunha compoñente de xeración e validación experimental de modelos empíricos derivados da primeira fase.
A pesada carga de traballo de mostraxe de campo e fase de observación experimentais completa con éxito analítica permitido
Spatial and temporal variability of primary production and respiration in marine microbial plankton
El estudio de la escala de variabilidad del metabolismo planctónico permite poder inferir e identificar patrones relevantes, requerimiento básico para comprender los procesos subyacentes y poder establecer modelos para predecir las posibles respuestas de las comunidades planctónicas ante variaciones ambientales. Este trabajo está centrado en el estudio de la variabilidad de la producción primaria bruta (GPP, de sus siglas en inglés Gross Primary Production), respiración del plancton (CR, de sus siglas en inglés Community Respiration) y el balance entre ellos (producción neta de la comunidad, NCP, de sus siglas en inglés Net Primary Production) en escalas de tiempo cortas (de horas a días) y escalas espaciales pequeñas medianas (varios km a miles de km). La aplicación de nuevos sensores de oxígeno que permiten medir cambios de concentración del oxígeno disuelto en una masa de agua hace que se pueda reducir el tiempo de incubación necesario para las estimas del metabolismo planctónico (medido normalmente en incubaciones de 24h). En este trabajo se demuestra la aplicabilidad de estas nuevas tecnologías en comunidades de plancton natural, obteniendo resultados significativamente no diferentes a las medidas tradicionales de incubaciones con botellas claras/oscuras. Además, estas nuevas técnicas permiten realizar estudios sobre la linealidad de las tasas de respiración planctónica, ya que registran en continuo la variación de la concentración de oxígeno disuelto en el agua. Así, estudios pertenecientes a este trabajo demuestran que las comunidades planctónicas de la Ría de Vigo recolectadas en 5 momentos puntuales del año mostraron una respiración lineal a lo largo de las 24 primeras horas de incubación. Asimismo, se comprobaron distintos sesgos potenciales relacionados con el método de incubación con botellas claras/ oscuras no encontrándose evidencias de la existencia de errores asociados al volumen de botella ni al efecto botella.
Los estudios de variabilidad del metabolismo planctónico a dos escalas diferentes (decenas de kilómetros y miles de kilómetros) demostraron que la relación entre la producción primaria bruta y la respiración de la comunidad depende del sistema de estudio. Mientras que en estudios de pequeña escala el metabolismo planctónico se encontraba en una situación de autotrofía neta/balance metabólico (NCP>0), con un fuerte acoplamiento entre GPP:CR en una gran escala de rangos, los estudios de gran escala mostraron una gran variabilidad en los datos de producción primaria bruta y unos datos de respiración más homogéneos, encontrándose en este caso las poblaciones estudiadas en situaciones de autotrofía neta (NCP>>0).
El estudio de la respiración fraccionada por diversos tamaños (>0.8 µm y 0.8-0.2 µm) mostró una contribución de las bacterias muy variable, con valores medios del orden de 24-30%. En este trabajo se muestra como la estructura de tamaños no sólo afecta a la producción primaria, sino que también a la respiración de los diferentes grupos de tamaño que componen las comunidades planctónicas.Ministerio de EducaciónXunta de GaliciaMinisterio de Ciencia e Innovació
Balance metabólico neto de la comunidad de plancton microbiano en el giro oligotrófico subtropical del Atlántico Norte
Para poder desentrañar completamente el funcionamiento del ciclo del carbono, así como los servicios que los organismos microbianos oceánicos pueden proporcionar a la sociedad, es imprescindible cuantificar la producción neta de las comunidades microbianas del océano superficial, caracterizar su variabilidad y conocer los procesos que la controlan. Sin embargo, la caracterización del metabolismo neto del océano sigue siendo una materia pendiente de la oceanografía, en gran parte debido a la escasez de datos de respiración disponibles y a las discrepancias que han surgido entre los valores de producción neta obtenidos con diferentes aproximaciones metodológicas. Este problema es aún más acuciante en los giros oligotróficos oceánicos debido a la poca accesibilidad de estas regiones.
Las hipótesis principales planteadas para esta tesis son:
- La producción neta de la comunidad no está únicamente modulada por la producción primaria bruta, sino que la respiración está igualmente implicada en la variabilidad del metabolismo neto.
- De esta primera hipótesis puede deducirse una segunda: debería encontrarse que el metabolismo neto es menos heterotrófico conforme nos alejamos de la principal fuente de materia orgánica alóctona, por lo tanto, en el caso del giro subtropical del Atlántico Norte, debería encontrarse metabolismo neto balanceado en el centro del giro, por ser esta la parte más alejada de la principal fuente de materia orgánica que es el continente y los sistemas costeros.
- La adecuada caracterización espacial y temporal de la producción neta de la comunidad con medidas in vitro, ayudaría a resolver la discrepancia entre estas medidas y las obtenidas con aproximaciones biogeoquímicas.
Para esta tesis se realizó una campaña oceanográfica con dos fases bien diferenciadas, una primera en la que se hizo un transecto longitudinal de 7 estaciones desde el borde Este del giro subtropical del Atlántico Norte hasta el centro del mismo, y una segunda fase en el que se realizaron dos estudios lagrangianos, cada uno de 8 días de duración. Los datos obtenidos en esta campaña se completaron con los de otras campañas anteriores en la misma región, para obtener una base de datos de producción neta de la comunidad que permitiera obtener patrones espaciales generales para el área de estudio.
Los resultados obtenidos del transecto y de la base de datos, indican que la producción primaria puede ser el factor que module la variabilidad de la producción neta a escalas locales, pero que, tal y como se planteaba en la primera hipótesis, la respiración también está implicada en esta variabilidad, lo que impide que se pueda deducir el metabolismo neto a nivel regional exclusivamente a partir de los valores de producción primaria bruta.
El análisis de la base de datos obtenida con la recopilación de valores de producción neta, permitió confirmar la existencia de un gradiente de heterotrofia en la región Este del giro subtropical del Atlántico Norte, ya que se vio que la frecuencia con que se encuentra metabolismo neto balanceado es mayor cuanto más nos alejamos de la principal fuente de materia orgánica que son los sistemas productivos del borde oriental del giro.
Así mismo, el diseño lagrangiano de los estudios en la segunda fase de la campaña, permitió caracterizar la variabilidad de corta escala temporal (diaria) de la producción neta de la comunidad microbiana, con lo que se observó que el metabolismo puede estar más balanceado de lo que previamente se había descrito con medidas in vitro. Por lo tanto, tal y como se proponía en la tercera hipótesis, la adecuada caracterización espacial y temporal ayuda a reconciliar las medidas in vitro con las aproximaciones biogeoquímicas que típicamente estiman metabolismo neto balanceado o ligeramente autotrófico en regiones oligotróficas.
En ambos casos, el cálculo del intervalo de confianza asociado a las medidas de producción neta de la comunidad ha resultado una herramienta imprescindible para la adecuada caracterización del metabolismo neto
Balances de producción y consumo de oxígeno por el microplancton en la capa fótica
La comunidad biológica pelágica ejerce una gran influencia sobre el ciclo natural del carbono. Sólo la medida simultánea de producción y respiración, sobre escalas de tiempo significativas biogeoquímicamente (mayores de un año) puede permitir estimar la magnitud de un 'excedente' de producción, disponible para ser exportado a capas profundas del océano, disminuyendo la concentración superficial de CO2 (bomba biológica) y, finalmente, la concentración atmosférica y el clima mundial. La presente memoria estudia los balances P/R del microplancton en la capa fótica, su acoplamiento estacional y su balance anual, y la importancia de la dinámica trófica del microplancton como moduladora de la relación entre producción primaria y exportación de carbono. Los resultados indican que el acoplamiento estacional de fases auto y heterotróficas da lugar a un balance neto anual equilibrado, sin excedentes (exportables) de producción. Aunque la dinámica trófica afecta al destino final de la producción, el acoplamiento estacional de los procesos de producción y consumo de la materia orgánica condiciona la escala temporal para el estudio de aquella relación
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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