305 research outputs found
cDNA cloning and bacterial expression of an endo-β-1,4-mannanase, AkMan, from Aplysia kurodai
No full textPreviously we isolated an endo-β-1,4-mannanase (EC 3.2.1.78), AkMan, from the digestive fluid of a common sea hare Aplysia kurodai and demonstrated that this enzyme had a broad pH optimum spanning 4.0 to 7.5 and an appreciably high heat stability in this pH range (Zahura et al., Comp. Biochem. Physiol., B157, 137-148 (2010)). In the present study, we cloned the cDNA encoding AkMan and constructed a bacterial expression system for this enzyme to enrich information about the primary structure and the characteristic properties of this enzyme. cDNA fragments encoding AkMan were amplified by PCR followed by 5'- and 3'-RACE PCRs from the A. kurodai hepatopancreas cDNA using degenerated primers designed on the basis of partial amino-acid sequences of AkMan. The cDNA including entire translational region of AkMan consisted of 1,392 bp and encoded 369 amino-acid residues. The N-terminal region of 17 residues of the deduced sequence except for the initiation Met was regarded as the signal peptide of AkMan and the mature enzyme region was considered to comprise 351 residues with a calculated molecular mass of 39961.96 Da. Comparison of the primary structure of AkMan with other β-1,4-mannanases indicated that AkMan belongs to the subfamily 10 of glycosyl-hydrolase-family-5 (GHF5). Phylogenetic analysis for the GHF5 β-1,4-mannanases indicated that AkMan together with other molluscan β-1,4-mannanases formed an independent clade of the subfamily 10 in the phylogenetic tree. The recombinant AkMan (recAkMan) was expressed with an Escherichia coli BL21(DE3)-pCold1 expression system as an N-terminal hexahistidine-tagged protein and purified by Ni-NTA affinity chromatography. The recAkMan showed the broad pH optimum in acidic pH range as did native AkMan; however, heat stability of recAkMan was considerably lower than that of native enzyme. This may indicate that the stability of AkMan is derived from an appropriate folding and/or some posttranslational modifications in Aplysia cells
An endo-β-1,4-mannanase, AkMan, from the common sea hare Aplysia kurodai
No full textA mannan-degrading enzyme was isolated from the digestive fluid of the common sea hare Aplysia kurodai by ammonium sulfate fractionation followed by conventional column chromatography. The purified enzyme, named AkMan in the present paper, showed a single band with an approximate molecular mass of 40,000 Da on SDS-PAGE and preferably degraded a linear β-1,4-mannan from green algae Codium fragile producing triand disaccharides. The optimal temperature of AkMan was 55 °C at pH 7.0 and temperature that caused 50% inactivation of AkMan during a 20-min incubation was 52 °C. AkMan retained high activity at pH 4.0–7.5 and was not inactivated in such acidic pH range by the incubation at 40 °C for 20 min. AkMan could degrade glucomannan from konjak root and galactomannan (tara gum and guar gum) as well as the linear β-1,4- mannan, while not carboxymethyl cellulose, agarose, dextran and xylan. These results indicate that AkMan is a typical endo-β-1,4-mannanase (EC 3.2.1.78) splitting internal β-1,4-mannosyl linkages of mannan. The Nterminal and internal amino-acid sequences of AkMan shared ∼55% amino-acid identity to the corresponding sequences of an abalone β-1,4-mannanase, HdMan, which belongs to glycosyl hydrolase family 5 (GHF5). Thus, AkMan was also regarded as a member of GHF5 β-1,4-mannanases
ULUTÜRK AKMAN SEMA (2014). Sağlık Hizmetlerine Yönelik Algı Araştırması İstanbul Örneği. EKONOMETRİ VE İSTATİSTİK E-DERGİSİ(20), 1-67. (Yayın No: 1152407)
No full textOn the correct determination of rotational angles for twisted-profiled sweep objects
No full textIn the context of the paper of V. Akman and A. Arslan, "Sweeping with All Graphical Ingredients in a Topological Picturebook" [Computers & Graphics, Vol. 16(3), pp. 273-281, 1992], a new construction of the rotational matrix is presented. This fixes a bug discovered by the first author
Mustafa Akman. İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler (İstanbul: Ekin Yayınları, 2017)
No full textThe book, İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler, consists of six sections: “Ibn al-ʿArabī”, “philosophy of waḥdat al-wujūd”, “approach to Jesus Christ and Pharaoh”, “approach to women, religion and the hell”, “[Ibn al-ʿArabī’s] resources of thinking and relation with philosophy”, and “Ibn al-ʿArabī and critiques against him in the history.” According to Akman, it is a requirement to make readings on philosophy, mysticism, and theology to understand the thinking of Sufi-philosopher, Ibn al-ʿArabī. The author, according to himself, has read Ibn al-ʿArabī through these fields, but he assesses Ibn al-ʿArabī’s teaching in the context of theology (kalām).Mustafa Akman. İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler (İstanbul: Ekin Yayınları, 2017): Değerlendirmemize konu olan İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler başlıklı kitap altı bölüm-den oluşmaktadır: "İbn-i Arabî", "Vahdet-i Vücûd Felsefesi", "İsâ Aleyhisselam ve Firavun'a Yaklaşım", "Kadın, Din ve Cehenneme Yaklaşım", "Fikir Kaynakları, Şiâ ve Felsefeyle İlişkisi", "Tarih Seyrinde İbn-i Arabî ve Tenkidi". Yazara göre sûfî-filozof olan İbn-i Arabî'yi anlamak için felsefî, tasavvufî ve kelamî oku-malar yapmak gerekmektedir. Kendisinin de İbn-i Arabî'yi bu alanlardan okuduğunu fakat kendi çalışma alanıyla ilişkisi nedeniyle kelamî meseleler bağlamında İbn-i Arabî'yi değerlendirmeye çalıştığını belirtir
Dashes As Typographical Cues For The Information Structure (Extended Abstract)
No full text) Bilge Say and Varol Akman Department of Computer Engineering and Information Science Faculty of Engineering, Bilkent University Bilkent, Ankara 06533, Turkey Phone: [90] (312) 266--4133 (secretary) Fax: [90] (312) 266--4126 fsay,[email protected] Conference Topic: Information-based approaches to syntax, semantics, and pragmatics of natural language Accepted for presentation at ITALLC 98. Please send all correspondence to the second author. We take em-dash as our sample punctuation mark and examine its usage from a discourse perspective, using sentences from well-known corpora. We particularly comment on how dashes can give hints on information structure, focus, and anaphora. Throughout the paper Discourse Representation Theory is used as a framework. Keywords: Punctuation, Discourse, Discourse Representation Theory, Information Structure 1 Introduction To the initial onlooker, punctuation marks and topic/focus structure of an orthographic sentence seem to be unrelated..
Investigation of micro gaps occurred between resin based root canal sealers and root canal dentin using bacterial leakage and photogrametry methods
No full textBu çalışmanın amacı; farklı rezin esaslı kök kanal patları ve kor materyallerinden oluşturulan test gruplarının sızıntıya dirençlerinin ve kök kanal dolgusu kalitesinin bakteriyel sızıntı testi ve fotoğrafların sayısallaştırılması yöntemi ile incelenmesidir. Bu amaçla 129 adet ortodontik veya periodontal nedenlerle çekilmiş, benzer boyda ve kalınlıkta yuvarlak, tek kanallara sahip dişler kullanıldı. Dişlerin kron kısımları mine sement sınırından devamlı su soğutması altında ayrıldı. Kök kanallarının apikalleri 0.06/#45, olacak şekilde K3 döner alet sistemi kullanılarak hazırlandı. Dişler ekteki şekilde, farklı patlar ve kore materyallerinden oluşturulan 7 deney grubu (n=15) ve 2 kontrol grubu (n=12)'na ayrıldı: Acroseal/K3 Güta-perka, Diaket/K3 Güta-perka, AH Plus Jet/K3 Güta-perka, MetaSeal/K3 Güta-perka, MetaSeal/Resilon, RealSeal/Resilon, RealSeal/K3 Güta-perka. Tüm gruplardaki örnekler aseptik koşullarda açılı tek kon tekniği ile doldurulduktan sonra iki odalı sisteme bakteriyel sızıntısını ölçmek üzere yerleştirildi. Bakteriyel sızıntıya dirençleri 60 gün boyunca takip edildi ve elde edilen verilerle Kaplan-Meier testi ile istatistiksel analiz yapıldı. Örnekler bakteriyel sızıntı test düzeneğinden çıkarıldı ve %3'lük gluteraldehitte bekletilerek bakterilerin fiksasyonu sağlandı. Her gruptan rasgele seçilen 6 örnekten art arda su soğutmalı sistemle kesitler alındı. Elde edilen kesitler Leica MZ16A mikroskop, IC3D kamera ve stereoexplorer 2.1 yazılımından oluşan sistem kullanılarak X50 büyütme altında incelendi. Her bir kesitin incelenmesi için stereo fotoğraflar elde edildi. Kesitlerde görülen boşlukların alanları elde edilen görüntüler üzerinde oluşturulan matematiksel modeller üzerinde ölçüldü. Boşlukların miktarına grupların, kesitlerin ve bölgelerin etkisini incelemek için bu değerlere SPSS versiyon 16.0 kullanılarak Çok Yönlü Varyans analizi (ANOVA) ve Tukey HSD testleri uygulandı. Grupların bakteriyel sızıntıya dirençleri arasında anlamlı bir fark bulunmadı (p=0.76). Kesitler incelendiğinde boşluk miktarı yönünden MetaSeal/Resilon grubu istatistiksel olarak diğerlerinden farklıdır ve bu grupta daha fazla boşluk (1610.8µm2) vardır. Diğer gruplar arasında istatistiksel olarak fark yoktur (p=0.66). Tüm gruplarda güta-perka/Resilon- pat arasında oluşan boşluklar, dentin-pat arasında oluşan boşluklara ve patın kendi içinde oluşan boşluklara göre daha fazladır. Toplam boşluk apikal ilk 4 kesitte daha az, 15. kesitte daha fazladır. Deney gruplarının hiçbirinde örneklerin sızıntı gün sayısıyla, boşluksuz kesit sayısı arasında korelasyon tespit edilmemiştir .The aim of this study was to evaluate the sealing ability or obturation quality of test groups created using different resin based sealers or core materials using bacterial leakage test or by means of photogrammetic analysis of digital images. One hundred twenty nine teeth extracted for orthodontic reasons or periodontal problems with similar size and single rounded canals were used for this purpose. The crowns of the teeth were removed under water cooling. The apical part of the root canals was prepared K3 rotary instruments to a size of 0.06/#45. The root canals were then obturated using the following sealers or core materials to create seven test groups (n=15) and 2 control groups (n=12): Acroseal/K3 Güta-perka, Diaket/K3 Güta-perka, AH Plus Jet/K3 Güta-perka, MetaSeal/K3 Güta-perka, MetaSeal/Resilon, RealSeal/Resilon, RealSeal/K3 Güta-perka. After obturating the roots using a tapered single cone technique in aseptic conditions, the samples were inserted in a microbial leakage model consisting upper chamber and a lower chamber to evaluate the resistance to bacterial penetration. The leakage values were then recorded for 60 days and the data was statistically evaluated using Kaplan-Meier test. After leaving the bacterial leakage model, the bacteria were fixed using 3% gluteraldehitte. Randomly selected 6 roots from each group were serially sectioned under water cooling. The sections were then evaluated under X50 magnification using Leica MZ16A microscope, IC3D camera and a system consisting stereoexplorer 2.1 software. Stereo digital images were taken fort his purpose. The mean areas of the voids were measured on the mathematical models created on these digital images. To evaluate the effect of group, sections and location on the quantity of the voids, ANOVA and Tukey HSD tests were done using SPSS version 16.0. No significant difference was found among the test groups according to their resistance to bacterial leakage. When the sections were evaluated, MetaSeal/Resilon group showed statistically more voids when compared to the other obturation groups (1610.8µm2). No significant difference was found among the other tested groups (p=0.66). The voids occurred between the sealer and the core material gutta percha/Resilon was significantly higher in all the tested groups. The total area of the voids were smaller in apical area (4?Th section) and higher in the coronal region. No correlation was found among the resistance to bacterial penetration and occurrence of voids
A science teaching program proposal based on constructivist science education to develop 6 year-old children?s scientific processing skills
No full textBu araştırmanın temel amacı, okul öncesi eğitim kurumlarına devam eden 6 yaş çocuklarının bilimsel süreç becerilerini etkili ve kalıcı bir şekilde kazanabilmeleri için araştırmacı tarafından hazırlanan “Bilimsel Süreç Becerilerini Geliştirmeye Yönelik Yapılandırmacı Yaklaşıma Dayalı Bilim Öğretim Programı”nın etkisini ortaya koymaktır. Öntest-Sontest kontrol gruplu deneme modelinin kullanıldığı araştırmanın çalışma grubunda 2009-2010 öğretim yılında Konya ilinde bulunan Ayşah Anaokulu ile Necip Fazıl Kısakürek İlköğretim Okulunun anasınıfına devam eden 40’ı deney (18 kız, 22 erkek), 40’ı kontrol gurubunda (16 kız, 24 erkek) olmak üzere toplam 80 çocuk yer almıştır. Hazırlanan fen öğretim programında çocukların bilimsel süreç becerilerini destekleyici fiziksel olaylar ile ilgili mıknatıs, su, sarkaç, rampa, silindir ve gölge etkinlikleri bulunmaktadır. Veriler yine araştırmacı tarafından hazırlanan “Okul Öncesi Bilimsel Süreç Becerileri Ölçeği” ile toplanmıştır. Deney ve kontrol gruplarının kendi içlerinde ön-test/son-test puan ortalamalarının karşılaştırılmasında bağımlı t testi, gruplar arasındaki başarı farklılıklarının tespitinde ise bağımsız t-testi kullanılmıştır. Ayrıca “Bilimsel Süreç Becerilerini Geliştirmeye Yönelik Yapılandırmacı Yaklaşıma Dayalı Bilim Öğretim Programı”nın kazandırdığı davranışların kalıcılığını test etmek için de yine deney ve kontrol grubunda yer alan çocukların son-test puan ortalamaları ile kalıcılık testi puan ortalamaları karşılaştırılmıştır. Araştırma sonucuna göre, “Bilimsel Süreç Becerilerini Geliştirmeye Yönelik Yapılandırmacı Yaklaşıma Dayalı Bilim Öğretim Programı”na katılan deney grubu çocuklarının Okul Öncesi Bilimsel Süreç Becerileri Ölçeği puan ortalamaları ile mevcut bilim öğretim programına katılan kontrol grubu çocuklarının puan ortalamaları arasında istatistiksel olarak 0.05 düzeyinde anlamlı fark gözlenmiştir. Deney grubunun puanları kontrol grubunun puanlarına göre daha yüksek bulunmuştur. Ayrıca, araştırma sonucuna göre, deney grubundaki çocukların Okul Öncesi Bilimsel Süreç Becerileri Ölçeği kalıcılık puan ortalamaları ile mevcut bilim öğretim programına katılan kontrol grubu çocuklarının puan ortalamaları arasında istatistiksel olarak 0.05 düzeyinde anlamlı fark gözlenmiştir. Deney grubunun puanları kontrol grubunun puanlarına göre daha yüksek bulunmuştur. Bu sonuçlar, okul öncesi eğitim kurumuna devam eden çocuklara uygulanan Bilimsel Süreç Becerilerini Geliştirmeye Yönelik Yapılandırmacı Yaklaşıma Dayalı Bilim Öğretim Programının çocuklara bilimsel süreç becerilerini kazandırmada etkili ve kalıcı olduğunu ortaya koymaktadır.The basic aim of this study is to reveal the effect of “Constructivist Science Education Program” developed by researcher for efficient and lasting acquisition of scientific processing skills by 6 year olds attending pre-school education institutions. The study in which an experimental pre-test post-test model with control group was used the experimental group is composed of a total of 80 children, attending Ayşah Nursery school and nursery class of Necip Fazıl Kısakürek primary school in Konya in 2009-2010 education year, 40 (18 females, 22 males) being in the experimental group, 40 (16 females, 24 males) being in the control group. In the science education program there are magnet, water, pendulum, ramp, cylinder and shadow activities which will support the scientific processing skills of children. Data was collected with “Pre-school Scientific Processing Skills Scale” which was also developed by researcher. In the in-group comparison of pre-test and post-test score means of experimental and control groups dependent t-test was used and to find out differences between groups independent t-test was used. Besides, to test whether the behaviors acquired with constructivist science education are permanent or not, post-test means scores and Constructivist Science Education Program and those permanency test scores of the children who received current education program at 0.05 level. The scores of the experimental group were found to be higher than the scores of the children in the control group. This result indicates that Constructivist Science Education Program administrated to children permanency test scores of the children in the experiment and control groups were compared. According to the result of the study, there found significant difference between the Preschool Scientific Processing Skills Scale scores of the children in the experimental group who received Constructivist Science Education Program and those of the children who received current education program at 0.05 level. The scores of the experimental group were found to be higher than the scores of the children in the control group. Besides, according to the result of the study, there found significant difference between the Preschool Scientific Processing Skills Scale permanency test scores of the children children in the experimental group who received attending pre-school education groups is effective in the acquisition of scientific processing skills
The Use Of Gold And Silver Nanoparticles As Modifiers For The Determination Of Arsenic And Antimony By Electrothermal Atomic Absorption Spectrometry
No full textTez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2011Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2011Elektrotermal Atomik Absorpsiyon Spektrometrisindeki (ETAAS) tayinlerde girişimleri önlemek için diğer tedbirlerin yanında modifier kullanımı da gereklidir. Modifier matriksi uçucu veya girişim yapmayan bir forma dönüştürür ve/veya analitle daha az uçucu bir bileşen oluşturarak ve/veya analiti fiziksel olarak koruyarak girişimleri elimine ederler. Modifierler bazen kendileri de matriks bileşenleri ile reaksiyona girerek girişim yapan türlere dönüşmektedir. Bu durumunu önlemek için, bazı metalik modifierler ya çeşitli işlemlerle elementel halde kolloidleri şeklinde hazırlanarak veya bir indirgenle karıştırılarak veya grafit fırında bir süre ön ısısal muamele sonucu oluşturulup ardından analitin enjekte edilmesi şeklinde kullanılmışlardır. Bu çalışmada da altın ve gümüş nanopartiküllerin elemental halde sentezi ve modifier olarak kullanımı araştırılmıştır. Öncelikle stok altın nanopartiküller (AuNP) ve gümüş nanopartiküller (AgNP) sentezlenmiş ve bu stok çözeltilerin Ultraviyole-Görünür Bölge (UV-GB) spektrumları çekilerek ve ayrıca Transmisyon Elektron Mikroskobu (TEM) ve Taramalı Elektron Mikroskobu (SEM) görüntüleri alınarak karakterizasyonu sağlanmıştır. NaCl, Na2SO4 ve deniz suyu matrikslerindeki arsenik(As) ve antimonun(Sb) için piroliz sıcaklıkları ve modifier miktarı optimize edilmiş ve ayrıca bu modifierlerin kullanımının analitlerin atomlaşma sinyallerine etkisi incelenmiştir. Metodun validasyonu için optimum çalışma şartlarında AuNP ve AgNP modifierler kullanılarak gerçek deniz suyu ve çeşme suyu örnekleri ve sertifikalı referans maddelerde analitlerin eser miktarlardaki analizleri standart ekleme yönteminden yararlanılarak gerçekleştirilmiştir. Geri kazanımlar ve ölçümlerin tekrarlanabilirliği gibi analitik parametreler belirlenmiş ve standart ekleme yapılarak arsenik ve antimon konsantrasyonları kantitatif olarak % 95 güven aralığında tayin edilmiştir.In order to eliminate interferences in electrothermal atomic absorption spectrometry (ETAAS) the use of a modifer is mostly necessary. Modifiers interact with (i) matrix converting it to a volatile and/or non-interfering form (ii) with the analyte itself forming its less volatile compound and (iii) physically protect the analyte and prevent its removal from the furnace. Sometimes modifers are converted to interfering forms upon reacting with matriks components. In order to prevent this situation, some metallic modifiers were either prepared as their colloids in elemental form or mixed with a reducing agent or thermally pretreated in the graphite furnace and then analyte was introduced. In this study synthesis of elemental gold nanoparticles (AuNP) and silver nanoparticles(AgNP) and their using as a modifier were investigated. Firstly, the stock gold nanoparticles and stock silver nanoparticles were prepared and these nanoparticles synthesized were characterized by Ultraviole-Visible (UV-VIS) spectra, Transmission Electron Microscope (TEM) and Scanning Electron Microscope (SEM). The pyrolysis temperatures, atomization temperatures and amount of modifier were optimized for the determination of arsenic(As) and antimony (Sb) in NaCl, Na2SO4 and sea water. The validation of the method was performed using certified reference sea-water and waste water samples applying standard addition method. The certified as well as spiked amounts were recovered in 95% confidence level.Yüksek LisansM.Sc
Specificity, Automatic Designation, and `I' Varol Akman and Aylin Koca
No full textThis paper studies the context-dependence of the first-person indexical `I,' while attempting to make the identifiabilitycriteria for specificity and Thus, Jrgensen (2000:146) notes that the term has been used to drawatleast four differentdistinctions:(i) whether the speaker believes the referenttobeunique# (ii) whether the speaker knows the identityofthe referent#(iii) whether the speaker wants to express a generalization, and(iv) whether the speaker believes the identityof the referenttobeimportant. It is known that several allegedly sound descriptions of specificitymentioned in the literature fail to be adequate on their own in covering all conditions of the notion. A prolific author contributing to recentliterature on specificity, von Heusinger (2002:2) explicates assorted characterizations of this notion. (See Journal of Pragmatics,vol. 19, no. 3, for a special issue on specificity,guest-edited by him and identifiedby def spec def non-spec indef spec indef non-spec speaker + -- + -- hearer + + -- -- Table1 The `identifiability' criteria for definiteness and specificity(Legend: def definite, spec specific) definiteness clearer for this important indexical. Having been influenced by John Perry's work on indexicals, we'll show that this (seemingly) clearest case of an indexical poses a difficult
- …
