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Thermomorphogenesis: Opportunities and challenges in posttranscriptional regulation.
No full textPlants exposed to mildly elevated temperatures display morphological and developmental changes collectively termed thermomorphogenesis. This adaptative process has several undesirable consequences to food production, including yield reduction and increased vulnerability to pathogens. Understanding thermomorphogenesis is, thus, critical for understanding how plants will respond to increasingly warmer temperature conditions, such as those caused by climate change. Recently, we have made major advances in that direction, and it has become apparent that plants resource to a broad range of molecules and molecular mechanisms to perceive and respond to increases in environmental temperature. However, most of our efforts have been focused on regulation of transcription and protein abundance and activity, with an important gap encompassing nearly all processes involving RNA (i.e., posttranscriptional regulation). Here, I summarized our current knowledge of thermomorphogenesis involving transcriptional, posttranscriptional, and posttranslational regulation, focused on opportunities and challenges in understanding posttranscriptional regulation-a fertile field for exciting new discoveries
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CRISPR/Cas to enhance gene expression for crop trait improvement by editing miRNAs targets.
No full textArticle states that gene editing tools such as CRISPR/Cas9 are often thought of as a means to prevent gene expression; however, a more subtle and yet powerful approach is the enhancement of gene expression by precise deletion of repressor sites within a gene of interest. Authors argue that gene editing of miRNA target sites is preferable over deletion of the miRNA genes themselves, given that it avoids the pitfalls of unspecific derepression of miRNA target(s) beyond the gene of interest
A necrópole do século XVI instalada na Villa romana do Rabaçal
No full textSilva, A.M.; Carnim, G.; Isidoro, J.; Reis, M.; Matos, V.; Marques, A.C. 2001. A necrópole do século XVI instalada na Villa romana do Rabaçal. In: M. Pessoa; L. Rodrigo; S. Santos (Eds.). Roteiro: Rabaçal - Aldeia Cultural. Penela: Câmara Municipal de Penela, pp. 20-22. ISBN: 972-97881-1-
The drafts of The Year of the Death of Ricardo Reis: José Saramago\'s writing movements
No full textOs rascunhos do romance O Ano da Morte de Ricardo Reis (1984), do escritor português José Saramago (1922-2010), oferecem uma boa oportunidade para o estudo do método criativo do autor à luz da Crítica Textual e Genética. Por meio do levantamento, organização e interpretação das marcas de edição deixadas no documento pelo escritor acréscimos, supressões, substituições, inversões de palavras e enunciados, etc. é possível entrar em contato com o processo editorial que deu origem à obra. De modo que, sob a forma de uma edição crítico-genética e fac-similar, a comparação entre o texto dos rascunhos e o texto da primeira edição (editio princeps) ajuda a estabelecer os critérios que norteiam as intervenções do autor sobre o texto, mostrando que nem todas as alterações previstas no original foram acatadas pela versão impressa.The drafts of the novel The Year of the Death of Ricardo Reis (1984), by the portuguese writer José Saramago (1922-2010), offer a good opportunity to study the author\'s creative method in the light of Textual and Genetic Criticism. Through the gathering, organization and interpretation of editing marks left on the paper by the writer additions, suppressions, substitutions, inversions of words and statements, etc. it is possible to approach the editorial process that gave rise to the work. So that, in the form of a genetic and critical edition with facsimiles, the comparison between the original text and the text established in the first edition (editio princeps) helps to define the criteria that guided the interventions of the author, showing that not all changes in the original document were accepted by the printed version
Missing pieces in the puzzle of plant microRNAs
No full textPlant microRNAs (miRNAs) are important regulatory switches. Recent advances have revealed many regulatory layers between the two essential processes, miRNA biogenesis and function. However, how these multilayered regulatory processes ultimately control miRNA gene regulation and connects miRNAs and plant responses with the surrounding environment is still largely unknown. In this opinion article, we propose that the miRNA pathway is highly dynamic and plastic. The apparent flexibility of the miRNA pathway in plants appears to be controlled by a number recently identified proteins and poorly characterized signaling cascades. We further propose that altered miRNA accumulation can be a direct consequence of the rewiring of interactions between proteins that function in the miRNA pathway, an avenue that remains largely unexplored
Gene regulation by translational inhibition is determined by Dicer partnering proteins
No full textMicroRNAs (miRNAs) are small regulatory RNAs produced by Dicer proteins that regulate gene expression in development and adaptive responses to the environment1,2,3,4. In animals, the degree of base pairing between a miRNA and its target messenger RNA seems to determine whether the regulation occurs through cleavage or translation inhibition1. In contrast, the selection of regulatory mechanisms is independent of the degree of mismatch between a plant miRNA and its target transcript5. However, the components and mechanism(s) that determine whether a plant miRNA ultimately regulates its targets by guiding cleavage or translational inhibition are unknown6. Here we show that the form of regulatory action directed by a plant miRNA is determined by DRB2, a DICER-LIKE1 (DCL1) partnering protein. The dependence of DCL1 on DRB1 for miRNA biogenesis is well characterized7,8,9, but we show that it is only required for miRNA-guided transcript cleavage. We found that DRB2 determines miRNA-guided translational inhibition and represses DRB1 expression, thereby allowing the active selection of miRNA regulatory action. Furthermore, our results reveal that the core silencing proteins ARGONAUTE1 (AGO1) and SERRATE (SE) are highly regulated by miRNA-guided translational inhibition. DRB2 has been remarkably conserved throughout plant evolution, raising the possibility that translational repression is the ancient form of miRNA-directed gene regulation in plants, and that Dicer partnering proteins, such as human TRBP, might play a similar role in other eukaryotic systems
Santo Ângelo: a firma - ação da modernidade na arquitetura da cidade, 1930-1945
No full textDissertação (mestrado) - Univesidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Urbanismo, História e Arquitetura da CidadeEm um país de proporções continentais, o processo de desenvolvimento urbano é percebido mais facilmente nos grandes centros localizados especialmente na parte litorânea brasileira. Essa dinâmica pode ser também evidenciada na cidade de Santo Ângelo, localizada no interior, ao noroeste do Estado do Rio Grande do Sul e fundada enquanto redução Jesuítica em 1707. Nesta dissertação o fenômeno urbano observado em Santo Ângelo, entre 1930 e 1945, revela especificidades locais como o resgate de uma memória missioneira, e condicionantes regionais como a interligação à malha ferroviária Estadual no inicio da década de vinte. Este desenvolvimento é notado pela atuação de uma sociedade étnica e culturalmente diversificada, formada e influenciada por um intenso trânsito e permanência de um contingente imigrantista, por um poder político centralizado em um contexto nacionalista e pela ação de uma empresa construtora, a Santo Angelense Ltda, que viabiliza através da sua produção a instauração da Capital das Missões. É quando se distingue um setor de Santo Ângelo mais ligado ao passado e outro mais ligado ao futuro, reflexo de um sítio físico ocupado em diferentes períodos, por uma sociedade urbana em estruturação, direcionada por um novo planejamento e perceptível no seu tecido urbano. É neste período de uma década e meia que ocorre a instituição de novos paradigmas arquitetônicos e a consolidação hierárquica deste tecido urbano determinantes de uma nova forma urbana composta pela formação de um bairro residencial e de um centro de atividades diversas. A modernidade e a tradição são aspectos presentes neste processo de desenvolvimento urbano de Santo Ângelo, na construção do ser cidade durante a Era Vargas, quando repercutem nas paisagens construídas obras inovadoras, capazes de representar o significado e o estabelecimento de uma nova configuração urbana. Podem ser destacadas obras de maior magnitude como a construção do Cine-Teatro Municipal e da nova Igreja da Matriz, as quais refletem diretamente na arquitetura da cidade e na consolidação de suas partes distintas. In a continental sized country, the process of urbanization is more easily detected in big centers. These dynamics can also be seen in Santo Ângelo, a city in the north-west of the State of Rio Grande do Sul that was founded by the Jesuits in 1707. In this dissertation, the urban phenomenon observed in Santo Ângelo, between 1930 and 1945, shows local specificity as the rescue of a missionary memory, and regional factors as the connection to the State railway line. This development is perceived by the action of a culturally and ethnically diverse society, formed and influenced by an intense traffic and permanence of an immigrant contingent, conducted by a public power centralized in a nationalist context and by the action of a construction company, the Santo Angelense Ltda, that makes possible, through its production, the establishment of the Capital of the Missions. This is when an area from Santo Ângelo more connected to the past and another more connected to the future can be distinguished. This is the reflex of a physical space settled in different periods, by a growing urban society, directed by a new planning and perceived in its urban area. It is in this period of a decade and a half that occur the institution of new architectonic paradigms and the hierarchical consolidation of this urban area determining a new urban focus, composed by the formation of a residential area and an area of various interests. Modernity and tradition are present aspects in the process of urban development of Santo Ângelo, in the construction of the city being during the Vargas Era, when innovative buildings appear on the constructed landscapes, able to the meaning and the establishment of a new urban configuration. Buildings of great magnitude can be perceived as the construction of the Cine-teatro Municipal and of the new Igreja Matriz, which reflect directly in the architecture of the city and in the consolidation of its distinct parts
Pept?deo antimicrobiano homotarsinina: s?ntese, estudos reacionais de dimeriza??o e ensaios de citotoxicidade
No full textSubmitted by Rodrigo Martins Cruz ([email protected]) on 2014-12-18T17:01:07Z
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Previous issue date: 2013Neste trabalho foi estudada a influ?ncia dos efeitos estruturais na rea??o de dimeriza??o associada ? obten??o do pept?deo antimicrobiano homotarsinina (Htr), bem como foram realizados ensaios hemol?ticos e de toxicidade desse pept?deo perante c?lulas humanas. Primeiramente foi realizada a s?ntese da cadeia monom?rica da homotarsinina (Htr-M), empregando-se a estrat?gia Fmoc de s?ntese em fase s?lida. Em seguida, o produto foi purificado por cromatografia l?quida de alta efici?ncia em fase reversa (CLAE-FR), tendo sido o homod?mero obtido sequenciado e caracterizado por espectrometria de massas (MALDI-ToF). Foram realizados estudos das prefer?ncias conformacionais da Htr-M por dicro?smo circular (CD) em diferentes meios e condi??es, como na presen?a de tamp?o Tris-HCl aquoso, em diferentes misturas de TFE-H2O e na presen?a de micelas de SDS. Realizou-se ent?o a rea??o de dimeriza??o do mon?mero em tr?s meios: (i) solu??o tamp?o Tris-HCl 100 mmol?L-1 pH 8,5, (ii) solu??o micelar de SDS 350 mmol?L-1 em tamp?o Tris-HCl 100 mmol?L-1 pH 8,5 e (iii) solu??o TFE:H2O 40:60 (v/v) em Tris-HCl 100 mmol?L-1 pH 8,5. O acompanhamento cin?tico das rea??es de dimeriza??o foi realizado por CLAE-FR. Como resultado, foi observado que em solu??o micelar de SDS a rea??o se completa em aproximadamente 6h (rendimento de 62%), enquanto que em solu??o tamp?o e em solu??o de TFE:H2O s?o necess?rias 24h e 48h (rendimentos de 66% e 85%), respectivamente. Os resultados de CD obtidos para a Htr-M em condi??es similares ?s empregadas nas rea??es de dimeriza??o mostraram que a Htr-M apresenta predominantemente conforma??o rand?mica em tamp?o Tris-HCl aquoso, enquanto adota predominantemente estrutura de h?lice ? em solu??o de TFE:H2O (40:60) ou na presen?a de micelas de SDS. Assim, os resultados do acompanhamento cin?tico da rea??o de dimeriza??o indicam que a conforma??o predominantemente rand?mica da Htr-M em tamp?o Tris-HCl aquoso, bem como a diminui??o de sua mobilidade e maior intera??o com a superf?cie das micelas de SDS e os efeitos de agrega??o que ocorrem em solu??o de TFE:H2O influenciam diretamente na forma de aproxima??o das cadeias monom?ricas, atuando de maneiras diferentes na forma??o da liga??o dissulfeto. Por fim, foram realizados ensaios de toxicidade em c?lulas humanas, os quais mostraram que Htr-M e Htr n?o apresentam toxicidade a leuc?citos mononucleares, al?m do que tamb?m n?o apresentam atividade hemol?tica.Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Qu?mica, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013.ABSTRACT
This dissertation is mainly related to studies concerning the role of the structural effects on the dimerization reaction that leads to the antimicrobial peptide homotarsinin (Htr). Besides, hemolytic assays as well as the toxicity of this peptide against human cells have also been investigated. Firstly, the monomeric chain (Htr-M) was obtained by Fmoc solid-phase synthesis. The product was purified by reverse phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) and then sequenced and characterized by mass spectrometry (MALDI-ToF). Circular dichroism (CD) studies regarding the Htr-M conformational preferences were performed for the peptide in different media and conditions, such as Tris-HCl aqueous buffer, TFE:H2O mixtures, as well as in the presence of SDS micelles. The dimerization reaction was then performed in three distinct media, namely: (i) Tris-HCl aqueous buffer 100 mmol?L-1 pH 8.5, (ii) SDS micellar solution of 350 mmol?L-1 in Tris-HCl 100 mmol?L-1 pH 8.5 and (iii) TFE:H2O 40:60 in Tris-HCl 100 mmol?L-1 pH 8.5. CD studies performed in similar conditions indicated that Htr-M presents predominantly random conformations in aqueous Tris-HCl buffer, whereas it adopts ?-helical arrangements in either TFE:H2O (40:60) solution or in the presence of SDS micelles. The kinetic monitoring of the dimerization reactions was carried out by RP-HPLC. The results indicated that the reaction is completed in about 6 h (yield 62%) in the presence of SDS micelles, whereas 24 h and 48 h (yields 66% and 85%) are necessary for the dimerizations performed in the aqueous Tris-HCl and in the TFE:H2O solutions, respectively. Therefore, the kinetic studies indicated that the predominantly random conformation of Htr-M in Tris-HCl aqueous buffer, as well as the mobility decrease alongside with the peptide-micelle interactions in the presence of SDS, as well as the aggregation effects in the TFE:H2O solution directly affect the inter-chain approach process, which leads to different pathways of the disulfide bond formation. Finally, toxicity assays were performed in human cells and the results showed that both Htr-M and Htr are not toxic against mononuclear leukocytes and also do not show hemolytic activity
Os Maconheiros (filme e memorial)
No full textTCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Comunicação e Expressão. Cinema.Memorial acerca da concepção do piloto da série ”Os Maconheiros”. Disponível no Laboratório de Estudos de Cinema(LEC)**FICHA TÉCNICA** Produção: Carol Morgan, Leonardo Gatti, Sarah S. Motta e Alfredo Reis Operação de câmera: Gustavo Salvalágio Foco e assistente de fotografia: Arantxa Pellme Foquista: Carmina Renones Iluminação: Marcelo Ribeiro Maquinária: Julio Aied Passos Continuista: Leonardo Gatti Assistência de direção: Sarah S. Motta e Victor Ávila Direção de arte: Cléo Rosa e Carol Alves Atores: Neri Neto, Kainã Pacheco, Gabriel Rosa, Luiz Conti, Rodrigo “Ingrato” de Freitas, Gustavo Salvalágio e Parcos Araújo Som: Iolanda Mazzocchi Montagem: Rodrigo “Ingrato” de Freita
One-dimensional study of hydrodynamic model applied to a channel stretch of stream of Gregório in São Carlos, SP
No full textO presente trabalho reporta o esforço empenhado para relacionar nível d\'água e vazão, fazendo uso exclusivamente de medições de nível, em campo, durante a passagem de ondas de cheia através de um trecho de canal prismático situado no perímetro urbano da cidade de São Carlos, SP denominado Córrego do Gregório. Montagens para coleta de dados em campo foram testadas e foi utilizada a modelagem hidrodinâmica 1-D para a resolução das equações de Saint-Venant, através do método implícito de quatro pontos de Preissmann. Apesar do potencial do método, já apontado por alguns autores, o presente trabalho reporta dificuldades na realização de medições e também problemas na modelagem de trecho de canal com características muito particulares. Várias análises foram realizadas tais como a verificação do número de passos de tempo necessário para minimização dos efeitos da condição inicial imposta (IQ1), a verificação da celeridade de uma onda de cheia analisando os picos dos eventos e assim determinar o coeficiente de cisalhamento de Manning proposto por Aricò, Nasello e Tucciarelli (2009) e o método implícito na resolução das equações de SV proposto por Jin, Coran e Cook (2004), que funciona como um filtro baseado no número de Froude (condição do tipo de escoamento) também foi testado. Durante o evento do dia 23/03/2013 foi estimado as velocidades em campo. Para cada um dos 12 eventos registrados foi realizado uma simulação utilizando o modelo hidrodinâmico e o melhor resultado foi utilizado em uma segunda simulação para comparar as lâminas d\'água observadas e calculadas. Ao analisar o quanto os valores de erros máximos absolutos (ERMAX1 e ERMAX2) representam em relação ao máximo registro obtido no evento, em porcentagem, têm-se eventos com 3,6% até valores absurdos de 27,1%. Assim, trata-se de um trabalho teórico-experimental que oferece subsídios importantes para futuros trabalhos nessa direção.This work reports the committed effort to relate water level and flow, using exclusively field measurements of level, during the passage of flood waves through a prismatic channel stretch located on the surroundings of São Carlos - SP called stream of Gregório. Assembles for data gathering in the field were tested and it was used 1-D hydrodynamic modeling for solving equations of Saint-Venant, through the four points Preissmann implicit method. Despite the potential of this method, as pointed out by some authors, this study reports difficulties in performing measurements and to model a channel stretch with very particular characteristics. Several analyzes were performed such as checking the number of time steps needed for minimizing the effects of the initial condition imposed (IQ1), verifying the celerity of a full wave analyzing the peaks of events and so to be able to determine the Manning friction coefficient proposed by Arico et al. (2009) and the implicit method to solve the S-V equations proposed by Jin, Coran e Cook (2004), which acts as a filter based on the Froude number (condition-type flow), was also tested. During the event of the day 23/03/2013 was estimated speeds in the field. For each of the 12 recorded events a simulation was made using a hydrodynamic model and the best result was used in a simulation to compare the second water depths observed and calculated. By analyzing how the values of maximum absolute errors (ERMAX1 and ERMAX2) account for the highest recording obtained at the event, in percentage, have been events with 3.6% until absurd values from 27.1%. So, it is a theoretical-experimental that offers important information for future work in this direction
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