120 research outputs found
cDNA cloning and bacterial expression of an endo-β-1,4-mannanase, AkMan, from Aplysia kurodai
Previously we isolated an endo-β-1,4-mannanase (EC 3.2.1.78), AkMan, from the digestive fluid of a common sea hare Aplysia kurodai and demonstrated that this enzyme had a broad pH optimum spanning 4.0 to 7.5 and an appreciably high heat stability in this pH range (Zahura et al., Comp. Biochem. Physiol., B157, 137-148 (2010)). In the present study, we cloned the cDNA encoding AkMan and constructed a bacterial expression system for this enzyme to enrich information about the primary structure and the characteristic properties of this enzyme. cDNA fragments encoding AkMan were amplified by PCR followed by 5'- and 3'-RACE PCRs from the A. kurodai hepatopancreas cDNA using degenerated primers designed on the basis of partial amino-acid sequences of AkMan. The cDNA including entire translational region of AkMan consisted of 1,392 bp and encoded 369 amino-acid residues. The N-terminal region of 17 residues of the deduced sequence except for the initiation Met was regarded as the signal peptide of AkMan and the mature enzyme region was considered to comprise 351 residues with a calculated molecular mass of 39961.96 Da. Comparison of the primary structure of AkMan with other β-1,4-mannanases indicated that AkMan belongs to the subfamily 10 of glycosyl-hydrolase-family-5 (GHF5). Phylogenetic analysis for the GHF5 β-1,4-mannanases indicated that AkMan together with other molluscan β-1,4-mannanases formed an independent clade of the subfamily 10 in the phylogenetic tree. The recombinant AkMan (recAkMan) was expressed with an Escherichia coli BL21(DE3)-pCold1 expression system as an N-terminal hexahistidine-tagged protein and purified by Ni-NTA affinity chromatography. The recAkMan showed the broad pH optimum in acidic pH range as did native AkMan; however, heat stability of recAkMan was considerably lower than that of native enzyme. This may indicate that the stability of AkMan is derived from an appropriate folding and/or some posttranslational modifications in Aplysia cells
An endo-β-1,4-mannanase, AkMan, from the common sea hare Aplysia kurodai
A mannan-degrading enzyme was isolated from the digestive fluid of the common sea hare Aplysia kurodai by ammonium sulfate fractionation followed by conventional column chromatography. The purified enzyme, named AkMan in the present paper, showed a single band with an approximate molecular mass of 40,000 Da on SDS-PAGE and preferably degraded a linear β-1,4-mannan from green algae Codium fragile producing triand disaccharides. The optimal temperature of AkMan was 55 °C at pH 7.0 and temperature that caused 50% inactivation of AkMan during a 20-min incubation was 52 °C. AkMan retained high activity at pH 4.0–7.5 and was not inactivated in such acidic pH range by the incubation at 40 °C for 20 min. AkMan could degrade glucomannan from konjak root and galactomannan (tara gum and guar gum) as well as the linear β-1,4- mannan, while not carboxymethyl cellulose, agarose, dextran and xylan. These results indicate that AkMan is a typical endo-β-1,4-mannanase (EC 3.2.1.78) splitting internal β-1,4-mannosyl linkages of mannan. The Nterminal and internal amino-acid sequences of AkMan shared ∼55% amino-acid identity to the corresponding sequences of an abalone β-1,4-mannanase, HdMan, which belongs to glycosyl hydrolase family 5 (GHF5). Thus, AkMan was also regarded as a member of GHF5 β-1,4-mannanases
Bihistî Ramazan Efendi (From Vize) And His Theological World
Bihiştî Ramazan Efendi Vize’de doğmuş; Çorlu’da vaizlik ve tarikat şeyhliği yapmıştır. Çok yönlülüğüyle bilinen ve bu bağlamda şâirliğiyle de ün yapmış olan Bihiştî’nin kelâmla ilgili bilinen yegâne eseri, Hâşiyetu'l-Hâşiye alâ Şerhi Akâidi'n-Nesefîyye li'l-Hayâlî adıyla yazdığı hâşiyedir. Şerh ve hâşiyecilik dönemlerinin bütün özelliklerini taşıyan bu hâşiye, Osmanlı medreselerinde, Hayâlî hâşiyeleri içerisinde en rağbet göreni olmuş ve Osmanlının son dönemlerine kadar Hayâlî hâşiyesi ile birlikte defalarca basılmıştır. Bu makalemizde kendisini Mâturîdî gelenek içerisinde konumlandıran Bihiştî’nin haşiyesini ve aynı zamanda tasavvufî yönü de olan Bihiştî’nin düşünce dünyasını ve adı geçen hâşiyesinde sergilediği kelâmcılığını inceleyeceğiz.Bihistî Ramazan Efendi was born in Vize and was a preacher and sheikh in Çorlu. Bihistî who has been famous for his sophistication and poetry accordingly is seemed to have only one work as a footnote named Hâşiyetu'l-Hâşiye alâ Şerhi Akâidi'n-Nesefîyye li'l-Hayâlî (Footnote on Footnote of Commentary of Nesefy Aqaid of al-Hayaly). This footnote that bears all the features of "the explanation and footnote era" was the most demanded one among footnotes of Hayali and was printed several times together with the al-hayali footnote. In this article we will study the footnote of Bihisti who locates himself in Maturidi tradition and the world of thought of him who also had sufistic sides and we will also focus on his thelogy in his aforementioned footnote
On the correct determination of rotational angles for twisted-profiled sweep objects
In the context of the paper of V. Akman and A. Arslan, "Sweeping with All Graphical Ingredients in a Topological Picturebook" [Computers & Graphics, Vol. 16(3), pp. 273-281, 1992], a new construction of the rotational matrix is presented. This fixes a bug discovered by the first author
Mustafa Akman. İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler (İstanbul: Ekin Yayınları, 2017)
The book, İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler, consists of six sections: “Ibn al-ʿArabī”, “philosophy of waḥdat al-wujūd”, “approach to Jesus Christ and Pharaoh”, “approach to women, religion and the hell”, “[Ibn al-ʿArabī’s] resources of thinking and relation with philosophy”, and “Ibn al-ʿArabī and critiques against him in the history.” According to Akman, it is a requirement to make readings on philosophy, mysticism, and theology to understand the thinking of Sufi-philosopher, Ibn al-ʿArabī. The author, according to himself, has read Ibn al-ʿArabī through these fields, but he assesses Ibn al-ʿArabī’s teaching in the context of theology (kalām).Mustafa Akman. İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler (İstanbul: Ekin Yayınları, 2017): Değerlendirmemize konu olan İbn-i Arabî: Kelami Tartışmalar, Sorular, Şüpheler başlıklı kitap altı bölüm-den oluşmaktadır: "İbn-i Arabî", "Vahdet-i Vücûd Felsefesi", "İsâ Aleyhisselam ve Firavun'a Yaklaşım", "Kadın, Din ve Cehenneme Yaklaşım", "Fikir Kaynakları, Şiâ ve Felsefeyle İlişkisi", "Tarih Seyrinde İbn-i Arabî ve Tenkidi". Yazara göre sûfî-filozof olan İbn-i Arabî'yi anlamak için felsefî, tasavvufî ve kelamî oku-malar yapmak gerekmektedir. Kendisinin de İbn-i Arabî'yi bu alanlardan okuduğunu fakat kendi çalışma alanıyla ilişkisi nedeniyle kelamî meseleler bağlamında İbn-i Arabî'yi değerlendirmeye çalıştığını belirtir
Dashes As Typographical Cues For The Information Structure (Extended Abstract)
) Bilge Say and Varol Akman Department of Computer Engineering and Information Science Faculty of Engineering, Bilkent University Bilkent, Ankara 06533, Turkey Phone: [90] (312) 266--4133 (secretary) Fax: [90] (312) 266--4126 fsay,[email protected] Conference Topic: Information-based approaches to syntax, semantics, and pragmatics of natural language Accepted for presentation at ITALLC 98. Please send all correspondence to the second author. We take em-dash as our sample punctuation mark and examine its usage from a discourse perspective, using sentences from well-known corpora. We particularly comment on how dashes can give hints on information structure, focus, and anaphora. Throughout the paper Discourse Representation Theory is used as a framework. Keywords: Punctuation, Discourse, Discourse Representation Theory, Information Structure 1 Introduction To the initial onlooker, punctuation marks and topic/focus structure of an orthographic sentence seem to be unrelated..
Ekonomik gelişme sürecini etkileyen beşeri sermayede eğitimin rolü: Bartın ili örneği
06.03.2018 tarih ve 30352 sayılı Resmi gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Ekonomik gelişme, bir ülkenin imkân ve değerlerinin tümüyle kullanılması sonucu erişilebilecek bir düzeydir. Gelişme, ekonomik büyümeye ek olarak sosyo-kültürel yapının gelişmesi gibi yapısal değişmeleri de içine alan çok boyutlu bir kavramdır. İkinci Dünya Savaşından sonra daha çok ön plana çıkan ekonomik gelişme, iktisatçıların üzerinde durduğu önemli konulardan biri olmuştur. Günümüz dünya ekonomisinde bilgi toplumuna yönelik oluşumlar, ekonomik gelişmede beşeri sermayenin önemini daha da belirginleştirmiştir. Klasik üretim faktörlerine ek olarak beşeri sermayenin öneminin artması ekonomik gelişme ve büyüme politikalarının yeniden gözden geçirilmesine neden olmuştur. Bilgi toplumuna geçiş sürecinde başarılı olabilmenin temel koşullarından biri, teknolojiyi etkin kullanabilecek eğitimli, bilgili, becerili ve alanında uzmanlaşmış nitelikli insan gücüne yani beşeri sermayeye sahip olmaktır. Beşeri sermayenin ortaya çıkmasında en önemli faktör ise eğitimdir. Bu çalışmanın amacı, beşeri sermayenin ekonomik gelişme sürecindeki rolünü ortaya koymak ve Bartın özelinde mevcut durumu değerlendirmektir. Çalışma yöntemi olarak kaynak taraması ve yüz yüze anket uygulaması tercih edilmiştir. Çalışma kapsamında katılımcıların eğitim düzeyi ile gelir düzeyleri arasındaki ilişki incelenmiştir. Elde edilen veriler SPSS programına aktarılarak, değişkenler ve değişkenler arasındaki ilişkiler istatistiki testlere tabi tutulmuştur. Anket sonucunda Ki-kare Testi ile yapılan değerlendirmeden elde edilen bulgulara göre eğitim düzeyi ile aylık toplam gelir arasında istatistiksel olarak önemli bir farklılık bulunmuştur (p<0,05). Ayrıca katılımcıların eğitim ve gelir düzeylerinde meydana gelen değişimin hayat standardını, kişisel gelişimi, sosyal yaşantıyı önemli ölçüde etkilediği, dolayısıyla beşeri sermayede eğitimin önemli bir rolü olduğu sonucuna ulaşılmıştır.Economic development is a level that can be achieved by using the total opportunities and values of a country. Development is a multidimensional concept that includes structural changes such as the development of socio-cultural structure in addition to economic growth. The economic development that came to the forefront after the Second World War was one of the important issues that economists focused on. In today's world economy, the formations intended for information society has made the importance of human capital more explicit in economic development. In addition to the classical production factors, the increasing importance of human capital has led to a revision of economic development and growth policies. One of the basic conditions of being successful in transition to information society is to have educated, knowledgeable, skilled and qualified manpower, human capital, who can use technology effectively. The most important factor in the emergence of human capital is education. The aim of this study is to reveal the role of human capital in the economic development process and to evaluate the current situation in Bartın. Source scanning and face-to-face survey were preferred as the study method. Within the scope of the study, the relationship between the educational level and income levels of the participants was examined.The data obtained were transferred to SPSS program and the variables and the relationships between the variables were subjected to statistical tests. As a result of the questionnaire, a statistically significant difference was found between education level and total monthly income according to the findings obtained from the Chi-square test (p <0.05). In addition, it was concluded that the changes in the education and income levels of the participants had a significant impact on the standard of living, personal development and social life, and therefore, education had an important role in human capital
Diyarbakır İhtisas Kütüphanesi 101 numaralı şiir mecmuası
Klasik Türk edebiyatı, Türk edebiyatının gerek şiir ve şair gerekse yazınsal tür ve dil zenginliği açısından en verimli devridir. Bu devirde dini, siyasi, ictimai, aşk ve daha birçok tema nazım ve nesir türlerine konu olmuştur. Söz konusu temalar klasik Türk edebiyatında bu denli geniş konulara kucak açmış ve Klasik Türk edebiyatına adeta en parlak dönemini yaşatmıştır. Buna bağlı olarak Fuzûlî, Bâkî,Şeyhî, Nâbî, Nef'î, Şeyh Gâlip ve bir çok şâir ve bu şairlerin şaheserleri meydana gelmiştir. Klasik Türk edebiyatında karşımıza çıkan en önemli tür şiir olmuştur. Şiir, dönemin toplumuna bir nevi ictimai bir reçete görevi görmüştür. Bu çerçevede kimi şair veya müstensihlerce dönemin şâirlerinin şiirlerine mecmualar aracılığıyla yer verilmiştir. Böylece söz konusu şiirler döneme gerek edebi ve gerekse tarihi açıdan kaynaklık emiştir. Çalışmamızda Diyarbakır İhtisas Kütüphanesi AHA 101 adlı şiir mecmuası üzerinde durulmuştur. Söz konusu çalışmada evvela mecmua kavramı üzerinde durulmuş ve mecmualar hakkında bilgi verilmiştir. Daha sonra söz konusu mecmua birçok açıdan ele alınmıştır. Çalışmada mecmuanın orijinaline bağlı kalınmış olup ilgili mecmuanın çeviriyazısı yapılmıştır. Ayrıca mecmuadaki şiirlerin türleri incelenerek söz konusu şiirlerin vezinleri tespit edilmiştir. Daha sonra mecmuadaki şiirlerin hangi şaire ait olduğu saptanmaya çalışılmış ve şairi hakkında kısa dipnotlar düşülmüştür. Ayrıca inceleme kısmında da mecmuadaki şairler hakkında kısaca bilgi verilmiş olup söz konusu şairlerin varsa divanındaki şiiri mecmuadaki şiir ile karşılaştırılmıştır. Karşılaştırmadan sonra varsa farklılıklar belirtilmiştir.Divan literature is the most productive period of Turkish literature in terms of both poetry and poet and literary genre and language richness. In this period, love, political, social, religion, politics and many other themes were the subject of verse and prose genres. Poetry, which embraces such a wide range of subjects in divan literature by theme, has given Turkish literature its most brilliant period. Consequently, great poets and masterpieces of these poets have been formed. Poetry was the most important genre in Divan literature. Poetry which served as a sort of ictimai recipe to the society of the period. Within this framework, the magazines where elite poems are kept together by some poets or underdogs have absorbed both literary and historical sources. In this study, the poem journal AHA 101 of Diyarbakir Specialized Library is emphasized. In this study, firstly, the concept of magazine is emphasized and information is given about mecmualas. Later, the magazine was discussed in many respects. In the first stage, the original magazine was adhered to and translated from the Ottoman alphabet into the Latin alphabet. The types of poems in Mecmu were examined and their vizines were determined. Then, it was searched which poetry belongs to which poet and existing poems are in the poets' divans. A short note about the subject was reduced to a note. In addition, brief information was given about the poets in the magazine. After determining whether the poets had divan in question, the poem in the poet's divan was compared with the poem in the magazine. Later, if any, differences were noted
- …
