116 research outputs found
Landscape in Spatial Planning: Some Evidence on Methodological Issues and Political Challenges
No full textIn recent decades, the landscape has given a new impulse to the renewal of spatial planning. This process has nevertheless raised several methodological issues about how to deal with sensitive non-functional aspects in spatial planning tools and procedures, as well as new challenges for policy design. Placemaking, landscape urbanism, and landscape planning do not differ just in scale but in their very idea of public/collective interest and the action that is required to reach them. Reflecting on some evidence from the recent Italian experience of landscape plans and policies, based on direct involvement in practice and academic debate, the author will highlight several main issues at stake today in this field. The conclusions will argue some potentially promising innovation perspectives, on both processes and contents regarding landscape-based spatial planning and policies, as well as some critical conditions of an institutional context
Biochemical and genetic markers of the adaptation of cultivated coffee to climatic variations
No full textLa baisse de la production et la prolifération des maladies engendrées par le changement climatique dans la caféiculture, particulièrement pour Coffea arabica, conduit à chercher de nouvelles pratiques culturales et étudier la réponse adaptative des caféiers aux modifications environnementales. En se basant sur l’importance des composés phénoliques dans la réponse des plantes aux stress et sur la richesse des caféiers en ces composés antioxydants, la réponse adaptative des caféiers cultivés en plein champ a été étudiée en s’intéressant à l’évolution du contenu des feuilles en ces composés dans différentes conditions de culture simulées par un gradient altitudinal, des cultures sous ombrage ou l’obtention de plants greffés. Les analyses biochimiques montrent que certains composés phénoliques s’accumulent dans les feuilles en réponse à la modification d’un paramètre météorologique spécifique. Ainsi, acides chlorogéniques et flavanols sont plus accumulés en cas de sécheresse alors que les flavonols glycosylés s’accumulent sous forte radiation solaire. La comparaison avec C. canephora permet de valider ces marqueurs. Les analyses transcriptomiques indiquent une différence d’expression des gènes de biosynthèse de ces composés suivant le stade de croissance de la feuille. Elles montrent également que la réponse à la lumière passe par la surexpression de nombreux gènes codant des HSP ainsi que ceux impliqués dans la photosynthèse et la glycosylation des flavonoïdes. Enfin, ces résultats montrent l’intérêt, suivant l’altitude, de l’ombrage et du greffage pour la culture de C. arabica.The decline in production and the proliferation of diseases caused by climate change in coffee growing, especially for Coffea arabica, leads to search new cultural practices and to study the adaptive response of coffee trees to environmental changes. Based on the importance of phenolic compounds in the response of plants to stress and the richness of coffee in these antioxidant compounds, the adaptive response of coffee grown in the field was studied by looking at the evolution of the leaf content in these compounds under different culture conditions simulated by an altitudinal gradient, shaded cultures or obtaining grafted plants. Biochemical analyzes show that certain phenolic compounds accumulate in the leaves in response to the modification of a specific meteorological parameter. Thus, chlorogenic acids and flavanols are more accumulated in case of drought while glycosylated flavonols accumulate under strong solar radiation. The comparison with C. canephora validates these markers. Transcriptomic analyzes indicate a difference in expression of the biosynthesis genes of these compounds according to the stage of growth of the leaf. They also show that the response to light is the overexpression of many genes encoding HSPs as well as those involved in photosynthesis and flavonoid glycosylation. Finally, these results show the interest, according to altitude, of shading and grafting for the cultivation of C. arabica
Cultural and gender politics in a neglected archive of Jamaican women's poetry : Una Marson and her Creole contemporaries
No full textThis thesis considers the gender and cultural politics of selected Jamaican
women's poetry published during the first half of the twentieth century and
seeks to establish that an approach to this poetry sensitive to these issues will
illuminate aspects of their work previously neglected by canonical and colonial
modes of interpretation. The central interest of this thesis is the poetry of Una
Marson, a black woman poet whose work has been critically neglected and
devalued to date. My project is to read Marson's work in some detail, and to
explore to what extent her poetry, which often works within colonial models and
with conventional notions of feminine fulfilment, employs received aesthetic
and ideological paradigms both strategically and subversively. In the belief
that critics of Jamaican women's writing should be as attentive to the gender
and cultural politics of their ways of reading, as of the texts they wish to read,
the first chapter of this thesis engages in a sustained analysis of theoretical
positions and attempts to map out the various problems and possibilities
which critical discourses present in relation to this material. The second
chapter examines the various social and literary contexts in which Jamaican
poetry was produced and received during this period, and the third chapter
looks in more detail at contemporary notions of aesthetic and cultural forms.
The fourth and fifth chapters are structured aromd close textual readings
which explore the variety and complexity of Marson's, and her Creole
contemporaries', poetic engagement with the issues of cultural and gender
identities. The thesis concludes that Marson's poetry questions dominant
notions both of identity and of aesthetics, and consequently that her poetry
offers an example of Jamaican literary expression which moves beyond the
nationalization of consciousness which has come to mark the literary
achievement of this period
Digital transformation of TVET and skills development systems in Africa: state of play and prospects
No full textInhibition de l'expression des gènes de virulence chez Rhodococcus fascians et Pseudomonas aeruginosa par des flavonoïdes isolés chez les genres Dalbergia et Combretum
No full textPlants are continuously confronted with a multitude attack either abiotic but also biotic in nature. Interestingly, despite the abundance of bacteria that plant has to face, only few are able to induce death or disease in the host plant. It is therefore likely that, in addition to secondary metabolites with antimicrobial properties, plants also synthesize secondary metabolites which are able to inhibit the expression of virulence genes in bacteria without affecting either growth or viability, which allows plants to host willingly or not bacterial populations. This work focuses on the identification of such metabolites in Malagasy plants (genera Dalbergia and Combretum) and the demonstration of their inhibitory effect on the expression of virulence genes in two different pathosystems: Rhodococcus fascians (a phytopathogen) and Pseudomonas aeruginosa (an opportunistic pathogen). Thus, two metabolites were isolated using a combination of chromatographic techniques coupled with tests that evaluate the expression of certain genes involved in the virulence mechanisms of these bacteria. The first is a new prenylated isoflavanone, named perbergin, isolated from the bark extract of D. pervillei. It was shown that the perbergin target attR gene expression, encoding a LysR-type transcriptional regulator that plays a key role in regulating the expression of virulence genes of R. fascians and the transition from an epiphytic to a pathogenic lifestyle. Therefore, we have also shown that the expression of all virulence genes known to date in R. fascians is also affected while the expression of genes involved in epiphytic fitness of the bacteria is not altered. In addition, the application of perbergin at the time of infection of plants susceptible to R. fascians shows that this molecule reduces in vivo the virulence of R. fascians, highlighting the potential of perbergin as an anti-infective agent. The second is a flavonoid known as catechin, isolated from the bark extract of C. albiflorum. Catechin significantly inhibits the expression of genes that regulate the mechanism of quorum sensing in P. aeruginosa such as lasI, LasR, rhlI and rhlR but also lasB and rhlA which expression depends on quorum sensing. Therefore, the production of virulence factors such as pyocyanin and elastase is significantly affected. Because of the limited number of our arsenal of antibiotics and their increasing ineffectiveness, the identification of these compounds create a path to an alternative in the fight against pathogenic bacteria and multidrug resistance of pathogenic bacteria to antibiotics. Our results also demonstrate the richness of Malagasy plants as (re)sources of new therapeutic molecules and the importance of widening the range of bacterial targets to be investigated to develop new strategies to fight within the endless war that we are waging against bacteria pathogens.Les plantes sont continuellement confrontées à une multitude d’attaques qu’elles soient de nature abiotique ou surtout biotique. Il est intéressant de noter que malgré la multitude de bactéries auxquelles les plantes doivent faire face, seules quelques unes sont capables d’induire la mort ou une maladie chez la plante hôte. Il est dès lors fort probable que, outre les métabolites secondaires ayant des propriétés antimicrobiennes, les plantes synthétisent également des métabolites secondaires capables d’inhiber l’expression des gènes de virulence chez les bactéries sans toutefois affecter ni leur croissance ni leur viabilité, ce qui permet aux plantes de contenir les populations bactériennes qu’elles hébergent de gré ou de force. Ce travail porte sur l’identification de ce type de métabolites dans des plantes malgaches (genres Dalbergia et Combretum) et la démonstration de leurs effets inhibiteurs sur l’expression de gènes de virulence chez deux pathosystèmes différents: Rhodococcus fascians (un phytopathogène) et Pseudomonas aeruginosa (un pathogène opportuniste). Ainsi, deux métabolites ont été isolés en utilisant une combinaison de techniques chromatographiques couplées avec des tests qui évaluent l’expression de certains gènes impliqués dans les mécanismes de virulence de ces bactéries. Le premier est un nouvel isoflavanone prénylé, nommé perbergine, isolé à partir de l’extrait d’écorces de D. pervillei. Il a été montré que la perbergine cible l’expression du gène attR, codant un régulateur transcriptionnel de type LysR qui joue un rôle clé dans la régulation de l’expression des gènes de virulence de R. fascians et qui assure la transition entre un mode de vie épiphyte et le mode pathogène. En conséquence, nous avons également montré que l’expression de l’ensemble des gènes de virulence connu à ce jour chez R. fascians est également affectée alors que l’expression de gènes impliqués dans l’aptitude épiphyte de la bactérie n’est pas altérée. Par ailleurs, l’application de perbergine au moment de l’infection de plantes sensibles à R. fascians montre que cette molécule atténue la virulence de R. fascians in vivo, mettant en exergue le potentiel de la perbergine comme agent anti-infectieux. Le deuxième est un flavonoïde, connu sous le nom de catéchine, isolé de l’extrait d’écorces de C. albiflorum. La catéchine inhibe significativement l’expression des gènes régulateurs du mécanisme du quorum sensing chez P. aeruginosa tels que lasI, lasR, rhlI et rhlR et également lasB et rhlA dont l’expression dépend du quorum sensing. En conséquence, la production des facteurs de virulence tels que la pyocyanine et l’élastase est significativement affectée. Compte tenu de l’appauvrissement de notre arsenal d’antibiotiques et de leur inefficacité croissante, l’identification de ces composés ouvre une voie alternative de lutte contre les bactéries pathogènes et la multirésistance des bactéries pathogènes aux antibiotiques. Nos résultats démontrent également la richesse des plantes malgaches comme (res)sources de nouvelles molécules thérapeutiques et l’importance d’élargir le champ des cibles bactériennes à investiguer pour développer de nouvelles stratégies de lutte dans la guerre sans fin que nous menons contre les bactéries pathogènes.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe
Etude des levures endogènes de <i>Evodia bilahe</i> (Rutaceae) endémique de Madagascar
No full textEvodia belahe, un arbre endémique de Madagascar, de la famille des Rutaceae, est utilisé à des fins diverses et son écorce est surtout utilisé pour servir de levain dans la fabrication de Betsabetsa (bière artisanale). Cette plante se rencontre surtout sur les deux versants (Est et Ouest) de la chaîne montagneuse de Marojejy. D’après la logique biotechnologique, elle pourrait donc renfermer de la levure fermentaire du genre Saccharomyces. Cette étude aurait pour objectif d’isoler, de purifier et d’identifier les levures sauvages contenues dans l’écorce d’Evodia belahe. Des méthodes classiques d’isolement microbien ont été entreprises, telles que l’isolement sur milieu YGC. Deux souches ont été retenues : une souche blanche et une souche rose. Après identification en se basant sur les caractères culturaux, morphologiques, physiologiques, biochimiques (galerie Api Candida) et génétiques, la souche blanche a été reconnue comme étant l’espèce Saccharomyces cerevisiae, levure responsable de la fermentation alcoolique, et la souche rose appartient à l’espèce Rhodotorula glutinis, qui participe à la formation de l’arome et du goût du produit alcoolisé. La souche blanche, contrairement à la souche rose, est fermentaire.© 2016 International Formulae Group. All rights reserved.Mots clés: Evodia belahe, Rutaceae endémique, Saccharomyces cerevisiae, Rhodotorula glutinis, MadagascarEnglish Title: A study of the endogeneous Evodia belahe (Rutaceae) yeast, endemic of MadagascarEnglish AbstractThis study aims to insulate, purify and detect wild yeast contained in the Evodia belahe bark, a Malagasy endemic tree belonging to the Rutaceae branch which can be used in various targets. Its bark is primarily utilized as leaven Betsabetsa (an artisanal beer) manufacturing. This plant can be found on both sides (Eastern and Western) of the Marojejy mountainous chain. Based on biotechnological logic, it is likely to contain Saccharomyces yeast. Classical germ isolating method, namely YGC isolating medium is carried out. As a result, two strains can be retained: the white and pink ones. According to cultural, morphological, physiological, biochemical (Analytical Profile Index : API Candida) and genetic analyses, the white strain belongs to Saccharomyces cerevisiae species, whereas the pink strain is among Rhodotorula glutinis species, one that plays a major part in alcoholic drink flavor and taste. In contrast with the pink strain, the white one can be used in fermentation.© 2016 International Formulae Group. All rights reserved.Keywords: Evodia belahe, endemic Rutaceae, Saccharomyces cerevisiae, Rhodotorula glutinis, Madagasca
Antimicrobial effects of essential oils of Cinnamosma fragrans on the bacterial communities in the rearing water of Penaeus monodon larvae
No full textFarmed shrimps are vectors of various Vibrio species that are considered a potential health hazard. Previous study has shown that Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus, and Vibrio alginolyticus dominated in the water and larval samples of shrimp hatchery (Randrianarivelo et al. 2010). The effects of two essential oils (EOs) of Cinnamosma fragrans, an endemic plant to Madagascar (B8: linalool-type and B143: 1,8-cineole-type), were determined on the total heterotrophic aerobic bacteria and the Vibrio concentrations in the rearing water of Penaeus monodon hatchery. The assays took place in OSO Farming's shrimp hatchery in Madagascar. EOs were directly added to the water tank. The bacterial concentrations of water tank were assessed on marine agar and thiosulfate citrate bile sucrose agar. The larvae culture corresponded to four replicates each of B8, B143, erythromycin (E), and control (oil and antibiotic free). The bacterial concentration of the rearing water in B8, B143, and antibiotic (E) tanks were significantly lower ( p<0.05) than in the control. Further, there was no significant difference ( p>0.05) between the three treatments B8, B143, and E. This study demonstrated that both EOs of C. fragrans, like antibiotic, inhibited bacterial growth in the rearing water of P. monodon larvae. The potential of C. fragrans EO to control the bacterial load in in vivo conditions of P. monodon hatchery makes it a relevant option for producers to minimize risk of Vibrio growth in the rearing water of larvae, which is the primary source of colonization of shrimp larvae
Evaluation des propriétés anti-infectieuses envers Pseudomonas aeruginosa des feuilles de Tambourissa purpurea A. DC (Monimiaceae), une plante médicinale endémique malgache
No full textDans la lutte incessante contre les infections bactériennes, et face aux défis de la résistance aux antibiotiques, la recherche de nouveaux composés ciblant la virulence bactérienne est une approche thérapeutique d’intérêt. Connaissant la grande richesse des plantes médicinales en tant que sources de composés naturels, nous nous sommes fixé pour objectif de rechercher des composés ayant des propriétés antivirulences envers Pseudomonas aeruginosa à partir d’une plante médicinale endémique de Madagascar, Tambourissa purpurea A. DC. une Monimiaceae utilisée traditionnellement pour soigner les maladies parodontales et les caries dentaires. Suite au criblage de différents extraits de feuilles de T. purpurea pour leur activité anti-infectieuse chez P. aeruginosa, le composé xanthophylle lutéine (Lut) a été isolé de l’extrait hexanique. Ce composé, à 22 μM, inhibe la formation du biofilm de P. aeruginosa (de 56 %) et son maintien ainsi que l’expression des gènes du système las et rhl du Quorum Sensing (QS). Par conséquent, la production de facteurs de virulence contrôlés par le QS, notamment les rhamnolipides, la pyocyanine, l’élastase et les mobilités des types twitching et swarming sont considérablement réduits (62 %, 67 %, 19 %, 34 %, et 40 % d’inhibition, respectivement). De plus, la Lut désorganise la structure du biofilm établi et augmente significativement l’activité bactéricide de la tobramycine contre les cellules de P. aeruginosa encapsulées dans le biofilm. De manière intéressante, le gène régulateur des facteurs de virulence vfr a été suggéré comme étant la cible principale de la Lut. Ces résultats suggèrent que la Lut représente une candidate potentielle pour des investigations in vivo quant à son effet anti-QS et antibiofilm sur des modèles infectieux d’organismes supérieurs. Ils confortent également la richesse des plantes médicinales malgaches en tant que sources de composés anti-infectieux innovants ainsi que l’importance de telle investigation afin de renforcer notre arsenal thérapeutique en composés antivirulences et antibiofilm pour la lutte contre les bactéries multirésistantes.In the ongoing fight against bacterial infections and with regard to the challenges of antibiotics resistance, the search for new compounds targeting bacterial virulence appears as a relevant therapeutic approach. Knowing the great abundance of medicinal plants as a source of natural compounds, we set ourselves the goal of the researching natural compounds with antivirulence properties targeting the virulence of Pseudomonas aeruginosa, from a medicinal plant endemic to Madagascar, Tambourissa purpurea A. DC. a Monimiaceae traditionally used to treat periodontal diseases and dental caries. Following the screening of different extracts of T. purpurea leaves for their anti-infective activity in P. aeruginosa, the xanthophyll compound lutein (Lut) was isolated from the hexanic extract. This compound, at 22 μM, inhibited P. aeruginosa biofilm formation (by 56%) and maintenance as well as the expression of the Quorum Sensing (QS) las and rhl genes. As a result, the production of QS-controlled virulence factors including rhamnolipids, pyocyanin, elastase as well as the twitching and swarming motility are significantly reduced (62%, 67%, 19%, 34%, and 40% inhibition, respectively). In addition, Lut disrupts the structure of the established biofilm and significantly increases the bactericidal activity of tobramycin against biofilm-encapsulated P. aeruginosa cells. Interestingly, the virulence factor regulator gene vfr was proposed as the main target of Lut. These results suggest that Lut represents a potential candidate for in vivo investigations of its anti-QS and antibiofilm effect in infectious models of higher organisms. They also support the richness of Malagasy medicinal plants as sources of innovative anti-infectious compounds and the importance of such investigation to strengthen our therapeutic arsenal of antivirulence and antibiofilm compounds in the fight against multidrug-resistant bacteria.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe
Dalbergia trichocarpa, source of natural compounds which affect quorum sensing mechanism and biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa
No full textDepuis quelques décennies, les bactéries pathogènes multi-résistantes aux antibiotiques sont de plus en plus répandues dans le monde. Cette situation a suscité le besoin et l'intérêt de trouver des médicaments antibactériens avec de nouvelles cibles potentiels. La découverte des systèmes de communication de type quorum sensing (QS) régulant la virulence bactérienne représente une des cibles privilégiées pour contrôler les bactéries pathogènes autrement qu’en interférant avec leur croissance bactérienne. Dans l’écosystème naturel, un grand nombre d'organismes (Eucaryotes et Procaryotes) co-existent en synthétisant chacun de leur côté des métabolites secondaires. Les plantes, étant en permanence en contact avec des bactéries, synthétisent des métabolites secondaires capables d’inhiber l’expression des gènes de virulence chez les bactéries sans pour autant affecter ni leur croissance ni leur viabilité. Notre objectif a été de contribuer à la valorisation de la biodiversité malgache en identifiant des plantes et en y isolant les composés actifs présentant une capacité à perturber le mécanisme de QS chez P. aeruginosa PAO1, une bactérie pathogène opportuniste de l’homme, des animaux et des plantes. Dans ce but, nous avons tout d’abord réalisé un criblage d’activité anti-QS de différents flavonoïdes commerciaux. De ce criblage, la narigenine et la naringine ont été sélectionnées pour être les molécules de contrôle positif et négatif des tests d’activité anti-QS, respectivement. Par la suite, 4 espèces de Dalbergia endémique de Madagascar ont fait l’objet de criblage pour leur activité anti-QS. Ce travail a fait ressortir l’activité anti-QS très intéressante de l’écorce de D. trichocarpa à partir de laquelle nous avons isolée le composé actif nommé la coumarate de l’aldéhyde-oléanolique (OALC). Le contrôle naringénine et l’OALC ne présente aucun effets inhibiteurs sur la croissance bactérienne de P. aeruginosa PAO1 et sur l’expression du gène QS-indépendant aceA suggérant une activité d’inhibition spécifiquement liée au QS. Cependant, ces deux molécules présentent des spectres d’inhibition différente. En effet, les deux molécules diffèrent dans le sens que la naringenine n’inhibe pas l’expression du gène gacA et la motilité de type twitching contrairement à l’OALC. Ces résultats suggèrent que l’OALC et la naringénine représente des candidats potentiels pour des investigations in vivo quant à leur effet anti-QS et anti-biofilm sur des modèles infectieux d’organismes supérieurs. Par ailleurs, ils démontrent la richesse des plantes malgaches comme sources de nouvelles molécules anti-virulence ainsi que l’importance de telle investigation afin de renforcer notre arsenal thérapeutique en composé antibactérienne dans la lutte continuelle contre les bactéries pathogènes/Since few decades, multidrug resistant bacteria spread all over the world. This situation gives rise to the need and interest in finding antibacterial drugs with novel potent target. Discovery of communication system termed Quorum Sensing (QS) which regulate bacterial virulence factor represent privileged target in another way than interfering with bacterial growth. In natural ecosystem, many organisms (Eukaryotes and Prokaryotes) produce secondary metabolites. As plants are permanently in contact with bacteria, they have synthetized secondary metabolites which inhibit bacterial virulence gene expression without affecting bacterial viability. Our goal was to contribute to the valorization of Malagasy biodiversity and specifically to identify plants and isolate bioactive compound presenting ability to disrupt QS mechanism in P. aeruginosa, opportunistic pathogen bacteria in plants, animals and human. In this purpose, screening of commercial available flavonoids has been firstly carried out. From this screening, naringenin and naringin have been selected to be used as positive and negative QS inhibitor controls, respectively. Subsequently, Four Malagasy endemic Dalbergia species have been screened for their anti-QS activity. This work pointed out the interesting anti-QS activity of D. trichocarpa bark extract which led to the isolation of oleanolic aldehyde coumarate (OALC) as one major bioactive compound. At the concentration tested, naringenin and OALC did not affect P. aeruginosa PAO1 viability and didn’t reduce QS-independent aceA gene expression suggesting a specific anti-QS activity. However, these two compounds present different inhibition spectrum. Indeed, naringenin didn’t inhibit gacA gene expression and twitching motility contrarily to OALC. These results suggest that OALC and naringenin represent potent candidates for in vivo investigations in their anti-QS and anti-biofilm activity onto eukaryotes infectious model. Besides, this finding demonstrated the potent source for novel anti-virulence compounds of Malagasy flora and the importance of this kind of research to strengthen our antimicrobial therapeutic arsenal with the ongoing struggle against bacterial infection.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe
Evaluation of Phenotypic Variations in the Antibiotics Sensitivity of Escherichia Coli by Repeated Exposure
No full textEnterobacteriaceae, in particular Escherichia coli, are habitual residents of the gastrointestinal tract, capable of causing a large number of infections. The MIC varies according to the bacterial strains and the antibiotics used, hence the need to carry out antibiotic sensitivity tests. The objective of this study is to evaluate the behavior of Escherichia coli after repeated exposure to the same antibiotic to demonstrate a possible correlation between excessive intake of antibiotics and bacterial resistance.
A prospective and descriptive study was carried out in the Laboratory of Microbiology of Fundamental and Applied Biochemistry (Faculty of Sciences Antananarivo) during the month of November 2019. The strains studied were the reference strain Escherichia coli ATCC 25922 provided by the Laboratory and two clinical strains from the Microbiology Laboratory of the Joseph Ravoahangy Andrianavalona University Hospital Center (CHU JRA) Antananarivo. Repeated exposure to Tobramycin and Ofloxacin of these strains were performed.
The results of our study showed that most E. coli is exposed to the antibiotic, the more it develops resistance. The evolution of E. coli\u27s sensitivity is different in the presence of Tobramycin with MICs up to 4 times the starting value while in the presence of Ofloxacin, the MIC increases to 125 times the initial value. This difference may be due to the different target of the antibiotic which causes the bacteria to develop variable mechanisms to escape it.
Key words: E. coli - MIC - antibiotics - repeated exposur
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