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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
No full textThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Mitomycin C in highly myopic eyes - Author reply
No full textOphthalmology. 2005 Feb;112(2):208-18; discussion 219.
Mitomycin C modulation of corneal wound healing after photorefractive keratectomy in highly myopic eyes.
Gambato C, Ghirlando A, Moretto E, Busato F, Midena E.
SourceRefractive Surgery Service and Antimetabolite Therapy Research Unit, Department of Ophthalmology, University of Padova, Padova, Italy.
Abstract
PURPOSE: To evaluate the role of topical mitomycin C in corneal wound healing (CWH) after photorefractive keratectomy (PRK) in highly myopic eyes.
DESIGN: Prospective, double-masked, randomized clinical trial.
PARTICIPANTS: Seventy-two eyes of 36 patients affected by high (>7 diopters) myopia.
METHODS: In each patient, one eye was randomly assigned to PRK with intraoperative topical 0.02% mitomycin C application, and the fellow eye was treated with a placebo. Postoperatively, mitomycin C-treated eyes received artificial tears (3 times daily, tapered in 3 months), whereas the fellow eye was treated with fluorometholone sodium 2% and artificial tears (3 times daily, tapered in 3 months).
MAIN OUTCOME MEASURES: Uncorrected visual acuity (UCVA) and best-corrected visual acuity (BCVA), contrast sensitivity, manifest refraction, and biomicroscopy. Contrast sensitivity was determined using the Pelli-Robson chart. Corneal confocal microscopy documented CWH.
RESULTS: Mean follow-up was 18 months (range, 12-36). No side effects or toxic effects were documented. At 12-month follow-up examination, UCVAs (logarithm of the minimum angle of resolution) were 0.4+/-0.48 and 0.5+/-0.53 (P = .03) in mitomycin C-treated eyes and corticosteroid-treated eyes, respectively. At 1 year, corneal haze developed in 20% of corticosteroid-treated eyes, versus 0% of mitomycin C-treated eyes. At 12, 24, and 36 months, corneal confocal microscopy showed activated keratocytes and extracellular matrix significantly more evident in untreated eyes (Ps = 0.004, 0.024, and 0.046, respectively).
CONCLUSION: Topical intraoperative application of 0.02% mitomycin C can reduce haze formation in highly myopic eyes undergoing PRK.
Comment in
Ophthalmology. 2006 Feb;113(2):357; author reply 357-8
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
No full textWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Electrofiltration of Biopolymers : Spatially Distributed Process Analysis
No full textIn biotechnology the current downstream processing trends are directed towards integrated, faster and more effective processes. Electrofiltration is a hybrid method which is a combination of membrane filtration and electrophoresis in a dead-end process. Spatially distributed process analysis together with the applicability of electrofiltration for technically important biopolymers such as PHB, chitosan and hyaluronic acid enables the implementation of the technology into industry
Prozessstrategien zur Beeinflussung der makromolekularen Zellzusammensetzung photoautotropher Mikroorganismen bei Kultivierungen im Labor- und Pilotmaßstab
No full textIm Rahmen dieser Arbeit konnte mit Hilfe verschiedener Prozessstrategien die makromolekulare Zellzusammensetzung photoautotropher Mikroorganismen während der Kultivierung erfolgreich manipuliert werden. Im Zentrum der Untersuchungen stand dabei, wie sich unterschiedliche Kultivierungsparameter, mit Hauptaugenmerk auf die Photonenflussdichte und die Substratkonzentration, im Labor- und Pilotmaßstab auswirken. Als Modellorganismus diente die Mikroalge Chlorella vulgaris. An diesem Stamm wurde der Einfluss der Licht-, Kohlenstoffdioxid- und Stickstoffverfügbarkeit auf das Wachstum und die Zellzusammensetzung unter idealisierten Wachstumsbedingungen in einem Rührkesselreaktor näher untersucht. Es gelang, nicht nur die spezifische Wachstumsgeschwindigkeit von Chlorella vulgaris in Abhängigkeit von einem limitierenden Substrat, sondern zusätzlich die Auswirkung des Substrates auf die stöchiometrische Grundzusammensetzung zu bestimmen. Im Bereich niedriger Biotrockenmassekonzentrationen von cX = 0,3 g L-1 sind für eine optimale Prozessführung mit einer Wachstumsrate µ ≥ 2 d-1 eine minimale Photonenflussdichte von PFD0 = 200 µmol m-2 s-1, ein CO2-Partialdruck von 0,5 kPa - bzw. ein CO2-Anteil des eintretenden Luftstroms von 0,5 % (v/v) - und eine Ammoniumkonzentration von mindestens c(NH4+)Zulauf = 20 mg L-1 nötig. Für diesen Betriebspunkt ergibt sich eine Zellzusammensetzung mit einem Gesamtproteingehalt zwischen qP = 0,4 und 0,5 g g-1, einem Kohlenhydratgehalt zwischen qKh = 0,2 und 0,3 g g-1 sowie einem Lipidgehalt zwischen qL = 0,1 und 0,2 g g-1. Ist eine höhere Proteinausbeute erwünscht, sollte die beschriebene Strategie einer substratgesättigten Kultivierung bei gleichzeitiger Lichtlimitierung angewendet werden. Wird eine höhere Kohlenhydrat- oder Lipidausbeute verlangt, ist die ausgeführte Strategie einer stickstofflimitierten Kultivierung zielführend. Der eigens zur Untersuchung von stickstoffgesättigtem und -limitiertem Wachstum etablierte kontinuierliche Luminostat-Prozess für Chlorella vulgaris konnte erfolgreich auf die Mikroalge Nannochloropsis limnetica, die Kieselalge Phaeodactylum tricornutum sowie das Cyanobakterium Synechocystis sp. übertragen werden. Bei allen Stämmen führte, übereinstimmend mit publizierten Ergebnissen, ein Stickstoffmangel zu einer Speicherstoffakkumulation und eine ausreichende Stickstoffversorgung zu einer Proteinakkumulation. Die Übertragbarkeit des entwickelten Prozesses kann daher als bestätigt gelten.
Die Ergebnisse der Wachstumskinetik in Abhängigkeit von der Photonenflussdichte und der Stickstoffverfügbarkeit für den Stamm Chlorella vulgaris sowie das metabolische Netzwerk wurden zur Erstellung eines strukturierten Modells genutzt, um pho-toautotrophes Wachstum zu simulieren. Das generierte Modell ist in der Lage, zellinterne Verän-derungen der Zellzusammensetzung in einem Chargenprozess nach Eintritt einer Stickstofflimi-tierung mit Hilfe spezifischer Raten zu beschreiben. Insgesamt wurden 16 spezifische Raten zur Darstellung der anabolen und katabolen Stoffwechselwege berechnet. Die bei den Simulationen erhaltenen Wachstumsverläufe stimmen sehr gut mit experimentell gewonnenen Daten überein. Im Mittel liegt die relative Streuung der geschätzten Parameterwerte unterhalb der unteren Schranke von 15 %. Das postulierte Zellmodell wird durch das Simu-lationsergebnis und die gemessenen Wachstumskinetiken sowie durch die Er-gebnisse der Luminostat-Versuche unterstützt. Die makromolekulare Zellzu-sammensetzung wird maßgeblich von der Photonenflussdichte, der CO2-Verfügbarkeit und der Stickstoffverfügbarkeit beeinflusst.
Die oben erwähnte Zunahme des Proteinanteils unter lichtlimitierten Wachstumsbedingungen konnte auf einen Anstieg der Anteile der Proteinkomplexe der Photosysteme zurückgeführt wer-den. Von 18 untersuchten Aminosäuren stimmen 12 Aminosäuren in ihrer prozentualen Zunahme zu über 80 % mit deren jeweiligen Anteil in den Proteinkomplexen der Photosysteme I und II überein. Die Erkenntnisse bestätigen Literaturangaben, nach welchen lichtlimitiertes Wachstum zu einer erhöhten Expression von Lichtsammelkomplexen führt. Als Reaktorsystem wurde ein 8 L Plattenreaktor im kontinuierlichen Luminostat-Betrieb eingesetzt. Ergänzend konnte, mit Hilfe von statistischer Versuchsplanung und -auswertung, ein Zu-sammenhang von Protein- und Chlorophyll-Zellquota nachgewiesen werden. Da die Pigmente der Lichtsammelkomplexe ebenfalls unter lichtlimitierten Bedingungen verstärkt exprimiert werden, ist die Aussage nachvollziehbar, dass unter lichtlimitierten Bedingungen der Proteingehalt der Zelle ansteigt. Die Medienkomponenten Ammoniumchlorid, Magnesi-umsulfat und Eisensulfat zeigten einen signifikanten Einfluss auf den Protein- und Pigmentgehalt. Unter den hier verwendeten Versuchsbedingungen wurde für Chlorella vulgaris als Maxi-mum ein Proteinanteil von qP = 0,65 g g-1 erreicht.
Zur genaueren Charakterisierung des Cyanobakteriums Synechocystis sp. wurde die spezifische Wachstumsgeschwindigkeit in Abhängigkeit von der Licht- und Phosphatverfügbarkeit unter idealisierten Wachstumsbedingungen untersucht. Es zeigte sich, dass eine minimale Photonenflussdichte von PFD0 = 46 µmol m-2 s-1 und eine Phosphatkonzentration von mindestens c(PO43-)Zulauf = 4,16 mg L-1 eingestellt werden sollten, um unter den gegebenen Ver-suchsbedingungen eine hohe Wachstumsrate von µ ≥ 1,3 d-1 zu garantieren. Eine quantitative Charakterisierung der Bedingungen, welche eine Akkumulation des Biopolymers Cyanophycin von bis zu qCP = 0,4 g g-1 begünstigen, wurde mit Hilfe von Chargenprozessen in Plattenreakto-ren verwirklicht. Vorausgehende Arbeiten konnten - wenn auch nur qualitativ - zeigen, dass Sy-nechocystis sp. zur Anreicherung dieses Biopolymers unter Phosphatlimitierung fähig ist. Neben dem spezifischen Phosphoranteil von qP,X 1 mg g-1 eine gleichbleibende PCE erreichten, kann außerdem davon ausgegangen werden, dass phosphatlimi-tiertes Wachstum keinen Stresszustand für Synechocystis sp. darstellt.
Um die Erkenntnisse aus dem Labormaßstab in den Pilotmaßstab zu übertragen, wurde eine Kultivierung in einem 230 L Freiland-Plattenreaktor durchgeführt. Als Prozessvariante wurde ein im Vergleich zu kontinuierlichen Prozessen ökonomisch sinnvollerer repetitiver Chargenprozess gewählt. Die wechselnden Bedingungen der Tag- und Nachtphasen und die damit verbundenen photosynthetischen und respiratorischen Zellaktivitäten stellen bei Freilandkultivierungen eine besondere Herausforderung dar. Die eintretenden pH Änderungen erforderten die Regelung des CO2-Eintrags durch einen PI-Regler. Wie in vorausgegangenen Arbeiten wurde durch die Kombination eines PI-Reglers mit einer Ammoniaklösung als pH Stellmittel außerdem eine Stickstofflimitierung erfolgreich vermieden. Mit dieser Strategie wurde bei Chlorella vulgaris ein Proteinanteil von bis zu qP = 0,63 g g-1 im Labormaßstab bzw. qP = 0,65 g g-1 im Pilotmaßstab erzielt. Über die Prozesszeit konnte ein zyklischer Verlauf der Zell-zusammensetzung - bedingt durch die Tag- und Nachtphasen - beobachtet werden. In den Nachtphasen sank die Biotrockenmassekonzentration cX um bis zu 10,0 % aufgrund respiratori-scher Prozesse zur Energiebereitstellung.
Zusammengenommen wurden verschiedene Strategien entwickelt und verifiziert, die eine Mani-pulation der Synthese biologischer Makromoleküle durch photoautotrophe Mikroorganismen ermöglichen. Die Produktausbeute kann aktiv beeinflusst werden. Der Anteil essentieller Ami-nosäuren oder gesättigter Fettsäuren kann im Bereich stöchiometrischer Minima und Maxima verschoben werden; dies kommt den Wünschen der Futter- und Nahrungsmittelindustrie bezüg-lich einer gezielten Produktion physiologisch wertvoller Stoffgruppen entgegen. Kostengünstig wirkt sich die Möglichkeit einer Freilandkultivierung aus. Eine präzise Bestimmung von Wachs-tumskinetiken in Abhängigkeit von limitierenden Substraten kann einen essentiellen Beitrag für die Prozessentwicklung liefern, sofern produktrelevante zellinterne Regelkreise entsprechend berücksichtigt werden. Mess- und regelungstechnische Verfahren ermöglichen außerdem eine Automatisierung von Prozessen. Die quantitative Verfügbarkeit von Nährstoffen und Energielie-feranten bestimmt sämtliche metabolischen Vorgänge in der Zelle und wirkt sich direkt auf die Wachstumsrate aus. Eine gezielte Prozessauslegung erfordert daher eine allumfassende quantita-tive Betrachtung der Abläufe in- und außerhalb einer Zelle
A Multi-Language Comparison of Influences on Author Verification using Character N-Grams
No full textWe create a new multi-language corpus for author verification based on Wikipedia talkpages, and evaluate the influence that differences in topic and time have on character n-gram author profiles. Topic alignment between two texts is found to increase author verification precision, and an authors writing style is found to change over time, but not more significantly after 3 years than after 1 year.Information ArchitectureWISElectrical Engineering, Mathematics and Computer Scienc
A 0.12mm<sup>2</sup> Wien-Bridge Temperature Sensor with 0.1°C (3σ) Inaccuracy from -40°C to 180°C
No full text Resistor-based temperature sensors can achieve much higher resolution and energy efficiency than conventional BJT-based sensors [1], but they typically occupy more area (> 0.25 mm 2 ) and have lower operating temperatures (le 125 {circ} {C}) [2]-[4]. This work describes a 0.12mm 2 resistor-based sensor that uses a Wien-bridge (WB) filter to achieve 0.1 {circ} {C} (3 sigma) inaccuracy from - 40 {circ} {C} to 180 {circ} {C}. Compared to a state-of-the-art WB sensor [4], it occupies 6 × less area and achieves comparable relative accuracy over a 76% wider operating range. Session 10.3 Green Open Access added to TU Delft Institutional Repository ‘You share, we take care!’ – Taverne project https://www.openaccess.nl/en/you-share-we-take-care Otherwise as indicated in the copyright section: the publisher is the copyright holder of this work and the author uses the Dutch legislation to make this work public.Electronic InstrumentationMicroelectronic
Mikroreaktorentwicklung und -charakterisierung zur Erschließung physikalisch-chemischer Parameter in der Proteinkristallisation
No full textInhalt dieser Arbeit ist die Entwicklung und Charakterisierung von Mikroreaktoren für die Kristallisation biologischer Makromoleküle, einem der Schlüsselprozesse in der aktuellen biotechnischen Forschung. Hauptziele waren die Bereitstellung neuartiger Technologieplattformen als kompakte wiederverwendbare Mikroreaktoren, deren physikalische und verfahrenstechnische Charakterisierung sowie die Überprüfung, inwieweit sich mikrostrukturierte Komponenten für den Einsatz in der Biokristallisation eignen. Die Entwicklung wurde hierbei in zwei Arbeitsabschnitte unterteilt: I) Batch-Mikroreaktor zur temperaturkontrollierten Kristallisation im Batch-Betrieb; II) Fluss-Mikroreaktor zur temperatur- und konvektionskontrollierten Kristallisation im kontinuierlichen Betrieb. Die thermische Charakterisierung der Mikroreaktoren umfasste die Analyse der Temperaturfelder und Erfassung dynamischer Parameter mithilfe von Pt-Dünnschichtsensoren und thermografischen Messungen. Die fluidischen Parameter wurden in Messungen zum Druckverlust, zur Verweilzeit- und Geschwindigkeitsverteilung ermittelt. 3D-FEM- bzw. CFD-Rechnungen dienten im Zuge der Designoptimierung zur Variantenstudie und Analyse experimentell unzugänglicher Bereiche. Experimente und Simulationen wurde anhand analytischer 1D-Modelle validiert. Untersuchungen zum temperaturkontrollierten Kristallwachstum von Modellproteinen zielten auf die Evaluierung des Mikroreaktorkonzepts und dessen Charakterisierung ab.
Ein Ergebnis der Arbeit ist der Prototyp eines voll funktionsfähigen Batch-Mikroreaktors auf der Basis von Silizium-Mikrosystemtechnik und Dünnschichttechnologie zur temperaturkontrollierten Kristallisation kleiner Proteinmengen. Weiterhin gelang es durch Integration (mikro-) fluidischer Strukturen, das Mikroreaktorkonzept für den kontinuierlichen Betrieb zum Fluss-Mikroreaktor zu erweitern. Die Mikroreaktorsysteme erfüllen die thermischen und fluidischen Anforderungen der Biokristallisation. Die Temperierung ist im Bereich . = 5°C . 50°C exakt (.T ±3 s) erlauben Studien mit dynamischen Temperaturprotokollen. Im gesamten Flusssystem liegen laminare Bedingungen vor. Verweilzeitverhalten und Druckverlust (.p ¡Ö 100 mbar) des Mikroreaktors werden dominiert durch die fluidische Peripherie. Im Chipreaktor als dem eigentlichen Reaktionsraum herrschen homogene Strömungsverhältnisse ohne Totvolumina und Rückströmungen. Erste Untersuchungen zur Proteinkristallisation im Batch-Mikroreaktor zeigen, dass die Mikroreaktoren unmittelbar einsetzbar sind. Der Einfluss der Temperatur als sensitiver Parameter in der Proteinkristallisation konnte mithilfe verschiedener Temperaturprotokolle nachgewiesen werden. Die Kristallqualität reicht an die am weitesten verbreitete Standardmethode, die Dampfdiffusion .Hängender Tropfen., heran. Durch ihre homogenen und gut zu charakterisierenden fluidischen und thermischen Betriebsparameter eignen sich die Mikroreaktoren hervorragend als Sekundärverfahren im Parameterscreening sowie für physiko-chemische Untersuchungen der Kristallogenese zur Erstellung von Phasendiagrammen. In Perspektive bedeutet die Integration weiterer fluidischer und analytischer Komponenten eine beträchtliche Erweiterung des Parameterraums und eröffnet neue Möglichkeiten zur in situ-Analyse physiko-chemischer Prozesse
Einfluss von Licht und Temperatur auf die Kultivierung von Mikroalgen - Auslegung und Betrieb von Freiland-Pilotanlagen zur Bestimmung prozessrelevanter Kinetiken
No full textDie großtechnische Produktion von Mikroalgen wird von den klimatischen und prozessspezifischen Bedingungen beeinflusst. In dieser Arbeit wurde einerseits die Auslegung und die Inbetriebnahme einer neuartigen Freiland Pilotanlage behandelt und anderseits der kombinierte Einfluss von Licht und Temperatur auf das Wachstums- und Produktbildungverhalten untersucht. Durch die Modellierung des Wachstums unter Freilandbedingungen wurde die Grundlage für eine weitere Prozessoptimierung geschaffen
A ±25A Versatile Shunt-Based Current Sensor with 10kHz Bandwidth and ±0.25% Gain Error from -40°C to 85°C Using 2-Current Calibration
No full textAccurate current sensing is critical in many industrial applications, such as battery management and motor control. Precise shunt-based current sensors have been reported with gain errors of less than 1% over the industrial temperature range (-40°C to 85°C) [1]–[4]. However, since they are intended for coulomb counting, their bandwidth is limited to a few tens of Hz, making them unsuitable for battery impedance or motor-current sensing. This paper presents a current sensor with a wide (10kHz) bandwidth and a tunable temperature compensation scheme (TCS), which allows it to be flexibly used with different types of shunts while maintaining high accuracy. A low-cost room-temperature calibration scheme is proposed to optimize gain flatness over temperature by exploiting the shunt's self-heating at large currents. Over the industrial temperature range and a ±25A current range, it achieves state-of-the-art gain error (±0.25%) with both low-cost PCB and stable metal-alloy shunts.Green Open Access added to TU Delft Institutional Repository 'You share, we take care!' - Taverne project https://www.openaccess.nl/en/you-share-we-take-care Otherwise as indicated in the copyright section: the publisher is the copyright holder of this work and the author uses the Dutch legislation to make this work public.Electronic InstrumentationMicroelectronic
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