1,720,979 research outputs found
Study of PI3K/AKT/mTOR pathway in breast cancer progression
Get PDFDeregulation in the PI3K/AKT/mTOR pathway is associated with breast cancer development. Using experimental models of breast carcinogenesis induced in mice, xenografts of tumor cell lines, and tumors from patients we found a differential role of AKT1 and AKT2 isoforms in breast cancer progression. That is, AKT1 regulates nuclear proteins related to cell proliferation, such as cyclin D1 and pS6, whereas AKT2 regulates proteins related to cell migration and invasion such as vimentin, integrin b1, F-actin and FAK. Furthermore, activation of AKT1 promoted the hormone-independent and endocrine resistant phenotype, whereas activation of AKT2 lead to a more aggressive phenotype and lung metastasis. We analyzed 98 luminal breast carcinomas and found that nuclear AKT1 associates with low grade tumors, while cytosolic AKT2 associates with high grade tumors. Furthermore, presence of cytosolic AKT2 was positively correlated with a shorter time to progression of the disease (earlier relapse). In addition, based on our results and data analysis from public databases of The Cancer Genome Atlas, we postulate that throughout the progression of the disease there would be a switch between AKT1 and AKT2 isoforms, which maintains AKT2 inhibited while AKT1 prevails in the early stages. In the more advanced stages, this inhibition is lost and AKT2 prevails. Specific miRNAs are good candidates involved in this regulation and are now been tested in our lab in different experimental and clinical conditions. We propose the use of AKT1 and AKT2 isoforms determined by immunohistochemistry as prognostic markers that could help to better stratify breast tumors and direct more specific therapies.Fil: Novaro, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina54 Annual Meeting Argentine Society for Biochemistry and Molcecular Biology: LIV Reunión Anual Sociedad Argentina de Investigación en Bioquímica y Biología MolecularParanaArgentinaSociedad Argentina de BioquímicaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasFondo para la Investigación Científica y Tecnológic
Malignant mammary cells acquire independence from extracellular context for regulation of estrogen receptor alpha.
No full textInteractions between luminal epithelial cells and
their surrounding microenvironment govern the normal development and function of the mammary gland. Alter- ations of these interactions can induce abnormal intracel- lular signaling pathways that affect the development and progression of breast tumors. One critical component of mammary gland development, as well as breast cancer progression, is the expression of estrogen receptors. In a previous study using cultured nonmalignant mammary epithelial cells, we found that the basement membrane molecules, laminin-1 and collagen-IV, were involved in maintenance of estrogen receptor (ER) expression, and that this response could be interfered with by disrupting cell-extracellular matrix adhesion. Here we use phenotyp- ically normal mammary epithelial SCp2 cells to dissect the promoter region of the ER-alpha that is involved in the selective response to basement membrane. We also analyze the alteration of this response in SCg6 cells, a malig- nant cell line that shares a common lineage with the SCp2 cells, to provide insight into the relative overexpression of ER-alpha and the unresponsiveness to basement membrane regulation found in those malignant cells. Evidence is presented to show the relevance of the cross-talk between different signaling pathways in the constitution of a functional tissue organization and how this integration may be disrupted in the malignant phenotype
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Study of the mechanisms of resistance to tamoxifen and palbociclib in breast cancer
No full textEl cáncer de mama es la neoplasia maligna con la incidencia y mortalidad más alta en mujeres en el mundo. Aproximadamente el 70% de los tumores de mama expresan receptores de estrógenos (ER) y de progesterona (PR) y son por eso susceptibles al tratamiento con inhibidores hormonales como el tamoxifeno. Si bien la terapia hormonal es eficaz para el tratamiento de estos tumores, un alto porcentaje de los pacientes eventualmente recae a esta terapia. Recientemente se ha aprobado el uso de inhibidores de ciclo celular, como el palbociclib, para el tratamiento de los pacientes que recaen a la terapia endócrina o que presentan cáncer de mama metastásico. Sin embargo, de igual forma que con el tratamiento hormonal, estos pacientes eventualmente dejan de responder al tratamiento o incluso algunos no responden desde el comienzo. El objetivo general de este trabajo fue estudiar los mecanismos de resistencia asociados al tratamiento con tamoxifeno y con palbociclib, para poder proponer mejores estrategias terapéuticas para los pacientes que recaen a los mismos, así como también para evitar o retrasar el desarrollo de resistencia. Para esto, utilizamos las líneas de cáncer de mama humano T47D y MCF-7 para generar variantes resistentes a ambas drogas por presión selectiva con dichos agentes por 12 a 24 meses. Generamos primero las variantes resistentes a tamoxifeno (T47D-TR y MCF-7-TR) y a palbociclib (T47D-PR y MCF-7-PR), y luego a partir de las resistentes a tamoxifeno generamos las variantes doble resistentes a tamoxifeno y palbociclib (T47D-TPR y MCF-7-TPR), simulando la secuencia terapéutica utilizada en la clínica. Evaluamos la morfología de las líneas resistentes creciendo en 2D y observamos que presentan mayor atipia celular que las líneas parentales, forman estructuras irregulares y desorganizadas creciendo en 3D sobre Geltrex y en suspensión como mamosferas, lo cual se correlaciona con una expresión aberrante o reducida de E-cadherina. Además, encontramos que la variante resistente a tamoxifeno T47D-TR presenta un aumento en la capacidad de formar mamosferas, así como en la expresión de marcadores de stemness. A su vez, tanto la variante resistente a tamoxifeno MCF-7-TR como la resistente a palbociclib MCF-7-PR presentan una mayor capacidad migratoria que la línea wild type. Por otra parte, las variantes resistentes presentan una menor tasa de proliferación que la línea parental, tanto in vitro como in vivo. En contraposición a esto, encontramos aumento en la expresión de proteínas del ciclo celular como ciclina D1, ciclina E2, CDK4, CDK6 y CDK1 y disminución en Rb, dependiendo de la variante analizada. Encontramos también una menor expresión de ER y PR en las variantes resistentes, así como también un aumento en la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR a nivel de AKT o de la proteína ribosomal S6, y un aumento en PKCα. Evaluamos la sensibilidad in vitro de las variantes a inhibidores de PI3K/AKT/mTOR que actúan a distintos niveles de la vía, y encontramos un mayor efecto inhibitorio utilizando rapamicina (inhibidor de mTOR) que utilizando alpelisib (inhibidor de PI3Kα). Además, observamos que la combinación de rapamicina con palbociclib es más efectiva que los tratamientos, tanto in vitro como in vivo, no solo en reducir la proliferación y el crecimiento tumoral, sino también inhibiendo la expresión de proteínas del ciclo celular y la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Finalmente, para validar los resultados obtenidos en las líneas celulares, utilizamos xenotrasplantes derivados de pacientes (PDX) obtenidos a partir de biopsias de pacientes con tumores de mama ER+, sensibles y resistentes a tamoxifeno y palbociclib. Disgregamos los PDXs para obtener células individuales, las cuales fueron crecidas ex-vivo en 3D sobre Matrigel. Observamos que la mayoría de los cultivos son sensibles al tratamiento con alpelisib (inhibidor de PI3Kα). Por otra parte, la totalidad de los PDXs analizados son sensibles al tratamiento con everolimus (inhibidor de mTOR), independientemente de la presencia de mutaciones o alteraciones en genes de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Además, la triple combinación de palbociclib con everolimus y fulvestrant (inhibidor de ER) es más efectiva que las drogas individuales, no solo inhibiendo proteínas del ciclo celular sino también la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR. En conjunto, nuestros resultados indican que el tratamiento combinado de palbociclib con inhibidores de mTOR es efectivo tanto en un contexto de resistencia a tamoxifeno como a palbociclib, inhibiendo en paralelo tanto la proliferación celular y el crecimiento tumoral como la activación del eje ciclina D1/CDK4/6/Rb y de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Esta combinación podría evitar una reactivación de esta vía downstream mTOR y así retrasar el desarrollo de resistencia. En conclusión, en este trabajo generamos y caracterizamos modelos experimentales de resistencia adquirida a tamoxifeno y a palbociclib, simulando la secuencia terapéutica utilizada en la clínica. Estos modelos son útiles para estudiar tanto en cultivo celular como in vivo los mecanismos asociados al desarrollo de resistencia, para de esta manera poder proponer mejores estrategias terapéuticas para el tratamiento de los tumores de mama que recaen a estos esquemas, así como también contribuir a la identificación de posibles biomarcadores de respuesta terapéutica.Breast cancer is the malignant neoplasm with the highest incidence and mortality in women worldwide. Approximately 70% of breast tumors express estrogen (ER) and progesterone (PR) receptors and are therefore sensitive to endocrine inhibitors, such as tamoxifen. Although endocrine therapy is effective for the treatment of these tumors, a significant amount of patients eventually relapse. Recently, the use of cell cycle inhibitors such as palbociclib has been approved for the treatment of patients that relapse to hormone therapy or have metastatic breast cancer. However, patients ultimately relapse to this treatment, or do not respond from the beginning. The aim of this work was to study the mechanisms of resistance associated with tamoxifen and palbociclib treatment, in order to propose better therapeutic strategies for patients to avoid or delay cancer relapse. To accomplish this, we exposed T47D and MCF-7 breast cancer cell lines to progressively increasing concentrations of tamoxifen or palbociclib over a period of 12 to 24 months, thus generating resistant variants. Firstly, we obtained the tamoxifen-resistant variants (T47D-TR and MCF-7-TR) and palbociclib-resistant variants (T47D-PR and MCF-7-PR). We next used the tamoxifen-resistant variants to generate the double resistant variants (T47D-TPR and MCF-7-TPR), as a means to mimic the treatment sequence used in the clinic. We evaluated the morphology of the resistant variants growing in 2D and found that they display increased cellular atypia compared to their parental lines. They also form irregular and disorganized structures growing in 3D on Geltrex and in suspension as mammospheres, which correlates with an aberrant or reduced E-cadherin expression.Furthermore, the tamoxifen-resistant variant T47D-TR shows increased mammosphere forming capacity, in concordance with higher expression of stemness markers. Moreover, both the tamoxifen-resistant variant MCF-7-TR and the palbociclib-resistant variant MCF-7-PR display enhanced migratory capacity. Regarding cell proliferation, the resistant cell lines show decreased growth rate compared to the parental cell line, both in vitro and in vivo. On the other hand, we found cell cycle proteins such as cyclin D1, cyclin E2, CDK4, CDK6 and CDK1 to be increased in the resistant variants in contrast with their reduced proliferation rates, as well as reduced Rb. Additionally, the resistant variants exhibit lower expression of ER and PR, overactivation of PI3K/AKT/mTOR pathway at the level of AKT or ribosomal protein S6, and higher expression of PKCα than the wild type. We next evaluated the response of these cell lines to different PI3K/AKT/mTOR inhibitors that act at different levels of the pathway. We found that rapamycin (mTOR inhibitor) was more effective in suppressing cell proliferation than alpelisib (PI3K inhibitor). Furthermore, rapamycin and palbociclib combination had a greater effect than each drug used separately in suppressing cell proliferation and tumor growth as well as in reducing cell cycle proteins and PI3K/AKT/mTOR activation. Finally, in order to validate these results, we used patient derived xenografts (PDX) obtained from ER+ breast cancer patients that harbored sensitive or resistant tumors to tamoxifen and palbociclib. We disaggregated the PDXs to obtain single cells which were next grown on Matrigel. We found that most cultures are sensitive to alpelisib (PI3K inhibitor), whereas the totality of PDXs are sensitive to everolimus (mTOR inhibitor), regardless of the presence of mutations or alterations in PI3K/AKT/mTOR pathway. The triple combination of palbociclib with everolimus and fulvestrant (ER inhibitor) is also more effective than each drug separately in reducing cell cycle proteins and PI3K/AKT/mTOR activation. Collectively, our results indicate that combined treatment of palbociclib with mTOR inhibitors is effective in the context of resistance to either tamoxifen or palbociclib by inhibiting cell proliferation and tumor growth as wells as regulating the activation of the cyclin D1/CDK4/6/Rb axis and PI3K/AKT/mTOR pathway. The proposed combination could therefore prevent pathway reactivation downstream mTOR, delaying the development of resistance. In conclusion, in this work we were able to generate and characterize experimental models of acquired resistance to tamoxifen and palbociclib, following the therapeutic sequence used in the clinic. These models are useful to study the mechanisms associated with resistance both in cell culture and in vivo, in order to suggest better therapeutic strategies for patients that relapse to these therapies, as well as contribute to the identification of new biomarkers of therapeutic response.Fil: Rodríguez, María Jimena. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Study of the mechanisms of resistance to tamoxifen and palbociclib in breast cancer
Get PDFEl cáncer de mama es la neoplasia maligna con la incidencia y mortalidad más alta en mujeres en el mundo. Aproximadamente el 70% de los tumores de mama expresan receptores de estrógenos (ER) y de progesterona (PR) y son por eso susceptibles al tratamiento con inhibidores hormonales como el tamoxifeno. Si bien la terapia hormonal es eficaz para el tratamiento de estos tumores, un alto porcentaje de los pacientes eventualmente recae a esta terapia. Recientemente se ha aprobado el uso de inhibidores de ciclo celular, como el palbociclib, para el tratamiento de los pacientes que recaen a la terapia endócrina o que presentan cáncer de mama metastásico. Sin embargo, de igual forma que con el tratamiento hormonal, estos pacientes eventualmente dejan de responder al tratamiento o incluso algunos no responden desde el comienzo. El objetivo general de este trabajo fue estudiar los mecanismos de resistencia asociados al tratamiento con tamoxifeno y con palbociclib, para poder proponer mejores estrategias terapéuticas para los pacientes que recaen a los mismos, así como también para evitar o retrasar el desarrollo de resistencia. Para esto, utilizamos las líneas de cáncer de mama humano T47D y MCF-7 para generar variantes resistentes a ambas drogas por presión selectiva con dichos agentes por 12 a 24 meses. Generamos primero las variantes resistentes a tamoxifeno (T47D-TR y MCF-7-TR) y a palbociclib (T47D-PR y MCF-7-PR), y luego a partir de las resistentes a tamoxifeno generamos las variantes doble resistentes a tamoxifeno y palbociclib (T47D-TPR y MCF-7-TPR), simulando la secuencia terapéutica utilizada en la clínica. Evaluamos la morfología de las líneas resistentes creciendo en 2D y observamos que presentan mayor atipia celular que las líneas parentales, forman estructuras irregulares y desorganizadas creciendo en 3D sobre Geltrex y en suspensión como mamosferas, lo cual se correlaciona con una expresión aberrante o reducida de E-cadherina. Además, encontramos que la variante resistente a tamoxifeno T47D-TR presenta un aumento en la capacidad de formar mamosferas, así como en la expresión de marcadores de stemness. A su vez, tanto la variante resistente a tamoxifeno MCF-7-TR como la resistente a palbociclib MCF-7-PR presentan una mayor capacidad migratoria que la línea wild type. Por otra parte, las variantes resistentes presentan una menor tasa de proliferación que la línea parental, tanto in vitro como in vivo. En contraposición a esto, encontramos aumento en la expresión de proteínas del ciclo celular como ciclina D1, ciclina E2, CDK4, CDK6 y CDK1 y disminución en Rb, dependiendo de la variante analizada. Encontramos también una menor expresión de ER y PR en las variantes resistentes, así como también un aumento en la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR a nivel de AKT o de la proteína ribosomal S6, y un aumento en PKCα. Evaluamos la sensibilidad in vitro de las variantes a inhibidores de PI3K/AKT/mTOR que actúan a distintos niveles de la vía, y encontramos un mayor efecto inhibitorio utilizando rapamicina (inhibidor de mTOR) que utilizando alpelisib (inhibidor de PI3Kα). Además, observamos que la combinación de rapamicina con palbociclib es más efectiva que los tratamientos, tanto in vitro como in vivo, no solo en reducir la proliferación y el crecimiento tumoral, sino también inhibiendo la expresión de proteínas del ciclo celular y la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Finalmente, para validar los resultados obtenidos en las líneas celulares, utilizamos xenotrasplantes derivados de pacientes (PDX) obtenidos a partir de biopsias de pacientes con tumores de mama ER+, sensibles y resistentes a tamoxifeno y palbociclib. Disgregamos los PDXs para obtener células individuales, las cuales fueron crecidas ex-vivo en 3D sobre Matrigel. Observamos que la mayoría de los cultivos son sensibles al tratamiento con alpelisib (inhibidor de PI3Kα). Por otra parte, la totalidad de los PDXs analizados son sensibles al tratamiento con everolimus (inhibidor de mTOR), independientemente de la presencia de mutaciones o alteraciones en genes de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Además, la triple combinación de palbociclib con everolimus y fulvestrant (inhibidor de ER) es más efectiva que las drogas individuales, no solo inhibiendo proteínas del ciclo celular sino también la activación de la vía de PI3K/AKT/mTOR. En conjunto, nuestros resultados indican que el tratamiento combinado de palbociclib con inhibidores de mTOR es efectivo tanto en un contexto de resistencia a tamoxifeno como a palbociclib, inhibiendo en paralelo tanto la proliferación celular y el crecimiento tumoral como la activación del eje ciclina D1/CDK4/6/Rb y de la vía de PI3K/AKT/mTOR. Esta combinación podría evitar una reactivación de esta vía downstream mTOR y así retrasar el desarrollo de resistencia. En conclusión, en este trabajo generamos y caracterizamos modelos experimentales de resistencia adquirida a tamoxifeno y a palbociclib, simulando la secuencia terapéutica utilizada en la clínica. Estos modelos son útiles para estudiar tanto en cultivo celular como in vivo los mecanismos asociados al desarrollo de resistencia, para de esta manera poder proponer mejores estrategias terapéuticas para el tratamiento de los tumores de mama que recaen a estos esquemas, así como también contribuir a la identificación de posibles biomarcadores de respuesta terapéutica.Breast cancer is the malignant neoplasm with the highest incidence and mortality in women worldwide. Approximately 70% of breast tumors express estrogen (ER) and progesterone (PR) receptors and are therefore sensitive to endocrine inhibitors, such as tamoxifen. Although endocrine therapy is effective for the treatment of these tumors, a significant amount of patients eventually relapse. Recently, the use of cell cycle inhibitors such as palbociclib has been approved for the treatment of patients that relapse to hormone therapy or have metastatic breast cancer. However, patients ultimately relapse to this treatment, or do not respond from the beginning. The aim of this work was to study the mechanisms of resistance associated with tamoxifen and palbociclib treatment, in order to propose better therapeutic strategies for patients to avoid or delay cancer relapse. To accomplish this, we exposed T47D and MCF-7 breast cancer cell lines to progressively increasing concentrations of tamoxifen or palbociclib over a period of 12 to 24 months, thus generating resistant variants. Firstly, we obtained the tamoxifen-resistant variants (T47D-TR and MCF-7-TR) and palbociclib-resistant variants (T47D-PR and MCF-7-PR). We next used the tamoxifen-resistant variants to generate the double resistant variants (T47D-TPR and MCF-7-TPR), as a means to mimic the treatment sequence used in the clinic. We evaluated the morphology of the resistant variants growing in 2D and found that they display increased cellular atypia compared to their parental lines. They also form irregular and disorganized structures growing in 3D on Geltrex and in suspension as mammospheres, which correlates with an aberrant or reduced E-cadherin expression.Furthermore, the tamoxifen-resistant variant T47D-TR shows increased mammosphere forming capacity, in concordance with higher expression of stemness markers. Moreover, both the tamoxifen-resistant variant MCF-7-TR and the palbociclib-resistant variant MCF-7-PR display enhanced migratory capacity. Regarding cell proliferation, the resistant cell lines show decreased growth rate compared to the parental cell line, both in vitro and in vivo. On the other hand, we found cell cycle proteins such as cyclin D1, cyclin E2, CDK4, CDK6 and CDK1 to be increased in the resistant variants in contrast with their reduced proliferation rates, as well as reduced Rb. Additionally, the resistant variants exhibit lower expression of ER and PR, overactivation of PI3K/AKT/mTOR pathway at the level of AKT or ribosomal protein S6, and higher expression of PKCα than the wild type. We next evaluated the response of these cell lines to different PI3K/AKT/mTOR inhibitors that act at different levels of the pathway. We found that rapamycin (mTOR inhibitor) was more effective in suppressing cell proliferation than alpelisib (PI3K inhibitor). Furthermore, rapamycin and palbociclib combination had a greater effect than each drug used separately in suppressing cell proliferation and tumor growth as well as in reducing cell cycle proteins and PI3K/AKT/mTOR activation. Finally, in order to validate these results, we used patient derived xenografts (PDX) obtained from ER+ breast cancer patients that harbored sensitive or resistant tumors to tamoxifen and palbociclib. We disaggregated the PDXs to obtain single cells which were next grown on Matrigel. We found that most cultures are sensitive to alpelisib (PI3K inhibitor), whereas the totality of PDXs are sensitive to everolimus (mTOR inhibitor), regardless of the presence of mutations or alterations in PI3K/AKT/mTOR pathway. The triple combination of palbociclib with everolimus and fulvestrant (ER inhibitor) is also more effective than each drug separately in reducing cell cycle proteins and PI3K/AKT/mTOR activation. Collectively, our results indicate that combined treatment of palbociclib with mTOR inhibitors is effective in the context of resistance to either tamoxifen or palbociclib by inhibiting cell proliferation and tumor growth as wells as regulating the activation of the cyclin D1/CDK4/6/Rb axis and PI3K/AKT/mTOR pathway. The proposed combination could therefore prevent pathway reactivation downstream mTOR, delaying the development of resistance. In conclusion, in this work we were able to generate and characterize experimental models of acquired resistance to tamoxifen and palbociclib, following the therapeutic sequence used in the clinic. These models are useful to study the mechanisms associated with resistance both in cell culture and in vivo, in order to suggest better therapeutic strategies for patients that relapse to these therapies, as well as contribute to the identification of new biomarkers of therapeutic response.Fil: Rodríguez, María Jimena. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Role of PI3K/AKT/mTOR pathway in breast cancer tumor progression
Get PDFAntecedentes: El cáncer de mama es la neoplasia maligna más común en mujeres y unade las primeras causas de muerte por cáncer en el mundo. A pesar de los avances en eldiagnóstico y en el tratamiento para esta enfermedad, un alto porcentaje de los tumoresprogresan y metastatizan en órganos distantes. PI3K/AKT/mTOR es la vía mutada conmayor frecuencia en tumores sólidos; alrededor del 70% de los tumores de mamapresentan alguna mutación en esta vía, lo cual se asocia con un peor pronóstico yresistencia a la terapia endócrina, contra HER-2, radio y quimioterapia. Existen tresisoformas para Akt: AKT1, AKT2 y AKT3, con discrepancias sobre sus funcionesespecíficas. Objetivo: El objetivo de este trabajo fue estudiar el rol diferencial de AKT1y AKT2 en los procesos de proliferación, migración e invasión celular a lo largo de laprogresión tumoral en cáncer de mama. Antecedentes: En trabajos previos dellaboratorio utilizando un modelo de carcinomas mamarios murinos habíamosdemostrado que la sobreactivación de la isoforma AKT1 era capaz de inducir elcrecimiento tumoral hormono-independiente. Los tumores generados resultaron ser másdiferenciados que los tumores de los que derivaron, con formación de estructurasductales y mayor expresión de citoqueratina 8 y laminina I, y menor expresión decitoqueratina 14. Metodología: Para extrapolar los resultados obtenidos en otrosmodelos experimentales, utilizamos tres líneas celulares humanas de cáncer de mama (IBH-7, IBH-6 y T47D), analizamos el efecto de sobreactivar o silenciar específicamentecada isoforma sobre el fenotipo tumoral en cultivo y en xenotransplantes. Resultados: En las líneas celulares IBH-7 e IBH-6 demostramos que AKT1 induce el crecimiento detumores mamarios, a través de la activación de la proteína ribosomal S6 y el aumento enla expresión de ciclina D1. Además, la sobreactivación de AKT1 induce el crecimientotumoral hormono-independiente a través de la fosforilación de receptores hormonalesen ausencia de agergado exógeno de hormona. En consecuencia, la sobreactivación de AKT1 fue capaz de inducir resistencia al tratamiento con ICI182780 (Fulvestrant), unantagonista del receptor de estrógenos. Coincidente con los antecedentes mencionados,el fenotipo tumoral obtenido con la sobreactivación de AKT1 es de tipo glandulardiferenciado, con aumento en la expresión de las proteínas luminales E-cadherina ylaminina-I. Sorprendentemente, el silenciamiento de AKT1 endógeno disminuyó laproliferación e incrementó la migración e invasión celular in vitro a través de la induccióndel eje β1-integrina/FAK/MMP9, e in vivo, siendo los tumores resultantes altamenteinfiltrantes. Por otro lado, la sobreactivación de AKT2 también indujo tumores concaracterísticas infiltrantes pero sin modificar el crecimiento tumoral. Por el contrario, elsilenciamiento de AKT2 endógeno disminuyó la motilidad celular en cultivo, regulandoproteínas del citoesqueleto como F-actina y vimentina. El grado de invasión de losxenotransplantes IBH-6 y T47D con distintos niveles de AKT1 y AKT2 se asoció con lapérdida en la expresión de E-cadherina y un aumento en la expresión de vimentina,marcadores de progresión tumoral. Encontramos además que el silenciamiento de AKT1induce un aumento en la expresión de AKT2 endógeno, sugiriendo una regulación entreisoformas. Por último, en un ensayo preliminar encontramos que el tratamiento coninhibidores de PI3K/AKT/mTOR si bien disminuye el crecimiento tumoral, aumenta laincidencia de metástasis pulmonares. Este resultado puede ser relevante en el diseño deterapias con inhibidores específicos de dicha vía. En conjunto, nuestros resultadosmuestran funciones diferentes, y en algunos casos opuestas, para AKT1 y AKT2 en laprogresión del cáncer de mama. Demostramos que AKT1 tiene un rol relevante en elcrecimiento tumoral, regulando proteínas involucradas en la sobrevida y proliferacióncelular y activando en forma ligando-independiente los receptores hormonales, estoúltimo conlleva a la adquisición de resistencia a la terapia endócrina. En un estadiotumoral más avanzado, tanto la disminución de AKT1 a través de la activación del ejeβ1-integrina/FAK/MMP9, como el aumento de AKT2 a través de la regulación delcitoesqueleto de actina, llevarían a una mayor agresividad tumoral dada por un aumentode la invasión celular. Conclusión: En base a nuestros resultados, proponemos que tantola pérdida de AKT1 como la ganancia de AKT2 podrían ser consideradas comobiomarcadores para clasificar a los tumores mamarios con características más agresivas. La relevancia de nuestro trabajo radica en el análisis exhaustivo de la función de la vía PI3K/AKT/mTOR, diferenciando el rol particular de AKT1 y AKT2 y de sus proteínastarget downstream, que a futuro podría aplicarse en el diseño de terapias dirigidas a cada tipoy estadio tumoral para lograr un mayor efecto terapéutico.Background: Breast cancer is the most frequently diagnosed cancer and the leadingcause of cancer death among females worldwide. Despite the early diagnosis and theimprovement in the treatments, a considerable amount of tumors progress andmetastasize. PI3K/AKT/mTOR is the most frequently mutated pathway in solidtumors; approximately 70% of breast tumors display an activating mutation in onecomponent of the pathway, and it is associated with a poor outcome and resistance toconventional therapy. There are three AKT isoforms: AKT1, AKT2 and AKT3, withdifferent specific functions. Specific aims: The main aim of this thesis was to study thespecific role of AKT1 and AKT2 during proliferation, cell migration and invasionthrough breast cancer progression. Background: We have previously demonstrated that AKT1 overactivation was sufficient to induce hormone-independent breast tumorgrowth. The resultant tumors were differentiated, with high levels of cytokeratin 8 andlaminin-I and low levels of cytokeratin 14 expression. Methodology: In this study, weused three human breast cancer cell lines, IBH-7, IBH-6 and T47D and we analyzed theeffect of up- or downregulation of AKT1 or AKT2 on tumor phenotype, in culture andin xenografts. Results: We demonstrated that AKT1 induced tumor growth throughribosomal S6 protein and cyclin D1 increase. Moreover, AKT1 upregulation lead tohormone-receptors activation, even in the absence of exogenous hormone supply. Consequently, AKT1 overexpression induced resistance to the estrogen receptordownregulator, ICI182780 (Fulvestrant). Moreover, AKT1 overexpressing tumorsdisplayed glandular differentiation, with high levels of E-cadherin and laminin-I. AKT1silencing decreased cell proliferation and, surprisingly, increased cell migration andinvasion in cell culture, through the β1-integrin/FAK/MMP9 axe. Besides, silenced AKT1 tumors were highly invasive of the adjacent adipose and muscle tissue, andinduced lung metastasis. On the other hand, AKT2 overactivation also induced moreinvasive tumors and lung metastasis, with no changes in tumor growth although. On theopposite, AKT2 downregulation decreased motility in cell culture, by regulatingcitoskeleton proteins as F-actin and vimentin. We also found that AKT1 silencinginduced an upregulation in AKT2 expression, suggesting a cross regulation between thetwo isoforms. Finally, in a preliminary study we found that PI3K/AKT/mTORinhibitors are capable of decreasing breast tumor size but of inducing more aggressivetumors and lung metastasis. This effect could have great implications in the managementof new targeted therapies against the pathway. Altogether, our results clearly showdifferent, and in some cases opposite roles for AKT1 and AKT2 isoforms in breastcancer progression. We demonstrated that AKT1 has a relevant role in tumor growth,through the regulation of proteins involved in cell survival and proliferation, and troughthe activation of hormone receptors, ultimately leading to endocrine resistance. On theother hand, the downregulation of AKT1, as well as the upregulation of AKT2, canincrease cell invasion and tumor aggressiveness. Conclusion: We propose that AKT1loss and/or AKT2 gain should be considered as biomarkers to better classify invasivemammary tumors. The relevance of this work is the deep analyses of PI3K/AKT/mTOR pathway, differentiating AKT1 and AKT2 functions, and itsdownstream proteins in breast cancer progression, which could be useful in the future todesign targeted therapies for each tumor type and stage.Fil: Riggio, Marina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
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