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    Caractérisation d'ARNs non-codants liés à la voie Nrf2 chez l'écureuil hibernant Ictidomys tridecemlineatus

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    "L'hibernation est une stratégie utilisée par certains mammifères pour confronter les périodes hivernales. Plusieurs changements physiologiques ont été caractérisés ces dernières années chez les mammifères hibernants. En revanche, les bases moléculaires sous-jacentes à l'adaptation au froid chez ces animaux sont plutôt méconnues. Les ARNs non-codants, incluant les microARNs (miARNs) et les longs ARNs non-codants (IncARNs) sont des acides nucléiques notamment capables d'influencer l'expression protéique de multiples transcrits. Bien que les cibles moléculaires de ces ARNs non-codants soient nombreuses, leur rôle durant l'hibernation reste à caractériser. Nous avons posé l'hypothèse que certains ARNs non-codants sont différentiellement exprimés durant la période d'hibernation et qu'ils peuvent influencer l'expression de transcrits impliqués dans l'axe de signalisation du facteur de transcription Nrf2 qui, dans plusieurs modèles, démontre un rôle dans la réponse au stress oxydatif. En utilisant l'écureuil hibernant Ictidomys tridecemlineatus comme modèle d'étude, les niveaux d'expression de différents miARNs, IncARNs et transcrits d'intérêt ont été évalués par qRT-PCR dans le coeur de I. tridecemlineatus. Le miARN miR-200a et les transcrits de Nrf2, p21 et RBX1 ont tous démontré une dérégulation dans les tissus cardiaques torpides suportant la modulation potentielle de l'axe Nrf2 par certaines ARNs non-codants à basses températures. Des essais d'activité effectués sur l'enzyme DICER dans trois tissus contrôles et hibernants de I. tridecemlineatus supportent également une modulation potentielle des miARNs en hibernation. En somme, ces résultats présentent, pour la permière fois, une étude portant sur les ARNs non-codants et l'axe Nrf2 en hibernation et positionnent ces molécules comme des acteurs potentiels régulant ce processus. Mots clés: Ictidomys tridecemlineatus, hibernation, ARNs non-codants, microARNs."--Sommaire.statement of responsibility: Jacques Joseh Frigault, B.Sc.Thèse présentée à la Faculté des études supérieures et de la recherche en vue de l'obtention de la maîtrise ès science en biochimie.thesis: M. Sc. (biochimie) Université de Moncton 2018bibliography: Comprend des références bibliographiques : feuilles 66-85.language: Thèse rédigée sous forme d'article, texte en français et en anglais

    Caractérisation de microARNs liés à l'adaptation au froid et à la réponse à l'imidaclopride chez le doryphore de la pomme de terre Leptinotarsa decemlineata

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    "Le doryphore de la pomme de terre Leptinotarsa decemlineata est un insecte qu menace les champs de pommes de terre des agriculteurs. Ceux-ci jouent notamment un rôle important dans la défoliation des plants de pommes de terre et s'adaptent aisément à plusieurs insecticides supportant ainsi la nécessité de développer des approches novatrices pour contrôler leur activité. L'identification des bases moléculaires sous-jacentes à divers mécanismes physiologiques essentiels chez les doryphores est nécessaire pour en arriver à de telles approches. Il est intéressant de noter que les doryphores adultes doivent confronter annuellement les périodes froides de l'hiver via multiples mécanismes physiologiques, métaboliques et moléculaires. Les microARNs (MiARNs), des petits acides ribonucléiques, ont démontré des variations d'expression dans multiples modèles d'adaptation au froid laissant croire qu'ils sont impliqués dans ce processus. Par contre, les données sont inexistantes concernant les MiARNs sous-jacents à l'adaptation aux basses températures et à la tolérance aux insecticides chez le doryphore de la pomme de terre. Ainsi, nous posons l'hypothèse que certains MiARNs sont différentiellement exprimés à basses températures de même qu'en réponse à certains insecticides chez L. decemlineata et que leur modulation en laboratoire peut affecter la tolérance au froid chez ces insectes. Dans le présent projet, l'utilisation de séquençage à haut débit et de qRT-PCR a été préconisée pour révéler des signatures de MiARNs liées à l'adaptation au froid, incluant miR-9a-3p, miR-210-3p, miR-276-5p et miR-277-3p, et à la réponse à l'insecticide imidaclopride tels que miR-100-5p, miR-282-5p et miR-989-3p. Une étude fonctionnelle des cibles potentielles de ces miARNs a démontré plusieurs processus d'importance associés à ceux-ci comme la transcription et l'homéostasie du glucose. Les résultats accumulés lors de ce projet identifient donc notamment une signature de miARNs modulés par le froid chez le doryphore de la pomme de terre et ouvrent la porte sur l'exploration d'une approche ciblant la cascade de synthèse d'ARNs non-codants comme stratégie de contrôle de cet insecte ravageur. Mots-clés: Adaptation au froid, hypométabolisme, Leptinotarsa decemlineata, répression traductionnelle, ARNs non-codants, microARNs."--Sommaire.statement of responsibility: Mathieu Daniel Morin, B.Sc."Thèse présentée à la Faculté des études supérieures et de la recherche en vue de l'obtention de la maîtrise ès science en biochimie".thesis: M. Sc. (biochimie) Université de Moncton, 2017bibliography: Comprend des références bibliographiques : feuilles 89-104.additional physical form: Également disponible en version électronique. Les pages contenant des informations personnelles ne sont pas reproduites.language: Thèse rédigée sous forme d'article scientifique, comprend du texte en français et en anglai

    Élucidation du rôle de trib 1 dans les cas de glioblastome multiforme

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    "Le gLioblastome multiforme (GBM) est la tumeur cérébrale la plus fréquente et agressive. Les patients atteints de GBMs étant associés avec une espérance de survie de 12 à 14 mois suivant le diagnostic, l'amélioration des approches thérapeutiques actuelles pour ce type de tumeur est essentielle. Suite à des résultats générés par biopuce visant à identifier des kinases différentiellement exprimées dans des échantillons de tumeurs cérébrales primaires, une élévation des transcrits de tribbles-1 (trib 1) a été observée. Les protéines Tribbles sont des régulateurs clés de multiples voies de signalisation et leur dérégulation est liée à la perte de l'homéostasie cellulaire et à la carcinogenèse. Une biopuce tissulaire a ensuite révélée la surexpression de Trib 1 chez des échantillons de patients GBMs versus des échantillons de cerveaux normaux utilisés comme contrôles indiquant une potentielle pertinence clinique pour cette observation. Les niveaux de transcrits trb 1 ont donc subséquemment été évalués dans un panel de lignées cellulaires GBMs par RT-PCR et une expression ubiquitaire de ce transcrit a été observée. Des immunobuvardages de type Western ont également été effectués sur ce panel et ont révélé que la majorité des lignées cellulaires exprime fortement la protéine Trib 1 lorsque comparé à l'expression mesurée dans une lignée cellulaire d'astrocytes normaux. La lignée LN405 s'est démarquée par sa surexpression de Trib 1 et fut ainsi sélectionnée comme modèle cellulaire pour les expériences subséquentes. L'expression de Trib 1 a ensuite été modifiée à la baisse par siARN dans les LN405 et l'impact de cette réduction sur divers phénotypes cancéreux a été mesuré. Cette expérience a notamment permis d'observer une variation des niveaux phosphorylés d'ERK de même que des niveaux du facteur de transcription supresseur de tumeur CEBPα. L'objectif de cette recherche étant d'identifier les protéines qui sont les plus suceptibles à promouvoir la gliomagenèse et le développement des GBMs, ces résultats fournissent des pistes intéressantes dans le processus d'élaboration d'un schéma thérapeutique amélioré pour le traitement de cette tumeur." --Sommaire.statement of responsibility: André Odjélé, B.Sc.En annexe texte intégral de : miRNAs as important drivers of glioblastomas: a no-brainer? par Odjélé, André; Charest, Dhany; Morin, Jr, Pier dans Cancer biomarkers : section A of Disease markers, 2012.Thèse présentée à la Faculté des études supérieures et de la recherche de l'Université de Moncton pour l'obtention du grade de maîtrise ès sciences en biochimie.thesis: M. Sc. (biochimie) Université de Moncton 2014.bibliography: Comprend des références bibliographiques: feuilles 65-83.additional physical form: Également disponible en version électronique. Les pages contenant des informations personnelles ne sont pas reproduites.language: L'article en annexe est rédigé en anglais

    Caractérisation et modulation de la résistance au témozolomide chez le glioblastome multiforme

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    "Le glioblastome multiforme (GBM) est la forme de tumeur cérébrale la plus commune et l'approche thérapeutique à ce jour implique une combinaison de chirurgie, radiothérapie et de la chimiothérapie avec le témozolomide (TMZ). De nombreux mécanismes contribuant à une résistance innée ou acquise à cet agent thérapeutique ont été identifiés et peuvent mener à un échec du traitement. Cette étude entreprend une approche métabolomique pour caractériser des profils métaboliques observés chez des cellules GMB sensibles ou résistantes au TMZ. Cette approche fut aussi utilisée pour explorer les changements métaboliques observés suite au traitement avec le TMZ et lomeguatrib, un inhibiteur de la MGMT avec un potentiel sensibilisateur au TMZ. Des métabolites ayant déjà été identifiés comme ayant des rôles dans la résistance à la chimiothérapie incluant le glucose, la citrate et l'isocitrate ont démontré des niveaux élevés chez les cellules résistantes au TMZ. De plus, une signature de métabolites comprenant l'alanine, la choline, la créatine et la choline phosphorylée a été identifiée comme élevée dans la lignée U373S suite à tous les traitements étudiés. Ces résultats présentent les profils métaboliques associés à la réponse au TMZ dans des modèles de lignées cellulaires GBM et proposent une suite intéressante qui pourrait influencer le développement d'outils thérapeutiques ou diagnostiques pouvant avoir un impact sur la réponse au TMZ ches les GBMs. Des analogues structuraux du lomeguatrib ont aussi été synthétisés afin de mieux comprendre le mécanisme d'inhibition et les paramètres structuraux nécessaires à une bonne inhibition de cette protéine. Malgré la variabilité de les GI₅₀ de ces molécules, trois d'entre elles semblent avoir un impact lors des traitements combinatoires avec le TMZ. Un groupement aromatique relié en position O6 par un groupement CH₂ et un groupement donneur semble être la meilleure combinaison pour l'inhibition de cette protéine et une viabilité cellulaire réduite."--Sommaire.statement of responsibility: Patrick-Denis St-Coeur, B.Sc.Thèse présentée à la Faculté des études supérieures et de la recherche en vue de l'obtentin de la maîtrise ès sciences en biochimie.thesis: B. Sc. (biochimie) Université de Moncton 2015bibliography: Comprend des références bibliographiques: feuilles 78-108.additional physical form: Également disponible en version électronique. Les pages contenant des informations personnelles ne sont pas reproduites.language: Thèse rédigée sous forme d'article, comprend du texte en français et en anglais

    Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis

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    The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed

    Variations on the Author

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    “Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship

    Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis

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    We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis

    Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts

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    We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more sophisticated methods

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