1,721,261 research outputs found
Data associated with "Food and habitat supplementation promotes predatory mites and enhances pest control" by Etienne L., Bresch C., van Oudenhove L. and Mailleret L. To appear in "Biological Control"
No full textThis dataset gathers the raw results of four experiments performed on the predatory mite Neoseiulus cucumeris, with different kinds of supplementations, in laboratory (two experiments, BAF and BSP1) and greenhouse (two experiments, BSP2 and Biocontrol) settings. The second greenhouse experiment involves the pest mite Tetranychus urticae in addition to the predatory mite
Python code for the article "The proportion of resistant hosts in mixtures should be biased towards the resistance with the lowest breaking cost" by Clin et al. 2023 submitted to PLOS Comp Biol
No full textThese files are code for a Python Streamlit application to reproduce the simulations (disease prevalence as a function of cultivar mixture composition) presented in the referenced article. Parameters can also be varied by the user. Different contexts are presented (no plant priming, plant priming)
Processus d’invasions biologiques : de l’approche descriptive à l’approche prédictive / Biological invasion processes : evaluation and prediction
No full textFacon Benoit, Mailleret Ludovic, Renault David, Roques Lionel. Processus d’invasions biologiques : de l’approche descriptive à l’approche prédictive / Biological invasion processes : evaluation and prediction. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), supplément n°12, 2015. Les invasions biologiques et leur gestion au carrefour des sciences naturelles et des sciences humaines et sociales. Colloque organisé à Rennes (Université de Rennes 1) du 20 au 22 octobre 2014. pp. 110-113
Shared predation: positive effects of predator distraction
No full textSimple rules based on population equilibria can characterize indirect interactions in threespecies
systems but fail to predict them when considering behavioral mechanisms. In this
paper, we revisit the effects of shared predation, i.e. the situation in which two prey are
consumed by a common predator. Such predation usually induces negative indirect interactions
between prey, or apparent competition, through an increase of predator density
and thus of predation pressure. Two mechanisms can however weaken apparent competition
and lead to equivocal signs of indirect interactions. On the one hand, predator
distraction, which stems from the difficulty to efficiently forage for different prey at the
same moment in time and diminishes the number of prey captured per predator. On
the other hand, predator negative density dependence limits predator growth. To get
further insights into simple rules describing indirect interactions brought about by shared
predation, we studied two classes of one-predator–two-prey models exhibiting these two
mechanisms. We found robust simple rules derived from predator equilibria which state
that at least one prey is favored by the presence of the other when the predators partition
their foraging effort between them. These rules thus characterize a surprising wide range of indirect effects including apparent predation, apparent commensalism and apparent mutualism. They also highlight different situations in which larger predator populations do not entail smaller prey populations and in which neither prey species can be negatively affected by the other
Introduction strategies of organisms in a spatially structured environment
No full textL’établissement correspond à la formation d’une population pérenne dans l’aire d’introduction. Les populations introduites ayant des effectifs faibles, elles sont sujettes à plusieurs mécanismes augmentant leurs risques d’extinction. La structure spatiale de l’aire d’introduction, une mosaïque hétérogène de patchs d’habitat appelée « paysage », peut affecter la persistance de la population introduite. L’objectif de cette thèse est d’étudier l’interaction entre cette structure spatiale et ces mécanismes, ainsi que leur impact sur l’établissement. Les recherches entreprises ont été conduites en utilisant des modèles stochastiques afin de simuler des invasions et faire émerger des prédictions, et en testant expérimentalement ces prédictions grâce à des introductions artificielles de Trichogramma chilonis en microcosmes. Ces travaux ont permis d’identifier un effet fort de la connectivité du site d’introduction, qui peut diminuer les chances d’établissement au niveau local en favorisant l’émigration depuis le site d’introduction, et augmenter les chances d’établissement à un niveau plus large en permettant la colonisation d’autres patchs dans l’aire d’introduction. Au niveau du paysage, nous avons identifié l’impact des hubs, des patchs concentrant les flux de dispersion, qui accroissent fortement la vitesse de colonisation mais diminuent le taux d’établissement. L’établissement était également favorisé par l’agrégation de la ressource et la colonisation par sa dissémination à travers le paysage. La nature stochastique des dynamiques de colonisation est telle qu’il est nécessaire de les prendre en compte pour étudier l’établissement.Establishment is an important stage of biological invasions, which corresponds to the formation of a persistent population in the introduction area. It is not trivial, as introduced populations are often small, and subject to various specific mechanisms, which increase extinction risks. The spatial structure of the introduction area, which is usually a heterogeneous mosaic of habitat patches called a “landscape”, can interact with those mechanisms and impact the introduced population persistence. This thesis objective is to study the interaction between this spatial structure and those mechanisms, as well as their impact on establishment. On the one hand, we used stochastic models to simulate invasions and formulate predictions. On the other hand, we tested these predictions by performing artificial introductions of Trichogramma chilonis in laboratory microcosms. We were able to identify the impact of the introduction site connectivity, which could decrease establishment probabilities at a local level by increasing the emigration rate from the introduction site, and increase establishment at the landscape level by increasing the colonisation rate of other patches in the introduction area. At the landscape level, we identified the impact of hubs, i.e. patches concentrating dispersal fluxes. They strongly increased colonisation speed, but also decreased establishment. The clustering of resources increased establishment, while its scattering increased colonization. Our results show that introduced population dynamics are highly sensitive to their size. The stochastic nature of colonization dynamics is also necessary to study establishment
Indirect interactions between prey : modeling and influence of the behavior of a common predator
No full textCette thèse a pour objet la modélisation de systèmes multi-proies–prédateurs. Elle s’intéresse particulièrement à l’influence du comportement d’un prédateur sur les interactions indirectes entre ses proies, i.e. l’effet de l’ajout d’une proie sur la densité des autres. La théorie classique prédit l’occurrence d’effets indirects négatifs entre les proies, ou compétition apparente, résultant de l’interaction avec un prédateur commun ; des résultats plus récents identifient certains mécanismes à même d’atténuer ces effets négatifs. Nos travaux revisitent les hypothèses autour de ces mécanismes dans des systèmes composés de deux proies et de leur prédateur commun. Après avoir fixé le cadre écologique en rappelant les principaux types d’interactions directes et indirectes, nous introduisons les modèles proies-prédateurs classiques. Les travaux se concentrent ensuite sur une famille de modèles présentant de la densité-dépendance négative chez les prédateurs couplés à différentes modélisations du comportement des prédateurs lorsqu’ils sont confrontés à plusieurs types de proies. Nous montrons notamment que les interactions entre ces mécanismes peuvent inverser la compétition apparente et, contre intuitivement, accroître la densité des proies par l’intermédiaire d’un prédateur commun. Nos résultats trouvent pour partie application en lutte biologique, où il est courant de chercher à favoriser les auxiliaires en aménageant leur environnement (apport de nourriture alternative, refuge, ...). Ils suggèrent que de telles pratiques peuvent se révéler contre-productives, le contrôle des ravageurs pouvant être affaibli du fait d’une distraction de leurs prédateurs.This thesis deals with multi-prey–predators modeling. It is particularly focused on the influence of the behavior of a predator on indirect interactions between its prey, i.e, the effect of the addition of a prey on the other prey. Classical theory predicts the occurrence of negative indirect effects between prey, or apparent competition, resulting from the interaction with a common predator. More recent results identify mechanisms that mitigate these negative effects. Our work revisits the assumptions about these mechanisms in systems composed of two prey and their common predator. After setting the ecological framework by recalling the main types of direct and indirect interactions, we introduce classical predator-prey models. The work then focuses on a family of models with predator negative density-dependence coupled with different models of predator behavior when faced with different types of prey. We show that the interactions between these mechanisms can reverse apparent competition and counter-intuitively, increase prey density through their common predator. Our results are relevant to biological control programs, where a common practice aims at fostering biological control agents by providing them with alternative food or shelters. Our theory suggests that such practices may be counter-productive, pest control being disrupted by a predator distraction effect
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Modélisation et contrôle en dynamiques de populations. Applications en protection des plantes.
No full textMes recherches mobilisent des concepts et outils de la modélisation, des biomathématiques et de l'écologie théorique pour étudier des questions relevant de la santé des plantes et de la protection écologique des cultures. J'utilise en particulier des formalismes à base de systèmes dynamiques, le cas échéant hybrides, pour modéliser, comprendre et contrôler les dynamiques de populations qui interagissent entre elles. Une thématique importante de mes recherches concerne l'optimisation des introductions d'ennemis naturels dans le cadre de la lutte biologique par augmentation contre les ravageurs des cultures. Différentes questions sont approchées, comme l'influence de la densité dépendance dans les dynamiques des ennemis naturels ou celle de la structuration spatiale de l'habitat. Ce thème m'a conduit à m'intéresser à des questions relevant de la biologie de l'introduction, en contribuant à la mise en place d'une approche couplée modélisation - expérimentation en mésocosmes pour étudier l'influence de la structure spatiale de l'environnement. Un autre pan de mes recherches s'intéresse aux épidémies des pathogènes de plantes, notamment en environnement saisonnier, dans un double objectif de compréhension et de contrôle de leurs dynamiques et de leur évolution. Finalement, je rapporte plusieurs résultats plus théoriques sur les systèmes consommateurs - ressources. Quelques perspectives ainsi qu'un bref point de vue sur la modélisation concluent ce manuscrit
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