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Caractérisation préliminaire d'un isolat québécois (QST) de l'herpèsvirus bovin type 4 (BHV-4) à l'aide des anticorps monoclonaux
Full text linkMémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal
Identification et caractérisation moléculaire des protéines structurales majeures du virus du syndrome reproducteur et respiratoire du porc (SRRP)
Full text linkLe virus du syndrome reproducteur et respiratoire du porc (SRRP), a été
récemment reconnu comme étant l'agent étiologique primaire d'une entité
pathologique qui se manifeste par des troubles respiratoires chez les animaux de
tous les âges et par des troubles de la reproduction chez les truies. Ces affections
confèrent à cette maladie une importance économique hautement considérable, et
ce à cause de la forte mortalité des porcelets, la baisse de croissance des animaux
atteints et la chute des paramètres d'élevage. Le virus qui en est responsable
présente une morphologie togaviriforme, alors que l'organisation et le mode de
réplication de son génome (molécule d'ARN de polarité positive d'environ 15 kb)
rappellent ceux des coronavirus. Sur la base de ses caractéristiques morphologiques
et moléculaires, le virus du SRRP a été provisoirement classé dans le genre
Artérivirus de la famille Togaviridae, avec notamment le virus de l'artérite équine
(EAV), le virus de l'élévation de la déshydrogénase lactique de la souris (LDV) et le
virus de la fièvre hémorragique simienne (SHFV). Le genre Artérivirus est
actuellement beaucoup plus affilié aux membres de la famille Coronaviridae, et sera
probablement considéré sous peu, comme représentant une famille virale à part
entière. Les travaux entrepris dans le cadre de la réalisation de ce programme de
recherche ont porté sur certains aspects moléculaires qui faisaient défaut dans les
connaissances sur le virus du SRRP. Ils visaient tout d'abord à identifier les
protéines structurales du virus et à assigner leur région(s) génomique(s) codante(s).
L'analyse moléculaire de ces protéines virales en ce qui a trait à leur synthèse, leurs modifications post-traductionnelles, ainsi que leur incorporation finale dans les
particules virales, a constitué le but ultime du présent travail de recherche. Par marquage radioactif et radioimmunoprécipitation, il a été possible
d'identifier trois protéines structurales majeures désignées N, M, et E, ayant
respectivement une masse moléculaire de 15, 19, et 24.5 kDa. Parmi les trois
protéines, seule la E est glycosylée. Les expériences préliminaires de traduction in
vitro ont démontré que ces protéines pourraient être codées respectivement par les
cadres de lecture ouverts (ORFs) 7, 6, et 5 situés à l'extrémité 3' de l'ARN
génomique. L'assignement des protéines N, M, et E aux ORFs 7, 6, et 5, a été
confirmé en utilisant des antisérums monospécifiques dirigés contre le produit
d'expression dans E. coli de chacun de ces gènes. Les résultats d'analyses de séquençage d'un isolat de référence du Québec
ont révélé des variations génomiques importantes au niveau de l'extrémité
génomique 3' terminale, comparativement à la souche prototype européenne. Les
variations génomiques observées suggèrent l'existence d'au moins deux génotypes
du virus du SRRP. Ces variations génomiques affectent principalement les gènes
codant la protéine glycosylée de l'enveloppe (0RF5) et la nucléocapside (0RF7),
ce qui suggère que ces deux gènes sont à la base de l'émergence des variants
antigéniques. Des variations génomiques importantes ont aussi été notées au niveau de la
région 3' non codante du génome viral. Hormis les mutations nucléotidiques, une
insertion de 22 nucléotides fait que la région 3' non codante de la souche IAFexp91
est la plus longue de tous les membres du genre Artévirus séquencés jusqu'à maintenant. Par RT-PCR, on a pu constater que cette insertion de nucléotides
pourrait constituer un marqueur génétique des souches nord-américaines du virus
du SRRP. Cette caractéristique a été mise à profit afin de distinguer les souches
nord-américaines des souches européennes par la technique RT-PCR. En réalisant un marquage bref des cellules infectées suivi de différentes
périodes de chasse, il a été possible d'analyser l'acheminement des protéines
structurales majeures du virus à partir du lieu de leur synthèse jusqu'à l'étape finale
du bourgeonnement viral. Ainsi, il a été démontré que la glycoprotéine de
l'enveloppe (E) du virus est retenue pour une durée anormalement longue au
niveau du réticulum endoplasmique. Cette protéine acquiert sa conformation finale
au bout de 60 min suivant sa synthèse, moment où le virus semble être libéré de la
cellule. L'analyse des protéines virales en conditions non réductrices a montré que
les deux protéines de l'enveloppe (E et M) se lient très rapidement après leur
synthèse par le biais de ponts disulfures donnant naissance à des hétérodimères
(complexes M-E). C'est d'ailleurs sous cette forme que ces deux protéines sont
incorporées dans le virion. L'association de ces deux protéines sous forme
d'hétérodimères semble précéder le processus de glycosylation qui porte sur la
protéine E. Au cours de cette étude, une interaction spécifique entre la protéine de la
nucléocapside (N) et les deux protéines de l'enveloppe a aussi été mise en évidence.
Les résultats obtenus suggèrent que l'association entre ces protéines a lieu très
rapidement après leur synthèse, débutant vraisemblablement par une interaction
entre la protéine N et M, avant que cette dernière soit recrutée dans les complexes
M-E. Considérés de façon globale, les résultats de la présente thèse aboutissent à
des implications dont il faut tenir compte, non seulement dans l'aspect
immunobiologique de l'infection virale, mais aussi dans le cadre des études qui
seront amorcées afin de mieux disséquer le cycle viral
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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