5,022 research outputs found
Leishmania donovani (HU3) genome: all possible ORFs
No full textThis dataset contains coordinates for all possible ORFs (longer than 20 triplets in length), and the corresponding amino acids sequences, derived from the reading of the Leishmania donovani (HU3 strain) genome in all six frames. Hence, two files are provided:(i) LdHU3_All-ORFabove20Aas (GFF file/text file), which contains genomic coordinates of the ORFs; (ii) LdHU3_TodosPeptidos+20, which contains the polypeptide sequences. In both files, the entries are named with the chromosome number and the coordinates of the ORF. For instance, the first entry is LdHU3.01:442..603:r (this means that the ORF/amino acid sequence was read in the minus strand (:r)), between positions 442 and 603 in chromosome 1.The genome sequence used for creating this dataset may be accessed at: https://www.wikidata.org/wiki/ Q97940468Also, a dataset with the L. donovani genome sequence (fasta file) may be downloaded through the following Mendeley data entry: Requena, Jose M. (2023), “LdHU3_Genome sequence”, Mendeley Data, V2, doi: 10.17632/b82fm2w2h9.2The assembly of this genome is described in the article: Camacho, E., González-de la Fuente, S., Rastrojo, A., Peiró-Pastor, R., Solana, J.C., Tabera, L., Gamarro, F., Carrasco-Ramiro, F., Requena, J.M., and Aguado, B. (2019). Complete assembly of the Leishmania donovani (HU3 strain) genome and transcriptome annotation. Sci. Rep. 9, 6127. (PMID: 30992521). https://rdcu.be/bxaE
LdHU3_transcriptome
No full textThis dataset contains the location of the transcripts annotated in the Leishmania donovani (HU3 strain) genome. For additional information, see: Camacho, E., Gonzalez-de la Fuente, S., Rastrojo, A., Peiro-Pastor, R., Solana, J.C., Tabera, L., Gamarro, F., Carrasco-Ramiro, F., Requena, J.M., and Aguado, B. (2019). Complete assembly of the Leishmania donovani (HU3 strain) genome and transcriptome annotation. Sci Rep 9, 6127. PMID: 30992521.The archive should be explored using a genome visualizer like IGV (https://igv.org/) and the L. donovani (HU3) genome (Mendeley data: LdHU3_Genome sequence; http://dx.doi.org/10.17632/b82fm2w2h9.1
LdHU3_protein coding sequences
No full textThis dataset contains the location of the protein-coding sequences annotated in the Leishmania donovani (HU3 strain) genome. For additional information, see: Camacho, E., Gonzalez-de la Fuente, S., Rastrojo, A., Peiro-Pastor, R., Solana, J.C., Tabera, L., Gamarro, F., Carrasco-Ramiro, F., Requena, J.M., and Aguado, B. (2019). Complete assembly of the Leishmania donovani (HU3 strain) genome and transcriptome annotation. Sci Rep 9, 6127. PMID: 30992521.The archive should be explored using a genome visualizer like IGV (https://igv.org/) and the L. donovani (HU3) genome (Mendeley data: LdHU3_Genome sequence; http://dx.doi.org/10.17632/b82fm2w2h9.1
Author response
No full textDetecting pathogens and mounting immune responses upon infection is crucial for animal health. However, these responses come at a high metabolic price (McKean and Lazzaro, 2011, Kominsky et al., 2010), and avoiding pathogens before infection may be advantageous. The bacterial endotoxins lipopolysaccharides (LPS) are important immune system infection cues (Abbas et al., 2014), but it remains unknown whether animals possess sensory mechanisms to detect them prior to infection. Here we show that Drosophila melanogaster display strong aversive responses to LPS and that gustatory neurons expressing Gr66a bitter receptors mediate avoidance of LPS in feeding and egg laying assays. We found the expression of the chemosensory cation channel dTRPA1 in these cells to be necessary and sufficient for LPS avoidance. Furthermore, LPS stimulates Drosophila neurons in a TRPA1-dependent manner and activates exogenous dTRPA1 channels in human cells. Our findings demonstrate that flies detect bacterial endotoxins via a gustatory pathway through TRPA1 activation as conserved molecular mechanism.sponsorship: Vlaams Instituut voor Biotechnologie Alessia Soldano Luis Franco Guangda Liu Natalia Mora Emre Yaksi Bassem A Hassanr Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0702.12 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0077.15 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0680.10 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0681.10 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0503.12 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0654.15 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0761.10N Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0596.12 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar Fonds Wetenschappelijk Onderzoek G.0565.07 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Alejandro Lopez-Requena Natalia Mora Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar KU Leuven GOA/14/011 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Luis Franco Alejandro Lopez-Requena Guangda Liu Natalia Mora Emre Yaksi Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar European Commission IUAP P7/13 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Luis Franco Alejandro Lopez-Requena Guangda Liu Natalia Mora Emre Yaksi Thomas Voets Rudi Vennekensr KU Leuven OT/12/091 Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Luis Franco Alejandro Lopez-Requena Guangda Liu Natalia Mora Emre Yaksi Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talaverar KU Leuven PF-TRPLe Alessia Soldano Yeranddy A Alpizar Brett Boonen Luis Franco Alejandro Lopez-Requena Guangda Liu Natalia Mora Emre Yaksi Thomas Voets Rudi Vennekens Bassem A Hassan Karel Talavera (Vlaams Instituut voor Biotechnologie, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0702.12, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0077.15, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0680.10, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0681.10, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0503.12, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0654.15, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0761.10N, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek|G.0596.12, KU Leuven|GOA/14/011, KU Leuven|OT/12/091, European Commission|IUAP P7/13, KU Leuven PF-TRPLe)status: Publishe
Leishmania major (Friedlin): fasta files for protein-coding genes, coding sequences (CDS) and protein sequences
No full textA de novo assembly of the 36 chromosomes for Leishmania major (Friedlin strain) was attained in 2021 [see: Camacho, E., González-de la Fuente, S., Solana, J.C., Rastrojo, A., Carrasco-Ramiro, F., Requena, J.M., and Aguado, B. (2021). Gene annotation and transcriptome delineation on a de novo genome assembly for the reference leishmania major Friedlin strain. Genes (Basel). 12, 1359. PMID: 34573340]The sequence of the genome can be downloaded at:- Mendeley data: LMJFC_Genome sequence (https://data.mendeley.com/datasets/mcxg7rt2rv/1)- TriTrypDB: https://tritrypdb.org/tritrypdb/app/workspace/strategies/326805833/431018853- Leish-ESP: http://leish-esp.cbm.uam.es/In this Mendeley data entry, the following files can be downloaded: - LMJFC_ProteinCodingGenes_24may23.Fasta [Fasta file with sequences of the gene models for all protein-coding genes annotated to date]- LMJFC_CDS_24may23.Fasta [Fasta file with the sequences of the protein-coding sequences (CDS) annotated to date]- LMJFC_Proteins_24may23.Fasta [Fasta file with the sequences of the proteins annotated to date]These archives would be valuable for whole-organism approaches, such as differential gene expression, proteomics, and phylogenetic analyses, among others. Our commitment is to update this entry as soon as annotation improvements are produced
Control biológico de meloidogyne incognita en pimiento (Capsicum annuum)
No full text[SPA] Las enfermedades causadas por nematodos suponen unas pérdidas muy importantes para el sector hortícola, por lo que conseguir un control adecuado de este patógeno es fundamental. En este trabajo se ha identificado el nematodo causante de la enfermedad de la “agalla de la raíz” en las plantas de pimiento analizadas en el campo de Cartagena, como Meloidogyne incognita, mediante técnicas moleculares y de histopatología. Asimismo se ha estudiado la relación entre la población inicial de nematodos y el crecimiento de plántulas de pimiento bajo plástico, obteniendo la tasa de reproducción del nematodo en pimiento en condiciones de cultivo y, siendo el límite de tolerancia (T) de la planta a M. incógnita de 1,5 huevos y J2 por ml-1. Para el control biológico de M. incognita se han probado microorganismos antagonistas del patógeno de manera individual o en combinaciones. El uso de microorganismos aislados ha resultado ser poco efectivo. La combinación de dos hongos como Paecilomyces lilacinus y Trichoderma. harzianum produjo un control de la enfermedad entorno al 70%, aunque el mayor inconveniente fue la poca persistencia en el suelo de estos hongos. La combinación de tres antagonistas (P. lilacinus, T. harzianum y Bacillus firmus) resultó que la inclusión de la bacteria no mejoró la efectividad de la combinación de los dos hongos antagonistas, pues fue solo del 46,6%, aunque hay que tener en cuenta que concentración del inoculo inicial para esta experiencia fue el doble que la anterior. En general, la concentración inicial de inoculo del nematodo en el suelo, es determinante para alcanzar una efectividad elevada en el control de la enfermedad. El uso del formulado Nemaout que contiene bacterias promotoras del crecimiento y aminoácidos de origen vegetal, es el que produjo los mejores resultados en el control de la enfermedad. En conclusión, debido a sus componentes, la combinación de antagonistas puede usarse como preventivo aunque si el inóculo inicial de nematodos en el suelo de cultivo es elevado, estos antagonistas deberían de ser aplicados en el momento del trasplante y luego a la mitad de la estación de cultivo. Nemaout, sin embargo puede ser más efectivo antes del trasplante. Finalmente se analizaron los compuestos excretados por los hongos T. harzianum y P. lilacinus en los cultivos “in vitro” confirmando su actividad nematicida (90,5% en mortandad de J2). Los extractos metabólicos concentrados de las suspensiones miceliares de T. harzianum produjeron una mortandad del 100% de los J2.[ENG] Diseases caused by nematodes pose very significant losses for the horticultural sector, so achieve an adequate control of this pathogen is essential. The present study has identified the nematode causing disease "root gall" in pepper plants analyzed in the area “Campo de Cartagena”, as Meloidogyne incognita, using molecular techniques and histopathology. Also we have studied the relationship between initial population of nematodes and growth of pepper seedlings under plastic, obtaining the reproduction rate of the nematode in pepper in growing conditions and, being the limit of tolerance (T) of the plant to M. incógnita de 1.5 eggs and J2 per ml-1. For biological control of M. incognita, pathogenic antagonist microorganisms were tested individually or in combinations. The use of isolated microorganisms has proved ineffective. The combination of two fungi as Paecilomyces lilacinus and Trichoderma. harzianum produced a disease control around 70%, although the biggest drawback was the low soil persistence of these fungi. The combination of three antagonists (P. lilacinus, T. harzianum and Bacillus firmus) proved that the inclusion of the bacteria did not improve the effectiveness of the combination of the two antagonistic fungi, because it was only 46.6%, although it should be note that initial inoculum concentration was twice than the last experience. In general, the initial concentration of nematode inoculum in soil is crucial to achieve high effectiveness in controlling the disease. The use of Nemaout, formulated containing plant growth promoting bacteria and plant aminoacids is the one that produced the best results in controlling the disease. In conclusion, due to its components, the combination of antagonists can be used as preventive, although the initial inoculum of nematodes in soil culture is high, these antagonists should be applied at the time of transplantation and then half of the crop cycle. Nemaout, however, may be more effective before transplantation. Finally the compounds excreted by the fungi T. harzianum and P. lilacinus in in vitro cultures were analyzed, confirming their nematicidal activity (90.5% in mortality of J2). The metabolic extracts from mycelia suspensions concentrates of T. harzianum produced a 100% mortality of J2.Universidad Politécnica de Cartagen
Modelos Lejanos : Raúl A. Orgaz, la sociología y la historia de las ideas sociales argentinas
No full textFil: Grisendi, Ezequiel. Universidad Nacional de Córdoba-CONICET.Fil: Requena, Pablo M.. Universidad Nacional de Córdoba-CONICET
Persistent Inequalities?: Expansion of Education and Class Inequality in Italy and Spain
No full textThe paper analyses inequalities in educational outcomes (IEO) by class of family of origin in Italy and Spain for five 10-year cohorts born from 1920 to 1969, using the cumulative logit (ordinal regression) model. In both countries the question is whether, as education expanded, the class IEOs remained stable or diminished. The dominant view in the 1990s was that, with the exception of a few countries, inequalities persisted. In the current decade the consensus on this is changing, and decreasing class IEO is now more often found. Italy has been given as an example of educational expansion while maintaining class IEO. Spain was not included in previous analyses. The results show clearly that class IEO diminished in Spain as well as in Italy; differences in the timing of expansion and change in IEO can be accounted for through the different institutional settings of the two countries. A more contained reduction of IEO is found in Spain than in Italy
REQUENA, José Luis (Lic.) (1 of 2)
No full textSenator Elmer Thomas asks B.A. José Luis Requena an analysis of the advantages and disadvantages of using gold standard, silver standard, bimetallic standard or directed money. He also asks him to give him advice on silver because there is a surplus and it is likely that the United States will stop buying. B.A. Requena sends to the Senator an analysis of the reasons they chose golden standard and the advantages to change to a bimetallic standard. He analyzes gold and silver production, commerce and price fluctuation. He sends the analysis to Gen. Plutarco Elías Calles. B.A. Requena sends to the General a poem written by him while he was in exile for the persecution of Gen. Victoriano Huerta. B.A. Requena sends to the Gen. Calles in January 1938, an analysis of the economic situation in Mexico. Analysis with the title “A glance of the economic situation in Mexico”. The author gives his opinion regarding the administration of Gen. Calles and the Dos Estrellas Mining Company. He analyzes economic-social policies, worker movements, commerce, agriculture, foreign investment, communications and cost of living. He also analyzes the currency situation and purchase of silver as a measure to fight a war. He argues the national situation is bad and there is an external threat of economic depression because of the progress of communism. / El senador estadounidense Elmer Thomas solicita al licenciado José Luis Requena le haga un estudio a las ventajas y desventajas de elegir entre un patrón único de oro, un patrón único de plata, un bimetalista o uno de dinero dirigido; le pide también le dé recomendaciones acerca de la política sobre la plata, ya que hay excedente de este metal y es posible que Estados Unidos no necesite comprar más. El licenciado Requena envía al senador un amplio estudio de las razones que se tuvieron para tomar el oro como patrón y la conveniencia de cambiarlo por uno bimetalista. Analiza la producción de oro y de plata; comercialización, fluctuaciones de precios. Requena expone sus razones, a favor del patrón bimetalista, a fin de detener la crisis monetaria. Este estudio se lo envía el autor con una nota al general PEC. El licenciado Requena envía al general PEC una composición poética escrita por él cuando estaba en el destierro por persecución del general Victoriano Huerta. El licenciado Requena envía al general PEC en enero de 1938 un estudio acerca de la situación económica de México a petición de este último. Se lamenta de la política obrera y agraria que ahoga a la industria y desalienta la inversión extranjera, como sucedió en la compañía Nestlé, que fue liquidada por las excesivas demandas salariales, huelgas y abusos de los trabajadores. Estudio titulado "Una ojeada sobre la situación económica de México", que consta de generalidades en la que se pronuncia por un sistema socialista bien entendido. Acredita su trayectoria con su trabajo como presidente y fundador de la Compañía Minera de Las Dos Estrellas, modelo de prestaciones sociales, educativas y de salubridad, sin necesidad de implantar doctrinas comunistas. Analiza los resultados prácticos de la política económico-social seguida desde un punto de vista agrario; de movimientos obreros, comercio, de cultivo, de inversión extranjera, de comunicaciones; del aumento del costo de la vida. Asimismo analiza la situación monetaria, la compra de plata como reserva para enfrentar otra guerra, por parte de Estados Unidos. En cuanto a las conclusiones afirma que la situación interior es mala y en camino de empeorar y la externa con amenaza de depresión ante el creciente avance del comunismo
Instalación eléctrica de baja tensión, certificación energética y plan de autoprotección de la estación de ferrocarril Utiel-Requena
No full textEl siguiente proyecto tiene por objeto especificar las condiciones técnicas, de ejecución y
económicas de la instalación en BT de la Estación de Ferrocarril UTIEL-REQUENA
perteneciente a la compañía FERROCARRILES.Celda Rufino, M. (2014). Instalación eléctrica de baja tensión, certificación energética y plan de autoprotección de la estación de ferrocarril Utiel-Requena. Universitat Politècnica de València. https://riunet.upv.es/handle/10251/51412Archivo delegad
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