1,721,011 research outputs found
Mangoldia, a new lichen genus in the family Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales)
No full textLücking, Robert, Parnmen, Sittiporn, Lumbsch, Thorsten (2012): Mangoldia, a new lichen genus in the family Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales). Phytotaxa 69 (1): 1-5, DOI: 10.11646/phytotaxa.69.1.1, URL: http://biotaxa.org/Phytotaxa/article/view/phytotaxa.69.1.
FIGURE 1 in Mangoldia, a new lichen genus in the family Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales)
No full textFIGURE 1.Mangoldia australiana (holotype). A–B, thallus with ascomata. C, section through ascoma showing hymenium with asci and ascospores and lateral excipulum. D, asci with young (left) and mature (right) ascospores. E, two mature ascospores. F, ascus with mature ascospores staining violet-blue in Iodine solution. Scale in A and B = 1 mm, in C–F = 10 µm.Published as part of Lücking, Robert, Parnmen, Sittiporn & Lumbsch, Thorsten, 2012, Mangoldia, a new lichen genus in the family Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales), pp. 1-5 in Phytotaxa 69 (1) on page 3, DOI: 10.11646/phytotaxa.69.1.1, http://zenodo.org/record/506618
A new international journal for rapid publication of botanical taxonomy
No full textChristenhusz, Maarten J.M., Chase, Mark W., Fay, Michael F., Lumbsch, Thorsten, Monro, Alex, Vorontsova, Maria, Zhang, Zhi-Qiang (2009): A new international journal for rapid publication of botanical taxonomy. Phytotaxa 1 (1): 1-2, DOI: 10.11646/phytotaxa.1.1.1, URL: http://dx.doi.org/10.11646/phytotaxa.1.1.
"Taxonomische Studien von Mitgliedern der thelotrematoiden Ostroplaes (lichenisierte Ascomycota) in Australien"
No full textA taxonomic revision of the Australian members of trentepohlioid, ecolumellate thelotremataceaen Graphidaceae (Ostropales, lichenized Ascomycota) is presented. This species-rich group of crustose, predominantly tropical and subtropical lichens has been neglected for a long time, and is still poorly known. Particularly the studies for Australia are highly fragmentary.
Approximately 4000 specimens, including a total of c. 500 type specimens, herbaria collections, and almost 1000 samples collected during two field trips, were examined morphologically, anatomically, and chemically. A total of 103 species of 13 genera (including one newly described genus) could be identified. 33 species are new records for Australia, and 20 species were described new to science. Of the currently listed 71 names of this group for Australia, 50 are accepted as valid species. The remaining names and species, listed in an appendix, proved to belong to other genera, be synonymous to other taxa or falsely identified collections. 21 species (including species not known for Australia) are newly combined and several new synonyms are proposed.
In the taxonomic part an introduction is provided, including a historical overview of the development of generic concepts and delimitations within the treated group. This is followed by a brief presentation of earlier taxonomic studies and collections of thelotrematoid lichens in Australia. It also provides a general treatment of the climatic and biogeographical conditions of the continent. Further, the main characters are described, including anatomical, morphological and chemical features. The ecology and distribution of thelotrematoid lichens are discussed. All treated species are described and illustrated, their distribution is mapped, and a key for the identification provided. An overview of the distinguishing characters between genera is presented in a table.
To illuminate the phylogenetic relationships within this group, three phylogentic analyses were carried out using partial sequences of nuclear and mitochondrial ribosomal DNA loci. The first analysis employed a combined dataset of the mitochondrial SSU (mtSSU) and the nuclear LSU (nuLSU) of 105 species of Ascomycetes. As a result, it could be shown that the hitherto separted two families of Ostropales, Graphidaceae and Thelotremataceae, are not monophyletic, but form several lineages within one strongly supported monophyletic group. Consequently, Thelotremataceae is reduced to synonymy with Graphidaceae. The second and third analyses were carried out using a single dataset of nuLSU and mtSSU sequences respectively. In the nuLSU analysis 40 specimens of 38 species were included, in the mtSSU analysis 50 specimens of 25 species were examined. These analyses showed that all genera of thelotrematoid lichens included in the study are para- or polyphyletic, with the sole exception of Diploschistes, and that the present generic concept within Graphidaceae needs revision. The new genus Melanotopelia is introduced based on molecular and morphological evidence
Akazien-bewohnende Pseudomyrmex Ameisen - Integration physiologischer, verhaltensbiologischer, chemischer und genetischer Daten zur Untersuchung der Stabilität von Ameisen-Pflanzen Mutualismen
No full textMutualisms are interspecific interactions that benefit all partners involved. These interactions often include reciprocal adaptations of the partners. Acacia ant-plants secrete sucrose-free extrafloral nectar and I demonstrated that the defending Pseudomyrmex ant mutualists correspondingly almost completely lacked invertase activity (15 to 19 ng glucose released µg-1 ant fresh weight min-1). In contrast, generalist and exploiting ant species possessed invertase activity (89 to 107 ng glucose µg-1 min-1). In experiments, sucrose uptake induced invertase activity in generalist (300%) and exploiting workers (250%) as well as in larvae of all species (170-310%) investigated, but not in mutualist workers. Thus, the mutualists loose invertase during their ontogeny. This reduced metabolic capacity ties the mutualists to their host plants, but it does not prevent the mutualism from exploitation. A molecular phylogeny demonstrated that the exploiter species did not evolve from former mutualists but from generalists. Thus, being physiologically specialized and dependent on their host plants prevents mutualists from evolving into exploiters, while other mechanisms are required to stabilize a mutualism against the exploitation by species that evolved from generalists.
The colonization patterns of a mutualistic and a parasitic acacia-inhabitant were compared using three complementary approaches: observations of aggression behavior, chemical analyses of cuticular hydrocarbon profiles and genetic microsatellite analyses. Genetic data indicated that one colony of the mutualist Pseudomyrmex ferrugineus inhabited up to two host plants (ø 1.56), while several parasitic P. gracilis colonies (ø 2.23) shared the same individual host. In both species, ant individuals inhabiting the same acacia possessed characteristic chemical profiles. In behavioral experiments under field conditions, inhabitants sharing the same acacia showed no aggression, which is in line with cuticular hydrocarbon profiles. Genetic, chemical and behavioral patterns were concordant for P. ferrugineus, while genetic heterogeneity and low relatedness (Rmin=0.00±0.18) of P. gracilis was in contradiction to chemical and behavioral data. The non-aggressive coexistence of different colonies of P. gracilis seems to prevent the inhabitation of hosts by other species. Genetic identity of ant colonies, the ants’ chemical profiles and their behavior towards conspecifics shape the colonization pattern of acacias and can determine the outcome of plant-ant interactions.
Large and fast growing colonies are advantageous in competitive environments to allow for efficient nest defense and foraging. How the obligate acacia-ant Pseudomyrmex peperi forms colonies was investigated in the present study. The species establishes distinct, but highly polygynous colonies that can inhabit large clusters of host trees. Analyzing workers, males, queens and virgin queens (264 individuals) from two supercolonies with eight polymorphic microsatellite markers indicated that colonies are founded by one singly mated queen and supercolonies are established by intranidal mating among colony-derived males with daughter queens. This allows colonies to constantly grow by budding without having to found new colonies. Ancestral states reconstruction revealed that polygyny represents the derived state among acacia-ants and has evolved at least twice independently. The extreme polygyny of Pseudomyrmex peperi achieved by intranidal mating may play an important role for species coexistence in a dynamic and competitive habitat.
I was able to identify physiological, genetic and behavioral adaptations of mutualistic acacia-ants to their specific life style. Large colonies with high numbers of individuals, which allow for efficient host defense, seem to be a key adaptation of mutualistic acacia-ants. Constant colony growth is possible especially in the polygynous acacia-ant Pseudomyrmex peperi and seems to be a higher adaptation towards the life style as acacia-inhabitant. High relatedness among individuals colonizing the same host reduces conflicts and increases inclusive fitness of the individuals. The genes and consequently the behavior of the mutualist workers are then passed on to the next generation and allow the mutualism to persist in evolutionary terms. In contrast, ant species that parasitize the mutualism of acacias were not adapted to their hosts. They do not depend on the host plant and decrease plant fitness. These parasites can only persist in evolutionary terms because they coexist with mutualistic ant species that assure the maintenance of myrmecophytic traits in host plant populations.Mutualismen sind Interaktionen verschiedener Arten zu gegenseitigem Nutzen. Diese Wechselbeziehungen können Anpassungen der Partner einschließen. Als eine solche gegenseitige Adaptation sezernieren Ameisenakazien Saccharose-freien extrafloralen Nektar (EFN) und die auf den Pflanzen lebenden mutualistischen Ameisenarten haben in Anpassung an ihre Wirtspflanze die Fähigkeit verloren, das Enzym Invertase zur Spaltung von Saccharose zu expremieren. Zudem konnte experimentell gezeigt werden, dass die Aufnahme von Saccharose die Invertase-Aktivität von parasitischen (250%) und generalistischen (300%) Ameisenarten erhöht, nicht aber die von Mutualisten. Im Gegensatz zu adulten Tieren zeigten Larven aller drei untersuchten Ameisengruppen eine induzierbare Invertase-Aktivität (170-310%). Diese während ihrer Ontogenese reduzierte Verdauungskapazität bindet die mutualistischen Ameisenarten physiologisch an ihren Wirt. Andererseits verhindert jedoch der Verlust von Saccharose im EFN nicht die Ausbeutung des Mutualismus durch parasitische Ameisenarten. Anhand einer molekularen Phylogenie basierend auf DNA-Sequenzen wurde nachgewiesen, dass die Parasiten aus generalistischen Arten evolviert sind und nicht aus Mutualisten. Die physiologische Anpassung und die damit einhergehende Abhängigkeit der mutualistischen Ameisen von ihrer Wirtspflanze scheint die Evolution zu einem Parasiten zu verhindern, nicht aber die Ausbeutung des Systems durch Parasiten, welche aus Generalisten evolviert sind.
Die Koloniestruktur mutualistischer und parasitischer Ameisenarten wurde in der vorliegenden Arbeit mit Hilfe von Verhaltensbeobachtungen, chemischen Analysen kutikulärer Kohlenwasserstoffe und genetischen Mikrosatelliten-Daten vergleichend untersucht. Verwandtschaftsanalysen belegten, dass eine Kolonie des Mutualisten P. ferrugineus bis zu zwei (ø 1.56) Akazien-Pflanzen besiedelte, wohingegen sich mehrere Kolonien des Parasiten P. gracilis (ø 2.23) einzelne Wirtspflanzen teilten. Bei beiden Arten besaßen die Individuen, welche dieselbe Wirtspflanze bewohnten, charakteristische Profile kutikulärer Kohlenwasserstoffe. In Verhaltensexperimenten im Freiland zeigten die Bewohner einer Wirtspflanze keine Aggressivität untereinander, was durch die Profile der kutikulären Kohlenwasser-stoffe erklärt werden konnte. Genetik, Chemie und Verhalten von P. ferrugineus wiesen somit ähnliche Muster auf, während bei P. gracilis die genetische Heterogenität und der z.T. geringe Verwandtschaftsgrad (Rmin=0.00±0.18) im Widerspruch zu Chemie und Verhalten standen. Durch die friedliche Koexistenz verschiedener Kolonien des Parasiten P. gracilis kann der limitierte Lebensraum „Akazie“ vor Besiedelung durch artfremde, konkurrierende Ameisen geschützt werden. Die Interaktion zwischen Ameisen und Pflanzen hat also Einfluss auf die genetische Identität von Ameisenkolonien, ihre chemischen Profile und ihr Verhalten gegenüber koloniefremden Artgenossen.
In einem kompetitiven Habitat sind große und schnell wachsende Kolonien von Vorteil, weil diese eine besonders effiziente Futtersuche und Nestverteidigung ermöglichen. In der vorliegenden Arbeit wurde untersucht, mit welchen Strategien die mutualistische Ameisenart Pseudomyrmex peperi Kolonien etabliert. Es konnte gezeigt werden, dass die Art extrem polygyne Kolonien bildet und so große Gruppen von Wirtspflanzen besiedelt. Mikrosatelliten-Daten zeigten, dass — trotz der großen Anzahl von Königinnen — Kolonien von einer einmal verpaarten Königin gegründet werden und durch Tochterköniginnen, welche mit Männchen aus derselben Kolonie verpaart sind, zu Superkolonien heranwachsen. Basierend auf DNA-Sequenzdaten wurde gezeigt, dass Polygynie innerhalb der mutualistischen Akazien-Ameisen das abgeleitete Merkmal darstellt. Die Polygynie von P. peperi ermöglicht es der Art, eine langjährige Beziehung mit ihrer Wirtspflanze einzugehen. Diese Sozialstruktur scheint eine weiterführende Anpassung der Ameisenart an ihre Wirtspflanze zu sein.
In der vorliegenden Arbeit konnten physiologische, genetische sowie verhaltensbiologische Anpassungen mutualistischer Akazien-Ameisen an ihre Lebensweise identifiziert werden. Extreme Koloniegrößen mit hohen Individuenzahlen, welche ihre Wirtspflanze effektiv verteidigen, scheinen eine wichtige Anpassung von Akazien-Ameisen zu sein. Besonders polygyne Arten sind zu einem kontinuierlichen Koloniewachstum fähig. Durch einen hohen Verwandtschaftsgrad unter den Ameisen einer Akazie werden Konflikte reduziert und die Gesamtfitness der Individuen erhöht. Die Gene und daher das Verhalten der mutualistischen Ameisen wird somit an die nächste Generation weiter gegeben und ermöglicht ein Bestehen des Mutualismus in evolutionären Zeiträumen. Ameisen hingegen, die den Mutualismus parasitieren, sind nicht an die Wirtspflanze angepasst. Sie sind nicht von ihrer Wirtspflanze abhängig und reduzieren durch ihr Verhalten die Fitness der Pflanzen. Diese Parasiten können evolutionär nur bestehen, da sie mit den mutualistischen Arten coexistieren und letztere den Erhalt myrmekophytischer Eigenschaften der Wirtspflanzen gewährleisten
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Phylogenie und Phylogeographie antarktischer und bipolarer Flechten der Gattung Usnea, Neuropogon
No full textFlechten sind symbiontische Organismen, die aus einem Pilz und einem oder mehreren photosynthetisch aktiven Partnern, eukaryotischen Algen oder Cyanobakterien, bestehen. Diese Organismen haben eine Reihe von morphologischen Merkmalen entwickelt, die in nicht-lichenisierten Pilzen fehlen. Die taxonomische Bedeutung und Interpretation der Variabilität dieser Merkmale sind unklar. Zudem zeigen Flechten oftmals weltumspannende Verbreitungsmuster, aber historische Populationsprozesse sind weitgehend unverstanden.
In der vorliegenden Arbeit wurden erstmals phylogenetische und phylogeographische Ansätze kombiniert, um Artgrenzen, die Bedeutung morphologischer und chemischer Variabilität innerhalb und zwischen Arten sowie die zugrunde liegenden vegetationshistorischen Prozesse zu untersuchen. Als Modellorganismus diente eine hauptsächlich in der Antarktis und in angrenzenden Gebieten verbreitete Pioniergruppe aus der Flechtengattung Usnea, die Untergattung Neuropogon. Zurzeit werden 15 strauchige, steinbewohnende Flechtenarten mit schwarzer Pigmentierung, dunklen Fruchtkörpern und südhemisphärischer oder zirkumpolar arktisch und antarktischer (bipolarer) Verbreitung zu Neuropogon gezählt. Im Rahmen dieser Arbeit wurden mögliche Ursachen für diese ungewöhnliche Verbreitung untersucht, insbesondere die Frage, ob genetischer Austausch zwischen den beiden Polarregionen bzw. zwischen Südamerika und der Antarktis stattfindet oder ob die Populationen effektiv isoliert sind. Die Arbeit umfasst drei Hauptthemen: (1) die phylogenetische Stellung der Untergattung Neuropogon innerhalb Usneas, (2) die Abgrenzung von Arten innerhalb der Neuropogon-Gruppe und (3) der phylogeographische Kontext für die Artabgrenzungen und die rezente Verbreitung der Arten.
Im ersten Teil konnte auf Basis von 50 ribosomalen ITS-Sequenzen von zwölf Neuropogon-Arten gezeigt werden, dass Neuropogon paraphyletisch ist. Die Gruppe spaltet sich in eine Kerngruppe nah verwandter Arten mit unklaren verwandtschaftlichen Beziehungen und in drei weitere Arten auf, die in eine andere Sektion innerhalb Usneas fallen. Die Pigmentierung des Thallus und die dunklen Fruchtkörper scheinen keine Neuropogon-spezifischen Merkmale zu sein und sind eher auf raue klimatische Bedingungen zurückzuführen. Folglich wurde Neuropogon mit Usnea synonymisiert.
Im zweiten Teil wurde der Datensatz auf 308 Individuen und drei Genfragmente, die ribosomale ITS und IGS und das proteincodierende Gen RPB1, erweitert. Die phylogenetische Analyse dieser Daten zeigt eine Trennung zwischen einer Kerngruppe und einer Außengruppe, bestehend aus drei monophyletischen Arten sowie einem Artkomplex aus neuseeländischen Proben. Die Kerngruppe besteht aus drei verwandten Gruppen, in denen sich jeweils vegetativ reproduzierende Individuen um eine der drei fertilen Arten U. trachycarpa, U. perpusilla und U. aurantiaco-atra gruppieren. Mit Hilfe der phylogenetischen Arterkennungsmethode nach Wiens & Penkrot (2000) konnten Artgrenzen innerhalb dieser Gruppen aufgedeckt werden. Neben kryptischen Arten wurde dabei jeweils eine bipolare Abstammungslinie innerhalb des U. trachycarpa- und des U. perpusilla-Komplexes entdeckt, die bisher als eine zusammenhängende Art, U. sphacelata, betrachtet wurden.
Zuletzt wurden die Datensätze der drei Gruppen separat, mit Hilfe der Nested Clade Analyse (NCA, Templeton et al. 1987), in einem phylogeographischen Kontext an der intra-interspezifischen Schnittstelle untersucht, um Artgrenzen und populationshistorische Prozesse abzuleiten. Bei großen geographischen Distanzen traten allerdings Probleme in der NCA auf. Die Übereinstimmung von genetischer Abweichung und geographischer Distanz ist insgesamt gering. Alle nordhemisphärischen Populationen sind im Vergleich zu den südhemisphärischen Populationen genetisch sehr homogen, woraus auf rezente Fernverbreitung geschlossen wird. Es gibt deutliche Hinweise auf kryptische Artbildung sowie auf eine postglaziale Wiederbesiedlung der Antarktis und periodischen Genfluss von Südamerika in die Antarktis. Zur Unterstützung der Artabtrennungen, wurde die Verbindung morphologischer und chemischer Merkmale mit der Position der Haplotypen in den hierarchisch geschachtelten Haplotyp-Netzwerken anhand von Kontingenztafeltests und ANOVAs überprüft. In fast allen Fällen konnten die phylogenetischen und phylogeographischen Schlussfolgerungen durch diese Daten signifikant unterstützt werden.
Aus den Untersuchungen ergeben sich folgende taxonomische Schlussfolgerungen: (1) drei neue Arten wurden entdeckt; (2) U. sphacelata und U. perpusilla sind Artkomplexe, die insgesamt aus mindestens sechs Arten bestehen; (3) U. antarctica ist synonym mit U. aurantiaco-atra; (4) fünf Arten, U. acromelana, U. ciliata, U. perpusilla, U. subcapillaris und U. trachycarpa, werden als vorläufige Arten akzeptiert, bedürfen aber weiterer Untersuchungen und (5) vier der zurzeit akzeptierten Arten, U. acanthella, U. durietzii, U. patagonica und U. subantarctica, werden in ihrer derzeitigen Abgrenzung bestätigt
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
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