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Les premiers stades de vie des poissons dans le SO de Madagascar : éléments pour une meilleure connaissance de la biodiversité et une meilleure gestion des ressources exploitées
No full textMarine ecosystems which provide multiple ecosystem services essential to human well-being are currently threatened by resources overexploitation and the use of destructive fishing gears. This leads to a global loss of 20% of mangroves, 19% of coral reefs, and 110 km2 per year of seagrass meadows. The coastal habitats that support up to 20% of global fisheries production are the most affected, particularly in least developed countries such as Madagascar. In this country, 87% of coral reef are threatened, particularly in the southwestern part of the island where small-scale fishermen practice juveniles fishing. A better knowledge of the ecology of young fishes is thus a key point for the implementation of effective and robust measures. The present work was centred on early developmental stages of fish identified using DNA barcoding. Identifications to the species level were used to predict the post-larvae supply and to discover the variability in juveniles recruitment that appears to be related to the alteration of post-larvae supply. In total, 387 species have been observed with nine new species for Madagascar. The interests and limitations of DNA barcoding are widely discussed in Chapter 1. Post-larvae supply was better predicted by the remotely sensed oceanic conditions with an accuracy of 60% for species richness and 50% for abundance. However, the performance of models for predicting abundance appears to be influenced by the characteristics of water masses that are different among sites, while the performance of models for predicting species richness appears similar between the sites (discussed in Chapter 2). The remotely sensed oceanic conditions better explained the post-larval fish assemblages. However, these oceanic conditions structure mostly the post-larval fish assemblages in water masses with coastal water characteristics than those in waters with ocean characteristics (discussed in Chapter 3). The period of juvenile recruitment as well as juvenile assemblages differ among years. These interannual variabilities were also observed on post-larvae supply which were conditioned by the interannual variation of oceanic conditions. This suggests that alterations in post-larvae supply influence the temporal distribution of juvenile fish, which is a subject discussed in Chapter 4. The case of Siganidae recruitment, which seems to be strongly linked to post-larvae supply, is developed in the final discussion of this thesis. Likewise, the identification of nursery areas allows to propose management measures to deal with the local context that are also discussed.Les écosystèmes marins qui fournissent de multiples services écosystémiques indispensables au bien-être de l’humanité sont actuellement menacés par la surexploitation des ressources et l’utilisation d’engins destructifs. Ceci conduit à une perte à l’échelle globale de 20% des mangroves, 19% des récifs coralliens et 110 km2 par an des herbiers. Les habitats côtiers qui soutiennent jusqu’à 20% de la production globale de la pêche sont les plus touchés, notamment dans les pays les moins avancés comme Madagascar. Dans ce pays, 87% des écosystèmes récifaux sont menacés, notamment dans le sud-ouest où les petits pêcheurs utilisent des engins prohibés capturant les juvéniles. Une meilleure connaissance de l’écologie des jeunes poissons est donc un point clé pour la mise en place des mesures de gestion efficaces et robustes. D’où l’objet de ce présent travail centré sur les jeunes stades de développement des poissons, identifiés en utilisant le barcoding ADN. Les identifications à l’espèce ont permis de prédire l’approvisionnement en post-larves et de découvrir la variabilité du recrutement en juvéniles qui semble liée à l’altération des apports en post-larves. Au total, 387 espèces ont été observées avec 9 nouvelles espèces pour Madagascar. L’intérêt et les limites du barcoding ADN sont largement discutés (chapitre 1). L’approvisionnement en post-larves a été mieux prédit par les conditions océaniques obtenues par télédétection avec une précision de 60% pour la richesse et 50% pour l’abondance. Pourtant, la performance des modèles pour prédire l’abondance semble influencée par les caractéristiques des masses d'eau qui sont différentes entre les deux sites, tandis que la performance pour prédire la richesse parait similaire entre ces deux sites (chapitre 2). Les conditions océaniques obtenues par télédétection expliquent mieux les assemblages de post-larves. Pourtant, ces conditions océaniques structurent davantage les assemblages de post-larves dans les masses d'eau présentant des caractéristiques d’eaux côtières que ceux dans les eaux présentant des caractéristiques océaniques (chapitre 3). La période de recrutement et les assemblages de juvéniles diffèrent entre les années. Ces variabilités interannuelles ont été aussi observées dans l’approvisionnement en post-larves qui semble conditionné par les variations des conditions océaniques. Ce qui suggère que les altérations des apports en post-larves influencent la distribution temporelle des juvéniles (chapitre 4). Le cas du recrutement des juvéniles de Siganidae, qui semble être fortement en lien avec les apports en post-larves, est développé dans la discussion générale. De même, la localisation des zones de nourriceries a permis de proposer des mesures de gestion tenant compte du contexte local qui sont aussi discutées
Les premiers stades de vie des poissons dans le SO de Madagascar : éléments pour une meilleure connaissance de la biodiversité et une meilleure gestion des ressources exploitées
No full textMarine ecosystems which provide multiple ecosystem services essential to human well-being are currently threatened by resources overexploitation and the use of destructive fishing gears. This leads to a global loss of 20% of mangroves, 19% of coral reefs, and 110 km2 per year of seagrass meadows. The coastal habitats that support up to 20% of global fisheries production are the most affected, particularly in least developed countries such as Madagascar. In this country, 87% of coral reef are threatened, particularly in the southwestern part of the island where small-scale fishermen practice juveniles fishing. A better knowledge of the ecology of young fishes is thus a key point for the implementation of effective and robust measures. The present work was centred on early developmental stages of fish identified using DNA barcoding. Identifications to the species level were used to predict the post-larvae supply and to discover the variability in juveniles recruitment that appears to be related to the alteration of post-larvae supply. In total, 387 species have been observed with nine new species for Madagascar. The interests and limitations of DNA barcoding are widely discussed in Chapter 1. Post-larvae supply was better predicted by the remotely sensed oceanic conditions with an accuracy of 60% for species richness and 50% for abundance. However, the performance of models for predicting abundance appears to be influenced by the characteristics of water masses that are different among sites, while the performance of models for predicting species richness appears similar between the sites (discussed in Chapter 2). The remotely sensed oceanic conditions better explained the post-larval fish assemblages. However, these oceanic conditions structure mostly the post-larval fish assemblages in water masses with coastal water characteristics than those in waters with ocean characteristics (discussed in Chapter 3). The period of juvenile recruitment as well as juvenile assemblages differ among years. These interannual variabilities were also observed on post-larvae supply which were conditioned by the interannual variation of oceanic conditions. This suggests that alterations in post-larvae supply influence the temporal distribution of juvenile fish, which is a subject discussed in Chapter 4. The case of Siganidae recruitment, which seems to be strongly linked to post-larvae supply, is developed in the final discussion of this thesis. Likewise, the identification of nursery areas allows to propose management measures to deal with the local context that are also discussed.Les écosystèmes marins qui fournissent de multiples services écosystémiques indispensables au bien-être de l’humanité sont actuellement menacés par la surexploitation des ressources et l’utilisation d’engins destructifs. Ceci conduit à une perte à l’échelle globale de 20% des mangroves, 19% des récifs coralliens et 110 km2 par an des herbiers. Les habitats côtiers qui soutiennent jusqu’à 20% de la production globale de la pêche sont les plus touchés, notamment dans les pays les moins avancés comme Madagascar. Dans ce pays, 87% des écosystèmes récifaux sont menacés, notamment dans le sud-ouest où les petits pêcheurs utilisent des engins prohibés capturant les juvéniles. Une meilleure connaissance de l’écologie des jeunes poissons est donc un point clé pour la mise en place des mesures de gestion efficaces et robustes. D’où l’objet de ce présent travail centré sur les jeunes stades de développement des poissons, identifiés en utilisant le barcoding ADN. Les identifications à l’espèce ont permis de prédire l’approvisionnement en post-larves et de découvrir la variabilité du recrutement en juvéniles qui semble liée à l’altération des apports en post-larves. Au total, 387 espèces ont été observées avec 9 nouvelles espèces pour Madagascar. L’intérêt et les limites du barcoding ADN sont largement discutés (chapitre 1). L’approvisionnement en post-larves a été mieux prédit par les conditions océaniques obtenues par télédétection avec une précision de 60% pour la richesse et 50% pour l’abondance. Pourtant, la performance des modèles pour prédire l’abondance semble influencée par les caractéristiques des masses d'eau qui sont différentes entre les deux sites, tandis que la performance pour prédire la richesse parait similaire entre ces deux sites (chapitre 2). Les conditions océaniques obtenues par télédétection expliquent mieux les assemblages de post-larves. Pourtant, ces conditions océaniques structurent davantage les assemblages de post-larves dans les masses d'eau présentant des caractéristiques d’eaux côtières que ceux dans les eaux présentant des caractéristiques océaniques (chapitre 3). La période de recrutement et les assemblages de juvéniles diffèrent entre les années. Ces variabilités interannuelles ont été aussi observées dans l’approvisionnement en post-larves qui semble conditionné par les variations des conditions océaniques. Ce qui suggère que les altérations des apports en post-larves influencent la distribution temporelle des juvéniles (chapitre 4). Le cas du recrutement des juvéniles de Siganidae, qui semble être fortement en lien avec les apports en post-larves, est développé dans la discussion générale. De même, la localisation des zones de nourriceries a permis de proposer des mesures de gestion tenant compte du contexte local qui sont aussi discutées
The early life stages of fish in SW Madagascar : elements for a better knowledge and a better management of exploited resources
No full textLes écosystèmes marins qui fournissent de multiples services écosystémiques indispensables au bien-être de l’humanité sont actuellement menacés par la surexploitation des ressources et l’utilisation d’engins destructifs. Ceci conduit à une perte à l’échelle globale de 20% des mangroves, 19% des récifs coralliens et 110 km2 par an des herbiers. Les habitats côtiers qui soutiennent jusqu’à 20% de la production globale de la pêche sont les plus touchés, notamment dans les pays les moins avancés comme Madagascar. Dans ce pays, 87% des écosystèmes récifaux sont menacés, notamment dans le sud-ouest où les petits pêcheurs utilisent des engins prohibés capturant les juvéniles. Une meilleure connaissance de l’écologie des jeunes poissons est donc un point clé pour la mise en place des mesures de gestion efficaces et robustes. D’où l’objet de ce présent travail centré sur les jeunes stades de développement des poissons, identifiés en utilisant le barcoding ADN. Les identifications à l’espèce ont permis de prédire l’approvisionnement en post-larves et de découvrir la variabilité du recrutement en juvéniles qui semble liée à l’altération des apports en post-larves. Au total, 387 espèces ont été observées avec 9 nouvelles espèces pour Madagascar. L’intérêt et les limites du barcoding ADN sont largement discutés (chapitre 1). L’approvisionnement en post-larves a été mieux prédit par les conditions océaniques obtenues par télédétection avec une précision de 60% pour la richesse et 50% pour l’abondance. Pourtant, la performance des modèles pour prédire l’abondance semble influencée par les caractéristiques des masses d'eau qui sont différentes entre les deux sites, tandis que la performance pour prédire la richesse parait similaire entre ces deux sites (chapitre 2). Les conditions océaniques obtenues par télédétection expliquent mieux les assemblages de post-larves. Pourtant, ces conditions océaniques structurent davantage les assemblages de post-larves dans les masses d'eau présentant des caractéristiques d’eaux côtières que ceux dans les eaux présentant des caractéristiques océaniques (chapitre 3). La période de recrutement et les assemblages de juvéniles diffèrent entre les années. Ces variabilités interannuelles ont été aussi observées dans l’approvisionnement en post-larves qui semble conditionné par les variations des conditions océaniques. Ce qui suggère que les altérations des apports en post-larves influencent la distribution temporelle des juvéniles (chapitre 4). Le cas du recrutement des juvéniles de Siganidae, qui semble être fortement en lien avec les apports en post-larves, est développé dans la discussion générale. De même, la localisation des zones de nourriceries a permis de proposer des mesures de gestion tenant compte du contexte local qui sont aussi discutées.Marine ecosystems which provide multiple ecosystem services essential to human well-being are currently threatened by resources overexploitation and the use of destructive fishing gears. This leads to a global loss of 20% of mangroves, 19% of coral reefs, and 110 km2 per year of seagrass meadows. The coastal habitats that support up to 20% of global fisheries production are the most affected, particularly in least developed countries such as Madagascar. In this country, 87% of coral reef are threatened, particularly in the southwestern part of the island where small-scale fishermen practice juveniles fishing. A better knowledge of the ecology of young fishes is thus a key point for the implementation of effective and robust measures. The present work was centred on early developmental stages of fish identified using DNA barcoding. Identifications to the species level were used to predict the post-larvae supply and to discover the variability in juveniles recruitment that appears to be related to the alteration of post-larvae supply. In total, 387 species have been observed with nine new species for Madagascar. The interests and limitations of DNA barcoding are widely discussed in Chapter 1. Post-larvae supply was better predicted by the remotely sensed oceanic conditions with an accuracy of 60% for species richness and 50% for abundance. However, the performance of models for predicting abundance appears to be influenced by the characteristics of water masses that are different among sites, while the performance of models for predicting species richness appears similar between the sites (discussed in Chapter 2). The remotely sensed oceanic conditions better explained the post-larval fish assemblages. However, these oceanic conditions structure mostly the post-larval fish assemblages in water masses with coastal water characteristics than those in waters with ocean characteristics (discussed in Chapter 3). The period of juvenile recruitment as well as juvenile assemblages differ among years. These interannual variabilities were also observed on post-larvae supply which were conditioned by the interannual variation of oceanic conditions. This suggests that alterations in post-larvae supply influence the temporal distribution of juvenile fish, which is a subject discussed in Chapter 4. The case of Siganidae recruitment, which seems to be strongly linked to post-larvae supply, is developed in the final discussion of this thesis. Likewise, the identification of nursery areas allows to propose management measures to deal with the local context that are also discussed
Fish post-larvae assemblages at two contrasted coral reef habitats in southwest Madagascar
No full textpeer reviewedThe temporal structure of reef fish post-larvae assemblages were examined at two sites on the southwest coast of Madagascar: Nosy Ve Island, off Anakao, where every forms of fishing have been banned since 1999, and the north of the Great Barrier Reef of Toliara which has been impacted by overfishing for years. Fish post-larvae were collected using light traps during five nights of the new moon periods from August 2013 to February 2014. A total of 34 and 36 families grouping 95 and 101 different morphospecies were collected from the two sites respectively. At both sites, fish post-larvae were more abundant and diverse from December to January. Significant differences in the assemblage structure of reef fish post-larvae were detected between seasons due to the Pomacentridae (Pomachromis richardsoni and Parma spp1), Mullidae (Parupeneus spp), Siganidae (Siganus sutor) and Blenniidae (Istiblennius edentulus). The relationship between fish post-larval assemblage and abiotic factors differed between the two sites. At the Anakao site, temperature and water transparency explained 26.4% of the variability observed in fish post-larvae assemblages when at the Great Barrier Reef site, these two variables and salinity explained 20.7% only. All these results are discussed in the context of the development of post-larvae capture and culture for ornamental fish market and food fish rearing
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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